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transcript sequence >TCONS_00013900 ID=TCONS_00013900|Name=TCONS_00013900|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1915bp CATCAGATTTTTGGCAAGAGGTGATGGAGAACAAACCGTTCTTGATTCGC GATCCGATGCTAATGGAAGACGCCATCTTCATGAAAGAACAAGATGACGA TGATTTCAGCACCGACTCCTGGGAACGAATCTCAAACGAAGAATTAGATG ATTTCGTGCAAATCTCCAACACAATAAGCAGTCCACCGACGTCTCCAGCT ACTTCCACTGAAAGTATTGGTAATGGCTTCAATGGTGGTTTATTGGGAGG ATCTACAGATTCGGAAGACACTTTCAAAGCATTGAGCCAACTTGATGACG ATCCACCAATACTGATCAAAATGGAATCAGAGCAATCACCATTAAGTATG TCGACCTTCAGCATGTCATCATCACCACCATCATTCTTGGATACTGCGCC GTCTCCATTGATGAACTCAAccaaacaacaacagcaacaacaacaaaatc caCTAAATGATACACCAGAAACACGAGCCATGAAGCGGGAGCGTAACCGT TTGGCTGCACGCAGATGTCGACAGAAACAAAAAGATCGAATTGATTATCT CGAAAAGGATGTCAAACAAATCGAAACGGACAATTTCAAAGTTGAGAACG AAATCAAATTGTTACGGCAACAATTGAACGAATTACAAAGTGCTTTAATT AACCACGACTGTATGTTAAAGCACGGTCTAACGCCAAGACAACATTACTA TTCAGTCAAATTCTGAGCATAAGACCAGAAGAAGATGGCGGACGAATGGC GAATAAGCGCTTATGCCTATCAACAGTTGCTAAGGAACACACTTTTTCCA AAAGATGACAAACGTCATTGCAATATGGTAGCGTAATTATGCGAACCGTT GCCATGGAGATcgtaaacaaaaacaacaagatGATGGGGGTGCTAAGTGA CAAATTACTCGAATTATGCGAAGAATAATTTTTCCGTATTACAAATATGA CCAACTTCATGGATGAATGTTACCCATGAGGAAGTAAGCCTTTGGTCCAC CCACATGGTTTTAATATCGATGGGTTCTTATTACCACAGAAACATGAATA TTCACCTATAGCTTGGCTTTTACATGGAAATAAGACGCAAACAAACGCTT TAAAACTTATCTTTTCACTAAACGTAACGAACTTAgtgaattaaagaaaa aagataaattttcaCATACTTTGGCTTGGTAGTATGAATGTTGATCTTTT GATGGTCCGCAAAGCACCATATTCTAGTCAACGCCACGCCACGCCACGGG CGTTCACATCAACTGCCCAATCCACGAGAAGGAGATATCATAATAACATG ACATCATTATTGAGTGATGATTCATAAATACACATAAACAAAAGACTGAA AAATAAATAGtacaaatattttaatatttccaCATCCAGTTTGTAaatat taaaacttttttttNACTGAAAAATAAATAGtacaaatattttaatattt ccaCATCCAGTTTGtaaataataaaacttttttttttaaagaaattgtat AAAATAGTATTTTAGTTGTCAAGATTTGTATGTCAATAAttcaaagtaaa acaaaaaaaaatcacagtcAAATTTTGTTCGAAATTTGTCAATGTTAACA AAAATATGCCTCTGCTCTGACCCTCAAGTTAATATGAGTTTTTtctaatc aaaatttaaaaactctataatttattgaaatttgagGAAATGTCCTGCAT TGGTAAAGACTAGAGATTAGCAACAGCTCTTACGTTGTCACTGAGATAGT TTTGATATGAAAAATTACAATTATTCGAACAAAATATTTCTAGGTAGGAT AATAACTTTCTATACGATATTTTTTATGTAAGAgaagaaaataataaata taatatttggaatttatttatgtatattttgaaaggtgaaagaaagaaga aagcaTAAAGTAAAT Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000174:548225..568715- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00013900 ID=TCONS_00013900|Name=TCONS_00013900|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=20491bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000174:548225..568715- (Clytia hemisphaerica) CATCAGATTTTTGGCAAGAGGTGAGCATATTTTTTCGTATAAAATTTCTA
CATTGATTTTAAATTTATTTTTAATAGGACCTTGCCCAGTGGACACAGGA
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TTGTTTCAACACTCATATAGCGCTATATAAACCCTGTGACATTAGATAAA
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ACAAATTCAATATTGAAGTAAGTTCGCAAATTCGAATTCGAATTCTAAAA
ATGCTCTTGCATTTGCAAGTTTAAGAAAAAGACAACTTCTCGATATCGCT
AACGTACTCTCGGGNGCATTTGCAAGTTTAAGAAAAAGACGACTTCTCGA
TATCGCTAACGTACTCTCGGGTACCTAATAACCGTCCCCCCGCTAATTAA
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GCTCATTAAGTTTTGAGATTTTTTCCAACCCCCACGCTTATTCCAATCCC
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CAGGGTCTGTGACTTCACATATCTGTATCTCTGAGTGTGTATTGGTTATT
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CTCCAATTCTCGTCCCCACTGAAAATAATCAAATAATCCAACCCTCGCTG
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CTGGGGTCCCAGTGGGTCTGTGACACAGAGGTATTTTCAACGTTCGTTTG
ACGTTATATGGACGCTGCGAGTATTAGATAAACGTCAAAACAACGTTGTG
TGCCGTCTGGGTTGCCAATTTTCCCCACCTTTTTTATCACATGTAGTTTC
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AGAGAGATTTTTAGATTTCTTGATTGTAGGATGAGTCAATTGATTTCATC
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TGACATCTTGCAAAAACAAAAGTATGGCGTGAGTCACTCTTCCACGAAAA
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TTCCTCCGTAAGCTTTAAGTTAAGGAAACAAGATATAGCTTCACTCAGCA
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ATCGTAGGATGAAGTCTTCAAGCAAGTGAGACTATTTCTAGAAAGATGAC
AACAGGTTAAAGGAATGCAATGAGCGTAGGTTTTTTTTGAAAGAATCAAA
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TTCGGAAGACACTTTCAAAGCATTGAGCCAACTTGATGACGATCCACCAA
TACTGGTAAGATATAATGACACGTTAAAGCAACGTTTATCTAACGTTCAT
GACATCCATATTTTGTTAGATTGAACGTTAAACCAAAGAAGAGCCTAGAG
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AGAACTATTTTAAAGGACAATGAGGTTCAAAGTGCCAAAAATAAGAACAG
CCAAGCCTAATAAAAACTTTACTGGTTCTTATAAAAAAAGAGTGTATCAT
GCAAACGATCATGCACGAGAGAAAATTGTCTTAACTTTAGACTTCCAGAT
TGATTTACTGATAAACTAATTTTATAAGTCTTTCTCTGAGGGTAGAAGAT
TGATTGAAAAGATAAAAAGCACCCTAATCAAACATACATAAGGGTTTATC
AGTGGGAACATTTGACGTCAAAGCTGCACTCTCTAAAATGACTAGTTCTT
ACCAAAATTTTCAAGAACTATCGTCATAAAGTGACAAGCTTAAAAATTTT
CGGACCAAGTTAACAATCAGAGAGATAAAAACATTTTATTTGCATGCAAG
CTATTACTCTTCAAAACAAATTTTTGTGTACTTTTTTGACAAATGTTTAA
TAAAATGTAAACAAACATGGTAGATAGGAGTAGTTGGGAAGCAATTTTAA
TCCTGCCTGTGACGTCAATCAGAGGAAATCATTGCAACATAGTGTTTATT
TTTTACGAGGGAGGATGAAAATGGAGAATGGTTAAAGTTGCAACAGATAA
AATTCTTTTCATCATCCGCCCCCTACATAAAGATTAAGGTACACACAAAA
GTGTATGCAAAAAATTCTCTAAAATCACTTTTCATCAAATATGGTGTTTG
TTGCGAAACGCTAAAATGATTTCAATAGGCTTACGTCAGCAAATTGCAGA
AGCTAATATATAATACACGTAGAGCGGTAGAAATGGTATTATTTAATAAA
CGACCAATAACCACAAAGCATATAACACAGTGATAGGAGGAAGAAAGAAA
CTCTGATTGATCATTTGAAAAACACATAAAAGAGGGAAGTCTTCATAAGT
GAAAAACAAACTTTTCTCAAATCAAGAAAAGAGGAAGAATTCAGTTTATT
CGTTGGTGTGTGAATAGGACGACAGAAAGATGAGTCCTTCTCATTTATTT
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CATGTCATCATCACCACCATCATTCTTGGATACTGCGCCGTCTCCATTGA
TGAACTCAACCAAACAACAACAGCAACAACAACAAAATCCACTAAATGAT
ACACCAGAAACACGAGCCATGAAGCGGGAGCGTAACCGTTTGGCTGCACG
CAGATGTCGACAGAAACAAAAAGATCGAATTGATTATCTCGAAAAGGTAA
AAGTCTTTTCTGACTTTTTTTAAAGAAAATTGTTAAGTTTCCATCGTTTA
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AAATTTGAGAGCATTCGATACATTTCAATTAATCCTTAAAACACTTAGTA
AATAAGTCTGCGACCGCAGTGTCGCAATCCACACGAAGGTAGGGTAAGCC
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TATTTTGAAAGGTGAAAGAAAGAAGAAAGCATAAAGTAAAT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000174 | supercontig | sc0000174:548225..568715 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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