TCONS_00021066 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00021066
Unique NameTCONS_00021066
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length2270

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00021066 ID=TCONS_00021066|Name=TCONS_00021066|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2270bp
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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000377:176603..188691-

Legend: exon
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>TCONS_00021066 ID=TCONS_00021066|Name=TCONS_00021066|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=12089bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000377:176603..188691- (Clytia hemisphaerica)
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ATATGGTATATTCACTAGAATAAATGTACGCTAAATATAGAAATCCTGTT CCGATTTCGTGTGTCTCTCATTTTAAAATCTCACTATGCAAGGATTGTAG AGCGGAATTTTCTACTTAATACTTATTTCCGTGTATTTATTACAAAGTTC TCGTCCTTTCTCTTCACAGTTCAAGGAGAAGGCATTGAATTTACTGACCC CCGGAACATTCAAGAATTCGGATCCGGATCGGCTGAAAATGGTCAAGTTC CGGATGATACGGAAACTGATGGAGAAGATGACGATGACGATGATGATAAC AAAGATGACATCATCAAGAATGATATCATTAAAAAGAATGATGGTAGCAA AGAAGCGACGACTATAACAAAAACGAAAGTGGAAAAAAGCATTGAAACAA ACTCTGTTAAAAAAGATAGTAAATTTTGGAAAAAAACATCAAAGTTGATC AACAGAGGCAAAAATGAACGAGGGAAAGTACAAAATATTGTCTACTTTGA TGACCAGAAAGCGAGTAAGAAAAGGAAACAAAAGGAGGATGAGAAAAGAC TTCAAAAAGCATGGCAAGCTTTGAAAATGCGATATCAAAAATGGTATGAA AATTCAAAATACTATCGGTGATAATTTGTTTTACAAAGGATAAACGATCC GTCGTGTTTAATAAAATGTTACTTAGAAAATAAGATTAGCGGTAAAAAGT TACTCTTCAGGCGATAGAAAAGAGTACAATATAGCCAAATACTACAGGGA AGCTACTCAACAATGGTTGTAAAATAAGAATTGCTTGGCATTGGACGGCG AAAAAGCCATGCCACATTTCTGGAATGGTTGAATATTTTAATGTGACTGT TTATTGCCCCAATTATAATATGGTTTGTTTTTGCTTAGTCTTCTATGATG TGTACATTGAGGTCAAGCTATTTACCATATCGCAGCATATTAAAAATTTA 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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_011811XLOC_011811Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00021066-exon-sc0000377-1575043694:188321..188691TCONS_00021066-exon-sc0000377-1575043694:188321..188691Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00021066-exon-sc0000377-1575043694:179283..179444TCONS_00021066-exon-sc0000377-1575043694:179283..179444Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00021066-exon-sc0000377-1575043694:178668..178934TCONS_00021066-exon-sc0000377-1575043694:178668..178934Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00021066-exon-sc0000377-1575043694:176603..178072TCONS_00021066-exon-sc0000377-1575043694:176603..178072Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00021066-exon-sc0000377-1510915933:188321..188691TCONS_00021066-exon-sc0000377-1510915933:188321..188691Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00021066-exon-sc0000377-1510915933:179283..179444TCONS_00021066-exon-sc0000377-1510915933:179283..179444Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00021066-exon-sc0000377-1510915933:178668..178934TCONS_00021066-exon-sc0000377-1510915933:178668..178934Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00021066-exon-sc0000377-1510915933:176603..178072TCONS_00021066-exon-sc0000377-1510915933:176603..178072Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00021066-exon-sc0000377-1491911889:188321..188691TCONS_00021066-exon-sc0000377-1491911889:188321..188691Clytia hemisphaericaexon
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TCONS_00021066-exon-sc0000377-1491911889:178668..178934TCONS_00021066-exon-sc0000377-1491911889:178668..178934Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00021066-exon-sc0000377-1491911889:176603..178072TCONS_00021066-exon-sc0000377-1491911889:176603..178072Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000377supercontigsc0000377:176603..188691 -
Expression

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Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.800444 1.20861 0.292356 0.200217 0.0928554 0.0458597 2.01393 1.64715 2.40071 2.16511 2.02303 2.04638 2.32975 2.06873 0.342111 0.304199 1.52484 1.1192 4.23615 6.07958 2.23853 2.15534 1.68752 1.64186 0.674584 0.824726 0.0236036 0.0251904 0.028659 0.0681311
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00021066 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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