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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00050420 ID=TCONS_00050420|Name=TCONS_00050420|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1561bp
CACTGTTTTCCCGGAATTCCCTTTTGTGATTATTCATTTGAGGAGTTTTT
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AGACTTTTGTG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_171:170016..174490+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00050420 ID=TCONS_00050420|Name=TCONS_00050420|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4475bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_171:170016..174490+ (Clytia hemisphaerica)
CACTGTTTTCCCGGAATTCCCTTTTGTGATTATTCATTTGAGGAGTTTTT
GTCAATCATGTCTACAATAATTGTCATATTGTTCGTTTGTGTGCAAGCCA
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GTTTTGCAATGGAATTCTTTAAACTGTAACCCATCAGCTTTGCAATGGAA
TTCTTTAAACTGGAACCCATCAGTTTTGCAATGGAATTCTTTAAACTGTA
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TTGAATGCATCCATCAGTCAGGATTTTGATTAATATCTTGGCTTTTGCTC
TATTCTATGGTTCAATAATTACACCATCCTCACTCATCCGGACTCATGCA
TCTTCTTTCAGAACAGGATTCTCTTTGCTGTAAATGTAATGTAACCAATT
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agttttttaactttttatgaCGCACATTATTTAATTCCTAtgataatttt
catattttttgacAAGACTTTTGTG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00050420-exon-scaffold_171-1491911889:170016..170428 | TCONS_00050420-exon-scaffold_171-1491911889:170016..170428 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00050420-exon-scaffold_171-1510915933:170016..170428 | TCONS_00050420-exon-scaffold_171-1510915933:170016..170428 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00050420-exon-scaffold_171-1575043694:170016..170428 | TCONS_00050420-exon-scaffold_171-1575043694:170016..170428 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00050420-exon-scaffold_171-1491911889:173343..174490 | TCONS_00050420-exon-scaffold_171-1491911889:173343..174490 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00050420-exon-scaffold_171-1510915933:173343..174490 | TCONS_00050420-exon-scaffold_171-1510915933:173343..174490 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00050420-exon-scaffold_171-1575043694:173343..174490 | TCONS_00050420-exon-scaffold_171-1575043694:173343..174490 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_171 | supercontig | scaffold_171:170016..174490 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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