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The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00045646 ID=TCONS_00045646|Name=TCONS_00045646|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4011bp
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GATGACCAACGTACCTACTTCTTCTGTGACATAGTCTAACTATGGAAAAC
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tgatATCCAAG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_100:172769..190768+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00045646 ID=TCONS_00045646|Name=TCONS_00045646|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=18000bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_100:172769..190768+ (Clytia hemisphaerica)
cgaggattgagccgagaacgctccgcgaactcctgcgcgggtgacaaact
tcaatctgtcaatcattttctcaagcgaagagtatgcgaagcgattctag
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tccctttattttcattcctagaacttttgcaaaaaaaagtgacCTACTGA
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CCTCGTGCCTCGTCCgccattttgattgttttgaaaataattcgaATGTT
GTTTGGCTCATGGCCGCCTTACTCAACTTTCTGGGCCGAATGTTTGGGTC
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CAGCAGACCATTTCGAAATCGAACACTCGAACTGCACAagacaaaaacca
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ATAAAAATAGCTGATAGCACACACACCAGCAGAGACCACGCCCTTATCCC
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ttattttttggacctatcCTAGTCTTttgaggtcctataaattaaccgtt
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AAGACACTCCCAAACTAGCAAATAAAAGGGAACGAACAGGAACGTACTCT
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AGTTCCATTCTATATGTATTTAAAAAGTCGCTTGTGATGAcagattttat
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CTTTCTTAAATGAGTTTTTTATTCGATATCTACTGTATTTTGGTTTATAA
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attttattataagcacttttgaattacattttataaataatccaaaactt
ttctttcattttttctctttgaggctttcattatattcaCACCACGTTAC
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TGatataatacacgtttttttataagaacagaaggctttgatggccaaga
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GTGCAATCTTTTTTATGCTACCATACTATTGGGCTATCCCTGCAAACAAG
ATCCGAATGTGccaacccccgggggggggtggggtactagggcaagatgg
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cgaacctcagcggagcacccccgtcagTCGACAAGGgtaatacccccccc
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tcattcggtttttttttaagaacctacCAATCCAGCATTCCACGAGGTTG
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CATGATGAGTATGAACCATTTTAAAAGCTTGTTCTAgcattacacatttt
tttaagaaactagttttaccaagcagtctcaatatttcttaagaaatcgg
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tctcctatcttctatattgattttctgactttctcaagtgtatCTAACtg
ttaaatatttttctggaattttgccttgattggaaggttcttaaaaaacc
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ttcttacaaaaaacgtgtatttttttaaaaactaacTTGCATATCCAGGC
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taagaacaagttaagaacaattttaaggcCAGGACACTTAAACCGAGTTT
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ttttagctttaaaactcaaaaggttaagaacaagACTTTTGATTTTGcag
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GCACTTTAGAGGGACTGAAACGATTTGAAACAACCCGCAATTTTGACCTG
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GGATTCAGAAAAATCAGTAGCTAACCGTCTTTGTCACAGAAAAAACGCAC
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TAGACTTTTGTCTTGCCTTTGAGATGATATATCCGAATCAATAAGGAAAA
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TTTTTAGAAGTCTGGTGTCACGTTCTGTAATGCGAAGCGTTTCACTTATT
CTACACTTTCGAGTGCTCGACCTTTCACAGTGGCTACTCTGTCAAATCTC
ACTGAGAATGACGTAATTGGATACTTCAATGACGTCATTGCATTGTTGTA
ATGTTTCTTTCTATATTTCGTGTACTCGCTGTCTATAAATATGGTGTGCC
CTAGCCGGATGATCCATGCTGTGATGttatatcagattataaaaatacag
ttgatttttttaatttcaattttcaaaatgtattttcagAAAGGCTGAAG
TGGGTCATTTATTTTACGAAGAATTGTGGTTTCTTTGAGTGAGAATTTTT
AATTGTGATTCTTTGGGAGCTTGGTACTGAATATGACGGTGTGAAATACG
ATTTGACGGTGTGAAATACGATTTGACGGATTTTCACAAAGATTTGATGG
ATACAACCGTCATTTGAGCGAATGTATCTATTTATTTACCACGCTACTGC
TGGGTAGGGGATGAGTACAAATGTTTTGTTTATAGTAGATCTTGTGACGT
TCTTAAGGTGAAGCAGATTCTTGAAATTTGAGTGTTTTATATCCGTCACT
TGATCTGTCAAGTTTGTGCATTGATATCAAGTAGTAGGTGATTGAAATAT
CCAATTAAGACATtctgttttttatatttcgtCCTAGATGGAGAGCAAAT
CAAATTGACCAAAGTATTCCTTTTATGGGAATGTTTCGCCCTCCTCAGGA
GAGACATGCATCTTGTTTTTGTGAAGCTTAAAGTTTCGTGGTGTTTGAAT
AGTAAATCGTCTggtgtcatatttttcaaaaattttatttttaaaaaaat
cttatgaAATATACTTAATGCAGGTTTTTAACCACTTGAAAAAAGACTTT
ATGCTTTGATTTCCATAACAATTTTAATTGCAGGTTTTTGTTTTGGGTTG
CTATTCAAAGCAAAGTAACCGCTGTTTTGAGGCTTTTCCCGTATGGAGTC
ATTcctatagtacgtacgcaaaaaCTTTCCAGATTTTTGCCGCCGCTctc
ccttgtacgcagagaataaaataaatgccgtcatttaaacaatagacgtA
CGACGCACGCTTTTGCTAACCCCCCTCTCCCCTCctcttcactgcgtacg
tactatatggatggcccctatAAATGATTAAGTCAGAAATCGAATGAATT
CTAGACTGTTcctataatttttttaatcttgtgttttttcaaattacaag
atctaaaaaCAGTGTTTTAAATCTGAACCATTTTTAGAATACAAGTGTTT
GTACAACATTTCAATTCAAAGGAAATTAGTTCACTTAAAGCAGTCTTGTT
AAAATCTCGATCAATGGAAGACTTATAATAGTGTATGATAACTTTGCAAA
TAtaataactttacaaatatgTATTTGCATATGAAAGGTGTATTTTCTTC
AAGGGTCTTCTTACACCTTTTTGATAAGTGCAGGGCTAATGTTTTGTCTT
AACCTAATTacactttgagcctgaaatatGCTTTTGCTATGCGTGCTTCT
ATTTCGAATTAGTCTAGTATACAAGACGACTAATTTAGACATAgaagaaa
ataagcaaaaaatgttggAAGAGATAATAGGTAGGCTTTACAAACTAATT
TTGAATTATGCATGCTTTTGTGTCATTATTAATTTCGAACTCAGCGTAAA
CTTTGGTGAGGTTCAAGTTCTTTACAAAATATGCTTAAAAAGATTATGCT
TACTAAAAATGTGTGTGTTTGTGCAACAAGTTTCGCTAGTTTGATAATAT
TATTGTATGATGTTTTTATTCTGAGGCATTGAGGTTAACTTaagttattc
ttaaatttttatcgCCTCCAATCTTTACACAGAAACAACTTTGATTTGCT
TGGTTGGTGCTAGACAGACTCTTTAATTACATTATTATTCAATGATACGG
TATAATTTATATTCCTTtgtttcaaaatgttgaaatacaACTCGAGCAGT
AAATTTCAACACAGTAATAATCATAACTCATACTGAAAGTTTTCGACGAT
GAAACCGGTGCTCTTATATACGTACAGGTTTGGCATGTGTTGGTGTTAAT
TATCTGGCAACGTAGATACAGAaatttcttccgacacgctaaagctctaa
aggtcaggaaaattttcaacatctgaaaggtttagattacggaattttgc
aagccCGTGTCAAGGATTATGCAGCGGGAGTTCTGGTAACCCagcctctc
cgatgggaaattggcctgCTCCTTTAGAGTTTTAGCATGGGCGCTCGCCA
ATCCGCAattggaatatcagataatagTATTAACCTTTTTTATATTAGCT
GTGTTCAAAGAGAATTAAAGAGTATGTTGAATATGCTAGATTCCATAGTG
TGCAAGGgagttccaggtcccacctaacCCTAAAATTCCAACCTTCAATC
CAGACTCCCAGCTGAAAATACTATCCCCACGACAGTGTTGCGGTTGTCAG
TGATTAGGTCGAAGCTCAACCTTTTTATTTCCCAGGGGGGGAGTGATATT
AATAAGCgattcccggtgggggttactagtgaccgcctatagcagtgccg
aTGGACCAAAAGTAAGacctaaaagcctggatttGTTTATTGTGTAGACT
ATGGAAAACAAGAATATCTGTTTGTGAGTTATAAGGAGTTGAATTTCGAT
ACTTTGTTTTGAGAGAGATTTGAAGTTTGGATAGAAATCGATCATGTCTT
GTCGTgctaaattgatatttttacagTGAGTTTTGGCTTGATTTTCATTA
ACTAAGATAAAATCATTTATCATTTATATGTTGTGTATCTGTAGAGGGTG
TATATTTATATGTTGTGTATCTTAATACACTGAACTCTAACTCTATACCT
ACAAGAAATTTGGGTTTGAGTTTGTAAGGGTAGATTACATTAAATGTTAG
TAGCTGAGAGAATACACCTAACGACCTTTAACGGCGGGGTCGGTAATGAA
GAGTTGTGAATTTACAAGGAAACGGCTtccaaattctttttcaatgaaGT
CCAATACAACGACTTGAGACCATTTGATGTTATTCCTCCCTGGTAAACTT
GTACCCAATCTCTTCACGCTTTAAAGTTTGACAAGTGTATTagtacaccc
ctttctcacagacccacagggaacccttcccactagaaaaattatccaaa
gagtcgtcccactggaaaattatcCTCGAATATTTGTTGCAAATGATGCT
TTTttctcatccccactgaattttctgacttaaagtcaaaagaattgaaa
tccccagccatgaaaaatatgggaatatcaatcctcagccataaaaaata
tgggaatatcaatccccatcgagtttcagtccgttgttTTTATCCCAACA
GGgtgaaaaaatcctactgggtctgtgagaagggggtgtattagtGTAAT
AACATCAGAACTTGGAGACTATTCGACTATTCGACTGTTCGACTAAGACC
CAACTATTTGACGTCATTCCTTCCAAGTGGACTGGAGTACAGTCTCCTCA
CGCTTTAAAGTTTGATAAGTTAAATTGCTTGCCTTCAATTGTGATAAGTA
CACAAAAAGAGGAAGGCCTTGTAAAACTCTTCTTGATCAAGTGGTTGATT
CGAGTGGACTGTCTTTGAATGAGTTGTGCAACCGGGCACTTGCAAGGAAA
TGATTTCTGCTTGATAATTTATTATGATGATTGGAGTGTTAGCACTACCC
TATATTACTAGGAATAGTATTTGGTAAAATTATATtagtacacccccttc
tcacagacccacagggaacccttcccactagAAGGAGGTGCATTAGTGTA
ATAACTTCATTGTAGACAATTTGACTGCTCATTAAACTAAGACCCAACCC
TATTTTATACAAATGGTGTATTGGTATATCATTTGAATCTAAAATATGAT
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AGTTTTGAGGTGAATCTTCCAGACGCTAAACCCGTTGGATATAATACTTG
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GTTTGTTCCCTAATATAAGATCCCAAAATGATGCCTCACAATACATATCC
TCTGAAACTCAAAAACTTTTCTTATCGTTTTAGGTAACCAGAAGTATacg
taaaagagaaaaaaagacgAGTTTCGTCGGAGAAGACTATATTTACGAGA
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GAAAGTTACGGCTACCAGAGTCCTTACAAGAACTTTGTCTCGATCATTCC
ATTGAATTTGTTGTGATTGATATGAATAAGAGTTTGGATGAGCAAGGTCC
TTTTGACGTTATTATTCATAAAGTTTTGGAATGGTATAATCAGGGTGAGG
ATGTTGGTGAAGCTAAattgaagaaattattgatgcaCGCACAGGCTAAT
CCGAAACTTGTTTTATTAGACTCTGTACAAAAGACTTATGAGTTGGCTGA
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GAAAACGTGATGGCAATCGTGAATAAACACTCGCTTTCTTTCCCGTTGAT
CACGAAACCGCCACTGACACGTTTCGATGCCGAAGCACATGAcatgtcaa
tcattttttccgAGCATTCCATTGGTGACGTCATGAGTCCATGTGTCATT
CAAGAATTTGTCAACCATGGTTCAAAATTATACAAAATCGCCAATGCCGA
TCGGTCGCACTACATCTGCGAGCGGCCGTCCGTCAAAAATCTTGAAGCCG
GATGTGAACAGACTGTTTATTTTGATTCGATGACCGTCTCAAAGGTTAAT
ATCCATAACAAAGATTTGCATGACATTGACCCGAATCGCCAGAAATTCAG
GACTTATATTGAGGACCAATCGCAGTGTGTCTTGGATCAGCAAATTATAA
GTGAACTTTTGAGACGTATTGTCAaatattctggtctgtattttttcGGT
GTGGANGCTAAattgaagaaattattgatgcaCGCACAGGCTAATCCGAA
ACTTGTTTTATTAGACTCTGTACAAAAGACTTATGAGTTGGCTGACCGTC
TACACAGCATGGAGATTTTGAAACAATGTGAATTTTCATTGAACGGAGTT
GAGGTATTTGTTCCCCGATTCGCATTTGTCGAGAAAACCGATTCGGAAAA
CGTGATGGCAATCGTGAATAAACACTCGCTTTCTTTCCCGTTGATCACGA
AACCGCCACTGACACGTTTCGATGCCGAAGCACATGAcatgtcaatcatt
ttttccgAGCATTCCATTGGTGACGTCATGAGTCCATGTGTCATTCAAGA
ATTTATCAACCATGGTTCAAAATTATACAAAATCGCCAATGCCGATCGGT
CGCACTACATCTGCGAGCGGCCGTCCGTCAAAAATCTTGAAGCCGGATGT
GAACAGACTGTTTATTTTGATTCGATGACCGTCTCGAAAGTTAATATCCA
TAACAAAGATTTGCATGACATTGACCCGAATCGCCAGAAATTCAGGACTT
ATATTGAGGACCAATCGCAGTGTGTCTTGGATCAGCAAATTATAAGTGAA
CTTTTGAGACGTATTGTCAaatattctggtctgtattttttcGGTGTGGA
CATTATTATTGATCAAGAGACTGGGAATTACGGAATCATAGATCTGAATT
ATATGCCTAGTTATAATGGTGCTTTAGATCTTTTCGCTAAAGACTTGTTT
gacaaattaaaagaaattgaCTCTGCTCGAATCATGGCAAAATGATGTGA
TGCAAGTAGAGTCTTTGGTACATTTTTATGGTTATGTTTACACGTTATTT
GGTTCCCAAACATGGAGAGATTATATATGTAGCATGTAGATGGGGTCTTA
GAAAGACATTTATAATGGGATAACAAATGTAAATagcttaactttttttt
tttgaataatctTTCTTCTGGTCTGGAAATTGTCATAGGGGAAATATTAT
TTGTCTTCTCTCAGGTACCAAATGAACggtaaaaactttcaaaagtttGA
GTAGGGTGAAGCCAAAGAAAACTCTGGTGGAGGCTCATAGCGATTCTGAC
GtacaaatcgattttaaactaaATAACAGCAGCGAGAAGGGGTAAACTGA
AGTTGGAATAAGGGTATTTAGACTTTTTTTGATAGGTTAAAAGTATTTAG
AAAACTAAAGAGCTAGGGGGTTTGGTCCATATAAGTCCCGAAGAGTTAAA
ATGAACAAGGGGCGTACAAATGGGCGTACACTAGGCAACAGAGAGCAGGA
TGTATAAAGGATTTGATGGTTTTTTTTCTTGATCACTTAAATAGGATGTA
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GAAAATTGGGGATTAGATAAAAGaattttggtttaaaaaaacCATGGTCA
TTATTAGACattctttatttttagatttaatTTGGTAATggaaaaaatcg
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ATCTgtttaattttgcgaattgcgaatcgcgaaaatggcaaaaactcgcg
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GAAATATTATTTGTCTTCTCTCAGGTACCAAATGAACggtaaaaactttc
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CGATTCTGACGtacaaatcgattttaaactaaATAACAGCAGCGAGAAGG
GGTAAACTGAAGTTGGAATAAGGGTATTTAGACTTTTTTTGATAGGTTAA
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TACCTACTTCTTCTGTGACATAGTCTAACTATGGAAAACACCATTCATCT
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GTTTTTTTGAACAAGGTGTCTCTAATAATTATGAATACGAACATTTTTTC
CGAATCTAATTAAAATTGTatcttttcaattcttttttttgatATCCAAG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00045646-exon-scaffold_100-1491911889:172769..173463 | TCONS_00045646-exon-scaffold_100-1491911889:172769..173463 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00045646-exon-scaffold_100-1510915933:172769..173463 | TCONS_00045646-exon-scaffold_100-1510915933:172769..173463 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00045646-exon-scaffold_100-1575043694:172769..173463 | TCONS_00045646-exon-scaffold_100-1575043694:172769..173463 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00045646-exon-scaffold_100-1491911889:185802..187881 | TCONS_00045646-exon-scaffold_100-1491911889:185802..187881 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00045646-exon-scaffold_100-1510915933:185802..187881 | TCONS_00045646-exon-scaffold_100-1510915933:185802..187881 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00045646-exon-scaffold_100-1575043694:185802..187881 | TCONS_00045646-exon-scaffold_100-1575043694:185802..187881 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00045646-exon-scaffold_100-1491911889:189533..190768 | TCONS_00045646-exon-scaffold_100-1491911889:189533..190768 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00045646-exon-scaffold_100-1510915933:189533..190768 | TCONS_00045646-exon-scaffold_100-1510915933:189533..190768 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00045646-exon-scaffold_100-1575043694:189533..190768 | TCONS_00045646-exon-scaffold_100-1575043694:189533..190768 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_100 | supercontig | scaffold_100:172769..190768 + |
Blast
BLAST of TCONS_00045646 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: ITPK1 (Inositol-tetrakisphosphate 1-kinase OS=Homo sapiens GN=ITPK1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 125.946 bits (315), Expect = 3.858e-30 Identity = 81/284 (28.52%), Postives = 147/284 (51.76%), Query Frame = 2
Query: 779 RVGVCFIELTRRKLRLPESLQELCLDHSIEFVVIDMNKSLDEQGPFDVIIHK---VLEWYNQGEDVGEAKLKKLLMHAQANPKLVLLDSVQKTYELADRLHSMEILKQCEFSLNGVEVFVPRFAFVEKTDSENVMAIVNKHSLSFPLITKPPLTRFDAEAHDMSIIFSEHSIGDVMSPCVIQEFVNHGSKLYKIANADRSHYICERPSVKNLEAGC--EQTVYFDSMTVSKVNIHNKDLHDIDPNRQKFRTYIEDQSQCVLDQQIISELLRRIVKYSGLYFFGV 1615
RVG E +KL ++ ELC +E V +++++ ++EQGP DVIIHK V+ +Q + + + + A+P+ ++LD + L DR S E++++ E + + P F + ++ M ++ K+ L+FP I K + +H+M+I+F++ + + PCV+Q F+NH + LYK+ S+ + +RPS+KN AG ++++F+S VSK + L ++D K E S ++I EL R + + G+ FG+
Sbjct: 9 RVGYWLSEKKIKKLNF-QAFAELCRKRGMEVVQLNLSRPIEEQGPLDVIIHKLTDVILEADQNDSQSLELVHRFQEYIDAHPETIVLDPLPAIRTLLDRSKSYELIRKIEAYMEDDRICSPPFMELTSLCGDDTMRLLEKNGLTFPFICKTRVAH-GTNSHEMAIVFNQEGLNAIQPPCVVQNFINHNAVLYKVFVVGESYTVVQRPSLKNFSAGTSDRESIFFNSHNVSKPE-SSSVLTELD----KIEGVFERPS-----DEVIRELSRALRQALGVSLFGI 280 HSP 2 Score: 125.946 bits (315), Expect = 3.962e-30 Identity = 71/229 (31.00%), Postives = 124/229 (54.15%), Query Frame = 2
Query: 1652 ANPKLVLLDSVQKTYELADRLHSMEILKQCEFSLNGVEVFVPRFAFVEKTDSENVMAIVNKHSLSFPLITKPPLTRFDAEAHDMSIIFSEHSIGDVMSPCVIQEFINHGSKLYKIANADRSHYICERPSVKNLEAGC--EQTVYFDSMTVSKVNIHNKDLHDIDPNRQKFRTYIEDQSQCVLDQQIISELLRRIVKYSGLYFFGVDIIIDQETGNYGIIDLNYMPSYNG 2332
A+P+ ++LD + L DR S E++++ E + + P F + ++ M ++ K+ L+FP I K + +H+M+I+F++ + + PCV+Q FINH + LYK+ S+ + +RPS+KN AG ++++F+S VSK + L ++D K E S ++I EL R + + G+ FG+DIII+ +TG + +ID+N P Y G
Sbjct: 87 AHPETIVLDPLPAIRTLLDRSKSYELIRKIEAYMEDDRICSPPFMELTSLCGDDTMRLLEKNGLTFPFICKTRVAH-GTNSHEMAIVFNQEGLNAIQPPCVVQNFINHNAVLYKVFVVGESYTVVQRPSLKNFSAGTSDRESIFFNSHNVSKPE-SSSVLTELD----KIEGVFERPS-----DEVIRELSRALRQALGVSLFGIDIIINNQTGQHAVIDINAFPGYEG 304
The following BLAST results are available for this feature:
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