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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00048158 ID=TCONS_00048158|Name=TCONS_00048158|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=688bp CGAGACCAATCAAGACAACATaaaaacttatgTATCAGTTTACTATGAGA ATGAGGTGGGACCTCGTGACGATACTTTAGAATGGCCAATGCCTTGGAAA TCGTTGACTTTCACTTTAATCTTTAATGGAGTTGAAATTGCTCAAACTGT GATAAGAAGTACAGATGAAGGAGGTAGATTGAAAGATTCATTTAAAAGAC CATTTAATCCATGGGCTTACCAGCTTGGAAATCCGTCAGCATTTGAGCAC GGCTTATTCAAGAACATAACTATGAATGATAGTGTTGCATAAGATTTGAA ATGAATTGATCTTATACTCAGTAAATGGTGTAAACTACATTTGAAACAAA CTATCCATTTCCAAGAAATTGTATTTATGGGTGGAGCCTTGGATTAGTCG ATCGAATTATTTATCGTCTTTAATCAACTTTTCAATTTAAGACCTCCATT TAAACCTAAATGATCGATGGTAATTACAGTAATTACTTGACCTTACTCTT AGATTGACTTCGCCTTTGGATATTTTGGACGtatgttttcttcttctttt tagaGTAAGTGAAGAGTTTATAAAGATTACAAATACTCTTTTGGTTccaa ataattttcgaaaattaacaATCAGGGGTggttatttggaacctaagacc atgttcagaaacgaaacggttccgaaacaagtgtgaac Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_141:198058..207762+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00048158 ID=TCONS_00048158|Name=TCONS_00048158|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=9705bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_141:198058..207762+ (Clytia hemisphaerica) CGAGACCAATCAAGACAACATATACACTTATGTGTCAGTTTTCTTTAATA
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atttggaacctaagaccatgttcagaaacgaaacggttccgaaacaagtg
tgaac
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00048158-exon-scaffold_141-1491911889:198058..198078 | TCONS_00048158-exon-scaffold_141-1491911889:198058..198078 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00048158-exon-scaffold_141-1510915933:198058..198078 | TCONS_00048158-exon-scaffold_141-1510915933:198058..198078 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00048158-exon-scaffold_141-1575043694:198058..198078 | TCONS_00048158-exon-scaffold_141-1575043694:198058..198078 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00048158-exon-scaffold_141-1491911889:207096..207762 | TCONS_00048158-exon-scaffold_141-1491911889:207096..207762 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00048158-exon-scaffold_141-1510915933:207096..207762 | TCONS_00048158-exon-scaffold_141-1510915933:207096..207762 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00048158-exon-scaffold_141-1575043694:207096..207762 | TCONS_00048158-exon-scaffold_141-1575043694:207096..207762 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_141 | supercontig | scaffold_141:198058..207762 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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