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transcript sequence >TCONS_00015839 ID=TCONS_00015839|Name=TCONS_00015839|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3334bp TGGATATAACAAATGACATTATGCGtcaAAAACGAACTACTAAAGATCAA TGGAAGTACACAATCCTGTTGAATACCATCATGGACCAACCATGGAGAGA CCATATTCAACACGTCACGAATCTTACTACTCAAGTCGACTCACAATGGA TGATTCCGAAATTATCACACTTCATCCTCTAATCATTGGAAAAGACATTG TTGTCTGTATGCCAGAAGTTAATAAAGTGTTACGTAATGTATACCAAGTC TTATCACAAGCCAATTACTATTTATCTAAGCATGGGATTACATCTCGACG ATATACAGGCGCCCAGTTGATCCGGATCAAAATGTTGGGCATTTTAGGAC ATGAAGccaaagtttgttcttatattttgcAAAGAGATGCTGAGAGGATT TTCGATAGTTTTGACGTCAGTGGAGACAGCCGTAAATCCACCCGTATCCA GTGGATGGAGCCCGTATTATTAGATGAAAAACCGATGCCTCAATCTACGA CCCGTAGCAATTCATCCACGAATAGCAAGAACGATCAGCAGCAGGACGGC CCGGTCAAAGTTCATCTTTTTAAACTGAATGACGATATTATAGTCTGTGC ACCTGAAGTTCAAAAAGTAGTCCAGTCTAATTTCCACCAAGGTGCAACAG TCGGTTATTATTTCACCAAACTTGGTATTGTGCCTTACAAGTTTATCCAT ACATCACATCTAGATAAGATAAAGGAACTAGGAATTGTGAAGAAATGCGC AGTCCATTGTACTTATATTTTGAAAGATGACGCATTAAGAGTCTTTGAAG CATACGGTATGACACAAGATCAAATTGAAAATCATGTTGAATTCCTTGAT GTGATGGTGTTAGCTGAAGGAACCTCCAGATCGtggaaaaataagaaaga acGTTCATCACCGTCAACAAGTAGCCTAGAATCACCGCGCGGTGGAAACT GCTTATCACCAGCCAGCAACGTGTCTGACTACTCTGGCAAACATGATCTA GAGACCGAGGATTATGCTCAAGCCTCTGATAAAGATATGACtgttcatat tttcattgtCGAAGGAAATGAAGTTGTCTGCATGCCTGATATccataaaa ttgttcaaaatatcCACGGCAATTCCATCCAAGTCAATTACTACTTTAAT AAACTCAAAGTTCAAAAACGCCGTTTTTGTTTTGCTCATTTACGTGAACT AAAGAGTCGTAATATTTTACAGAACAATGCAACGTATTGTACTTACGTGC CAAAATCAGATGCTGAGAAACTATTCCAGATTTACTGTTTGGTGGATGAT CCAAAGTTGAAAGGAGTCCAATGGTCAGAACCAGTGAACTTGGATAACAA AATCTCCAATTTAGCGTCACCGACACTATCAGAACCAGATACCAACGTTT TTGATGACAACGAAAAAGAATTAGTGGTACATACGTTTACAATGGAAAAT AGTACCGTGGTAATTACAGTTCCGGATGTTCACCGGGTTGTAGATTTCCT TGATGAACAGAGCGCATCTCTTGATTACCATTTCCGGAAACTCGGTATCG CGAAATGTCGCTTTACATACGCTCAACTCCATCAATTACGCCGCCTCAAC GTCATTAAACGTCCAACCGTATGTACGTACATTGCCAAACATGATGTTAA TCGCTTGTTGAAAATGTATGAGACCGAACGTAACAGACACCGGATGAATA AAGTCAAATTTTTACCACCGGTACAGCTAGTACGCGGAACTCCCCCTCAA CAACAAACCGGAAACCCGAAATACATCAAACGTGAAAAATCACCTCCTAA AATCAAAACTAACGGTCGACAGTCGCCATCGCCCACCAAGGTGATGTCCC CCTACCACCAGCCCGCGTCTCCTACCACTGAACGAGCACCTACCAGTTTC ACCAAGCCACCTACCTCCTCCCCACCCAACCCACACCAAGAAGAAGACAT GCCATCCTCACACTCAGTCGCTATCACGCACATTCAAAGCATCCATCCAA CCATTGATTGCCCGATTGTTATCCCGAACGGAGATTATGACCCGATGAAA GCTGGTCGGGATAACGGTGAAAGCGATCGCAAAAGATCACATGAGAACCC GGATTCACCTTCtaacaataaaaaattcaaatttGGAGATGCAACTTATG AAAGTTTGGTCCGAGAAAACTCACGCAAAGAAGATGAACTCAGAATTTTG CATGACGGTTATCAACGTGAAATCAAGGATGAACGAAGTAAACGACAAAC GGCCGAGCGAGTTTTAAACGAGTTGAAAGACCAACACAAACGAGAGATGA CAGAACTACGAGAAGAATTACGAAAATTGAAAGAGGAGAAGTTAGACAGC AAATTGAAAATCTTCCATCGAGGAAATGTGGATGATCACGATTCGCCTTT AAGTAATGGCTTCCATGAAGATTGATCTGGATACCACTCTATGGTCCTTA TGTTGGTCATGTACTTTCGTTCGGCTAAGGAAAGATTTCATGCATAGAAT CACGGATTTAATAAAGGCCCTCTAAAAATTAAATCTATGACAGAATCAAC CAGAAGTTCTAGCCATTCCTACAGTATGTCCAATTGATTTACAATCATTG ATAATGAAGGTACTGGCAGCACTATCGTTCATTACAATGGATTACATAGt caataaaaacattgaaatatgaGCGATGGGACATTTGTATCCTCGACAAT GCCAAGGTAATCGATGGGGATTGTTTTGACAGAATTCAACTACATGCACA ACAGTAGCGTGGTGGATCGACCAAAATTcgggcaaactggggaggcaatt tcagaaaattttgattttggcgctctctatcaaatgaaaattattaTCTT TTTGATCGAAAACTGCCAGGTGTAAAGGTGTTTAAAagcaaaggggcgcc gaaattagtaatAAGAGGCGTCgccctgcccccccccccatgccaccacg ctactgacaCAATATTTTTACCCATAAAAACGAAAACGTGGATTTTCTTT GAAGATTACGAAGAAAACCCAATTTCCAGGTCACCACTAGAATTAACTGC AATGTTAGAACTTTCACATACCCATATATTTCTATAGTTTATAATATCGT Agttaaagtaatgaaaattattttttcaatactggcagtttcatgttttt acaaacAATCCTCAGTTGAAAATAATTTTTTTCAAAAAATTATTTTCAAC TGAGGATTGTTTGTAAAAACATGAAACTGccagtattgaaaaaataattt tcattactttaacTACGATATAACGCTTCTAACTTCGGTTGGTTAAGCAC TCTTTTGATGGATGAAAGCATTGCTTCAACAAAT Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000217:97476..125763- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00015839 ID=TCONS_00015839|Name=TCONS_00015839|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=28288bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000217:97476..125763- (Clytia hemisphaerica) TGGATATAACAAATGACATTATGCGGTGAGTTATACTCAAACATTCTTAT
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ACATTTTGGCCATTAAAGCCTTCTGTTCTTATATAGTTTGCTCTTATAAA
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AAAAATAATTAGATAAACCAATCCTCTCACTGCAAAATATTATGCTATTT
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TTGAGAATTATCTTTGTAAAAAATATAGTACGCCAAACATTCTACATAGT
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GCCAAAAAATAATACTAGTGTCCAGTTCTCTTCAAAAAAAAAATGTATTT
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TTCACTTTAAAAAATGCCAACATTCAGTAGCCTAAATATTTTGATTTTTA
TGCCTGTCAATTTTTTATGGTTCTAATGAGAAAGGTCTAATAATATAAAC
TTTTATTGTCAACTTTTGTTTGATCAATATTATAAAGAAATAATGCCATG
TATAATACTTATTGAAAAATGTCAATTGTTGTTACATTTTTATTTTTGTT
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CGAAAACCGCTGGGGGCCTCATTAGATCAATTGGATTTTGAAATAATTTC
ACCAGATTTATATTGGATAACGTTTCAGAAAGCAAAAGCTTTGTATCAAT
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TGTGTCTCTTTGCTTATATCTTGGATGAGCTGAACTATCCCAATGAGGGT
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GGATAAACGACTCATAAAACGATGGAGAGCGATCATTGTATTTTCATTGT
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GGCGGCTCGAAGATGTTTGATTTTTTAAATTGTTTATCAGTCTTATTTTA
AAAAAGTTCTCTAGCTCTCTCTTTTTGTACATTTACAGAAAAAAAGTTTG
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GAAAAACATCATTAGACAAGAAATTCAGACAAAATGGTTATAGTGACACA
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GAACAATAACATCATTACTGCGGACATAGCTAGTACACGAGAAATCGGTA
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AGAAATCAGCAAAATGGCTTGCTTCCCTTGAGTTTCCTTTCATTTTATCT
CATCCCGCTCTATTCATTTTTTTGACGACAATTCTTCTTCCGAAATACAA
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CTGTTTTCTGAGTTTTTGTAAGTCATTTTGAAAATCAAAATTTCAATTTT
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CCCCCCCCCTCCCGTTATCAATTCTTGAAAAAAATTTAGGTAGAACATAT
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CCTTGTCTCATTAGTTCAATTTTCAAAACAAAATGTGAATTCTGAATTTT
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GAAACGAGGCCGGGCTGTATGTTTTAGTTTTTACAAGGGATTTCACCGTG
AACAAAAACAATCATAAAAATTGATAGAAAAAAGCTTTTGAGCTCAAATT
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TTCACAAATGTTCTGGAGATGTCCATTCCAGTCTTAATTTTAGAGTTCAG
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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TCONS_00015839-exon-sc0000217-1491911889:98890..99018 | TCONS_00015839-exon-sc0000217-1491911889:98890..99018 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00015839-exon-sc0000217-1491911889:97476..98401 | TCONS_00015839-exon-sc0000217-1491911889:97476..98401 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000217 | supercontig | sc0000217:97476..125763 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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