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The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00012126 ID=TCONS_00012126|Name=TCONS_00012126|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4032bp gcatcaaggaaaagaaaaagaaaaagaaatcatcaaaaaagaatgaagaa gaaaacagtTCTCATAATTGGAGCTGGCATTTGCGGTCTTGCCTGTGCAA GAGAATTAACAAAACATGACGCAATTAATGTTGTTGTTTTGGAAGCTTCG AATAGAATTGGAGGCAGAATCCATTCCCATACAACGGAAGATGGTGTTTC CTTAGAACTTGGAGCACATTATATCCATGGTACCATTGGTAATCCCATCT ACGATTTCGCTGTCGAAAAAGGAATCATTGAGAAAACCATTGAAAAGCAA GcTTAAACACAATGAAGAAATTGATGTGAAAAACGAAGTTgatcaacaaa acaaaacgaaacaaaacgaaagtgaaagttaaAGTGATTATGTCTTCATC GACACGACTAATAATATAAAGGTTATTCTGTTATGGTGAAATTGTAACCA ATGGATTCGTCTACTTATCAATATATTGCCAACCCACGGACACATACACA GAAGGTTTTATCTTTAGTTGTGAAATTATGGTTGATCGCCAACTTTGTGA CTGGACCATTCGCACTGGTTTATGGTGTTGAGAATATCGCAGAATGTCCA AGCCAGCCGTGGATCCCTATTTTCCTGATGGCTCAAGGCGTCGCATCAAT CATTCTTATTTCACTCATGTTGACATGTTTTATCAGTTGTAATGATGACG AGAAAGCGACACATTGGTTCCGCTGCAtgacattttttatcattctcgTG ACACTAGCCTTGATGACATGGCATTTTGTTGGCTCATATTGGGTATTCGG GCTATACCAACAATTACAAGTTGACGGGTCATGCGCATCGAATTGTTATA TGTTAGCTTTCGTTTTACTTGTGGTTTGCCAGATATGTTATGgtactttt gttttgttttttccatGTGTCTTGAAAGAACGCATCTGTGCATCACGTTa ttgaaatttggaaaagaCTTGGATGTAAAATTAATGcagaatttatattt ttcttcgcTTTAAATGAATCATAATAGCGAGGTTATATAAATCACTACGA TGGACTAAATTAGGGTAGCCTTCGTTCGCGCTTCGGAACTTTTCTACAGg tttaaggttttatttttacataagtgtttccgtttcatattagAAACATA TGTCATacgcttttcttttttttttaagaatctagttttaccaagcagcc tcaatgtttcttaagaaatcggccttttgagccttaaatgcttcttacat gtttctaaactttttaacataatcagcctcatgtaAGGCTGGGTTGGAAG GTTCATAAAtgaaaccgaattaaaaaaagttattttctcattctcagcct cagcatgtttcctagatgtttcttagtttttaggctttctgagcctcatg tttcttaaaagtgtgtttcttaaataaaaaaaaaacgtgtatcagaaCAG Tgtttgcctattgttatattatgttatgttatgttttcctttcctctttc tgaccaacattgctccacatctgtgtcaattcaatgtgaaaaagcttgta aattaaaattgatgagcaagcaaacaatatcactcttatttaaaaataaa acctttaactcaAAAGTAAGGCAGACTTATCCCACGAAGAAATCAGAAAT TAACAGATAGTAAAGCAAAGCGGATATAGTACGCAGGCGGTAAGCATCTT GTTTTCTGATTACCCCGTAAAAAGTAATATTATTCCCATAGGAGAAAGAA GTGGGCGTGGGTATGGGTGTGTCAAAAACACTTTACCTGACACcaacaac cccccccccccccatttaaaCTTATGTCTTTGATAACTGCTTCTTCTGCG TCTGGATTTCTGCAGAGCTTTCTTGTCTAACTGACTGACTGATAAAAAGA CGTTATTACGATCAAGCGCCACCGTTCCTGTTTTTTCATGATTCATTGCG GTCGTACCTATTTCAACATCAAAGTAATTTatgaatttataaaaaatagc TTTTTGTTTCAACATTGTTTTTATGCACAGACACAACGATACGGCAAATA CAGTACAGACGGTTTatggatttctttttttttggaatattcaCTGCACA GATGTTGTGCTTTCAGCTCTTACAAgcaacaagcaaaaaaaagtgaatat cacaaaaaatatcgctgttattgtttttgaaaacatgtgaagcgtcttat tggtcaagcgctgaaattctattctaATAttacgtgacctaggtaggatt tcctacctaacctcggcacacttttcagccaaagcacgacatctgaccct ttgggctttataaatctataaaATTTTGTCCCTGATCTGAAGAATATATC AGCCTCACaacttctatccccattgggactcCGATAGGGATTCTAATCCC CACTATGGGAAAAATTCCAacggggctgtgaaacaggggtacATTATCCC GAAAAACTCGTAAGGGTGCAGCAATGCTCTCATTTTTTTGCGTATTTTTA AAAGGGGTTTAGAGAATTCTATATTTATTTTCTCCACAATTATGAAATTT AAAAGTATTGTAAATTATAAATTGtaaataacaaagaaaaaaaggaattt tatcAACATAATTATACATTGCAataaatatattataatataatattaaA TTTTTCCCTCTTTATATTTCCATAACTTTGAACATTGTCCTTATGAAAAA CACTGGTCTGTAAGCattttgttttaactttttgttagctttttcttttg ttattatcaaaaaatgagaattgatttcctcagtttttgatcacgttacc aagtacttAGGGATGAGtttaaaatttaattacatgatcaaaaagtgagc ataACAAACTATTTtatcaacgcaagttcaagtaagaaacaatggaaaga aacgaAAGGCCTCCAGACCGggtttttttatacggactatgcttAGAATA ACGGCTTTCTTTAAAAGAATTCGCTCAATATCCCAAATAATTTCTGCTGA AAATGCAAATTTCCAATACTTGAAACCACACAAAACAACAAATGAAATAA CCCATGAAAGGTGTGTAAAAGGTGTTTCCCAGATTAAGTATCACACCAGA TTGATTTTATATTGATTTCGTGGTGGCTACACCACAACACTATCCAAAAG TTTGTCTCTTTGGCATGTTTAAATGTTAGATTTATAGATCAGAAATGAAC GGAGAAACTTTTTCATACAGTATATCGAACTCATACATTAGGAATGTcgt ttgtaaaaagtttttttttaactaacTGATGAATGCTTGAAAGCGCAGGA AAagtattagaaaaaaaatttctccgttCATTTCTGAACAATGATAACGC TCTAGGGTattaagcacacacaatttaaAGTCAGTCATACAATAATGTTA GATTTAAATATTCTCTGTTAAGAATTAATTTAGGGTCTAGTTCattcaat ctttaaaaaaagttgaaattttagaGTTATTTGAGATTTGAGGTCTGTAT ATAAATGTGAaccatgaaattttttaaattgtatatatttattttgtcaa aagtcGCACCTTAAAATATCCACTATTCATTTTATTCCACTATTCAAATT TCGTAGCTCTTAAAATTTGACAGCAGTTTCATTTCAAGGGTTCCCTCTAT TCCATTCCCATCTATGATTTCAAACTTCTTTATGATGAAAATACTGTTAG TAAACACGACCCTTCTCACAGTCCTGGTAGGGTTTTTCACCCAGTGTTGC TGACTGTAACTCAGTAGAGATTTATATTCCCATATTCTTTAAtgacacct ccttctcacagacccactggaaaaattggccgaaatatcgtccccggtgg aaaatgaTCCTCTAATTATTGTCCATACTGAATCAATTAAACCAGCCCTC ACTGCAAatatattatgctatttttcctatccccaatgaattttctgact ttagaataaaagaattgaaatccccagccataaaaaatatgggaatttCC AATCTGAGTTTATCCCCACTAATCCgatcggg Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000137:436167..450322- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00012126 ID=TCONS_00012126|Name=TCONS_00012126|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=14156bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000137:436167..450322- (Clytia hemisphaerica) GCATCAAGGAAAAGAAAAAGAAAAAGAAATCATCAAAAAAGAATGAAGAA
GAAAACAGTTCTCATAATTGGAGCTGGCATTTGCGGTCTTGCCTGTGCAA
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TTTTTAGGCTTTCTGAGCCTCATGTTTCTTAAAAGTGTGTTTCTTAAATA
AAAAAAAAACGTGTATCAGAACAGTGTTTGCCTATTGTTATATTATGTTA
TGTTATGTTTTCCTTTCCTCTTTCTGACCAACATTGCTCCACATCTGTGT
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TAGTACGCAGGCGGTAAGCATCTTGTTTTCTGATTACCCCGTAAAAAGTA
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TCTTTGATAACTGCTTCTTCTGCGTCTGGATTTCTGCAGAGCTTTCTTGT
CTAACTGACTGACTGATAAAAAGACGTTATTACGATCAAGCGCCACCGTT
CCTGTTTTTTCATGATTCATTGCGGTCGTACCTATTTCAACATCAAAGTA
ATTTATGAATTTATAAAAAATAGCTTTTTGTTTCAACATTGTTTTTATGC
ACAGACACAACGATACGGCAAATACAGTACAGACGGTTTATGGATTTCTT
TTTTTTTGGAATATTCACTGCACAGATGTTGTGCTTTCAGCTCTTACAAG
CAACAAGCAAAAAAAAGTGAATATCACAAAAAATATCGCTGTTATTGTTT
TTGAAAACATGTGAAGCGTCTTATTGGTCAAGCGCTGAAATTCTATTCTA
ATATTACGTGACCTAGGTAGGATTTCCTACCTAACCTCGGCACACTTTTC
AGCCAAAGCACGACATCTGACCCTTTGGGCTTTATAAATCTATAAAATTT
TGTCCCTGATCTGAAGAATATATCAGCCTCACAACTTCTATCCCCATTGG
GACTCCGATAGGGATTCTAATCCCCACTATGGGAAAAATTCCAACGGGGC
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CTCTCATTTTTTTGCGTATTTTTAAAAGGGGTTTAGAGAATTCTATATTT
ATTTTCTCCACAATTATGAAATTTAAAAGTATTGTAAATTATAAATTGTA
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ACTTTTTGTTAGCTTTTTCTTTTGTTATTATCAAAAAATGAGAATTGATT
TCCTCAGTTTTTGATCACGTTACCAAGTACTTAGGGATGAGTTTAAAATT
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TTCAAGTAAGAAACAATGGAAAGAAACGAAAGGCCTCCAGACCGGGTTTT
TTTATACGGACTATGCTTAGAATAACGGCTTTCTTTAAAAGAATTCGCTC
AATATCCCAAATAATTTCTGCTGAAAATGCAAATTTCCAATACTTGAAAC
CACACAAAACAACAAATGAAATAACCCATGAAAGGTGTGTAAAAGGTGTT
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CTACACCACAACACTATCCAAAAGTTTGTCTCTTTGGCATGTTTAAATGT
TAGATTTATAGATCAGAAATGAACGGAGAAACTTTTTCATACAGTATATC
GAACTCATACATTAGGAATGTCGTTTGTAAAAAGTTTTTTTTTAACTAAC
TGATGAATGCTTGAAAGCGCAGGAAAAGTATTAGAAAAAAAATTTCTCCG
TTCATTTCTGAACAATGATAACGCTCTAGGGTATTAAGCACACACAATTT
AAAGTCAGTCATACAATAATGTTAGATTTAAATATTCTCTGTTAAGAATT
AATTTAGGGTCTAGTTCATTCAATCTTTAAAAAAAGTTGAAATTTTAGAG
TTATTTGAGATTTGAGGTCTGTATATAAATGTGAACCATGAAATTTTTTA
AATTGTATATATTTATTTTGTCAAAAGTCGCACCTTAAAATATCCACTAT
TCATTTTATTCCACTATTCAAATTTCGTAGCTCTTAAAATTTGACAGCAG
TTTCATTTCAAGGGTTCCCTCTATTCCATTCCCATCTATGATTTCAAACT
TCTTTATGATGAAAATACTGTTAGTAAACACGACCCTTCTCACAGTCCTG
GTAGGGTTTTTCACCCAGTGTTGCTGACTGTAACTCAGTAGAGATTTATA
TTCCCATATTCTTTAATGACACCTCCTTCTCACAGACCCACTGGAAAAAT
TGGCCGAAATATCGTCCCCGGTGGAAAATGATCCTCTAATTATTGTCCAT
ACTGAATCAATTAAACCAGCCCTCACTGCAAATATATTATGCTATTTTTC
CTATCCCCAATGAATTTTCTGACTTTAGAATAAAAGAATTGAAATCCCCA
GCCATAAAAAATATGGGAATTTCCAATCTGAGTTTATCCCCACTAATCCG
ATCGGG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00012126-exon-sc0000137-1575043694:450163..450322 | TCONS_00012126-exon-sc0000137-1575043694:450163..450322 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00012126-exon-sc0000137-1575043694:449339..449479 | TCONS_00012126-exon-sc0000137-1575043694:449339..449479 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00012126-exon-sc0000137-1575043694:442311..442498 | TCONS_00012126-exon-sc0000137-1575043694:442311..442498 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00012126-exon-sc0000137-1575043694:441781..441865 | TCONS_00012126-exon-sc0000137-1575043694:441781..441865 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00012126-exon-sc0000137-1575043694:436167..439624 | TCONS_00012126-exon-sc0000137-1575043694:436167..439624 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00012126-exon-sc0000137-1510915933:450163..450322 | TCONS_00012126-exon-sc0000137-1510915933:450163..450322 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00012126-exon-sc0000137-1510915933:449339..449479 | TCONS_00012126-exon-sc0000137-1510915933:449339..449479 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00012126-exon-sc0000137-1510915933:442311..442498 | TCONS_00012126-exon-sc0000137-1510915933:442311..442498 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00012126-exon-sc0000137-1510915933:441781..441865 | TCONS_00012126-exon-sc0000137-1510915933:441781..441865 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00012126-exon-sc0000137-1510915933:436167..439624 | TCONS_00012126-exon-sc0000137-1510915933:436167..439624 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00012126-exon-sc0000137-1491911889:450163..450322 | TCONS_00012126-exon-sc0000137-1491911889:450163..450322 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00012126-exon-sc0000137-1491911889:449339..449479 | TCONS_00012126-exon-sc0000137-1491911889:449339..449479 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00012126-exon-sc0000137-1491911889:442311..442498 | TCONS_00012126-exon-sc0000137-1491911889:442311..442498 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00012126-exon-sc0000137-1491911889:441781..441865 | TCONS_00012126-exon-sc0000137-1491911889:441781..441865 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00012126-exon-sc0000137-1491911889:436167..439624 | TCONS_00012126-exon-sc0000137-1491911889:436167..439624 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000137 | supercontig | sc0000137:436167..450322 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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