TCONS_00013382 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00013382
Unique NameTCONS_00013382
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length325

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00013382 ID=TCONS_00013382|Name=TCONS_00013382|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=325bp
GTTATAATGGCGGTCCTGCTTTaaacaaatttgaatttctttagccaata
aaggaaaaaaagagaagtTTAGTCTCATCAAAACACAACACACCGCAATA
AATCAACAATCAGTGCATCAGAAAGAATAGAAGAAAAACAAGAAATCACA
GGTTTAAAACACTGTCAATGTTTGGGACACCAGAGAAATTAGAAAGCAGA
CGTAATCACATTACCATCACTTGTGATCAAGAGACTGGATCGAGTCCGTA
TCATANctcttaagttgttcttattttttggcatttttgagcctcattgt
tcttataaaattgttcttataaaaa
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000167:251537..272287+

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00013382 ID=TCONS_00013382|Name=TCONS_00013382|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=20751bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000167:251537..272287+ (Clytia hemisphaerica)
GTTATAATGGCGGTCCTGCTTTaaacaaatttgaatttctttagccaata aaggaaaaaaagagaagtTTAGTCTCATCAAAACACAACACACCGCAATA AATCAACAATCAGTGCATCAGAAAGGTATGATATTCAGGGTATAAGTACT TGAGCCTGATAAGAGagatttttgtaagattttcCCATTGTTTGAACAgc aaatttttgttgattttttagcTGAACTGCCGTCTGCGTCTGGACTGGGC TGGTGTCTACCATCTGTACTGGCTCTGCTCTGCTGGTGTTCGAGTGCCAT CCCATTAGGATGTCAAGATGTTGTTTGAAAGTTTGTTTAGTACAGTATGG TTCTACCCATGAAAGACAATCCTTCCAAATATTCTATAGaatatttaatt taattaataTCTAATGCTTTgagccattccagaaaatttttgttaccccc tcGTCAGACAACGtgcattttttcattttttcatttttctagcctcagaa atattttttttcttccagtgGTAGTCGGAAATTCAGATGAAAATCCATGT ATTTTCGCAAAATGTGTTGAAAATTCCACTCTATTTTACCTAGTCCAGGG TCTGGAGCTCAactattttttgcctttgataatttgatggtggaaaaaat agAGAGTCCAGTGGAACCCACAAATTATGTAACTGAAACTATTAACTGTc acaccaaatttgaatttaaaaccaatCAGAATTCCCTNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNaaaccccggggggggt acttaggcaaaatgggtgccgtgtatgtgcgagccataagggtacctttt ctcattcctcaaaagtctctcaaaggggtatatacaaattcaaaagtaag tctctgaaagggtcccaaaatcacgaaaatcaaaaatttctctctcaaag ggtcgcgatttccaaaaagtttgaccaaaatttggtgacaatcaaaccaa aatttggaaaaaatgaaccaaaatttaggaaaaagtctctcaaagggtcc caaaatcaccaaaattttgNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNCTTTAAGATCTTCATTGTAGAATTGCTTCGTAAACTTTT AGATTCTCGGAATTAGATTTTGTTTTGAACGGCAGTTAGTCAAAATCAAT AATTAAGCCGTGGTTTTCCTCACTAAGATAAGAACATTATTTAAAGACAA ACAATACgggcattttatttttaatcaaacaaCCACAGATATTGCGCAat ttagaattattttcaaaagttgacgCATGCGTCGACCAANTTGGTACAGT ATGGTCCTACCCGTGAAAGACAATCCTTCATTCCAAATATTCTAATGCTT TgagccattccagaaaatttttgttaccccctcGCGCGCTCGTCGGACAA CGtgcattttttcattttttcattttttctagcctcagaaatattttttt tcttccagtgGTTGTTggaaattctgatgaaaatccatgtaTTTTCGCAA AATGTGTTGAAAATTCCACTctgttttacctttttttcacaATTGCCGTG GAGATTCATACATTTTCTCCTTGCACAGTCCATCACAAACTGCCATATAA ACAAagctcaacattctcacaaaagttgtctttttgatttcccaaattTC GTCGTAAGCGTTCACtttcacaataatttatgtaattgcaatttcggtca gtccacagtcgggttcaacattTACGCGTGTTTTTAttcacgtgaccgaa gtgcctactaaaacaatccgggggtaggtggcgaagcaacacatcagata gaccttttttcaaagaggccaccctgttgaataattatgtagtccagcag aaaaacaatgatagagccatgcataattactgtatcatgcatattgtaat aattatgcaaagttttatcattgtttttctgctggactacataattattc aacagggtggcctctttgaaaaaaggtctattaatcgcagtgccgtagca actgggggggggccaaggggggctatgcccccccaataattttttcaaaa attgttattttgctaaatgcaaagtttttcttttttaatttgtcataatt gtcacaattgagtgcattttcaagcaatctagagctcaaattttcaaaat tccccccctcgggccaaaccatgcttggccctcgcggtgtcactaaactt cagccccctcaatatgaaaatgtttcctacggcactgaatcgtaaagtaa agaaatatcttttgacattgacaattgaatttaatatattacattatatt tcctttaattcaaaaatcaaaaattcattttgcattcattcgcgaaaaaa gaaaataataataatgaattaatattacataNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN taaaaattatgaatttataataattacaaaaaacaaaaagttagatatat acttcattagtgaaatattcaataaattcctactTTCAATTTTCActggg cgtttttctagggcttcgtttatcgcgaaatttttgcgtcacacaaactt tctcggccgctcgtaataattatgcattgccaaatttggttctccattgt caagacaggatcgatggtgacgtcacctNcataaaaaagaaaggattccG TCAggtttatgcatatattaatttgcgagatattctattcgccgcacGAG CGCatttttcgtagactagtcggaatacttttttttactcgcgggattga tggtaacttttcatcttcgtttttttttaaatgaagcacaaccgaaaaaa aatgaaacttcaaaaagttGCGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNgtattgggggttctagtcttgacccct aagcctacgcgagattgaagcgtttgggtaaacaagacaaaactccaaaa aagctggtgttttgaagagCTTCCTTGCGATtgaaatatcgctgtttgtg agACTGTTGCAAATTTTTAGtcagaattttgaattttggtgaaattttTT TAGTTAGGAAACATTTGGTGAGTTTCTGTTCgcagccgcaatcaaaaaaa tcataaccccACTCATAAAAAATTACGTTTGCGTCttttcataacttctt ttcctctagataaatttttgtgaaattttcaggagagataataaaattgt cattaatatcatgttcaaacatcTAGGCGGCTatctaaaatatgttccgt tcgcgtcgccgaccgactcaccttcaaaacataaatcccgagtcggaaaa atgtcggaaaaagtttttgatagctaagcacttctttgaatcatcattcg ctatgaatatttatttactcaacccacattgagtcccgtttgagtttttt catgtacccttattgaaattttcaagtcgaaATTTGGCGAcgcggtaggg ccaatacccTCGAGAGCCGAAAGTAAGGTCCGCTTTTAAGGTTCACACAT GAGCGCGcacatttaatttggcaaatcaaagatggcggcaagagattttg ttgattgccgactCGATTCTTCGGGATTTGCTGGATTTAAAAAacccgac aaaatttactaccgactgaccgaccgactggatttgaagatgttttatga tgcgaacagaacatattttagattgtcgccgtaaaacattctctttaaag gaaagaaaaaaaatggcaatgtttaagtttacatttctctaaccttccac aatactaaagtgagcatttttacctaccgcctctacggtggagatggcga gactgttaaacggtgtattattggctataaaaactttttgagtCGGTAGA AATTTCTTCAACTTACAACAATGATAGAATGCACCTATTTAAACAAAATA ACCAGCGCATCTTTTATCTTTCTCCTTCTTCATCTtacaatgaagcactc aaagtcaaatagaattaagcacaaaagataTTCTTATGATTGTGAAATGC CGCTTGCGCCTTCGCTACGGTGGAGTGCGTGACGTAACTCACGCAGCAAA AAACTCGTCTTCTGTTGGCTGATCATATTGGCCGTTTTGctgttaccacc ctcgaagcagcgGGTGCCTTTATCATTTCACAACTATATACCGCGTGGAG CGCGTATCGCGTATCGCGTAGCGTGTAGCATAGGGTTCGCCAACCTGGTG CACATCCCTAACCCCTCACCTGGCCGGCGGTGCACCCACCCGGCAGTGCA TACGCATGGTNGCGTGTAGCATAAGGTTAGGGATTTGCAACCCCTAACCC CTCAACCAGCCGGCGGTGCATACGCTTGGTGGCTTCTTCGGAGTAATGGC AatcataacagttagcctaactcgtcagtcaGATTTATTTATGTATAGTA CTAAGACCTTCGTATAAGTAACCCCAAATATCGATTTTTCGGCAGCGGCT TGGcctatgtatgtatgtatgtaatagtttatttcaagttgacgaacagg tagcaacaaaggctaataaaagtcaacgctactttacaatttgtaaggtg attacagTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCGTTAGTGATGACTGGATTTCTTGAA GGATCGAAGTTTTGATACTTTCTCCTAGGGTGTCGAtttgttctttaatt tttttttcgaagtcaTCTACAGTGTACGAATCGTTTTCTAGGCtcttatt ctttgttttaagagttttcactttcttttggtATTCTTTGATCGATTGAT CACGCTCGTGtatgatattttttaaattttcttggtcgCTCTCCATACAT AACAATTCTATATTTTTTGAGATGTCTACACAGTTTGAGCAGATGAAGGT TGCTTTGTTGCGTTTCAGGGTTTGATTGTTTAAGTGTATTTGGACTTGGT ATGCTGGTAGTTTAGAGCATTTGAAATGAACTAAACGAGAACATTTTACC ATGGAGCATTTAAGGGTGTTTGCTTCGTCTGGAACGAAGCAATNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTCTCTGTTGATGTTATGTCAATGGATGATA TATCACTGGGTGGATCCTCATCCAttgttggtgattttggtggcGGAAGA TGATGGTAGTGTTTGTGGGAGCttaattttttagtaaaaataccagattt ttggtaaatttttgtgtttttgtgaaaaatttgttGTATTTTACTAGAAG CTCTGCcacaaaaaaatttgacgtccgatcacgttgacgtcaaataaaga ATGATAGATAGGGCATTGGTTTAGGAATCTATAGGTTCCCGGTTCGAGAC CCCCTTTGGTCACtattcaacttgaaaaaaattctaagtccagccggatg catctgaagcttTAGCCGAATGTCAAGGAAGATCATTTACTTTGGTCTct ggctttgggaagtagtaatgttttttattgttttcgattgaaaatattaa gaaacttaagtttagtgtcatttagtttttgtaggcttatagaatggcag gatcctggatggcttCCCTAACTGCTTTTGCTCTCGGAAATCCTGCGTTG TCCGCACCCTGTTACAGataaattctggaatggccctctGCTCTATTCTC gcagttttcaaattttacgcTTTTCATACTTCTGCAGGCAGTCCCTAATT TATGTGAATGCATGCTGCCTGCCTCTCATCATTGTAATTGAAATTTGGGG TACTATTTTCTAGTATGCACCATGCATAAATGATCCTCTAtcattctctt tttcttttaaggCTGTAAATGTTCAGTTTATTAAAGTGGCTCAATGAGGG AATccctttcaaaaatgttttttgtagAAGCTGCAATTGTTGAATAAGGC ATCTCTTTATCtcttctatttctatttctttgaGGCCCATTTTTGCAACT ATACTTACTTACTTCAGTATACTTcagtttgatttgatgatattcATCTG TCCAGCTCGTTGAGCCCAACACGTATGATTTGATCGAAAAGAGCATTTGA TTCAGCCAATCTTGTTTGTCGCGACGTAGTGTGAGGTTTGTCGGGTATAG AGCACAGATATTTATCGAGTCGTTTCTTGAATGAATCTTTTGAACAGCCA GTAATATTTCGTATGTCAGAGGGAATACTGTTGAAGAGTTTTGGACCCTG TACAGTTAAGCTCTCACAAATAAATTTGCGAAAGCTACTTCGTTCGATTG TTCGTAGTTTGCATTTTCGACCATGACGGCTTGTAGTTGAAGACGAGACA CCACCTTTTACAGTGCCATCTCCTTCagtgtggctgaaatttggtactat ACCCTCTAGTATCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGTAAATAGGAA TGATATGACTGTCTTTGAAGAGATGTGGTGTTACCCCGTTATCAAAACAC TCTCTCCAGATTGAACAAAAAGGAGTTGCTAGTTCTTAActacaattttt gagaaaaattgcagAAAAACCATCGGGTCCTGGTGCTGCATTTTTGGATA TTGTTCCAATCTCTTCAACAAAGTCCTCTTTCGTAAAATCAATATCAGTC AAAACAAAATCACTGTCTTTATCATTATTATATTTTGCGTTTTCGAGTGG TGTACTGATTGGTACTGTTTTTGAAGAATGTCTGCCATTTTTTTACCGTC AGACACATAATTGTTTGTTGTTTTATCTATTAAAGGACCAATTCTAGCTT TGGTCTTACTATGTCTTTTAGcataagaaaagaaatattaaactattaaa ctatagacgctttcgaTTAGCGCCatgtcagcaccttgaactgactaccc aattcccctcacattgCATAggttcaaaaagttgaaattttcctattttt ccgacccttactggggactgaaatttgattttctggtTTTTTTTGACGta ggagtttaagcttagactgtGTACGTACAGATTTGAGTCCATTGAGTCAG ATTGAGTATATGTTATTGATCTCTGACCATCTGTTGAGGTCATTTTAATG GAGCTGACCATCACCTTGACTGGACACAAGAAACAGCAAGGAACCCTTGG GACACCCCAGATATTAAGACATCTGTATTTTTGGATAGCTTTGCAggggg ggggtaccaagtcAGTACTGGACCAAAGGTAAACttgttttttggatttt tttccaaaaaaattagacCACCACCCTGTTTAGTACACTCTACTAACTTT CTTCCACGGTcagggctttgacaccacccttttagtacattGTACTGACG TTTCTCCACGACTGAATttttgataccacccttttagtacattGTACTGA CTTTTCTCCATGAGCAGAtttttgacaccaccctttcaGTACTAGCTGTT TTTTAGATCAGATAAGTTTATAAACCACCCCACTGCACTGTACTCACTGT TCTAATTTCTTCTTTAATTGCCACCCTATACAaaggttttgaagcatttt gctataagaaaagcaccaaatttatataaaaggaaaaaatttgaatatta aaatatttgaatccTTGTAGTACAAacactgaaacaatgaaacagacAAA GTCATTCGAATACAGTGTAATTAGCTGAAATTAGCACGTTAAAACACTCA AAACCAACTTTGAGTTATTTCCCTTCCTATGACTTGATTTCTGGTTGTCT GGCAAGCTGTAGCAGTTTTtctcttttgaaaaagaacaatAAGAGACTTG AAAGCTTTGATTTAAACGCTTACacattcaaattcttttgttgccataat gtagatagggctttaaagaaattgtaaataAGAATGGACTTAAGGCCAGT CTCCATACTATTATACTGTCCAGGGTTTCGGTAGGGTGGGAAGATCTATC CCACAACACAGAAATCCTGAAAGCAAACGGGTAATCTATATCAATCTAAT TACCAGTGGTAGGtttgtttgaaataaaaaaaaaaaatccagagTGGACA GTTGTTgtggaaagaaaattgaagtcaGTGCTGCTTGAGGAAGAGCTAAG AAAGTGTTCTTGGAGCAGATTGGGCTGCTTGAAAATGAATAGAGAGGGAT TGCTTGAGCGTAGAAGGTGTAATCAGAAcaatgttttgaagaaaagaaga tgAGATTGTGATGGGCTTTGAACCAAGGTGTCATGGAAATGTCAGACGTG TATGCTAAATAAATCACAACATGGGGCTGTGGGCCATAGAACAAACTTTG AAAAGATGAAGATCCTATTTTTGTGTTAGAGTTGAGGCAAAGTCATGTGG CTGTCTAAGCTTTTTGAATGGCCGTAATGGAATAGAGTTGTGTAGACAGT TGTCTAGGCGAGAAGAAGAGGAAGCATTTAAGACTTCCCCTAGAGTTAGG TGTGCCAGCAGGAGTAAACACTCTTTGCTTTTCTAGAACCACCCATCTTC TCTACCAAGAGACATGAAAGTCAAACCTGGGTCATTGCGGCCCGAGGTGG GAGTGCTAGCAAAAAGCCATTGAAGCTGAACTGAATTaaagaattgaaaa gaaaaattgagagagTAGTTTCTATTACAGAGTATGAAGGAGATAAAGGT GACAGGCCTACGACAGTGTAATCAGATCGCAATTATCTCTCCAATGTGAA AATAGAGAGGAAGTGGTGCCAATCAGTGAGCATATTGGAAAAACAAATAT GGTGAATCTTGAGTTAGAAATTGGGAAAAAGAATGGGAAGAGTAAGTATA CGAAAAAGGAGATCCacaaggatgttgacaaaattgatCTGGAATCATTG TAGCTTCTTTGGAATTATAGTCATAAGTTGTGGGTATATACTTAACTCCA ATATAAGTtggataaaatgataaaatgattgaaataaTATAATTAAGAAA TTGAACAAGTATCTCCAAATGTTTAAAAGTTCTTGCTTGATGAGGGTATT TTGTGATAGAAATGCTAGTTTTTGGTGTCTGTGGATGTAAGTAAGGTTCC GATGGTGGTGTTATTTTTGTATACTGTGGTCGGTCGTGGGATGGCATTTG ACAATTCCTCATCCTCTTCTATGATGGACCAATATTCATTAATGGTAGAT CTGATGTACTCATCTTTGTTTCTGTATAGAATGAGAGGGAGAAAGGGTGC TTGAGGTCCTTGATTTCGGTTGCCACCATAGAGCAAAGTGTGACGGGGTA TTGACAGGGCCTTTGCAATGTTGCGGTTAATGAGGGATAGTGGGTATCCA CGAGCCAGAAAAACTTTGGTAaggaaattcagtttttttgttAGATTACG CACACTGCGACTCTGAaacccagacggtgtcaatcgaacaacttcgaacg aAAATTGCAATCGAcggtaatcgaacgcgatcgaataattgctaTTCGAT TGTAGAacgcaatcgaatttcaatcgaacGACCGATTCCTgtgtaatatt cgattgtgttggATTGCGTTTGAATAAATTTCGATTGGTTCAATTAAATA TgatcgattgcgttcaatttatTCAACGTTTGATCCGTTCACTTGACACC GTCTGGTGAAACAAATTCAATCAAGTAAACAGGAAACATTGAGAGAAAAT CAGTGTACTAATTTGTATAGCTTAACCAGCCTTGACTTGAAGGTCTCGGA CCAGCTTGGACCTTACAAATTAGGGCAAATATACATGAGAATTCTCTggg tttgtgtgtttttaccaCTGAAATTAGTACAATGTACTAACTTCTCAGCG TGTATCAGTTCAgaacaccaccctttttagtacagtgtactagctttttc aatgtttttttctcagaggaccacccttttagtacactgtactaactcaa tttaacctaaaaaatacaccacccaaccagctatgggccagtacactgac tcgGTACCCTGCCCCCCTGAGCCTTGTCTTGACTGAGACTCTATGTTCTC CCCGTTAGGAAGGATTTAAATCCAGCAGAGAAGTTATCCACAAACATCCA CAAAATTTTTTGCAGAAGTATTGAGTGGTCAACCCAATCGAATGCTTTAC TGAAATCAAGGTAGATGACATCTACATTGTTGTCATTTTCAATATGATGG ATTagctatttctatttctatttggttgagttgcaggaggctttgaggcc tattttcgcaactatagacgctttcaatgagcgccccgtcagcaccttgg actaactacccaattcccctcacgtggcatgggttgacccgggcgaaggt tcattcacttgccaagcgaactgctgcgagtgggaatcgaacctcagtca cCTGTGTAACAACCAAGGTcaataaccactataccacagtgCCTTGGCCT CAGCATTTGGCTGAGGCAGGATCTTCCTGCCCTAAATCCATGTCCAGTTT AAATTTTTCGAATGATAATAGGTCATATAATTAAATTGTCTCTTACAACA CAGCCGTTACCTagggacaagataatttatcccaTTTGTACTGGCTGAGG aaaagtaatttgttattcaatagactgtTGTGTTCTCTTAAACGACTATG AAAACAACAAacttttattgcatttttttattgcatttctcgcgattggc tttatatttttttctgattttttacacagtaaTGCTGATGGAGcccaatt ttttgggcaaatttgtgtcaaaaagtgcctaacatgggttttttcacctt ttaatTTATCGTCAATAGGGAAATCacgctaaaatatttattcaccctaa aatatttattcacccTCGTATCTACGACTATAAGTCATACGACTTAAACT ATACTTCGCAGGTCGATATTAatttgagctgtgatactcacagtaatcta ttcaagctgctcactacacttttttactctcttgctatttgtcctatttt tatctaaGTCTcattatcaggtaggtccattcagcatgttgcttgttaat tCTTGAAAAGTTATGCTTTtgaatcttttcaaaatcaaatttatagAAAT ATTATTGTCAAAATCTCTAACAAAACCAGAAAAGATTTGTTCAGAAAAAA GGAAATGGAATAAGTTGAAGACTGTAGTATACCAGTCATACAAAAGACTG AACTTATATTTTACACACTTTCTACAAGCAACGAGCCTCTTATTTAAGTA AAGACAAGATGAGGTAGATTTCTTTTAAAATTTGTTTATAACAGAAATAA CTACAGGAAAAGACAACACACCTTAAAGGTTTTCTACAGGAATAAAAGGA GCTTATTTTAGGCAGTGTCTTCATGCTGAGTCAGATAAATAAAAGCTACT TTTTTACGCAACGATATATCCTGCAAACATTCTATTGCTTTTGTAAACAA AAAAATGGCAAAGTTGATTTCGAGCAAATTTACAATCGAATGTTTTGATT ATAAGATAGAACACGTTCTGTTTATTATAAACATTCAAGTCCCTTATTAT TTGAGATATGTTTTTTTATTCAATGTATTTTCATTTTTTCAAAACCTTTT TCTAATCTTGTCGCACTTGTTTTTACTACATCAGCATCATCAGACCTTTC AATTAAAACAAAACCTTTAAATCCAATTCAGATGAACCTTGTTTAAAGGG GAAGATTATAAAGAGACAGACAGCAAGAGTTTATCAGCTTACTAGCAGGA GTCATAATGTGAGTGACGTGACAATGTAACGAGTGTTCTTTAACATACTT TTGCTTTTACATTGGGGTCAAGTAGGGTTTTAAAAGGTTAAGGATAAAAT GCCCCTGATATATGTTATGCAACTTTTTGTTATATAATACCAAGATTTTA AAGTCAGCTGATGCTAGGGTCACTTGGGTCAACTGAGTTTAATGATTGAT TGATATAATTCAAAAGTTATAAATGCCTTAGAGAGCACAATTTAGTTTAA CAGTCTTTTTAACTTTTGTGATATTAGCTTGCTCTGAAGTTTTGATTTTT ATCAAGTTCAATAGCTCAGTTAGCTCTAAGTTTAACGACTGATATTGATA TTATTCAAAACTTATAAATACCTTAGAAAGACTTTCCAATAATAATGCTC TTCGCTTAATTGTTAGACTCTTAAGCTTTGGAATATTGTGGTGATTTTCG TGAATTAACCTCGAATCTGCGAAAATTTATGTTCTCGATAAATCAGCATC AGTGATATTTTAACTTATTTCGTTTCCATCATTAAATTGTTTTGAtactt cgaatctttttggttttcaaaacattgCGCGCAAAATTCTTTTGATAGAC GAGCTTTTCTTTGTATTTAAAGAGCGGCTTTTTTGTCGGGTGGTCACTAA TTAAAGGCGGCTTTTGTGTAAGGTGTGAAATATGTCTGACTCATCTTTGA TAATTAAATGATATAATTATTGAATATAATTATAGTTTTGCTTCTTTTGC TCATAACAAATTTATATAAAATGAAAGTGTTCTTTTACACTGATTACGTA GAGTGATGAGccacgtaacgtttcaaaacaATGAATTACTCTATGTTTCA GAATAGAAGAAAAACAAGAAATCACAGGTTTAAAACACTGTCAATGTTTG GGACACCAGAGAAATTAGAAAGCAGACGTAATCACATTACCATCACTTGT GATCAAGAGACTGGATCGAGTCCGTATCATANctcttaagttgttcttat tttttggcatttttgagcctcattgttcttataaaattgttcttataaaa a
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_007478XLOC_007478Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00013382-exon-sc0000167-1491911889:251537..251661TCONS_00013382-exon-sc0000167-1491911889:251537..251661Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00013382-exon-sc0000167-1510915933:251537..251661TCONS_00013382-exon-sc0000167-1510915933:251537..251661Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00013382-exon-sc0000167-1575043694:251537..251661TCONS_00013382-exon-sc0000167-1575043694:251537..251661Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00013382-exon-sc0000167-1491911889:272088..272287TCONS_00013382-exon-sc0000167-1491911889:272088..272287Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00013382-exon-sc0000167-1510915933:272088..272287TCONS_00013382-exon-sc0000167-1510915933:272088..272287Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00013382-exon-sc0000167-1575043694:272088..272287TCONS_00013382-exon-sc0000167-1575043694:272088..272287Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000167supercontigsc0000167:251537..272287 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0 0.64879 0 0 37.6396 34.5157 3.26229 6.56771 5.35846 11.7715 4.25021 6.83147 1.72643 1.19077 2.27749 1.68993 3.13322 4.26168 0 0.757039 0.234489 0 0 0 3.61812 3.62403 0 0.733698 0.482893 0.855682
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00013382 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top