|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00011937 ID=TCONS_00011937|Name=TCONS_00011937|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4886bp CACGCAGCAGGCTTAGAGAATGGTGCATGAGTAATAACTTCGATTCTCTG ACTCAATTGCTTTGTTACAAAAAGAACAGTAACAGTAGCGAaccaaatag aataaaaattgatatagtttttttgttgaatttcgttGAGACACtgtttt tttatctattttggtTGACTTTCGATCACCTGGTAAAAAGTTGTCCCTGG TATCGTCGGGACAGATCTTTTGGTGttggtaatttttttctggataaTAA TATGTGGATAAGTTAATGTTATACCGTTGAATTTTAACAATCTAATATTT GTTATTTTGTCATTCATTTACCGTCGAATGCTGAAATGAAATTGGCCCTG TTTATTTGTTTTCTTGTGGCCAccataatttcaaaatGTCACGGCATCGA TTTATTTTGTACACCAGACTCAATGACAATCACTTTGGAAATGAATATCG ATCCAAAAGTATATAGCACCTCAATCGTCAAATTCGAAAATACTAATTGT ACGGCAACAACAAATGGAACACATTTCTTTATTACGTCACAATTTAACGA ATGTAACACACAAATCGGGGAAACAGTAGATGATATCGTGTTCTCAAATC GGGTTATTGTGGACCCGAATAATTTAAAACCGGACGCGATCATTCAGCGG TTGGAACATACTGAACATATTTATCCAGTCAATTGCTTGTTGAGGAAGGA AAATGTGGTGGTAACAAATACAGGATATAACCTTACAGGTGACGGATGGG AAGAATGGGGAGCGTGGTCAGAATGCACCAAAACTTGCGGAGGAGGAACA ACAACTAGGAAGAGAGATTGCCGTGTATCGCGTAGAGATGATCTAAATTG TCCAGGATTGGAGGTCGAAGTTGCCCATTGTAATAATGTCACTTGCCCAT TGACATGCGACGATATagaatgtgattttttcaatcaTGAAGAATGCGAA CCACATTATATCTTTCAAAATGCAACGTGTGAATGTATGAAAGGCTGGTA TGAACTGGATGACGGTACATGTGACACAGAAGAGAAAATAGTTGGAGTAC AAATCACCTTGGGATCTGATTTTCAAGATGAATTTGTGTCATTTAAATCG AACATTACATCAGACTTTAAATCGAGAATCGAAACACAATTTACCCTACA ACTGGGGCTTGTACCACCAGAACGTTTTATGGTTACCGAATTTTCCGCGG GTAGTGTGATTGTGGACGGCCTGGTCATTCTTCCTCGAAACACaacagaa aacaaaacaacaattcAAGAAAAACTGGTGACTGAGTTACAAACGAACAC GACCGGTTTATTGGAAGAATTTAATGTCACTAAAATTAATAAAGTTAATG aaaCCTACATTTGCGAGCTTGAATCAGACACATGCAACCGAACGCGATCA AACTGCACTGATACACCAGACCTCTTAACTCATTATCAATGTGATTGTTT TGAAGGCTACATCAACAAAACCGTGTATATCTGTCAAGATTATTGTGAAT ATGGTATCGACACGTGTAACAATATATCAACTGTGTGTAGAGGAACACCA GGGGTCGGTCGCCATTATGAATGTGATTGTGCTTTTGGTTTCGAGCGGTT AGATAATAGTACTGATACATGTACACCAATGCCTCGACCATGTGATAATT CAACAATGAACACGTGTAATAATTCAACATCAACGTGCATCAATACCTTT ACGGCACCCATCTATTATAACTGTGCTTGTAACGATGGTTACCTGAAGTT TAACAACACTGTTGATCAATGTTTGGATTATTGCGTCTCAAATAACGATA CTTGTGATGATAACACGACAATGTGTCGCGCAACACCCGGCGACGGACGT CATTATGAATGTGACTGCAAATATAAACACGTAAGGCTAGACAACAACAC TGACGCCTGCACACTAGCCGATACTCCATGTGCTTGGGGAAATGATACTT GTGATAAAGATATATCAACATGTATCGATACTTACACGCATCCAAACTAC TTTGACTGTAACTGTTCAGCCGGATATGTCAAACAAAATCATACGACATG TTTCGACTTTTGCGTTGATAACTCCGACACATGTAACGACACATCAACGA CGTGTTTGGCGACACCTGGTAAAGGGCGGCATTACGAATGTCCTTGTAAA CATGGATTTGAGAGACTCGATAACAACACGGACTCATGTACACCGATGCC AAGACCTTGTGATACAGGGAAAGATACTTGTAACAAGACACGATCCAATT GCACAAACACTTTGACAGCTCCGGTTTACTTCAACTGCTCGTGTGGTGAT GGTTATCTCAAATTCAACAACTCAGTTGATGATTGTCAAGACTACTGTCA TATTGAAGCTGATTCCTGCAACAAAACTTCAACGATGTGTGAGGCAACTC CTGGCAAAGGACGACATTATGAATGTCCATGTAAATTTGGTTTCGAGAGA TTAGATAACAACACAGACAGTTGCACACCAATGCCAAGACCTTGCGACAC AGGGAAAGATACTTGCAATAAAACTTCATCCAACTGTACAAACAGCTTCG AAGCTCCTTTCTACTACAATTGTACCTGTGAAGCTGGTTATTTGAAGTTT AACAGCTCCTTGGATCAATGTCATGAGTATTGTCGTATTGAGGCTGATAC CTGCAATACAACCTCTACAACTTGTATGTCTACTCCTGGCAAAGGACGAC ACTACGAATGTCCATGTAAACATGGCTTTGAGAGACTCGACAACAACATG GACAAATGTACGCCGATGCCAAGACCTTGTGACACAGGGAAAGATACTTG TAACAAGACAAGATCCAATTGCACAAACACTTTGACAGCTCCGGTTTACT TCAACTGCTCGTGTGGTGATGGTTATCTCAAATTCAACAACTCCGTTGAT GATTGTCAAGACTACTGTCATATTGAAGCTGATTCCTGCAACAAAACTTC AACGATGTGTGAGGCAACTCCTGGTAAAGGACGACATTATGAATGTCCAT GTAAATTTGGTTTCGAGAGATTAGATAACAACACAGACAGTTGCACACCA ATGCCGAGACCTTGCGACACAGGGAAAGATACTTGCAATATGACTACATC AACCTGTAACAATACTTTCACAAACCCTGACTATTACAACTGCTCATGCA ACCCAGGCTACTTCAAAGAAGGAGGCTCACTCGATAAGTGTTCGGATCAT TGTCAGTTCGGAGTCGACACCTGCAACACAACTTCCACCACTTGCAAAGC CACTCCTGGATCTGGTAGATACTTCGAATGTCCATGTAAATTTGGTTTCG AGAGGTTAGATAACAACACAGACAGTTGCACACCAATGCCAAGACCTTGC CACACAGGGAAAGATACTTGCAACATGACTACATCAACCTGTAACAATAC TTTCACAAACCCTGACTATTATAACTGTTCTTGCAGTGATGGTTATCTGA AACAAGGAGGTTCACTGGACAAATGTTTGGATCATTGTCAATTCGGAGCT GATAGCTGTGACGAAACATCTTCGATTTGTGTGGCAACTCCTGGCAAAGG ACGACACTACGAATGTCCGTGTAGATTTGGTTTTGAGAGACTCGATAACA ACATGGACAAATGTACACCGATGCCCAGACCTTGTGACACAGGGAAAGAT ACTTGTAACAAGACACGATCCAATTGCACAAACACTTTGACAGCTCCGGT TTACTACAACTGCTCGTGTGGTGATGGTTATCTCAAATTCAACAACTCAG TTGATGATTGTCAAGACTACTGTCATATTGAAGCTGATTCCTGCAACAAA ACTTCAACGATGTGTGAGGCAACTCCTGGCAAAGGACGACATTATGAATG TCCATGTAAATTTGGTTTCGAGAGGTTAGATAACAACACAGACAGTTGCA CACCAATGCCAAGACCTTGCGACACAGGGAAAGATACTTGCAACATGACT ACATCAACCTGTAACAATACTTTCACAAACCCTGACTATTACAACTGCTC ATGCAACCCAGGCTACTTCAAAGAAGGAGGCTCACTCGATAAGTGTTCGG ATCATTGTCAGTTCGGAGTCGACACCTGCAACACAACTTCCACCACTTGC AAAGCCACTCCTGGATCTGGTAGATACTTCGAATGTCCATGTAAATTTGG TTTCGAGAGGTTAGATAACAACACAGACAGTTGCACACCAATGCCAAGAC CTTGCCACACAGGGAAAGATACTTGCAACATGACTACATCAACCTGTAAC AATACTTTCACAAACCCTGACTATTATAACTGTTCTTGCAGTGATGGTTA TCTGAAACAAGGAGGTTCACTGGACAAATGTTTGGATCATTGTCAATTCG GAGCTGATAGCTGTGACGAAACATCTTCGATTTGTGTGGCAACTCCTGGC AAAGGACGACACTACGAATGTCCGTGTAGATTTGGTTTTGAGAGACTCGA TAACAACATGGACAAATGTACACCGATGCCCAGACCTTGTGACACAGGGA AAGATACTTGTAACAAGACACGATCCAATTGCACAAACACTTTGACAGCT CCGGTTTACTACAACTGCTCGTGTGGTGATGGTTATCTCAAATTCAACAA CTCCGTTGATCAGTGTCAAGACTACTGTCATATTGAAGCTGATTCCTGCA ACAAAACTTCAACGATGTGTGAGGCAACTCCTGGCAAAGGACGACATTAT GAATGTCCATGTAAATTTGGTTTTGAGAGGTTAGATAACAACACAGACAG TTGCACACCAATGCCAAGACCTTGCGACACAGGGAAAGATACTTGCAATA AAACTTCATCTAACTGTACCAACAGCTTCGAAGCTCCTTTCTACTACAAT TGTACCTGTGAAGATGGTTATTTGAAGTTTAACANN Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000134:167283..180347+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00011937 ID=TCONS_00011937|Name=TCONS_00011937|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=13065bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000134:167283..180347+ (Clytia hemisphaerica) CACGCAGCAGGCTTAGAGAATGGTGCATGAGTAATAACTTCGATTCTCTG
ACTCAATTGCTTTGTTACAAAAAGAACAGTAACAGTAGCGAaccaaatag
aataaaaattgatatagtttttttgttgaatttcgttGAGACACtgtttt
tttatctattttggtTGACTTTCGATCACCTGGTAAAAAGTTGTCCCTGG
TATCGTCGGGACAGATCTTTTGGTGttggtaatttttttctggataaTAA
TATGTGGATAAGTTAATGTTATACCGTTGAATTTTAACAATCTAATATTT
GTTATTTTGTCATTCATTTACCGTCGAATGCTGAAATGAAATTGGCCCTG
TTTATTTGTTTTCTTGTGGCCAccataatttcaaaatgtaagtatttttt
CGTTGGTTTTTCtaggagatttaaaaaaaaaatgtgaatttaCCGCAATA
ATCCATAAAAGACaagatttgattttcaaacGTAAACGCAAgtaaaataa
atcagaaaaatgAATCTTGAATAAGTTAAAAATGAAGGAACAGGGATGTG
CGTTTTATAATAAAAGCTATAAAATTTCGGCTAAATTTCAGGGGTTCTTG
TTTTTACAAAGAATTTAGGTTGTTTTAACCCCCTGTTCCAGTGACAATTT
CAATTTGCAGGGAAGTACCAGGAAACTAAataaatttcatccaaaaaagG
CATTTTGGCCTTATGTTCATCAAGTTGTCTTACATATCTAAAATTGTATT
TCATGGCTAGACTACTGGCCTTACACGTTACTCGCCaactatttttttct
taatatcAACATTAATTCACAGCTCGGAAAGAGTAAAATGTTGATAGCTT
CCTCTGTTTAATaagttttttcattaaatttgtaATAAAATTCATCTAAA
ATCCTAAAGTCAATGCAATTTTTATATTcttagaaattaaatttttcata
gaaTCAAGACTTCGTAAATAAAGTTTCAGCCtgataaaaaattttgttaG
TTTTGGCACTTTAAAGTATTATTGCATAGAAAAACCTCAAAATAAGATCA
TTACAAACTTAGCTTGAAAAATCGTCTTAAATTCACCAAAAATAAGATTA
AGATGACTTAAGGGTATCAGAACAAAAAACTCAACTAATCTTCTGTCATT
TTGATGGATCTATCCAAAAAGGGGTAATCAAAACTTGCATTGcaaatcaa
aacttttattatgTATCTCTCTGGAAGGCTTTGCATGTTGAAAAcgctat
ttttttataagaacaatgttgAGTCCAGAATGACTAAATTTCAGGCAAAT
TGAtggtcaaagtaataaaaataggGTACATAGCCTAAAAGTCTAAAAAG
CCTCAGTATGCTCTAAATGTACGAACAggataaaaacaatttgaagCTTA
TAGTGTCAGGACAGTATTAAAAGAACAAAAGTAGTTGAGTCTCCCAAAAA
ATTGTACTCGTTTTAATAAAAAGAGAGTTTTTTAAGAGTGCTTGTTAAAC
TTAGAGAGATTATTTCCCCAAATTTAAGCCAAATTTTTAGTCCAAATCTC
AAGAATTTATATGACCCTTCGAGGGAAGActcgatttttgattttcttaa
gTTTGGGGGTACAGAGACTTACAGAGACTCTTTTCAATGGTTTCCGTgcc
cctttgagggactttcgagtgtgtgaaaaagggaccatTTTGGCTcatcg
cacatacccggcacccattttgcctaagtatctCCCGgtgatattcttaa
aaattgaaatgaaaaaggaaggaaaaaaagtgaacataggatctgaaaat
tttattttcacttatttGAAATcgtagatttttctttttttccagatAAA
ATATTACATACCCCAAATAAGAATactggataaaaatttctagaaTCAAT
ATCGTCCAAATGGACTGAGGGTCccaattgaaactttcttcagcAAATGT
ACCGTAAAAAATGAATCCTAAATACAAATTTGCTCAACAGtttctacttt
ttcaaattttccacaAAAGCGCACCCGGTGAATACTGTAACTGATTTTAA
TTGTTATCGTATTTTGTGAGGAAAAATACATATAGAATATTCCAGATTCT
ATAACACTTAGCTTAGCCTGGAGCATAGAAGGCAAAGGTACATTACaatc
attgacttccaagcccgaagggctagttagactcgagactcctggatgag
aaataaagcaacttatttcccatccagaacgcccgcgcgtggtctttaca
caaacgccggattgaaagtaaaatctatcgatATATTTCAACGAATACAG
TCATCAAAAACAAAGGACCCGCTAGATACAATCTTTTGTCGTGATTCCGG
CGCGTTCCAGGCGccttctggatgggaaataaatagcttcactttttctt
gcctggaaaaggttagagattctactctactcttgtctcccgaatagacg
gggggagagtccgaataagcaggggggtaggaaattttctaaattctagt
AAGcaggggggatggaataagagggggggggggggtaatttgaagacata
tttttttaactgatatcaatttcaacaaaaaaaaaagaaactttaacaaa
tgaacacgtaaaataagaaccaatactaacaaaaaggaaaatttaaacaa
gtttaaggtctatctacacggtaataaaatatcaaattattcaaatttaa
ttagcaggggggtcttaataagagcggggggctggattatttttctctta
tcaattagcggggggacgtctattcgggagacaagagtagcccttcaggc
tttaaactcaatgatcaCAATGTGTACACTTTATTTGTAAGAACTTGTAA
ATTTTTGATGATGCTCTTCTTtatttggcactttgagcctaaaaTAATTC
TTATCTTGTTCTCATTTTCAGGGTAAAACTTAAATGTTTTAAGATGTAAG
TAGCCTTTTTCCAGACTAACTCTGAACcattattttcttaaaattccgCT
ATTCCGGGCTCAGCATTGTTTTTAGGTTGTTCTCGTTTTTAGTCACTTTG
AGcctcttgttcttataaaaataatgtaGCTAGTAGAATAAAAGTATTGT
GCCCTAAGCACAGAACTGATACGAATTCACTTATACAACATGcatttcaa
tagaccttttcataaattacgtcacgagcatcacttgcctcgtgttccaa
caattaccatggtgattatatcccttgagacattaaatgatctttttatg
aatagaaagcagttttaataaaatccgttgggagttaatcaccatggcaa
taatttcaaaaaagggCAAGtaatgttcgtgacgtaatttatgaaaaggt
ctatttattaATAATCGACCCATTTATCGGGTAACAAGATAACccgtttt
ttcaattttacggATGAAAAGAGAAAATCTCAACCTTGCGTGTTGTCTTA
TCATCATAATATAAGGGATGTAaaatgtcatcaaaatttcagTCTTTTAA
ATAAGTTTCCTAACAATAAATGGCTAACATCTGCTTTCATGGGGGGGGga
tgaaaaatagaaattaaagaaaatctAATTCAATACTTCAAATGAGCTAG
TATTCCAAGAGCAAGCTATACTAAAGTCTatttctggctgaactttgctt
tttaataccttatcggggaaaatttcgtcgggaaaaacttggccgaaatt
tcgtcacttttccccgacgaagttttccttGATAAGGTAAttgattttcg
aatttttttaaaagccgTAAATAATCCGCTCAAAGTTatctttcaaacaa
aatattacttttttaatcatatttACGAACTTTCAAAAGCAATGTATCAA
AATTTGTGGACTGCCAAATTAAATGTCATGTTTGGAACAGATTTTAAATG
TAAACGTTCACTATGCACGgacaatattttctttgaatgcattacacgct
tcttttttatataagaatggcgcttttcatttcatcatgggttttttttt
ttttttttttttttgatattcttacggtattcttaggttaagatcgaaat
ttgcCCTAGATTTAACATGTAATACAAACCTGAAGAATATTGAGCGTTAC
TGGGATGTTATTGACAATTCACAGGtgaaaatgccttaaaatggcattct
taggttcagttgctaaattccatgatggtgatattcttaccatattctta
tttttggccattttcatcatgggtattcttatttttaaaaagcgtGTACA
TTTAATACCTCTCTTTACTTTAAAAAGCCATTTATCAAAATGATAAGAAG
TTTAGGATTCAAAataacctctataactcgaactcgATAACTGAAACATC
TCGAACAAATTAGTGTTCCCCATTCGTGTTTAAGGTTATGGGGACTCCAC
TGAAAAGgtcctttttttattgaaagggaTTTCACATGGGACCCTCTTCG
TAATGAGAATTCAGGGTTTTAAACTGCTTGCGTCCTAAATCGGATTCGGG
CTCCTTATACAAACTTTTCTTATAAGATAGTTGTTTTCCCATACCACCTT
CCACCATGGATATTCTTATGATATAAATATTCCTGAAATCTTCTAAACGG
TGTTCCATACCCAGCTTAAATTTACAATGTAATACAGTCGACTTTCggta
attcgaactcgaacaggGAATcctatttgttcgaattacagagagattcg
aattatagaaagtatatcaAGAAAGTTTCNACGAACGGGGAATcctattt
gttcgaattacagagagattcgaattatagaaagtatatcaAGAAAGTTT
CTCGTTGACGGGGACTGAAAgcaggttcgaattatagaaatatttaAATA
ATGAAGTTCGAATAGATGAAAGTTTTCTGTACTTTACTTCAAGTAAAATA
TAGCATTTTCAGGTTGATTCTATGATGTTGATgttgatattcttagcata
ttcttaatttttgaccaattttattATGAACATTCTTAtagagtatattc
ttataacaaGGCGTGAAGTAGCTGAGGTTTTTTAGAGatctgtgattcag
actaaaAGGGTTTCTTCTGTTACGCAAGCAAATTGCGCCGTCAAAAATGG
TGCGTTTCCCCGGTCTGTTCAATAAACACTTGACTCGTATAATATTTTCT
TGTTCTCGTGTAAAAGTATcatgaaaaaaatgtataatatgACTCATTCG
GTATATTACACCATAATGTTATGATCTGACAAAAAAACGTAATAGCTTAA
TATCTATTATCAATTGTAACAATGTTATACAAAATAAGTTGTTTTAATTA
GACCCGCTGAgtcaaataaaatcaaaatgagaaTTCCATAgagtattaaa
aaaaatatactgTAAAAATGGTGCAAAACTTGGTTTTTATGTAACCCACA
AGCTTTGTAAAACTTGAGAGAAATAGAACTCCACTCCCAGGtgtcttaaa
ggttttattcttacataagtgttcccgtttcatatcagacacatatttca
tatcaggacagagTCTTCTTATTGTttatgttatgctgatataggcaaga
aaatgttttcttttcctattttgatcaatcttgctccacatctgtgtcaa
tccaatgtgaaaaggcctgtaaatcaaaattgatgagtaagcaaacgata
aaACCCTAACCGACGAGATAGCTTATCGGATTATCCAGGCCCAGCGGAAG
CAGGGAGATTGGGAAGACTTCAGCTTCCctacttttgagcaaatgagatt
tttttttctcgaattcctagcaaattttatctcattttgagccttcagcc
tccccacttttacggttttTCCACCGGTTCTGTTATCGCAAAAGTTAAAA
ATCTAAACTGATTCTATCTACCCGTTTTCAGGTCACGGCATCGATTTATT
TTGTACACCAGACTCAATGACAATCACTTTGGAAATGAATATCGATCCAA
AAGTATATAGCACCTCAATCGTCAAATTCGAAAATACTAATTGTACGGCA
ACAACAAATGGAACACATTTCTTTATTACGTCACAATTTAACGAATGTAA
CACACAAATCGGGGAAACAGTAGATGATATCGTGTTCTCAAATCGGGTTA
TTGTGGACCCGAATAATTTAAAACCGGACGCGATCATTCAGCGGTTGGAA
CATACTGAACATATTTATCCAGTCAATTGCTTGTTGAGGAAGGAAAATGT
GGTGGTAACAAATACAGGATATAACCTTACAGGTAAGACAGTCTTGGATA
TCCCGCGATTACAGTTCAAAGACAAAAATGTAAACTGCATAACACCTGGG
TGCGTGGTAAATGTTATCTGTAAAacaatactctcgggtacctagtTTCC
AAGGTACTTTAAAGACATTCTTATCCCAACTACTGCATCAAATTTTTTAA
GTAATAATAAATAAGCCGTAGTAATTTGTGCTTAGTTTCGGAGGTTTTTA
TTCATCCaaatttttaggctgaaaagttcttaaaatatttttaatacgAC
AGTTATATTCTTTGTAACCTTAAGCACTTTTTACACACCAGTCGTTATAA
GCTCCGTTATTTTTGGCTTTGACGGATTAAAAACCGACGTAATACAACGA
GTGTATAATATCATTTTTGAATCTGAggctaaaattgttcttaatttgtt
cttattagGTGACGGATGGGAAGAATGGGGAGCGTGGTCAGAATGCACCA
AAACTTGCGGAGGAGGAACAACAACTAGGAAGAGAGATTGCCGTGTATCG
CGTAGAGATGATCTAAATTGTCCAGGATTGGAGGTCGAAGTTGCCCATTG
TAATAATGTCACTTGCCCATTGAGTAAGTGTCCACTTTATTCAGAATTTT
TTGACTATCTCTTTCCCGCTTAGATCTTCACAGGGCAAAGAAATATCTTT
GAATAAGAATGATTCGAATTACGGAGATTTTTTATATGGATTTCAAGCTG
AGGGGACCAACGCTTtagatcgaattaaagagaggtTTGAATTCTAGAAG
TTCAAATTAAAGAAGAGGACTGTACAGCTTTGAGGCTGTTACAGGAACAA
TCGAATCACTGATCCAATACCAAATACTACAGTTTTTTTAATTACTGTTC
ATAATGCCTGGAACCTTACGAAATTGTTCGTAAAGGGATAAGCtaataaa
aagtaaaacttaGCTCAAAGATTGCTCCCAGTCCCATGGTCCTTAGTAAA
CACATTCTGAGGAACATATGACTATCTAAAATCACAAATTTCNCACAccg
ttggaaaggaaatttcagaCCGAACAACTTTTCTGCTTACGAGAAACGAT
gaaaatgtactcaatgtgactcaaaatgaaaaatgatgacgtcatcattt
tcactgttttaattttttctctaaCCATATACACGAGACGTGTATCATAT
GAAACAGGAATCTGAAATGAAATCTCTAACTTTTTTTGACTCGccaattt
cgccaaaattagttctcgtcaaaataagttcccttaataTTAATGAAATT
AATTCCATTTTCTCCCATACAGCATGCGACGATATagaatgtgatttttt
caatcaTGAAGAATGCGAACCACATTATATCTTTCAAAATGCAACGTGTG
AATGTATGAAAGGCTGGTATGAACTGGATGACGGTACATGTGACACAGAA
GAGAAAATAGTTGGAGTACAAATCACCTTGGGATCTGATTTTCAAGATGA
ATTTGTGTCATTTAAATCGAACATTACATCAGACTTTAAATCGAGGTAAA
TAGCATATAattaaaatctgttctgttCGTGGCCCTTCGTGGAAATAATT
CCTCAGCTGTCTAAAAGCTGTTGAATTTTTCGAAGCATGCCACGTAAAAT
ATTTggtattgttattattattattattaaaatctTAGGATGCCATTTTG
GGGACCACCGAAAACCGACCcatagagagactgatttttgctgaaaaggt
gacccttagagagactttttgaaatgttttttttcgatttttgaaaaaag
tcatacccttagagactttattacaattttttctctggaaatcaaaaaat
ttcctaaaaatcctgaattttcagacccttagagagactaatttaaaact
ttctgatttttccaacccttagagagactttgaaaggtcaACGAGGCCCA
CGATTATCAAAATTGCTTCGACAATTTGAAAGAAAGTATCAAATTTAGAC
TAGATGCTCTTTAGACCTTAGAATTGATATTAGAATATGTGAcctatttt
ttgatttgaaagcgTAAAAAGGGtctattttgaaagtaaaaatttcGAGC
CCATTTTAGGTATATAGGAGACTTTAAGGCGAGTATAACCGATTTCGGAA
TTGAGTGGGAGTTAAACCTAATGTCGAAAATTTAAAACCTCATCTTACTC
ATAACATTTCCTTTTGTGTTACCTTTAAAACAACAACTTTTCATTCTCAC
TTTTATAGAATCGAAACACAATTTACCCTACAACTGGGGCTTGTACCACC
AGAACGTTTTATGGTTACCGAATTTTCCGCGGGTAGTGTGATTGTGGACG
GCCTGGTCATTCTTCCTCGAAACACaacagaaaacaaaacaacaattcAA
GAAAAACTGGTGACTGAGTTACAAACGAACACGACCGGTTTATTGGAAGA
ATTTAATGTCACTAAAATTAATAAAGTTAATGGTGAGTTTCTCGTTAGTT
tcatgaggcccccccagcggtttgcgtgatggcgtaaccgggactttttt
cttgcgtgatggcgtgattagagattttttttggcgtgatggcgtgatca
agatttttggCGTTATGCGtaatagggcaaaaatttgatgcgtgatgcgt
gatttgggctattaaatcgctattttttgcgtgatgacaaattttagcga
ttttcgtaatgcgtgatggagaaaatttttttgcgtgatggcgtgattag
gggtgccgctgggggccTCTTTAATAGATATCATATATACAACACTACAA
TCAAGGCCATAATATTTGACAAATCTTATAgtcacaaacaatttggaagc
ggTCTAAGTTAGGTTGGATTGAAGTATTATGACAcataaagcctaaaaat
gtccttaaattgttcttaatgttctggccatcgaagccttattttcttac
atagtttattcttataaaaaatgcataTTTCTTCATCAGAATCTAATCTG
TAGTCCctcttattttttctttggaaactcaaaatttttgagCGAACAAC
CAAACCATGTCCAAATGATGCACTGATACGTCCGTCAGAATTTAAAGATT
CTggttttaaataagagtgatgcTATCGTTTGCTtcctcatcaattttaa
tttataagctTTTTAAGGAGCAATATTGgctagaaagaggaaaaaaagat
tattttgtttatgcagcacaatataacaatagggagacaccgtcctgata
tgaaatatgtgtctgatatgaaacgggaacaattaccatgcaaaaaaaaa
acaactttaatctccatttttgattttagaaaCCTACATTTGCGAGCTTG
AATCAGACACATGCAACCGAACGCGATCAAACTGCACTGATACACCAGAC
CTCTTAACTCATTATCAATGTGATTGTTTTGAAGGCTACATCAACAAAAC
CGTGTATATCTGTCAAGATTATTGTGAATATGGTATCGACACGTGTAACA
ATATATCAACTGTGTGTAGAGGAACACCAGGGGTCGGTCGCCATTATGAA
TGTGATTGTGCTTTTGGTTTCGAGCGGTTAGATAATAGTACTGATACATG
TACACCAATGCCTCGACCATGTGATAATTCAACAATGAACACGTGTAATA
ATTCAACATCAACGTGCATCAATACCTTTACGGCACCCATCTATTATAAC
TGTGCTTGTAACGATGGTTACCTGAAGTTTAACAACACTGTTGATCAATG
TTTGGATTATTGCGTCTCAAATAACGATACTTGTGATGATAACACGACAA
TGTGTCGCGCAACACCCGGCGACGGACGTCATTATGAATGTGACTGCAAA
TATAAACACGTAAGGCTAGACAACAACACTGACGCCTGCACACTAGCCGA
TACTCCATGTGCTTGGGGAAATGATACTTGTGATAAAGATATATCAACAT
GTATCGATACTTACACGCATCCAAACTACTTTGACTGTAACTGTTCAGCC
GGATATGTCAAACAAAATCATACGACATGTTTCGACTTTTGCGTTGATAA
CTCCGACACATGTAACGACACATCAACGACGTGTTTGGCGACACCTGGTA
AAGGGCGGCATTACGAATGTCCTTGTAAACATGGATTTGAGAGACTCGAT
AACAACACGGACTCATGTACACCGATGCCAAGACCTTGTGATACAGGGAA
AGATACTTGTAACAAGACACGATCCAATTGCACAAACACTTTGACAGCTC
CGGTTTACTTCAACTGCTCGTGTGGTGATGGTTATCTCAAATTCAACAAC
TCAGTTGATGATTGTCAAGACTACTGTCATATTGAAGCTGATTCCTGCAA
CAAAACTTCAACGATGTGTGAGGCAACTCCTGGCAAAGGACGACATTATG
AATGTCCATGTAAATTTGGTTTCGAGAGATTAGATAACAACACAGACAGT
TGCACACCAATGCCAAGACCTTGCGACACAGGGAAAGATACTTGCAATAA
AACTTCATCCAACTGTACAAACAGCTTCGAAGCTCCTTTCTACTACAATT
GTACCTGTGAAGCTGGTTATTTGAAGTTTAACAGCTCCTTGGATCAATGT
CATGAGTATTGTCGTATTGAGGCTGATACCTGCAATACAACCTCTACAAC
TTGTATGTCTACTCCTGGCAAAGGACGACACTACGAATGTCCATGTAAAC
ATGGCTTTGAGAGACTCGACAACAACATGGACAAATGTACGCCGATGCCA
AGACCTTGTGACACAGGGAAAGATACTTGTAACAAGACAAGATCCAATTG
CACAAACACTTTGACAGCTCCGGTTTACTTCAACTGCTCGTGTGGTGATG
GTTATCTCAAATTCAACAACTCCGTTGATGATTGTCAAGACTACTGTCAT
ATTGAAGCTGATTCCTGCAACAAAACTTCAACGATGTGTGAGGCAACTCC
TGGTAAAGGACGACATTATGAATGTCCATGTAAATTTGGTTTCGAGAGAT
TAGATAACAACACAGACAGTTGCACACCAATGCCGAGACCTTGCGACACA
GGGAAAGATACTTGCAATATGACTACATCAACCTGTAACAATACTTTCAC
AAACCCTGACTATTACAACTGCTCATGCAACCCAGGCTACTTCAAAGAAG
GAGGCTCACTCGATAAGTGTTCGGATCATTGTCAGTTCGGAGTCGACACC
TGCAACACAACTTCCACCACTTGCAAAGCCACTCCTGGATCTGGTAGATA
CTTCGAATGTCCATGTAAATTTGGTTTCGAGAGGTTAGATAACAACACAG
ACAGTTGCACACCAATGCCAAGACCTTGCCACACAGGGAAAGATACTTGC
AACATGACTACATCAACCTGTAACAATACTTTCACAAACCCTGACTATTA
TAACTGTTCTTGCAGTGATGGTTATCTGAAACAAGGAGGTTCACTGGACA
AATGTTTGGATCATTGTCAATTCGGAGCTGATAGCTGTGACGAAACATCT
TCGATTTGTGTGGCAACTCCTGGCAAAGGACGACACTACGAATGTCCGTG
TAGATTTGGTTTTGAGAGACTCGATAACAACATGGACAAATGTACACCGA
TGCCCAGACCTTGTGACACAGGGAAAGATACTTGTAACAAGACACGATCC
AATTGCACAAACACTTTGACAGCTCCGGTTTACTACAACTGCTCGTGTGG
TGATGGTTATCTCAAATTCAACAACTCAGTTGATGATTGTCAAGACTACT
GTCATATTGAAGCTGATTCCTGCAACAAAACTTCAACGATGTGTGAGGCA
ACTCCTGGCAAAGGACGACATTATGAATGTCCATGTAAATTTGGTTTCGA
GAGGTTAGATAACAACACAGACAGTTGCACACCAATGCCAAGACCTTGCG
ACACAGGGAAAGATACTTGCAACATGACTACATCAACCTGTAACAATACT
TTCACAAACCCTGACTATTACAACTGCTCATGCAACCCAGGCTACTTCAA
AGAAGGAGGCTCACTCGATAAGTGTTCGGATCATTGTCAGTTCGGAGTCG
ACACCTGCAACACAACTTCCACCACTTGCAAAGCCACTCCTGGATCTGGT
AGATACTTCGAATGTCCATGTAAATTTGGTTTCGAGAGGTTAGATAACAA
CACAGACAGTTGCACACCAATGCCAAGACCTTGCCACACAGGGAAAGATA
CTTGCAACATGACTACATCAACCTGTAACAATACTTTCACAAACCCTGAC
TATTATAACTGTTCTTGCAGTGATGGTTATCTGAAACAAGGAGGTTCACT
GGACAAATGTTTGGATCATTGTCAATTCGGAGCTGATAGCTGTGACGAAA
CATCTTCGATTTGTGTGGCAACTCCTGGCAAAGGACGACACTACGAATGT
CCGTGTAGATTTGGTTTTGAGAGACTCGATAACAACATGGACAAATGTAC
ACCGATGCCCAGACCTTGTGACACAGGGAAAGATACTTGTAACAAGACAC
GATCCAATTGCACAAACACTTTGACAGCTCCGGTTTACTACAACTGCTCG
TGTGGTGATGGTTATCTCAAATTCAACAACTCCGTTGATCAGTGTCAAGA
CTACTGTCATATTGAAGCTGATTCCTGCAACAAAACTTCAACGATGTGTG
AGGCAACTCCTGGCAAAGGACGACATTATGAATGTCCATGTAAATTTGGT
TTTGAGAGGTTAGATAACAACACAGACAGTTGCACACCAATGCCAAGACC
TTGCGACACAGGGAAAGATACTTGCAATAAAACTTCATCTAACTGTACCA
ACAGCTTCGAAGCTCCTTTCTACTACAATTGTACCTGTGAAGATGGTTAT
TTGAAGTTTAACANN
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00011937-exon-sc0000134-1491911889:167283..167669 | TCONS_00011937-exon-sc0000134-1491911889:167283..167669 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00011937-exon-sc0000134-1510915933:167283..167669 | TCONS_00011937-exon-sc0000134-1510915933:167283..167669 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00011937-exon-sc0000134-1575043694:167283..167669 | TCONS_00011937-exon-sc0000134-1575043694:167283..167669 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00011937-exon-sc0000134-1491911889:173164..173514 | TCONS_00011937-exon-sc0000134-1491911889:173164..173514 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00011937-exon-sc0000134-1510915933:173164..173514 | TCONS_00011937-exon-sc0000134-1510915933:173164..173514 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00011937-exon-sc0000134-1575043694:173164..173514 | TCONS_00011937-exon-sc0000134-1575043694:173164..173514 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00011937-exon-sc0000134-1491911889:173941..174105 | TCONS_00011937-exon-sc0000134-1491911889:173941..174105 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00011937-exon-sc0000134-1510915933:173941..174105 | TCONS_00011937-exon-sc0000134-1510915933:173941..174105 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00011937-exon-sc0000134-1575043694:173941..174105 | TCONS_00011937-exon-sc0000134-1575043694:173941..174105 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00011937-exon-sc0000134-1491911889:174805..175027 | TCONS_00011937-exon-sc0000134-1491911889:174805..175027 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00011937-exon-sc0000134-1510915933:174805..175027 | TCONS_00011937-exon-sc0000134-1510915933:174805..175027 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00011937-exon-sc0000134-1575043694:174805..175027 | TCONS_00011937-exon-sc0000134-1575043694:174805..175027 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00011937-exon-sc0000134-1491911889:175741..175964 | TCONS_00011937-exon-sc0000134-1491911889:175741..175964 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00011937-exon-sc0000134-1510915933:175741..175964 | TCONS_00011937-exon-sc0000134-1510915933:175741..175964 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00011937-exon-sc0000134-1575043694:175741..175964 | TCONS_00011937-exon-sc0000134-1575043694:175741..175964 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00011937-exon-sc0000134-1491911889:176812..180347 | TCONS_00011937-exon-sc0000134-1491911889:176812..180347 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00011937-exon-sc0000134-1510915933:176812..180347 | TCONS_00011937-exon-sc0000134-1510915933:176812..180347 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00011937-exon-sc0000134-1575043694:176812..180347 | TCONS_00011937-exon-sc0000134-1575043694:176812..180347 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000134 | supercontig | sc0000134:167283..180347 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
|