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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00019492 ID=TCONS_00019492|Name=TCONS_00019492|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2079bp Naaaatcagaaaaagttaatgatccaatttttcacaaagtccaaaaaacc cgttttttagccgttttttggcccaaatttgcccaaaaaacttttttttc gaaagtcgggcaccgtcacattcgagggtttatagttacacatctttgtg caaaaaatcagaaaaaactaatgagccaatcatgaggaaagctaataacg aacgaacggacgaacggacaaaggttaatttataggacctccccaaaaaa gaaaataaatggcTTATAAAAGATCTAGTGTCGAAAACTCATTGCCATCA ATTGCATAAAGCagattttttattcaaagtttttaacaaataatAACTGA CTCAGCGAGAATGaattatcaaaaaagatttttacagATAAGTTTTATAG TTAATATATACGAAACATTGTAccgaaaatttatgaaaaagaaccaaaaa aaatagtgcaaaaaaaaaaaaatataataataagaACATAATTATGTACC TACAATTGTAATATAATATCCAAAAATAATAGTTGTAAATCTTTAAATTA GACCCGGTGTCCTTTAAATATCCCAGGATTTTTAATGACGTTAAAACATC TAAATAATaacatcgaaataaaaatataactcAAATAATATAATGGACAA TTAACAAATGATTaacaaaaatatctaaattaaattctttttaaCATGAT GTATTACCTAGATATATCATTATATGGATGAATGGTAATTATTTTATGAG TACACATTTTTtctataaggaacacgtttataaggaacttgaggctgaaa atggtccgaaaaataaggaactgTTACGGAACTGCTTTAGGCTGAGAATA TAAAATCAAGTTAAGGAACAGAGAGTTAAACTTCATCTTGCACAGATTCA CAAAAACAGTTCAAAATATCATATCAAAATATTGATGAAACAACATTCAA TAGATGTCTTTTTTGTAATGTAGTTATGTAGTTGTTTAACAGCATCAAAT Cagtccaaacttagcagctaagtaaataaggaactcgataaggaacttta aGGCTGAGATTctctggaaaaataaggaactccaggctcggagccaagtt aaggttccttataaaaaaagtgtactgtagtgcaaaaagaaaagattcga attattaACTTTTAGCTTGTCAAGTCTTAAATTAGACTAGTATAATAAAG TGCTGTCGTTAAAAATTATCATACTGTCAGTAAGGTGAACATAATATAAA ACATcctaaagtttttaaaagtatgtcagtgtcaaaaatatttctaaggA GCTTCTAATACATGATTAAGCCAAAATGACAGTCAAAATATGTGTTAATA TCTGTTGTTTGTAATTAGAGTTGTTGATCGCGGTAAAGAGGTAAAGATCT TGAAGTTTGAAGATTAGAATAGAAAATAGATGTCGCTGTCCTGTGAGATT GTAAAGCATACAAAGTCCACTCGTTTTAAGTGTGCACATTTTTTTTTACT ACATGGTTTCTTCATGGCAGCAAAAAAGGGTGCATAATTTTGCATACTTA AACTATTAATGAGTAATTTTTACACTTAAAGCGAATAGAATCTTGTATTA CATCAACCATAAAAATATCATTTGGATCATCTGACCAATAATGTAAGTAA CATACTCCCAATGCTCTCGAAAGGAGATACCACTTCATATTATCTTGTCA ACCAGGTACCCAGTCAGCTAAGTAATTAACACCATCTTCGTATAAATTGA TTGGTTTATAGAGTAGAATGACACTCGAAAGAATCTTACCAACGatatat ttccatattttcaaTATAGCAGTGTAAGTTATACAGCACTTTGTAAATCT TTCAATATCAACTAACAACCAAGAGTAGGTTGCAAACCAAACACATTACC TCAAGCTAATCTTTgtactttcgaattttttggaATGACATTCTAATAGA GCACGATTGCATGACTAATGATCAACTCAATGCTCTGGGAAAGAGATACG AGTGCTTTAAATGAGTAAAAAAAATCGAGGTTCATATAACAGGGTGCTAT GAAAATATCCTCCAGGTGATTCCAAGCNt Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000328:36499..38577 Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00019492 ID=TCONS_00019492|Name=TCONS_00019492|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2079bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000328:36499..38577 (Clytia hemisphaerica) aNGCTTGGAATCACCTGGAGGATATTTTCATAGCACCCTGTTATATGAAC
CTCGATTTTTTTTACTCATTTAAAGCACTCGTATCTCTTTCCCAGAGCAT
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00019492-exon-sc0000328-1491911889:36499..38577 | TCONS_00019492-exon-sc0000328-1491911889:36499..38577 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00019492-exon-sc0000328-1510915933:36499..38577 | TCONS_00019492-exon-sc0000328-1510915933:36499..38577 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00019492-exon-sc0000328-1575043694:36499..38577 | TCONS_00019492-exon-sc0000328-1575043694:36499..38577 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000328 | supercontig | sc0000328:36499..38577 . |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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