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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00052585 ID=TCONS_00052585|Name=TCONS_00052585|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1947bp
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AGAATAAAGTAACATAATACAACAACATTTGAATTCTTCAATTCTCA Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_218:427415..434873+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00052585 ID=TCONS_00052585|Name=TCONS_00052585|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=7459bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_218:427415..434873+ (Clytia hemisphaerica)
tttttttgctcGATCAATAATTTAACGTTTTATAACccgcaatttttttc
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AGATTTTGTGCAAGAAACCTAGCATAACTAAGACATGACAGCAGTTTTCT
ATATTTGGttaattttggctaatttaacAACGTAAGAAGTATATTTTTGA
CTATGGACTTGCCAATGACCCTCCTTCGATGATAGAACAGTCCCATCCCA
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TCATCTCTTATCACTTTGACTCTTTATTTTGatcctcattgttcttatat
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TGTTTTTATATTGAAGCTACAGAGATCAAAAAAACTTGTCTTAAGCATAA
TTAGGGTCTTATCACAGCCAGATGCTATTTTTTCGGCCCTGATCAAACTA
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ATTCAACCATTTTTATTTCCTACAAATTTCCGAAAGTTCTATTGATTGAA
TTTTTGAGACCGGCAGACGTGGCACCGACCAATACAAAGCTCACACTGAG
CTATTTTAAACATTATTATACACAGCTTGAAGTAAAATATACTTATTCGC
CATAAATCCCATCTAAGGATCATTACTAGTTTTTCTCATTGATCCGATTG
GTAGTGCTGGGCAAAGTATAATTTGTAACAGAGCTAAGGTggaaatatat
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CCTTTCGCctcattttatattttgttcATTGTCTTATCTAAGGTTAAACA
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AGTACGCAGTAGTTTTTTTCAAACCTTTGGATTGCAATAATCAAAGTCGT
AAAAATTGGTCATAATTCTAAATCATCAATCTAATGAGCTCTTACGCTCT
AACCATCCAAATActctaaaaactttttcaatcaaatccATTCTTAAAGT
GTACTATGACGAGCGCGAACTTTTATTATAAGTTAAAAAGTTACCGAAAT
CGGAAGCTTTTAGTATTGATTTATGTAGAATACAATCTCAACTCTTTCAA
GGGCATATCACGAAAGTTTGTAATATATATTGATATGTAACTACTACAGA
CGAGTGTCTAACACTCGGACATAACTCATAACTCAAAAGACAGATTGCCA
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ATAAGCATCAGCGAAAAGCGGATACATGGTTTGCTAATCTATTTTTAACG
CTCCTTCCTTCTAATTCTTCTAATTCGATAAAATTTGTCCCCTCGATATA
TCCAGAAACTTAAAATTCACCAATGGTTATTTTCCCTCTACCATTACAGA
TGGATATCAACCTCTTGACAATCAACTTCATCTTGATACTGACAACACTT
TCAATCACCACACAAACCGTTCAAGCTGGTGAACAAAAAGGACCTGGCGT
ACGACACATTTGCGGCAAAGACTTCATCAGAACCTGGCAAATCCTCTGCA
AAATCAAACAACTTAAACGTAACCGTGGTAGGAAAAGACGTTCTCTTCTT
GACGGTAAGTGCTTGATTTATACTTTATTCTAAACacgtcttttttcttt
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GATCCAGGGCTACAAAACGGTCTTTCTATGCCAATTTTGTTGTTTGAGTC
TATTGCNAAAACTCTGGCTCTCAGGGTTAAAACTCTTACTTTGATCCAGG
GCTACAAAACGGTCTTTCTATGCCAATTTTGTTGTTTGAGTCTATTGCTC
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CGTGTACGTTTCTTCTTTTGACCACGTGATTTATCCTTTCAGATGGCGTT
GTTAAAATCAAATCAGCACACGACTTATTGGACAGCAGAACTGCTAGATC
ATTTTTAAAAGCTTCCTTATCGGTAAGGAGTAAACGTTCGATTTACAGTC
GAGTGAACACATTAAATGCTTCCGAGGAATGTTGCATGGAAGGATGTCGT
CTTTCCGAAATCAATGAATACGATTGCTAAAACATCATGTTTCAGTTGAC
AGGACTGTATTCATTCAAACTTTAACGGTTCTAGTATGATCAAAAGAGTC
CAGAAAACTCAAAAGCTGGAACAGGTCTTTTGAAATGGAAATCATGCCAT
ATGATAGGAGGAAATAAGCCTTCGATTGGCTTTCCGAGATAAACGATTGA
TTACAATTAATTAAGTTATTGGACCATAGGTTATCATGATGAAAACTCGA
TACCTATATTTAAATACGTTATCCAAACCTTTAGTGTAATATCTGACAAT
ATACAGTTTAGTTATAGGTATGCTTTTAGATAATTTTTCGGGTTATCGGG
GTACAAATATATTCCAAAAGTACCAAATTTGAAATCCGAAATCTAATTTT
AACGTATTTAAAACAATTATTTTAAGTATATATGACAATAAAATGtggaa
tttgttttttaaaacttcgtttttaatttatttacatTAAATAGGATTGA
GGTTAGTTTTATACAAAGGTGGATGCAAGGAGCCCTTGTTATAagccttt
tcataaatcattCCGAGTAACGAttacctcgttttgaaaccattaccaag
gtgattaaatcccttgAGTTTTTCAAATATTGCTTTTATAAATAGGCTAA
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GTTGCCCGTGATATAATTTGTGAAAAGGTCTCTTCGcaagatttttatca
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TTATAGTCATGTCGCACTTAAAACCATTAACCTGCCCCCTACTAAACTGT
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TCCTTGATGCAATGTTTATGCGAATATTCAATATAACCTGCTATcaactt
ttccaattttttttcttgcattcacttttgttttaatattttccccgaag
ttttttaactttttaatctTCAATATTTGAAGGAATTTTAGTAACCATGA
TTACAATTTGTGTCATGGGCCCAATTATTATGTATAGTCCCCATTTAATC
ACATTTATCcatttaaatttcttataaccagttatttctcaatttattat
tttaaagtGTATTAGACTATTAGACTTTAGGCAGCCAATGAAATGCCTGA
TGACCCATGCAGTatgtatttttagattttacaaTAGGATGCTTTAAGTA
TATTCGGTATGCAGAATAAAGTAACATAATACAACAACATTTGAATTCTT
CAATTCTCA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00052585-exon-scaffold_218-1491911889:427415..427689 | TCONS_00052585-exon-scaffold_218-1491911889:427415..427689 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00052585-exon-scaffold_218-1510915933:427415..427689 | TCONS_00052585-exon-scaffold_218-1510915933:427415..427689 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00052585-exon-scaffold_218-1575043694:427415..427689 | TCONS_00052585-exon-scaffold_218-1575043694:427415..427689 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00052585-exon-scaffold_218-1491911889:432814..433018 | TCONS_00052585-exon-scaffold_218-1491911889:432814..433018 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00052585-exon-scaffold_218-1510915933:432814..433018 | TCONS_00052585-exon-scaffold_218-1510915933:432814..433018 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00052585-exon-scaffold_218-1575043694:432814..433018 | TCONS_00052585-exon-scaffold_218-1575043694:432814..433018 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00052585-exon-scaffold_218-1491911889:433407..434873 | TCONS_00052585-exon-scaffold_218-1491911889:433407..434873 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00052585-exon-scaffold_218-1510915933:433407..434873 | TCONS_00052585-exon-scaffold_218-1510915933:433407..434873 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00052585-exon-scaffold_218-1575043694:433407..434873 | TCONS_00052585-exon-scaffold_218-1575043694:433407..434873 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_218 | supercontig | scaffold_218:427415..434873 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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