TCONS_00047544 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00047544
Unique Name	TCONS_00047544
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	885

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_131:171918..182232-

transcript sequence

>TCONS_00047544 ID=TCONS_00047544|Name=TCONS_00047544|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=885bp
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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_131:171918..182232-

Legend: exon

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>TCONS_00047544 ID=TCONS_00047544|Name=TCONS_00047544|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=10315bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_131:171918..182232- (Clytia hemisphaerica)
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TAACACTGAGAAATTTAAAATTATAGGGTTTATATTTTTTAATTACTGGA
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GCTGTTTTGACCTGCAAAATTCTGATTGAAATCCTGATCGTCCAATCAAT
TTAATACAGAGAGAATATTGACCAACGGTGGTTCGGTCTAGCTGCCATCC
ACTTCGTCAAAGAGAGGAATAAATTGACTAATGATCTAAAAAGACACCCC
TGTCTCACAGCCCCGGTGAAACTTTTTCTCACAGTGGGGAAAAATTTTTT
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TCTGCTGACGTCAGCAAAATTTGCAAAAGAAAATATGCAAAAATGTTCCT
ATTATTGAAATGCAACTTTTGTCCAAATTTCATATTTATACCATAAGCCA
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TTTTGCCTAATATCTTTTTTTGGGTGAAAAAATTAATTAACAGCAATTCC
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TGACAAGTGGAAACGGTGATAAAAAATTTAGGTAAATTTGGACGTGCCTT
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ATGTCCAGAAAAAACTTGACGTCTGCGCAACTTCCCCTTGAGTCTTTCTA
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TTTTATTGCATAATTCTCCCTGCTAGTCTGTCAGACACTCCCCTGATTAC
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TTGTTAAAAAATTATAAATAACGTGAACACTAAGAGTTTGCCATAAATAG
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TGATTGCGTGAATAGGCATTTTCGGTTGCGTGAATGCGTGAAAATTGAAA
AAAAAATGCGTGAATGCGTCAATCTGGGCTTTTTTGTGCGTGAATACGTG
AATTTTCCCTTTTTTCCACCGATTATGTACAGTTTTCCCGATTTTCCAAT
GTTTCCCCGATTTTTCCCAAAAATTTTTCCGATTTCTGAACAATCGGGTT
ATTGCGTGAAACTCGAGGAAAGTTTGCGTGAATGCGTGAATTTCGAAAAA
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TTCTTTTCCCTCTTTTTTAAGATCTCTCTGGTACAGTCTAAAAAAACACC
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CGCGCGATACAAAATTGAAAATTCGTGATTTTCTTTTTCCAAGGCAGTAG
GGAGGAGAGCCGGCATATTGAAAGTACCTCTGTAGTGGAAGGTTTCATTG
TGCAATATAGTTAAAATACGGCTTGAACTTTGAATTCAAGTGAAAATACT
GAAGTTTTGGTAATTCTTTCGTGCATAGAGAAAAGACTACAAATATATCT
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CAAAAGTTGAGATGAAAAACGCAACGCTGTATCCCGCGGAGGCGCCATTT
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CTCTAGAGTACTAAAATTATGGATTTGCGGCAAAGTGCCGCTTAAGGTGG
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AATAAGACANGACTGTATGCGGGAATTTTTAAAGCCTTTAATGACAAAGG
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AAAACAGATTTCGATACAGCTAGAAGCATAGCTAGCATCGGCTCCGTACT
TTAACCCCGTCTCTAGTCAAAGATGAAAAAGCCCTCATTGAATTCACTCC
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TAAAAGTTGTGTTTTGTGTCGAGACTATTATGTAAAATATTACAAACAAA
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CGTATATATAATTTCACTTTTGGAATGGTAATGGTAGGGTACTTTCTTTT
TTGAGAGCTGCTTTTCAAGATGGAGGGAGGCTTATAACGAAAATTGCTAT
ATAGTGAGTCGCTCACTTTAATTTTCTTCTTTTCTATTTCATCAGGAGGA
AGCGTGATCACAGATGAAGACTTGAATGGGCAAATGATGGAAGGTTTAAG
TGGAGAAAGAAGTCGATCAGAACGTATGGAAATCTTGACACCGGCCCTTA
ACAATCGACACCTCGTGAAACGCAACACAATGGCGTCAGGGCCGACGACT
CAGGAAGCCAATTTCCGAAAACGTACGTCATAAACGAACTCAATTATTGA
TTGTTTTGCTCTGATTACATTTTGTTTGTTTGTTTACGTGAAAGGTGTGT
TTTTATGACGTCATCACGTGACCAATATTGACAGTGTACTTTACAGAACC
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GTCCATTCCATAAGTTGTGAAACTAAAATTTTGAAATTTGAGAAAAGCAC
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TTGGCACGCGACACTTAATAGAGAGATAGATAAAAGTGAGATATTTCGTA
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CTTAGATATAACATAGAAGTCTTTTCACTTAGCCTTCCCAGCTGGCACAC
AACGTTGTTTCAACGTTTTTCTAACATCTTTTCGTCCATATAACGTTAGA
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AGTAGTTTGTAAAATGTGATCTGTGGAGGAGATTCTATTTATTGAAACNT
GGATTTTCGCGGATGACACTCAAATCCGCGAAATCCGCGAAATTAATCCC
TGCGAAAGTTTATCCCATTACTGTAAAGTACATAAAACTGATTTCTTTCA
ATGCCATGGTTTAATCTAACCTTTGAATCGAGAAAAACTTCAGATCACAA
TCTAAGACCCTCTTTACATTTACAAATTTTAACACATTTCATTATCATTT
GATTTAAAATCACAGGATGTTTAATTTATCTTAACTCAGACAGCTTTATC
TAAGTGTTTCGCAATTCAAACAAAGAACTTACACTTTGTGTGTGTTAGCG
TTTCCAAAAGAAATGATCTGCAACTAATGTCCGCCTGTCTTCCTCCTTTC
TTATATTCAGGTTTGCGTCGATACTTATACGATCCTTACTATCATTATCA
TTATCATCATCACCA

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_030283	XLOC_030283	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_131	supercontig	scaffold_131:171918..182232 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0	0	0	0	0.148311	4.06871	3.68689	3.74313	0.940456	2.50023	4.12577	7.42265	4.29189	4.50172	9.76033	5.64523	6.69011	0	0	3.44565	1.66361	1.10765	2.53651	3.53306	4.40214	0.804671	0.335595	0	0

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00047544 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00047544 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

You are here

TCONS_00047544 (transcript) - C. hemisphaerica