TCONS_00012186 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00012186
Unique NameTCONS_00012186
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length1120

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00012186 ID=TCONS_00012186|Name=TCONS_00012186|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1120bp
aaaacaatcgaaatacattctaaaagtcctagatcactgggctatccacA
CTTCGATCAACCTACAGAACTCCGTCTTGTACACTTTTGGTCTATTGGCT
AATGTTTgtgtgtttttgttttcaagtaatgatcaaaacaaaccaataaC
AATCACAGgCTTCTTTGATGGGTTTTCAATATACACCTGGCTCATTGTTT
TGACGCAGGCACTGAATGGACTTCTTATCTCCCTAATAATGAAGTATCTC
AGCAATATCGTGCGTCTATTCATGATTGCGTCATCTATGCTACTGACCAC
ACTTCTATCAAGTGTCATCTTTGGTTACAAGCCAGATATCTACTTTGCTT
TGGCCTTTCTTTTGGTTATATTCGCCCTCTATATATATCATTTTGATGGT
TCACAATCTGGTATCAAAACGAACAAGAAAACAGTGAAAGACATTTGAAG
ATGAAATAAGAAGAAGATAATTTTTATTGGAGCTTTAAAAGCTGATGGAA
GAGGcccccaagcggttttcgtTAAGACGTAATAGCGACTTTTTTGCAgc
gtgataacgtgatttggaatttttttcttcgtgattgcgtgatgagaagt
caaaacgtgatcgtgatttgaaaaatcACCACCCCGATACACGAGttaga
ctttttcaaagggatgcgtgattatccaagttttttgttgttttgtctga
tcgtgattgaaggcaaaaaattgcgtgagatatcgtgatcagagttaccg
ctgggcTGGGCCTCTATGGAACACGGTGAAATAAAGGAACATGAGAACAG
GAATGACCCTGTGGATATTGATTGTACCGAATTTTAATACTGTAATGAAC
AAAATGATTTATGAATTAGAtatttttctaaacattttatatacatttat
aaGACTTATTTAtttgcactttttttatcaaaagaaaaatctattcgtcc
attcaaagaaatttatgcatgatttttcatttcattcacCTCAAGTAATT
TAACAGAAACTCCCTTCGCCACCTATCGCTTAGATATTGGGGTATGCCAG
TAAGACTGTTGATGTTCTCACCCttataaaattggtaaaaattatatttt
gtatttatcgTGTAAGCCTT
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000141:74409..84840-

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00012186 ID=TCONS_00012186|Name=TCONS_00012186|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=10432bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000141:74409..84840- (Clytia hemisphaerica)
AAAACAATCGAAATACATTCTAAAAGTCCTAGATCACTGGGCTATCCACG
TAAAATATCTAGCATTTCATTTGAAGTTGTTTTTTGTTCACTCAAAGCTT
TTTTACGTCCACGATGAAGAGGGGAGAAGGTTAGAAATCTTCAAGGATTG
ACAATAGATATTATTTTTTCTGGCCAGGATTGTGCCCTTTTTCGGTATGA
TCAGAAAGGTCTGAGAAAAACATTAATATCGTTAAAATTCCATTGTATTT
ATGCTAAAACTAAAAACTTTGCAACATGAGTATCTTGACTTTGGAAAGTT
ATCTAGCATTTGGATGGTTTTTCGTAGGAGGGTCACAAGACCATAGAATA
AATCTACAGGCCAAAGATCTCAAACAATCTGAAAATCCATTTTAAGTGAA
AATTGGTTCATTCATTGAATGGCTCTTTTTATTTCTTTCCGACTATATTG
ATAGAACAAATGTGGCAAATCAATGTCATCAATGTCAATTGAATTCTCTA
CCTGGTCAGGAAATCCCGGCTAAAAGGTTGAAGTTCATTTTGTTTTGGTC
ACGTGATCGAAACGCATGGGTAGGTTTTCGGCGGAGGCGAGTCTGCTACC
TTAGGACTGTTCAAAAAAGTAAACATTACCTTTTGTTTTTCATGGAAACA
AGATGGCTGAGCACCTTGGAACTGAAATCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTACCGTCTCATTCCTGAAAATATAGCATC
TTAGCAACCCAAAACCACCATCAAATATTTTTCACCTCTTGGGGGACGCA
GACCCCCCAGATCGACCTGGTCTATTTCAAATACTGTATATCAGCAAAAA
ACATATTTTATAACTAATATCTTTTGGGAAAGAAACCTGTTGAATAACAA
GAAAAGTATTTTAACTTTATTCATAAATGTAATATAGGAATGTTTAATTA
GTCTAAAAACATGCAAACAAAATAGACTTGAAACTTATTACAAAGATCAT
GCTATTGTTAGGGAATTGGCAAAAAACGATGCTCTACATTTATTGGATGA
GAAGCAACAGGCAAAAACAGAAAAAAACTGTGATTGGAAACACCGACAGA
ATGATTCATATAATATTATAAACAACTGAAGAAAGAAAATTCAAAATCTT
GAATGTGAACCGATTAAGAACTTCAATTAAAAGTAAAAAAGAAGGAAAAA
GGACAAAGCTATCACTGGGCATGTAGTCTTTTTATTAATTCTACTTATTC
AAAGGACAAAAGGATAAAATTTCATTTTCTATCTATTACTGGACAAAACA
TTTAAAAGCAAAGTCTTTTTAAAATTTGACAAGGACAGAAGGACAGAATT
CATTTCTTAATTTGACAAGAGGACATTGGCAGAAAGAAAAACTAAAGAAT
TTATTATTTAAGCTCAAAACAGCAGCAATGCAGAACAAACCAACCCGAAA
ACTCAAGAATTTATTATTTTAAGCTTATTAAAACAGCAACAAGACAGAAC
AAACCAACCCAAAAAATATTAAACAAAAAAGTTAAAATCTATAAGCGGGA
TAAAAAGGTAAAGTTACTGGCGAGAAAACAGGAAGATGAGCAGGAAAAGG
TACCGGATACATTGGTTGTTGGTAATTGAAAATGCCAGTTTGAAAAAATT
GATGTTGTTGCTGTTGGAAGGATGGTAAGCTTTGACAGATGGTTGGAGGT
TGACAGATGGTTGGAGGTTGAAGGATGGTTGGAGGTTGATGGATGGTTGG
AGGTTGAAGGTTGAAGGTGGAAGGTTGATTGGTTGGAAAACTATTTAAAA
GGGTACGTCGGGCTGGGTAATGGCGGTGTAACGATGCTTTGTTCTGCTTT
GCTGCTGTAATGTTTTTGTAACGGTTTTGCTTGAAATTTTTCTTTTTCCA
GCGTTTACAATTATTGTTTGTTTTAGTGTTCTTTGTTTCTGTGTCCTTCT
TTTTGTCCTTGTCTGTTGTTTTGTTCTTTGTTTTATCGGTGTCTTCTTTA
TCCTCAATGTCCATACTTACTTCTGTTTCCTTTGGGTTTGACAGGCTCAA
TTTGTCCATTAAATCCTTGTTTTTTTGTTTTAAAACTGCAATTTCTTGCT
CATGAAGTTTTTTTTGTTTATTCTGTCGGTGTCTTCGTTGCCGGTTTTTT
TCTGTTTTTGCCTCTTTCTTTTCGTCCAAAATAAGGCGGGCATCATTTTT
TGCCAACTCAAGGTCGAAAGCACAATCTTTGTAATACAACTCGAGCATTT
TATTTATTTTTTGCTGTAAAAAGAAAGAAATTGAAGTAATTTAAAAGGTC
AGAACTTGACATTTTTGAGCTCAAAACCTGTGTTGCNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAACAAACCTACTCCTTTATATTGG
GGAGAACCACGATAGACAGGACAGCCAGGGAAGACACATCCATCTCCATT
CACCTTCACCATTTTTTTCTATTTGAAAAAAAATTGTTTGTTTTGATATT
TGGAAAAAAATGTTTTGTTTATGTTGTTGTTTGGGTGACNATTGGGGAGA
ACCACGATAGACAGGACAGCCAGGGAAGACACATCCATCTCCATTCACCT
TCACCATTTTTTTCTATTTGAAAGAAAATTGTTTGTTTTGATATTTGGAA
AAAAATGTTTTGTTTTTGTTGTTGTTTGGGTGACTAATTATTTTTGTCCG
AAAGTATGTTAATAAATTATAATAATTGAAATAATTACAAGTTTCAGTCC
TAAAGTAGCACCTTCGCCTCCTCCTTCTCCGCCGACTTTTACCCATGCGT
TTTGATCACGTGACCAAAATAGAAAAAATCTCAACCTCGGGTCTCGCGCA
AACCCGATTTCCTGACCATGTATTTCTTCAATTGACATTGATGTCATAGA
GTGCTCGATCAGTTCAAAAAACCAGAGCCATGTATCAATATTTTTAAAAG
TTATCTTCCATTTAAAAAAACTAAATAAAGTACATTACTATGAGTTTCGT
GCTTTCACACTAATCATATGTACAATAATGATTGAAAAATCTGAAATTCG
ACGTGAAATTTAAAAAACTGGATAATTGGTGCAATAAAACTAGGTAATAA
AAACAATGATGAAAGCATTAAAAAAGTATTGAAAATAAAATTTATGATTT
GTCCGGGGGGACCGATTCGAACTTTTTACGTCGAATTTCAGATTTTTCAA
TCATTATTGTACATATGATTAGTGTGAAAGCACGAAACTCATAGTAATGT
ACTTTATCAAGAAACTTGACTTTATTTAGTTTTTTTAAATGGAAGATAAT
TTTTGAAAATATTGACTATATTGATAGAATTTTTGGAATTTCTTATTTTA
GACTTCGATCAACCTACAGAACTCCGTCTTGTACACTTTTGGTCTATTGG
CTAATGTTTGTGTGTTTTTGTTTTCAAGTAATGATCAAAACAAACCAATA
ACAATCACAGGTATAAGTTGTTTGTCGTTAATTCTAATCTTGGTAGCTTT
TTTATCTATAATCAGGAGAGAGATCAGAATTTTTAGGTAGGTTTTGTGAT
GGATAGCTTATTTCTACGTTTTTATTACACAAGATACACGACCAGTAGGC
TCGGTTATCTACGAGGTGAACGTGACCCTGAAGAAGTGGTGACGTCTGGA
AGATAGCTCTGTGCTCTTATTAAATTCGACATTTTGTTTGTTTTGTTTAG
GCTTCTTTGATGGGTTTTCAATATACACCTGGCTCATTGTTTTGACGCAG
GTATACAATGTCACAATTCTTTACTATGATTCATTAAATCATGGCCTCAA
TATGCTCTTTTTCGTGTAAACAAGCTCATTGGTGCAAATTAATGTCCTTG
AGCTTTCGTCCTTTATCTCCATAAGGTTTTTCAATCATTTTTTTATCTCT
TGCATTTCGATTCATACTTTTTAGGCACTGAATGGACTTCTTATCTCCCT
AATAATGAAGTATCTCAGCAATATCGTGCGTCTATTCATGATTGCGTCAT
CTATGCTACTGACCACACTTCTATCAAGTGTCATCTTTGGTTACAAGCCA
GATATCTACTTTGCTTTGGCCTTTCTTTTGGTTATATTCGCCCTCTATAT
ATATCATTTTGATGGTTCACAATCTGGTATCAAAACGAACAAGAAAACAG
TGAAAGACATTTGAAGATGAAATAAGAAGAAGATAATTTTTATTGGAGGT
ACACATTAGTTTATAAGAACATCCAGAATTTTTAAAGCTTTTGGATGTTC
TTAACTTCTTCTTATTTTCACCATGTTTTAGAGTCTGCAAAGCCTTAAAA
TGTTCTTAGCTGGGCCTTCATGTAGGTTCTGCTTCTTGTTTTAGCTTTAA
AAGCTGATGGAAGAGGCCCCCAAGCGGTTTTCGTTAAGACGTAATAGCGA
CTTTTTTGCAGCGTGATAACGTGATTTGGAATTTTTTTCTTCGTGATTGC
GTGATGAGAAGTCAAAACGTGATCGTGATTTGAAAAATCACCACCCCGAT
ACACGAGTTAGACTTTTTCAAAGGGATGCGTGATTATCCAAGTTTTTTGT
TGTTTTGTCTGATCGTGATTGAAGGCAAAAAATTGCGTGAGATATCGTGA
TCAGAGTTACCGCTGGGCTGGGCCTCTATGGAACACGGTGAAATAAAGGA
ACATGAGAACAGGAATGACCCTGTGGATATTGATTGTACCGAATTTTAAT
ACTGTAATGAACAAAATGATTTATGAATTAGATATTTTTCTAAACATTTT
ATATACATTTATAAGACTTATTTATTTGCACTTTTTTTATCAAAAGAAAA
ATCTATTCGTCCATTCAAAGAAATTTATGCATGATTTTTCATTTCATTCA
CCTCAAGTAATTTAACAGAAACTCCCTTCGCCACCTATCGCTTAGATATT
GGGGTATGCCAGTAAGACTGTTGATGTTCTCACCCTTATAAAATTGGTAA
AAATTATATTTTGTATTTATCGTGTAAGCCTT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_006858XLOC_006858Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00012186-exon-sc0000141-1575043694:84792..84840TCONS_00012186-exon-sc0000141-1575043694:84792..84840Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00012186-exon-sc0000141-1575043694:75931..76039TCONS_00012186-exon-sc0000141-1575043694:75931..76039Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00012186-exon-sc0000141-1575043694:75641..75690TCONS_00012186-exon-sc0000141-1575043694:75641..75690Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00012186-exon-sc0000141-1575043694:75193..75466TCONS_00012186-exon-sc0000141-1575043694:75193..75466Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00012186-exon-sc0000141-1575043694:74409..75046TCONS_00012186-exon-sc0000141-1575043694:74409..75046Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00012186-exon-sc0000141-1510915933:84792..84840TCONS_00012186-exon-sc0000141-1510915933:84792..84840Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00012186-exon-sc0000141-1510915933:75931..76039TCONS_00012186-exon-sc0000141-1510915933:75931..76039Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00012186-exon-sc0000141-1510915933:75641..75690TCONS_00012186-exon-sc0000141-1510915933:75641..75690Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00012186-exon-sc0000141-1510915933:75193..75466TCONS_00012186-exon-sc0000141-1510915933:75193..75466Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00012186-exon-sc0000141-1510915933:74409..75046TCONS_00012186-exon-sc0000141-1510915933:74409..75046Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00012186-exon-sc0000141-1491911889:84792..84840TCONS_00012186-exon-sc0000141-1491911889:84792..84840Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00012186-exon-sc0000141-1491911889:75931..76039TCONS_00012186-exon-sc0000141-1491911889:75931..76039Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00012186-exon-sc0000141-1491911889:75641..75690TCONS_00012186-exon-sc0000141-1491911889:75641..75690Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00012186-exon-sc0000141-1491911889:75193..75466TCONS_00012186-exon-sc0000141-1491911889:75193..75466Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00012186-exon-sc0000141-1491911889:74409..75046TCONS_00012186-exon-sc0000141-1491911889:74409..75046Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000141supercontigsc0000141:74409..84840 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.86668	0	0	0.0392856	0.82679	0.435924	0.616825	0.812628	0.230427	0.34989	0.41512	0.512803	0	0	0	0	0	0	0	0.1738	0	0	0	0.00410875	0	0	0	0.173868	0.953267	0.345852
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00012186 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top