TCONS_00051610 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00051610
Unique Name	TCONS_00051610
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	5268

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_202:240399..258128-

transcript sequence

>TCONS_00051610 ID=TCONS_00051610|Name=TCONS_00051610|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=5268bp
CAAGAAAGAAGCACAATACTTTTGTAAACCTTGTCGAGTTGATATTTTTA
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ATTGTGATTGTTCAATCACTTGGTTTCGAGACTGGTTATCTTTACAAACC
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AACACAACAAAGACTACACCATTCGTCCAAAATTCGTTATCCAACCAACA
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AATCTTTACAAGAAGTCTTCGACTTTGTTATTGAATGATATAAGACATGA
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CGCCCGCAACCGAAAATCATTAAACGGACAGGTGACGATGTCCGGTTACC
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TACGAGAAAGAGACGTTTAGTTTTATTGTTCGAGATTTGAAAGTTGAAGA
TAGCGGTTTTTATGCGTGTTCCGCGTCGAGTCGTGCTGGTAAAGTGAACG
CTACAGTTCAGCTGGTCGTAATAGCTAAACCGTCGTTCATCCGGCCAATG
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aatttcaatgaacgtGATGTCGGTTCTTATTCATGCCACGCATCCAATGA
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GAGAACAGGCTACTCCGAACGTTGCCATTATAGCTATGACGGTTATTATT
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AGCTCAGATCAGCATGATTCTGGAGTACTGGTTCACTATAAAAGTGGGTC
ATCTTTATGTGAGCAATCGTTGCTGCGTGAGAGTCGTGGCCGCCCTTATG
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ACCGAGTAGTTTACAGAAACGAAAACGTTTGACGTCACAGTCTAACCCCA
ATGCAAGGGAAGAGTCTAGTGGCATTGAGTCTGGTGTTAGCTCGTCTTCT
GAAAGTATATCTTCTTTTAAAGATGTTGATGCCCTGGGTCAACAGAATGT
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TAACTACTAGTCTATGAAAATACCGATGTTCCATTTTTTATTTAATCGGC
ATTATGCACCTAAGAATTCACCCTATTTCTATTATGAAAAAACACTTTTA
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CGTCTACTGCCCATAGCGTAAAtaacgttacgaacatcacttgccatGAT
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TAATCAAGTTTGATCTCCTTTAGCCTATACTaaacgtcacccgcgttttt
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transcript from alignment at scaffold_202:240399..258128-

Legend: exon

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>TCONS_00051610 ID=TCONS_00051610|Name=TCONS_00051610|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=17730bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_202:240399..258128- (Clytia hemisphaerica)
CAAGAAAGAAGCACAATACTTTTGTAAACCTTGTCGAGTTGATATTTTTA
CAGCATACATTCAAGTTAAACTTTATGAATTTACAATCCAAAATATTACT
GTATTTTCATAAAAAATTGAAGTTTTGTTTTTGCAGTTTTGTGTGTGATT
CAGTTTTAGTGTAGCTTCATGTGTTGTTGTGTGATGTGATAAAATAAGGA
GAGAGGAGGGAAAGAAAAAATAATTGGAAATTCAACACTATATTTCTCTC
AACACTATCTTGCTATCACAACAACACACTGGAAATCATTTTGTTGGTTT
TTTTTACAGTTAGAAACAAAATTCAAATTATTAAAAAAGTTTGAGTAAAG
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AAAACCAAGGATGGATATTTATAACTTTATTTATGTGGTGATATTGATTT
TCAATGTGCTGCTACCAAATGATGGAGTCCGCGCAGAAAGATCATGTACA
ATTAAGGAGAAAAGACTGGACTGCACGAAGCTGAACATGACTGTGTTTGA
ATCGACAATTTTTCCCACCAATATAGAACATATGTAAGCAGTGTGGCTTT
TTTTCTGTTATAGCTTCTGTCTGAGGTTTGTAAACCACAATCAATGATTT
CCTTGTTTGCTTTGATCAAGCTTTTAAGCCAAACTGGATCATAAGAAAAT
AAACAACATTTGTTAGTTTTAAGTGCTTTAAGTGCCTTGTTGAATGATTA
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TCCTAATTATAACATTAAATGTCAACAGTAAATGAGTGATTAAATGTTTC
CTCTCTTGTAATCAATATAATATTATGTGTCCACAAGAAAAGATTTATGA
TAACTGAGTTTGACTAATTGATTCTGTCACGTCTTTTAAAGATTGACTTT
TTTTCTCTTTTCAAATATCTTATCAGTTCTTTCTGACAATCTTATCTTTT
TCTCATATGAATATTTTGGGATGATGAATGGTTTAGTTGGACTTGTCTTT
TTATCTGTTGTCTGAATTTAGAAAGAGTAAACCGTGTGGTTAGCTTGATG
ATACTAGTCTAAAAAAGAGGGTCCTGAATCCTTGTTAGAGCAAAGTTTTT
CTTCATGCCTTGATTATATTCAAAGCTTTCTAATTGATAAATAAAGTGTG
AAGGTTATAACAAACTTTTCTTTAAGTTGTTGTTTTTTTGTCTCAAGATT
TGTGGTTTTACTGTACATGTCTGAAGAGAAAATCTCATTTCTTTTCAAAA
GTCTACTCTAAAAGTAACTTTATGATTGATAGGTTTTATATGTGAGTTCT
CTCTTTTTTTAAACAAGGACATTTTAAAATATTCTCAGGGAAGATACTTT
NTCTCTCTTTTTTTTTAAACAAGGACATTTTATAATATTCTCAGGGAAGA
TACTTTCCAACAATTACAGTTGATTTATTATGTTTCTTATTAACCTTTTT
AGTGTTTTTGTATCTCTTATCTCATATCTTGAAACATCTCCAAAAGTGGA
AAATAAGATTATAACAAAATCTGTTACAGATTCTGTTCTTAAGGAAAATT
GAGTCCTTTAATAATGCTTTAGTCATTGAATTGCACATTTAAAAATTCAT
TTTTCTACCCTAACCTTGCAAAAGTATGGAATGTAAAACTTTATTTATAT
ACAATTCCAGTATTTTTCCTAAAAATTCTTGTCGGGACTTAAAAGAGAGC
AGATCAAATAATGAAACTTCCCCAGGTTCAGTTACAGTGTTTTTCTGTGA
AGGTCTTTTTTTGAAACATATTACTATTATATATTCATCTTTTCCCCTCT
CTTTTGGAAATAATAATTTTTCTTGCTTCTTTCTATAATAATTCATTTTA
GCATATCTATAGCTCTGTAATTAAATATTTAACTGATTTATTGAACAGTA
TTTTTCTCCCTTTTCCCTAATCTTTTTCTATTTTTTAGCAATTCATTTTG
AATTCCCAATAGCACTGTCAGTAACCTATATCAAAAATGGAACTAGAGAA
AAAGCCTTATAAAATAGATTCTGAGGTCTTTGCATTGTAAAATACCAACT
GTGTTTTCTGCATGATAAATGTCCTGTTTCATTACTCAAAAAGGAACTGG
GCTCTGGGTGGGTTTTTCTAAAGACTGTACTAAGGAAAAATTTTAAAGGG
TTATCAGTAAAAAGCCTGTTGTTAAAACAGTTCATGATGAGTTTGCATGA
GAAATTCTATTTTCAAAACTCAAATTGCTCTATGCAAGCTTAAATTATTT
TCTCCCCAATGATGCTATGAGCTTTTATACAATCCATCCTTGTCCTATGT
GAATTTTGCAAAAATTATCACAATTCTTTTAATTTTTAAAGAATAAAGGC
ATGCTGATTATTTTGTCAACCCCAACCTGAGTTCAAAATAAATGTTTGCC
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TTGAATAAATGATCAAAGTTTTTTAAAAGTTAGTAAGAAAACTTTTGAAT
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CGATATTAATAAAAAAGCCACCCCTTTTCGCTTCAGCTGTTTTAGGAATA
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AATTTCTGTGACTAATTGCATCAAATCTTCAGAAATAATTTTCTAAGCTG
AGTTACACGTGCCTCCAATAACTGAAGATTGTCCTACACCTAATTTGGAT
AAGTAATTTGTTTCAATTAGGAGAATTCATTTTCTTAAATACTTGAAAGA
TCCTTGTTTCGTAATTATCAAAATTGATCATTTATAAATTTATTTATTTA
TAAATACAAAAAATTGGGTATCTTAAGTCTACTTAAGTTTTTAAATCCTT
TAAGATTTTAAGATATTTTGGTGATAATAAAATGTATGCTTTTATTTAGT
ATAGTATTTGGGACATGAATCATTATTTTAATATTTCCCATTTCTCATTA
TAAATCTCTCTCTCTCTTCTCTCTTGCTTTATATCTGCATCTGAAATACC
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CAAAGAGCTCTGTTGCTCGTCACACTCTAAATGTTTTTGTTATGATTTGA
TAAATAAAGGGAAAAAGAATTCTTATAAAATCAGTGTCACACACGTATGT
TTTTCTTTTGATTTTCTACAGCCTTATAAAGGTTAGAATACAAGAACAAT
GAATATAACATGTATATCTAAGATTTTTAGCCTGGTCTATGAAATGCAGA
TTTTTTCATTGAATGCTCTGCCCTTCTTTTGTCACTTGTGAAATTTTTAA
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ATGTTCCTATATAATAAACCCCCTTTGTATTATTAATGATTCTAAAGAGG
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TTAATTCATTTCCCTACTACTTTTTTAATGCTTTTAATATGCAATCAATG
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CTCGAACAACAACCTTTATTGAATACCATAAAGCATGTTTTTTTTCTAAA
TAGGAATTCATCACTAGTTTAAGCTTTCTGCTTTAAAAAAAAGAACCCAC
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GAAATATGAGTAACAATTATATCAAAAATCAGATTCCTTTCTGATTTATA
TCAAACACTTTTCAATAATATTAATTTTCGATTGTTTTTGAATTTAAATT
TTGAAAAAAATCAAAAGCATAATTTTGGAGAATAATAGATCCTACAGAAG
TATCCATGCTACAGAATATAGTTTGCTTTAGGCAATCTGCTTGAATTTTT
CATTAGATTTGCAGGAAAAAAATATCTTTCCAATTATTTAAATTTAGTCA
TTTTAAAGATCCATTGATTTCTTTTATTAAAGTGTTTTTTTTTTGTCTTT
TTTAGAGTATTGGATAACAATAAGCTGACAGAATTTCCAAATCTTGAAAA
ATTTCCAAATTTGAAGAGCATATCAATGTAAGTAGTAAGAAATTTAGTTT
GCTATTCTTATTATAGTTTTTCGTTATATATGATTGCTTTGTTTCTTAAC
TTGATAGATGAACTTAAGATATAAAACTAATCTAGATTTCAATTTGTCAC
ATTACCCTTATCAGAATTAAATAAGGTGATTAATGTCAATTTTTAAATTT
TGATTTATATATCTTCATGTATGTTTTTGATTGATTATCTTTCTAGATCA
CACAATCTTTTGACTTCACTCAAAAACTTTGGAAGCTTTCTACACTTGGA
GTTATTGTAAGACAATGTTTTTGGTTCAGTAAAACGGTCTCTTGTTTTTT
GTTTTCTTAATTTGCTATATTTGTCATTGAGAGATTGAAACGGTTTTCCT
TAGATAACATTCTCTTCCTGTTAGTTTTAATGGTCCATTCTATTTTTGAA
GTCAATAGTGCTGACCTGTTTGTCATCAAATAATAATGAAAACTATTATT
GAAAACAATTTTTGGGTACAAATCTTTTCATGTTAAAATAGTCATCTTGT
GTCTGTCAAATTTTCCATAGTTTTGAACATTTTGCTTCTTTTACAGAAAC
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ATTTAACTTTCATTTAACATTCTGATAAGCCTTGATATGCCAAAAATTAT
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CTCAAAAACTTTGGAAGCTTTCTACACTTGGAGTTATTGTAAGACAATGT
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ATTTGTCATTGAGAGATTGAAACGGTTTTCCTTAGATAACATTCTCTTCC
TGTTAGTTTTAATGGTCCATTCTATTTTTGAAGTCAATAGTGCTGACCTG
TTTGTCATCAAATAATAATGAAAACTATTATTGAAAACAATTTTTGGGTA
CAAATCTTTTCATGTTAAAATAGTCATCTTGTGTCTGTCAAATTTTCCAT
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GAAAATCTTGATGGATTGTTCAATTCGACACTCACAAAACTACAAAAATT
GTAAGCTTTCCTTTAACAAAATACAAAATATCATTTAACTTTCATTTAAC
ATTTCTGATAAGCCTTGATATGCCAAAAATTACCTCTTGAGGTCAACCAT
GGTGTCCTGCAGGTAATAATTAGTTCCCCCTTGTAGGGCTAGAAAACCCA
CATTTTCTACTCCTAAATTCTTCCCACTTTATTTAAAATTTTTGGCTTAG
CCCCTCATCAAGATGAAAACATTCAATTCCCCTCCTAGACAAAAGTTGAT
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GTTTCAAAAGTTAACAGTAGTTTTGCTTTTAATTTAGATTTATTAGTCAT
AATCAATTGGAGAAGATTGACAAGATCTTTCAGTCTTCCTTCCCAAACCT
TCAATCTTTGTAAGTCTTAAATTTATAAATCTGTATTTATAGTGTACAAG
AAAAAAAAATTTGAATTAGTACTTTAATGATAGTACTTTAATGATAGTAA
TTTAGTTTTCATCTTTATCGTATTGTCAGCTATCAAATGATAAATATCAA
ATGCTACGATTTTATGCTGAAAAATTTAGATAGATCGTAAAAAAATGTAT
AATTGGAATGAATCCCTAACTTAGTATTTATAAAATTCGCCGTTTTAAAA
AAAATTCAAGATTCAGTTAAGCCAATACTATATCTAACTAGATGATCTTT
CAGCATGTTGGTAGATGTAGATTGTGAAGTAACTGAGAAATTACCCAAGA
TTTTTATTTAAACTTCATGCATTCCCTTAAAAACAGTGCACAAATCTTTC
ACTAAAATCAGTTTAAATCTTTTTATCATTGTCTCATTTTAGGGATGCAA
GTCACAATAAAATTAAACAGCTGATTGGTTCCCGTAGAAGGAGTCGCAGC
CTGTTTCCCAACTTGAAGTACCTGTAAGTTTAGATACTGTACAAAGTTAA
ACTAACCAAAACATGTTTTCTGCACCAATGAATAGCTGTTTTTTTTTATC
GGAAGAGAGATAATACATGATTTCTTTTTTACCAAGATTGCAAGAAAAAT
ATGAATATGATGAAAAAAGACAAAGCAAAATTGCTTCTCCATGTTATAAC
AACAAATTTGATTTATTTCAACTCAACATTTAAAACAAAGTAATTTTCTT
TTTTAGGGCATTGAACAATAATGAAGTTTCCTATGTCAAGTATTTCTTCG
ATCACTTATCATCAACAGAGACGATGTAAAAAAAATTCCAAATTATTAGA
ATTAATGAATTATGCTTTGTTTTCTTGTTTATAAGAACAATAGAATCGTA
GAATCGATGTGACCTAATAAAAAGTTTGACTACTGAAGCAACCAGTTTTA
TATAAGCTTTTAAATTACCTCTGAGTTAGCAACTATCATGTTCTTACTTT
ATGTGTTTTTCGTTTAGGGTAATGCTGCTTTTTAATATTTGATTTTTTTC
CTTTCCACCTCTAGTATTCTTTCGTACAACAAACTACAAAAACTGACAAA
TGAGCATTTTATCACTTTGGTGCAAAGAAATAACCTGAAAGAACTGTAAG
TAAAAATTTATCTAGCTTTTTGGACCTACCTTCGGGTACCCCGGTGGAGG
TTCTATAAATTAATCCATGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTC
GTTCGTTCGTTCGTTCGTCTGTTACCGCCTGAATGGTTTAAGTGATTTTC
GTATTTGGGGAAATTCCTTTTTACCATTTTACATTAATCAACACACAAGC
TTTATTTTTCCATTCTGAATTACAGATTATTGTCACTTTTTCTTATTTTC
ATCTGATTTTAATCAGTAGGTAGGTCCATTCAGCATGTTGCTTGTTTTTC
AGACACACTGTATTATTTCATTAGATTTTCATGTAAGAGGATCGCACTGC
TTCTGGGTGCTACTTTTATCAAGAGCTATTTGACCACTTTCCTGTTTTTT
TTTAGATATCTTGATCACAATTTGCTGAAATCTATTGAACTGTGGTTTCG
ATTCCTGATTAAATTGTAAGTGACAAAATAATTCTTTCTGTGTAAATAAT
TCTGATTCTTTTTTTAAAGGAAGTAGTTCTGATCTAGAACGGATTTTCTT
AAATGAAAATATTAATAAACTTTGAAATTCTCAAATAAAACCTTAGAACC
TGCGAATTACAAATTTGGCCGTCTGTCATTAAGATTTGAAAAATCCCTAG
GAAAATGAAAGAAATTTACTCTGAAATAGGGCAAAACTGCAAAAATTAAT
CTCCGCAAAATGTGATTCTTCTCTTATAGGGATTTGAGTCACAATCGGTT
AGAAACTTTCAAAAATGACGCTTTTTACTTGGAATCACTCACAGAAATGT
AAGTAGTTTTCGGGTAAATTACAACCTAGGGTAGTTAAGATTTTTATCAA
GAAACCAGAACTGTAACGTCAATATCTCAAGACCATCTGAGCATAACACT
GTTTTCTGAATTATTATTGGCTTTGGTTTTTGGATAGTGTTTGTAATTGT
CAAACTGAATTTATTAAAATTGGTAAATCTTGTGTTTCCATGGGGGCGAT
ATGATTTAATCGTTAAACTGATTTATAATTAAAGTTTACTTTTGTTTCAC
TGTAGGGATCTATCTGGTAATAAGATTGCATTTCCATCTAAAGATTTATT
CAGCAAAACTCAAGCAATGGCACGACTGTAAGTTGTTTATTCAGTAAATC
AGGTTGTCCCAAGTTTCAACAGGTGGCACTTTCATCTCGAAATGCAGCGA
AATTTCAGAAAAATTTAAAGAATTTGATTTGTTGGGATATTTAGATTACC
ACTGAGAAGAAAGTTCCCACATCCATTGACTTGAGTTATGATAATNTAAT
TTCCGCAGGCAAATAAAGTTTTTCAGCATGTTGTACACTTTAAATGTTTG
GCGTGTGAAATCCAATTTAACACTTTAAAACTTCGCTGAAAAGGCTTTAT
CAAACTCACACGTGTTAATATAATTTCCGCAGGCAAATAAAACTTTTCAG
TATGTTGTCCACTATAAATATTCGGCGTGTGAAATCCAATTTAACACTTT
GTCAAACACTGGCAACTATAGTCCAAGAAGTATAAAACTTACACTACAAA
ACTCTAAAAACGTAGAAGGACAAGNCTTACACTACAAAACTCTAAAAACG
TAGAAGGACAAGATAGAAACAAGAAATCACAGTCATTAGTTCCCACGGGT
GGGAAAGTCAAATTAACACGGTGGGAAGGTACAATTCCCACCCTTGTACT
ACGCATGCGTAAAGAAAACCACAAGTGAAAATTGGGNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNCATTATAAGGGTGTATTCGATCAGTGTGTAACACAACGCTA
AAGGCGAGGCGTCCCGCAAGGGCGGCCTCATTCGTTCGCAATGGACTTGC
GTCGCAAGGGCTCAGTGGATAGACGGGTTTGAGGTCATTAAATTGGCTCT
CTAGTGCAGCTCCACTGTTGTGACAAAAGTGCCGGGATTCTCAAAGTAGC
GCAAGTACATGACAGAACGAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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NNNNNNNNNNNNGGGAGCTATCGAGCCAATGCTCACGAATGATCGAATAC
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GTGGGGAATCAAAATTTCTGCGTGTGGTTTTCGATAAAATAAGCGAGTGT
AAAATGCTAAATCCGACGTGGGATTTTCAATTTAACACGCGAGGAGAGAG
GGCCTGAAGTACGAAATTCGACGTGGGATTTTCGATTTAACACGTTGGAT
TTTCGATTTAACACGTTGGATTTTCGATTTAACACGTTGGATTTTCGATT
TAACACGTGTATTGTTCGATTCAGCACTCAATGTTTAAAGCGTGTGATCC
TGCGTTAACCACGTCGGAAATTCAATTATACACGTGTGATTTTGAGGGGT
GTGATTTAGCGTTTCCCCCCGGCGTAAAAACGAACCGATTCCCACGCGTG
GGATAGCAGTGTGAAATGTATACTTTCACACCGTGTGATTTTCACTTTCA
CACCGGTGTGATTTGATGACTTTTTCCTGTGAGTAGTTCTGATCTAGAAC
GGATTTTCTTAAATGAAACTTTGAAATTCTCAAATAAAAGCTTAGAACCT
GCGAATTACAAATTTGGCCGTCTGTCATTAAGATTTGAAAAATCCCTAGG
AAAATGAAAGAAATTTACTCTGAAATAGGGCAAAACTGCAAAAATTAATC
TCCGCAAAATGCGATTCTTCTCTTATAGGGATTTGAGTCACAATCGGTTA
GAAACTTTCAAAAATGACGCTTTTTACTTGGAATCACTCACAGAAATGTA
AGTAGTTTTCGGGTAAATTACAACCTAGGGTAGTTAAGATTTTTATCAAG
AAACCAGAACTGTAACGTCGATATCTCAAGACCATCTGAACATAACACTG
TTGTCTGAAATATTATTGGCTTTGGTTTTTTGATAGTGTTTGTAATTGTT
GAACTGAATTTATTAAAATTGGTAAATCCTCTCTGGGGACGACATAGTTT
GATTGTTAAACTGATTTATAATTAAAGTTTACTTTTGTTTCACTGTAGGG
ATCTATCTGGTAATAAGATTGAATTCCCATCTAAAGATTTATTCAGCAAG
ACTCAAGCAATGGCACGACTGTAAGTTGTTTATTCAGTAAATCAGGTTGT
CCCAAGTTTCAACAGGTGGCACTTTCATCTCGAAATGCAGCGAAATTTCA
GAAAAATTTAAAGAATTTGATTTGTTGGGATATTTAGATTACCACTGAGA
AGAAAGTTCCCACATCCATTGACTTGAGTTATGATAATGACAGTTTTCTT
GGCTAAACTTTCAGTTCAATCACACATACAATTTGTCACTAATCAACAAA
ACTAATCTTCAAAAGATTTTTAGTAAAAATTATTAAGAATTTCTTTCTCT
TTATATTGTAGCAATCTGAGTAACAACAATATTAGAAGCCTATCAGAGAA
CTCATTTATGTATCTTCAAAACTTGAAATACTTGGACTTGAGCACAAACA
ATATCTCTGTTGGCATGAAAGAATTTGATAAAGTATTTCTGTGGCTGAAA
AACCTTAAAACTTTGTAAGTATTACTTTAAGAAATCAATATTTCTCAAGT
CTTGGCAAATTTGACGATAGATCTCTTTTTTTTAAACATATTCCATATTG
GTCTTGGTACCGTGCAATAGCTATTACTTATCTTACACAAGGTTTTAATT
GCTTTCACATATTTTCTAAGGTTTTCAAAAAGCTCAACAGAGTGTAATCT
GCATTTTTTTCTTTTCCTACAGAAATATCAGACGAAACAAGATCTTACTA
TTACCAACAAACTCCTTCCCTGGATTAGGAGCTCTTGAAGTACTGTAAGT
ACCCCATTAATTAGTGGTTTTCCAGACCTTTCTAATTTCTCTATGAAAGG
GGACACTGTATATTTCTAATCTGATCTTATTTTGATTTACTTGGAATCAA
GAAATTCGAGAGGTATTTTTTGCATTCTATACTACGCCTTTTTAGGCACC
AAAAATTAAAAGCACATTTGGATTACACATTTTATACGAGCAAACTATAA
GAACATAGGTTTAAGAATAATTTAACACTCTATACCACCCAATTTCTTAT
GAAATTGGACAAAAATCCTCAACAAATGGCGAAAATAAGAACATCTTCAT
ACTTCAAAAGCTCAAAAATATTTAAGAACATCCATTTTGCTTTTTCTTAT
AAAAAACATATGGGAATATTATAGATGGTTACCCAGAAAATTTCGAAAAA
TCTACTACTTATTATAATTCAATGTCATTTTTATTCTGCATATTAATTTC
ATCTTCTCATTTTTTTTCTACCCTTCAGCGACTTAGCTGGGAATGACATC
AAATATATTGAAAGNAAAACATATTCCATATTGGTCTTGGTACCGTGCAA
TAGCTATTACTTATCTTACACAAGGTTTTAATTGCTTACACATATTTTCT
AAGGTTTTCAAAAAGCTCAACAGAGTGTAATCTGCATTTTTTTCTTTTCC
TACAGAAATATCAGACGAAACAAGATCTTACTATTGCCAACAAACTCCTT
CCCTGGATTAGGAGCTCTTGAAGTACTGTAAGTACCCCATTAATTAGTGG
TTTTCCAAACCTTTCTAATTTCTCTATGAAAGGGGACACTGTATAGTTCT
AATCTGATCTTATTTTGATTTACTTGGAATCAAGAAATTCGAGAGGTAAT
TTTTGCATTCTATACTACGCCTTTTTAGGCACCAAAAATTAAAAGCACAT
TTGGATTACACATTTTTATACGAGCAAACTATAAGAACATCGGTTTAAGA
ATAATTTAACACTCTTATGAAATTGGACAAAAACCCTCGACAAATGGCGA
AAATAAGAACATCTTCATACTTCAAAAGCTCAAAAATATTTAAGAACATC
CATTTTGCTTTTTCTTATAAAAAACATATGGGAATATTATAGATGGTTAC
CCAGAAAATTTCGAAAAATCTACTACTTATTATAATTCAATGTCGTGTAA
CATTTTTATTCAGCATATTAATTTCATCCCTTTTTTTTCTACCCTTCAGT
GACTTAGCTGGAAACGACATCAAATATATTGAAAGAAACGCCTTGTCTAA
TTTGAAAAATCTTGTCGAGCTGTAAGTAATGCTTGTGTAAACTCTTTGAA
AACCAAGCCTATCAATAACTCACGTTCTTGTTTGCCCAGCTCACGAACTA
TTCGTAACTTTTTGAAACTTGCTATAACGTGTTTCATTTCGATGTTCCGG
TTTTACAGAGAGGGGGGAAAATAGTATTCAGTCAAACACTGTAATTCGGT
ACTTTAATCATTGAAATTCCACCAGGACTTTGCGGGAAAATTTTATCAGA
CAAACTCCCAGTTTTATTAAAACATGGCTTTATCTCTTTGTTTATCCAAA
TTTACATTGTAATAAAAAATATCTTGTTGTTTTCTTCTCAGAAATATCGA
TACAAGGGACTTAGATTGTGATTGTTCAATCACTTGGTTTCGAGACTGGT
TATCTTTACAAACCACTTTGATCAAGAAATCGATCTCAGGTGTTTGTGCA
TCTCCACCATGGTTGAGAAACAAGAACGCGATGACTATATTGGACAGCGA
GTTGACCTGTGGTAAGGACGACTTTTCCTGGTAGCTCAGTCGGTAGATAA
AATAAGATGCAATTTTCAACTTATTTCAAAATTTGAATTTATGATTTTTC
TATTCTAGTAAAACACAACAAAGACTACACCATTCGTCCAAAATTCGTTA
TCCAACCAACATCCAAATACATCAAGATACACGGCAACGTCTCGTTAGAA
TGTGTTGCCACCTCCTCGGTCGAAAATCTAATCCTCATCAACTGGTACCT
AGACGGGCAGCCGGTACATCACCGTAAGACAGTGGAATCTAAGCTACAAT
ATGTCCGCGCGAATCTTTACAAGAAGTCTTCGACTTTGTTATTGAATGAT
ATAAGACATGACGAGAGGGGAAGTTATTGGTGTGATGCTGTGAATATTTA
TGGTTCCAGGCGTTCGAAAGAAGCTAACGTCACGATAGTTGGTAAGTGCC
TCAGAGGTGTACCCCTTTTCGGGGAGAAATCAGGAGAAATTCGTATGGAA
ATCTCTTATAAGATTTACTGCAACCCAATTGAAAATCGACAGGAATATCT
CCTGTTTAAAATATAATCAAATTTCAGAAATTCCTTTATTTTCTATGATG
TTATAGTACTCTCTTTTCTTGTTTGAATCCTCTTCCCCAGACAACAACAA
CAACATTATGACCTTTAGTTTTAGTCAGAGTAATTAATTTAAACTCAGGA
AGTTTTGATCCCTCTCGATCTGGGATTTTCCCAACAAATTATTGAAAAAA
TATTTTTTTGGAATTTTTCAACCTTGTATTATTTCGTTTTTTAATTTTAG
TGCCGCCAACAATCTCCAAACGCCCGCAACCGAAAATCATTAAACGGACA
GGTGACGATGTCCGGTTACCCTGCTCTGCGGAAGGGATCCCGGCTCCACT
CATTTCCTTCAAAAAGATTACAGGTGACGAAACGGCGTGGAAATATGCGA
CGATCAACCGGAGAATCCACTACGAGAAAGAGACGTTTAGTTTTATTGTT
CGAGATTTGAAAGTTGAAGATAGCGGTTTTTATGCGTGTTCCGCGTCGAG
TCGTGCTGGTAAAGTGAACGCTACAGTTCAGCTGGTCGTAATAGGTAGGT
GACTCCTTGCTTTTTTTATTTCACCCTATGTGAGGATATTGACCACGAAA
TCCTTGAATTAAAGTGATTCTGTTTCATCGTTAGTCAAACAAAATTCACG
CTTGCAGATCAGCTTACTTGCTCCGAAACGAATCAAATCGTTTCACTGGT
CAAATATTGTTTTCGTAATTTTGAGTCAATAAAATAAAACCCCTTAACGC
GCCATCTAATTTTGCTGTTTAGCCCGTTTATTGACTTATGTTATTCGATG
TCTCATTCTGAAAGCTTTCGAACGTCTATTGAACAGGTATCATTTAGGAC
ATAACATGGAATGTTAATTCTCCAAATTATCGAAAGAACTTGCTAGGATC
CTCTCAGTCAGACCGTCATAAATTATATTTTTTTCATCACTTTAAAAGGA
CGTGATTAAGAGAAAACGATATGTTAATATTTTGTTGCGTAAAACTCTCT
CTCTCTTTTGACATTTTGGGTTTGTTTTTGATTTGGGACCTTTTATGTTG
CGAGGTCACGCCATAGTTTCACTGTTTTAAAGTTATAATTCGCTGCTAGC
TGTGTCTGACGTGTTTTTTCATGTCATTTTTTGTTGTTACGGGTGTCATA
ACTCTTCATAACACTTCTTTTGGGATGAGTATAAAGAGTGTCCTTCTTCG
CAAAGAGTCTTCATTTCAATTTTTTTCGTTTGAAACTTTGATTCGCTTCT
TCCTTCCTTCTTTGCTTCAATCCTAAAATGAAGACTTTCAAAGGTACTAT
AAAGATTTGCCTTATGGTTTTTCTTTTGGCATATTAAAAAAAGGTGTTTT
TTGTTGTTGTTTTTTGCGGGCACATTTCTCTCCCATCATTCATATCCTTT
GATCGGAGTTGTCTCAAATACATGGAGGTTATTCATTTTTTTCTATCAAG
TCACGTTATTTACGCTATCATGGAAGTAAACGTTCGAATTTGTAGAGGTG
AATCCTTTTCCTTCCATAATGGCGGAAGTTACGTAATTTAGCAAAACTTC
TTTAGGTCTTTAAGTCTCACTTTCTGATCATAGCAATCAACTTTTCAATA
TATATTTAAAATGTTTTCAAAATTTGTTAATTTCAGCTAAACCGTCGTTC
ATCCGGCCAATGAAAAGCAAACGAGTACCGCCCGGAACTGTTGCCGTACT
GGACTGTATCATTTCCGGAAATCCCCGTCCACACATTCAATGGTTCAAAG
ACAACCATATGCTTCGACCTTCCAAATCGATTACTCTCTCCAACCAAATG
ATGGTGATTAACAATTTCAATGAACGTGATGTCGGTTCTTATTCATGCCA
CGCATCCAATGATCTCGGCTCTGCTTCTCAATCAGCTAGACTAGAATTAA
GTCAAACGGAACGAGAACAGGCTACTCCGAACGTTGCCATTATAGCTATG
ACGGTTATTATTGTGTTCACAGTAACTTCTTTCATATGGTTCATGATGTT
TTGTTATTGCCGACGGAAACGGAAACAAGAACGCGAAATATCTCGCGCGC
CTACAGACGATCATGCTCATTTATCACAGTACAAAGAAGGTCTCGTTCCT
GAACTACCGAAAGACTATTTATTACGGTGCAACGGTAAACTGATATCACC
GACGCCTCCCGTACTTACACCTGCTATAGATACGGTACAAAGGTTATCAG
ATTCAGAACCACTTCTAGAACATTCAATGAGACGAAGTGGTATCGCTTTC
GAAGACGACACACAAATAGATGATTGTCCGGAAGCGAACCTATTGATGCG
AGACACGCTACGTTACTTAAGGGAGCAAACTGATGCTCCGCCTTTAGGTA
AGGTGACGACGTCTCAGCTTCAAAAATCTCAAATAGACAATGATTACATG
ACAGACGAAGAGAGCTCAGATCAGCATGATTCTGGAGTACTGGTTCACTA
TAAAAGTGGGTCATCTTTATGTGAGCAATCGTTGCTGCGTGAGAGTCGTG
GCCGCCCTTATGTCACAATAGACGTCACACGTGACAAACGGAAAGAATCT
GGTATTAGGTATCATCATAAACATTCGCTCAGTGTTGATGATTCGAGTGT
CAATAGCAACCAACCGAGTAGTTTACAGAAACGAAAACGTTTGACGTCAC
AGTCTAACCCCAATGCAAGGGAAGAGTCTAGTGGCATTGAGTCTGGTGTT
AGCTCGTCTTCTGAAAGTATATCTTCTTTTAAAGATGTTGATGCCCTGGG
TCAACAGAATGTCGAAGTTCTATAGCATATCTTCTTATTTTTTATTTAAT
TTTCTCTATTTTTTGGCCGTTTCTTTGTTTGCAATTCGTTTGAGATTCCT
TTTTTCAGTTTACTAATATTAAATTTCATCTTCATTGATTTTAGCCCCAC
CTGCAACCAGCAGGTCGAGACAAGTTCGTTTGTATTTTGTTTTTGCGATT
TTGTTTTGATTTTTTCCTTGTATTGAAAAAAGCTCCCTGTTCGGGCAGGG
AATATTTTTGGTATTACATTTTTAGTAATATTAGCGCGTGTATTTCAAAT
TTTTGAGATGAATAATATGTGTAAAAATTGGAAACATTGTAATTTAGCCA
TAGACTAGCGGAAAACTTTATCTCATTCGCGCTGGATCGCGAAGGCTAAG
TGTTCCTTTTGGTAACTACTAGTCTATGAAAATACCGATGTTCCATTTTT
TATTTAATCGGCATTATGCACCTAAGAATTCACCCTATTTCTATTATGAA
AAAACACTTTTAGAAAGTATTTTTTGGGGATCGTAATTTTTTCACACACA
TGATATTATAGTTCAGATTTTTTATCTAATTTATGGTACTCTAATGTTAT
TAAGGGTTAATTCCCAAAATTAAGACACACTTTTAATAGAAGTCTTGGTT
GGGTAGTCTAACCTGAACAGCACGCTTTAAATTTTCGGACCAAGGACATT
TTTGAATCATCACGTCTACTGCCCATAGCGTAAATAACGTTACGAACATC
ACTTGCCATGATGATTAATTCTCAGCCGATTTTATTAAAACTACTTTCTA
TTCATATAAAAATCATTTAACGTCTCAAGGGACTTAATCACCATGGTAAT
TGTTAGAATACGATGCAAGTGATGTTCGTGATGAATCTGGAAGTTTTCGA
AATGCCTTTGAGTTTTTACAAGATACTTCACTAATTGGTCATTTAAAGTG
ATAGAGATGACGCGTTCTTTAGAAAAAGTAATAAGATTCTTTGATTACAT
CTTAACGACCAACCAAATCAAATAAGAGCTTGTAAAAACTCCAGCTTGTC
CCAAGTTTTCTAGTGTTTGGAAATTAAAGTGTGTGGCGTAATAATTTTTC
TGTATAACAGAATATTTTGCAAAAATTAAATGTACATTTTTCAGAGAGTT
CAAAACACTATGTAAATATTATTAGAAACTTGTTTCGCAAAATATTTTCC
AAACAAATGATTTAATCAAGTTTGATCTCCTTTAGCCTATACTAAACGTC
ACCCGCGTTTTTTTACGCAATTAACGTCTATTCCACTTTGCGACTTTTTC
GAATGTTTTGAGCCCAGGTTTTCGGGCTCTAAAGGCCGGTCTCCACTTGC
GCGCGCTGCAATCGCACTTTTTGGCTTCAATCCTTTTTGGTTGGAAAAAA
GATTACGTCATAAAAATGTAGCGCGCGCACGAAAAAAAAGTTGAACACAT
TTCAACTTTTTTCAACCGTTACGTCAGATCGCGCCAATGGAGTTGCTTCA
TTTTTCTTTTGACCAATAGCGTGGAAGCTT

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_032678	XLOC_032678	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_202	supercontig	scaffold_202:240399..258128 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0.0453868	0	0	0	0

Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00051610 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: LRIG2 (Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2 OS=Homo sapiens GN=LRIG2 PE=2 SV=3)

HSP 1 Score: 256.914 bits (655), Expect = 1.048e-69
Identity = 181/543 (33.33%), Postives = 286/543 (52.67%), Query Frame = 2

Query: 1262 NKLQKLTNEHFITLVQRNNLKELYLDHNLLKSI-ELWF---RFLIKLDLSHNRLETFKNDAF-YLESLTEMDLSGNKIAFPSKDLFSKTQAMARXXXXXXXXXXXXXXXFMYLQNLKYLDLSTNNISVGMKEFDKVFLWLKNLKTLNIRRNKILLLPTNSFPGLGALEVLDLAGNDIKYIERNALSNLKNLVELNIDTRDLDCDCSITWFRDWLSLQTTLIKKSISGVCASPPWLRNKNAMTILDSELTCVKHNKDYTIRPKFVIQPTSKYIKIHG-NVSLECVATSSVENLILINWYLDGQPVHHRKTVESKLQYVR--ANLYKKSSTLLLNDIRHDERGSYWCDAVNIYGSRRSKEANVTIVVPPTISKRPQPKIIKRTGDDVRLPCSAEGIPAPLISFKKITGDETAWKYATINRRIHYEKETFSFIVRDLKVEDSGFYACSASSRAGKVNATVQLVVIAKPSFIRPMKSKRVPPGTVAVLDCIISGNPRPHIQWFKDNHMLRPSKS--ITLSNQMMVINNFNERDVGSYSCHASNDLGS 2860
            N + KL +  F  L   NN++EL L+HN L  + + W    R L +L +S N +E    DA+ + + L+E+DLS N++    +  F     + RLNL +N +  +++  F +L NL+ LDL  N IS  +++  + F  L +L  L ++ N+I  +   +F GL +LE LDL  N I  I+ NA S   +L EL ++T  L CDC + W   WL       + S++  CA P WL  ++ + +   +  C     D  ++P+    P +  I + G NV+L C A SS ++ +   W  D + ++   T E+ ++Y +      + +S L L ++   + G Y C   N +GS  S++A +T+   P+  K P    I RTG   RL C+AEG PAP IS++K  G +     A   RR+H   E   F + ++K+ED G Y+C A + AG ++A   L V+  PSFIRP++ K V  G  AVL CI  G+P P + W KD+  L  ++      +NQ+++I +    D G Y+C  SN LG+
Sbjct:  249 NGISKLKDGAFFGL---NNMEELELEHNNLTRVNKGWLYGLRMLQQLYVSQNAIERISPDAWEFCQRLSELDLSYNQLTRLDESAFVGLSLLERLNLGDNRVTHIADGVFRFLSNLQTLDLRNNEISWAIEDASEAFAGLTSLTKLILQGNQIKSITKKAFIGLESLEHLDLNNNAIMSIQENAFSQ-THLKELILNTSSLLCDCHLKWLLQWLVDNN--FQHSVNVSCAHPEWLAGQSILNVDLKDFVC-----DDFLKPQIRTHPET-IIALRGMNVTLTCTAVSSSDSPMSTVWRKDSEILYDVDT-ENFVRYWQQAGEALEYTSILHLFNVNFTDEGKYQCIVTNHFGSNYSQKAKLTVNEMPSFLKTPMDLTI-RTGAMARLECAAEGHPAPQISWQKDGGTDFP---AARERRMHVMPEDDVFFIANVKIEDMGIYSCMAQNTAGGLSANASLTVLETPSFIRPLEDKTVTRGETAVLQCIAGGSPAPRLNWTKDDGPLLVTERHFFAAANQLLIIVDAGLEDAGKYTCIMSNTLGT 774

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00051610 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00051610 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
LRIG2	1.048e-69	33.33	Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domai...	[more]

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TCONS_00051610 (transcript) - C. hemisphaerica