TCONS_00053659 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00053659
Unique NameTCONS_00053659
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length1887

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00053659 ID=TCONS_00053659|Name=TCONS_00053659|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1887bp
ATGCTCTTTTCATTTTAGTGGATAGGGCAGACAAGACTTAAAATAAAAGC
CGAAGTTTAGATCATCATGGTTATTATATCATTGCCCGTGtcaaaattat
atattatatatcgttcacaaatattaaaatttacaaaaaattttcaacat
cgagaaaaaataatcaaaatatattACTATTTACAAAATAACATAAAAAG
AGTTTTCAAATCAGTGTCATTAAAGTTAACCATAAACTTTTATGTCCCAA
ATAAACACCCACCCCCACCGGTtaatttttcgagaaaaaaaacccCAGAT
ATTAGGACCTCCCCGTTTattaagttttaaaaatattttcagcttttgaa
gATAAAATAGCCTTATATTTACCTTAATTTTGGATTGTAAGAATTACAAT
TTCCCTGGCAGATAGGCCCACCATTTatatgaaaattttattaaaatttt
ccaaattcgagTAACGGGACTCTTGTATTTTCATACTACCGTGCCGGGCT
AAAAGACCAAAATAGACATGGAGACATAGACAGACATGCATGTTTTGGAA
AATGATCATTATAAACAGAACTTTAACCAAACAAACTAAACTCAAATCTA
TCCCAGCtgagaaggaaaaaaaatttcccacaAGATTTATTTTCCATATT
GAGACCTGAGGTTGTCAGATATAAAACTTTCCAGgagaaataatttaatt
tttacattcagttaAAAGGCTATAGACTGATCGCCCTCTTGTAAGAAAGA
TCTTTTACtgtattttagtttttaatataaaaacaacaaagtgcgttcta
ataaataaaaaaatcttcagaaaaaaatcaataaaaatgttcccataaaa
caaaattaacctgtgccaaaaatattaaataagttgaaaatgattgtcaa
caacaacaaagtgaTCTACCAGAAGGAGCcttatgaaaaaatagagaATC
TAATCATGGCATATACCTATCAACCTTTAAAGTGTAAAAAGACTGGGTTC
GTGtttaccactgacctttatataccctggaccaagcttttTTGNAAAGT
AGATccagcgctctcgatgcatttacaccgctattgagtagtgccgccat
tagggtaccacttttcaaaaactccgatcaatGATTTTGCTTGGCctgga
ttgagaagcttggtccagggtatgtAAAGGTCAGTGGTGTTTTACCGGGG
AGGAATGATGTCAAAATatctgaagtcgttgcattaATTCTCTCAAAGAC
AAAGAATTTTGACGTGATTTCCACGACTGGTAATGAACTTAGAAACCGAC
CACACAGTCAAGGGTTGATAGAAGTATCTATGATGATATGCGcaactgca
atgacttcaagaAATTATGGAGCTTCGACCCAATACGTTACAAAGAAATG
ACCATGTGCTGTAAAAGTGACTGTCAAAggccagaaaaaaaaaagattga
gagGATTTTCATATCCTGAAATTCCTACCTGCTTTTACATTTTCTTAATG
AATTTGAGGCCTAACAAGATTTGTTTAGTAACGCAGCCTATTGATTTTTC
TTCACTCGATATCATTTACTTTAAGCCCGCAATCTCATTTGATACCAACT
GGAAGCCACGTGTTAAGGGAATAAGTTTGATTATGCTGGCAAGGTTTCTA
TATAGTAGCAAAAAAGGAAGCACACTTAAAGCAATTTGACTTTAATTTCC
AATTTAAGGTGTTGTTAAAACTTAATATTTTCATTCCCAACCATCATTCA
CGACACTCACCATACGTGCGTTattacataatttattttacAAGACAGTT
TTACTTGTGCGCACTTGTTTTGGAATCAACATTGCTTCATCATTATCGAT
TTGATTGGGCAGTGAAACCATGGATGATGTCATATCT
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_233:416098..427302-

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00053659 ID=TCONS_00053659|Name=TCONS_00053659|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=11205bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_233:416098..427302- (Clytia hemisphaerica)
ATGCTCTTTTCATTTTAGTGGATAGGTGTAAAGATTCTTACATCTATTAC ATAATCTGCGTGCTTTTCGCGCGCTTACAGTTTCACGATAATCGGAATGA GCCGTCGGGCGGATGAGGCGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGG GTTGCACACCATTTTGACTGAAATTGAAGCCGTGTTGAACTGTAGACCGT TGACGTATGTTGGTGCCGATGATGAGATCGAATGCCTGACACCATCACAT TTGATTTGTGGGAAAAGAATCATCAGCCTCCCAACCGGACAAGTCGTGAA AACGTTGGAAGAAAGCTATCAACACGTCAAAAAATGTTTTGAAGATGCGC GGGAAAGATGGTACCGAGAATACCTCACAGAGTTGAGAGTACATCACAAG AAAGTCAAGAAATTCGAAACCCCAAAAGTTGGGTCTTTAGTTTTGGTTAA GGATGAAAACAAAAAGAGACAACTATGGAATGTGGGTAAGATTGAAAATT TAATTTTTGGAAGGAAAAATGTTGTTCGAGGAGCCTTGATTAGTTTCGGC ATTGAAGGCAAACATAAGGTCAAACGTCCCCTTGAACTGCTGTACCCCCT AGAGGTCCATGGGTGGGATTCTTTTCATTTTTCAGGACAAGAAACATCAA CAGGATTACCAAATGAAATGCAACAATCTAAGAATCATGTCAGTGTAGAG AAGGAATCCCAGCCAATTATACCGGCTGTTGTTCAAAATTTAGTTTTTTC TCCTAAACATCACACATCTATGTCTTCTGAACCTTCAATTGTTGCCACTT CTGGTCCATCAGTTTCTGTCGTCTCTGGTCCGTCAGTTCCTGTCGTCTCT GGTCTATCAGTTCCTGTCGTCTCTGGTCTATCAGTTCCTGTCGTCTCTGG TCTATCAGTTCCAGTCGTCTCTGGTCCATCAGTTCCTGCCGTCTCTGGTA CGTCAGTTCCTGCCGTCTCTGGTCCATCAGTTCCTGTCGTCTCTGATCTA TCAGTTCCTGTCGTCTCTGGTCCGTCAGTTCCTGTCGTCTCTGGTCCGTC AGTTCCTGCCGTCTCTGGTCTATCAGTTCCTGTCGTCTTTGGTCTATCAG TTCCTGTTGTCTCTGGTCCGTCAGTTCCTGTCGTCTCTGGTCCGTCAGCT CCTGTCGTCTCTGGTCCGCCAGTTCCTGTCGTCTCTGATCCGCTCATTCC TGTCGCCTCTGGTTTATCAAATTGTTATCAATATAATCAAGATGAATTGA TTGCACTTCCACGCACTCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCGACCCTTCTCTCACTGAACACTGTAGA TATCAGATGTCTTAGATTTTATATCATGTAAAGAATCATAAACTACTATA TCAATCGCTTCACTTTAATCCAAACCATCAATTTGTACAATAGGGCAGAC AAGACTTAAAATAAAAGCCGAAGTTTAGATCATCATGGTTATTATATCAT TGCCCGTGTCAAAATTATATATTATATATCGTTCACAAATATTAAAATTT ACAAAAAATTTTCAACATCGAGAAAAAATAATCAAAATATATTACTATTT ACAAAATAACATAAAAAGAGTTTTCAAATCAGTGTCATTAAAGTTAACCA TAAACTTTTATGTCCCAAATAAACACCCACCCCCACCGGTTAATTTTTCG AGAAAAAAAACCCCAGATATTAGGACCTCCCCGTTTATTAAGTTTTAAAA ATATTTTCAGCTTTTGAAGATAAAATAGCCTTATATTTACCTTAATTTTG GATTGTAAGAATTACAATTTCCCTGGCAGATAGGCCCACCATTTATATGA AAATTTTATTAAAATTTTCCAAATTCGAGTAACGGGACTCTTGTATTTTC ATACTACCGTGCCGGGCTAAAAGACCAAAATAGACATGGAGACATAGACA GACATGCATGTTTTGGAAAATGATCATTATAAACAGAACTTTAACCAAAC AAACTAAACTCAAATCTATCCCAGCTGAGAAGGAAAAAAAATTTCCCACA AGATTTATTTTCCATATTGAGACCTGAGGTTGTCAGATATAAAACTTTCC AGGAGAAATAATTTAATTTTTACATTCAGTTAAAAGGCTATAGACTGATC GCCCTCTTGTAAGAAAGATCTTTTACTGTATTTTAGTTTTTAATATAAAA ACAACAAAGTGCGTTCTAATAAATAAAAAAATCTTCAGAAAAAAATCAAT AAAAATGTTCCCATAAAACAAAATTAACCTGTGCCAAAAATATTAAATAA GTTGAAAATGATTGTCAACAACAACAAAGTGATCTACCAGAAGGAGCCTT ATGAAAAAATAGAGAATCTAATCATGGCATATACCTATCAACCTTTAAAG TGTAAAAAGACTGGGTTCGTGTTTACCACTGACCTTTATATACCCTGGAC CAAGCTTTTTTGNAAAGTAGATCCAGCGCTCTCGATGCATTTACACCGCT ATTGAGTAGTGCCGCCATTAGGGTACCACTTTTCAAAAACTCCGATCAAT GATTTTGCTTGGCCTGGATTGAGAAGCTTGGTCCAGGGTATGTAAAGGTC AGTGGTGTTTTACCGGGGAGGAATGATGTCAAAATATCTGAAGTCGTTGC ATTAATTCTCTCAAAGACAAAGAATTTTGACGTGATTTCCACGACTGGTA ATGAACTTAGAAACCGACCACACAGTCAAGGGTTGATAGAAGTATCTATG ATGATATGCGCAACTGCAATGACTTCAAGAAATTATGGAGCTTCGACCCA ATACGTTACAAAGAAATGACCATGTGCTGTAAAAGTGACTGTCAAAGGCC AGAAAAAAAAAAGATTGAGAGGATTTTCATATCCTGAAATTCCTACCTGC TTTTACATTTTCTTAATGAATTTGAGGCCTAACAAGATTTGTTTAGTAAC GCAGCCTATTGATTTTTCTTCACTCGATATCATTTACTTTAAGCCCGCAA TCTCATTTGATACCAACTGGAAGCCACGTGTTAAGGGAATAAGTTTGATT ATGCTGGCAAGGTTTCTATATAGTAGCAAAAAAGGAAGCACACTTAAAGC AATTTGACTTTAATTTCCAATTTAAGGTGTTGTTAAAACTTAATATTTTC ATTCCCAACCATCATTCACGACACTCACCATACGTGCGTTATTACATAAT TTATTTTACAAGACAGTTTTACTTGTGCGCACTTGTTTTGGAATCAACAT TGCTTCATCATTATCGATTTGATTGGGCAGTGAAACCATGGATGATGTCA TATCT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_033843XLOC_033843Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00053659-exon-scaffold_233-1575043694:427278..427302TCONS_00053659-exon-scaffold_233-1575043694:427278..427302Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00053659-exon-scaffold_233-1575043694:416098..417959TCONS_00053659-exon-scaffold_233-1575043694:416098..417959Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00053659-exon-scaffold_233-1510915933:427278..427302TCONS_00053659-exon-scaffold_233-1510915933:427278..427302Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00053659-exon-scaffold_233-1510915933:416098..417959TCONS_00053659-exon-scaffold_233-1510915933:416098..417959Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00053659-exon-scaffold_233-1491911889:427278..427302TCONS_00053659-exon-scaffold_233-1491911889:427278..427302Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00053659-exon-scaffold_233-1491911889:416098..417959TCONS_00053659-exon-scaffold_233-1491911889:416098..417959Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_233supercontigscaffold_233:416098..427302 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.0430222 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00053659 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top