TCONS_00018809 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00018809
Unique Name	TCONS_00018809
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	3015

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
protein sequence
transcript from alignment at sc0000309:72275..76660+
coding sequence from alignment at sc0000309:72275..76660+

transcript sequence

>TCONS_00018809 ID=TCONS_00018809|Name=TCONS_00018809|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3015bp
AAAATCCCTAGATTGTAAAGTTATTTCTTCACTACCTAGgaatttgaatc
ttttttccTGTGTACAATTCAGAATCATCTGCTCCCATATCAAAAGAAAG
CGTTCAAATTTCATTATCAAAAGTGAGTCTAATTTTATACAATCCTTACA
TCAAGTTTGACCAATAAACctcgatttgaaattttttcttttctcacaGG
AGCATGGAATTGTCATGAAGGGTGTCGAATGTATTGCTTACCTTCTTGCA
AATCCTCTTGTTGCAAACCAGGCGCACAAGATTATCATCCTGATATGATG
CCAGCCATCGAGAAATATCAGAAAAGACGTGTCTTAGAAGCGAAGAAACA
ACAGATTGCAGGAGCGGCCGATCCGTATGCATGTGGACAATTCTGTTCAC
CGACGTGTTACGACGGTGGGTGCTCATCAGCATGTTGTAGCGGTCAAATG
CAAATCCAACCAATGCCGATGATGCCACAAGCTCCGGTGATTCCTGGATG
TGTCCCAGAATGTATGCAAAACCCTTGCATGGAACAATGCCCGCCTCAAT
GTGGTTGTGATCAACAACAACCAGAAGCTGCAGAACCACCGCCACCTCCA
CCACCACCGCCACCACCTCCAAGGAGGCCTCGTCCACCACCAAGACgccc
accaccaccaccaagGCGCCGCCCTGCACCCGTGCGATGTGATCCTAGTT
GTGAAAAATTGTGTCTACCATCATGTGATTTCACTTGCTGTATCCCTGAA
GGTTTGAGGAGCACCAACTTCGCACATGCTTCACAAGGGTTCATCCCTAC
ACAAGAGCAGAAAGCGCCACCTCAACCTCCACGCTCAAGACCAGTGGCCG
GAGGATGTTCAGGAAGTTGTTCAAATGATTGCTTCCCATCGTGTAGTAAT
GACTGTTGCTCCGCTATGTCATCCGCACCCATGGCTCCACCATCCGCTTT
GTCAGGTTGCCCTGCTCCATGCCCCTCGTCATGTGCATCAAGCGGCTGTG
CACCAAGTTGTTGTGGTGATATGGCTCCACCTCCAATGCTACCACCAATG
CCACCACCACAGACTTGTCCATTAGGTTGCAGCAGCGCATGCGCACCTGC
TTGCACACCACAATGTTGCTTTCCTGGTTTAACCCAACCAAATCTATTAC
TACCACCTGCACCACCTCCAATGCCAATGGCTCCACCACCAGCAATGCCT
ATGGCTCCACCTCCAGCTATGCCTATGGCTCCACCACCTGCCGCCCCTGC
ACCATGTGGACCACAATGTGCCGCCTCATGTGCACCGGCATGCACACCAA
ACTGTTGCACGGGTGTTCAAGTCGGCCCGATCATCCCTCCACCGCCAGTC
CTCAGTTGCCCTTCACCATGTTCACAAAGTTGTGCACCCAGCTGTACACC
AGCATGTTGCGCTAGAACCTCACCCTTCATCCCTTTCGCACCTCTTGCTC
CACAACCACAACCTTCATGCGGTACTGGATGTGCTGCCTCATGTGCACCC
TCCTGCTCTGCATCCTGTTGTGGTGCACAAGCTCCCCCTCCAATGATGGC
TGCTCCCCCAGCGCAACCCCAATGTGGTATGGGATGCTCTGCTTCCTGTG
CACCTGCTTGTTCTCCTAGCTGTTGTAGCCCACCACCTCCTCCACCAGTT
ATGGCAGCACCACCACAATGCGGAATGGGTTGCTCAGCCGCTTGTGCACC
AGCATGTTCTCCAAGCTGTTGCGGTGCTCCTGCTATGCCACCTCCTGCTA
TGCCACCTCCAGCAGCTTCCCCATACACGTGTGGAGCTTCCTGTCCTGCT
TCCTGTGCACCAGCATGTAGCCCTGCATGTTGTAACACAGCGCCACCTCC
CCCACCAATCCTCATGGGAACACCTCCATCAGTTTGTGGTGCAAATTGTC
CAGCCGCATGCGCACCTGCTTGCAGCCCATCTTGTTGCAGTGGTGTACAA
CAACCACCACCTCCTCCGGTTGCCATGCCAGCCCCTGCAACTACAACATG
TGGTGCCAACTGTCCAGCTTCATGTGCTCCTGTCTGTTCACCATCCTGTT
GCAGTGCTCGTGCACCACCTGTAAATTGCCCTCCATCATGTCAACACACT
TGTGGACCAAGCTGCACATTGAGCTGTTGCGGTCAACAACCACCACCAAT
GCGTATCGTACACATGCCACCCATCTCCATCCAACTACCAGCTGCCCCAC
CTTCATGCGCTGGCACCTGTGCATCCTCATGTGCACCAGCTTGTACACCA
ACTTGTTGTGCTGCTTCAATGCCTCCTCCACCTCCACTAATGCAATGCTC
TACCGGATGCCCAGCTTCTTGTGCTCCTGCATGTCTACCGTCATGCTGTA
GTGCTACTCCTCCACCACCTGCCATGCCAGCAGTAGGTCAGTGCTCGTCA
GGGTGCTCTTCTTTCTGTGCTCCAAGTTGCACACCTGAATGTTGCGCTTC
TACTGCAGAAATCGATGCAATGGACAGAGAGATGGATAAAGCAGAGCAGC
AAATGTCGAAGAAAAAAGATGCAGAGAGCACTGATAAATGGGACAAACGA
ACAAAAAAACTGTCTGATGACAAAAAGAGAAGTCGTATCTTAGCTGATGA
CCGCAGAAGAAGCCTCATTCGACACTAATGTGTGGTAGTCAGATATAGAT
AGAACTTTATTTTACTGTCTGATATCAACAAAGACAATACTGTGACATTA
AGTTTTGTTCAAAGATCTTGAGAGAGAAAAACAACGATGCCGTAATAAGA
CCATCACTGTAGAATGCAAACGTGCAAGCTAGAGACATTTCAAAAAGTTA
AGAATGAAATTTTAATGCTTAAAGTCAGATGTCATTAACAGGGGTGTCCA
GTCTAAGGTGCAATCAAATGTAGATTTTATAGATTTTTTTTATTTTGATA
GATCCTTTTTTAAGGGTAATTAGATGTATTTTTATATATTTGTTTTAAAA
TGTAGTTGTAGTTTTTAGTGTTTTGTAAATTTTATTACAAAAAAATAAAT
AAAAACAAAACCCTC

Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00018809-protein

>TCONS_00018809-protein ID=TCONS_00018809-protein|Name=TCONS_00018809-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=799bp
MYCLPSCKSSCCKPGAQDYHPDMMPAIEKYQKRRVLEAKKQQIAGAADPY
ACGQFCSPTCYDGGCSSACCSGQMQIQPMPMMPQAPVIPGCVPECMQNPC
MEQCPPQCGCDQQQPEAAEPPPPPPPPPPPPRRPRPPPRRPPPPPRRRPA
PVRCDPSCEKLCLPSCDFTCCIPEGLRSTNFAHASQGFIPTQEQKAPPQP
PRSRPVAGGCSGSCSNDCFPSCSNDCCSAMSSAPMAPPSALSGCPAPCPS
SCASSGCAPSCCGDMAPPPMLPPMPPPQTCPLGCSSACAPACTPQCCFPG
LTQPNLLLPPAPPPMPMAPPPAMPMAPPPAMPMAPPPAAPAPCGPQCAAS
CAPACTPNCCTGVQVGPIIPPPPVLSCPSPCSQSCAPSCTPACCARTSPF
IPFAPLAPQPQPSCGTGCAASCAPSCSASCCGAQAPPPMMAAPPAQPQCG
MGCSASCAPACSPSCCSPPPPPPVMAAPPQCGMGCSAACAPACSPSCCGA
PAMPPPAMPPPAASPYTCGASCPASCAPACSPACCNTAPPPPPILMGTPP
SVCGANCPAACAPACSPSCCSGVQQPPPPPVAMPAPATTTCGANCPASCA
PVCSPSCCSARAPPVNCPPSCQHTCGPSCTLSCCGQQPPPMRIVHMPPIS
IQLPAAPPSCAGTCASSCAPACTPTCCAASMPPPPPLMQCSTGCPASCAP
ACLPSCCSATPPPPAMPAVGQCSSGCSSFCAPSCTPECCASTAEIDAMDR
EMDKAEQQMSKKKDAESTDKWDKRTKKLSDDKKRSRILADDRRRSLIRH

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000309:72275..76660+

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00018809 ID=TCONS_00018809|Name=TCONS_00018809|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4386bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000309:72275..76660+ (Clytia hemisphaerica)
AAAATCCCTAGATTGTAAAGTTATTTCTTCACTACCTAGgaatttgaatc
ttttttccTGTGTACAATTCAGAATCATCTGCTCCCATATCAAAAGAAAG
CGTTCAAATTTCATTATCAAAAGTGAGTCTAATTTTATACAATCCTTACA
TCAAGTTTGACCAATAAACctcgatttgaaattttttcttttctcacaGG
AGCATGGAATTGTCATGAAGGGTGTCGAATGTATTGCTTACCTTCTTGCA
AATCCTCTTGTTGCAAACCAGGCGCACAAGATTATCATCCTGATATGATG
CCAGGTAAGGATCTTtcgttcaaaattttaaatttattaaaacATTTATA
TATAActctaaaaagaaaattttaatggAAAGTTTATCGAAATAATGTCG
CAAAAAAGATGCTTATTTGTAGTTGAGTACGGTATCCATAAAGGACGACT
CTCTACAGTAAGATTCAGAAATTGTTCGAAGGCAAAATAGCGTCTTAGGA
GGAACAGGGAAAGAAATTCGGGTGACGGAAACattaaatttataaagatt
ccAATGCTATTATTCCTAATGTTCTAAGGAACATAGATTAATGAGGATGG
ACTAAAtaaatgttggtttgccgtcagccgacCGACTCTCCTCTAAACTT
GCCgacccaaaaacttttattgcTTTTTTAACTATTATTTGCTACaaaga
gaattttcaaaattcttcaaaattacaaaatgtagacaaaaattccatga
atgaccaaaacaaaaaagaaatttccgaccgaccgacccacctccaaaat
ctagggtcgggtgacgacAAAGCTAGAATTCCAGCCTAAAGTAGCTTGCG
ATAAAGGTCATAGGatttttttgacattgaaaAGCCAATAAATCTAATCT
CagtaaaattaataaacgatTTCAGCCATCGAGAAATATCAGAAAAGACG
TGTCTTAGAAGCGAAGAAACAACAGATTGCAGGAGCGGCCGATCCGTATG
CATGTGGACAATTCTGTTCACCGACGTGTTACGACGGTGGGTGCTCATCA
GGTAGGTGAAAGAGAACGagatatacaccttttcgaccgtagtcgcgcgg
tcaggcgcatgtcacttaattatttaattatccccttAAACTCGATCCAA
TCCTTTTTTGACAAATTTTTCTATTGTCTATAGGTGCGAAAAAAGGACTG
TGACGGTTTTAGTGGGATAAAGCAGACAAACAAATACCCGCGCGGTAATT
GGCGGCTATTATCGAAAAGGTGTATTATAGGCAACTGAACAAACATTTCA
AATACATTTTGGATAATCTTTGACGGTTTTAAGTAAAAACCCTATTATCG
ACTTTCAAAAACAATGAAAATATAGTGCTTGTCAAAAACTATTACCCAGA
TGAAAATGGACGGACTACAACTTGTTGGTGAAAGAAAGTAAAACCAACAT
TATTTTTTATCAATAGCATGTTGTAGCGGTCAAATGCAAATCCAACCAAT
GCCGATGATGCCACAAGCTCCGGTGATTCCTGGATGTGTCCCAGAATGTA
TGCAAAACCCTTGCATGGAACAATGCCCGCCTCGTGAGTAATAATTATAT
CTGTttttttttctgaaagagctCGAGTTTCAAATGACATAATGAtaggt
caaataaaaaaaacttaaaaaaaagaagtatTACTTAAAATACATAATCC
CGAgtgaagaaaaaacaacattattTTCTGCTCTTAGAATGTGGTTGTGA
TCAACAACAACCAGAAGCTGCAGAACCACCGCCACCTCCACCACCACCGC
CACCACCTCCAAGGAGGCCTCGTCCACCACCAAGACgcccaccaccacca
ccaagGCGCCGCCCTGCACCCGTGCGATGTGATCCTAGTTGTGAAAAATT
GTGTCTACCATCATGTGATTTCACTTGCTGTATCCCTGAAGGTTTGAGGA
GCACCAACTTCGCACATGCTTCACAAGGTATTGAACTAAATTTATTGCAG
AACAATCATTAGATTCTTTTTCCTTTTCGATTGAAAAATGTAAGTTAATA
TCGCCTTATCTATGAAGATGATAGCAACAACTACATTATGGTACATTGAA
CTATATGCTGTCAACCTTCTTTCTTTGAACATAAACAACTACCACATTTC
CATTTCAGGGTTCATCCCTACACAAGAGCAGAAAGCGCCACCTCAACCTC
CACGCTCAAGACCAGTGGCCGGAGGATGTTCAGGAAGTTGTTCAAATGAT
TGCTTCCCATCGTGTAGTAATGACTGTTGCTCCGCTATGTCATCCGCACC
CATGGCTCCACCATCCGCTTTGTCAGGTTGCCCTGCTCCATGCCCCTCGT
CATGTGCATCAAGCGGCTGTGCACCAAGTTGTTGTGGTGATATGGCTCCA
CCTCCAATGCTACCACCAATGCCACCACCACAGACTTGTCCATTAGGTTG
CAGCAGCGCATGCGCACCTGCTTGCACACCACAATGTTGCTTTCCTGGTT
TAACCCAACCAAATCTATTACTACCACCTGCACCACCTCCAATGCCAATG
GCTCCACCACCAGCAATGCCTATGGCTCCACCTCCAGCTATGCCTATGGC
TCCACCACCTGCCGCCCCTGCACCATGTGGACCACAATGTGCCGCCTCAT
GTGCACCGGCATGCACACCAAACTGTTGCACGGGTGTTCAAGTCGGCCCG
ATCATCCCTCCACCGCCAGTCCTCAGTTGCCCTTCACCATGTTCACAAAG
TTGTGCACCCAGCTGTACACCAGCATGTTGCGCTAGAACCTCACCCTTCA
TCCCTTTCGCACCTCTTGCTCCACAACCACAACCTTCATGCGGTACTGGA
TGTGCTGCCTCATGTGCACCCTCCTGCTCTGCATCCTGTTGTGGTGCACA
AGCTCCCCCTCCAATGATGGCTGCTCCCCCAGCGCAACCCCAATGTGGTA
TGGGATGCTCTGCTTCCTGTGCACCTGCTTGTTCTCCTAGCTGTTGTAGC
CCACCACCTCCTCCACCAGTTATGGCAGCACCACCACAATGCGGAATGGG
TTGCTCAGCCGCTTGTGCACCAGCATGTTCTCCAAGCTGTTGCGGTGCTC
CTGCTATGCCACCTCCTGCTATGCCACCTCCAGCAGCTTCCCCATACACG
TGTGGAGCTTCCTGTCCTGCTTCCTGTGCACCAGCATGTAGCCCTGCATG
TTGTAACACAGCGCCACCTCCCCCACCAATCCTCATGGGAACACCTCCAT
CAGTTTGTGGTGCAAATTGTCCAGCCGCATGCGCACCTGCTTGCAGCCCA
TCTTGTTGCAGTGGTGTACAACAACCACCACCTCCTCCGGTTGCCATGCC
AGCCCCTGCAACTACAACATGTGGTGCCAACTGTCCAGCTTCATGTGCTC
CTGTCTGTTCACCATCCTGTTGCAGTGCTCGTGCACCACCTGTAAATTGC
CCTCCATCATGTCAACACACTTGTGGACCAAGCTGCACATTGAGCTGTTG
CGGTCAACAACCACCACCAATGCGTATCGTACACATGCCACCCATCTCCA
TCCAACTACCAGCTGCCCCACCTTCATGCGCTGGCACCTGTGCATCCTCA
TGTGCACCAGCTTGTACACCAACTTGTTGTGCTGCTTCAATGCCTCCTCC
ACCTCCACTAATGCAATGCTCTACCGGATGCCCAGCTTCTTGTGCTCCTG
CATGTCTACCGTCATGCTGTAGTGCTACTCCTCCACCACCTGCCATGCCA
GCAGTAGGTCAGTGCTCGTCAGGGTGCTCTTCTTTCTGTGCTCCAAGTTG
CACACCTGAATGTTGCGCTTCTACTGCAGAAATCGATGCAATGGACAGAG
AGATGGATAAAGCAGAGCAGCAAATGTCGAAGAAAAAAGATGCAGAGAGC
ACTGATAAATGGGACAAACGAACAAAAAAACTGTCTGATGACAAAAAGAG
AAGTCGTATCTTAGCTGATGACCGCAGAAGAAGCCTCATTCGACACTAAT
GTGTGGTAGTCAGATATAGATAGAACTTTATTTTACTGTCTGATATCAAC
AAAGACAATACTGTGACATTAAGTTTTGTTCAAAGATCTTGAGAGAGAAA
AACAACGATGCCGTAATAAGACCATCACTGTAGAATGCAAACGTGCAAGC
TAGAGACATTTCAAAAAGTTAAGAATGAAATTTTAATGCTTAAAGTCAGA
TGTCATTAACAGGGGTGTCCAGTCTAAGGTGCAATCAAATGTAGATTTTA
TAGATTTTTTTTATTTTGATAGATCCTTTTTTAAGGGTAATTAGATGTAT
TTTTATATATTTGTTTTAAAATGTAGTTGTAGTTTTTAGTGTTTTGTAAA
TTTTATTACAAAAAAATAAATAAAAACAAAACCCTC

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000309:72275..76660+

>TCONS_00018809 ID=TCONS_00018809|Name=TCONS_00018809|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=12000bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000309:72275..76660+ (Clytia hemisphaerica)
ATGTATTGCTTACCTTCTTGCAAATCCTCTTGTTGCAAACCAGGCGCACA
AGATTATCATCCTGATATGATGCCAGCCATCGAGAAATATCAGAAAAGAC
GTGTCTTAGAAGCGAAGAAACAACAGATTGCAGGAGCGGCCGATCCGTAT
GCATGTGGACAATTCTGTTCACCGACGTGTTACGACGGTGGGTGCTCATC
AGCATGTTGTAGCGGTCAAATGCAAATCCAACCAATGCCGATGATGCCAC
AAGCTCCGGTGATTCCTGGATGTGTCCCAGAATGTATGCAAAACCCTTGC
ATGGAACAATGCCCGCCTCAATGTGGTTGTGATCAACAACAACCAGAAGC
TGCAGAACCACCGCCACCTCCACCACCACCGCCACCACCTCCAAGGAGGC
CTCGTCCACCACCAAGACgcccaccaccaccaccaagGCGCCGCCCTGCA
CCCGTGCGATGTGATCCTAGTTGTGAAAAATTGTGTCTACCATCATGTGA
TTTCACTTGCTGTATCCCTGAAGGTTTGAGGAGCACCAACTTCGCACATG
CTTCACAAGGGTTCATCCCTACACAAGAGCAGAAAGCGCCACCTCAACCT
CCACGCTCAAGACCAGTGGCCGGAGGATGTTCAGGAAGTTGTTCAAATGA
TTGCTTCCCATCGTGTAGTAATGACTGTTGCTCCGCTATGTCATCCGCAC
CCATGGCTCCACCATCCGCTTTGTCAGGTTGCCCTGCTCCATGCCCCTCG
TCATGTGCATCAAGCGGCTGTGCACCAAGTTGTTGTGGTGATATGGCTCC
ACCTCCAATGCTACCACCAATGCCACCACCACAGACTTGTCCATTAGGTT
GCAGCAGCGCATGCGCACCTGCTTGCACACCACAATGTTGCTTTCCTGGT
TTAACCCAACCAAATCTATTACTACCACCTGCACCACCTCCAATGCCAAT
GGCTCCACCACCAGCAATGCCTATGGCTCCACCTCCAGCTATGCCTATGG
CTCCACCACCTGCCGCCCCTGCACCATGTGGACCACAATGTGCCGCCTCA
TGTGCACCGGCATGCACACCAAACTGTTGCACGGGTGTTCAAGTCGGCCC
GATCATCCCTCCACCGCCAGTCCTCAGTTGCCCTTCACCATGTTCACAAA
GTTGTGCACCCAGCTGTACACCAGCATGTTGCGCTAGAACCTCACCCTTC
ATCCCTTTCGCACCTCTTGCTCCACAACCACAACCTTCATGCGGTACTGG
ATGTGCTGCCTCATGTGCACCCTCCTGCTCTGCATCCTGTTGTGGTGCAC
AAGCTCCCCCTCCAATGATGGCTGCTCCCCCAGCGCAACCCCAATGTGGT
ATGGGATGCTCTGCTTCCTGTGCACCTGCTTGTTCTCCTAGCTGTTGTAG
CCCACCACCTCCTCCACCAGTTATGGCAGCACCACCACAATGCGGAATGG
GTTGCTCAGCCGCTTGTGCACCAGCATGTTCTCCAAGCTGTTGCGGTGCT
CCTGCTATGCCACCTCCTGCTATGCCACCTCCAGCAGCTTCCCCATACAC
GTGTGGAGCTTCCTGTCCTGCTTCCTGTGCACCAGCATGTAGCCCTGCAT
GTTGTAACACAGCGCCACCTCCCCCACCAATCCTCATGGGAACACCTCCA
TCAGTTTGTGGTGCAAATTGTCCAGCCGCATGCGCACCTGCTTGCAGCCC
ATCTTGTTGCAGTGGTGTACAACAACCACCACCTCCTCCGGTTGCCATGC
CAGCCCCTGCAACTACAACATGTGGTGCCAACTGTCCAGCTTCATGTGCT
CCTGTCTGTTCACCATCCTGTTGCAGTGCTCGTGCACCACCTGTAAATTG
CCCTCCATCATGTCAACACACTTGTGGACCAAGCTGCACATTGAGCTGTT
GCGGTCAACAACCACCACCAATGCGTATCGTACACATGCCACCCATCTCC
ATCCAACTACCAGCTGCCCCACCTTCATGCGCTGGCACCTGTGCATCCTC
ATGTGCACCAGCTTGTACACCAACTTGTTGTGCTGCTTCAATGCCTCCTC
CACCTCCACTAATGCAATGCTCTACCGGATGCCCAGCTTCTTGTGCTCCT
GCATGTCTACCGTCATGCTGTAGTGCTACTCCTCCACCACCTGCCATGCC
AGCAGTAGGTCAGTGCTCGTCAGGGTGCTCTTCTTTCTGTGCTCCAAGTT
GCACACCTGAATGTTGCGCTTCTACTGCAGAAATCGATGCAATGGACAGA
GAGATGGATAAAGCAGAGCAGCAAATGTCGAAGAAAAAAGATGCAGAGAG
CACTGATAAATGGGACAAACGAACAAAAAAACTGTCTGATGACAAAAAGA
GAAGTCGTATCTTAGCTGATGACCGCAGAAGAAGCCTCATTCGACACTAA
ATGTATTGCTTACCTTCTTGCAAATCCTCTTGTTGCAAACCAGGCGCACA
AGATTATCATCCTGATATGATGCCAGCCATCGAGAAATATCAGAAAAGAC
GTGTCTTAGAAGCGAAGAAACAACAGATTGCAGGAGCGGCCGATCCGTAT
GCATGTGGACAATTCTGTTCACCGACGTGTTACGACGGTGGGTGCTCATC
AGCATGTTGTAGCGGTCAAATGCAAATCCAACCAATGCCGATGATGCCAC
AAGCTCCGGTGATTCCTGGATGTGTCCCAGAATGTATGCAAAACCCTTGC
ATGGAACAATGCCCGCCTCAATGTGGTTGTGATCAACAACAACCAGAAGC
TGCAGAACCACCGCCACCTCCACCACCACCGCCACCACCTCCAAGGAGGC
CTCGTCCACCACCAAGACgcccaccaccaccaccaagGCGCCGCCCTGCA
CCCGTGCGATGTGATCCTAGTTGTGAAAAATTGTGTCTACCATCATGTGA
TTTCACTTGCTGTATCCCTGAAGGTTTGAGGAGCACCAACTTCGCACATG
CTTCACAAGGGTTCATCCCTACACAAGAGCAGAAAGCGCCACCTCAACCT
CCACGCTCAAGACCAGTGGCCGGAGGATGTTCAGGAAGTTGTTCAAATGA
TTGCTTCCCATCGTGTAGTAATGACTGTTGCTCCGCTATGTCATCCGCAC
CCATGGCTCCACCATCCGCTTTGTCAGGTTGCCCTGCTCCATGCCCCTCG
TCATGTGCATCAAGCGGCTGTGCACCAAGTTGTTGTGGTGATATGGCTCC
ACCTCCAATGCTACCACCAATGCCACCACCACAGACTTGTCCATTAGGTT
GCAGCAGCGCATGCGCACCTGCTTGCACACCACAATGTTGCTTTCCTGGT
TTAACCCAACCAAATCTATTACTACCACCTGCACCACCTCCAATGCCAAT
GGCTCCACCACCAGCAATGCCTATGGCTCCACCTCCAGCTATGCCTATGG
CTCCACCACCTGCCGCCCCTGCACCATGTGGACCACAATGTGCCGCCTCA
TGTGCACCGGCATGCACACCAAACTGTTGCACGGGTGTTCAAGTCGGCCC
GATCATCCCTCCACCGCCAGTCCTCAGTTGCCCTTCACCATGTTCACAAA
GTTGTGCACCCAGCTGTACACCAGCATGTTGCGCTAGAACCTCACCCTTC
ATCCCTTTCGCACCTCTTGCTCCACAACCACAACCTTCATGCGGTACTGG
ATGTGCTGCCTCATGTGCACCCTCCTGCTCTGCATCCTGTTGTGGTGCAC
AAGCTCCCCCTCCAATGATGGCTGCTCCCCCAGCGCAACCCCAATGTGGT
ATGGGATGCTCTGCTTCCTGTGCACCTGCTTGTTCTCCTAGCTGTTGTAG
CCCACCACCTCCTCCACCAGTTATGGCAGCACCACCACAATGCGGAATGG
GTTGCTCAGCCGCTTGTGCACCAGCATGTTCTCCAAGCTGTTGCGGTGCT
CCTGCTATGCCACCTCCTGCTATGCCACCTCCAGCAGCTTCCCCATACAC
GTGTGGAGCTTCCTGTCCTGCTTCCTGTGCACCAGCATGTAGCCCTGCAT
GTTGTAACACAGCGCCACCTCCCCCACCAATCCTCATGGGAACACCTCCA
TCAGTTTGTGGTGCAAATTGTCCAGCCGCATGCGCACCTGCTTGCAGCCC
ATCTTGTTGCAGTGGTGTACAACAACCACCACCTCCTCCGGTTGCCATGC
CAGCCCCTGCAACTACAACATGTGGTGCCAACTGTCCAGCTTCATGTGCT
CCTGTCTGTTCACCATCCTGTTGCAGTGCTCGTGCACCACCTGTAAATTG
CCCTCCATCATGTCAACACACTTGTGGACCAAGCTGCACATTGAGCTGTT
GCGGTCAACAACCACCACCAATGCGTATCGTACACATGCCACCCATCTCC
ATCCAACTACCAGCTGCCCCACCTTCATGCGCTGGCACCTGTGCATCCTC
ATGTGCACCAGCTTGTACACCAACTTGTTGTGCTGCTTCAATGCCTCCTC
CACCTCCACTAATGCAATGCTCTACCGGATGCCCAGCTTCTTGTGCTCCT
GCATGTCTACCGTCATGCTGTAGTGCTACTCCTCCACCACCTGCCATGCC
AGCAGTAGGTCAGTGCTCGTCAGGGTGCTCTTCTTTCTGTGCTCCAAGTT
GCACACCTGAATGTTGCGCTTCTACTGCAGAAATCGATGCAATGGACAGA
GAGATGGATAAAGCAGAGCAGCAAATGTCGAAGAAAAAAGATGCAGAGAG
CACTGATAAATGGGACAAACGAACAAAAAAACTGTCTGATGACAAAAAGA
GAAGTCGTATCTTAGCTGATGACCGCAGAAGAAGCCTCATTCGACACTAA
ATGTATTGCTTACCTTCTTGCAAATCCTCTTGTTGCAAACCAGGCGCACA
AGATTATCATCCTGATATGATGCCAGCCATCGAGAAATATCAGAAAAGAC
GTGTCTTAGAAGCGAAGAAACAACAGATTGCAGGAGCGGCCGATCCGTAT
GCATGTGGACAATTCTGTTCACCGACGTGTTACGACGGTGGGTGCTCATC
AGCATGTTGTAGCGGTCAAATGCAAATCCAACCAATGCCGATGATGCCAC
AAGCTCCGGTGATTCCTGGATGTGTCCCAGAATGTATGCAAAACCCTTGC
ATGGAACAATGCCCGCCTCAATGTGGTTGTGATCAACAACAACCAGAAGC
TGCAGAACCACCGCCACCTCCACCACCACCGCCACCACCTCCAAGGAGGC
CTCGTCCACCACCAAGACgcccaccaccaccaccaagGCGCCGCCCTGCA
CCCGTGCGATGTGATCCTAGTTGTGAAAAATTGTGTCTACCATCATGTGA
TTTCACTTGCTGTATCCCTGAAGGTTTGAGGAGCACCAACTTCGCACATG
CTTCACAAGGGTTCATCCCTACACAAGAGCAGAAAGCGCCACCTCAACCT
CCACGCTCAAGACCAGTGGCCGGAGGATGTTCAGGAAGTTGTTCAAATGA
TTGCTTCCCATCGTGTAGTAATGACTGTTGCTCCGCTATGTCATCCGCAC
CCATGGCTCCACCATCCGCTTTGTCAGGTTGCCCTGCTCCATGCCCCTCG
TCATGTGCATCAAGCGGCTGTGCACCAAGTTGTTGTGGTGATATGGCTCC
ACCTCCAATGCTACCACCAATGCCACCACCACAGACTTGTCCATTAGGTT
GCAGCAGCGCATGCGCACCTGCTTGCACACCACAATGTTGCTTTCCTGGT
TTAACCCAACCAAATCTATTACTACCACCTGCACCACCTCCAATGCCAAT
GGCTCCACCACCAGCAATGCCTATGGCTCCACCTCCAGCTATGCCTATGG
CTCCACCACCTGCCGCCCCTGCACCATGTGGACCACAATGTGCCGCCTCA
TGTGCACCGGCATGCACACCAAACTGTTGCACGGGTGTTCAAGTCGGCCC
GATCATCCCTCCACCGCCAGTCCTCAGTTGCCCTTCACCATGTTCACAAA
GTTGTGCACCCAGCTGTACACCAGCATGTTGCGCTAGAACCTCACCCTTC
ATCCCTTTCGCACCTCTTGCTCCACAACCACAACCTTCATGCGGTACTGG
ATGTGCTGCCTCATGTGCACCCTCCTGCTCTGCATCCTGTTGTGGTGCAC
AAGCTCCCCCTCCAATGATGGCTGCTCCCCCAGCGCAACCCCAATGTGGT
ATGGGATGCTCTGCTTCCTGTGCACCTGCTTGTTCTCCTAGCTGTTGTAG
CCCACCACCTCCTCCACCAGTTATGGCAGCACCACCACAATGCGGAATGG
GTTGCTCAGCCGCTTGTGCACCAGCATGTTCTCCAAGCTGTTGCGGTGCT
CCTGCTATGCCACCTCCTGCTATGCCACCTCCAGCAGCTTCCCCATACAC
GTGTGGAGCTTCCTGTCCTGCTTCCTGTGCACCAGCATGTAGCCCTGCAT
GTTGTAACACAGCGCCACCTCCCCCACCAATCCTCATGGGAACACCTCCA
TCAGTTTGTGGTGCAAATTGTCCAGCCGCATGCGCACCTGCTTGCAGCCC
ATCTTGTTGCAGTGGTGTACAACAACCACCACCTCCTCCGGTTGCCATGC
CAGCCCCTGCAACTACAACATGTGGTGCCAACTGTCCAGCTTCATGTGCT
CCTGTCTGTTCACCATCCTGTTGCAGTGCTCGTGCACCACCTGTAAATTG
CCCTCCATCATGTCAACACACTTGTGGACCAAGCTGCACATTGAGCTGTT
GCGGTCAACAACCACCACCAATGCGTATCGTACACATGCCACCCATCTCC
ATCCAACTACCAGCTGCCCCACCTTCATGCGCTGGCACCTGTGCATCCTC
ATGTGCACCAGCTTGTACACCAACTTGTTGTGCTGCTTCAATGCCTCCTC
CACCTCCACTAATGCAATGCTCTACCGGATGCCCAGCTTCTTGTGCTCCT
GCATGTCTACCGTCATGCTGTAGTGCTACTCCTCCACCACCTGCCATGCC
AGCAGTAGGTCAGTGCTCGTCAGGGTGCTCTTCTTTCTGTGCTCCAAGTT
GCACACCTGAATGTTGCGCTTCTACTGCAGAAATCGATGCAATGGACAGA
GAGATGGATAAAGCAGAGCAGCAAATGTCGAAGAAAAAAGATGCAGAGAG
CACTGATAAATGGGACAAACGAACAAAAAAACTGTCTGATGACAAAAAGA
GAAGTCGTATCTTAGCTGATGACCGCAGAAGAAGCCTCATTCGACACTAA
ATGTATTGCTTACCTTCTTGCAAATCCTCTTGTTGCAAACCAGGCGCACA
AGATTATCATCCTGATATGATGCCAGCCATCGAGAAATATCAGAAAAGAC
GTGTCTTAGAAGCGAAGAAACAACAGATTGCAGGAGCGGCCGATCCGTAT
GCATGTGGACAATTCTGTTCACCGACGTGTTACGACGGTGGGTGCTCATC
AGCATGTTGTAGCGGTCAAATGCAAATCCAACCAATGCCGATGATGCCAC
AAGCTCCGGTGATTCCTGGATGTGTCCCAGAATGTATGCAAAACCCTTGC
ATGGAACAATGCCCGCCTCAATGTGGTTGTGATCAACAACAACCAGAAGC
TGCAGAACCACCGCCACCTCCACCACCACCGCCACCACCTCCAAGGAGGC
CTCGTCCACCACCAAGACgcccaccaccaccaccaagGCGCCGCCCTGCA
CCCGTGCGATGTGATCCTAGTTGTGAAAAATTGTGTCTACCATCATGTGA
TTTCACTTGCTGTATCCCTGAAGGTTTGAGGAGCACCAACTTCGCACATG
CTTCACAAGGGTTCATCCCTACACAAGAGCAGAAAGCGCCACCTCAACCT
CCACGCTCAAGACCAGTGGCCGGAGGATGTTCAGGAAGTTGTTCAAATGA
TTGCTTCCCATCGTGTAGTAATGACTGTTGCTCCGCTATGTCATCCGCAC
CCATGGCTCCACCATCCGCTTTGTCAGGTTGCCCTGCTCCATGCCCCTCG
TCATGTGCATCAAGCGGCTGTGCACCAAGTTGTTGTGGTGATATGGCTCC
ACCTCCAATGCTACCACCAATGCCACCACCACAGACTTGTCCATTAGGTT
GCAGCAGCGCATGCGCACCTGCTTGCACACCACAATGTTGCTTTCCTGGT
TTAACCCAACCAAATCTATTACTACCACCTGCACCACCTCCAATGCCAAT
GGCTCCACCACCAGCAATGCCTATGGCTCCACCTCCAGCTATGCCTATGG
CTCCACCACCTGCCGCCCCTGCACCATGTGGACCACAATGTGCCGCCTCA
TGTGCACCGGCATGCACACCAAACTGTTGCACGGGTGTTCAAGTCGGCCC
GATCATCCCTCCACCGCCAGTCCTCAGTTGCCCTTCACCATGTTCACAAA
GTTGTGCACCCAGCTGTACACCAGCATGTTGCGCTAGAACCTCACCCTTC
ATCCCTTTCGCACCTCTTGCTCCACAACCACAACCTTCATGCGGTACTGG
ATGTGCTGCCTCATGTGCACCCTCCTGCTCTGCATCCTGTTGTGGTGCAC
AAGCTCCCCCTCCAATGATGGCTGCTCCCCCAGCGCAACCCCAATGTGGT
ATGGGATGCTCTGCTTCCTGTGCACCTGCTTGTTCTCCTAGCTGTTGTAG
CCCACCACCTCCTCCACCAGTTATGGCAGCACCACCACAATGCGGAATGG
GTTGCTCAGCCGCTTGTGCACCAGCATGTTCTCCAAGCTGTTGCGGTGCT
CCTGCTATGCCACCTCCTGCTATGCCACCTCCAGCAGCTTCCCCATACAC
GTGTGGAGCTTCCTGTCCTGCTTCCTGTGCACCAGCATGTAGCCCTGCAT
GTTGTAACACAGCGCCACCTCCCCCACCAATCCTCATGGGAACACCTCCA
TCAGTTTGTGGTGCAAATTGTCCAGCCGCATGCGCACCTGCTTGCAGCCC
ATCTTGTTGCAGTGGTGTACAACAACCACCACCTCCTCCGGTTGCCATGC
CAGCCCCTGCAACTACAACATGTGGTGCCAACTGTCCAGCTTCATGTGCT
CCTGTCTGTTCACCATCCTGTTGCAGTGCTCGTGCACCACCTGTAAATTG
CCCTCCATCATGTCAACACACTTGTGGACCAAGCTGCACATTGAGCTGTT
GCGGTCAACAACCACCACCAATGCGTATCGTACACATGCCACCCATCTCC
ATCCAACTACCAGCTGCCCCACCTTCATGCGCTGGCACCTGTGCATCCTC
ATGTGCACCAGCTTGTACACCAACTTGTTGTGCTGCTTCAATGCCTCCTC
CACCTCCACTAATGCAATGCTCTACCGGATGCCCAGCTTCTTGTGCTCCT
GCATGTCTACCGTCATGCTGTAGTGCTACTCCTCCACCACCTGCCATGCC
AGCAGTAGGTCAGTGCTCGTCAGGGTGCTCTTCTTTCTGTGCTCCAAGTT
GCACACCTGAATGTTGCGCTTCTACTGCAGAAATCGATGCAATGGACAGA
GAGATGGATAAAGCAGAGCAGCAAATGTCGAAGAAAAAAGATGCAGAGAG
CACTGATAAATGGGACAAACGAACAAAAAAACTGTCTGATGACAAAAAGA
GAAGTCGTATCTTAGCTGATGACCGCAGAAGAAGCCTCATTCGACACTAA
ATGTATTGCTTACCTTCTTGCAAATCCTCTTGTTGCAAACCAGGCGCACA
AGATTATCATCCTGATATGATGCCAGCCATCGAGAAATATCAGAAAAGAC
GTGTCTTAGAAGCGAAGAAACAACAGATTGCAGGAGCGGCCGATCCGTAT
GCATGTGGACAATTCTGTTCACCGACGTGTTACGACGGTGGGTGCTCATC
AGCATGTTGTAGCGGTCAAATGCAAATCCAACCAATGCCGATGATGCCAC
AAGCTCCGGTGATTCCTGGATGTGTCCCAGAATGTATGCAAAACCCTTGC
ATGGAACAATGCCCGCCTCAATGTGGTTGTGATCAACAACAACCAGAAGC
TGCAGAACCACCGCCACCTCCACCACCACCGCCACCACCTCCAAGGAGGC
CTCGTCCACCACCAAGACgcccaccaccaccaccaagGCGCCGCCCTGCA
CCCGTGCGATGTGATCCTAGTTGTGAAAAATTGTGTCTACCATCATGTGA
TTTCACTTGCTGTATCCCTGAAGGTTTGAGGAGCACCAACTTCGCACATG
CTTCACAAGGGTTCATCCCTACACAAGAGCAGAAAGCGCCACCTCAACCT
CCACGCTCAAGACCAGTGGCCGGAGGATGTTCAGGAAGTTGTTCAAATGA
TTGCTTCCCATCGTGTAGTAATGACTGTTGCTCCGCTATGTCATCCGCAC
CCATGGCTCCACCATCCGCTTTGTCAGGTTGCCCTGCTCCATGCCCCTCG
TCATGTGCATCAAGCGGCTGTGCACCAAGTTGTTGTGGTGATATGGCTCC
ACCTCCAATGCTACCACCAATGCCACCACCACAGACTTGTCCATTAGGTT
GCAGCAGCGCATGCGCACCTGCTTGCACACCACAATGTTGCTTTCCTGGT
TTAACCCAACCAAATCTATTACTACCACCTGCACCACCTCCAATGCCAAT
GGCTCCACCACCAGCAATGCCTATGGCTCCACCTCCAGCTATGCCTATGG
CTCCACCACCTGCCGCCCCTGCACCATGTGGACCACAATGTGCCGCCTCA
TGTGCACCGGCATGCACACCAAACTGTTGCACGGGTGTTCAAGTCGGCCC
GATCATCCCTCCACCGCCAGTCCTCAGTTGCCCTTCACCATGTTCACAAA
GTTGTGCACCCAGCTGTACACCAGCATGTTGCGCTAGAACCTCACCCTTC
ATCCCTTTCGCACCTCTTGCTCCACAACCACAACCTTCATGCGGTACTGG
ATGTGCTGCCTCATGTGCACCCTCCTGCTCTGCATCCTGTTGTGGTGCAC
AAGCTCCCCCTCCAATGATGGCTGCTCCCCCAGCGCAACCCCAATGTGGT
ATGGGATGCTCTGCTTCCTGTGCACCTGCTTGTTCTCCTAGCTGTTGTAG
CCCACCACCTCCTCCACCAGTTATGGCAGCACCACCACAATGCGGAATGG
GTTGCTCAGCCGCTTGTGCACCAGCATGTTCTCCAAGCTGTTGCGGTGCT
CCTGCTATGCCACCTCCTGCTATGCCACCTCCAGCAGCTTCCCCATACAC
GTGTGGAGCTTCCTGTCCTGCTTCCTGTGCACCAGCATGTAGCCCTGCAT
GTTGTAACACAGCGCCACCTCCCCCACCAATCCTCATGGGAACACCTCCA
TCAGTTTGTGGTGCAAATTGTCCAGCCGCATGCGCACCTGCTTGCAGCCC
ATCTTGTTGCAGTGGTGTACAACAACCACCACCTCCTCCGGTTGCCATGC
CAGCCCCTGCAACTACAACATGTGGTGCCAACTGTCCAGCTTCATGTGCT
CCTGTCTGTTCACCATCCTGTTGCAGTGCTCGTGCACCACCTGTAAATTG
CCCTCCATCATGTCAACACACTTGTGGACCAAGCTGCACATTGAGCTGTT
GCGGTCAACAACCACCACCAATGCGTATCGTACACATGCCACCCATCTCC
ATCCAACTACCAGCTGCCCCACCTTCATGCGCTGGCACCTGTGCATCCTC
ATGTGCACCAGCTTGTACACCAACTTGTTGTGCTGCTTCAATGCCTCCTC
CACCTCCACTAATGCAATGCTCTACCGGATGCCCAGCTTCTTGTGCTCCT
GCATGTCTACCGTCATGCTGTAGTGCTACTCCTCCACCACCTGCCATGCC
AGCAGTAGGTCAGTGCTCGTCAGGGTGCTCTTCTTTCTGTGCTCCAAGTT
GCACACCTGAATGTTGCGCTTCTACTGCAGAAATCGATGCAATGGACAGA
GAGATGGATAAAGCAGAGCAGCAAATGTCGAAGAAAAAAGATGCAGAGAG
CACTGATAAATGGGACAAACGAACAAAAAAACTGTCTGATGACAAAAAGA
GAAGTCGTATCTTAGCTGATGACCGCAGAAGAAGCCTCATTCGACACTAA

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_010538	XLOC_010538	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00018809-protein	TCONS_00018809-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000309	supercontig	sc0000309:72275..76660 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.0474933	0.0638959	0.0331887	0.0593621	0.0226441	0.0658277	12.9619	16.1854	10.1669	13.1368	13.2699	6.3637	20.8112	20.6766	12.2612	45.2867	29.8474	26.6662	0.0336337	0	15.6283	16.6996	7.55571	9.45386	16.2742	19.9914	1.15001	0.539504	0.0299116	0.0152051

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00018809 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00018809 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

You are here

TCONS_00018809 (transcript) - C. hemisphaerica