TCONS_00047525 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00047525
Unique NameTCONS_00047525
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length1884

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00047525 ID=TCONS_00047525|Name=TCONS_00047525|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1884bp
CTTTAAACGCGTGGCTTCAACGATCGTTGCACAAAATGGTCTTCGTAGAG
TAAAGTCATTTACAGGCTGTGGATGTAGGCGATATGCAACAGCTATCAAT
GTACGAAACACAGACGGTTTCAATAAAATTGCAGACCAGATCAAAAGAAG
TGAAAATATCGTAGTGGTCTGTGGTGCTGGAATATCGACTCCTTCTGGAC
TTCCTGATTTCAGAAGGGACAGGACTTTACGACAATATTGAAGACTACGA
GCTCACCACCCCTACCGATGTTTTCGATTTACGTTTTTTCAACCACAACC
CTCGTCCGTTCTTCCGGTTGGCTAAATCCTTATACCCTGGGAATTTCGCA
CCTAACAAAGTCCACTATTTCTTAAAATTGTTATCTGTTAAAGATAAACT
ACGTCGCATTTACACGCAGAATATTGATACCCTTGAAGCCATTGCTGGTG
TTCcagataaaaaaatcatttttgctcATGGAAGTTTTCACACGGCCACT
TGCATGAATTGCTCTGCGAAATACAAAGCTGATGACATTAATgaCGAGAT
AATGAATGAACAGATTCCATTATGTCGCATTGACGGATGCCAGGGTGTAA
TAAAGCCTGACATTGTATTCTTCGGTGAAAATCTACCCTTGATATTCCAC
CAAAACTACCCTGGGGACTTGGAGGATTGTGATTTGATGTTGATCTTAGG
CACCTCTCTAGAAGTATTCCCTGTGGCTGGCTTGGTGTATCAGCTTCCTA
AAAATAAACCTCGCTTTCTGATGAACAGAGGCACTGTGGAACCTTTTACA
GGCGATCACCAGACCAGATCGAACGATTATGTGTTTAGTGGTGATCTAAT
GACAGGTGTATCTCGATTGGTCGACCATTTGGGCTGGAATGAAGATCTGC
AGAAGATTGTGAATTCTGGAGATGAAAGATAATGTTTTGAATCAGTTCGG
TTAGACGTAATTAAGAATCGATAAGGATCCAGATGACTTTTTACTTCACC
AAGATATAAATCCGTTCATTCTGGGTAGAACTTTAGACCCCAGTTTAATT
GACATTTTGATGTAAGCGTGGTTCAAATCACGAATCCCTACACAGTAGTT
TACGCAATAAAAAGTTCCAGACTTTTGAACGAAAGAAATATGAGGTAATT
TTCTACACAGTTGCTATGTTACAAACTGCAAATTgaaatttcttataaga
attaaacatttttttcaaatcaaagcATATTAAATTGATCCATCTGATTT
TGGTTAATCAAGTCATTTCACGACAAAATCCATAAAATGTGTGAAGTTAT
TTTTGTAGCATAAACGAAATTATCACCAAACGGTATTAATCAAGGTATAT
CAATCGCAGACTTTCTCAAGATGTACTGCTTATGAATTCatcaatatata
tttttattgagaagtgtattcttataaaaaacctcaATCAATTATATAAA
CAACTTCGACGTGATTCTATGCATGCATtaaaacacatctttttacatcA
GAAAGTTTAACCGTGATTTACCACACGAACCAATAGCATATAAATCCAAT
TGCTTCACTGCAAAACGTTTGTGCTGAAAAAGCAGACTTTGTTTTGTGAA
AATCGTTGGTTTGGTTCGCAATGATTTTATCAAGCTTTGTAAAATTCTTT
CTGTATACTAtacagaaaaattttcaaactgatTTTGATACTGTAATTAT
TTTACTAAAACCTTTATCTCAGTGACCCGGTTGTTTCGGAAATGGAAGAT
TTCTTTCCGAGCTTGCATTGTTTACAGCTCTCAATTTGAAACAAAGTTCA
TTTTAGTTATTGATCGAGAAGTTTTAGAGTTTATTGTATTTTGAAGTCTA
TTTTTCCAACAGATCATTAATACTGATATGTAAT
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_131:132053..146956+

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00047525 ID=TCONS_00047525|Name=TCONS_00047525|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=14904bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_131:132053..146956+ (Clytia hemisphaerica)
CTTTAAACGCGTGGCTTCAACGATCGTTGCACAAAATGGTCTTCGTAGAG
TAAAGTCATTTACAGGTAAGTAGGACAACAAATAATGTACAAATCTACTT
AATTGATGGGAATGAAACTGTTTTTGTCTTCTTATTAACACGCATTTCAC
GGTCCCTCTGGGACCcaagacccactggaaaatttggcagaaatttcGTC
CCCAATGGGATAAATAGCCTAGAATTTCAACCCCAtcgggaaattgactt
tgatttcataccCATCAGTAATTcttcaatgtttaaaaactgcactccaa
aaccatcccactggattctttaactttggaacaatagaatttctgtcTCC
TTTGGGATGTCAATAGATATTTTTATCGACCGGGCTGTGAGACAGAAGCT
GTGAGACAGAGGCGTTCATAAGCTGAGCAAAGTAGATTTCTCCCAAGTGC
TCTTTACTTTTATTACCACTACACCGAAATCTCACAATcgttgccaatat
attatggcactttTCCGGCGGTCAAATTTAAACACAGGGCAATAACCTCC
TCCTCCCTTCCGAACAATGTTGCTGGGAAAGAAATATTGCTTGGCCGGTC
TTTAGCCCCCTCCGACAACATTGTTTGGAGGGAGGGGAGAACTTACTTTT
GAGCTTTGTGCCATAGGTTTTTTCCATGATTGTAGTTTAAAACTCATCTC
TGTTCGATCTTATTACTGGTTTCAAGTTCTCTCAAAAATTGTTGTTTCTT
CTGCGAATAAAGGCTGTGGATGTAGGCGATATGCAACAGCTATCAATGTA
CGAAACACAGACGGTTTCAATAAAATTGCAGACCAGATCAAAAGAAGTGA
AAATATCGTAGTGGTCTGTGGTGCTGGAATATCGACTCCTTCTGGACTTC
CTGATTTCAGGTAATTGATTTTAACAGCTTAAGTTAAGAGATGCTAAGTT
TCAAGTTACTGGAttattttgatagttttttaaCCCTAGCTGAAAGGGTT
GTATGCTATTCCAATGCTAGTTTTATCTAATCgacagaaaattaattttt
tccaactttTCACCGACGAATTGTCTACCGATAAGATATTTGAAATTTTA
GGTTCACTCCAGTAATTTCTCTTAAGCAACAATATTCAGGGTCAAAATGC
TAAGTTCCGATCACTTAATCCAACTTAAGTGGAAATCTATCATACAGTCT
TTCTATGCCACAATATGctgtattatatttttttggaaaacggTAGAAAA
TACATTCTTTATCACCTTGTTTGTCCTAGATCAGAAGGGACAGGACTTTA
CGACAATATTGAAGACTACGAGCTCACCACCCCTACCGATGTTTTCGATT
TACGTTTTTTCAACCACAACCCTCGTCCGTTCTTCCGGTTGGCTAAATCC
TTATACCCTGGGAATTTCGCACCTAACAAAGTCCACTATTTCTTAAAATT
GTTATCTGTTAAAGATAAACTACGTCGCATTTACACGCAGAATATTGATA
CCCTTGAAGCCAGTAAGTAATTGAGAACGCAATCTTTCCAATTTATCTTA
GTAAAATACTTCGACGGACCCGTATTATCTTCCTTCTTTGCGATTCGCAT
TTTAATTCTTTGAATGGAGAATTTCTCAAATATATGGAAAAGCCTTGTAC
TTACTCACTTTCCATACTTTTAATACTTAGTGCACTATTCATTTGATGCA
CCTTGACGCTAACATTTAACTTTTACATACACAAAACTATACTTTCTAGC
AGATTCACTCTAGGTTACTGTGTGTATTTTATATGGAAGGTGTTGATATA
AACCTGCTAAAGGGGCTTTTCTTCTACTTTTTTAGTTGCTGGTGTTCcag
ataaaaaaatcatttttgctcATGGAAGTTTTCACACGGCCACTTGCATG
AATTGCTCTGCGAAATACAAAGCTGATGACATTAATGTAACCATTAGAAT
CATCTCAGATCATCTAGTCAATTCATCTAAACAACTAATGAAaagagttt
ttaatttttttgcagaGACTggaacagtagcgtagacaggaggggcgcaa
aatttgtgtaggagagcagatttttatgacacattAATATTATGAATATA
TGAtaacagtgtcataaaaatctgctctcctacacaaattttgcggccct
cctgtctacgctacagTAGGAAATTGTAGTAGTTGATGTCATTGAACAGT
ATTCCACAAATACTGGTTAGATATTTCAGTTATCTTTGTATAGCTGATGG
ATAATTATTAAGTCTTTCAGcggtattttttttctttaaggaCGAGATAA
TGAATGAACAGATTCCATTATGTCGCATTGACGGATGCCAGGTATTTTAT
GTTGACATTTCTCTGCGTTCCACGAAAGAAGCTTGGGATCCTAATCCCCC
CTACTATGGGACttcacgttttttcataagaacaaactatataagaacat
aaggcttcgatggcaaaaatgttaagaacaagttaagaacattttaaggc
ttcgtggacagccaatttcttaagaaaatagataaaaatggTTACAAAAT
GGTggaattaagaacatttttaggcttaaaacccaaaaaattaagaacct
ccgaaggcttcaaaagttttggatgttcttataaaaaaaagtgtatttaa
cTCAAGCTAACCTTTGTGCAATGGGCTTACTTGTTTGATTTATTATCAAC
TTTTACGATGAGAATGTCATTCTTATCGCCTTTTTCGTCACCCTTAGAAA
GGAAAGCTGGGATCAGTCTACAGACGACAAATACAGATTAGTTCACCAAT
TTGTTGGTTGTCCTATCTTATTTTATAGTACATAAATGTGTCATTGATTG
CTTTTCAATTGTCATTACAATGAGGATTTTTTGGGCACTTAGTACAGGCG
ACGTTTGTCTTCGATACTCTAATATCAACATGGGATCAACATTATCAAAC
AATATTGTCTTTTCTTTTAATAGGGTGTAATAAAGCCTGACATTGTATTC
TTCGGTGAAAATCTACCCTTGATATTCCACCAAAACTACCCTGGGGACTT
GGAGGATTGTGATTTGATGTTGATCTTAGGCACCTCTCTAGAAGTATTCC
CTGTGGCTGGCTTGGTGTATCAGCTTCCTAAAAGTATTCGAGATAAGCCT
ATTTATTTATGCAAGGGGTAGACTTTTTAGCTGGAAATAAGCCATCCTCG
TAGTATGATTCGTTTTCTACTTTCTGATAATCTTTTCTACTGTGTTACTG
TTTGAAGTCTTTTGTCACACTAAATTATGTGTCAAATACTGCTATATTTT
TCACCCAACACAATAAAATTGTGTTGACCAAGCTGGTTATATTCTTCATC
GATTTGAGGGAATTGCACTTCTTTTACGAAATTACTTAATGTTTAGCCCA
TGTAAATCTGGTTGACATGCTTTAATAACACGAATTGaaacactcccttc
tcacaggcCAACTGGCACCCTTTCCCACtaaaaaaattggccaaaatttg
tGTTCCCGCTGAAAgcaatcagataagcaaatcctcactgcaaaattgtg
ctattttttcaatCCGAACTAAATTTTCCGGCTCAAAAAactattgacaa
aaaaaaagcgTTTCTGTCtcccaatagaccttttcataaattacatccGC
GACTACACGACACGGTAGCGTACGGTCATGCTCtgactttcaaaattttg
gagtTTCAAacttaaaagaagtttttactTTAGTGACGTTTCTTTGAATG
GAGGATTGattattttaccttttttggagCTTGCTGATATTATATAGAGT
TTATCTGGAgtcgaaattgaaattttcaagtgttTGTTGGATTACCTTTA
CATCTGGCAAGGAGAAATATTACACGGATGAAAGATATGAGCAAGTACTG
AGGGACTAATAGTACACGTTTGTTcatgatttcaattttgaagacGAGAT
AAACTTATAAAAACTTATTATATATTTGCATCACTCAAAGttgggaaata
ttttttctcactCAAGAAGCACTTTTTCTCTTATACATTGAATTGGAAAA
AGTCGAACGTTTTACTTTTTCGAGATGAATCGCTTCGTCATTTTAATGAT
CTTAATTGCTCTTAATGCATTCGTTCACACTTCGATAATCGATTACGTCG
TTACAAAAAAGAATGAATCTTTTTGTAAACACAACCCATCGAAAATCAAA
AGAATGAAATCGCCTGTTAGTTATTACACAAACTCTGATGCAACTTTCAA
CATCGTATTATCTGGTGATATTGAAATCAATCCCGGTCCTGCACCTAAAT
GCACTAAGTGTGATAAAGGAGTTGGAACTAACAGGAAGCGCCTTCAATGC
GTCAAATGTCTCTGCCTTACCCATGCATCATGCTTAACGCTCTCCAAATA
CGAACAAAAACATATGACATCTCGCATCGTTGTACAATGGACATGCAGCG
ATTGTACTTTGACTGTCCTACCCTTCTTTGGTTTGAGAGATTTGAATTTC
GatgaaagtttttcaaatgaGGAACTTGTTATTGAAAACACTCATCTAAA
ATTATTGAATGAGAACCGTAATTTGACTTCGATCGCACACATAAACGCTC
AGTCGCTTCTTTCTACATTCACCGAATTCTCCACCATGTTAACCCTTCAT
CAGTTTGACATCATTACCGTCAATGAAACATGGCTGCAAGATAACAAACA
ACAGCTAGAATACGTTGAAATCGCCGGTTACACTCCTATCTTCAGACACC
GAGGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNaaattttctttccgccaaaatttcttcctttaaggtacatccaacaga
aaaaatgtatcataactgactggaatgaaattaacaaaatgtttaattac
actatgtttctcttttattttgtagtaatgaactatagcttaattgtttg
atgtttggaggagctctcaggcttgttttaaaatttaaataattttaaat
caagttatcaaatgtttcacattttgtacattattcaacatttttagtct
actctgtttcagtacatctcttacatctgttaaatcacttattaaagcta
tctagctaagctctattggctgaccttccagcctcggctggtttatttat
cttaatttatcattattttatttttcttagatCTTAGATTaactaaatat
atttttttttaacacaaaaatttttgctgctttAGGCAGATATACACATT
TAGACCTTTTCAACCACTTTAGACTCTTTGCCATTTACTCAATATACTCA
TTACTCAACTCCGGTAGTTTCACTACTCTCAAGTCTTCATTCTAGCCTCG
TTTAGCCTCTGGGGTCGTTATAATCCTTTTTAAACTTAtgtatttaataa
aaatttataactattttattctatttattcttttgtattttcactttcat
ttttaagtttaggCGGAAGAGAAATTTGTACAAATTGAAGCCAAATAAat
gtgaaataaaataaaaaaaaattgaattcatcagcattgaaaaaaataga
aatatcaatccccatcaagtttttttccgttatttttacccccactggct
gaaaaaatcccaacgggtctgtgagaagggggtgtatttaaTAGCTCGTA
TATCATTTCCTTTCCTTCTCTAGATAAACCTCGCTTTCTGATGAACAGAG
GCACTGTGGAACCTTTTACAGGCGATCACCAGACCAGATCGAACGATTAT
GTGTTTAGTGGTGATCTAATGACAGGTGTATCTCGATTGGTCGACCATTT
GGGCTGGAATGAAGATCTGCAGAAGATTGTGAATTCTGGAGATGAAAGAT
AATGTTTTGAATCAGTTCGGTTAGACGTAATTAAGAATCGATAAGGATCC
AGATGACTTTTTACTTCACCAAGATATAAATCCGTTCATTCTGGGTAGAA
CTTTAGACCCCAGTTTAATTGACATTTTGATGTAAGCGTGGTTCAAATCA
CGAATCCCTACACAGTAGTTTACGCAATAAAAAGTTCCAGACTTTTGAAC
GAAAGAAATATGAGGTAATTTTCTACACAGTTGCTATGTTACAAACTGCA
AATTgaaatttcttataagaattaaacatttttttcaaatcaaagcATAT
TAAATTGATCCATCTGATTTTGGTTAATCAAGTCATTTCACGACAAAATC
CATAAAATGTGTGAAGTTATTTTTGTAGCATAAACGAAATTATCACCAAA
CGGTATTAATCAAGGTATATCAATCGCAGACTTTCTCAAGATGTACTGCT
TATGAATTCatcaatatatatttttattgagaagtgtattcttataaaaa
acctcaATCAATTATATAAACAACTTCGACGTGATTCTATGCATGCATta
aaacacatctttttacatcAGAAAGTTTAACCGTGATTTACCACACGAAC
CAATAGCATATAAATCCAATTGCTTCACTGCAAAACGTTTGTGCTGAAAA
AGCAGACTTTGTTTTGTGAAAATCGTTGGTTTGGTTCGCAATGATTTTAT
CAAGCTTTGTAAAATTCTTTCTGTATACTAtacagaaaaattttcaaact
gatTTTGATACTGTAATTATTTTACTAAAACCTTTATCTCAGTGACCCGG
TTGTTTCGGAAATGGAAGATTTCTTTCCGAGCTTGCATTGTTTACAGCTC
TCAATTTGAAACAAAGTTCATTTTAGTTATTGATCGAGAAGTTTTAGAGT
TTATTGTATTTTGAAGTCTATTTTTCCAACAGATCATTAATACTGATATG
TAAT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_030271XLOC_030271Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1491911889:132053..132117TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1491911889:132053..132117Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1510915933:132053..132117TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1510915933:132053..132117Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1575043694:132053..132117TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1575043694:132053..132117Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1491911889:132815..132962TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1491911889:132815..132962Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1510915933:132815..132962TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1510915933:132815..132962Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1575043694:132815..132962TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1575043694:132815..132962Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1491911889:133337..133564TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1491911889:133337..133564Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1510915933:133337..133564TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1510915933:133337..133564Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1575043694:133337..133564TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1575043694:133337..133564Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1491911889:133888..133988TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1491911889:133888..133988Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1510915933:133888..133988TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1510915933:133888..133988Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1575043694:133888..133988TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1575043694:133888..133988Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1491911889:134343..134393TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1491911889:134343..134393Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1510915933:134343..134393TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1510915933:134343..134393Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1575043694:134343..134393TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1575043694:134343..134393Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1491911889:135026..135185TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1491911889:135026..135185Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1510915933:135026..135185TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1510915933:135026..135185Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1575043694:135026..135185TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1575043694:135026..135185Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1491911889:145826..146956TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1491911889:145826..146956Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1510915933:145826..146956TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1510915933:145826..146956Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1575043694:145826..146956TCONS_00047525-exon-scaffold_131-1575043694:145826..146956Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_131supercontigscaffold_131:132053..146956 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
4.21628	4.05981	0.908107	1.68438	0.718859	0.153726	0.583169	0	0.563693	0.788761	0.726813	1.09473	1.2158	0.984776	1.31577	2.15266	1.74575	1.22446	0.819383	0.608362	0.628357	1.23527	2.51203	2.10504	0.58687	0	1.26742	1.85585	0.558396	1.1356
Blast
[Close]
BLAST of TCONS_00047525 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: SIR3 (NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-3, mitochondrial OS=Homo sapiens GN=SIRT3 PE=1 SV=2)

HSP 1 Score: 201.06 bits (510), Expect = 2.585e-57
Identity = 113/235 (48.09%), Postives = 151/235 (64.26%), Query Frame = 3 
Query:  210 SEGTGLYDNIEDYELTTPTDVFDLXXXXXXXXXXXXLAKSLYPGNFAPNKVHYFLKLLSVKDKLRRIYTQNIDTLEAIAGVPDKKIIFAHGSFHTATCMNCSAKYKADDINDEIMNEQIPLCRIDGCQGVIKPDIVFFGENLPLIFHQNYPGDLEDCDLMLILGTSLEVFPVAGLVYQLPKNKPRFLMNRGTVEPFTGDHQTRSNDYVFSGDLMTGVSRLVDHLGWNEDLQKIVN 914
            S G+GLY N++ Y+L  P  +F+L FF HNP+PFF LAK LYPGN+ PN  HYFL+LL  K  L R+YTQNID LE ++G+P  K++ AHG+F +ATC  C   +  +DI  ++M +++P C +  C GV+KPDIVFFGE LP  F  +   D    DL+LILGTSLEV P A L   +  + PR L+NR  V P       RS D    GD++ GV  LV+ LGW E+++ +V 
Sbjct:  159 SPGSGLYSNLQQYDLPYPEAIFELPFFFHNPKPFFTLAKELYPGNYKPNVTHYFLRLLHDKGLLLRLYTQNIDGLERVSGIPASKLVEAHGTFASATCTVCQRPFPGEDIRADVMADRVPRCPV--CTGVVKPDIVFFGEPLPQRFLLHV-VDFPMADLLLILGTSLEVEPFASLTEAVRSSVPRLLINRDLVGPLA--WHPRSRDVAQLGDVVHGVESLVELLGWTEEMRDLVQ 388
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00047525 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1
Match NameE-valueIdentityDescription
SIR32.585e-5748.09NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-3, mitoc... [more]
back to top