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transcript sequence >TCONS_00015689 ID=TCONS_00015689|Name=TCONS_00015689|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1559bp AGATAAGTTGCAATGAGATATTGAAAGGGAGAGGAAACTAACTAAATACA TTAGCCAGTTTCAGATCCTACTCTATTGCTCCATATCGCTGAAACGAAAT TGAAAATGTGCTGAATATGAGTAACTATCGTCAGATAACATATGCATTTA ATATGAGCGAACAGAGAACGGCGTCCACTGCACCAACGACAACTTATATT GAAAGCAAAGAGGAAGAAGAAGACGAACGGGTACCAAGACCACATTCTGC AGATATGGGGCGTGGAAATACACCCGCCAACATGAATGAAGACTCAAGAA GCAGCCGAATGAGTCCAATCTCAATCAACGGTGATTTGTCACCTTCACAA ACCATGGGCAACATGCGTGCGTTGAGTTTCATGAATTCTGGTAAACGCGG TCGAAAGACGGACCGCGAGAGAGAAGAGGCGGGCGGTCGCCGGGAATGGA ACGACAACGAAATATCCACTTTGATCGCTCTGTGGAGTGACAATGACATT TTATACGACACGAATCACCCATTATACTACGTGCAAAGCGAACGGAAGCT AGTCATGGAATTCATCAGTAAAGAAATGAACATATCTCAAAGAGACGTCA ATGATAAAATGCATAGCCTGAGAACCTATTACTGTTCACAACGTCAACGA ACAGAGGCTTTAGACGCGAAATGTGTTGGAAGCAGTAGAGCTTTTCCACG TTGGAAGTTCTATGATAAAATGTCCTTCTTATACGAGAGTGTCACCAACA GGGCTGCTAAGAGCTCTTTAAACACTACAAGGCGTGGCCGGAAACCCCGG GAGCCCTCACGCGGTGAACAATTGACATCAATGGGTGATCCCTCACAACC GACCATACCGTATACTATGATACCTGGGAACGTCCGGAACGATTATTCGC CGACGACAAGTTCCGCATTGCGGAATGAGCCCAATAACCTGCATTCAAAC GCCCCGGAGCGCACGTTATACTCAGATGAACGTTTTGAAAACACTAACGG ACATTTAAGTCACTCAAGTTCTCCCTTCACGAAATACCAAATAGTAAGCA GCCCTGAATCAACAGGGAGCACATCTCGGAAACGCCATTGTCCGGAGGAT GTATGGGCGGAAGCGCCCTCTCTTACACCAAAAGACATTCAAACTCAACA CTCGATACGTAAAGAGAACAATCATACACCGTTTAAAACAATAGAAGTTC CGTTGAACACGGCGGACGAAATTTTCGGACATATGGTAGCTTGCTCGCTG GCTCAAATGTCGGACGAACAACAAAAAGAACATTTGAAACTCGAAATACA AAAACTGATTTACACTACTAGATTCAAGGCAGCAAATGGAACTCTATAGC AACTATCCTCTTTCCCTCCAACTTCtgtaaataattatttattttcttcg GTTCTTGagaacattttcttatttgaataaGTCGATTGGAAAAACTCGTT TTCGAGTTGTTCCGATTTCTTTGCATTTGACATTCGACTAAGTGCTTAAT CCGCATTGCTTTTGtatgttctttatttttcttaggTTTTTGTTGTACAT TTGATAAAG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000215:294857..312861- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00015689 ID=TCONS_00015689|Name=TCONS_00015689|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=18005bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000215:294857..312861- (Clytia hemisphaerica) AGATAAGTTGCAATGAGATATTGAAAGGGAGAGGAAACTAACTAAATACA
TTAGCCAGTTTCAGATCCTACTCTATTGCTCCATATCGCTGAAACGAAAT
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TGGGGAGTCTGGGGAGCCTGGATATGCTTATAAGCGTTATGCTTGTAAAA
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TTAATGAATTTTATGTCAGGAAGTTGTTCATCTTATATTGGTGCTGATTG
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TTAAGCCCTGAAGATGCTGGGGTTGAAACTATTGGATGAGATACAAATGA
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AAGAAATCTATCATGGACTCCCGAGAATTTCCTCTGTTTTGACCAGCAGG
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TGATGATGATGATGATTTAGCAAATGTTTTTGATGGTTGCTGGATAACTT
TCCTCATTTTTTATTCTACAGATAACATATGCATTTAATATGAGCGAACA
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CATGTTGAGCGGTCTAGAAGTTTACTTTTAGGTTCCAAATATACGCCTCC
CCCGCTTGGAATTTTTTTTCGAAAATTTTCCAACCCCCCCGGACCTTATT
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AGAAGGTCCCTTATTCGACTCTAAATATCCTGATTTTAGCCTATATTTAC
CTTATTTTGGGGCTTTCGTTATCACAATTTTCCCCCCCCCCCCCGTTTAT
TAATTTTAAGAATAATTTAAGCTTTCAAAGAGAAGGTCCCTTATTCGACT
CTAAATATCCTGATTTTCGCCTATATTTACCTTATTTTGGGGCTTTCGTT
ATCACAATTTTCCCCCCCCCCCCCGTTTATTAATTTTAAGAATAATTTAA
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CTATATTTACCTTATTTTGGGGCTTTCGTTATCACAATTTTCCCCCCCCC
CCCCGTTTATTAATTTTAAGAATAATTTAAGCTTTCAAAGAGAAGGTCCC
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GCTTTTTGAGTTTCAGTCTCCCGAACTCCCGCGCGGCATTTGAAATCAAT
AACTAATACCATTGAGTTGAAAGCCCCGAAGGATCTATAGAGATGAAACT
TCTCAGTGTGAAGTCAAAGTCAATGAAGCCACTTATTTTACATGCGGATG
AAATTTGGCAAAAGCTTAAAGATAAAATAGAGTGTAAGCCTCGGATCTCA
AAAAATGAATAAAGAAAATTTAAAAAAGCTGCCAGTCTCACAAGTCTCGT
CGAGCCCTTTGTATACACATACATCACATTTCCCATTCAAACGTATACCT
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AAGCCCAGGTTGAGTATTTAAAACGCTCACAAAAGATAAGAACATAAAAA
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TTTTATTTTGATAGAGAGAGTGAAATTCTATGAAAAATACAATAAATTGT
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GGAAAAATACTGATACACGCCAAAAAACAAAATACGTAATTTATCGGTGT
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AAAGTACAGCACTGACAACGAGAAGAATATAGAACAGAAACTTAAAGTCA
TTCTCAGCTTACACTGAAACTCAGTCAAACTGATTTTCTTGAGAAATAAA
TGGGCGTTTTAGAAGGCGGAAAACATCAACATTTACCTTGTCTTATAGAT
ATGGGGCGTGGAAATACACCCGCCAACATGAATGAAGACTCAAGAAGCAG
CCGAATGAGTCCAATCTCAATCAACGGTGATTTGTCACCTTCACAAACCA
TGGGCAACATGCGTGCGTTGAGTTTCATGAATTCTGGTAAACGCGGTCGA
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ACGACACGAATCACCCATTATACTACGTGCAAAGCGAACGGAAGCTAGTC
ATGGAATTCATCAGTAAAGAAATGAACATATCTCAAAGAGACGTCAATGA
TAAAATGCATAGCCTGAGAACCTATTACTGTTCACAACGTCAACGAACAG
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AAGTTCTATGATAAAATGTCCTTCTTATACGAGAGTGTCACCAACAGGGC
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TAAAG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00015689-exon-sc0000215-1575043694:312728..312861 | TCONS_00015689-exon-sc0000215-1575043694:312728..312861 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00015689-exon-sc0000215-1575043694:298123..298240 | TCONS_00015689-exon-sc0000215-1575043694:298123..298240 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00015689-exon-sc0000215-1575043694:294857..296163 | TCONS_00015689-exon-sc0000215-1575043694:294857..296163 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00015689-exon-sc0000215-1510915933:312728..312861 | TCONS_00015689-exon-sc0000215-1510915933:312728..312861 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00015689-exon-sc0000215-1510915933:298123..298240 | TCONS_00015689-exon-sc0000215-1510915933:298123..298240 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00015689-exon-sc0000215-1510915933:294857..296163 | TCONS_00015689-exon-sc0000215-1510915933:294857..296163 | Clytia hemisphaerica | exon |
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TCONS_00015689-exon-sc0000215-1491911889:294857..296163 | TCONS_00015689-exon-sc0000215-1491911889:294857..296163 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000215 | supercontig | sc0000215:294857..312861 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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