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transcript sequence >TCONS_00015838 ID=TCONS_00015838|Name=TCONS_00015838|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3561bp caacaataaaaacctttttttaatgagactttaaaatattttttttacca aaCCCCTCATGTCTATTAATCACATTTTTTATTTGCTACTTTCTTTTTGT CACACAAGTCATTTTGTATACATGTTTCATGTCAATTTGgtatataaaaa tcaaaaataaatctaatacAAGAGTTCGAATATTTTGAAGTAAAGAAGTT AAATGTGAAGACAATCAAAGCCATCATCATACAAAACCGGCGAAAGAATC TTtcaAAAACGAACTACTAAAGATCAATGGAAGTACACAATCCTGTTGAA TACCATCATGGACCAACCATGGAGAGACCATATTCAACACGTCACGAATC TTACTACTCAAGTCGACTCACAATGGATGATTCCGAAATTATCACACTTC ATCCTCTAATCATTGGAAAAGACATTGTTGTCTGTATGCCAGAAGTTAAT AAAGTGTTACGTAATGTATACCAAGTCTTATCACAAGCCAATTACTATTT ATCTAAGCATGGGATTACATCTCGACGATATACAGGCGCCCAGTTGATCC GGATCAAAATGTTGGGCATTTTAGGACATGAAGccaaagtttgttcttat attttgcAAAGAGATGCTGAGAGGATTTTCGATAGTTTTGACGTCAGTGG AGACAGCCGTAAATCCACCCGTATCCAGTGGATGGAGCCCGTATTATTAG ATGAAAAACCGATGCCTCAATCTACGACCCGTAGCAATTCATCCACGAAT AGCAAGAACGATCAGCAGCAGGACGGCCCGGTCAAAGTTCATCTTTTTAA ACTGAATGACGATATTATAGTCTGTGCACCTGAAGTTCAAAAAGTAGTCC AGTCTAATTTCCACCAAGGTGCAACAGTCGGTTATTATTTCACCAAACTT GGTATTGTGCCTTACAAGTTTATCCATACATCACATCTAGATAAGATAAA GGAACTAGGAATTGTGAAGAAATGCGCAGTCCATTGTACTTATATTTTGA AAGATGACGCATTAAGAGTCTTTGAAGCATACGGTATGACACAAGATCAA ATTGAAAATCATGTTGAATTCCTTGATGTGATGGTGTTAGCTGAAGGAAC CTCCAGATCGtggaaaaataagaaagaacGTTCATCACCGTCAACAAGTA GCCTAGAATCACCGCGCGGTGGAAACTGCTTATCACCAGCCAGCAACGTG TCTGACTACTCTGGCAAACATGATCTAGAGACCGAGGATTATGCTCAAGC CTCTGATAAAGATATGACtgttcatattttcattgtCGAAGGAAATGAAG TTGTCTGCATGCCTGATATccataaaattgttcaaaatatcCACGGCAAT TCCATCCAAGTCAATTACTACTTTAATAAACTCAAAGTTCAAAAACGCCG TTTTTGTTTTGCTCATTTACGTGAACTAAAGAGTCGTAATATTTTACAGA ACAATGCAACGTATTGTACTTACGTGCCAAAATCAGATGCTGAGAAACTA TTCCAGATTTACTGTTTGGTGGATGATCCAAAGTTGAAAGGAGTCCAATG GTCAGAACCAGTGAACTTGGATAACAAAATCTCCAATTTAGCGTCACCGA CACTATCAGAACCAGATACCAACGTTTTTGATGACAACGAAAAAGAATTA GTGGTACATACGTTTACAATGGAAAATAGTACCGTGGTAATTACAGTTCC GGATGTTCACCGGGTTGTAGATTTCCTTGATGAACAGAGCGCATCTCTTG ATTACCATTTCCGGAAACTCGGTATCGCGAAATGTCGCTTTACATACGCT CAACTCCATCAATTACGCCGCCTCAACGTCATTAAACGTCCAACCGTATG TACGTACATTGCCAAACATGATGTTAATCGCTTGTTGAAAATGTATGAGA CCGAACGTAACAGACACCGGATGAATAAAGTCAAATTTTTACCACCGGTA CAGCTAGTACGCGGAACTCCCCCTCAACAACAAACCGGAAACCCGAAATA CATCAAACGTGAAAAATCACCTCCTAAAATCAAAACTAACGGTCGACAGT CGCCATCGCCCACCAAGGTGATGTCCCCCTACCACCAGCCCGCGTCTCCT ACCACTGAACGAGCACCTACCAGTTTCACCAAGCCACCTACCTCCTCCCC ACCCAACCCACACCAAGAAGAAGACATGCCATCCTCACACTCAGTCGCTA TCACGCACATTCAAAGCATCCATCCAACCATTGATTGCCCGATTGTTATC CCGAACGGAGATTATGACCCGATGAAAGCTGGTCGGGATAACGGTGAAAG CGATCGCAAAAGATCACATGAGAACCCGGATTCACCTTCtaacaataaaa aattcaaatTTGGAGATGCAACTTATGAAAGTTTGGTCCGAGACAACTCG CGCAAAGAAGATGAACTCAGAATTTTGCATGACGGTTATCAACGTGAAAT CAAGGATGAACGAAGTAAACGACAAACGGCCGAGCGAGTTTTAAACGAGT TGAAAGACCAACACAAACGAGAGATGACAGAACTACGAGAAGAATTACGA AAATTGAAAGAGGAGAAGTTAGACAGCAAATTGAAAATCTTCCATCGAGG AAATGTGGATGATCACGATTCGCCTTTAAGTAATGGCTTCCATGAAGATT GATCTGGATACCACTCTATGGTCCTTATGTTGGTCATGTACTTTCGTTCG GCTAAGGAAAGATTTCATGCATAGAATCACGGATTTAATAAAGGCCCTCT AAAAATTAAATCTATGACAGAATCAACCAGAAGTTCTAGCCATTCCTACA GTATGTCCAATTGATTTACAATCATTGATAATGAAGGTACTGGCAGCACT ATCGTTCATTACAATGGATTACATAGtcaataaaaacattgaaatatgaG CGATGGGACATTTGTATCCTCGACAATGCCAAGGTAATCGATGGGGATTG TTTTGACAGAATTCAACTACATGCACAACAGTAGCGTGGTGGATCGACCA AAATTcgggcaaactggggaggcaatttcagaaaattttgattttggcgc tctctatcaaatgaaaattattaTCTTTTTGATCGAAAACTGCCAGGTGT AAAGGTGTTTAAAagcaaaggggcgccgaaattagtaatAAGAGGCGTCg ccctgcccccccccccatgccaccacgctactgacaCAATATTTTTACCC ATAAAAACGAAAACGTGGATTTTCTTTGAAGATTACGAAGAAAACCCAAT TTCCAGGTCACCACTAGAATTAACTGCAATGTTAGAACTTTCACATACCC ATATATTTCTATAGTTTATAATATCGTAgttaaagtaatgaaaattattt tttcaatactggcagtttcatgtttttacaaacAATCCTCAGTTGAAAAT AATTTTTTTCAAAAAATTATTTTCAACTGAGGATTGTTTGTAAAAACATG AAACTGccagtattgaaaaaataattttcattactttaacTACGATATAA CGCTTCTAACTTCGGTTGGTTAAGCACTCTTTTGATGGATGAAAGCATTG CTTCAACAAAT Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000217:97476..119000- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00015838 ID=TCONS_00015838|Name=TCONS_00015838|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=21525bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000217:97476..119000- (Clytia hemisphaerica) CAACAATAAAAACCTTTTTTTAATGAGACTTTAAAATATTTTTTTTACCA
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CGAAAATCATCCAAAAATATTCTTACGGAATTNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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ATATTCTTACCATATTCTTAATTTTTTGGCCATTTTCATCATGGACATTC
TTATAAAGTGTATTCTTATAAAAAAAGGGTGTATTCACCGCACTCTAAAA
TAAATGACTGGAATGGTCGTCTCCATTTTAATTTCTGTTGTAAATTTGAT
CTATAAATTAGTTATGAATTTCATGTTACAAATTACACTGTCTCAAAATG
TTACACGCTTTTTTTATAAGAATATTCGTATCATGATGAAATTGGCCACA
AATTGAGCATATGCTAATAATGCCATCATGGGGTATGGCAACTGAACCTA
AGAATGCCATTTTTAGAGTATTTTACCTGTAAATTACCAATTATTCCCCA
TCAACGCTAAAAAGTTTCACAAACTGAATTCCAAGTCTTTGCTTGAGCTA
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TGTAAGAATATTTCAGGATAATTTTCCCAAAAAGCTAAAAATATTCACGA
TGAATTGAAAAACACCATTCTTATAAAATAAGTGTATGTATCCGAAGCCC
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TGGAGATGTCCATTCCAGTCTTAATTTTAGAGTTCAGTGATTGAAATCTT
CTGTGTGTGTTTTAATGTCTGGTTCTGGTTGGTTAGTTTTAGTTTCGATT
TCACGGTTGAGTAGTTTAAAGTTTAACAAATGTTTATAATTTCATTTTAT
TTCTTTGTTTATGTGATTTCTAATTTCTAAAAATTTGATTATGTTATTAA
ATATTTTGAATAAACTTTTAGAAAGTTTGAAAATTCAATTTTTTTTGGTA
TTTGAATTTTCTGAAAAATTTCGAAAAAATTGTTGAAATATTATGGAAAT
GTTCTTGAGATTAGCTTGATATTCTGTACGTATTTCTCGGATTTTAATAC
AAATTTTATCATTATAAAATTATTATATTCGTAATATATGACAAACAATG
TCACATATAAGTTTTTACACAATGGTTGTGAGAAATTAAATATTGATCAA
AAAATTATTTTCATCATAAAAAAGGATATTTATTTATATACAAAATGTCA
ATAAAGTTATGTTGAAGTGTCAAAGAGCTTTAATAAAAACACTTAACTTC
TAAAAAGGAAAAGACGTAAATCGAAAAAAAAAGTCATAAAAAATTTTATG
TGTATGTTGATCTAATAGATTTTTTAATGTCATTTCATTGAGAGGTATTA
TTCTTTTGTTTATTAGCTCAAATCTCCTTCAAAACTGTTATTTTTTTCAA
TGTTTATTTTTCTATATATCTTGACTGTGTTTTCTTAAACAAATAACTAA
AAAAATTGACTTTAGCATCATTCACTACCAAACTCCATTACTCTTGAGTC
AATTTGATGTTATATGTTTGTAAGAGATAGTATAGTTAGGTAATACATTA
CATACACAATATAATACAATGCATAGTACATAGTACAATACATAGGAGGT
ATTTGGTTAAATAAGGTATTAGGTTATGGTATTGATTTATGCTATGAGTT
TCAAAATTTTCTGATCCCTTGTGATTGTGAGTTTTTGTTCAGCTTAACCA
CGCCTCCTTTGCAAGAATATTTGTTTTTTTCCATAATATTTGGGAAAATA
CTAAGTACTGATGCCATTGACTTGTTTTGCCTTAGGTTGATTTGTTTATC
TGATGGTTGACAACTCGGGGTTATGATTTATATACAGAAAATTGGCAAAG
TAGTCAAAAATATTTGGAAAATAACTCTGAGGATCTAAAAAACTGCGAAA
TTTCCTCTCTAAGGTTCAATTTTCAATCATTTGCTCAGACATACCAATCA
CCTTGAAAACCTTGCACCCCTCCTTGGCTTGAATGTACTAATTTGCACAA
TGTCATTTTCAATTCATTTTTATTTTCAGTCAAAAACGAACTACTAAAGA
TCAATGGAAGTACACAATCCTGTTGAATACCATCATGGACCAACCATGGA
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TGGATGATTCCGAAATTATCACACTTCATCCTCTAATCATTGGAAAAGAC
ATTGTTGTCTGTATGCCAGAAGTTAATAAAGTGTTACGTAATGTATACCA
AGTCTTATCACAAGCCAATTACTATTTATCTAAGCATGGGATTACATCTC
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GATTTTCGATAGTTTTGACGTCAGTGGAGACAGCCGTAAATCCACCCGTA
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ACGACCCGTAGCAATTCATCCACGAATAGCAAGAACGATCAGCAGCAGGA
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ACAGTCGGTTATTATTTCACCAAACTTGGTATTGTGCCTTACAAGTTTAT
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ACAAAATCTCCAATTTAGCGTCACCGACACTATCAGAACCAGATACCAAC
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TATGTACCATTTAAAGTGCTTTCGCCGTCGTATTGGGTCTAATCATCAGC
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CTTTTTAACCGCTATCTCTGATCGGAGTTTCTACAAATAGGCCCTTTCAT
GGTCGGAAGGAATCATAGGTAGTCAATACCACCGTGCTCTAATAACGACT
TTCTATTGGGCCAAAATTGCCGTTTTGGGAGTGCAGTTAGTCCTTATTAC
CCATGATTCATTTAAACCGTGAAATGGTCTGGTGTTGCATTTGGTGGGTG
TAGGTACATTTTCCCATCACATTTAGGCAGCACTAACATTGAGAAGTGTC
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000217 | supercontig | sc0000217:97476..119000 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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