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transcript sequence >TCONS_00018947 ID=TCONS_00018947|Name=TCONS_00018947|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3415bp GAAACCTTTAGTTAGGAAATTATCACACAACAACctacattcaaaaaaaa ataatatatcaaaATAGAGGGGTCTTAAGAACTAAAAGAAGCATACATAA AATCAATCACCGTAAAAACAACATAATATAAATATTCATTGTTACATACG CAAACAGGATTGATTGAAATTTACGGGAGAGAGGAAGAACAACTCCGGGG actcgaaaataattttcatcagCGCTAATATTACCAAGAAGTGAGATGGT GAATTAACAACGAGCTAAAGGATCTGcccctttaattttgataaatcttt ggGTGTTAAGAATATTATTAAAAATGGATTGACATTTTGATTGATTGGCT TGGAATATTTTTATTGGTTATCTCCCTTTAAGGGAGTTTAATAGTTATCG AATTGGTAGTTCTAAAAGTTACGTAACTTTTCGAGAACTTTGAGATACTA TTATTCAAGTTGCTAACTGCTACTTTACAAATTGGTAAAAGTACTGTTTA GATTGCTAAGATTAAATTGgtgattttttaatttgtttgaaTGACAATGG GCTCAATTGGAAGTATCAAAGATATTCTAtccatcaaaataaaacatcgG CATGATTCATATACGGATCAATTTTGTCGTATTTTTATGTCGAAAATGTT TATTATCAGTGCTCTAGTGATGGGTGTGGACTTTTTCAATGATAAAGTAT CATGCATTGTACCCAAAGAGAGTGGATTAGGTAGCGATTTCGTGCACAGT GCTTGTTGGATACAGGGTTTTTACATCTACACGGAGATGATGGACCGTAT CGAACAATCAGGTTATTATGGTATTCCCAAAGATATTGATATGGATGGAC TGACCAATGATGGTCGGTTATGCAGATCAGTACCTAGAGGATCTAGACAT AAAGATCCACGTTGCAACATCATGCATAAGACGTTCTTCTTACAATTTCA ATGGATGCCTTTTTTCATTTCCAGTCTGGCGTTACTTCAATACTTCCCAT ACCTCATATTCAGAATCGTCAACACTGACATTATATCACTTAAAACAACA CTTAAAAGTGAAATAGACACTGACTCCATTGTCAAGAATTACTTCAACTA TAAAATCAATTCAATCCTCAAGATGAGAATACGTATCATATTAaatgttt tcattaaaatggcTTACGTCTGTGTCACTGTCATGGGCTTCTGGTTGTGT GACATGTTACTGAATGGTAATTTTTATAGTTATGGCACCAATTGGATTAA ATGGACCAAATATAATAATAGCATGTCACATGATATCAAAGTCAGGAACC ATCCAAAACCCGGGAACGTGTTATTGCCACCCATGGGTTTCTGTGAAATC CACGAGAGCTCACGTGACGTTCGTCAAACCTTCACCAATACCAATAAATT CGTTTGTGAAATCTCTCCAAACATCTTATATCAATACGTATTAATTATCT TATGGTTCTTAATCGTCTTCAGCATCATCATAAGTATTAGCGGACTTTTG ATCAATTTAGTCGGACATTTAGTAACCGTCACCTGTTTCTTACGTCACGA TAATCCGTCAAAAGAGATTTATCAACGTCTGACGTTCCGAGAAGTCGAAT ATTTGGAAATGATTCGTCGCCATAATATACCAGTTTTTGGTGAGATTGTC CGTAAATTACAAGTGTCTCGTGTTGATTGTCGGACAATGTCGACTTTTGA TGATAATACCCATGAACTGGAATCCTTAAAACATGACATGATGAAAAATG ATTTGTCTACCATCATGAATCACAACCATAACAATACGGTCGCCCATAAC AACGCTGTCAACAACAATAAACATAACCCATTGGCTAAAGCGAATGCACC AGACAAAAGCCCTGAAACAGGCTACATTACAACTTGATCCCAATATTAAT GTACAGTACATAACTACACCCCCTTATCACAGAtccactgggaacccttt cccactggaaaagttgTCCAAAATTTTGTTCCCGGTGagaaattatcctc caatttttgtccctacttataataatcaaattaaccaatcctcactgcaa aatattatgctatttttcccttccccgctgaattttctgaaaagaattga aatccccagcataaaaaatatatgaatatcaatcccaatcgagtttcagt tcgttatttttatccccactggcttaAAAATCCTacagggtctgtgagaa gggggtgtttaacTACGCTTGCCTTTTAATGGTTTTCTGGTTGAAACCTA AACTCTTTTAAACCTTTGTATCTTCCTTACCATGTATCGGTGCAATTATG CTGCTggttgctaaaattttcaaagccaACACAGATATTATACGTGTTTC AAGATAATTGTATATCACTTTGATGGAAAAGTACTTAAATTGATGTATAT TTTATAATTACAAACCACAGTGAAATCTTTGTAAACCTTCATTGATTGCT GGTCTTTATTGGTGATGGTGAATGATGTTGGTGGTGTTTATTAAGTAGGT GCTGGTAGTTTTGATATGATTTAGATTAAGtttataataaatttttgagT ATAACACCCATGTGTCACAGACCAGGTGGGACCCACTACCCGCTGGAAAA TTCGTCCCCGGTTTGAAAAACACCCTATAATTTCAGCCTCTATGAATaat tgattttgttttcatccccttttgaaattttatggataaaaattgcactt cataACAATCGCCACTGGATTTTTTGGCCTGGCAgcaataaaatttcttt ccCCGTTAGGATTTCACGGATTTCCCACTGTGGAAAGAAGtcctgtgaga caggggtgtattaaaaGTTATACTAATACATATGAATTTTTTGGTGTGGT CTATTTCAGGCTATAAAGGACTAGAGTGTggatttttattgtatttttgt cTGTTCACATCTTGTGCTTTTGAAATCCAACGTACAAAGTTTCTAACCTG Gtctacaatcggcgccgaaatatttggcacaaaaggggaatctcctcaaa actttaaaaccgcaagtgatcattaagtgctttgaagtacggttggaaag tagagttttaaccctgagttttaacattagacctAAAACTTATAAGCtta ggatctaaaagctcaaaaatgttcgaTTAAGGTTGAGAATATAGCCTTGA AGCCACCTAACCCCTCCCAACTCGAAAAATCCAAAGATTTTACAGACTGT CTAAATACTatgaaatacaaacaaaaaatttgttGCCTGATtcctgaaat ttaattttcaagattttgtaaatagaaatttaaaacaatagtatattttt ttataaaagaagttGTCATATTATTTATTTGTTATTATTTGAATTACTAT ATGGAGATGGAATATTTTATACttgatttcaatgaaaatgaacATTGATG GTTCTATatctaatt Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000313:303789..316618- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00018947 ID=TCONS_00018947|Name=TCONS_00018947|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=12830bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000313:303789..316618- (Clytia hemisphaerica) GAAACCTTTAGTTAGGAAATTATCACACAACAACCTACATTCAAAAAAAA
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TTTCTTACGTCACGATAATCCGTCAAAAGAGATTTATCAACGTCTGACGT
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AATGTCGACTTTTGATGATAATACCCATGAACTGGAATCCTTAAAACATG
ACATGATGAAAAATGATTTGTCTACCATCATGAATCACAACCATAACAAT
ACGGTCGCCCATAACAACGCTGTCAACAACAATAAACATAACCCATTGGC
TAAAGCGAATGCACCAGACAAAAGCCCTGAAACAGGCTACATTACAACTT
GATCCCAATATTAATGTACAGTACATAACTACACCCCCTTATCACAGATC
CACTGGGAACCCTTTCCCACTGGAAAAGTTGTCCAAAATTTTGTTCCCGG
TGAGAAATTATCCTCCAATTTTTGTCCCTACTTATAATAATCAAATTAAC
CAATCCTCACTGCAAAATATTATGCTATTTTTCCCTTCCCCGCTGAATTT
TCTGAAAAGAATTGAAATCCCCAGCATAAAAAATATATGAATATCAATCC
CAATCGAGTTTCAGTTCGTTATTTTTATCCCCACTGGCTTAAAAATCCTA
CAGGGTCTGTGAGAAGGGGGTGTTTAACTACGCTTGCCTTTTAATGGTTT
TCTGGTTGAAACCTAAACTCTTTTAAACCTTTGTATCTTCCTTACCATGT
ATCGGTGCAATTATGCTGCTGGTTGCTAAAATTTTCAAAGCCAACACAGA
TATTATACGTGTTTCAAGATAATTGTATATCACTTTGATGGAAAAGTACT
TAAATTGATGTATATTTTATAATTACAAACCACAGTGAAATCTTTGTAAA
CCTTCATTGATTGCTGGTCTTTATTGGTGATGGTGAATGATGTTGGTGGT
GTTTATTAAGTAGGTGCTGGTAGTTTTGATATGATTTAGATTAAGTTTAT
AATAAATTTTTGAGTATAACACCCATGTGTCACAGACCAGGTGGGACCCA
CTACCCGCTGGAAAATTCGTCCCCGGTTTGAAAAACACCCTATAATTTCA
GCCTCTATGAATAATTGATTTTGTTTTCATCCCCTTTTGAAATTTTATGG
ATAAAAATTGCACTTCATAACAATCGCCACTGGATTTTTTGGCCTGGCAG
CAATAAAATTTCTTTCCCCGTTAGGATTTCACGGATTTCCCACTGTGGAA
AGAAGTCCTGTGAGACAGGGGTGTATTAAAAGTTATACTAATACATATGA
ATTTTTTGGTGTGGTCTATTTCAGGCTATAAAGGACTAGAGTGTGGATTT
TTATTGTATTTTTGTCTGTTCACATCTTGTGCTTTTGAAATCCAACGTAC
AAAGTTTCTAACCTGGTCTACAATCGGCGCCGAAATATTTGGCACAAAAG
GGGAATCTCCTCAAAACTTTAAAACCGCAAGTGATCATTAAGTGCTTTGA
AGTACGGTTGGAAAGTAGAGTTTTAACCCTGAGTTTTAACATTAGACCTA
AAACTTATAAGCTTAGGATCTAAAAGCTCAAAAATGTTCGATTAAGGTTG
AGAATATAGCCTTGAAGCCACCTAACCCCTCCCAACTCGAAAAATCCAAA
GATTTTACAGACTGTCTAAATACTATGAAATACAAACAAAAAATTTGTTG
CCTGATTCCTGAAATTTAATTTTCAAGATTTTGTAAATAGAAATTTAAAA
CAATAGTATATTTTTTTATAAAAGAAGTTGTCATATTATTTATTTGTTAT
TATTTGAATTACTATATGGAGATGGAATATTTTATACTTGATTTCAATGA
AAATGAACATTGATGGTTCTATATCTAATT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00018947-exon-sc0000313-1575043694:315889..316618 | TCONS_00018947-exon-sc0000313-1575043694:315889..316618 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00018947-exon-sc0000313-1575043694:314621..314788 | TCONS_00018947-exon-sc0000313-1575043694:314621..314788 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00018947-exon-sc0000313-1575043694:310652..311065 | TCONS_00018947-exon-sc0000313-1575043694:310652..311065 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00018947-exon-sc0000313-1575043694:303789..305891 | TCONS_00018947-exon-sc0000313-1575043694:303789..305891 | Clytia hemisphaerica | exon |
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
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Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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