|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00018369 ID=TCONS_00018369|Name=TCONS_00018369|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2317bp AGAGCAATGTGCAGTAGAGAGAAGATCGAGGAATTTTAGGATCAACTAGA AAATGTTTGCCAAACTAAAGGAATAATGTCAGCTGCACAAATTTTAAATT GTAATGAATTGGATTTCTGTCTACAGCACAAATCCAAAGGCAACAATTTT ATAGACAAGACCATGAGGCATAATTACCATCCAACCAACAGTTCCAAGGA GCAATTGACTTCTCTAGCTTGCATATGTACAGATCCAGATATCAAAGTTC GACCATTCGTTTCGTACCCTGTGAAATCTGTGCAAGCTTGTAATCTTGTA GACCTGCCACCACGAACTGACACATTGTCAACAGCAAAGGGCTGGATAAC AACACATTCCTTCCGATATTGGGTTGAAAGTGTTTCCGTGAAAAATATAC CATCTACATGCCCTGTGTTACTGATCTTCGATGGTCACAGCACTCATATT ACCTGGGAAAATACTGTGAAATAAACCTGATCGAACTGTTATATTTGCCT AGCCATGCCTCACACATTTTACAACCCCTTGATGTAGGAGTATTTGGGCT AATGAAAAACAGTCATACCAAACACTGCGATATTCGCCTGAGCTNTTGAT GTAGGAGTATTTGGGCTAATGAAAAACAGTCATACCAAACACTGCGATAT TTGCCTGAGCTAGAATAACACAAATATCTTTAATGCTGGCAAGACCATAA AAAAGGTTATTGATAAATATGTGTTTGGGGGCCTTTTCAAAAAAGCCTAC TATGGCGCTATGTCTGCAAATAACGTGCTAAGTGCATTTCAATCAACAGG CATATGGCCAATCAACTGAAACTGATTGAATTGGGATAAGTTCGCCCCAG CAGAAGCCCAGTTTAAAACCACTGCTAAACACTTTGGATTTTCCTGGACA ATCTTTGATGGGAAGAATCTCCCATGGAAAAAGTAGGTGAGATTCTTTTA AAGGAGACATTCCGATATCAAATCAACGAAAACCAGGAAATTAGAGGTAA ATATATATAACAGTAAATTATTTAGAATGAATTACTAGTTGAATCAAGGT TGCGtctacaatcagcgccgaaatatttgTTTAAAGTACGGTTTGAGTCT TATcattagacttaagaccttaggatttcaggatctaaaagctcaaaaat gttccaataaggttGAAAATATTGCCTGcgagccacttaacccctcccaa atagaaaaatccaatgaaacaaaatgGAAGTACTCAAACTGCAATTCTCA CCCtagctttaaattctgaaaaacgttaaaatacccaaaatggccaatat atttcggtgcCAATTGTAAATAACTATTGAATAGAACATTATATTTTTAT GCGAAATTGGGGGATCATTATTTAAATGATCTTGGGATGGTAAAATTAAA CACAAAAGAGTATGATTATCCCTTTTAAATAACCtcttaattttcttaat ttttctatcAAAGTTTTCAGGGCGGTGTGCAAAAGACAGAAAATTGAAGA GTTTTATGATCAACTTGAAACTGTTTGTTAAACAAAACACAATCACTTGA GCTGCACAAATATTCAATTGCGATGAATCGGGTTTTTGTCTGCAGCGAAA ATTCCAAGGCAACGTGTTCATCACAACTACCATGTGACCAAAAGTTCAAA GGAGCAATTGACTTCTCAAGCTTGCATCTACTGATCTGAACAAGGTGAAC AAGATGAACCAAAACAATGCAACTGATCGCCGCCATGTTGAATACGAGAT GGTGTCATCATATCGTAGACGTTTTTCAAAGGGAACACGCCAAATGCTGA ATGCTGGATGATCAAGAtgAACAGCAAAAAGAACAGACAAAAGACTCTCA CAACACATCACAATGTATTGCACCAGGAACATCTTATTATCCACTAAAAC ACAAAATTGTTGCGACGCATCGCATTCGAAAAACCGTGTGACATTCTGTT TATTCATTATACTGATTGTCTTGGCCAAATTATGCAACACAGAAAACTTA TCTCCGCAACAAAACAAACATCCGCGACGTCATGTCCGAATTGTGATACG GAACTCGCCAATCACTCGCTCAACGGATAACATACTTATGCGGTACGCCC GTGAAAGGGACCGGACGTTGGTCAGGGTGATTCGCACGAAGCGCCGCAAG CGAAACAAGGACGTTTTACACATCGCTCCCACACACATGAGAACTGTCCG GCTAAAAAGCAAAACAGGATTCTTTTTGGAGATACAACCGTCCGGAAAAG TCACCGGACATGTAAATAAAACCAAATATACCAAGATGGAGCTACAAGTG ATCACACCGCACGTCAA Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000297:129391..145190+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00018369 ID=TCONS_00018369|Name=TCONS_00018369|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=15800bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000297:129391..145190+ (Clytia hemisphaerica) AGAGCAATGTGCAGTAGAGAGAAGATCGAGGAATTTTAGGATCAACTAGA
AAATGTTTGCCAAACTAAAGGAATAATGTCAGCTGCACAAATTTTAAATT
GTAATGAATTGGATTTCTGTCTACAGCACAAATCCAAAGGCAACAATTTT
ATAGACAAGACCATGAGGCATAATTACCATCCAACCAACAGTTCCAAGGA
GCAATTGACTTCTCTAGCTTGCATATGTAAGTAAATTCTATTCCACTATT
CATTCCtgtaaaaaacaataaaacactacttagaaaaaaattgtgatata
ctaaatgagtttatgaaaaatgtgtgaTTCACATGCATGACAAGTTCAAG
AAATTGCAATTTTAAGTTCTTCGGGCTTACAAATCAGATCTTCTTATCCA
AAGGCCTTATGATGCGTCCAGCCTAAATAGCTTAAGGGCTGTTCATAAGG
AGACCGGCTGCTCACCTAGCCGTGCCAGTCCAACTCCATATGAACAGTCC
CTTAGTGTACACAAATATATAACACATTTTAACATTGTCTTTTTGTTCTA
CAGGTACAGATCCAGATATCAAAGTTCGACCATTCGTTTCGTACCCTGTG
AAATCTGTGCAAGCTTGTAATCTTGTAGACCTGCCACCACGAACTGACAC
ATTGTCAACAGCAAAGGGCTGGATAACAACACATTCCTTCCGATATTGGG
TTGAAAGTGTTTCCGTGAAAAATATACCATCTACATGCCCTGTGTTACTG
ATCTTCGATGGTCACAGCACTCATATTACCTGGGAAAATACTGTGAAATA
AACCTGATCGAACTGTTATATTTGCCTAGCCATGCCTCACACATTTTACA
ACCCCTTGATGTAGGAGTATTTGGGCTAATGAAAAACAGTCATACCAAAC
ACTGCGATATTCGCCTGAGCTNTTGATGTAGGAGTATTTGGGCTAATGAA
AAACAGTCATACCAAACACTGCGATATTTGCCTGAGCTAGAATAACACAA
ATATCTTTAATGCTGGCAAGACCATAAAAAAGGTTATTGATAAATATGTG
TTTGGGGGCCTTTTCAAAAAAGCCTACTATGGCGCTATGTCTGCAAATAA
CGTGCTAAGTGCATTTCAATCAACAGGCATATGGCCAATCAACTGAAACT
GATTGAATTGGGATAAGTTCGCCCCAGCAGAAGCCCAGTTTAAAACCACT
GCTAAACACTTTGGATTTTCCTGGACAATCTTTGATGGGAAGAATCTCCC
ATGGAAAAAGTAGGTGAGATTCTTTTAAAGGAGACATTCCGATATCAAAT
CAACGAAAACCAGGAAATTAGAGGTAAATATATATAACAGTAAATTATTT
AGAATGAATTACTAGTTGAATCAAGGTTGCGtctacaatcagcgccgaaa
tatttgTTTAAAGTACGGTTTGAGTCTTATcattagacttaagaccttag
gatttcaggatctaaaagctcaaaaatgttccaataaggttGAAAATATT
GCCTGcgagccacttaacccctcccaaatagaaaaatccaatgaaacaaa
atgGAAGTACTCAAACTGCAATTCTCACCCtagctttaaattctgaaaaa
cgttaaaatacccaaaatggccaatatatttcggtgcCAATTGTAAATAA
CTATTGAATAGAACATTATATTTTTATGCGAAATTGGGGGATCATTATTT
AAATGATCTTGGGATGGTAAAATTAAACACAAAAGAGTATGATTATCCCT
TTTAAATAACCtcttaattttcttaatttttctatcAAAGTTTTCAGGGC
GGTGTGCAAAAGACAGAAAATTGAAGAGTTTTATGATCAACTTGAAACTG
TTTGTTAAACAAAACACAATCACTTGAGCTGCACAAATATTCAATTGCGA
TGAATCGGGTTTTTGTCTGCAGCGAAAATTCCAAGGCAACGTGTTCATCA
CAACTACCATGTGACCAAAAGTTCAAAGGAGCAATTGACTTCTCAAGCTT
GCATCTGTAAGTAAATTCAAATCACTCctgtaaaaacaataaaaacaatc
ataGCATAGAAAATTTGTAATCGACCCGGAATGAAATCCTATTAGGAAGA
TATGGTTATGGTTGTGGACTTGAAatgaaatagaagaaaaactaGTTCTT
TGAAGACAGACTGCAAAAGTATCTAGTTTTAAAACATAATCAAGCATTCC
TAAATACTTAATGTATACAcatccttctcacagacccggtaggatttttc
tatctagtggggatgaaataacggattgaaactcgatgggattgctattc
ccatatttttatggctggggatttcaattcttttgttttcaagtcagaaa
attccgttgggatgggaaaatagcataatattttgaagtgaggattggtt
taagTTTGATTATcatcagtggggacaaaaatcgGAGGATAATTTCCCAC
CGGGatgatattttggacaattttttccagtgggaagggtttcaagtggg
tctgtgagaagggggtgtatgtATCATTCATATAAGTACTTGTCCGATTG
ATGCTGGAGTTTTCAATTACTCAACATAACATCctaactagcaaaaggtc
tatgagtatgttagaaagcCTTTCCATTAAAATTAAACCACTATCCTTCT
CTTCTTCTGGaacattgataaaaaagttgttaCAATCAACTTTGAAATTA
GACGTCCAAATATCAAATccctggaaatctttaggtATTGATAAGTATAA
TGAAATTTGTGATCAAGCAATGTTTTGATAATGCAAAGTCATCAATATCT
GAAATAAGAGTTTCGCATTGCGAACAAAACATTAAAGGCGCGGggaaaaa
aatactttacatTGCGATCTAAACATTGCTGGATCACaaatttcgaaaac
aaaagtaaatagGAGTAGTATTATACTTATCATTTATCAATACctaaaaa
tttccagggggtttgatATTCTTTTTATTACGATAATTAAGCAAAATATG
ATGGTACGTGAACCTTTTGGAAATTCTATATTGTTCCTTTAAATAAACCA
TTTACGAGACTGTAAGGTCAATGATTGCTCTTTCCTTTATTTCACAAGTT
ACaatgttttatttcaatttttattcgaCACCTTTCAGACTGATCTGAAC
AAGGTGAACAAGATGAACCAAAACAATGCAACTGATCGCCGCCATGTTGA
ATACGAGATGGTGTCATCATATCGTAGACGTTTTTCAAAGGGAACACGCC
AAATGCTGAATGCTGGATGATCAAGAGTAAGTTCAAATATGGTTAAATCC
TCACTATATTCTTTCTTATAAATCGCTTCGCTTCTTTTTATTCGCTAATA
CGTGCCTTAGGAAGTTCTAATCAACAAGCAGAATAGAATACGGAATAGTA
GGATTTAGTTagttaagaaaataaaagaatgctTGCTTGTGTTTTAATTC
TGTATAGAAATAAAAGGTTCCCTTATGAAGGCTATCATGTAAACCTTGGT
CAGGTTTATGGTAATTATTTGATCATNTGAAGGCTATCATGTAAACCTTG
GTCAGGTTTATGTTAattatttgatcatttttgaacGCCTTGCAATGGAT
caggtttgaaaatattttgctccTCCAAAGAGGTGAGAGGATATCACCGT
CCACTTCACAGCTTACCGCAATTAATGCGCTTTTTATCTGATATGAACCT
TGCTTATATTTCTTGAGAATATAAAATACATCATAAATTACATCACTCTA
AGCCAGACAAATTCATTTAGCAAGTAAAATATCTCTTGAGCAAGTAAAAT
ATCTCTTGAGCAAGTAAGGCTCTTTGTTTGCTAGTTGTTCTGCTGataga
agtatttattttacgACGTATCGAATGTTCTAGGTAtcttcttttaaaga
aaaagctAAACTCTCagatatcaaaaaatatttagccCCATACCTGGTAT
ACAGTAGACACTCAAAGTTATTTAAAcgccaaaaaatttcaaactaagCT
TTTCCCTTGAGACAGCTTGCAGACCCAAAATTTCTTCAAGCAAAATCCTC
TCGCTTAAACagtagactctcgcttattTGAACTCCTGTTATTCGAACGA
AGTCCTAGTTTTGCTCATTCGAATTNGCTTGGCTAAGCTTCCAAGGTTGG
AAGTGTTTGTATtgtattttaacctttttttaataagcacaACATTAATA
TGTGAACACTGCTAATCAAATTAGCCTATACCGATTAGTAATTCAATtct
ttaaataaaaactttgaataaCCAGGATTCTTTTTCACCTTCCATTGCAA
AGATATTTCTACTCTAGAAATGTCCAGTCGGGAAAAAATCAGGTAAGCAA
ATTAGATCCAACTTGTCTCACCTTATTGAATCTAGTGAGCACTAGACCAA
AAACGGATTCTTTTGCGTAGAAAAAAAACCGTGGCGTCTAGTAAAGGTTA
TATTGAATCTTGTTCGAAAGCGTCGAGAAATGGAAAATCACTTTGGGAAC
ACACGAGTCCTTGCCCAAGCACTCTGAACTATTCTCACCAGACATATCCA
AAGGATGGGTTGTTGTTGAGAAGACATTTTTAGCATTCCAACAAAATTCT
TGACTTAATTCCTTAATTACATTTTGGTCTAATTCTTCCCATCATGTCTA
AATGATTCATTAAGCATTGAAAGTGATACTTTATTAATTGGATTTTTATT
cccagtttttttttaaatgactttcCATGCaatgttttcatgttttcata
ttttcaaatgttttgacatATACACTGTCACACAGGGATTagtaattcaa
agaaaacaGGATTCCGCCAGTTGACGCTTTATGCGAGACTTTCTTTGCTT
GAtggcaaatcaaaaaaaaatgttacaaaaatcTTGCATCAATATAACTT
CCACTGAAGAAATCTTTgtaattttctttactttttgaatATTCCGAGAT
ctaatttgaatgaaaaatcttCGTTTATGGATTCTTTAAACATTTTCACA
TGCTAAAAATCGAATaagaaataaagcgaaaaaaacttcaaattctCATG
AAAAAAACCCGGGGCCTATCGAAAAACAGAATGTCGAATGCCCTTCAAAG
AATTTCCTCAAGAAACTTAACGGTGAATTTCAACTTGATCAAAACTTGAA
TGGAATTCTATTTGCAATTGAAGGTAACTTTCCATCGAGACTGAAATAGC
TTTTTCCTTAGTAAGACCATGGTCTAGACATATCACAACGACTTCGTTGT
TAAAAAGCAGACAGACGGGTTGACAAAGTTATTGAgaagtgaacaaaaaa
ttgaaaataaataggGAAGAAAAAATGGAAGTGGGAAAACAGAAACAAAC
GCAGCATGCTTCTTTAGCAAGGTAATGGGTGATGTCAAGTTAAGAGGATA
TTCGATACCAATACCACGATTTAACAAACTATTTGTAAGAACAAAGTTAA
GATTGTCAATCATAATTGAGATATGTCTTAGTTAAGTTGATCACATGAAA
TATATGTCATTGTTACAAACTACCCATACTGCTTTGCACAGTTTTCTTAA
AAACTTCGTAGATCAATATTACAAGGAACTGATCACCATAATTGTTAATT
GTTCAAATCAGatgaaatgttcttataaaataatatgTTAAGCATCAGTT
AAATCTGGTGGNTCAGatgaaatgttcttataaaatgatTTGTTAAGCAT
CAGTTAAATCTGGTGGTATAGGTCATTCTTTTCAAAGTAATACCTCTTTT
CCTTACTCTTTTGAAAGGAGAATCAAAATGGAGTGTTTACTCATCCATCC
TTCAATTTGCTTATAAAAGTATCTAAGCATCAACAAATCTCTTCTTCAAA
ACATGTCCTGCTATTCATTTGGTGAACTAATGCGAGTGGGAAAAGTCTTT
TGACTTCATTGATTGATTTTGGTTATAAAAGAGATGGTTGTCTGGTCATT
TTTGTTAGTTAGTGGTCATGTAGTGATTCGTATTGTCTGGAAGGAGGTGT
TTGTCTGAAGCTAAGCAAGTTCTCTGTTGAGATGTTTTGCACTAGATTTA
CCTTAGCTTGTTTAATACCAACCTGCAAAGGTGCTCGAAAGGAGGATGGA
CTAGTTTTACCAGGGTTAAATAATGAAGTCATTACATTGTATTTACCGCT
TAAGTTTACACAGGTTTGACGTCAACCGACCCCAGTGAACTTGAATTGAT
GGCTGGTTGACAGTGGTGTACGCAAACAGTTATCTACAAAAGTGTCCAGG
CTGGTCCTTGGTCAGCCTTGTGCTAAACTAAGGAAATGAGTGATTACCCT
CGGGAGTACAATAATGATAGCAATTGTAAACTTCTCGTGCCATGGGACAT
TTTACTCCAAATGTTCATGATTCTCATGTTCTGTTTTCTCTATATATAGT
TTGTTGATAATTGATTTTGTAAGACTGTTTTAATTTCCAATTCATTTTCT
CATTAGACTGCTTTCCTCTTAGAATCTCGTTTCACATTGAACTCTATCAA
ATCAGATTTACAGAGTTTAAATAAACTTTCTAAAACCCTTTCCTTCCGTA
TCTTAATACTGAAATAGACTAGTTCCCTGCTTCATATCGTTCTCTTTAAT
TACTATCAAAGATTATTTCTGCATTATAAAGTGAAACTAGTGTCTAGCTA
TTCAATTTATTTCTACTATTCAGCTCTGCTAAGGCACTTTAACTTTTGGT
ATTTTCTTGGAGggatttttttaaaactgaGAGCTTTTTCTACCTCAATG
AGCAGATCTTCTACAAAGGTTTGAAAGAAAGTTAGCGAGAGAGAGAAGCG
AGTGGCAATATTTTTGCAATGTCGGCCATCACACACACACGTGACATTTT
GATGATGAACTATGGGTAAAGGAAACAAACCTCCAGTTTGCTTACAAAAT
AAATGACTACAGTGAGTGCGAGATAGTCGACTGCTTCACATTTTTANTGC
TTACAAAATAAATGACTACAGTGAGTGCGAGATAGTCGACTGGTTCACAT
TTTGCTCGTCTCGTTGTTACATCATTACTTTTTCCGATGGGAGCTTTATA
TTGTGACACTTCTTAAACTTTGGAAATTTCAAATGAGTATTAGACTACTT
TGataggataaattttcgcggggattagaTTCGTGGTTgggctcatccgc
gaaattttaagattttgcggggacttaatttcgcggatgtcACTATTGTG
AGACAATATTTTGACGATTTCGTTGCTTTCTGAACGcgaatttaatcccc
gcgaaattttatcccattagtATTAGCAGTTATTGGTTTTGAGATTCTGT
TCCAGGCCTCCTGCTTTGTTTATGTGTAGTCAATGGCGAGAAGACATTAT
AACTTTTTTCTGGGCTGGACTTTTGATTGATTAACGGGTAGATCTAATTC
AGCTAATCGAGTATGAGATATGATGATGTAATTAGAATTTCGCAATTAAT
TTACTTAATTAGTATCATTAATTACCTTTCAAGTATTTCGAGTTATTTGT
GGTACTTGTAAAATTCTTTCATGTATACGTATCGGTACTTTGGGCAAATC
TTACCCCATAAATTGGCGATTTAATAATAAAGTTCGCACTCAGAAGTAAA
ACTGAATTCGAGCTGTATAAAACTTTTGTGCTATGTTTTGTGTGACCTAG
GTGTATCAAAAATTTGCTGAAGCAAAAATATTGTGACATTTTGATTCGAG
CAACCTGCAAATAAGAGAGCTTAGTTGATGTTTAAGTACGTCTGATCATA
ATCAGTCAATTTTGAAATCGAGACTTAAGTTTATAATCAAGAgtactcac
tcactcactcactcactcactcaatGTTTCAATGAATTTGCAAATTAGTT
ATCTCTGTAGAACTCTCTCTCTCAACTGGCAGATATAGAAGTTTGTCTCG
CTTgacataaaatgttcttaaagctGCACGTATTTCGGAGTTTGATGCGT
CTCTTCTATTTACCACTTCCTTGTATAAAGCATCAGTCAGTCATTGATTA
ATTACTATTATGTCATCACACTACTCATTTCTTGACATTCTCATTATGAT
GGCCACCATTATGGTTCTTCTCATTATGTCATTATCGTTTCATTATCGAT
AAAGTGTGCTGCTTCACATCCGTGGGAAATTTGAATGTTTGCTACATAAA
TAGCTTTCCGTGAAACAAACCTTCCAGATGGTCGAGGTGGGATATGTTAA
GGTTATGGTGATACCAGGTGGTTTAGAGTTTAGAGGTTTAGAGTTTATGG
ATTTCCATAACTTGTAGGAAAGATAATTcgttgagttaaggagacattct
aTTTATGGAGGTTTTTATAGGAGGGATACTCTATCTACTGCATAGGAAAC
TATCGCTGGACACTTTGAATGagaatattttgtattttgaatttCGTACA
AATTTCTTTCTAAAGCTGGCAAAGTCACAAATTTCCTTGTTGGCTGTCTG
CAAGGCTGGGAAGCTAATGAATTACTAAATGCTATTTCAAAGAATCTCCC
CCTCCCCCACCAAAATGGTTCAACACTTCTGCATTTcttattgaaacaaa
aatttccttcTGGATATTCTAGTTTCCTCTGATCCTCGATTGGAAAAACA
AATACGACTTAACAAGATGAATTGATGGAggttatttgaaagaaaaaaat
gtcatgTTGAACAAGTTAAGATGTCAACCTCGTAGTGGTTGACCTGTCAT
TTTGCCAGTTGTTGTATTGACTATCAAATACTTCCGTTCGCATCTCATCG
ACCTCTTATCCTCATTAGATACAGTTTTAAGTTCGCCATCATTTTGAAGC
TACTTTTTCAGGCTTTATCCGGCTGCCATTACTAATGGATTACGTGACAC
GAATTACAAAAGTATCAGCGCCAAAACGATTCTAATGTATatgattgatt
ttaaaaataacccTAATTAATTTCTATTTTCGAGATTGTATGTGCCAAAA
ATCCAGGTAAAGCAGTGGAGTTTGTTTATATTGTCGCGTGAAATTTGGCT
TAACGAACCATCAACGAAAGcggaaattttttatttttgcgtgTTAGCAA
TTTTCGTAACTGTGCGATGGTAACATGGTTTTATTTATAGAATATGAGAG
TTGGATGGTCTGTAAAAACACTAGTTAATTCCTGATCGACTTTCTTAGGC
TCGAGTCTTTGCTCTTTGGATTGAGTTAGATAAGACTGGTAGTCTTTTTA
CGGCTAAGTCTTTTGGAAATGAGTGTTGTTTGagaggaagaaattttatt
ttttaaattgatgaGAATTGAATAATTGACGCAAAATGTTCGTAATTAAA
ACCGCAAAAATTCGTTGAATTTGCGAACAATTCAATTTTACTGTCAGTCT
TCTGttcatgtttatttttctggGCCAACCAACTTGATGTAAACAATGTG
ACTGAACTTTTCTGACCTCCTTTTCCTCTAAAGATGTGATACGAAAAAAG
ATCTGTCAAAATGTTTGGTTGACACTCAAGGTTCACTTGTTGCCAAAACC
GCGTAACGGTCATAACTCGAGAAAAAAATACGACTCTAGCCAGccccttt
tcttcttttgtttactAAGGGCTAATCGAGACGAAAATGTGTTAAAGGGC
TGGGTAACAGAGTCTCAATATCTTAAGTCTCAAGCACCTTCAAAAGTCTA
AGTTGAATAGTTATAGGGTGGCTTTGACGAACGAGGTCTACTTACTTTTT
GGaaactttaaattcattttGAGTGTGAATAATTTCGGTAAAAGCTCTTA
TTTGAATGAAAATCACAGTGATGTTTCCATAGCTCGAATCTTTCATAACT
TTACCCTTGTTTGTTCGATTTATGGGGACTCCACTGTTCCTTGTCAAGGA
GAATAGAATAGACTTAAAGACAAAGGATTTTGAACTCTGATGAAGTTTGC
ACGTGTTTGATCATTTAtcttatcatttttttatttctagtgAACAGCAA
AAAGAACAGACAAAAGACTCTCACAACACATCACAATGTATTGCACCAGG
AACATCTTATTATCCACTAAAACACAAAATTGTTGCGACGCATCGGTAAG
CCAGTGGTTATTTTCTCTTCTATTTGTGCACAATAATATATGTAAACCTC
TGGCTCAGTCAAAGCTGTGAGACAGATACAGAAAGTTTTCTTCTTGTTCC
ATCTGTTAAGAAAAACTTGCAGTATCCCTTCCATCATCTATGCCTCGTCA
GATTCTATTTATATTTCTCTGACCATTTCCGAATGATTCTATGAAGTCAA
CGCATATATGATAGTTGTCGTTTCGAAATTCCACACGCGTGCCTTAAAAA
CAAACCTTCTGGTATTTCCTATTACCTCAAACAATTTAAGGACACAAACC
TCAACACAGAAGGGTCATCTTTAGGCTTTAGTAATTTAGAACTTGAAATT
TGAGACGTCTCACGctgatttgataatttttgttgCAAGTATAAATAGTA
GTACGAGCCTTTATATTTAGCTCTGTTTCCGTTTTGTGTTTATTCTTATG
CAGTAACTGCCAGAAATAACGCACTCTAGACCACCTAAAATTTAACtact
tattatatttttctattagAACTGAGCCtctgctgttcttatttttttgg
cactttgagcctcaaattgttcttattttattcTTATTCATTGGGTGCag
ttgaggtattttaggctttatacccaatttttactactttgacccttAAT
TGCCTGAAATTGGGTAATTCCAGGcgcagcattgttcttaaattgttctt
attttttggcggttttgagcctcattgttcttatgaaattgttcttatat
aaaaaaactgtGTTTGATACCTCGCGTTTATTCTAGGTTATTGTATAAAG
TTTGATAGGTCTTTCGTAGCAGTTTATGCACTCCTATGTAGGGCCGGGCt
ggctaaaattttgaataatctTTGGCCTGTCATTTACTGATTAGCTTTTC
TATCAGAAAAACACACAAGtcgaaattttgtttgtttttcgtTTGAACAG
AGTCAACAAACTACTTCCACGCCGCTTTTTTAATGAGACTTTTTGCAACA
TCAACAACCCTTAATCACTTATGATTGTCATCTGTTTTGTTAAGATATGA
TAAAGGACCGACCATCCAAGCTCTTTCGTCAATTCATTCATGGTCTAAAC
AAACCTTCTCCTCGTTTTTATTTAGTCCTGCGTAAAGCCGAAACATTTTT
TAGTAGgaacaaactatttaagaacataaggctttaatggccaaaatatt
aagaacaagttaagaacattttaaggctttgcagaatCTAGAACAgcgaa
tttcataggaaaatggacaaaaatactaaaaaaatggcgaaaataagaac
atgttaagaaattttttagatttgttCGATTTCCAGTATCAATTATCGAG
AGGAAACTTAGTGTTCTTTTGGTTGTCTTCGGCACACTTGCTCTGCTTTC
AATAAACTGTATTTCAAAGCCTAGTTTTTATCGAATtatcatttttgaga
ttttctgaaGAACAGGGCACAGCTCATGGTCAGGCTTGAATAATCTTTTA
CTATGATGTTTCTGTTTGAGATTGTGTCGTATTattcaacaaaataatga
aCCGCATAAACTAAAGACTTTGAGTTTGCTTTTTCATCATACAAAGTGAT
GTTATGGCTGATTTAATCAACATTGTTTGTTTTTGCCACAAATGAGGTCA
TTAGAGCTTTTCGTACATGTCATCAAACTGACAGACTCTCCTATGCAATT
ACCCGGTAATGAAAagatttaaaggctttttatGAGCAAATCAAAGACTT
AGTTGCAATCCTGGAAGGATAGTATCGGTATTCGGAAGGCTCTTTGGCAA
AACATACTAATGGGCGTATTGTTCTAGTTTCATAACCTATTAATGCGTTA
AAACGATTTAAAGATTTTgcacaaaaagtcaaaaattgacgatttttgTA
ACAAGTCGATCTTTATGACGGacggatttttttttatataatccACCACC
GCTTTCGATTCTTTCACACCGTATAAAGTTTAACACGTTTAAATAAATGA
GCTTTACAGAAAGTCCTTAAGTTGACGAAAAGCTTGTGGGTTCAGACAAT
GGTTATTAGCTTTGacacctttttttaaagatattgtAAGTAAAAGTGAA
CAGTCTTTCCATTTTGTGAAGCGGCTTTTGCCAGTCAATATTTGAAGTGG
TGTCGCATTTCAACCATCTGACGCACTTGTGTTGTCGAAAGGCTGAGAGT
GGATTTTCTAaccaaaaagaaagttttgaagtgATCCCATCTGTCAATAA
GTAAAGTAAACGAGCAAAGAAGTACTCGACTGAAGTGTGAACTTATGATT
GTCATTGTCTGTTGTATCTTATACCAGCTCTGTCTGGAACTGTAGCGTCT
TTGTCGCTTGAGCGTAGATCAAGTTTTTCAAGAAACTAGGGTCAAAGTTT
GTGAATGAAAAGTCATTATATCAATTTACTCAGATACAGATAATTTAGAC
GTTATTCAACTCTGGTTAAAAGTTTACAAGTATATTGAAGCAGCTTTAGC
AAATTTCTTTCTCAATTCTTTTTGCTCTTATACTGTGTCTTATCATCTCT
CTTACTCTATTCGTGAGAAGGTTTTTCTCGTTCGGCAACCTGACACTAGA
AATACCATATCAATAACTCGATCCTTAATCAATCATCGTTTTCTTTTAAC
ACTGATTGTCCACTACGCGTGAATTGTATAAGTCTGCTAAGCATTCAGGT
ATTCATTCAGAAAAATGCCTACaccaaaattcaagaaaatcttaagatat
tttttttctcacaacGAGTCAAAATGTTCTGTTGGAATGCCATCTAAAAA
GATTCGAGTAGAACTAATTTCGTTTTCCTCCCTCAGTTCAATATATCGTC
GATAAATTTTTAGGGTCGCCACAAAGGCACTGGGCGCGTATAAATCATGT
TTTTACAGACAGTAAAAAAAATAGGACCTCGTATTAACTTTACACAGCAT
GTCTGGCTACCGCTTAAACCCCCTGAAAAGTCACTTCCATTTCAGTGAAA
ATGCTGCAGCTTTGACCTTGTAAGACGGGGGTAACACGGGTAGACATCAA
AGGTAAAACGCCAGCGGTTGATATTTACTGCAATTTCGTAagcaagtttt
ttttgaatcaatctctttgaagtttttttctttctttcttaatttttccC
ACTGATAATGACACTTAGACTTATTCATCAATATTTTCAACTTCTCAACG
TTTTGAGCTTcgcaaaattgtttttatatgaagTCAAGATGATGAGATAG
CTTATGGAAACCTCAAAATGATCAATAGGGTAAGGAAGACTTTACACCTC
TCCTTTTCGATGATCGAAATTTTGTGTTTGGGTGTATTTCTACtcgataa
aagtttaaaaagttggcattatttttgaaaatatatgtCCTTTGgtcttg
ttttaaaattttcgttCCTGTTAATAATTTTTGGTGAGAACACTATCTAG
CGAATAAGAGGTTATCTGCATTTGTAAATCTATAAAGGGCTGCTTATTCA
GCCNCTGTTAATAATTTTTGGTGAGAACACTACCTAGCGAATAAGAGGTT
ATCTGCATTTGTAAATCTATAAGGGGCTGCTTATTCAGCCATTGGTAAGA
tttgattatattttattgATTCTTGAGTCTTGAAGTAAGAAATTGAAAAC
AGTTTTGGAGGATATCAATCATGATGGATTCTTGTATTTGATTCCTGACA
AACGATCTGAAGTGTTTTAAAAGCTAGACTTTTTATCATCAGAGCGGAAT
AAAGGTCGAATTTCGAAACTAATACtgcagtggagtctctttaactcgaa
cctccataactcgaacaagttttatcatgttcccttcagttaacaatgcc
ttataaaccttactctataattcggaatttccttaactcaaacaagttgT
GCGTGCTCGAATTATGGAGACTTCACTTTACAAACGGTCGACCCTTATAC
TATACATGGTTAATCCATGAAAGAAAAGACAAGAAATCAAATACTTCTGA
TCATTCACTACTTTAGGCGCTTATGGTTTTCTCTCCCCTCGATATCAGAT
GAAACAGCTCCATCCACTTGAGAATAATCTTAAAAATCTACTTTGTTGAT
CAACGTGTCtgtcaaaaaaagtttcttctcAAGCAAAAAGAGCTTTTAGA
AAGATCTCATGTAGACAGTTATAAAGTTGATGTGATACATGGAAATTGCC
TTGCGTCGTTTTCGTTTCGATTGCCAATGGAGTGCATGTGTTTGAGTTGC
CTTGTTCAGAAAATGAAATCGTGGTTTGACGCCGTAAAGGTATGGCCAGG
ATGTTGTTGTGTTAGTGCTCTAAAGAAATAAAACGAATACGGTCAATTTT
CAAAGCTGCAAAATTCTGCTGAAACAACTTCATAAaatgaacgaatgaat
gaatgaatgaataaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatga
atgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaat
gaatgaatgaatgcaTAAATGATTTACTACGTAAGGCCACAATAAATACT
GCACTTCCGTGTTTATCAACAGGAAAtgtcaaattcatttttttgataaa
cgaggtgttaaaagttatctttttaCCTCCAAGAATAGCATGATCGTTCA
ATTTGATAAATTACATGTCAGGGTATGTGCCTGTGAGAGGTTCTATAAAT
CAAGTGAATGTTGACGTTGTGTATTTGTTGACATGTATAGATGGAACGAT
AATACCAAATATACCAGTATTTTATGCTTAGTACTCTATCCACATTTGAT
ACAGATAAAGCCCTTACTACATTGCATCACAATCTCTATACTATCACTAA
ACAAcgatttctattgtttttattttacagCATTCGAAAAACCGTGTGAC
ATTCTGTTTATTCATTATACTGATTGTCTTGGCCAAATTATGCAACACAG
AAAACTTATCTCCGCAACAAAACAAACATCCGCGACGTCATGTCCGAATT
GTGATACGGAACTCGCCAATCACTCGCTCAACGGATAACATACTTATGCG
GTACGCCCGTGAAAGGGACCGGACGTTGGTCAGGGTGATTCGCACGAAGC
GCCGCAAGCGAAACAAGGACGTTTTACACATCGCTCCCACACACATGAGA
ACTGTCCGGCTAAAAAGCAAAACAGGATTCTTTTTGGAGATACAACCGTC
CGGAAAAGTCACCGGACATGTAAATAAAACCAAATATAGTAAGTGAATct
ttgaactttttattttacttactATCTCTGGAAAGGCAACAAAATATGCT
GAAATCTTAACTTTACGGCTGACTTTATAAGTTTTAACTTTAATAAATTC
CAGCACTCCGTAAATTCTAATTTTCcattaatttttttagtttaaaaaca
AATTGGTAATCTTAGTTTTTTTATGCTACGGTATGGTTCGCGGTCAGCCG
AAAAGACCTAGTGATCCCAAATGATGCCAGTGGCACTTAATGGGTTAAAC
GACAAATGGAACGAATTCGAAACCCAAGAAAATCCTCTTTAAATCTGGGA
TTTTACTCCCTCGCTTTAAttgttaaattaaattaaattaaatgtaCCAT
CGGGTCAGGTGTAATTGACTGTAAAAAAGAGAATCCTCGGATGGGACAAT
GCGGGCCGGATGTCCACTTGAAACAGACCTGTAGGATTAAAAAAGTCACT
TCCTTGTTTACAGCCAAGATGGAGCTACAAGTGATCACACCGCACGTCAA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00018369-exon-sc0000297-1491911889:129391..129616 | TCONS_00018369-exon-sc0000297-1491911889:129391..129616 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00018369-exon-sc0000297-1510915933:129391..129616 | TCONS_00018369-exon-sc0000297-1510915933:129391..129616 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00018369-exon-sc0000297-1575043694:129391..129616 | TCONS_00018369-exon-sc0000297-1575043694:129391..129616 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00018369-exon-sc0000297-1491911889:129944..131396 | TCONS_00018369-exon-sc0000297-1491911889:129944..131396 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00018369-exon-sc0000297-1510915933:129944..131396 | TCONS_00018369-exon-sc0000297-1510915933:129944..131396 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00018369-exon-sc0000297-1575043694:129944..131396 | TCONS_00018369-exon-sc0000297-1575043694:129944..131396 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00018369-exon-sc0000297-1491911889:132529..132666 | TCONS_00018369-exon-sc0000297-1491911889:132529..132666 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00018369-exon-sc0000297-1510915933:132529..132666 | TCONS_00018369-exon-sc0000297-1510915933:132529..132666 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00018369-exon-sc0000297-1575043694:132529..132666 | TCONS_00018369-exon-sc0000297-1575043694:132529..132666 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00018369-exon-sc0000297-1491911889:139331..139435 | TCONS_00018369-exon-sc0000297-1491911889:139331..139435 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00018369-exon-sc0000297-1510915933:139331..139435 | TCONS_00018369-exon-sc0000297-1510915933:139331..139435 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00018369-exon-sc0000297-1575043694:139331..139435 | TCONS_00018369-exon-sc0000297-1575043694:139331..139435 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00018369-exon-sc0000297-1491911889:144321..144678 | TCONS_00018369-exon-sc0000297-1491911889:144321..144678 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00018369-exon-sc0000297-1510915933:144321..144678 | TCONS_00018369-exon-sc0000297-1510915933:144321..144678 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00018369-exon-sc0000297-1575043694:144321..144678 | TCONS_00018369-exon-sc0000297-1575043694:144321..144678 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00018369-exon-sc0000297-1491911889:145154..145190 | TCONS_00018369-exon-sc0000297-1491911889:145154..145190 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00018369-exon-sc0000297-1510915933:145154..145190 | TCONS_00018369-exon-sc0000297-1510915933:145154..145190 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00018369-exon-sc0000297-1575043694:145154..145190 | TCONS_00018369-exon-sc0000297-1575043694:145154..145190 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000297 | supercontig | sc0000297:129391..145190 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
|