TCONS_00019988 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00019988
Unique NameTCONS_00019988
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length2854

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00019988 ID=TCONS_00019988|Name=TCONS_00019988|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2854bp
tgATAAATAGAGAAGAATAACAAGAAGCTTAGTTTAGAACAGTCACGATA
TCCGATGAAAACAGATCAACTTCACACACGCGCACACTAAAGTCATTGCT
TGAAGGAACAGGAGTGGTATTTAGCAAATTATAAAGGGTTTCTTATTATC
GAGCATTTTTAAATTATCCTTGGTTGTGGTTCGAAGGCAAAGTTTGGATG
TGACAACAATCTATCGGAAAAAATGTTAATGAAACAATTATCACCAAGAT
CTTTGAAACGATTGAAGGAGAATGGGGCGAGCAAtaaacaaaatcaacaa
aaagaacaaaagactTATAAAGTGGTCGTTATTGGAGATTGCGAAGTTGG
AAAGTCTgCATTGACAATGCAATATGTCAGCAATGTATTCCTGGATTTCC
ACGATCCAACCATCGAAGATTTCTTCCAAACACAGACTGTCGTTGATGGA
GAATCAGGGATTGTTGATATTTTGGATACAGCAGGCCAAGATGGAAGTCA
AACAACAATGAACGAGCAATATTTACGCCAGGGCGGCCAAGCTTATATTG
GCGTTTATTCAATCACCAGCCTCCCTAGTTATAACCGTCTGCGTAAGCAG
ATCCAAACGTTGAAACGTTTACGTGCTAACGAACGTATCCCGTTAATTAT
CGTTGCTAACAAATTAGACTTATTTAATGATCGCGTTGTATCAACGATGG
ACGGTATCGCACTAGCCCGTGAATTTGATTGTCCCTTTTACGAGGCCTCA
GCGGCTAATAGAATCAATGTTGAAGATGCTTTTAATGGACTGATTCGCCA
AGTACGAAAAATGGAGAACGACATTATGTTTGAATGTGAGAATCTGAAGA
AACCGAAGCTGAAACGATTCCGTAAATACGTATGTAAGAAGATTCAAAGT
CATATTGTGATTTGAAATGGTCAACAAATTGGAATCTTAGAAGCTGGATA
GTTAGTTGGAGTGGTTAGATGAATACTATGTACCTTTATGACACACATCA
GCAGTGACTCATCTTTGTGCTTGGTGAAATTGCCACAATCTCAAGATCTA
CGGTAAGAGGGAAAACATACATTGTCACTTTTTATGGTACAATTAGAAGA
CCAAGTGACTGGTACAAGACATCTCAATGGTAACATGTATTGCTATAGAG
AGATTCAAAGGGTAATAGACTTAATGCTGGAGTTGACTTTTGGAGCGCGA
GTAGCCACCAAGAAAAGACCTTTGCCGGTGAATTAATCAACAGAGTGGGT
AATTTTTcacaatgaaaacattttttgttgttgtgtgtttttgttttgtc
tAGCCTCTAGGTGATCAGGCAAACAACCTCGATAATTTCCAGACTATTTT
CAAAGAAGGGGGATTTATTTGAGTCCACCGAATAAAGAAAGCTTATCAAT
ACTTGAATGAGAGGAAGCTGGTGAATATGTTGTATTTTTAGAAAACTTCC
ACAAAAACAGGATTTGATTTGACAATCAATATCTCCTTTAACAACACCAT
GCGAAAACGATCTAGAGAAAAGGTGGAAGACAAAATGTCCTTCTATTTTT
CGCTCGATATCACATGCGTGCGCGATGTTCGTTTAAAAGTAAGGCGACCG
GAAAAAATAGCTTTCCACTGCTGTCTTATGATAATTATGTTTTTGTGCAG
CATCAGCAtattgtttgttgttgtttttggagAATTAAANAATGATAATT
ATGTTTTTGTGCAGCGTCAGCAtattgtttgttgttgtttttggagAATT
AAAATCGAGACAAATGTTTGATTCATTGTCTCGCTTATCCGACGGATGAC
GGATGGTAAATAACCGTCTGGTTtacaataataaaaagaaagggaaaaac
AAGCTTTTTGATGAGGTTTTCTACTTAACTTTTCGTGGGATTTTGTTATT
CGACATTTGACTATAATGCATTATTTTTGGGATGTTTTTCAAGGAAAACA
ACAATCTAACTAATCAATCAAAAaactatattttgaaaacaCTTATCAGG
GTATAGttaaaataacaacaacaacagccgTTAGCCAATAATATTAAACC
ACCACATATGTCTGTAATTGGTTTAATGATCAAAACAAGTTATTATCTTT
TAATGATCAATCATTATCTAATTAACATCAAAACAATAGCATAACAAAAA
CAACAGGAAAAGTACATTTTTCGCTGGCTACTtacttcaaaataaataaa
aacgatTTGACCTTTACATGCATACAATAATTTATAAGAGCACAATCTAT
AAGAACATTAAAAAGCTGATGAAAACGTTTTTAAGGTGTTAAAGTGAAAA
CTtaaggttaagaacatccaatttttttgacgttcttataaattaaaagt
gttaagaaaaattattattttcccagtttatttaaaaaacactttcgatt
tcctCTGAGTTGTTCCTTTAAGGAAATTATAACTTTCTTAACTATGCTAA
AGTTTTGACCTTGGAAATTTTTCTGTTAAGCAAGTCTATTGTGCATTTTT
GGTATTATCGAGGCAAACTGTcacttaaaaattttttttttttaattcca
cTAGAATTATTTATTTGTTTAACTAGTACTTTAGCGTGTACCGTTTATGA
TATTTACTTATTGTTATTTTGACAGTTTtgcaaaaataatataattttgt
gACAATTATATATTAAAATTGGACCGAAAATTTGAAAGTAGCAAAAataa
tttagacaaaatttaaTATTGATAAAGgaatttattgtaaataaacaAAT
GTCTTCTTTGTATATAACAGAAGTTTTAGAGAATTTTATATAAGGAATTT
TATTGAGCTAATTAATAAAGTTATGAaatatttgaatgaaaaatgaataa
aagt
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000345:49399..57763-

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00019988 ID=TCONS_00019988|Name=TCONS_00019988|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=8365bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000345:49399..57763- (Clytia hemisphaerica)
TGATAAATAGAGAAGAATAACAAGAAGCTTAGTTTAGAACAGTCACGATA
TCCGATGAAAACAGATCAACTTCACACACGCGCACACTAAAGTCATTGCT
TGAAGGAACAGGAGTGGTATTTAGCAAATTATAAAGGGTTTCTTATTATC
GAGCATTTTTAAATTATCCTTGGTTGTGGTTCGAAGGCAAAGTTTGGATG
TGTAAGCTTTTATGGTATGTTATTTTCTGTACGAGTTCAGAACCGGCGGA
AGCGGGGAGACTGAGGAGACTTACGCCTATCCCCACTTTAAATGAGATTT
TGTTCTCAAATTCCTAGCGAATTTTATCTCATTTTGAGCCTTCAGCCTTC
CCACTTTAACGGTTGTTCCGCCGGGCATGGAGTTATGCCCTTGCAACATT
TAAGACCAACAGTTTATTACATATATAATATATATATATAATACATGGAC
ATCAGAACCTTGTCTTTTTTAATTTCCTACATTTTTAAAATGGACAAATT
ACGGAATCAATTTTAAAAGTTCAAAACGCTGGACTACGTTACTACTTCAA
ACTCGGGTCCAGTCTCTTGATCCACTTTTTTTATGATTCTTATACAAAAG
TTTGCATCACAAGTCGGTCTAGAAGACTGGACGCTAGTTCCTTTAGTTAG
AAAGTTGGGTAATGATTGACCTCGTCAACATCTTGTCAAGTAGAGAAAAG
ATAGTGAGATTTTAAGATTCGCGTGACAGAAAATCGTGATTTTGCATTTT
CACACAAACCAACAACAAACTAATTAAGAAAGATTTCCCGAGGGTAAAAA
ACACCAGTCCGGGTGGAGGGGTGTCTTTTGCTCAAAACAATAACAAAAGG
AAATACTGTAAATATTTTTGACAGTGCAAGCGATTTGCAATTATAACAGT
GGTGATAGTCGAGGTCGGTAAAACTGTTTTTAAAAATGAGTCTATTTTCT
CTTACATTGGAATGTGCTTGTCTTAACTCTCTTTAATTAATTCCATATAA
AAACACAACGTCATCCTTTGTCATCCAATACGAAAAATTGCATAAATTAG
CGTTGGAACTAGTCATAGCTTTCACTAAATGCCCCCACTGAAAGGTCATG
ACATGCACTTATAAAGCTTTTAATGCTTCAAAGATTTATAAAGCTTTTAA
TGCTTTAAAGATTGAAACATGAAAAATAATCAGGAATAATTAATTGATTT
GATTATTGATTTATTTATTGATTGATTGATTGATTGATTAATTGATTCTC
TATTGCTACTTTGCCTAATAAACAATAGTCAAGAGGATACTGTGGATAAA
ATTCATCAAAAAGTTCTGCGCCATCTTAAATAGGGCGAAATAGAAACCAA
TCCTAGCTAAGGCCCGGACTCCACTCACCTACGCTGTGATTGCACTTCTC
AAGCAAAATCTTTTATGTTGTTGGTCAAAAGAAAATACCGTAAGTTGGTC
TAATGTCGACACCCGTCTTCTAATTTTGACATCCTTCTTTAGAGATAGGA
AAATTAGCAAGGTCGGAATCGCTGATTGAAACTAATTTTCTTTGTGAAGC
AATCAGAGAGGAAATAAACATTTCTCCATCAAAGTTCCCACCTTCCCATC
ATTCCTATCTTCAAAGTAGGGTGTCGAAATTAGAAGACAGGATGTCGACA
TTAGACCAACTTACGGTAATAAAGGAATGCCATTGTGGTCCATTCAGACG
TACAGTCGAGAAAAGTTGAAATGCGCCAAAGTTCATAGTACTTAATTTCA
CGATGCAATCTTTTCTCCAAGCTGAAAGGATTGAATCCATTAAGATGATC
GCAGCGCAGACAATGAAGATACGTGCCTTCAGGAAGCTAGACTTTTTGAA
TTTATAGTTATATACTTTCACTTCATGGTGTTTCTGTATGACTGTCTGTG
TGCCTAGTCTAACCACCGTTAAATGCCTTCGGGAAGGTCCCTCCTAACTT
GGAAAGCCAGAATTGGAGCTATTTCACCAAACTACTGGAGCGCAAGTTAT
TACGTAGGCTATCACAACTGAAAAAGTTGAATGTGCGCCTATACAAACTT
TTTTCAGGTTTTTCAATTAGATTTACCACACTGAACAAACAGTGAAAACA
CTCTAAGTTAGTGAGGTAAATCTAATTTTGAAGACCAAAAAAATAACAGA
CGACAAAGATAAATTCAGAAATTACAGTTTGAACAAAAATATCAACAAAT
GTACATTTGAAAACTTGAGCAAACTTCTTTAAAGATTCCAGAAAAAGAAT
TGAAACCATTGCTGAAATGAACTTCTGACTAAATTACAGTATTTATTCAG
TTTTAAAGACAAGAAACAAAATTAGCCATACAAAACACTTTTTCCAGTCA
AAGACGAAAGAATCAGCTCATAACCAGTCTGCCATTTTGTTTGTTTTGAT
TTGCAAAAGTAATATTGTAACTCGTGTTATGGTGTAATTATATACTTTTT
CTATAATTTGCATTTATAACACTCGCTTCAGCTTTTCAGTGCTAAAATCA
AAACTAATGAAATGTAATATATAATAATGGTAATAGCATATAATGTAATA
TGAAAATGTGTATAACATTTACCGCTGTATAATTTACCGCCATATTTTTG
CGGAACACTTAATTGGCCGGAAATCAAANTTTTTCTCGGACAGGACAACA
ATCTATCGGAAAAAATGTTAATGAAACAATTATCACCAAGATCTTTGAAA
CGATTGAAGGAGAATGGGGCGAGCAATAAACAAAATCAACAAAAAGAACA
AAAGACTTATAAAGTGGTCGTTATTGGAGATTGCGAAGTTGGAAAGTCTG
GTAAGTTTAAAAAAATATTTTTTTTGGGGGAGGGCTAAATTTTTGAAAAT
TATACCGGAGCCAAAACGTTTAATAATAAATCTGAATTTGGAATCATTTG
CATTCGATTTAAAAAGATTGGGATCAGATTTCTTCAGATATATTGATACT
TGGATAGACGCTTAGAGAACTTTTCAATATTAATTTTACATTACATAGCG
CCTGCCTTTATCTGCAAAAACAAAACCTAAGCTTTCTGAGAATTTCTTTA
CATTTTATGAATTCTAATACTGCGAGACTATTTTCACATGAATTCTGCTA
AAACCTGAATAAAGGTTTGTTTTGATACGTTTCAAAGTATTGATGTGATT
GATATCTTATTTTGATTTTATTGATATTTTATTTTGCATTTTGCTACAAA
AATAACTAAAACTATTTTTCAATAATTGATGTTTCTGTGTCTACATATGG
TGTCTCGGTGGGGAAGAAAATTTTGCCAAGGGAAACTCAGAAAAACCTTG
TTGTTTATGTCTACTTTATACAGTTGAGAAAAAAAATCAAAATTTAATAC
ATGCTGCGTAAAGATTTTGAAAAATAACAATCTTACAATATTTATGAATT
AGAATTTCTTATTTTGACGAAAATAAAATGAGCAACTTACTTTATGACGT
GTGCTAGACAAATGGAAAAGTAGGGGGTCAACTATTTTTAAGTCATCAAT
ATTCCCTAAAATTCAAAAAATATCGTACCTACTGTAGATCGCCTAGGCAA
CCCGAATCGAGGCATTTCTTTAATGAATGAGGAATCGTGTTTTTGCTAAG
TTTTTGTTATGGCATAATAACCGCCCAATATTTTGTCTGAGATTAAATAA
GAGACGTTATGAACATGTAAGAAAATCTCCTAAATACAGTATAAAACTGA
TGATGCATATCAAATATAATATTCCTCAAAATGGATGCAAATGTCTGGAT
ATGTAATACTGTACATCCAAAAGATTTGACCTACCAAGCTACAGATTATA
ATCTACTGTACTCTCTTTCTAGCGATACAAAGAAAATTCGTGTTCTTAAA
AATAAACATGCTTATAAGTTAATAAACAATTTATAATCCTAAGGATAAGT
TTCATTTATAAGACTTGAAACTCAAAGACTGTTTTAAAAACCACAAAGCA
CAAACAATCTGACGTGGTCCTCATGAGATTTTTAAATGACGTATATGGTT
GTTTACGAGAAATTATGAACGTTAGTGTTACGGGCCAAAAAGAATTAGAG
TATGATTAATTTTCAATTTTGAACTCTACAAAAACAAAAAACAATTTTGT
TGATTGAAAAAAGGTTTCTGCGAATACTGTCGTAGGCGTTCTTCCGCGGG
TAAATTAAGTTGTTGTTTTCGGATATCGTGATTTCTCTTTAGTAAACCCT
CTCTCTCTCTCCTTTGAGTAACAAATATCAAAACGTTTTTCTTTTATGAG
AACAAATTTATAATAACAGAAAACCCAAGAATAGTAAGAACAAGTGAGAA
CATTTTTATAGACTCTAAAGCACCCAATTTCTTACGAAATTATACAGAAT
TACCCACGAAATGGTACAAGAAACATTGGACGTTCTTGTAAAAAAACGTG
TATAACAAAAAAAACCACGAAAAATAGAGTGCGAAATTATCAGCAGCTGG
AAGTTCTTATATCTAAAAACAGGAGACGAATACACGCTTTTTTTTATAAG
AATGGTGTAAATCCGAAATGGATTTTCTTAACCTTTTTGGGAAAATCATT
CTAAAATATTCTTACAGCACATTCTTAGGTTAGAATCCTAATTCATACTA
TATTTAACATTTAGTACGTACGTCTCAAGCATAAAATGGCATTTTTGTGA
AAGGAGTGAGCCTAACTTGGGAATAATTGATAATTGATAATTGAAAATGG
CATTCTTAGCTTTAGTAGCAAAATTCCATGATGGTGATATATTCTTAACA
TATTCTTAGTTTTTTGGCCATTTTCATATTCTTATAAAAAAGAGCGTGTA
CTGAGAGAGTCGAAGCCCAGTCATCGATAGTCGATATAATAGAAATTTTC
GTTAACCCGATTATTATAACTTTTTGAAAAGTCAAAACTGAAGATAATTC
ATAGAAGGCTTCTTAAAACTTTAGTTCCTCTATGTACACTATGTATGTAT
ACTTCCGACAATAACAAAATAGAACTGCCTCTCTATCTGTGTATTTGATA
AGAAAAACCGACAACAACAAAAACAAAAACAACATTTTGACCGAGTCATC
AGCATTAAAAGAAAATGATAAAAACAACAAACAAGGAACTTTCACTTTTT
TATCAAAATAAACAACTTATTTGAAGTCCTATATTTGTGATGACTCATTT
TCAGTCAAAATTGAAAACAAGATGGTTGTTGTGACGTAATGTTATGAACC
CCAAAAACATGGCTGGTAAAGATATTAAAAGCAAGTCACCGCTAATAAAG
GGAAAAGAGAAATTTGCCCATAAGGGGTTTCTATTAGAAACAAAAACCCA
TGGTTACAAGATGTTTAGTGAAATGTCCTACCCTGCAAGAGATAGTTAAA
AAAGACCGTCCCGCAAAAAGTCAAGATCCGGTCAAGATATTGTTTGGACC
TTGAAAAACACTTTAAAAATGACCACTCATCCAAAATGACCATTTTATGG
ATGTTAAGAGAACAAAGTTTCCCAGCTGAGTAGTAGTTTATTTAAAGTGT
CCGTGTTTTTAGAAAGAAATCGTCAAATAGTCAAATCTCTATTTCTTTTC
TTTGCAGCATTGACAATGCAATATGTCAGCAATGTATTCCTGGATTTCCA
CGATCCAACCATCGAAGATTTCTTCCAAACACAGACTGTCGTTGATGGAG
AATCAGGGATTGTTGATATTTTGGATACAGCAGGCCAAGTAAGTCAATTA
ATATATCTCTCAAAGGGAAAAATAATTGGTCCTCCAACAGATTCGTGCAA
CTTCTATAAACTACATTCGATTATGTATGAGATTCACACTAAGGAAAATG
TGTTCGCATTCTTTGAAGTAATCTATATTTGTACGAAATGACGATGAAAC
AAGGCGTTCCAAAGTGTCCTTCTAAGATCTTCATTTTATAGATAGCCGAA
TGGACTGGTCACTCAGAGTCTGCGTAACAAAGAAATCTAACGAATTCTAA
ATAAATAATCTTTGCTTTAACTAATCGATACATTTTTTACCCATTTTCAG
GATGGAAGTCAAACAACAATGAACGAGCAATATTTACGCCAGGGCGGCCA
AGCTTATATTGGCGTTTATTCAATCACCAGCCTCCCTAGTTATAACCGTC
TGCGTAAGCAGATCCAAACGTTGAAACGTTTACGTGCTAACGAACGTATC
CCGTTAATTATCGTTGCTAACAAATTAGACTTATTTAATGATCGCGTTGT
ATCAACGATGGACGGTATCGCACTAGCCCGTGAATTTGATTGTCCCTTTT
ACGAGGCCTCAGCGGCTAATAGAATCAATGTTGAAGATGCTTTTAATGGA
CTGATTCGCCAAGTACGAAAAATGGAGAACGACATTATGTTTGAATGTGA
GAATCTGAAGAAACCGAAGCTGAAACGATTCCGTAAATACGTATGTAAGA
AGATTCAAAGTCATATTGTGATTTGAAATGGTCAACAAATTGGAATCTTA
GAAGCTGGATAGTTAGTTGGAGTGGTTAGATGAATACTATGTACCTTTAT
GACACACATCAGCAGTGACTCATCTTTGTGCTTGGTGAAATTGCCACAAT
CTCAAGATCTACGGTAAGAGGGAAAACATACATTGTCACTTTTTATGGTA
CAATTAGAAGACCAAGTGACTGGTACAAGACATCTCAATGGTAACATGTA
TTGCTATAGAGAGATTCAAAGGGTAATAGACTTAATGCTGGAGTTGACTT
TTGGAGCGCGAGTAGCCACCAAGAAAAGACCTTTGCCGGTGAATTAATCA
ACAGAGTGGGTAATTTTTCACAATGAAAACATTTTTTGTTGTTGTGTGTT
TTTGTTTTGTCTAGCCTCTAGGTGATCAGGCAAACAACCTCGATAATTTC
CAGACTATTTTCAAAGAAGGGGGATTTATTTGAGTCCACCGAATAAAGAA
AGCTTATCAATACTTGAATGAGAGGAAGCTGGTGAATATGTTGTATTTTT
AGAAAACTTCCACAAAAACAGGATTTGATTTGACAATCAATATCTCCTTT
AACAACACCATGCGAAAACGATCTAGAGAAAAGGTGGAAGACAAAATGTC
CTTCTATTTTTCGCTCGATATCACATGCGTGCGCGATGTTCGTTTAAAAG
TAAGGCGACCGGAAAAAATAGCTTTCCACTGCTGTCTTATGATAATTATG
TTTTTGTGCAGCATCAGCATATTGTTTGTTGTTGTTTTTGGAGAATTAAA
NAATGATAATTATGTTTTTGTGCAGCGTCAGCATATTGTTTGTTGTTGTT
TTTGGAGAATTAAAATCGAGACAAATGTTTGATTCATTGTCTCGCTTATC
CGACGGATGACGGATGGTAAATAACCGTCTGGTTTACAATAATAAAAAGA
AAGGGAAAAACAAGCTTTTTGATGAGGTTTTCTACTTAACTTTTCGTGGG
ATTTTGTTATTCGACATTTGACTATAATGCATTATTTTTGGGATGTTTTT
CAAGGAAAACAACAATCTAACTAATCAATCAAAAAACTATATTTTGAAAA
CACTTATCAGGGTATAGTTAAAATAACAACAACAACAGCCGTTAGCCAAT
AATATTAAACCACCACATATGTCTGTAATTGGTTTAATGATCAAAACAAG
TTATTATCTTTTAATGATCAATCATTATCTAATTAACATCAAAACAATAG
CATAACAAAAACAACAGGAAAAGTACATTTTTCGCTGGCTACTTACTTCA
AAATAAATAAAAACGATTTGACCTTTACATGCATACAATAATTTATAAGA
GCACAATCTATAAGAACATTAAAAAGCTGATGAAAACGTTTTTAAGGTGT
TAAAGTGAAAACTTAAGGTTAAGAACATCCAATTTTTTTGACGTTCTTAT
AAATTAAAAGTGTTAAGAAAAATTATTATTTTCCCAGTTTATTTAAAAAA
CACTTTCGATTTCCTCTGAGTTGTTCCTTTAAGGAAATTATAACTTTCTT
AACTATGCTAAAGTTTTGACCTTGGAAATTTTTCTGTTAAGCAAGTCTAT
TGTGCATTTTTGGTATTATCGAGGCAAACTGTCACTTAAAAATTTTTTTT
TTTTAATTCCACTAGAATTATTTATTTGTTTAACTAGTACTTTAGCGTGT
ACCGTTTATGATATTTACTTATTGTTATTTTGACAGTTTTGCAAAAATAA
TATAATTTTGTGACAATTATATATTAAAATTGGACCGAAAATTTGAAAGT
AGCAAAAATAATTTAGACAAAATTTAATATTGATAAAGGAATTTATTGTA
AATAAACAAATGTCTTCTTTGTATATAACAGAAGTTTTAGAGAATTTTAT
ATAAGGAATTTTATTGAGCTAATTAATAAAGTTATGAAATATTTGAATGA
AAAATGAATAAAAGT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_011228XLOC_011228Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00019988-exon-sc0000345-1575043694:57563..57763TCONS_00019988-exon-sc0000345-1575043694:57563..57763Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00019988-exon-sc0000345-1575043694:54964..55120TCONS_00019988-exon-sc0000345-1575043694:54964..55120Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00019988-exon-sc0000345-1575043694:52076..52206TCONS_00019988-exon-sc0000345-1575043694:52076..52206Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00019988-exon-sc0000345-1575043694:49399..51763TCONS_00019988-exon-sc0000345-1575043694:49399..51763Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00019988-exon-sc0000345-1510915933:57563..57763TCONS_00019988-exon-sc0000345-1510915933:57563..57763Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00019988-exon-sc0000345-1510915933:54964..55120TCONS_00019988-exon-sc0000345-1510915933:54964..55120Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00019988-exon-sc0000345-1510915933:52076..52206TCONS_00019988-exon-sc0000345-1510915933:52076..52206Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00019988-exon-sc0000345-1510915933:49399..51763TCONS_00019988-exon-sc0000345-1510915933:49399..51763Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00019988-exon-sc0000345-1491911889:57563..57763TCONS_00019988-exon-sc0000345-1491911889:57563..57763Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00019988-exon-sc0000345-1491911889:54964..55120TCONS_00019988-exon-sc0000345-1491911889:54964..55120Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00019988-exon-sc0000345-1491911889:52076..52206TCONS_00019988-exon-sc0000345-1491911889:52076..52206Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00019988-exon-sc0000345-1491911889:49399..51763TCONS_00019988-exon-sc0000345-1491911889:49399..51763Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000345supercontigsc0000345:49399..57763 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.119258	0	0	0.132024	188.792	146.072	15.1914	23.0823	2.07629e-08	4.64043	0.836256	2.91683	0.000134445	5.11247	7.63508	2.12202	1.25974	13.3269	15.5658	15.8724	0.0777699	1.93952	11.6592	1.24675	0.517089	4.18741e-08	12.5085	1.50397	29.2889	24.2342
Blast
[Close]
BLAST of TCONS_00019988 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: RIT2 (GTP-binding protein Rit2 OS=Homo sapiens GN=RIT2 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 168.703 bits (426), Expect = 8.286e-47
Identity = 87/186 (46.77%), Postives = 127/186 (68.28%), Query Frame = 1 
Query:  310 KTYKVVVIGDCEVGKSALTMQYVSNVFLDFHDPTIEDFFQTQTVVDGESGIVDILDTAGQDGSQTTMNEQYLRQGGQAYIGVYSITSLPSYNRLRKQIQTLKRLRANERIPLIIVANKLDLFNDRVVSTMDGIALAREFDCPFYEASAANRINVEDAFNGLIRQVRKMENDIMFECENLKKPKLKR 867
            + YKVV++G   VGKSA+TMQ++S+ F D+HDPTIED ++TQ  +D E   +DILDTAGQ    T M EQY+R GG+ +I  YS+T   S+    K  + + ++R    IPL++V NK+DL   R VST +G++LA+E++C F+E SAA R  ++DAF+GL+R++RK E+       +L + KLKR
Sbjct:   19 REYKVVMLGAGGVGKSAMTMQFISHQFPDYHDPTIEDAYKTQVRIDNEPAYLDILDTAGQ-AEFTAMREQYMR-GGEGFIICYSVTDRQSFQEAAKFKELIFQVRHTYEIPLVLVGNKIDLEQFRQVSTEEGLSLAQEYNCGFFETSAALRFCIDDAFHGLVREIRKKES-----MPSLMEKKLKR 197
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00019988 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1
Match NameE-valueIdentityDescription
RIT28.286e-4746.77GTP-binding protein Rit2 OS=Homo sapiens GN=RIT2 P... [more]
back to top