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transcript sequence >TCONS_00015627 ID=TCONS_00015627|Name=TCONS_00015627|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=913bp GCTTTTACTAACCTGATGCTCTCCTGTAGTTGTTCATTATCCTGCGTAAG TTTTTTAATATCATCAAACCGCTTGCGATCTTCATCAGTAAGTGCTAAAG TTTCAAGATGCTCGATTTCACCGCCATTTCCTTGCAGTTCAACAGATGTC GTAGCTTCGTTAACTTTCGTTACTTTTACTATCGTCTTGTAGAttagttt ttgattttcaaatttttgaaatgccTTTTGTATTGTTGTTTGTGGAGATT GTTTGTTCATTTTAGGAAGTACCAGTATATCCAAGTCAGTAATGGTGCGA GTTATCATCTCCACTAAAAGGTTTGGCCCAATAATATCTTCTTCATCAAC TATAATTATTGAATGCGAAACTTCTAAACCACGAAGAGTTCGATAGTCTG AGATTAAAACATTATCGGTATTTTCCAAGTTTTTGACAAGatcaattttt aacttttgaagaGGAACGTCGATGTCTAAATATGGTGCGAATACAACTGG TTTTCTGGTCTTGCTCTTCAGTAAGGCAGCTTCAGTCATTCTGACCTCTT GAATGTTGTTGCATATTAAAGCAACGCCTTCTTCGTTGCGTGACTCTAAA CATTGGCGTAAGATTATGGATAGCGTAGTAATTGCATCGACTGaattaaa agtgaaattttcatcgaGGTAAAAGAGTCTTGGTAAAATTTCACTCTGGA AATCATGACCACAGTCTGCATTAACGAATTTCACTGACGTATTGAGTTTT TTCATTACTTCGTATGACCCATCATCGCCCGTTGACTTTAAGATTTTCTC TGGATCATGGAGGTAGGTTAAAGTCGAAGATTTCGGCTCTTCAAAACCAA CTAAAATGAAATGATGAGATATTAAGTTGCTTGTACCAGAAAACCATAGC TTTTTCCTTGACA Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000214:246424..294684- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00015627 ID=TCONS_00015627|Name=TCONS_00015627|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=48261bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000214:246424..294684- (Clytia hemisphaerica) GCTTTTACTAACCTGATGCTCTCCTGTAGTTGTTCATTATCCTGCGTAAG
TTTTTTAATATCATCAAACCGCTTGCGATCTTCATCAGTAAGTGCTAAAG
TTTCAAGATGCTCGATTTCACCGCCATTTCCTTGCAGTTCAACAGATGTC
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TTCACTACTTCGTATGACCCATCATCGCCCGTTGTCTTTAAGATTTTCTC
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ATTTCGTTTTTTTCTACATCAATTTGAAATTTTTAACGAGATGATTGCTG
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TTAACGGAGTTAGTCAAAAGGCAAATCACAACCAAGCTCAGACATTCCAG
TGAAAATAATTAAGGAGAATAAATTTTTATGCTTAAACGTCTTTCCGAAA
GGATTTAAACTTGCCTTTATAGACTATTATATATCGCACAAAATATTGGT
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AGTACCTGGCTAGATGGTGAAATAGGTGTTCCCGAAAAATCCGTTCAAGG
GCGTCTACTTTCTAACATGAGATTTGTGTTTTACTTTATATGAGTCGAGA
CCTAATACCAGTAAAGCAATCTTCATCATTATGCAGAGCAAAAGCTTTAT
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AGGCTGAGACATGAAGCAATTGTGTACCCTTCCTAAATGTAAATATCGGA
TTAGATAAAGTATAAAGCCTGAAAAAAAATTACCAAATCAATGTGTCAGG
AAGGTGTTTAAAAAACAAAAGATAGGAGCTACCAGTAATTTTAGGGACTA
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TATCTAAAAGTCGTGCTCCATGCCTGCCTATCTGCCTATCATCAATAAAA
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TCCCTGTCAAAAGTTGAGAAAAGACGACTTTTTGTGCAAATAATCAACAG
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TGATGCATACGATATATTACCGCAGAGGCACTCGATTTCTCAACGATGGC
ATGTGCCGCCAAAAAGGGCTTAAAAACCGGACCCTTACAGTGCGGCCCTT
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TGGGTGCGAGTCAAATTTATAAAGATACCTTATTACACGAGTATTACTAG
TCATTTTATTAACACGAATCGAAAAATTTCGTGTTAATAAAAACCCCAAG
GTTATGTTAGAGCTGTACGACTTAAAGACTGAAGACGGGAGAATAATCAT
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GCCAAAGCAAGAAAAATCCTCCCCATAAAAACCCTTTTGTATAACCTATG
CATTAATTAATTAGTTGATTTATTTAAAAACATCGATGTCATCAAAATTT
CATTAATTGTTTGTTCCCTTGATTTGTTTATCTGTAACTCTTACCCTCTC
CTTCTGATTTGAAATTTTTTCTTTGATAAAATCGTGTAAATTAAATACCA
TGTAAAATCTTAAAAGTGCTCATTCGTATTAATTACCACTCACTCCAAAG
TTCAGATCGCTCAAATTTCAAGGCCGTTGAATACTTGACTAGTAATATTC
GTGTAATAGGTACATGACATTATCAAAAGTATACCCTTACAAAGCATTTA
AAGGGTCTCGAAATGCCGCCACATGCCGTGGGTCTGACCATATGAGTGCC
TCCCCCTGGGCATAGACACAACTAAACACGAATGTTCCTTCCTTAAAAAA
AGCTCTCAATTTAAGGGCTCTGACCATAGTGAATTTTCATATTTTTCGTT
TATAAAATGTGTTTTTCTGACTGATCTCCGCAGCAAAACTATGACATATT
ATATATTTTCTGTTAGGCCAAATATTCCTGAATCTAAAAAGGTAAAAATC
GCGATGAGAAAGATTGATGAAAAAGAAAACGAAGGCTTTTGCGAAGAAGA
GTATTTCAACTTTGAAGAGCTTATTTTCAGCGAATAAACAACATTTTGAT
TATTTTTTGCATCAGAAGGTGTATATTTTGCCGAACGAAAAATAGATTTT
CGGAAACTTTTTGTAAAAGCTTCTCCGTCTCAAAATCTTGAAAAAATTGG
TTTTTGAACGATTTTTCACTCTTGATAAATCTATTTAGAAAATTTTTCCG
AAAATTTTCAGAAAGTTCAATCCTTTGCAGACAATTTATAAGAAATTCGA
AACAAAAAAGTTAATCACCCATTAAAACTAAGCCCTTTTTGTAAAAGAGG
GTAATTTAACATTTTATCAACGTCTTTTTAAGGTTCATAACGTCATTTTT
GTAATTGAATTGCGAATTATCAAGTGATAGTAGAATAAATTCAGAAACAA
CTTATAAAGACAGTTTTTTGTTAAAAGTGTCAAGGAACTTAAAACAAAAG
TTTTATCTTCTAATCTCGTAACCGATATTTTGACTACGGTCAGAGCCCTT
AAAATATGAAGTTAAAAAATCAAATTAAACACCAAAATATAAAGAAAATT
TTACTCTAGGTATTGACTATTGTTAGCATTAATAAAATGGGGGACATGAA
ATCAAACTTAGTTATATTCCGATCGGAATAATAATAATTAAAATGCTGCG
TAAGAGATGTTTTATTGTAGAAACCCACTCAGTAAAGTTTTGTCTACAAC
CTAAATCGAATTTAAGATAGAGAAGTTGAAGCTGAATCAGAAGGAAAAAA
TCCCAGAAGAGATTTGAGGGGTCACCGGGGCTGACCAAAAATAATACAAT
TACCGGCAAATGGGTTTTTTATCAAAGCTTGCGTGTATTAAATTATTATA
CCTGCTAGTTCGATCTTTTCATGAATCATCTCTATATTTTCGTCTTTGTT
CTTCATGATTGTGAAAGTGAATTCGTATTCCATTGGTGCTTCCATTCTTA
ACCGAAGTTGTAACCAAATTAAACCATTTGAAACTTTGTGAACACAGCTT
TCGATTTCTTGGGGCACCCTTCTTTTACCGATTCTACAGCATTGAATGTT
GAAGATTACGTAGACATCGCTTGCATTGACGACAAAAACTACATCTTGAG
GTGTCATTTTATCAACTCTGTCAAACAATAAAATGTGTTTTCAAAGTCTG
TGAGGAAGATTTCCCTGTTAAATGTGGTCCAGGTTGGGCTTATGTGATAA
ACATCGCTACAAATTGGATAAATGGTCCTAACTCTGACCTCTTTTGTTAA
CAGCAAAACTTTTTTTGAAGCAGAGAAGACAATTGCTTGACGCGTTGAAA
CAGTTTAAAATAAGTGGCAAAAAGGCTTGAGGAATATTTAGTATATGTTA
TTTACTGAAATAAGTGAAACTTTCATTTTAGAATCTGTATTAATTTGCAG
ATTGACATATTATGCGAAGCTTAAATATCTCAGATGACAGACACCTTATG
GTTATTGGATTTATTTTCACCTAGCAACTATTATAGACACTTGTAAACCC
CTTATAAAACTTAGAGAAAAGGAAGAACGTTCATTGTCTTTCAATTGATA
TTTTAGCTTTTTCCACAATGGACACATGCCATGGCGGCTCGATAGGCTCT
AATTTTGACAATTGTTTGATAATCTTAGTCGAAAAGAGTCCTCTTCTTTT
TATTTCCAGACGAAAAAAATTACAAATTTGAGTTCTAGAGTGTTCTTAAC
AACATAAGGATAACCATACCTGAATGTCTTGTTTGGGCTGAGGGTGTGGC
TCGGTACTAAATTAAGAAAATAAGTGATCTTTGTTATATTTTGGTTTCTT
TCATTATGAAATATTTTTGAGTTTTAGAGGCAACAAAATTCAAATAATTT
GTTGCTATAATATTTTTTTAGTCCCGGTGATAATAGCGAAAGCAGATCTT
TTTGGGGATGTCATCTGAGTGCATGGTATATAGCTAGTAATCTGAAATAA
AGAGACATGGGTGTAGTAACTAGGTCACAGTGTGGATGTAAACCACACTG
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CATTATTAACGCCTACATGTCATCTCCAGTACATTTTAGATTATTCATTG
AAAACAGATTACAATATAGTCATTTTTCATGTCTCGATTATTCAATTCCG
AATAAAAGACATTCAGCGAAAAAAAAGAGAAACACCTGGGTAATCTAGTT
AAAAAACCGAAAGTAAATGGTAGACAAAGCAATGAGCCAAGGCAAAACGA
GATTAGCGTACCACTATGAAAGAAACCACTCCGGCGGTCGAAAAAACTTA
TTGATGTGTTCCACTTAGACCAAAATGAATCTAGCGTCATATTCACTTCG
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GAATGGCACGTGACCCAAACATAGTGTGGACAATAGATATACTCAATAGT
GACCTTTTACAGAAAAAATCAAGTTCATATCTATTTTGGTTCTTGAGAAA
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TGATTATGTCAAAAAGTTGGAAATGTAGGAAACATTTAAGACTCAAAAGG
CCGATTTCTTAAGAAACATTGAGGCTGCTTGGTAAAACTAGTTTCTTAAA
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TTCTTTTACCCAAATACAAAATGACTAGATTCTTATCAAACTCTTTGAAA
CTCATCTTAGGGTTAGAGGGTTTTCTTAAGCGGGTATTTTTATGATTTTG
CCAATTTTCACCAAAAGCGTTAGAATTTTATTGGAGATTAATTGTTTGGA
TTTTCTTTCAAGTGTTAAACGGTTAAACACGTAACCATGGAATGCCCCAA
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AATTTAATAATGTAGTTAATTGAGATTTTTCTTTTGAGTTTCGTTAAATT
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CGACTGAAGATAAGTTTCTGCAACCTTTTTCTTCGTTATTCCATTGAACT
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ATGATTTTGAAGGATTGAAATTGTATAGTATTTTCAATTGAATCTTACCC
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GTTTATTTTTAAAACTCTTATCTTTGCTCGGCTCAACTAACAGGATTTTA
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AAATATTTCAATCAAATAAGGCCGTGAAAATTAATAGAAAACCGGAAATG
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CAGAGCAAAAATAATAAACTACAACCCTAGAGGAAGTTTTTGTTATAGTA
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TGGAAGTTTTTTTTTTAATCGACTATACCGCAAATTTTAAAGAAAGCTCA
AACCGACCAACTGACGGAAAGGTATCCAGTGGTAAGACTTTAAACATTTT
ATTTACTAGAGGACAGTAGAACGTGAAACAGGGCTAGATTTTGTTGAAAA
AAAAAAGGTTCAGAAAACGGTTAATAATCTGAAAAAGACAGTTCTTTATA
GCAAAGTTTTGGCTTTTCTAAATTTCTTGGCCAAAATCTCGGTCTATCGA
GTATTACAACGTATTTCCATCTACTTTGATCAAAAATGGTAATTTCAAAA
TTAANGGCTGTTTATTTGATCGTTCTTCGGGCTGTTAATTTGATCGTTCT
TCGGGCTGTTCTTTTGTTCGTTCTTCGGGCTGTTCATTTGATCGTTCTTC
AGGCTGTTCTTTTGTTCGTTCTTCGGGCTGTTTATTTGATCGTTCTTTGG
GCTTTTCAGCTTTGGTCAATAATATATCCACTCTTCTGATGGCGTCGACG
TCTACGACAATGCTTTTGGTTTCTTTCCTGTTTTTATTCTTCTTCAACTC
TACTTTTGGTGTTGATGTTATGATCATAACAGCAATGTAATACCTTGCAT
CACGACAATCTTGTGGAGATAAATGAATCAAGGAGTTATTTATGATGTTA
AGGGAATTGATGCACGCGTGAACTCCACAATCCACGACGCCTTCTTGCTT
AGCAATGTCTGTTCTTGCAACAAAAACCCATTCGCTCTTTGTTGTTTCTT
TATGTGTCACACTGTACAGGATGTGTTTCATAAAGCGGAAAACGGTTGAC
ATGATCTCGGCATTGACAATGTGAAACGAGTCAAGATAATGAATTTGTTT
TCTTTGTAAATAAACAACTATGATGGACCAATGATTTCCAGCACGGTGGT
GGATTGGCATGATTAGAAGTCTTTTTGTTACAATTGGCTCATAGTTTTCT
AGATTAAGATGGATAGATGATGTTCCAGCTTCAAGAGCATTATAAACGTG
GCTGTTAAAAACATAGATGTCGTCTTTGTCGTGGGAGATTGCTAGCAAAT
ACGCGTTTATTACGTCACCTTTCAAGCATCTATCGGGAATAAGACTTCTT
TCTCAAGAACCAAAATAGATGTGAACTTGATTTTTTCTGTAAAAGGTCAC
TATTGAGTATATCTATTGTCCACACTATGTTTGGGTCACGTGCCATTCGA
TCCAAGTTGGCCAGAGCACTAAAATCGGGGTTTCGACAGATTCGCCTATG
TCAAGCAAAAGTGGTTTCCGCGCAGTTTCTCAAGAACCAATAGAGGTATG
AACTTGATTTTTTCTGTAAAAGGTCCCTATTGAGTATATCTATTGTCCCC
ACTATGTTTGGGTCACGTCCTGTTCGATCCAAGTTGGCCAGAGCACTAAA
ATCGGGGTTTCGACAGATTCGCCTATGTCAAGCAAAAGTGGTTTCCGCGC
AGTTTCTCAAGAACCAATAGAGGTATGAACTTGATTTTTTCTGTAAAAGG
TCCCTATTGAGTATATCTATTGTCCCCACTATGTTTGGGTCACGTCCTGT
TCGATCCAAGTTGGCCAGAGCACTAAAATCGGGGTTTCGACAGATTCGCC
TATGTCAAGCAAAAGTGGTTTCCGCGCAGTTTCTCAAGAACCAATAGAGG
TATGAACTTGATTTTTTCTGTAAAAGGTCCCTATTGAGTATATCTATTGT
CCCCACTATGTTTGGGTCACGTCCTGTTCGATCCAAGTTGGCCAGAGCAC
TAAAATCGGGGTTTCGACAGATTCGCCTATGTCAAGCAAAAGTGGTTTCC
GCGCAGTTTCTCAAGAACCAATAGAGGTATGAACTTGATTTTTTCTGTAA
AAGGTCCCTATTGAGTATATCTATTGTCCCCACTATGTTTGGGTCACGTC
CTGTTCGATCCAAGTTGGCCAGAGCACTAAAATCGGGGTTTCGACAGATT
CGCCTATGTCAAGCAAAAGTGGTTTCCGCGCAGTTTCTCAAGAACCAATA
GAGGTATGAACTTGATTTTTTCTGTAAAAGGTCCCTATTGAGTATATCTA
TTGTCCCCACTATGTTTGGGTCACGTCCTGTTCGATCCAAGTTGGCCAGA
GCACTAAAATCGGGGTTTCGACAGATTCGCCTATGTCAAGCAAAAGTGGT
TTCCGCGCAGTTTCTCAAGAACCAATAGAGGTATGAACTTGATTTTTTCT
GTAAAAGGTCCCTATTGAGTATATCTATTGTCCCCACTATGTTTGGGTCA
CGTCCTGTTCGATCCAAGTTGGCCAGAGCACTAAAATCGGGGTTTCGACA
GATTCGCCTATGTCAAGCAAAAGTGGTTTCCGCGCAGTTTCTCAAGAACC
AATAGAGGTATGAACTTGATTTTTTCTGTAAAAGGTCCCTATTGAGTATA
TCTATTGTCCCCACTATGTTTGGGTCACGTCCTGTTCGATCCAAGTTGGC
CAGAGCACTAAAATCGGGGTTTCGACAGATTCGCCTATGTCAAGCAAAAG
TGGTTTCCGCGCAGTTTCTCAAGAACCAATAGAGGTATGAACTTGATTTT
TTCTGTAAAAGGTCCCTATTGAGTATATCTATTGTCCCCACTATGTTTGG
GTCACGTCCTGTTCGATCCAAGTTGGCCAGAGCACTAAAATCGGGGTTTC
GACAGATTCGCCTATGTCAAGCAAAAGTGGTTTCCGCGCAGTTTCTCAAG
AACCAATAGAGGTATGAACTTGATTTTTTCTGTAAAAGGTCCCTATTGAG
TATATCTATTGTCCCCACTATGTTTGGGTCACGTCCTGTTCGATCCAAGT
TGGCCAGAGCACTAAAATCGGGGTTTCGACAGATTCGCCTATGTCAAGCA
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TTTTTTCTGTAAAAGGTCCCTATTGAGTATATCTATTGTCCCCACTATGT
TTGGGTCACGTCCTGTTCGATCCAAGTTGGCCAGAGCACTAAAATCGGGG
TTTCGACAGATTCGCCTATGTCAAGCAAAAGTGGTTTCCGCGCAGTTTCT
CAAGAACCAATAGAGGTATGAACTTGATTTTTTCTGTAAAAGGTCCCTAT
TGAGTATATCTATTGTCCCCACTATGTTTGGGTCACGTCCTGTTCGATCC
AAGTTGGCCAGAGCACTAAAATCGGGGTTTCGACAGATTCGCCTATGTCA
AGCAAAAGTGGTTTCCGCGCAGTTTCTCAAGAACCAATAGAGGTATGAAC
TTGATTTTTTCTGTAAAAGGTCCCTATTGAGTATATCTATTGTCCCCACT
ATGTTTGGGTCACGTCCTGTTCGATCCAAGTTGGCCAGAGCACTAAAATC
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TTCTCAAGAACCAATAGAGGTATGAACTTGATTTTTTCTGTAAAAGGTCC
CTATTGAGTATATCTATTGTCCCCACTATGTTTGGGTCACGTCCTGTTCG
ATCCAAGTTGGCCAGAGCACTAAAATCGGGGTTTCGACAGATTCGCCTAT
GTCAAGCAAAAGTGGTTTCCGCGCAGTTTCTCAAGAACCAATAGAGGTAT
GAACTTGATTTTTTCTGTAAAAGGTCCCTATTGAGTATATCTATTGTCCC
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CAGTTTCTCAAGAACCAATAGAGGTATGAACTTGATTTTTTCTGTAAAAG
GTCCCTATTGAGTATATCTATTGTCCCCACTATGTTTGGGTCACGTCCTG
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TTCTTCGCAGGCGCAGGCATTTCCTAAACAAAAATCTTTCTCATGAAATC
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GAGATGCTGCTAAGATTTAAAATGAGCATACTTTATTCTTCATATTCACG
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TATCAAGAGCTATTAATTTGATTATTTTAAAGAAAATTATGTATGAAGTC
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000214 | supercontig | sc0000214:246424..294684 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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