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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00021206 ID=TCONS_00021206|Name=TCONS_00021206|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4861bp
TTGTCATCTGTCAAGTCGAGTTTAGTCAAGTCGAGTTTCAGTCaataaaa
aagacttttgtCGTCAGTCAAGTCAAGTTTAGTCAGAGTAATGGACTTTT
TTCATCAGTCAAGTCAAGTCAAGTCAAGTCAGGTCAGGTCAGGTCAGAGG
TCTCATTTAATGTAAGAGTTTTTTATTGTCAACCAATTCATTATTATAAA
TTTTGTCGTACTAAAGTTTAAGTTCATGTAAAATAGTTTTGTCATCAGTC
AAGTCGAGTTTAGTCAAGTCGAGTTTCAGTCAATGAAAAAGACTTTTGTC
GTCAGTCAAGTCAAGTTTAGTCAGAGTAATGGACTTTTTTCATCAGTCAA
GTCAAGTCAAGTCAGTCTCATTTAATGTAAAGGTTTTTTCTTGTCAACCA
ATTCATTGTTAGAAATTTTGTCGTAATAAAGTTTAATTTCATGTAAAATA
GTTTTGTCGTCTGTCAAGTCGAGTTTAGTCAAAGTAAAAGAATATTGTCG
TCAGTCAAGTCGAGTTCAGTCAATTCGAGTTTCAGTCAATGTAAAATAGT
TTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTCTCACTTAATGTAATAGAGTTTTGTCG
TCAGTCAAGTCAAGCTTAGTCAGAGTAAGGGATTTTGTCATCAGTCAAGT
CAAGTCAGTCTCATTTAATGTAAAGGTTTTTTCTTGTCAACCAATTCATT
GTTAGAAATTTTGTCGTAATAAAGTTTAAGTTCATGTAAAATAGTTTTGT
CGTCTGTCAAGATGTTTATTTGATGTAAGATTTGAATATCAAGTTTCAGT
CAGTGGCAGACTCTTTACTGGCAGTCAAATCAAGTTTCAGTCATAGTCAA
TTTCAAATAGTTTTGTCATCGGTCAAGTCAAGTCAAGTTTCAGTCATAGT
CAAGTTTCAGTCATAGTCAATTTCAAATAGTTTTGTCATCGGTCAAGTCA
AGTTTCAGTCATAGTCAATTTCAAATAGTTTTGTCATCGGTCAAGTCAAG
CTTAGGATTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTCAGTCAATGTCAAATAGT
TTTGTCGTCGGTCAAGTCAAGCTTAGTCAATGTAAACGATATTTTCGTCA
GACAAGTCAAGTTTAAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTC
AAGTTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCGTCAGACAAGTCAAGTTTAA
GTCAATGTCAAATAGTTTTGTCAAGTTTCAGTCAACGTCAAATAGTTTTG
TCGTAAGTCAAGTTTCAGTTAATGTAAAAGAGCTTTGTCGTCAGTCAAAT
CAAGTTTCAATCAatataaaagttttttgttgtcagtcaagtcaagtcaa
gtttcagttaaaatccgggtcataatatttgagaaaaaaaggaaaattcc
caTGAAATCTTATAGTCACAAACAATTTCGAAGCGCtctggaagggtaga
gttttaacattagacttaagaccttaggtaggatctgaggatccaaaagt
acaagaatggtccaatagcgCTTAGAATATatcctggaagtctataaact
cctcccgaattgaaatattcgattaaatttaacaaatagcccaaaagcga
ctttctcgcccgaactttaaatttaGTAAACAAGGTAATAccgaaattct
caatatattttgaccgagagtGTAGAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTAA
GTTTGAAATTGTTTAATCATCAGTCAAGCCAAGTTTAGTCAATTTCaaat
agttttttcaaaattcagtcaAGTCAAGTTTTCAGTTAATGTAAAAGAGT
CTATTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTAAAGTAAAAGAGTTTTGTCG
TCAGTCAATTCAAGTTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTCTCGTCGGTCAA
GTCAAGCTTAGTCAATGTAAACTACTTTTTTCGTCAGACAAGTAAAGTTT
CAGTTATTGTAAAAGAGTTTTGTCATCAGTCAAGTCGAGTTTCAGTCAAG
TCAAGTTTTCAGTTAATGTAAAAGAGTCTTGTCGTCAGTCAAGCCAAGTT
AAGTTTCAGTCAGAGTGGGAGAGTTTTGTCATCAGTCAAGTCAAGTTTCA
ATCAATATAAATGAGTCTATTCGTCAGTCGAGTCAAGTTTTCAGTTAAAG
TAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCCAGTTTCAGTCAATGTCAAATAG
TTTTATCGTCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGTCAATGTAAAATAGTTTTTTC
GTCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCGTCGGTC
AAGTCAAGCTTAGTCAATGTAAACGATATTTTCGTCAGACAAGTCAAGTT
TAAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTCAGTCAA
TGTCAAATAGTTTTGTTGTCAGTCAAGTCAAGTTTAAGTCAATGTCAAAT
AGTTTTGTCAAGTTTCACTCAACGTCAAATAGTTTTGTCGTAAGTCAAGT
TTCAGTTAATGTAAAAGAGCTTTGTCGTCAGTAAATTCAATTTTCAGTCA
GAGTAAAAGAGCTTTGTCGTCAGTCAAATCAAGTTTCAATCAATATAAAA
GGTTTTTGTTGTCAGTCAAGTCAAGTCAAGTTTCAGTTAAAATCcgggtc
ataatatttgagaaaaaaaggaaaattcccaTGAAATCTTATAGTCACAA
ACAATTTCGAAGCGCtctggaagggtagagttttaacattagacttaaga
ccttaggtaggatctgaggatccaaaagtacaagaatggtccaatagcgC
TTAGAATATatcctggaagtctataaactcctcccgaattgaaatattcg
attaaatttaacaaatagcccaaaagcgactttctcgcccgaactttaaa
tttaGTAAGCAAGGTAATACCGaaattcccaatatattttgaccgagagt
GTAGAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCTTTAAGTTTGAAATTGTTTAATCATC
AGTCAAGCCAAGAGTTTAGTCAATTTcaaacagttttttcaaaattcagt
caAGTCAAGTTTTCAGTTAATGTAAAAGAGTCTATTCGTCAGTCAAGTCA
AGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTCA
GTCAATGTCAAATAGTTTTCTCGTCGGTCAAGTCAAGCTTAGTCAATGTA
AACTACTTTTTTCGTCAGACAAGTAAAGTTTCAGCTATTGTAAAATAGTT
TTGTCATCAGTCAAGTCGAGTTTCAGTCAAGTCAAGTTTCAGTCAAGTCA
AGTTTTCAGTTAATGTAAAAGAGTCTTGTCGTCAGTCAAGCCAAGTTAAG
TTTCAGTCAGAGTGGGAGAGTTTTGTCATCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGT
TAATGTAAAAGAGTCTTGTCGTCAGTCAAGCCAAGTTAAGTTTCAGTCAG
AGTGGGAGAGTTTTGTCATCAGTCAAGTCAAGTTTCAATCAATATAAATG
AGTCTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGTTAAAGTAAAATAGTTTTG
TCGTCAGTCAAGTCAAGTTTTTAGTCAATGTAAAATAGTTTTTTCGTCAG
TCAAGTCAAGTTTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCGTCGGTCAAGTC
AAGCTTAGTCAATGTAAACGACTTTTTTCGTCAGACAAGTCAAGTTTCAG
TTATTGTAAAAGAGTTTTGTCATCAGTCAAGTCGAATTTCAGTTAATGTA
AAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGTTAATGTCAAATAGT
TTTGTCGTCAGACAAGTCAAGTTTCAGTCAATTTCAAATAGTTTTGTCGT
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TCAGGTTTCAGTCAAAGTAAAGCAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAACTT
CAGTcaaagtaaaataattttgtcgTCAGTCAAGTCAGGTTTCAGTCAAA
GTAAAGCAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAACTTCAGTcaaagtaaaata
attttgtcgTCAGTCAAGTCAGGTTTCAGTCAAAGTAAAGCAGTTTTGTT
GTCAGTCAAGTCAAGTTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTTTCGTCAATCA
AGTCAAGTTTCAGTCAAAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAATTCAAG
TTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGT
CAATGTAAAATAGTTTTTTCGTCAGTCAAGTCAATTTTTCAGTCAATGTA
AAATAGTTTTGTCGTCGGTCAAGTCAAGCTTAGTCAATGTAAACGACTTT
TTTCGTCAGACAAGTCAAGTTTCAGTTAAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCA
GTCAAGTCCAGTTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTC
AAGTTTTCAGTCAATGTAAAATGGTTTTTTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTT
CAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCATCGGTCAAGTCAAGCTTAGTCAATG
TAAACGACTTTTTTCGTCAGACAAGTCAAGTTTCAGTTAAAGTAAAAGAG
TTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTTTGTC
GTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTC
AAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAA
GCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCA
GTTTAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAG
TAAAAGAGTTT Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000379:259598..265003- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00021206 ID=TCONS_00021206|Name=TCONS_00021206|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=5406bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000379:259598..265003- (Clytia hemisphaerica)
TTGTCATCTGTCAAGTCGAGTTTAGTCAAGTCGAGTTTCAGTCAATAAAA
AAGACTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTAGTCAGAGTAATGGACTTTT
TTCATCAGTCAAGTCAAGTCAAGTCAAGTCAGGTCAGGTCAGAGGTCTCA
TTTAATGTAAGAGTTTTTTATTGTCAACCAATTCATTGTTATAAATTTTG
TCGTACTAAAGTTTAAGTTCATGTAAAATAGTTTTGTCATCAGTCAAGTC
GAGTTTAGTCAAGTCGAGTTTCAGTCAATGAAAAAGACTTTTGTCGTCAG
TCAAGTCAAGTTTAGTCAGAGTAATGGACTTTTTTCATCAGTCAAGTTAA
GTCAAGTCAAGTCAGGTCAGGTCAGAGGTCTCATTTAATGTAAGAGTTTT
TTATTGTCAACCAATTCATTATTATAAATTTTGTCGTACTAAAGTTTAAG
TTCATGTAAAATAGTTTTGTCATCAGTCAAGTCGAGTTTAGTCAAGTCGA
GTTTCAGTCAATGAAAAAGACTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTAGTC
AGAGTAATGGACTTTTTTCATCAGTCAAGTCAAGTCAAGTCAGGTCAGGT
CAGAAGTCTCATTTAATGTAAGAGTTTTTTATTGTCAACCAATTCATTGT
TAGAAATTTTGTCGTGATAAAGTATAAGTTCATCTAAAATAGTTTTGTCG
TCTGTCAAGTCGAGTTTAGTCAATGTAAAAGAATATTCTCGTCAGTCAAG
TCGAGTTCAGTCAATTCGAGTTTCAGTCAATGTAAAATAGTTTTGTCGTC
AGTCAAGTCAAGCTTTCACTTAACGTAATAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAG
TCAAGCTTAGTCAGATTAAGGGAGTTTTGTCATCAGTCAAGTCAAGTCAA
GTCAAGTCAGTCTCATTTAATGTAAAGGTTTTTTCTTGTCAACCAATTCA
TTGTTAGAAATTTTGTCGTAATAAAGTTTAATTTCATGTAAAATAGTTTT
GTCGTCTGTCAAGTCGAGTTTAGTCAAAGTAAAAGAATATTGTCGTCAGT
CAAGTCGAGTTCAGTCAATTCGAGTTTCAGTCAATGTAAAATAGTTTTGT
CGTCAGTCAAGTCAAGCTCTCACTTAATGTAATAGAGTTTTGTCGTCAGT
CAAGTCAAGCTTAGTCAGAGTAAGGGATTTTGTCATCAGTCAAGTCAAGT
CAGTCTCATTTAATGTAAAGGTTTTTTCTTGTCAACCAATTCATTGTTAG
AAATTTTGTCGTAATAAAGTTTAAGTTCATGTAAAATAGTTTTGTCGTCT
GTCAAGATGTTTATTTGATGTAAGATTTGAATATCAAGTTTCAGTCAGTG
GCAGACTCTTTACTGGCAGTCAAATCAAGTTTCAGTCATAGTCAATTTCA
AATAGTTTTGTCATCGGTCAAGTCAAGTCAAGTTTCAGTCATAGTCAAGT
TTCAGTCATAGTCAATTTCAAATAGTTTTGTCATCGGTCAAGTCAAGTTT
CAGTCATAGTCAATTTCAAATAGTTTTGTCATCGGTCAAGTCAAGCTTAG
GATTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTGT
CGTCGGTCAAGTCAAGCTTAGTCAATGTAAACGATATTTTCGTCAGACAA
GTCAAGTTTAAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTT
TCAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCGTCAGACAAGTCAAGTTTAAGTCAA
TGTCAAATAGTTTTGTCAAGTTTCAGTCAACGTCAAATAGTTTTGTCGTA
AGTCAAGTTTCAGTTAATGTAAAAGAGCTTTGTCGTCAGTCAAATCAAGT
TTCAATCAATATAAAAGTTTTTTGTTGTCAGTCAAGTCAAGTCAAGTTTC
AGTTAAAATCCGGGTCATAATATTTGAGAAAAAAAGGAAAATTCCCATGA
AATCTTATAGTCACAAACAATTTCGAAGCGCTCTGGAAGGGTAGAGTTTT
AACATTAGACTTAAGACCTTAGGTAGGATCTGAGGATCCAAAAGTACAAG
AATGGTCCAATAGCGCTTAGAATATATCCTGGAAGTCTATAAACTCCTCC
CGAATTGAAATATTCGATTAAATTTAACAAATAGCCCAAAAGCGACTTTC
TCGCCCGAACTTTAAATTTAGTAAACAAGGTAATACCGAAATTCTCAATA
TATTTTGACCGAGAGTGTAGAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTAAGTTTG
AAATTGTTTAATCATCAGTCAAGCCAAGTTTAGTCAATTTCAAATAGTTT
TTTCAAAATTCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGTTAATGTAAAAGAGTCTATT
CGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTAAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGT
CAATTCAAGTTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTCTCGTCGGTCAAGTCAA
GCTTAGTCAATGTAAACTACTTTTTTCGTCAGACAAGTAAAGTTTCAGTT
ATTGTAAAAGAGTTTTGTCATCAGTCAAGTCGAGTTTCAGTCAAGTCAAG
TTTTCAGTTAATGTAAAAGAGTCTTGTCGTCAGTCAAGCCAAGTTAAGTT
TCAGTCAGAGTGGGAGAGTTTTGTCATCAGTCAAGTCAAGTTTCAATCAA
TATAAATGAGTCTATTCGTCAGTCGAGTCAAGTTTTCAGTTAAAGTAAAA
GAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCCAGTTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTA
TCGTCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGTCAATGTAAAATAGTTTTTTCGTCAG
TCAAGTCAAGTTTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCGTCGGTCAAGTC
AAGCTTAGTCAATGTAAACGATATTTTCGTCAGACAAGTCAAGTTTAAGT
CAATGTCAAATAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTCAGTCAATGTCA
AATAGTTTTGTTGTCAGTCAAGTCAAGTTTAAGTCAATGTCAAATAGTTT
TGTCAAGTTTCACTCAACGTCAAATAGTTTTGTCGTAAGTCAAGTTTCAG
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AAAGAGCTTTGTCGTCAGTCAAATCAAGTTTCAATCAATATAAAAGGTTT
TTGTTGTCAGTCAAGTCAAGTCAAGTTTCAGTTAAAATCCGGGTCATAAT
ATTTGAGAAAAAAAGGAAAATTCCCATGAAATCTTATAGTCACAAACAAT
TTCGAAGCGCTCTGGAAGGGTAGAGTTTTAACATTAGACTTAAGACCTTA
GGTAGGATCTGAGGATCCAAAAGTACAAGAATGGTCCAATAGCGCTTAGA
ATATATCCTGGAAGTCTATAAACTCCTCCCGAATTGAAATATTCGATTAA
ATTTAACAAATAGCCCAAAAGCGACTTTCTCGCCCGAACTTTAAATTTAG
TAAGCAAGGTAATACCGAAATTCCCAATATATTTTGACCGAGAGTGTAGA
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AGCCAAGAGTTTAGTCAATTTCAAACAGTTTTTTCAAAATTCAGTCAAGT
CAAGTTTTCAGTTAATGTAAAAGAGTCTATTCGTCAGTCAAGTCAAGCTT
TCAGTTTAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTCAGTCAA
TGTCAAATAGTTTTCTCGTCGGTCAAGTCAAGCTTAGTCAATGTAAACTA
CTTTTTTCGTCAGACAAGTAAAGTTTCAGCTATTGTAAAATAGTTTTGTC
ATCAGTCAAGTCGAGTTTCAGTCAAGTCAAGTTTCAGTCAAGTCAAGTTT
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TAAAAGAGTCTTGTCGTCAGTCAAGCCAAGTTAAGTTTCAGTCAGAGTGG
GAGAGTTTTGTCATCAGTCAAGTCAAGTTTCAATCAATATAAATGAGTCT
TGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGTTAAAGTAAAATAGTTTTGTCGTC
AGTCAAGTCAAGTTTTTAGTCAATGTAAAATAGTTTTTTCGTCAGTCAAG
TCAAGTTTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCGTCGGTCAAGTCAAGCT
TAGTCAATGTAAACGACTTTTTTCGTCAGACAAGTCAAGTTTCAGTTATT
GTAAAAGAGTTTTGTCATCAGTCAAGTCGAATTTCAGTTAATGTAAAAGA
GTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGTTAATGTCAAATAGTTTTGT
CGTCAGACAAGTCAAGTTTCAGTCAATTTCAAATAGTTTTGTCGTCAGTC
AAGTCAAGTTTCAGTCAAAGTAAAATAATTTTGTCGTCAGTCAAGTCAGG
TTTCAGTCAAAGTAAAGCAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAACTTCAGTC
AAAGTAAAATAATTTTGTCGTCAGTCAAGTCAGGTTTCAGTCAAAGTAAA
GCAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAACTTCAGTCAAAGTAAAATAATTTT
GTCGTCAGTCAAGTCAGGTTTCAGTCAAAGTAAAGCAGTTTTGTTGTCAG
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AGTTTCAGTCAAAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAATTCAAGTTTCA
GTCAATGTCAAATAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGTCAATG
TAAAATAGTTTTTTCGTCAGTCAAGTCAATTTTTCAGTCAATGTAAAATA
GTTTTGTCGTCGGTCAAGTCAAGCTTAGTCAATGTAAACGACTTTTTTCG
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AATGTCAAATAGTTTTGTCATCGGTCAAGTCAAGCTTAGTCAATGTAAAC
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CAGTTTAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTA
AGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAA
GAGTTT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00021206-exon-sc0000379-1575043694:264867..265003 | TCONS_00021206-exon-sc0000379-1575043694:264867..265003 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00021206-exon-sc0000379-1575043694:264411..264638 | TCONS_00021206-exon-sc0000379-1575043694:264411..264638 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00021206-exon-sc0000379-1575043694:259598..264093 | TCONS_00021206-exon-sc0000379-1575043694:259598..264093 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00021206-exon-sc0000379-1510915933:264867..265003 | TCONS_00021206-exon-sc0000379-1510915933:264867..265003 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00021206-exon-sc0000379-1510915933:264411..264638 | TCONS_00021206-exon-sc0000379-1510915933:264411..264638 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00021206-exon-sc0000379-1510915933:259598..264093 | TCONS_00021206-exon-sc0000379-1510915933:259598..264093 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00021206-exon-sc0000379-1491911889:264867..265003 | TCONS_00021206-exon-sc0000379-1491911889:264867..265003 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00021206-exon-sc0000379-1491911889:264411..264638 | TCONS_00021206-exon-sc0000379-1491911889:264411..264638 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00021206-exon-sc0000379-1491911889:259598..264093 | TCONS_00021206-exon-sc0000379-1491911889:259598..264093 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000379 | supercontig | sc0000379:259598..265003 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
|
