TCONS_00011768 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00011768
Unique Name	TCONS_00011768
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	3166

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000132:221453..239149-

transcript sequence

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GTGTGTGAGAGATTTCATCCTTGAGTACGCTTATACTCGATGCTTTGTTC
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GTAAACGGACTTGGCTCGCAAACAGGAGAGTACATGGCTATATATTTCCA
TATTCTCCCTTCAGAACATGATGATATATTAAGATGGCCTTTCAATCACA
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TATACTTTAGTGCCGACGCCGAACGAGGACAGTTATAAACGGCCTTCGGA
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AATTATCTTAACTTATCTTTTGTAAAATAGATTTTCAATCAATCGCTTTT
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TTCGATGCATTTGAACATCATCTTGAAAATTAAGAAGCACAATTGATCAA
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CGTACTTTCTGGCAGGTGGCAAAAATTCTTTCATGTTATCTTGAGGATAT
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AAACTGAGGTTTTGAAGAAAGGAAGACAAAAACACCTGCACCACTAACTA
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transcript from alignment at sc0000132:221453..239149-

Legend: exon

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>TCONS_00011768 ID=TCONS_00011768|Name=TCONS_00011768|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=17697bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000132:221453..239149- (Clytia hemisphaerica)
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GTGTGTGAGAGATTTCATCCTTGAGTACGCTTATACTCGATGCTTTGTTC
ATAAACATGAGAAGCATCATTGATCGAAAACGTGCTTTGCTCAACTCATC
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CGATAACAAATTAAAAAGTTATGGGCGATTTTCATTTAATGTTGATCTTG
GGCATTGCTTGGATGGTCTAACATAGTGCAAGTTTTCTGTGTGTTCTTAT
GATCAGATAAGAATGTTTAGTGTTTTTAAAAAGAGGTGAGAATCACTACT
CTACTTCTCCTCTACTTCTTTCTTTTTGGCTTCTTTGCTTTCGTGGAAAT
CGAGTAACAAGTTGTAATGACTTGTGATTGGATCAATGCTAAGGTTGAGC
TCACAAAGCAGTGCACGTACTTTAAAAAGAAATCTTTACAAGTTTGAAAA
AATTCCATATCATTGGTGTCTAATGCATTATCACATCTTGCTAGATCCTA
TTTTTGGAAATATTTTATTGTATATTCGAGTGATTGTGTGAACTAGCATT
GGTAGTGGCTTAGTAAATGTGAAATCGGAATATCACTTCACTTTTCAAAA
CTCCTACACTTTTCCGTGAAAAACTTCCTCATTAGAGTAGTGACGCTAAG
TCCGTTGCGTGATAAAGGTGATGAAAGTCGAGGGAGGTTGTGGAAATATC
AAATATACTAAACTTTAGAAACTTTGATACCAAAAGTATTCAAACTTATT
TCTCCTAGTCTTAAAGTAAAATAGCTGATTTCTTTCTAAACGCTTGTAAT
CAGTAAAACTTTGTATTTGAATTTTGATCAAATTATTTAATAAAGCCACT
TGAGACAACTGTTTTTGATCTCCAGTCATCCGGTCGTCGAGGTTGGAGTC
CATAAATATCGCTGGATGAATTGTTCATTTGATTTGTTGATCAAAATAGT
TCATTTCCCTTTTGTTGTGATGACAGATTGTCGTCTAATCTCTTTCTAAA
AGAATAGGGAAAGGTACTAATAAGATCTGCTAATAGTTCACTTCCTTCCG
TATTTTGAAAAACTTTACTGACGACTTTCAAGTTCCATTCCATTTAAATG
TGTGAGATTGTGCTCTAAGGTGTTTAGATGAGAAAGATTGTTGTGGTTAT
CGTGATTTCGTGTCTTTGAAGATTGTCGCATTACAGAGGTGTTTCTTTTA
TTGAACTCACCGATACGAATTGAGAAGACCTTGCTTCAAGGAGCCATTTA
TGTTTCTGAACTAACAATGTCTTCATCGAGGCCTTCAGCAAGTCGTTTTT
CAAGGTCCAAAAGCAAAAGACATGGTTGGTAAGGATTTCGATACTCCAAG
AGATTATTTTGTCAGCAACTTTGAAAACTAAAAAAAGCCTTCTGTTTTAC
GCACCTCTGCTGGGTATATGGTCAGATGAAATGATCAAAAGATAAACTTT
GATGGGATTGTGGTCATACTTAATTTAATCATTTTAATCGCAAATTGGCT
TTGATGTTTTTAGATATTTGTAGATGTGCTTTTTCCTAGCCATCGTGTAA
ACGGCATATGCAAGGCATAAAATATTTTGCTTTCCATTGGGACATCAAAG
TCATATTGGTTTTCGTTTTAGAAATGTTTGATTTCTGAATCGGTTATTTT
GACTAATGGAAAACCTTCAAAATTAAAAAACTATATTGTGATGCATTGCT
TTAAACATATTTTTCTTTAATTTTCACAGGATTCAACCATCAAGATGTCC
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CCATCGGTCTGCTGTTGGATGTTTTTTTGCCACTACTATCATACCTTGGT
AGTTTTTGAGCGAAAAATGTCAAAGCATCTGATTATTCAATCAACCTGTT
AACTTACTGCATTTTTCGAGACGACCGAAATGTGCAAATCTCACTTTAAT
TACTCTAAGTCACTACTCTTAACGTCTAAGTCACTGAAACTACTTTTTGA
AATTTTCTCGAAATATCGAATTGTTCGAGCATGGTATCGATTTTTCTCAC
CACTAACGTCATTCAGACGCTATGTCCAAGACCCCTCCCCCACACCGGGA
GCGTCCGCCACCAAAAATCGATGAAATCATGATTTATCATGTTTTTTCTT
TTCAAGTTTTACGCTTTTTCTTAAGTATTTTCCAGTAAGTAAAAAAAGAA
CATCCGAAAAACAAACAAACAAATCAATCACTCCTTTCTTAACTCTTCAA
ACCTACCTATATCTTTTTTTACACGAACAAATTATCAATCTTTTTTTTGA
AAATTTCGAGAAAATGACGACAAAACTATGCTCAGCTAGGGTAGTTAGCA
ATTTAATCATCCTCGAAAATCGATGCTTATGATGGGTTTTCTTAGCGTCA
CTGCCTCTGACCTCCTCGCGTCATTGTGACGTTAAAGTCGCAAACATCGA
TATGTGAGTGACCCCTAAGACAGACTAAAAAGATAAAATTATGTCACAAA
AGTTCAACATTTCCTTTAAATGTACACACAGTAAATATTGTAGTTCAAAA
GGTGTAGAGTGCGTTGAGTATAGTGCTTTGCGCAAGCTAGTAATAGTGAG
ATGTTAATAAGACGAGAGTCTTTTTAAAGCAACAGATCCGATAGTTTATC
CCATGCTAAGTCTACTGGTGCCATCTCAAGATTTAATCTTGTTACAATCA
GAGAACTGTTTTGAACGACAATTGGAAGCGGATTTTACACAAAAATGATT
GATGTTGCAATCTTAAGGTCTATGTAATAGAAAAGGTTGCTCTCTATGAA
GTAGCTATCATCATTTGATTTTTGGCTACTGCACTTTAAATACCAATTCC
ATCCAAACTATTTATCATGTTTTCTCTTTGATATCTCAAGATGCACTTTC
TTTAAATTCTTTTACATACGCAGGTTACACGATAAAGTTGAGAAATTTCA
ACCCTAAAAACAGCGGGAGGATTTACGGTGGTAGTTTTTTCTTTTTGGTT
TCCCACCGCGCGACTTTTGGCATGCTGAGATTGTTTGCACTGATAGCGGA
AGGCGGAGAGTTTATGTAAACCTATCCATTTCTGTAAATAACTTTTACAC
AGTAGTTTTGAAGTGAGAAGTCTGACTGATAGATGTGTGCGTTGACAGGT
TAAACCTCGCACACTACTAACGTTTTTATTAGAATCATAGGTGATCTGGG
CTGTGTATAAAGATGCTCTCGTCTTTAGAACTTTTCCGTTTGAATTAGCA
TCATGTTTATTTTTCGAGAGTACATTTGTTAGTTTTACTGTGATAGAACT
GCGATATTCTGGTCCTTGCATATACATTGTTCTCATTTCCCACTTGTTAC
AGAATGTTCATAGTTCTTATAAAAGTATTCCAGCGACAACAAAGAAGCTT
GTTTCATTTCTCATCCTTCTCTATTTTCACCTGATTTGTGGCAACCGAGG
AAAAATGTTGGAAAAATAGAACACGACAGAACGCGATCGACAAATTAAGA
ACGGAAATCTTTTCTCATTATGAGCGTCAAAAATGATGATGGCTTGTTAA
AAACACATCATCCTTTTCTTTCACCCTAATTAAGAGTTTATTTTTATTCT
GCACATTGTAAAAGCTACTAAGAAATGCTTGTTGCTGTTTAGTTAACGCA
GACGTACATCGAGTTGAAACGAGATGTCATTGCTTCGAATCAGAAAGGTT
TGGCTTATTTCTCATCCATAATTTCAAGGCGTATTCCCTTCATTAGTCTG
ATTAGTCAATTCAGAGAACCAAAATAAATGTTTTCTTGTTGGGAAATAAT
AGAGAGTGCTTTTCTTCCATATTTTTTCTTCAGTATTTATTTGTTTGAAT
AAAGTTCATACACATCATGAAGTTTGAAATGAGTTTTTGATGTTAATACC
TTGTGTGTTGGATCGTGTCTTATTCACGAGGCAGTGCGTTACCTGAGTAT
CGTGGGAAGACTTCAGTCTTTTTAGAGGTGCTTCTGTATTTAGATAAGCT
TATGTAAACATCAGAAGCTTAAGAAAGTTTGTTTCCATAATAAAAGCATC
CACCCTTAAGCAGTTTAGTCAGGCGATGCTTTCTTTTGTTTGTTTTTTGG
ATAGTTATGAGAATCATTTTTGATGCAACCGGTTTTATTTTTCCTGTTCT
TTACCAACACCCTTTCTCCAACACCACCCAACAATTTTTAAGAATTAGTT
TCGGAATAACCAAACATCAGTTTGATCAATTCTTGTGTGGTCCGACTATA
TTCTCCTTTTCTGCGAGAAGTTACCGGACTGGTGAGCAAGGCTACGAACT
CAGTATCATGTTGATCCAATTCAACCTTTTTTTCCCTTTGTAACAAACAG
AAAAATCTGTAAACTCGTCTTTCTTCTCGTAGATTTTCACGGACACAGCG
TTCCAGAAGCAGATAGAGGATGTGAAGATTATTTGTTGTTATTCATCGCA
TGGATGTTCATGGGAAGGAACCATACAATCTCTTACCGTAAGTCTCTTCA
TGTTCTTAAGACAGTCCATTGGAAGGCTTTAAAGACACTTTCATTTATCT
ATCTGCTAGACATCATCTTGACCCTTGACCAACCTCACGCCAGAACTGCG
AAAATAAAGACTTTTTGAAATGTTAACGTAAACCCTTAGCAACCAAAATA
TAGACGATGCATCGAAAATATTGACCACGAAAAATTCTTTTTCGCAGCCG
GGGAAATTTCTTTTTGTTGAACAATTAGAATCGTTTTGAAATCTTTGCAA
ACGACGAGCAGGTGGATTAGTTTTGGTGGACAGGATATTAAGAGTAATTA
CAAGTGGAAGGTGGTTTTCGCTCAACGAAATGTTTGGAATTGGCTGCATT
TCTTTGGTTTCCTTCACACTCGATTACTGTTCGTCTCCATCGTGATAAGT
ACCTTCATTTCCTGTAAATGTAATCTTTCGATTGTCTTTTGAATTTCAAG
TGAGAATTTTAACATTGCGATGGTGGAATCTTTACTTCGAACTTCTAATA
AAATAAGATGACTCATTGAAAACTGGTGGAAGGTCATGTGGCAATAACAT
CATATACAATTTGTGTTTATCGTGCATTGTTACACAAACTAACAAACAAG
CTGTAGTGTGTTTTGCTTTACGAGAGATGGAAGAAGGCCGCGCCAAGTGA
ATCCAATTTTCAAGAGTTTGGTTAATTTTTGTTTTCCCACAAAATATACT
TCTCTACAATTTTCTCACGGACAAGAAAATTTTGCTTTGCTATCGTTATT
TAAGCCATCAAAATTACCTTATGTCGGAGAGGCCTTGTTAATTTGAGGCA
ACTCATCTTTTCCTTCACCGATATTTGATTTTCGATTGAGATTACCCAAA
TAAGAAAAGGGGTTGAACGCACGACGCAATGGGATTACTTGTAGCATGGT
AATTGTAAGTTAAGTTCAACCTCTTCTTAGTGTAGTTGGCTTAGGAGTTG
AACGAGTGCCAAGATTTCAAATCTATTTCCTTTTTGTGAAAAGTTTCTCT
CCTCTCACGAAAATACGACACTTTTCAAATACAGCAAAAGTAACTTGTTT
AAATCGTTGTATTCTCAAAATCATTCTTCAATCTGATTTCCATTTCTGTT
CATCCAGTCAGTTTGTTGTGGCTGAGATTCTCTACTCTTACCTTTACATT
GATCATGTTTTTGAATCAGAAGAAAAAAGAATTTATCTGAGTAACCATTT
ATATTAATAACGGATCGGTCACCTAGCAATTAGTAATGATGAGAATTGAT
GGTCATTGATTGGAAGTGGTCTTTACAAAACTCCTGCTGTTCTTAATCAA
TTCCATCTGCAATGATGGTGAAGGGAAATAAGGAAAAGTGAAAAATAGAA
TCTTTTCATGATCTATTAGTTCAAGAGTGTAATGTTACTCTTTCTGTTGT
TAATCATCAGTGTCAATTGAAATTGCTGTAGTAGAGGCTGCGTGTATTTT
GAATTGTGTGAGTCATGGGGAATTAGCTTTAGGTCTCAATTCGGATTAAT
ACACAGTGATTTTATCCTTTCGTGTATCTCATTTCGTCAGCAAAGTTCAT
TGAGTTCATGAAAAATTGTAAAAAGCTAAATTTGCGTGTAGTTGCGTGTT
AAAGACTATTTGTTACACGAGAGACATGCAAGTGACGTGGAATTTCGAAT
GGGATTTGATTTCTAGTATTTTTCACTTTAAAAAGCCACCAGCTTATAGG
CCATTTCACAGTCGAAATGAATCATGGGTAATCAGGACTGATTGCGTCCT
CGTAATAACGGCGTCCCGTTGACTAGACTCAAAAACATCCAAAATTTTAG
ACCAATGGAAAGTCGTTATATACATAAGCGGTGGTACGGTGGTATTACCC
ATGATTTCTTTCAGCTCTGAAATGGCCTATGTGGTTTTTATATATAAGAA
CAAACTATATAAGAACATAAGTCTTCGATGGCCAAAATATTAAGAACAAG
TTAAGAACATTTTAAGGCTTTGCAGACTCCCAAACTAACTACCGATGTTT
AAGCTTCCTTAAACATCGGTATGATTATTGAATTGAATGGACAAAAATAC
TCACAAAATGGTGAAAATAAGAACATGTTAAGAACATTTTTAGGCTTGAA
ACTCAAAAAGTTAAGAAGATCTAAAGGCTTATATAAAAAGCCTTATAAAA
AAACGTGTATGCGTAAATTTAAGTTTTTTTCTTCAAATTAAGCGCACTTG
TTAACAGATAAAGCAGGATAAAGTGGCACGCGGATATTTTTACCCTGATG
AATGAAAGGCTGTCAACAAAAACACCAGAACTTCCTGTGGTGAATTCGAA
ACGAACTGTTGACATTTTTCTTGCCCTCTTCACAGCGCATGGATGGTGCT
CTTTGATGATAGTCCTCCTTTAAACAAGTGGTTTACGCTTTCTAAAGGGT
GCTCTTTACCAAAAATCATGATTTTTCTGAACTAAGATAGATTACCTCAC
AGGTGTTTATTATGCTTTTGGAGCTTGGTTTGAATTTTTTCAACTTTGTT
TTTCGGTATCATTAACAAAGCATAACTTTCCTGAAAATTCTTCCGGTCAT
AAGTTTGTAAGCCGATGTTATCATTAATTTGAGAAATTTCATATATCTTA
TTTTCTTATATCAACTCTTTTGTTAAATTGTTAAACATGGTCATTTTTTT
CGGGGAAATTGTGCACCCCTAAGTAAGCAATGATGTATATTGTAACTATG
GGATTCAGGTCGTTAACAACAAACGCATCGAAAAGGGGGGAAATGGTAGC
ATTCTTTCGAGCTGAAGAATAACAAAACACTTGAAGACTTCAAAAGATTT
GAAATATAAAGTACACTTGATTACAATGTCTCGCAACGTCATTTGGTCTC
CTCTTTACGACGTCTTGATAGAAGTTCAGTCAGTTCTCATTGTTCGTTTG
CATTCAGTTTACTTGTGGGCTGCTTGCAGATGGATGGGTTTATTTTATTT
GTTTCTGTATGAAACGTGATTTTTTTAACATTGATTATTTTTTTATGGTT
CGCTTTCATTTTACGCTAAGCTTAATAAATTGAGTTGAATAATGTATAAT
ACACCGTCTTGTGTGCATACCACGAGTGACTTACTATAGGTATTTGTATT
CACAAATGTCAAGCTCGCTTTCTGTTGCTTGTGGTCGGATATCCTTATCT
TTCATGGTAAGATCAAGAATGTCAGCTCGCGAAGGAAATGCTTTTTGCAC
TGAGTAACCAAAACGTCAGCAAATGCGATTTGAATTTTGACAGGTTTTTT
GACCGCATAAAACCTCAGTGTTAACACATTGCTCAAACACTCCTCGAGAT
TGGTTCGTAGGCGTTCAAAGAATGTTTCTCTCTCTTATTTTTAGAGTTAG
TTGTAAAGGTCTAAACCCATGAGGCTACAGATATATCGAAGAGCAGCGCT
GATTATTAAGCAACGATAATAAAACATAGATTGATTACAGGTCCCTGTAA
TGGTTATTGTATTCTAAAGATTATTTGAAATTTTGAAATTTTGAAATACA
TTCATTGAAAGGGAAGATTTTGATGGAAGAGTTCTGATTGGTGCAATTGA
TAAGCCCTAATGTGTGCGATATCTGATGCAATTGGAAACCTAGCTCTGAG
AATTTACACAAGATATTTTACAAAGGGGATGGGGAGGAGCTCTAGGACCT
GTAATGTGTTTGTTTATGGATTAAGACGCGCTACATCATGAAGAGATCAC
TTGAAATAGATTTCTGACCTTTCTTAATGAACTCTATTTGTTACTTGAGC
TGTCGATGAATATTATTCGTAGTCTTTACTTGAGGATCAGCTCACAGTGG
CTTTAAAATGACCTTTTTATCTTACTTTCATTATGTGGCATGACTTAAAA
AAACGAGTTCTAGTTCCTTCCCGAACCTGTATGAACTGGTCTTTTATACT
TTTTCTGAATGCTATTTTGAAAAAAACCTCTACGCATCAGTTTATAATCC
TTTTTAATAGAATCAAACGGATTAAGGCAACGGCGACATTTGAATTGCTT
TCAACTCTCTCTTGCTCTCATTTATTATATACACTCAATGACAGAAAACC
CTGTTCCTTTTTCTTGAAACTTTTTCAAAAAAATAACGGACGACTTGAGA
TGATTTTTGAATGATTTTTGAATTTTTATAAATACTTGGGTGGTTTTAAC
TGACGAGTAATGGTTTGAGGAGATGTACACACCGTAATTGCGATTAAGAA
TACGATTTTAAAAAGCTTTTTGAATGCTGGAGTGTGTTATGAGTAATACC
AGTAGCATTGATATGTGCACCTTGATGGTAAGGTTTGATAGCCTCATTTT
TGCTCACTACTCTTGCATTATCCGCTATATCCATTCGACAACTTTTAAGA
AATTTTCTTAATTTGCATTTTCAGAAGGGAACATATTTATTAGAGGGTTT
GATTTTATATCAGAATTTACTTATCATTTCACTCAATGCTCTATTAACCT
TCTCAAAGTATATACACTGAATCTTCAAAAATGAAATTAAAAATAGAAAT
ATTGACGGATATCTACATCAATTAAAGCGTTTATAAAAAGTGTCTGTTTC
CACGACGATAAAAATGACATCATCTTTTCATTAAAGTGACGTCATCTATT
TTGATAACAGATAAAATATAGGATTTTGGAACAACAGAGATTAGATGATT
CGCGCTTTTGCATGTATGACCCGCGTTTATAATGTACTAACATTTCGAAA
TAACCAATAAATGAATGCGAAAATACCCCCTGTTAATCTACTGATATACT
CTGTTTAAAGGTGTATCGACAGGGGGTTAAATGATGACGCTATCTACTGT
TTTCGAAAACGATATAGCGCGCCAATGTCGACAGATGTTTCATTCGGGCT
CTCAGTTTGAACAATATATTTGCTTTCTTTCTTTCAAAATCATTTTTGTT
TTGGCTCTTTGTTCTTTATGATTTGCGATGGGTAAATCGCGTGCTGGAGA
TATCAAGAACTACATTAGATATTCCTCATGAAAAAATCGATTTCTATTTT
TCACTGATATTTTCAGGGTTTTAAGAAAAGATCCGCTTATATTTTATTCT
ATGTTTTTCGTCTTTTCTCGAATAGTTTGGAACGAGGCAAATATTTTTTT
AAAGCTCGTGATTTTCATGTTGCTCACTGTTGATCTTTCAGGAGCATAGA
GAAGACTGTGAATTCGTGAACGTGATTTGTGAGAAAGGCTGTGGAAGCAC
TTTACTCAAGTATCAATTGGAATCGCACATTTGTTTGGACCCATCTACAC
CGTCACTACAACAAGAATTGGCACTTTGTAACTCAGCCTTCATGGAGAAC
GGAGAATTCGTGGATGTAAGTAAAGCTTTAATGTATATTTAGTATGAGAT
GGTGGACTAATTTGCCAAATATGTTACTGGTACAACAATCACGTTGTAGA
GTTTGAATCGGTCACATACTGGTGTATGTACCAGAGAAACTCACTTGCAC
CTCGCAGCAGATTTTTAAAATCTCATTTTCAGTTTATTAAATTTAAAGCA
AAGCTTAATTCTTATGCATCATCGCAAAAGCAAGCGCTATGATTCACGAC
TATTATCAAGCCAGTGTTTATCTCCTTAATAAACAAACAAAGGGGTTATT
GAGATGTGCCTTCAAACCTCACCATTCGTCACTTACAAGTCAACTCGATT
TCGCAAAAGATTTCAAAGGATTTTCTTTGATACGTACTCGTGAATCAGCA
AGGATAATCTAAAAAAAGTTTGTTTTAGTGGCCGCTATTTTGGACTCCTT
GATGTTTGTGTGCAAGAAGAGAGACTTTTTATGAAGAGTTGTTTATTCCT
GCTCAGACAATATTTCACAATATCACGATGGATGTTTGGTGACGTCTTCG
TCTTTTTACCGGCTGTTGTTTTTCTGAACAAGCTTCTGTTCCTTTTTTGA
TAATGGAACGAGGAAGGACCCCCTTGGTCGCTTACAAGGCGCCATATTGT
GTCTTGTTGTATGTCTCGTATGTTATACGATCGAATGATGTATGATTGAT
AAAATAAAAAATATATGTGAAGTTTGTTTAGTATCATGTTCAGTCTTCTC
ATCTAAGTTGTGAATCAATCTTTCTTTCGATCGGTCGATCGGTATCTACA
GACGTTCGATCATGCTGTGTGATCTTACGTTGATTCACCTTCGCAATAAG
AAACAAAAAATCCAGTTTTGCACAGTTTGTGTCAAGAGGAGAAATTGATT
TTGGAAGTCAAACAATTTATAACGTGGCAGAAGATTAAGAGGTGATTTTG
GGGTAATCGATTTGGTACTTGAGTTTGTGACAGAGTGACTGCCTTTTTTT
TGATTAAGAGATTTACATTTTTAGTGAGTGTTGATTGAAGAATGAATGGA
TAAAAGAAATTCGAGATGACAGCCTGCTTCATTTCTGTGATGATTGATTG
CTTAGCTTTCTATTCCCTTGCTTTTTGATGCAGGGATGCTTCGAGTGTTG
AGGTCAAGAGGATAGCTTATTTGTTTTTATTTTGTTCCGAATGTTGAAAA
GATAATTTTAAGTGTATATATAAAGTTGGTCAATCTCAGTTGAAGTTTGA
ATATGTAAAAGAAAATGAATTAAAAATGACGAAAGCTAGATCGATTGACC
TTCCATACCACATAAATAGTGAATGGAACAAACACCTACTTGGTGACGTC
GACCATTGCCAACTGAATTTCAACATTCACACTTTAGTTAGTTGCCACCT
GATTCAATCGGAATTGAACGATTGCTAAATGTTGAAAGAAAGTCAAGGGA
ATATTTAAGAGAACTTCTTTACGAGAAATTTTACTGTAATTTTCAGAAGA
TTTTTTAAATAGATAGATGGTGAAATTACAAAGTAAGTAGCATCGACCTG
AAATTAAAACCTTTTTTTCTAAAAACGATGACCTGGCTTTTGATTACTGA
CATTTTAAATGTTCAGTATTCTTTAACTTTCACGTCTCAAAAGCTAACTA
TCGCCAAAAAGTCGTGACAAAAAAAAAAAGTTTACGGAAGTTTCGTGACG
ATTTTAAGGAAAATTGAGGCTGCCAAGACAAACTTGGCGTATACAAAGAA
ACTTTGTTTAGAAACGTGAAATATATTCACACTGCAAACATTGAAGGTTG
GTACAAGTAGAGATAAAGACTACTTCAGTTGGAGCCAGCATAGAATACAG
TATGCTTGAGTTCTAATCCAACTTATTCCATAGTACTTGAGCAAAAAGAG
TCAAAATAAGTTCAGTGAATACTTATGTGAGAAATGGTAACAACTGATTC
NGTCAATCTCAGTTGAAGTTTGAATATGTAAAAGAAAATGAATTAAAAAT
GACGAAAGCTAGATCGATTGACCTTCCATACCACATAAATAGTGAATGGA
ACAAACACCTACTTGGTGACGTCGACCATTGCCAACTGAATTTCAACATT
CACACTTTAGTTAGTTGCCACCTGATTCAATCGGAATTGAACGATTGCTA
AATGTTGAAAGAAAGTCAAGGGAATATTTAAGAGAACTTCTTTACGAGAA
ATTTTACTGTAATTTTCAGAAGATTTTTTAAATAGATAGATGGTGAAATT
ACAAAGTAAGTAGCATCGACCTGAAATTAAAACCTTTTTTTCTAAAAACG
ATGACCTGGCTTTTGATTACTGACATTTTAAATGTTCAGTATTCTTTAAC
TTTCACGTCTCAAAAGCTAACTATCGCCAAAAAGTCGTGACAAAAAAAAA
AAGTTTACGGAAGTTTCGTGACGATTTTAAGGAAAATTGAGGCTGCCAAG
ACAAACTTGGCGTATACAAAGAAACTTTGTTTAGAAACGTGAAATATATT
CACACTGCAAACATTGAAGGTTGGTACAAGTAGAGATAAAGACTACTTCA
GTTGGAGCCAGCATAGAATACAGTATGCTTGAGTTCTAATCCAACTTATT
CCATAGTACTTGAGCAAAAAGAGTCAAAATAAGTTCAGTGAATACTTATG
TGAGAAATGGTAACAACTGATTCTTTTGTGATTTGTGTTTGTCTGTTTTG
TCATTTGACAAGTGATTGGAGCAAACCTAAACATCCGAATGAATCCATCA
GTCAACAAGATATGTGATCTCATGTATTTTATACCATAACCCTCGACTTT
TTCTCTTCGCTTCATATAGTCTCATACGCACACATGGCTTGTGATGTGCG
GTCGATACATGGTTTTCTATTTTCGAATGGGTAGACAAGAAATATAGAAG
GTTTTGAGTTTGGTCAACAGTAGACTAGAGTAGTTTGAGAATATAGGACT
CTTCGTTGCTTTAGTGACTGTTACCTGACACTGTTATTATATTTGGTTCT
TGTGAAAATATTTTTGTATGAAAGTATGAAAGAATTAAAAAACAAAACGG
GTATGATTCGTTTACGAATGCAGAAATACATGGAGAGAATAAGCGGTGAT
GAAAGTGCTGGTAGTGCTGGTGGTGGTGGTGCTGGTGGTGGTGGCAAATA
TTACGCCAGTGAAACAATCACCGAAGAAAGTGAAAACGATATCGACGTAA
GTTCATGGTGTAAAGAAAGAAAGGAACTTGAACTCTTTTTTTACTTACTG
GGGTCATTGAGGCTCAACCGGATTGTAATTTTACTAATTCTCATTTAATT
TCTACTTGCAGGATCACGATTGCACGATGGAATCACGTCCAGGACCTGAG
GGTGAATCTTCAAGAACAATGCCCACTTCTTCAGAGGTAAGGGATGAAAC
TTGTGACGGATACCAAGGGATGATGTTTCCAAATAGGGTTGCAAATGGCC
CCACACTTCGAATGGTCTTTATAAGGATTACACTTCATCTTAACTCAATG
AACAAATGAAACTTTTGAGGATGATGAGGTTCATTGACCACAAGGGGCGT
TCTTTAACGTGCTTTATGAGATTTTTATGACCAACAAATGATTATAAATT
TGAATTTTTTTCTCATGATTTCCCATGGTATGGCTAAACTATGAATGGGT
TTAGAAGTATTGAGCCCTTCAACGTTATGATTACATGACATGGGCCTGTT
CTGTACGATTTCTCTGTTGATAAATTTTTGTAAAAGAAGGTGGTTCAATT
CCTTTTTTGAAGTAAAATGTTTCTTAGGATTTGTCCGTACAATATCTTGT
TTCAGTTTTGAAGTTTGAAACTGAGATTAGGCCAAAGGGGAAAGATTCTT
TCCTCTAGGGAAACATAATCTTTGGGAAATATTTGAATTCTAAAGAAAGT
TTATTTCTCTTTTTTTCGTGAGCAGTGAAAAATATCATTTTTCGTTATGA
AGGATGTCAAAGTTTAAATCCCTTTTCTTCATCCATCCATCATCAATTCT
CTTTTCCATTCTCATAATCGGTTGAGATACAACACAGATGTTTTGTGTCT
TTCTTTTTCCTGTTCCTCAACTGATAGTATACTGAGTATATCTTGTTCGA
GCAAAATATAATGTTCAAGAAACTTTTTTTCGGGATTTGCTTCAGGGTTG
AAACATTTTTTAACGTTTTTTTTTAAATTGCTCGATTAACTAAAGGAAAC
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TGTGAAATCATTATTTGACTGACTCTTGCTTTATTAAGTTATTGTACATA
TTAAAATCCCACTTCAATACAACAAAATTTGTACTTTTAAAGTAAAAAAG
CCTTGTAAGATTAAGAAAACAAACATTTTCGAAGATCGTATTCTTGATCC
CATGTTGAGATAACTTCGTTTGTTTGGATTTTCGTTTACAAAAAATCATT
AAAATATCAGAAAAAAAGTTAGAATCTGAAGAAATTGCTTTTAACCTACT
AAAATAAAAAAGACTTACCTACGCACTTAAACGCCCCTTCATTCAAAATC
AGTTTTTTATCTGTTAATTTTGTTGACAATTGTTGAGATTCTGTCGCAAT
TTTAAGCTATAGAATTATTATTCACGTACCATCTTCCTCCTGTGCAAGAA
ATTCATTACAATTCTTTTCCTTACCGTCAATAGGAACCAGCATCGCCAAG
TATTTCAGGAGATGGCGCTTCTTTGAAATTCTGTAAATTTATCAAGCTGG
GTTGTAAGTTCAAGGTAAGAAAACAACAGAAATTTCACTTTACAAATACT
CGAGTCATGGTGAAAAAAATATTGACTAACCCAACTAGTCTAAGAATGTG
TGACCAATGATGATTCTGTCACTTTTTTCGATCGAATCGAGATACGCTTA
CAATCATTATCTTCATTCTCTTCTTCCTTTTTATTATTCCAGGGAAATCG
ATTCGAGGTCGATTTACATATGGATATCGCTTCCGAGACACATTTAGATC
TGGTCTGTAAATCTATCAATGAAATCAAAACAGAATATATTAAGAAAGAA
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TCCAAAACGGAGATGTTTATGGAGGAAATTACTCGCTTGAAAGTACAGGC
CAATCAACTTCAAGAAGAAATGAATGAATCACGTGACACTAATTTCACTG
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GTTAATAAAACGGAACTTTCAGTATACAGCCCACCTTTCTTTACCAGTCG
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GATGATATATTAAGATGGCCTTTCAATCACAAAATCACTTTTTCTCTTCT
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TCGAACTTCAGGGTTTAAGAAAACTATCACCATCCCCATATATTCACAAT
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GTATGACAAATCCGTTTGCTCACACTAGCCAAATTTATCATCCAAAATAT
GTTTTCATGATCGATCTTTTGCTTTGCGTCTATTAGTCGTTGGGTAAAAT
CGATGAGTCGTCGTAACGACATCAGCTTTGTCGTACTTTCTGGCAGGTGG
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GTCCATCCTCAAAATGTTCTTTCAGTGGAACTGCTCCAAACCATCAATCA
TTTTCTCCCTTTTTCCTTCAAATCGGTTTTGATATCTTAATATTAAAAGT
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ATTCCATTTAACCTAAACTGTGAAAACGTTCAGCAAACTGTATAATCAAG
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CTCATAAAAGAAATTTTGAATTCTCGTCTTATTTTGATGAAGTGAAGTGA
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TTTCATCTCTTTTATTTTAAAGTTTATCATATTTCAACATTTTTTACCAG
TCTGAACTTCCACTTCCAAAACTGTTTACTTGTCCTAGCAGTATGAACTT
AAAAACTGTAATAAATCGATTGATAATTGATGAAAAGAATTCCTACTTAT
CAATAAATTCCATTTGATTCGATGATGAATTTACTTTAAATGGGCCCCAC
AGTTTGGGTGACAAAATGAAAGTTACGTCCCAGTACACCAATTGAAA

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_006608	XLOC_006608	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000132	supercontig	sc0000132:221453..239149 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0	0.375119	0.285432	0	0	0.0530458	7.69527e-08	0	0	0.79047	0	1.42065	1.92123	1.43937e-09	0.25751	4.78333	11.2728	1.59173	2.61624	1.34877	2.401	0	0.261717	0	9.25042e-08	0	0	0	0

Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00011768 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: TRAF3 (TNF receptor-associated factor 3 OS=Homo sapiens GN=TRAF3 PE=1 SV=2)

HSP 1 Score: 157.532 bits (397), Expect = 5.022e-40
Identity = 125/498 (25.10%), Postives = 226/498 (45.38%), Query Frame = 2

Query:  134 ALLNSSNSFNRKYKIQPSRCPVDGEALDTNKIFTDTAFQKQIEDVKIICCYSSHGCSWEGTIQSLTEH-REDCEFVNVICEK-GCGSTLLKYQLESHICLDPSTPSLQQELALCNSAF-MENGEFVDDHDCTMESRPGPEGESSRTMPTSSEEPASPSISGDGASLKFCKFIKLGCKFKGNRFEVDLHMDIASETHLDLVCKSINEIKTEYIKKENKVIAKHDNKIKLVQDYICKQNVVIKDLHETNRTLETNSRNMQNQIKDLASKTEMF----------MEEITRLKVQANQLQEEMNE-----------SRDT----------------------------------NFTGSLLWKIKNFSKHMQNAVNKTELSVYSPPFFTSRYGYKVRAQLFVNGLGSQTGEYMAIYFHILPSEHDDILRWPFNHKITFSLLEQTPDQTNVTYTLVPTPNEDSYKRPSDKMSDGKGFNRFISLDALKKGKYIKNDSIFVKIRV 1453
            ALL+SS+           +C    E++  +K+F D   +++I  ++I C   S GC+ +  +  L  H + DC F  + C +  C   +L+  L  H+  + +    +   + C S   M   +  +D DC       P   S +T+   SE  A  S   +  S   C F + GC F+G   ++  H   ++  H++L+ +  N ++ +    +N+ + K +  I+ + + IC   + I+   E  R  E+   ++Q  I   A K +             EE   +K     LQ  + E           +R+T                                  ++ G L+WKI+++ +  Q AV    LS+YS PF+T  +GYK+ A++++NG G   G +++++F I+  E+D +L WPF  K+T  L++Q   + ++     P PN  S+K+P+ +M+   G   F++   L+ G YIK+D+IF+K+ V
Sbjct:   79 ALLSSSSP----------KCTACQESIVKDKVFKDNCCKREILALQIYCRNESRGCAEQLMLGHLLVHLKNDCHFEELPCVRPDCKEKVLRKDLRDHV--EKACKYREATCSHCKSQVPMIALQKHEDTDCPCVVVSCPHKCSVQTL-LRSELSAHLSECVNAPST--CSFKRYGCVFQGTNQQIKAHEASSAVQHVNLLKEWSNSLEKKVSLLQNESVEK-NKSIQSLHNQICSFEIEIERQKEMLRNNESKILHLQRVIDSQAEKLKELDKEIRPFRQNWEEADSMKSSVESLQNRVTELESVDKSAGQVARNTGLLESQLSRHDQMLSVHDIRLADMDLRFQVLETASYNGVLIWKIRDYKRRKQEAVMGKTLSLYSQPFYTGYFGYKMCARVYLNGDGMGKGTHLSLFFVIMRGEYDALLPWPFKQKVTLMLMDQGSSRRHLGDAFKPDPNSSSFKKPTGEMNIASGCPVFVAQTVLENGTYIKDDTIFIKVIV 560

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00011768 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00011768 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
TRAF3	5.022e-40	25.10	TNF receptor-associated factor 3 OS=Homo sapiens G...	[more]

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TCONS_00011768 (transcript) - C. hemisphaerica