TCONS_00052675 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00052675
Unique NameTCONS_00052675
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length1605

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00052675 ID=TCONS_00052675|Name=TCONS_00052675|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1605bp
gcaTGATGGAAGAGAAACCAGAGTTGGTGGCTACTGAAGATGAAATACGT
TattacaaatgtcaaaaattacGCGGGAAGTTTGACGAGAAACTTCAGGA
GAAAGTATTTGATGAAATGAAGACTGAAGATCCTCAGGAAATCTACAAAT
TCTTTGAAACCAAGAAAAAGCAAATCCTAAAATGCAGGAAAAATAAGACC
ATCAATGCTGACCAGTTTAACCTTCTCCTGCCATCGCACGGCGAGACAAA
TGTTAAACTGTTTGATACAAGCTTGCTGATTTTTGTACTGACAGAGTTTT
TCAATAGCGAGCATCATATTCTGAAGAAAGTCCGAAACTGGTTGCAACAT
AAAACACCACCTGAACTCGACGAGCAACAATTCAACGATATCTTTGATGC
AGTCGAGAAACCTTTGATGGATTTAGGAGTACCAAAGGAGGATTtggaaa
gaataaaaaaaatgagagtGATGGATGCTGAAGCTAAAAGATTGCTAAAT
ATCAAATCCTTCAATTATAACTGTCAACCTCCTGTTGCCAATCATCACCA
TCGGAAAGCAGTTATTGATAACATCCATGCAGCAATGCTTCTACAACATG
CAGATGACACAAAGTTTGGAGTTGTTGTCAGTGGATTACCAGGTTGCGGA
AAATCTGAAGAAGCTAAAGTCTACTGGAAGACCTTCCAAAAGAAGTATTA
CGAGGACGTAGTCTGTTGGGTGAATTGTAATGACTATATGTCTATGCTGA
AATCCTTTGGCGATATTGCTGACCGATGCGGAATCAACACCAAAAACCCT
GACGGATCGTACAGAAAGTTAGAGGAGATTGCGGACCTTGTGTACAAGTT
CTTTAGTACGGAACAAGAAGGAAACATTCCAAGGAAAGTTCTATTTATCT
TCGATAACGCTGATGACCAAAATGACGTTGGTAAATTCATTCCAACGGCA
AACTATGATGCAATACACATGCTAATCACATCACAGTGTCAAGTATGGGA
TCCACGTTTCCGAGTTATCAAGCTCGATGTTTTCACAGTTGAAGAATCTC
AAATCTTTCTTCAACAAAATATCAAACGGGATGAAACAGAATCCACGACC
AAGCAGCTCTATGAAATGCTCGGGTGTCATCCTTTAGGTATGCAACAAGC
AGTATCCTACATTAACGAGCATGGCATTGATATAGAAACTTACATTATCG
AGtttaaaaagagacaaaaggaGTACATGTCAAAGGAATCGGATCAGATC
GGAAAAGCGACCGTTTACACTACCTTATCGTTAGCTTACGAGAGAATCGA
GAACGAAGGAGACAGCGCCATTATCCAGCTAATCAACATCATTGCATATC
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GACTTATCAGCGTTGAATGACAtacttcattttttatcaaaatattcaat
caTTAATATCTCATTGTCAAATAGCAACACTTCGTATGCTGAACAGCAAC
TAACGTGTCATTCCTTAACACAAGCATTCTTGAAAATTCACCAAATTGAT
AAACGTGAAGAAATAATACAAAGGCTTGGAGCAGTTTTCATCGAAGATCT
AAAGA
Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00052675-protein

>TCONS_00052675-protein ID=TCONS_00052675-protein|Name=TCONS_00052675-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=534bp
MMEEKPELVATEDEIRYYKCQKLRGKFDEKLQEKVFDEMKTEDPQEIYKF
FETKKKQILKCRKNKTINADQFNLLLPSHGETNVKLFDTSLLIFVLTEFF
NSEHHILKKVRNWLQHKTPPELDEQQFNDIFDAVEKPLMDLGVPKEDLER
IKKMRVMDAEAKRLLNIKSFNYNCQPPVANHHHRKAVIDNIHAAMLLQHA
DDTKFGVVVSGLPGCGKSEEAKVYWKTFQKKYYEDVVCWVNCNDYMSMLK
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DNADDQNDVGKFIPTANYDAIHMLITSQCQVWDPRFRVIKLDVFTVEESQ
IFLQQNIKRDETESTTKQLYEMLGCHPLGMQQAVSYINEHGIDIETYIIE
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TCHSLTQAFLKIHQIDKREEIIQRLGAVFIEDLK
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_218:475002..521349-

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00052675 ID=TCONS_00052675|Name=TCONS_00052675|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=46348bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_218:475002..521349- (Clytia hemisphaerica)
GCATGATGGAAGAGAAACCAGAGTTGGTGGCTACTGAAGATGAAATACGT
TATTACAAATGTCAAAAATTACGCGGGAAGTTTGACGAGAAACTTCAGGA
GAAAGTATTTGATGAAATGAAGACTGAAGATCCTCAGGAAATCTACAAAT
TCTTTGAAACCAAGAAAAAGCAAATCCTAAAATGCAGGAAAAATAAGACC
ATCAATGCTGACCAGTTTAACCTTCTCCTGCCATCGCACGGCGAGACAAA
TGTTAAACTGTTTGATACAAGCTTGCTGATTTTTGTACTGACAGAGTTTT
TCAATAGCGAGCATCATATTCTGAAGAAAGTCCGAAACTGGTTGCAACAT
AAAACACCACCTGAACTCGACGAGCAACAATTCAACGATATCTTTGATGC
AGTCGAGAAACCTTTGATGGATTTAGGAGTACCAAAGGAGGATTTGGAAA
GAATAAAAAAAATGAGAGTGATGGATGCTGAAGCTAAAAGATTGCTAAAT
ATCAAATCCTTCAATTATAACTGTCAACCTCCTGTTGCCAATCATCACCA
TCGGAAAGCAGTTATTGATAACATCCATGCAGCAATGCTTCTACAACATG
CAGATGACACAAAGTTTGGAGTTGTTGTCAGTGGATTACCAGGTTGCGGA
AAATCTGAAGAAGCTAAAGTCTACTGGAAGACCTTCCAAAAGAAGTATTA
CGAGGACGTAGTCTGTTGGGTGAATTGTAATGACTATATGTCTATGCTGA
AATCCTTTGGCGATATTGCTGACCGATGCGGAATCAACACCAAAAACCCT
GACGGATCGTACAGAAAGTTAGAGGAGATTGCGGACCTTGTGTACAAGTT
CTTTAGTACGGAACAAGAAGGAAACATTCCAAGGAAAGTTCTATTTATCT
TCGATAACGCTGATGACCAAAATGACGTTGGTAAATTCATTCCAACGGCA
AACTATGATGCAATACACATGCTAATCACATCACAGTGTCAAGTATGGGA
TCCACGTTTCCGAGTTATCAAGCTCGATGTTTTCACAGTTGAAGAATCTC
AAATCTTTCTTCAACAAAATATCAAACGGGATGAAACAGAATCCACGACC
AAGCAGCTCTATGAAATGCTCGGGTGTCATCCTTTAGGTATGCAACAAGC
AGTATCCTACATTAACGAGCATGGCATTGATATAGAAACTTACATTATCG
AGTTTAAAAAGAGACAAAAGGAGTACATGTCAAAGGAATCGGATCAGATC
GGAAAAGCGACCGTTTACACTACCTTATCGTTAGCTTACGAGAGAATCGA
GAACGAAGGAGACAGCGCCATTATCCAGCTAATCAACATCATTGCATATC
TAGATGGAAGAGATATCAAGAAAGGTCTCTTACTCAAATCTGTCAACGAC
GACTTATCAGCGTTGAATGACATACTTCATTTTTTATCAAAATATTCAAT
CATTAATATCTCATTGTCAAATAGCAACACTTCGTATGCTGAACAGCAAC
TAACGTGTCATTCCTTAACACAAGCATTCTTGAAAATTCACCAAATTGAT
AAACGTGAAGAAATAATACAAAGGCTTGCAGCAGTTTTCATTGGAGATCT
TAAGATATGTGAAAGAAATAACCTGAAGATGGATGGATATTTCTGGTATC
AGCATTTCCATCATATTTGCAATAGTGATCAAGATAGTGCACTCTTAATG
GAATTCAAAGAACATCAAGTATTACTGATAAATTTATTCAAAACAAACGG
AGACATTCAGAGACTTCAATTTTTTATCGAACAGATTTTAAACAATTTAC
TCGAAAAACATGATGATGACCATCATTTAGCCCATTTAGTGTTGGAAACA
CAGCACAATATTGCGTTCTGCTTACTAGAAACCGGTCAAACGAAAGAAGC
TCTCGAAATTTACCGACGAGTTGAACAGAAGCAGCTAAAAATATTGGGCA
CTGATCATCCAAGGGTGTTGATAACGCAACACAATATTGCGCAATGCTTA
CAAGACACCGGTAAAACGAAAGAAGCTCTCGAAATTTACCGACGAGTTGA
ACAGAAGCAGCTAAAAATATTGGGCACTGATCATCCAAGGGTGTTGATAA
CGCAACACAATATTGCGCAATGCTTACAAGACACCGGTAAAACGAAAGAA
GCTCTCGAAATTTACCGCCGAGTTGAACAGAAGCAGCTAAAAATATTGGG
CACTGATCATCCAAGGGTGTTGATAACGCAACACAATATTGCGCAATGCT
TACAAGACACCGGTAAAACGAAAGAAGCTCTCGAAATTTACCGACGAGTT
GAACAGAAGCAGCTAAAAATATTGGGCACTGATCATCCAAGTGTGTTGAT
AACGCAAAAGAATATCGCAGATTCTTTGGTAGATATTGAAAAGAAAGAGG
AAGCCGTTGTCATTTACAAACAGGTCGCGTCAAAACAATTGAACGTTCTT
GGTGAACAACACCCAGACTTACTCATCACGAAATACAATTTAGCTGTTTG
CTTGCACAAAATTGGACGAATTGAAGAAGCTTTGGATATATTTAGAGAAG
TGGAGCAAGTGAGAATGACAACACTTGATGAAAACCATCCATCATTGGTG
AGAACCAAGAAGTTCATCGAAATGTGCTTGGAAGATTTGAAATCAAGTAA
TAAAAGGTTAGTTTATAATAAAACTGGAGGTCTTATTCAGATTTTGTGGT
AATATCTTAAATACCGAGACAAGGTTATGTAATGATGTCATTCATCAACT
ATAAATACTTCAAATTATGTGGAAAGGATTTTCAAGCATTTTACGCAGTT
TTACGTTACTTTACTTAGATTCAAGTTTTTGGTGCGACAGTGAAAGTATT
CTCACGGAAGAAAAAGTTCAAATGATGGACTGATTTTGTGAAAATTGACA
ATCAAATATTAAATGTATTACCTTTAAGTTATCTTCGTTTGTATTTATTG
CGTTTAAATGCTTTTTTTTAGTGTCCTGAAGAGACGATGTGTTATTGCAT
GAGCCTGAAAGAAGATGAGATACACGTAAGAGAAACTTTTTGTGTTTTCC
ATAATTATAAAGTCTTTCTTAGATAAAAACCTCCATCGTTCATGATTTCT
AAAATAATGGATGATTTTACTAAAAACCATTCACGATTTGTTTCAGAATT
TTCCAATGTCACGCTTTATACATTATTTCAAAGAACAGCAAAAATATTCG
GATGGCTGCACAACTAATTCGATAAATAAACGAACAAAAGTATACTTCAC
CAGAAACGTTTTGTTATTGTGGTATAAAGACTTTTCAGCAAAGAAATAAA
GAGTATTTAAATTCAAAATATCAAAATGTGACAAAAGGTAAAATTGAAGT
GAAGATAATCATGAATCATTGATCGATAAACAATGAACGAGAAGACAACA
GGCTTCAACGAAGTAGCCACGACATTGTTCATCTAAGCTGTCGACTGTAG
TTTCTTTGCCCCTTCAAACGGTATTTTGATGGAGAATTTTTTTGTTGAAA
AACTTTCAATGCAACATAAATTGATGATCAAAATGGAAGGTTTCATTAAT
CTGAAAAGAGCTTTTTGATACAGATTCGTTAGATGAAACTAACAATGCGA
ACCAAATGAACAAAATAAACATTTTCTATATTTTTTATCGATCGCCTGAG
GGCGATTTCAGTCCAATCTCATTTTTGAATCGAAAGTAAATGTTTGACTC
GCTTACCTTTATAAACTCATTAAGTTTCCTTACATCTTGTCTGAATAGGA
GAGATTTTAATTTTTTTTCAGGCTATATCCCATCCCCTTCCTCAAAGTGT
AACTTTTTTCTCCAGGGTCTACGCCTTACTTTTGCTTTGATCATGTGTTA
TGTACTGACTAATAATGGCAAAAGTTGCAGATCAAATAAAATGTATAACA
GGCTTTAAGTAGTTTATTGTATTCATCACTTTTGTATTGTTTATGACGTC
ATTCTCCTATCATTTCAATGTTCGTCTCATTTATCCATGTTCATTATGCC
ACATTATGCTTAGAGCAGTTAAATTGATTTACTTTAAGCGAGACAATAAT
TTCACAGCTGTTTTAAAACGCATGCGTAAACATTTTGTTTTTTATTACAA
CGATTTTGATAGTAAAATTAGTAGTCTCTCGAATTGAAATTGCATGACCT
TTAAGACAAAACAACGATAAAGTAGCTTTTAAAGAGGTAGGGTTCACTCG
ACCATTTTGCTCGACTTTATAATTTCTTCTACCTGCTCTATTCTTGCTCT
ATATTATCAGAGCATCAGAGACAGATCCGCATCGCAGGGTGTAAAGTAAT
AAACCATCAACCTTGCCCTTCTACGACTGAACGAAAAAATGGACAAAGTG
AAAATTATTTTCTTAGTGAACACTACAGAAGGTTCTTTCTCCGATGACTT
TCTCGAAAATAAGTGATCGCCAACAGTGTGTTTGAAACACGCTGACCTAG
TATTAAATAACACTTTAAACTTGTTGCCCCGCAGGGGCTTTTGTTGCTTC
ACGTAGCGGACTTGCTCGCCAGAAAAATATTCATGTTGTTTCTTCAGATT
TTTTTCGTGATATTTTTTTAACTTTCATGCCATTTTACACAGAGCACTTG
TGAAAGCGAGAAATCGAAAGTCTCGTCTGCACTGCCAGTCTACACAGCTT
TAAAGTTTCACAAACAACAAACAGCACACAAGATTTTTGCTTGGTTAATA
TCTTTTTAACGTAGTTGCTCAAAACTAAAAATGGATTTAGTTGAGGGACA
TTGTTTGCTACTGAATGAATAACTATCAAACTACTGATATTGGATCAAAC
CTTATACGATTGTCAGAATAGACCTTTTCGCCTTTGCGTCCGCCATATTG
AATTGTATGCAAAAATTATGGTTGCCGAATTGCCGTGGTGAAATTTCCTT
AGAAAGTATGCAAAACATATGCAAAAAGAAAGTATTAAATAAAAACTTAC
ATGCATAATTGGCATTATATTAAAGTGTAATCTTGTAGAAGAAAGATTAA
ATTTGCTTCTCTTGAAAACTAAAAACAATTATATTCACTCATCTCTTAGA
ACAAGCACTTCAAAAGACCATAACATTATCGACATTAGACAGAATCTCAA
ACTGAAAAATCACCCGCGAAGGTAAAAAACAATCCTTATTCGGCTGACGG
CAAATTATTCTCCTGGGAATAGAGCCGCCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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CGGCATTTTCGTTCCTGTATTTTTGCATACAATTCAATATGGCGGACGCA
AAGGCGAAAAGGTCTATGGATGACATCTTCAACAATGACAGTTGTTTTAC
ATTAGCTACACACACAGTCAATACGTTGCTCTACCGGAAACCCTACTGAT
ATTATAAAGGCGTAGACAAAAGGGAAATTGACTGTTAATTCATACTGTCT
ACCTATATAGTGACTTCATTTTGAAGGAAATTAAATTGGATTTTTTAGTA
GAAATCGACAAAACCCAGTACCCTATATGGATATTGCATGCGCCGAAAGT
AATTTTTCAAAGAGTAAGCCTTGCGCCAAAACGTGCCAAAAACTGGTACC
AACATTGAGTTTCTTACAGAAGGTTTAGTGAGTGAGACATGCCAATGAGA
ATATACTATGACTAACATGAACTGAAACTGATTCATTCTCGTGGACATTT
GAAGCACAGTGTTACAGCAAAAAAATGGTTGAGCATGGGGAGCAGCGAGC
AGAAAAATGTAAACAGAAGTGGAACAAAAGCCGAAAAAACGATGGATTAT
GGAATATTTGATGCTATTTTGTGAATAATTCTTTACGCCAATATTGAAGC
TTTAGCAAACTTTGAAAATGCTGTTTATGCCACTATTACTGTGCCAGAAC
GGTACTTCGATGTGTATGTACGCCGAAGATTTTCAGCCCTAGTAACCTGA
ATTCCAGACTGGGACAACATTTCAAGCTTCTAAGAAAAGCTTATTATTAC
ACACGCTATTGGAGTAATTTCAATTTGAATTGTTTTGTCACATATTATGA
ACAGACTCGAACACTNCTTATTATTACACACGCTATTGGAGTAATTTCAA
TTTGAATTGTTTTGTCACATATTATGAACAGACTCGAGCACTCTCTCTAC
TAATACCACCACTGCACACTGTTAAACGTAGGAGCGTACTTTGCTCAAAT
AAAAACTGAACAAACTTTTTGACTTTTTAGAACCAGACGTCCAATAAAAT
ACAAGCACAATGTTGTACCTACCTGTGAAGTGAAAAGTTTTTAACCATGT
TGACGGTGGTTACAACGGGACACGGTGTCTGAAATAACAGTCATTTTGTT
GAAGAATCTCTGCTTTCTTGCTTGTCAGGGAAGTGGAAGTGGATTACAGC
GATAGAAAAAATTGTGTACAGTGGCGGATTAGATGAAGTTTTAATATTTT
CATAGTGACTAATTTTCGCTTAAGGCCCCTTTTCAGATTTTCTTAGGATT
TTATTTTATGGTCTTTGTAAATAAGAACAAAGGCTGGGAAATCCGGGAAA
TTTAATCCCTGAAAATTAATACCTTTATTAAAATTATCTGATTCAACTGC
CAATTTTGAGAGCAACTATCAAATTTATATCTTTAGTAACCATGAAGAAA
TTTTATTCAATCAATTTCATTTTGGAATTCAACTTTAATCTGCATTATGT
TCTTTATGGGAACGAAGCACTTTCAGTTTCACAGTACACATTCTTATGTT
TGGGTTTTCAAAAGTGATCTTTATCTGGTGATTGAAGAAAATCAACTTTG
ATATCATTCTAGTTCTTAACATGTTGCAAAACCTGTAATGGTTTTAATTC
AGGTCACTTTGCATCAGAAAGTGTAGATTTAACATGTTTTTTTTTGGATT
GACACTTTCGTTATGTATGGATCTTACTGAGAAAATTTTAACCGCATCGG
CTCGTGTTTCTTAGCTTTAAACAGCTCTAGTAACATTGAGCACTTTTTAT
GAAGACTCACTTCATCAATTTATAGTCTGATTATGATTCCCGTGCTCTCT
TCATGGCTAAGTTCCTCTGGGCTAACATCTGCTATTGGCGGGGCATTCAT
AGCGACAGCTACTTGCTAGTAATATATTATATGAGTATATGATATAAATT
TGTTAATATTTTGGTGGTAAGAAGGATACTATCATAATGAAAATTCTTGG
TATCAGGATTTATTTCAAGCAACAAGCTAAGAACTTTTTATGCATGTATC
TCTTACAATAGAATTACGATAGAATTCAGCCGGTCTATGGACGATCAGCT
TTTCCCGCCCTCTCTTGATTGTTGGAGTTCTTGACTGAACTTTTTCATCC
ATTTTTTGAGATCATCAAGATTTTTTAAGAGCACTGCCAATTATATAATA
TAACTGATATACTTAATTTTTTTAAAACTACTGGTCTGTAAGTCCTTGAC
TTTATCGATTGTTTTATTTAAAAGGTAGACTGGAGTCGTTTATAATGCAT
GTAATACTAATAATAAACACAAATAATGATACGGGATTTAGTTTGTATAA
ACGACTGGAAGANTGATGTACATATATTTCCTGTTTCCTATGTGAAGAAG
GTATTCGGAAGAACCAAAGAGGATGTATATACATAACCATTGATAGCTTT
TGATCCACAAATGATTTACACCAAATTTAGTTGCCTCGAGTTGTTACCTA
GGATCAGTCCTTTCACTTTCTAGACCTTATTGTGACCATCGATCAAAGAT
GCAGTTAAATCATGTAAAATCGTTTTTCTATCAGTCGTTACTGCAAAATA
AAAACTCATGAAAAAACAATTTTATTTAAATTTTCAATTTCATTTAAAAC
AATATTTGTATTTTTCAGGATTTCATGCCCATAATTGGCCCAGCGCTAGC
GAGTGTAGCGAGTGGGCCTTTAAAGAGAGTGTCACTATTTTTTTTCCGTG
TTTCCTTCTGTGTGTCCGTTTTGGTAGAAACGGCGCTTTATACCAGTNAC
CGTAAGAATATTTTTGGATGATTTTCGCCAAAAAGTTAAGAATACCATGA
TGAAATGAAAAAACACCATTCTTATAAAAAAAAGCGTGTATGGGTATTTG
AGATTTGAAGTTTAGTATATGTTGACATTATTTCGAAGTATTTACTTACA
TAAATTTGCACTATTTACTCACGGGTAGAAAGGATAAATATTTTTTTCTG
TAGCGTATTTTTTCACATGACGATTGAAAGTATGTGAAATATCATTTTGT
TTTTACTGTAAACACTTTAATAAATAAGCAAATAATTTGTTGTTGTTTTT
TGTGATACGTTTGATGTGGAAGTTTTAAATTTACTGAATTGCTCTTTCTG
TGTTGGATATCGCAGGTTTGTTATAAATTTTTATTAGTTATTTTAGATAA
ATGATGTACCCCGGGGGGGGGGGGGTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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TGGAATTTTTGGAAATCGCGTAAATTACGCTTTTGCTGGGCCTTCACGCC
TAACGGGCTTCTTGTTTGTCAAAAAACGGGTTTGAAGGTTCAAAACTTTT
ATTGACTTCATTTTTGACACCCATTTCTCACAGACCCAGTAGGATTTTTT
CAGCAAGTAGGGATAAAAATATCGGACTAAAACTCGATGGGGATTGATAT
TCCCATATTTTTTATGGCTGGGGATTGAAATTCCATTGTTTTCAAGTCAG
AAAATTCAGTGGGGATGGGAAAAACAGCATAATATTTTGCAGTGAGGATT
GGTTTATTTGATTATTCTCAGTGAGGACAAAAATTGAGGTATAATTTTCC
ACTATATAATTTTTCCAGTGGGACAGGCTCCAACAGGGCAACCACTCCAA
CATTTCATCCAATATTAAAAAAACTACATGTTGGATAAAATGTTTGACCG
GTTTGTCCTTGCCTTTACTGCTTTAAAACAATAATAACTAACACCTTTAA
CAAGTCCATCATTTAAAGGTTTTGTTTTTACATAAGTGTTTCCGTTTCAT
ATCAGACACATATTTCATATCAGGACAGTGTCTTGCTATTGTTATATTAT
GCTTATATAAGCAAAAAATGTTTTTCTTTTCCTCTTTCTGACCAATCTTG
CTTCACATCCGTACCAATTCAATGTGAAAAAGCTTGTAAATTAAAATTGA
CGAGTAAGCAAACGTTATCACTCTTATTTAAAAACAAAACCTTTAATTAC
TCCACCCCAAGAACTATAAGTGGACACGATCATTAATATGAGACCAATTT
TGGCCTACTTGTGGACATTGATACCATGTGTTAAACTTTTATCAATTATT
TGAACATAGTGAGTATTGACAAATATCAGTGGATATGTTATCTTCAAAAA
TTGATAAATCTTTAACACTGTTGAGGTCCTGTGTCACAACGATCAAATCA
AACAACTTATTAACACCTAAAGTGATGACAAAAAAATGATAAAAAATTAA
CAAGGTCTTTTTTTTGGAAATGATAAAAAATAGTCTAAAACTTTAATTTG
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AAACTTGGTAATTTTTATCATAAATTTGTGGGAAACTGCCAAAATTTGGG
TCATTTATTTTTAACTCTTTGTTTTGATACATATCTCTTTAAACTATAGG
CAGAACTACAATTTTGAATAATTTGAACAAAAATAGATAAAAACTTAACC
AAAACTAGTATGTACTTGTAAATATTACACTAATTAAGTTGTGTGTTAAA
ATATTATCAAAATTGACATAAATGGTTAAAAAATGACCAATTGTTTGCAT
ATTAACAAAATCTTGAGTATCAATGGAGCGAAATCAGAAAAAGATAGNNN
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GACAATTAAAATTCAGAAACTTATTAACAAAACAAATTTTTGGACAATTT
TATGATGTCCACAATGGTGTCTCATATTATTGATCGTGTCCAAGTTGTTA
AATGGTGGAAAATAACAAGACTTTTTCCCTGTTAATCTCACTTCAGACCA
AAATAAAAAACAAGCACGCCAGAAGAGCCAAGAAAGAGAACCATATGGAA
GTTTGAGGAAATGGTTAAACAGAACCGTTAATTCTTACCTGTATTCACTT
GTTCACTGGTGTTTTGTTCTTAATATTTGGTTTCTTTGCTCAAAGAAATG
TAAGTATTGTCCATGATAATAACGACTCTCTGTTTTCCATTTTTCATTTA
CGCATGTCAAGTAGAACATTCATAAGAAAAATAATAAAAGAATGAAGTGT
TTGTTTAAAGTACAATGAAAATAAGCGAATACTATTTAAATTAATGATGT
TTGAATTGTTATTTTATTTTGAAAAAGAAAACCACCACGATATTTATACA
TGGTGAGTGTGACCGAGGAAAGGCCGAAAAATAAATCAAATTTAGTGAGT
TTGCGTCCACCGTATCGAGTACTTCCGTTTTCTTTTTTATTTTCCTTACC
ACCGCCGCCGTAGAATGCCTATTTTGTAATACTTTCGCTAAAGCAAAATT
AATAAAGGTTAAAAGTTTATTAATTGCGCTTAGCCAAAGTATTACGATAA
GTTTTCGCGGTAGTCGGTGCGGAATAAAATTTAGAAACGAAAGTGATCGA
AACTTCTAGAACATACATTCGTTAAGATAAAATCTAGCGTTTTGTTTAAT
GATTCCAGTCCGCAAGTTCTAGGTAAGCGTAACCAAGCATTTGTAAACAT
TGCTCGTTTTTAAATGGTGGTTTTATTTCAGCTTGCTGTGAGGCGGCTTT
GGTTGTTTGTGTTTATCACCACACCACTACACGCAACAATACAGACAGGT
ATGAACTTTTTTTTACAGGTAGAAATAGGTGTTGATAGGTTGATTTAGTT
GTGTAAGACAGATTATCAGTTACTAAAGTCTGTCTCAAAATAATTTACAG
GTTGAGACGAAAATGGCTAACTTTTGATAAAATTCGAATCAAAGTTGCGA
TTTTGTGTTCATTGAAAAGATATTTGTCAGTGGAATATTATCAAGCAAAA
AAAAATCGAAAAATAAAGAAAAATGAAAATTAAAAATGAAGAAGAAAAAA
ATCAACTTCTTGTAGAAATGTGGTATGATTACCATTTTCACTACACAGGA
GTGATTCTTCAATCTTAGATCATTATCACTGTGAAAAAAAATTTCCAAAA
ATATTCATTCGATTAAAAAACATAGAACAAAAATTATTGCTGATTGACTC
TATGAAGTAGTAAAAAATGACAAAAACAGCCTATTGTCAATCAACCAATA
ACAAACTTTGTGTGATATCTTTTGACAACCAAAGCCGAATTTCCCAAAAA
GTGATTTTTTTAGAAAACTCTGTGCTGGGAAGTTTTTGGAAGATCGAGTT
GGATCCACGCTTTTCTTTTATAAAAATATGAAGATGCAATACAGATCTGT
TGATGAAGATTGAAATTGACTTTTCCAATAAAGAATGTCTGAAAACTGAA
CCCAAAAACTAGAAGAAACAATCTACAATGAAAAAAATACGACAAAAAGT
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TATAAAGACACAATCTGCGCGAGTTATTTCAAAACACAGACTTGTAGTCC
GGTAAAATTACATTTTTACCTTCAAAAAAATCATATATGCTGTTGAAATT
TGAGTCCTAGAACCACCAATAGAAAACCGCATTCAATTCTTTAGTACAAG
CGCCTACAAACTACGGTGAGCACTACAGCTTTCACTGAAATTAAACTGTG
GAGACATACTGTAAGGATTTTATCGCGTGTGTCTCAATCACATCTAAAGA
ATTGAAAATGGAGAGCACATATGTTATGTTATGCTCAAGTAGATAATACA
ATTTTTAGTACTATCTAAAAATGATATGGTTTATTTCGGACTACTGGGTT
ACGAGGACATCAAACAAAACTACAACCAATTCATTCAAGTGGAATCAACT
GGTAGTGAAATCAGCTTCAGATGTGTCAAATGTCGAAATTGTACCACCTG
CAAAGAACACAGTACTGAAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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TCCTTCGGTGGAGGGGACATAGATTTGCATTCCACACCGACATCCAGAAG
ATGTATAACACTATCAAGCTCGATCAATCTCACTGGTGTTTACAACGATA
CCTATGGCATGAATCACTTTCCCATGATGCATTACCAGACGAAAAAATCA
TCAAGACTCTTATATACGGAGTTAAATCAAGCAGAAATCAGGCAGAATTC
GGTTTGAGGGAGACCGCCAAAATCTTCCAAGACCAATATCCAAATGTCTA
TCGTACTGTTTCAAAGGATATCTACGTCGACGATTGTTTATCTGGGCATT
CAACACTGGAAGAAGTCCAAGAAATGTCCAACGAGCTTGAAGTAGTCATA
TCCCACGGTGGTTTTGCTCTCAAAGGTGTAACAATCTCAGGAAGTCATCC
AAACGAAAATCTCTCATCAGACGGTGAAACAATATCAGTTGCTGGAATGG
CATGGAAACCAAAGGAAGATTCGATCGCACTTGACATCAAAGACCTCAAT
TTTGCAAAACGTTATCGTGGCAAGAAAGTTGGTGTCATCAATGAAGTACC
AGCAAAATTAACCAGAAGACAATGTGTATCCAAAGCTTCAGAAGTCTTCA
ACTTATCCGGAATCATCACACCAATCACAGCATCGCTCAAATTGGATTTA
CATGATCTAGTAAACCGAAAACTATCTTGGGACGACACATTGCCTGAGAA
TCTTCGTCAACTCTGGATATCGAACTTCCAACTCATCTCAGAAATTAAAG
ACATCACCTACAGAAGAGCTATCGTACCTGAAGATGCTGAGAGTCTACAA
ATCAACACGTTGGATTTTGGTGATGCAAGTCAATCCATTGCATGTTCAGC
AATATATATTCGTTTCAAGAGAACCTGTGGCAACTACTCGTGTCAACTGA
TTTTTGCTCGTTCACGTATCCTACCAGAAGACATGACTCAACCAAGAAGA
GAACTAGTAGCAGCACTTCTAAATGCTCACACTAGTGAAGTAGTTTGTCA
GGCTTTCTCAACTCAACACAACGCATCCCACAAGTTCACTGACAGTCAAA
TCGTTCTTCACTGGTTATGTAATGAAGACAGACCACTCAAGAAATGGCTC
AGGAGTCGTGTGGTTGAAATCAAACGTTTTTCTTCATCATCAAATTGGAG
TTACATCAAGAGCACTGACATGATCGCAGACATAGCAACAAGGAGATGTG
ACTCAAATGAAGTCATTGCACCCAACTCTACATGGATCAATGGATTCCCA
TGGATGACTGGTGACGACTTCCCAAATCTCACAGCAAAGGAAATATCACT
CAGCCAGAAAGAACAACAGGAAGTTTCCAAGGAAGTCAACACAACAGAAC
AAAAATCACACTTCACCAAAGCAGATGTCAACGAAGCATCCAAGTTCTAC
AAGTTCTCAAATTACTTAATTGACCCGTTACGTCACAGATTTTCANNNNN
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GTTGAAAGAAAGATCCGAGAGATTCGTCGATCAATGGAAACTCAGTTCAC
AAACCAAAAGTTATCACTGATGCAACTCGAAACACTTGTTGCTCAAATCT
CTAACAACATCAACAATCTACCAATGGCAATTAGAGGGATAAAAGGAGAC
TTCGAAAGCGNGACTCGATTACCATCACTGGAAAAGCAACTCAAGCAATG
ATTGATCTGTCATCTACTACTTTTGCAGTACCAATTGTGTGCCGTCATTC
ACCGATAGCAATCAGCATTCTTAACGAAATTCATTGGTATCATCCAACAG
TTCGCCATTCTGGTATTGAAACCACATACATNCCAATCGACTACGTCTTG
GTCGAAACAATGATCGAAGTCCTACTGGCTCGTTCAACATCGTCTTCAAG
GATCGAATACTGGATCAGAACAAAACAATATTCGACGCCTGGTTTAAAAC
ATGGCTCGTAAACCATGTACCTCAACTCATGTTCACTCCAAAATGGTTCA
AATCAGATCGAGATATCAAGAAAGGAGATGTTGTACTCTTCACTAAACAC
GAATCAAAGTTGTCATCCAGCTATCAATTTGGTATTATCGATTCCATTGG
NNCATGTTGATGAGATTGATTTAATGCATGAACTCTACAAAATTCAATGA
ATTGTCTTGCTGGGGGGAGTGTAAGGATTCATCCTTAGTTCCCATGAGAA
AACTCCTCTGCCTTGACGTCACGAAAAATCTAGACTTATTAATTTTTTTA
ATTATTTTACGCGTCCCTTAGGGACTTGTTTCTACTTCAACTATGTCACA
GCATTTTCTCTCGTCACTTACTCAAATTTTTAATCCGAATGAACTTTGTT
GTTAACAAGAGAGCGTTGAAAGAACTTTGAGACATGAATTTGGTTTTTAA
TTTTTTGGTTGATTTTTGATTCACTTTGATTTTGATTTCTTACTTACATT
GTCAAGATCCACGACTGCTTTATTAAACCACATTTACCCTAGGCTATCTG
TTTGAACAGTCGTTACAAACAAAGCCTGATCGCATTCCTCCAATCAACCC
CAAATCCCTACAACATATGTTATGTTATGCTCAAGTAGATAATACAATTT
TTAGTACTATCTAAAAATGATATGGTTTATGTATAGGGTTTGCCAGAAAC
CGAGATATTAAGGTTTGAAGTTTTGCTGATATAGATAAAATGTCTAAAAA
TGGGCTGACTTAACCCGGGGGGGGGGGTACTTAGGCAAAAATGGATGATG
GGTATGTGCGGACGGTAAGGGTCGGTTTTTTCACCTTTCAAAGTCTCTCT
AAGGGTCGGAAAATTCAGAAAGTTTTAAATTAGTCTCTGTAAGGGTCGGA
AAATTCAGGATTTATTAGGAAATTGTAATAAAGTCTCTCTAAGGGTATGA
CTTTTTTCGATAATCGAAAAAAAAAATTCAAAAAGTCTCTCTAAGGGTCA
CCTTTTCAGCAAAAATCAGTCTCTCTAAGGGTCGGTTTTCGGAGGTCCCG
TCCGCACATATCCCTCATTCGCCAACCCTAGTACCCCCCCCTTAATCTAT
ATAACAAACGTCCTTTTTTTATATTTTATTGTCCGTGCCTAAAATACCGA
GCTATTCTTCGGAATACCGCTGCTTTTTTACGAGGCGTGCGTAATCAATC
CGAATACATATTAAAATATTTTCATATTTGTCATAGATATCCAGGATAAT
TGCGAATATCCCGGTGAAAAATCGAAAAACTTAGAGCATCAAAACAAGAA
AGGTAACGATATTATTCATTACATTCTTCTTAGCCTTATCATGTTTATAA
TTTTTAACGAATCTACATTCAAATTTATGATCAGCAAAAAATAAAGTAGT
TCTTGGATTCCCAAGTCAATTTGATGATGTCAAAAAGTACTTTTTCACGA
TGCTTTATAAACCCTGACCGCAGTATTGCCATCACGTTCATCTGCTAAGA
CCATTTTCAGACGTTATGGTTTCGTATCGCCCCGAAATGAAACAGTTCCA
AGACACTTACATTTGAAACGTCAAAAAAAAGATCGAAACGGTTTTTCTCT
TCTATTTAAATTGGAGGTATTGCTCCATATCATTGCTCTGAAAAGATCAA
AAATCAGTATGAACACTTCCTTTCCTTGCTTAACACCATACAGGAGCGAT
ACAAAAGCGTAACATCCAAACATGGTCAAATAGAATAATTTCTACACTGT
TATACTCAGTGCCTCATCAACTTCTTTTAGTTCGTTGGTCTGCGCAGTGA
ATGTAATTTTATGAAATACATGAAACAAAAATAAATACATTAGTCTGAAT
CACATACCTCTACAAAACTGCAGGTAGCTAGAACATGAATCCGTAACTGG
ATGCTAGCAGCCTAGAAAGAGGGATGAAATTCAATACTAATGAATACACG
TAGCTATTTAAAATTGTTTATTTTCAGCATGATGGAGGAGAAACCAGAAT
TGGTGGCTACTGAAGAAGAAGTACGTTATTACAAATGCCAAAAATTACGC
GGGAAGTTTGACGAGAAACTTCAGGAGAAAGTATTTGATGAAATGCAAAC
TGAATATCCTCAGGAAATCTACAAATTCTTTGAAACAAAGAAAAAGCAAA
TCCTAAAATGTAGGAAGAAAGGAGTCATCAATGTTAACCAGTTTAACCTT
CTCTTACCATCGAACGGCGAAACAAATGTTAAACTGTTCGATACAAGCTT
GCTGATTTTTGTACTGACAGAGTTTTTCAATAGCGAGCATCATATTCTGC
AGAAAATCCGAAACTGGTTGCAACATAAAANCTAATCAACCTATTTTAGT
TCGTTGGTCTGCGCAGTGAATGTAATTTCATGAAATACATGAAACAAAAA
TAAATACATTAGTCTGAATCACATACCTCTACAAAAATGCAGGTAGCCAG
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ATTGTTTATTTTCAGGACGATGGAGGTGAAACCAGAATTGGTGGCTACTG
AAGATGAAATACGTTATTACAAATGTCAAAAATTACGCGGAAAGTTTGAC
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TATGTCTATGCTGAAATCCTTTGGCGATATTGCTGACCGATGCGGAATTA
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TCATTCCAACGGCAAACTATGATGCAATACACATGCTAATCACATCACAG
TGTCAAGTATGGGATCTACGTTTCCGGGTTATCAAGCTTGATGTTTTCAC
AGTTGAAGAATCTCAAATCTTTCTTCAACAAAATATCAAACGGGATGAAA
CAGAATCCAGGACCAAGCAGANATCACAGTGTCAAGTATGGGATCCACGT
TTCCGAGTTATCAAGCTAGATGTTTTCACAGTTGAAGAATCTCAAATCTT
TCTTCAACAAAATATCAAACGGGATGAAACAGAATCCACGACCAAGCAGC
TCTATGAAGTGCTCGGGTGTCATCCTTTGGGTATGCAACAAGCAATATCC
TATATTAACGAGCATGGCATTGATATAGAAACTTACATTACTGAGTTCAA
AAAAAGACAAAAGGAGTACATGTCAAAGGAATCGGATCAGATCGGAAAAG
CGACCGTTTACACCACCTTATCGTTAGCTTACGAGAGAATGGAGAACGAA
GGTGATAGCGCCATTATCCAGCTAATCAACATCATTGCATATCTAGATGG
AAGAGATATCAAGAAAGGTCTCTTACTCAAATGTGTCAATGACGACGTAT
CAACGTTGAATGACATACTCCATTTTTTATCAAAATATTCAATCATTAAT
ATCTCATTTTCAGATAGCAACACTTCGTATGTTGAACAGCAACTAATGTG
TCATTCTTTGACACAAGCATTCTTGAAAGTTCACCAAATTGATAAACGTG
AAGAAATGATACAAAGGCTTGGAGCAGTTTTCATCGAAGATCTAAAGA

Coding sequence (CDS) from alignment at scaffold_218:475002..521349-

>TCONS_00052675 ID=TCONS_00052675|Name=TCONS_00052675|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=3204bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_218:475002..521349- (Clytia hemisphaerica)
GCTTGGAGCAGTTTTCATCGAAGATCTAAAGATGATGGAAGAGAAACCAG
AGTTGGTGGCTACTGAAGATGAAATACGTTATTACAAATGTCAAAAATTA
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CTTCTCCTGCCATCGCACGGCGAGACAAATGTTAAACTGTTTGATACAAG
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GAGCAACAATTCAACGATATCTTTGATGCAGTCGAGAAACCTTTGATGGA
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GAGGAGATTGCGGACCTTGTGTACAAGTTCTTTAGTACGGAACAAGAAGG
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CTAATCACATCACAGTGTCAAGTATGGGATCCACGTTTCCGAGTTATCAA
GCTCGATGTTTTCACAGTTGAAGAATCTCAAATCTTTCTTCAACAAAATA
TCAAACGGGATGAAACAGAATCCACGACCAAGCAGCTCTATGAAATGCTC
GGGTGTCATCCTTTAGGTATGCAACAAGCAGTATCCTACATTAACGAGCA
TGGCATTGATATAGAAACTTACATTATCGAGTTTAAAAAGAGACAAAAGG
AGTACATGTCAAAGGAATCGGATCAGATCGGAAAAGCGACCGTTTACACT
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TATCCAGCTAATCAACATCATTGCATATCTAGATGGAAGAGATATCAAGA
AAGGTCTCTTACTCAAATCTGTCAACGACGACTTATCAGCGTTGAATGAC
ATACTTCATTTTTTATCAAAATATTCAATCATTAATATCTCATTGTCAAA
TAGCAACACTTCGTATGCTGAACAGCAACTAACGTGTCATTCCTTAACAC
AAGCATTCTTGAAAATTCACCAAATTGATAAACGTGAAGAAATAATACAA
AGGCTTGGAGCAGTTTTCATCGAAGATCTAAAGATGATGGAAGAGAAACC
AGAGTTGGTGGCTACTGAAGATGAAATACGTTATTACAAATGTCAAAAAT
TACGCGGGAAGTTTGACGAGAAACTTCAGGAGAAAGTATTTGATGAAATG
AAGACTGAAGATCCTCAGGAAATCTACAAATTCTTTGAAACCAAGAAAAA
GCAAATCCTAAAATGCAGGAAAAATAAGACCATCAATGCTGACCAGTTTA
ACCTTCTCCTGCCATCGCACGGCGAGACAAATGTTAAACTGTTTGATACA
AGCTTGCTGATTTTTGTACTGACAGAGTTTTTCAATAGCGAGCATCATAT
TCTGAAGAAAGTCCGAAACTGGTTGCAACATAAAACACCACCTGAACTCG
ACGAGCAACAATTCAACGATATCTTTGATGCAGTCGAGAAACCTTTGATG
GATTTAGGAGTACCAAAGGAGGATTTGGAAAGAATAAAAAAAATGAGAGT
GATGGATGCTGAAGCTAAAAGATTGCTAAATATCAAATCCTTCAATTATA
ACTGTCAACCTCCTGTTGCCAATCATCACCATCGGAAAGCAGTTATTGAT
AACATCCATGCAGCAATGCTTCTACAACATGCAGATGACACAAAGTTTGG
AGTTGTTGTCAGTGGATTACCAGGTTGCGGAAAATCTGAAGAAGCTAAAG
TCTACTGGAAGACCTTCCAAAAGAAGTATTACGAGGACGTAGTCTGTTGG
GTGAATTGTAATGACTATATGTCTATGCTGAAATCCTTTGGCGATATTGC
TGACCGATGCGGAATCAACACCAAAAACCCTGACGGATCGTACAGAAAGT
TAGAGGAGATTGCGGACCTTGTGTACAAGTTCTTTAGTACGGAACAAGAA
GGAAACATTCCAAGGAAAGTTCTATTTATCTTCGATAACGCTGATGACCA
AAATGACGTTGGTAAATTCATTCCAACGGCAAACTATGATGCAATACACA
TGCTAATCACATCACAGTGTCAAGTATGGGATCCACGTTTCCGAGTTATC
AAGCTCGATGTTTTCACAGTTGAAGAATCTCAAATCTTTCTTCAACAAAA
TATCAAACGGGATGAAACAGAATCCACGACCAAGCAGCTCTATGAAATGC
TCGGGTGTCATCCTTTAGGTATGCAACAAGCAGTATCCTACATTAACGAG
CATGGCATTGATATAGAAACTTACATTATCGAGTTTAAAAAGAGACAAAA
GGAGTACATGTCAAAGGAATCGGATCAGATCGGAAAAGCGACCGTTTACA
CTACCTTATCGTTAGCTTACGAGAGAATCGAGAACGAAGGAGACAGCGCC
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GAAAGGTCTCTTACTCAAATCTGTCAACGACGACTTATCAGCGTTGAATG
ACATACTTCATTTTTTATCAAAATATTCAATCATTAATATCTCATTGTCA
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
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The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00052675-proteinTCONS_00052675-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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Expression

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Values : 
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Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Vocabulary: INTERPRO
TermDefinition
IPR027417P-loop_NTPase
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00052675 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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