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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00012566 ID=TCONS_00012566|Name=TCONS_00012566|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1455bp
TAATGAAAAATAGGACAGTATTAATATTTATTATTACGGAAGTATCTCAA
ATTTCAGTAATCTAATTGGTCTGTGGGTTTTTTGTGACATCATTGTGatc
tttcaaaaattatctTCCCCTCGAAACAAACGTCGAAAAGTGCTTTCTCA
TCATCGATTTTCATGATGTGCATAGAGTTCTAGCGGTCGGTTTAAGATGT
AACATAAGCCTTAATTCGTAAACCAAAGAAAACTGCTGACAGCGTGCAAA
AATTCTTGCACAACTTTCACAATTTTCGTAAACAAAACTtccttctaaaa
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ACAGCATATTTAAAGTCGAATCACAATCTTGATAGAAACTCAAACAGAAA
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GTTGTCATTGCCTGATTTGTATTAGAAATGACAGTTTACATGGCAGCCAT
CCCTTTTAGTTGGACACTTTCTTTATAAGTTTAAAGACTTCGTCGTGGTT
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TGTTGTTTTAGTTTTCAATACAAAGGCTCGTCAACAAAGCTTTTTCGAAA
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GAGCTCGCTAGCGGACTACTCTTAAACTTAGCTACGATTTCAATATTGCA
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TTATT Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000145:293123..303509- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00012566 ID=TCONS_00012566|Name=TCONS_00012566|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=10387bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000145:293123..303509- (Clytia hemisphaerica)
TAATGAAAAATAGGACAGTATTAATATTTATTATTACGGAAGTATCTCAA
ATTTCAGTAATCTAATTGGTCTGTGGGTTTTTTGTGACATCATTGTGATC
TTTCAAAAATTATCTTCCCCTCGAAACAAACGTCGAAAAGTGCTTTCTCA
TCATCGATTTTCATGATGTGCATAGAGTTCTAGCGGTCGGTTTAAGATGT
AACATAAGCCTTAATTCGTAAACCAAAGAAAACTGCTGACAGCGTGCAAA
AATTCTTGCACAACTTTCACAATTTTCGTAAACAAAACTTCCTTCTAAAA
TTTGAACTTCGATCATCATCATCGTGGGACGTGCTTGGCCTTTTGACTGG
ACAGCATATTTAAAGTCGAATCACAATCTTGATAGAAACTCAAACAGAAA
AGGAAAGAGATCAGACGAACGTACACGCAGTTAATTTATTTTTTTCAAAG
ATGTCAAGTAAAAGACCTCAATACTGGAAACCTGAAGATGAACAAATTTC
AGATAAAGACAAATTTGTTTCAAAGATGAAGAAAGATCCCTTCATTCCCA
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AACGAAAAAGAAGTATTAGACTTCATTCATGGTTTGTGTCATTAGGTCAT
TATTGAAGCTCTTGAAAAAATTAATGGGTTGGTCAGCGGGTAGCATTAAG
TTCTAGCAGTGTAGACCTAATACTTCATATATACGGGAAATGCATTTGGA
CTTAGGCGGCAATCACAAATATCTTCATTTCGCGTCCTCGTTGGGTCGAA
AAAGTAGGGTGGACAGGCCAAAATTTTCCCCTCAATTTTTAGAAACCAAA
CCAATTTTATTTGAAAGTCCTTACCTTGTGAAAAAAATGAGGGGTCATTT
ATAAGAATTGGTTAAGTATTCCCAACAAAGTTATTCCATTTTCAAAATAC
AAAAAAATCACCTTTTCAAAGAATCGCCNCAACAAAGTTATTCCATTTTC
AAAATACAAAAAAATCACCTTTTCAAAGAATCGCCTCACTACACCACGCC
AGCAAGAAATAATTTTCGGAAGCACCAAAATCGCGCCAAAAATGGCGGAT
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GTCTGAAAATCGGCCTGATGACTGTTAAACTTTAGCTTATCACCAATGAG
CTGGAAATGATAGCTAAAAACAAATTTCACCACTAGAAAGCTGAAATCCT
CAGCTTTCAGATAGTCTAAGGTGCTTAAATGAAAAAATCTGCAATCTTGT
TAAAAATCGCAATTTCTTCTTATTTTTCGAAATTCCAGACGGCCTGTAGA
TTTTCAAATAAAGCACTTTGTGATAGATTGTAGCCTAATCTTACCCTGGG
TTTACTAAAAAAACCGCGATTGAAAAGATGAACCAGCTCAATAGCGACAG
CCATTTGTTTCAATGTGGGTTGAGAATTTTCCGCTGCCGTGGTCAGCGCT
AAATCGCGTTTTCACCTTGACGTCGAAAAACATGAATATCTTTAAAAAGA
AAATAGATACCTGGATGCATTTTTTTTACTTGTTTCCCTGATAATTCCTG
ATTGATTTAAAAAAAAGAATGAACAGATTTGGATGATTCAAAGGTAAGTA
CTAATGCATTGAAGTTCATTTTTGTTAATTCTTCCTCGTTCCGCGCAAAA
AATCCCGACGAGTGCGCACCCTAGAAAAAGTGAGTCGGTAGGTCGGTCGG
TTGTAAAAATGTTCAGGTTTTCTTAAAATTGGACCCAGTGAATTTCTTCT
TCTCGTCTGACCTTAATAATCCATTTTTGGAGTGTATTCTTGAAGGAAAC
TGCCAGCCAGCAGCCAAAACGACCGTGCGTTACGGGTAACCACAAATTAT
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TTCTACTCAATTTTCGAGAGTGGGTCGGGCGACGACGCGAAACGAAGATA
TTTGTGATTGCCGCCTTAAGCTAAATAAAGTCCCACAAAAGCAGGACAAA
AATCAGTTTTTCAAAGTTTGCAAAAAAACGCCACATAGTACGTGTTTGGT
TTGGGAACGCAATGCGAAACAGGAACGCGAACTACCCATGTCTAAATTTT
TCTATATATCTCTAGAACTAACAGACTTTTTGAAATTCTGTAAAAAGGTC
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GTCAAATACTCGTTCATCTATTTAAGATTGAAGACAAAAATTTGCGAAGA
AAAATAAACCTCGAGCACAAAAAATGCTTTTTTAAACACTTTTTTCCACC
GAAAAACAAATAACTTTTATAGACTTACCTTCCCCAAACGTTGAAGAAGC
CTCTACTAATTAAAGTAAATGAGATAAGATAAGATAAAACCTTAAAATCA
ACCAGAATTTACAACCTTTTGTCCAAAGCAAAAGACGTGCTTTTCTCGTC
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TTTTTTCATCCAATCAGATCGCAAGATTTCACTTTCGCTTTCTTTTAGTC
CAATAAGACTGCGGGATTTGAGTCATGCAGAGTCATGTGACATCTTAATT
GAAAAACCTGCACGGAATAAAATATAAATACAGGGGTCACACTATTAGCT
ACAGGAACTGAAAGCAAACATTTAAGGCCAATATTTTGGGTTTTTCTGAA
GGACAAAAGGTATAGGAAGCTTTACTGAAGGAGGGATAACCGCTGGGACT
ATCTATTTAAAAGATATGGACAAAAAAAGGCACTTTTTTGGGTGATAATT
AAGATTTTACTTAGAAATTTTAATTCTCTTACCCCNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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CTCGACGAAAATTGGAAAAAGCAGGTTTTTGAATGTTTCTGCTCTTAAAG
TGCTATTTTTTGGTAAAAGCTATGCAATTTATGTTTGAAACAAAGAAGAT
ATGAGAATGCAAATTTTTTTAAGAATAAAGCTGAGTAAATTCTCTTTAGT
TTAAAAAAAGATTTGATGATCTTAGCTACTTTCTATGGTAAGATGTTTCA
CCCCAAACTTTATTTTACTAAAATTGTGAATTTGTAATATTCATCATGGG
GCCCCCCCAGCGGTTTGCGTGAATGCGTGAATGGGCATTTTCGGTTGCAT
GAATGCATGAAAATTGAAAAAAAAATGCGTGAATGTGTGAATTGAAAAAA
CTTGCGTGAACGTGAAAATTCACTTTTTGATTGCGTGAATGCGTGGATCT
GGGCTATTTTGTGCGTGAATACGTGAATTTTCCCTTTTTTCCAACAATTA
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GCTTGATTGCGTGAATTGAGGGTCCGCTGGGGGGGGCCTCCATCATCGAG
GGTTGATAAATTCAATAACCTACAAAAAAATAGTCAAAAGATTCACATAA
AACACTCCAATAATCAAGCGTTCAAATGTTTCTGATGTTTTTCTTTTTAA
AACAATTTTCTTAGTTACTTTGAGTCATAAAATTTTTTCATGAAATTGAC
AATAGATTTATTCTAATAAATTTCTTTGATACAACAAGAAGAGCGACAAA
AAAAATCAAACTTTGAAAGCATAAATTGAAAAAAAATCTACCATATATAT
GTTATATCAGGAATTATTCAATTATTCAATGGCTGTTTTTGCCTACAGGT
ATATAATAATGATATAAAATTGAATCACAAGTGTTCAAAAAGGCTAAACA
ATGGAAATGCGTCAACCCGTTCAGCTGACCAAAATGACACAAAAATCGCA
AAATGGTCTGTCAAGACTTAATTTAATATATTTTTGTTTGGTAAAGCAAA
TCTTGACAAGGAATGGATAAGCTTTTTATATAGCCAAAAAGAATTACCAC
AGCTTTTACCAAGAAAGTTATATTAAAGGTCCAATTTCAGCCATTTTCAG
CCAAATCCAACTTTTGTTCTTGCTGGTGCTTTGCGGAAACTTATCCTGTC
CATGTGTAAACATTCCCGTATGTTTCTGATGTACCGGTTGTTAAACCAAG
ATAAGACGGGTACTGTAATAAATAGTTATACAAGAAAAACCATTATTTCC
ACCTCAAAAGGTGACTTTCCAATAACTTTTGATAGAATTGTTCCCCTAAT
TTCCCCTTTTCAGTAGGTCTTCCTCTATCTTATGTGCTTCAGCAAATAAA
AAAAAAACCCTGGTCGAATCTTTGTATTCTTATCCTATTCTTTGCCACGG
TAAGTCATGTGACATCTTTTTCAACCAATAAGATTTAATAATTTTGAGAG
TAAAACAAACACTACTTTAACTCACTAAAAGATTATGTTTAATGAAAACA
CATATTTAATCTTCAGTAAGTGTTCTGTTGTACCCCAGTTCTGACGTCAT
GCTGTGGCGAAGAATAAATATAACAGAACAGCCATTCTACAGAAATTGCT
GTCAGGTGACTTTTTTCTACTGCATGATACAAATCACACATTTTCATTGG
ATGTTGGAAATTTATTTTTCACATGACAAGAGACGTTTTCTCGATGTATA
TGGATTATGGAGAAAAAAATCAGTGATTTAAAGGTTTTAATTATTCCTTT
TTCTTTTGCCATGTGTACTAAAAGATTCTACAATGTTTGGGGCAATTTTA
GAAAGTTGCTTGTGAAAAAAAAAAGGTTGTGAAAAAAAAGTTTGTTGCTT
GTGAAAAAAAAAGTTACTTCATTTTATTCACAATTGACTGTGAATTATTT
TATACAAAAACTTGTATAATATAAAATCTTGTGATTGGCTGGTCCTTCCA
GCTTTTTGATTGGCCAATTATGTACTAGCTGTTTTAAATTCCAATTCCAA
TCTTTAACTTTTTACTTACCATTCTAACAAATTTTGTTTGAAACTTTGAA
GCTAAAATTGAATGGGATACAGAGATTTTCTTCTCTTATGATCAACAATT
TATATGTATTTCCAAAATTTCGTGTAACAATAAACACTTGACATACACTA
AAAAAAATTAGTAAATAAATCATCTTATGAGCATATTATTCTCAATGTTC
GATATGATATGTGTGTTCTTTTTTGCACCAATGACCAGTAAAAGTATTTC
GTAAAAATAAACGAAAATTGCTTATAAGGTGAGCAAAAATAAACACATTT
GTCATATTATGTATATTTAGTATAAACATCATTGTATAGTATACAGGATC
TAGAACAAGGTGATGTGGTTTAATTACTTCAGGTTTGTACAAGTAGAGGA
ATGAAAAAGCACTTCCTACAATGCGACCAGGGTAAACGCTTATCACATAC
AAAGTAATAAGGTATTTTAATATGTGTAATGCTTTTATTTTCTTGTCCTG
TGATTCTTGGTTGGTGAAAGTTTGTTGTATCCTCTTTGAGATTCGAGTGT
AAAAGAAGACCATAAGAACAACTGGAAGCACACAATCTAATATTCGTTCA
CCAACAATAAATGCTACACGTTCACCTTTAGTTAATGAATTATCCCCAAA
AGTACATTTGATTTCCAATCTAGCTTTGATCATAGTGTCCATATTCAACC
CAGTGAAAGATAAATACAAAAACACGATCACGAGGGTGTAATTTCGTTTT
GTGATTCGTCTTTTGAACGGATTCATGATTGAATAGTATCTTTCAAAGGA
TAAAACTACCAGAAACCAACACCCCAACATGGGTAGTACGTAAAAACTGA
ACGGTCTCATAAACCGACATGCAAACTCACCCATCGGCCATACAGGCTGA
AAAGTGAAATATCGAAATAATGGTATTGTAAGGCAGTTCAGTAGATCCAC
TGTTGTTAAATGTAGCACTAGATAATGATATGATGACATTTCTCGTAGTT
TGTCTTTGTTGATGACTATGAAGTATACAATGACCAGGATATTACCAACG
ATTCCAATGGAGTAGAGTGGTAATGTGATGAAATTGTACCATTTGTTTTC
ATCGTGTTCTATAGTTGTAGAGTTCATCTTGTATGTTTTTCGCTTCCAAA
TGTCCTCTTTTTTTAGTTTCCTCCACAGTCTTGTATAAGTCTATTTTTCT
AAACTTATATCGATTGACTTATCACCTGTCTTTTAAATTTCAAAAGCCTA
GCCAAGTGTCGAGGTCATAATATTTCTATCCTTTTTTTGTACTGTATTAT
TTTGTTGCTCAGTTCCTGTTGACGTCTGGCACCTGTTTTAATTTCCAAGC
AAATACTACTTCTTACTACTCTTCAATTTAACTTGATTACACCTAAAAAG
AAATTTTGTTTTTATATAATTACACGCTTTTTCTTTTATTAGAACCCAGT
TTATAAGAACATTGAGGCTGAAATTCGTCGAAAAATTAAGAACATCGTAA
GAACATGCCCAGCCTCAGTTTGGAAAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAGCCTCAGTTTGGAAAAAAATGACAA
GAAACTACAATTTTTCCTCTTTTCAAGCAGTTTTAAACAAACTTAGGAAT
GGATTTTCTAAATCGAGAGTCAAATATTGTTCAAATTTTACCAATTTTAA
GTATTTTGCATGATATTGTCGATTTAGAGTAGTCTGAAAATTTAAGAACG
CACCTAAGAACATTTCAGGCTGAAAATTGCTAAAAGAATAAGCACATCCA
GGCTCAGCCAAATTTAAGGTGTTCTAATAAAAAAAACGTGTATTAGTTTT
TGAGAGTAATAAATTCGAGCCCTTCGTCCCAAAAGACGATAGTGATTAAA
TAAAGCCGATTTACAAGCAGGATTCAGTACATTTAAAAAAAAGTAATTTC
GTAAATTTGACATTGTCAGTGTTCTCAATTCAGTCTGTCAGCTCTGTCGA
AATTCGATGAAAAGTAGCTTTGATGAAAACTTTTGAAATGGAATCGTAAT
AAATGTAAACATTAGATATACTATTGTATTTGATGTTTATTTAATCTTGA
ATTCCACTGATCAAAAACATCTCAAAGATAATCAGATTGTATCAAGGGTC
TTCCGACCACTCTAAATCAGGGAATTGTAACTTGATTTCACTATCATTGG
CAATGACCTATTTTTTTTTAACTTGTAGTGTACTGAATCTTACTGTCAAA
ATAACAAATGAGTTTACTTTTATCACTTTTCAATTCCATTTCGATCTACT
TGTAACCGGTTCCCTTTTAAAACTGAATATTGTTTTGTTAAGGTAAACAT
TTACCCTGTTGAAGATGTCCTGGCAACCGTGGACATTTTACTCATAAAAA
TGCTTTCTACCAACTATGAATTAATTGACACCTGCTTTTGCAATTGAAAG
TCCAAATTCAGCGAAATGTAACAAATTAGTATGTGTTCTTTCCTTTTACA
ATAATATTCCGAAACCTTTAATTAGAGACATAACGAACAACTCCATTCTT
TGCAACTATGTCTTAAAAATTTACGTAACAAGATTAAACGCCCACGCAAG
CTAAAGATTCCAACTCCACTTTAATCGGTGGACTGTACACGTCTCTATTA
TTATTACTTTATCTAAATATTTGTCTATCATTTAGCACGATTAACAGCAA
TGTTTGCAAAAGAAATACTGAATGATGTACTGCTATAATAAACGTATCTT
TATGACCATTTCGTGACAATAATTTTGCTCTTCTGTATGAAAGAGAATTA
ATTTTTAGGCCAATCGTGCCCTATGTCAAACATTTTATTCTTTTTGGATT
AACCATTCTAGTCTTAGGTCAATTACCTTATAACACGAATATTACTAGTC
ATTTTTATTAACACGAATTGAAAAATTGCGTGTTAATAAAAACCCCCTTA
CTTAAAACCAGCCGTTGCTTCCTTGAAAAAGCAGAAAAATTCGTGTTAAT
TTCAGATTGTGTTAATTTCAAGGCCGTTAAATACTTGCCTAGTAATATTC
GTGTAATAAGGTATTTAACTCCTCATACAAAACATTCATCACACAGAATA
TCATAATTGGATGGTACAAATTAATTGTCAATTCTTTCTTTCCAAAAAAA
GATCTTATTTGCCATGCTTTTAATGAGTCGCCATTGATTTCTGTGGTTTT
CCTCGAAATTCTCTTTTTTAATCCGAGAAGCTCCATATGTCCTAGAACGA
AACACAATTTGTAGATTATTGAATTTGATTTCAAAACAGTCTGTTGTTAG
TTTAGTTTTCATAATGTTGGACAAATCCTTTAAAGGTTATCCTAAACTTA
ACTGTCCAGCACTACACGTTTTTTATAAGAACACTATACAAGACTTATGA
CTTCGATGGCCAAAATATTAAGAATATGTTAAGAACATTCAAGGCTTTGA
GAAACCCATAACACCCAATTTTTTTAGCAGATTGCACAAAACTCGTAAAA
TGGTGAAATTAAGAACATTTCAAAAACATTTTTAGGCTTAAAACTCATTA
AGTTACGAATATTCGAAGGCTCTAAAAATGTTAGACGTTCTTATAAAAAA
CCTGTATCTTATATCTCTCTAACACTATTTTAATGTTTAATTTTATGTCA
GAAGTGTAAGACCTTAAAAGAAACATGGATTTATTGGAGCCTCAGATTCG
ATTAAGAGCTTTTAGCACCATCAATTTTTGTTTGAAATTCTTAATAAAAT
GACGGCGAATGTGACAACCCACCCAATAGTTGTTTTGGAGAACGCGACGG
CCTATTGAATAACTAATTACTCCACAACAGTTACCTAGAGACAAGATAAT
TTATCACTTTTTTATTGGCTGAGGGAAAGTAATATATGTGGAGTAATTTG
TTATTAGATAGGCCGCGTTCTCCAAAACAACTATGAGAAAAAAATCTTTG
CAATTGAGAGAAAATGTTTTTAAGGAAGTCTGAAGAAATATAGATCGAAG
AATAGATTGAATATTTGATAACTACTTTTGATAATCTCAAGATAGTCTTC
TATTCAAAGTATTGCACCAAAAATGAAATAGATTCGTCTATTTGTAGACA
TGTAAATTTTAGTAGAAATATCAATTCTTCATGATAGAGAAAGTTTTACA
ATGAATCTGGATACATTCTGTTTTAAATTTGTTCGATCTCCATATCCTTC
CCCCATCTTATGAAATTTTCCGTTTCATTTTCCAGGATTTGCCGGTTTAT
TGGGAGCCATTGGTTACGGAGTATACGCTTACAGGACCAGAGGACCAGCC
ATGACGACAAGCCGATATCTAATGAGATTGCGTGTCATCGCTCAAAGCAT
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AAGACAAGCAGTAGATTCTAACGCTCTTCAATACCTGTGGAAACATTGTT
TATTCTTAGTTGAGTGGTTTTTGCCGTGGTTGACTCAGACTTTGAAGATC
TATGAATTCTTCTTCTACGTAGTTTGCAGTTTGTAGTTCCCGAATTCTTG
GAGTAGGCTTTCGATTTCAAACTTTTTAACTGGTTGTCATTGCCTGATTT
GTATTAGAAATGACAGTTTACATGGCAGCCATCCCTTTTAGTTGGACACT
TTCTTTATAAGTTTAAAGACTTCGTCGTGGTTTATCGAAGTGATAACACG
CCATAACCGATACGCATTTTGACAAGACTTCATGTTGTTTTAGTTTTCAA
TACAAAGGCTCGTCAACAAAGCTTTTTCGAAACAATGCCTCTGTCGACCG
TATCTCTGTGGAGCATGTTTAACTTTTGTAATGAGCTCGCTAGCGGACTA
CTCTTAAACTTAGCTACGATTTCAATATTGCACTAAATCGATTTAGGAAT
AATTATTATTTAACTTAACACTGCACTTTATACAAAATCTTTAAGATAGT
TGAAAAATTTCTTTATTTACATTTACGATAGAATATTACTTTAAACTATT
ATTTTGAAATGTGATATTATTTTGATATATCAGAACATTTAGGAAAAATT
TTTATCTTTAAATTTAAAAAATTTAAAATGTAAATATTTTAGTGTGAAAG
TCGACAAATAAAATAAATTTTCAGGCCTGAAATTATT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00012566-exon-sc0000145-1575043694:302957..303509 | TCONS_00012566-exon-sc0000145-1575043694:302957..303509 | Clytia hemisphaerica | exon |
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| TCONS_00012566-exon-sc0000145-1510915933:293123..294024 | TCONS_00012566-exon-sc0000145-1510915933:293123..294024 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00012566-exon-sc0000145-1491911889:302957..303509 | TCONS_00012566-exon-sc0000145-1491911889:302957..303509 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00012566-exon-sc0000145-1491911889:293123..294024 | TCONS_00012566-exon-sc0000145-1491911889:293123..294024 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000145 | supercontig | sc0000145:293123..303509 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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