TCONS_00011511 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00011511
Unique Name	TCONS_00011511
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	3392

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000128:501676..524141-

transcript sequence

>TCONS_00011511 ID=TCONS_00011511|Name=TCONS_00011511|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3392bp
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GTTATATTATGTTTACCTCATTGTCATACTgtcgaatttttt

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transcript from alignment at sc0000128:501676..524141-

Legend: exon

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>TCONS_00011511 ID=TCONS_00011511|Name=TCONS_00011511|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=22466bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000128:501676..524141- (Clytia hemisphaerica)
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AAACACAACGAAGTCAGAATTTTTTTCAGCGCAGGCAGCACGTTTTTCAG
AGAACAAGGGAAGAAAGAGTGTGAAAGAAAAGAAAGTTTAAAGTGGCATT
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AGAAAATCTAAGAAACCTCTTCAAGTCTCAAATTGTGTCTACACCAGCTG
TTATTGGTAAGAAAATAGACCTTTTTTCAAAGAGGACGTCCTGTTGAATA
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GTTCGGTCAGTAAAAAGTTCGATTAGTTCGATGATATCAAAAATCCTCAT
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GACTTAACAGCTTGACGTTTATTGTACCAGGATATTTGTCTATCCGGAAT
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GATCGAACTTAATCAAACACTCACAATCTTTTAAAAAATCAAAGAGTTCG
ATTAATCTTTTTAATCAAACTTTAATCGTTCGATGGAGTTCGATCAGTTC
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GTACTGATGTGGACCTAGGGACTTCCTTGGTCTTTTTTAACATTTTAGTT
TGGCGGATAATAGAATAAAAATATACCTGATCAACACAACCCAAACCTTC
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GGTTTTAAATTCCACAAGTAATGAACCTCTCATAGCTTTATCTTTATCTG
AATAAATCTGGTTGAAAACCTTCTGTCCTTTAGTCACACAGCCACTAGGA
AATCAAGCTTTCAGAAAAAACAACATCAGTCAGTCGAGGATTATAACCTA
AATAAGAGAATACCCAAGTTAGAGGATTACCTTATTTAGGAGATTTTCAG
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AATAGGGAGGTCAGGGCAAAATTTCAAACTCATCTAATCACTTTGAGAAT
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TGATTCCATGGTCCAATTTACCTGAAATTTTGCACACAAGCTGGAATTCA
TNGTGATTCCATGGTCCGATTTACCTGAAATTTGGCACACAAGCTGGAAT
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CGGTATTTTACAGACCGGTCTGTAAATTACACATTTTGATAAAAAAAAGT
GATCCCGTCGTCCGATTTACCTGAAATTTTGCGCACAAGCTGGGATTCAT
GAAACAAGTTAAAATCTGAATTTTCAAATTTTCAGAATATCTGGCGGTAT
TTTACAGACCAGTCTGTGAATTACACATTCTGGTTCAAAAAAGGGGATCC
TGTGGTCCGATTTACCTGAAATCTTGCACACAAGCTGGGATTCATGAAAA
TAGTCTAAAAAGTTTTCAAAATTGCCTGAATATCTGGCAGTATTTTACAG
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GCAAATTTTGCACACAAGCCACAATTCATTTAAGTCAAAATTGAAAACCT
GAAAACAGTCCCACCCCATGTCTGAAACTTGATGAGATTTTATGAGATTT
CCAAAACTATGCCATTAGTTAACAACAACTTTTTCCCACTTTCTTGAAAA
AAAAAAATTGCAAAGCAGATTCATTGAGATTTTCTTTTCTAGAAAAATTT
CCTTGCAGAGATGTCCAACAAAATTTGAAACTGGCAACTCCTGATACAAA
ATTTCTACAGGTTGATTAAGTTTGGAGAAGTTTTACTTAACTTTGAAATG
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TGAAACAAATTATTTTATGTTACTTTGTTGGAGCTAACATCCCAAAAATC
TGTAATTTTTTTTGCATAAAAAATTTCTGAAAGCTGAGATTCAGTTGTTT
GTTTATATTTTCTGCCATTTTGAGAAAAAAAAGACCAATCAAAAGGCAGN
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TTCTTGGCTCTTGGAGATCTTTCTTTTTTTCACGCGTAGATTCAAAACAA
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TGAAAAAATTATACGGCTAACGATTTTCGCTCAATTGTTATAACCTTTTG
AAAAAGGCCTATGTTTTGAAACGTAGGTGCCGGTTTCCCTGTCCGTCAAA
AATGGTAGGTGTGTTGCGATTATCGGACGATTGTGACTCAAGGAAGCGAC
GAAAACAGCTGGTTTTTTTTTTAAAAGACAGATTAAGAAATTCTCTATAC
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CGACCTTTTGGCCTCCCTACCAAAAACCAAAATAAAATATCTTTTCATTC
TTTTTCAAACTTCGAAAAACCATAAATAGCCTCATTTGCATGTGTTGACG
TAACTTTTAAAATAACGAAGAAACACTCTCAACCTTCAAAATTTTTTCTC
GACCCCCTTATTTAGGAGAGACAAGAGCGACTCACTTTCTGTTTGACCTG
CGTTTTGACCGCGTTTCTTAAATATGGCCCGATCTATGTTATTACTTTTC
ACGAAATTCTCATGATGTAGATCGGCCTTTAGATTGATAGACCCTAACCA
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TGATGGGAAGGCCAAAAATTAACGAAGAAAGAAAAGTCTCCTAGTTAAGA
GAAAGAAATCTCCTACTTAAGAGACCTTCTCTTAAATAGAGTATGCTCTT
ATTTAGGGTATAATCCTCGACTGTCAGTCCACGTGCGTTTGGTTTGGGAA
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ACTTACCTTCCCCAAACATTGAAGAAGCCTCTACCAGTCGGGTGTTTAAG
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AACATGAAAAGTTCTATAATAATATATTAAAAGATCCTGCATCAATGCCG
ACACACAGCCAGAAAATGATAACAAAACCCTCGTTGTAAATTTGTTTACA
TATGACTTGATTTTGCCATCTGCATTTCCAACAAAAACCAGTTGAAAACA
AAACTAAACGAGGCACAGTGGGCCTACTTATCGCGAGGGTGTCGAATACC
ACGTGTTCAATAATAAAATCAACTTTTATTTGCAAAAACAGCAATAATTG
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GAATTTACAACCTTTCGTCCCAAGCAAAAGACGTGCTTTTCTCGCCGCCA
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GCGGTTTTATTTTCATCCAATCAGATCGCGCGATTTCACTTTCGCTTTCT
CTAGTCAATAAGACTGCGGGATTTGAGTCATGTGACATCTCTATTAAAAA
ACCCGCGCAAATTAAAATAGAAATACAGCTGAATTAAGGCCAATATTTTT
GGTTTTTCTAAAGGACAAAAGGTATAGGAAGCTTTACTGAAAGAGGGATA
AGGCTGGGACAATCTATCTAAAAGATATGGACAAAAAAAGGCACTTTTTT
GGGTGATAATTAAGATTTTACTTAGAAACTTTAATTCTCTTACCCCTGTC
TCACCCACCCTGATATGAGCAAGGGAACCATGTTGGCCACCCCTACTGAA
AATTTCAGATCAAAACAAACAAGGAATTAATTCCTGTAACTCGAAGAAAA
TTGGAAAAAGCTGGTTTTTGACTGTTTCTGATCCTGAAGTGCTATTTTTT
GGTAAAAGCTATGCAACTTATGTTTGGATTTCTAGAAAGCTTACCCATTC
ATTGTCAATATATTTTTTATTTGAAAGTAATCTCTTCATGGAATAAAAAG
ATATAGTCAAATCTTGTAGGGTCATTTTTCAAAAAAATTTTGCCAAAATC
GATTTTCGCATTTCGCCATTTTACCCTACGCAAACGCACGTGAGTCATCT
ACAGGATGTATTTGCAACAACAAGGATGAGAGTTACCTGAATCAAGTTAA
AATTCCCAAGACAATTAGGGGTCTTCAACAAAAAACTTTCGAATTTTTTA
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CTTGCGTCGAAGATATTTTTCCGTACAGCAATCCTCACGCCAAGCAAAAT
TTCTTTTGTACCAGCATTCAATTTTTCAATAAGGGTGCAACTGCAAGATG
GGAAAAGAGGCGCATGCGCCAAAATAATTAATAAATTGACGCGAGCGTAA
GCGAGCAAAAGCAAATTTAGCCAAATGAAAGCTAAAAATCAATGGATTAT
GGAGTCATTCACGCCGAGCTGGAATTAAATCTTTACGCCAACTGAAAATC
AATCAATCTTTGTAAGTACCCTTACGCCAATGCGCCAAAAACGTTTCAGT
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GGTCCAACTACATACCGATAAAAAAGCAAGTATTGGGACGAAAATCTTTT
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TTTCACTTGCTTTCACCTTCAAGCACAAATTTGCAACTTTAAAAGTACAG
TTTTGAATTAGCTTTGATAAAAAAAACCATTTTTTCATTGGCCAGCGTGC
TGCCATTTCTTTCGAAATGTTGCGACTTCATCGCGTCTTTTTAACTTTCG
TTTTGATTAACAATATCAATGCGGGTATGAAAAAACTCAATGTTGGTGCA
AATACATAGACAAAAATTCAGCGATGTTGGGTGGAACTTAGGCGAGATCA
GCGCGATGGCGGACATGATTGGAAAAAATTGTGTTTTCGAAGATGTAAAA
GTTGGTTTCGAAAAAGTTTGGCCGATAAGAGCAAGGGGGGAGGGGGTCTG
AAGCTTATCAGCCCAATGCCAATAAAAAACTCAAAAGTTTTTGTCGAAGA
CCCCTTAATTAAAACTTGTGAACTTAAAATGATAAGTGTATCAACCAACC
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TTTATACGCTAAAGTAAAAGTAATTCCGCACATGTAATTGGGTCTGTGTT
TGTTTTGCACTATTTGTCGGGTGTTTTCGCAAATTTAGAAATTTCAGTAC
CCGACAAAACACCCGACAGCACCCGACTGTCGGGTGCACCGGCAGGGTCG
TGTTCTGTCTCTCCCGTAGATCTTTTTCTTGGGAAGTTGATCTTCAAATT
AGTTTTCAAGGTTGGCTTGGCTCAAATTTTCATCTATGGCTCAAATTTTA
GGCAATTTCTCATAGTTTTCGAAAATGTTAATTTCATTAAAAAGCGCCGG
GTCATTTTTTCATGAATCACTTTGGAAGTTTTGTGGCGCATTTTTTTGCT
TGCGAGTCAAGTAAACGATACAGCGCTTTTGCAGCATTAATCTTTGATAC
ACATTTTGGCGGGATGCTAATGTGACTAACTGTCTGTCACAGGTTTCGTT
CTGTACATTTTTTATCCATGGTGAACCCGTTTCCCTGATTTCCTGATAAT
TAAAAATTGGAACTTTCCAGTGGACGCGATTGGGCATACTGCCATCACAA
AATATTTTTCGTAAAAATTTACTGTTATTCTAATGCTAATACCGTAACTT
GGTCTAATGTCGACATCCCTCCTCTAATTCCGACCCCCTTTTTATAAGCT
GAAATTGATAGAAAAGGTTGAAACTGTTTTTCTTGGCTTAGTGGTCACAG
AGGAATAATCCTTTTTCAATTAGTGATTCAAGCTTTCATATTATTCTCGT
CTCTAAAGAAGGGTGTCGGAATTAGACAAGGGATGTCGATATTGGACCAA
CTTACGGTATAATCTACCGTTAACTGCTCCAACTTGGGACGAGTGTACGC
AACATGGGACTTGTTGATATCTTGCCTGTATTTTCACTTACTGTTAAATC
TCTTTGACAACAAATTTGTTTCGATAAGGCTGGGCTTAAAAAATTGTTGG
TTTGCCGTCACCCGACCCTATATTTTGGAGGTGGGTCGGTCGGTCAGAAT
TTTTTTTTATTTTGGCGATTTATGAAATTTTCATCCATGGAAGGGTTAAC
AGTTTGTTTACATTTAGGTAATTTTGAATAAAAAACAGAAGTGCTAGCAG
GGATTTTACGATTCTCATGCTTGAGACAAACAAGATACGAGTTTTGATTT
TTTATTGTTTGAAGTTTTTGAAGGAAAAAAAATCTTCTTTAAAATGGCAA
TAAAATTTTTTGGGTCGGCAGGTTTGGAGGTAGGGTCGGTCGGGTGACGA
CAAACCAACAATTTTTCAAGTCCAGCCTAACTCCACCAAGTTTATCAATC
GTACTTTCTGTCCTAACATGTCACGATAACTTTCACTGATAGCGCACCCT
TTTTAACTTTTGTTTTCATTTAAAATGACCGGACGCCGAATGGAGAATTA
GAGAACGCCCACCGCCCACCGCCTGATGAGATTAACAAATAGTGAGTGTG
TAACTTGCCGCACGAGTGACGTCAAATGCTCACATTACGAATTTTCATAT
TTCGATTTAAAAGCCTACTCGGTGTTAAAGAGAAATCGTGTATTTTTAAT
ATGCCATTCATTAAACTCAAATCAAATGACTTTGGAGGTTCGGTGAAATG
GCAGTGGAATGGCCGTCCCATGTTGCGTAAGATAGTCCCAAGTTGGAGCA
GTTGACGGTAGATAGGAAACATATTAAATTTGACTCTTTTTTTTGCTCGT
ATTTCTAAATTTCACGATAAAAAGAACTATTTACAAATTATTTTCTTTAA
TAGGCCTTGAATTGATATTGACATATTTAATGATGTCATAATCAATGCTG
TGCATATTTTGTCAGCATCGTGCATATTTTGTCAACATGCCACAAAATTA
TTTTCAGATTTTTAATATTTAAAAATTCCCAAAGAACACAGTCAGGGTGT
CCGGAAAATTCCCCCCGGCAAATTCCCACCCAGTGAATTCCCCCTGGTGA
ATTCCCCCCGGCAAATTCCCCCCAGCAAATTCCCCCCAGCAAATTCCCTC
CTGGTGAATTCCCACCCATATATTTTTATAACAATTGACATAGGCACATA
ACATCTTCTAAATTCAATAGAGAATGTAATAAAAAAGAAGTTGACATGTC
GATTGTACATTGACCCTTTGGAAATTTATTGACCTTCTAAAGGATGAAGA
AAACATGGTCCGTGTTGAGATTGTCCAACAACTTGTCGGCTACACCCCAC
CAGCCCAGAGACGGAGATATCGTGATTGTAATCAGCATATTATGACAATA
GTTGAGGATTATCCTAATCGTCAGACAGTCCAATATTTGAGAGCTATAGC
CCACAACATTGCGTTTTGATAGCTTTGTAAATTGGGATTTTTCGATTAAA
AAACATTTCATATTATTTTATATTACTATTATGCTCAAATTGTAGTTTTT
GTTTGTTTGTTTACTCTATTACAACGGTTTGTGTTTTAGATTTTGTCATG
AGAATATACCATAAGATTAAGAATAACAAAAAATAGCAGATTTTATTATT
TTCTCAGATATAAAAACTTGATTAATAAGCATTGTTTCCAGCCTTTCCAT
AGCCTGGATATCCAGGCTGTAAACTATTTCACTGTCTAGTTTTTGATATT
TTATGTTCTAGTTTACAGCCTGGTCTCCCTAGAGCGTTTTGCATTCTCCA
TATGAGAATGCAGTCCGCTTGCTTGAACTCATTTCGCTAAAGCCGTAAGG
GGTGGAGCAATTCTGAAGCAAAAATAGGATAGTCCTCCACTTGCTAGTGA
AGATAGTGCTTTCTGTTACATGAAAACATGAAAAAGAAGAAAACAGAGGC
AAGTTCATTTTCCAAGAAAAAATGGTTGGTTATAGTGATACATGCAAACT
TGTTTATGAGCTTTGGTGTAATCTTTGGATGTTTTAAATGGTCTTAGAAT
TTGTTAGTCTGCTTTTCATTAATTTTTCTTTGGCTGCCCGGGGTTGACTA
AAAAGTTTTGGAAACATGGGTTAGCACTTTCATTCTCTAGGGAGACCAAG
CTCTATAATTTTTAGAACTTTGTATGTTGAGGTAAATTTTGTTTTTTCTA
AAATTTCGAGCTTGGATATCAAGGCTAGCCTTTCCACTGTGATAAGGCTT
TCTGCTGAGATCAAAGGAATATTGCAAAACAGCCGTGAAAAGGTTTTCTT
GAAATTTGTTTTGATGCCCAAATGAAAGATATGAGATAAAAGATAAAACC
ATGATATTCGACGAACAAGAAGTTGATATAATGATATAACAAAAATATAA
TTAAAAGCGGGTTCCTTTCAGGGTACCTTTTGCTCTTTTATTGTTGTTTC
GATTAAAATATTGAATTTAGAACAATCCATCCAACCCCATCTTTTAAAAC
CATTCATTAATACTCATTACGGTCGTATTACACAACCGCGCGCAATCTAA
AACTATGACCAGACTGCACTTTTATTTATAAGAACATTACATAGAAAATG
AGAATTATTCTCTTTCAAGAAAAACTTGATCAAAATTATATTCTCAACTT
CAGTTGAGTTAGAATCTGAGAATGTGTGTCTGTGTGTATGTCCCAAAACT
TTGGGGCATCCTGGAGACTTCAAAAATTGTTCGATTTGGCTAAAACTTTG
CACACTTGTTCTTGGGTGAATATCTGGGGGCATTTTTTTTCATTTTTCAA
AAATTTTGATTTTTGGGGCCTGAGGACGAGTTTTTCGCCAAAACGAGGCT
AAAGCTTTGGAGCAGCCTACAGGCCTCCAAAATGGTCGGATTTGGCACAC
TTGTTCATTGGATGAATATCTGGGGGTCTACAATTGGGCCTATGAATAAT
TTGAAGCCACTGAAGTTGAGCCCAGTGCGTTGCACATGTTCGACTATATA
AAAAATATATGGGAAAAAATTTATCAGGGGGAATTTTCCGGTGGGGGAAT
CACCAGGGGGGAATTCACTGGGTGGGAATTCACCGGGGGGAATTCACCAG
GGGGGAATTTTCTGGGAATCCCAGTCAGTGAGGCTGGAACTTTGATTTTT
GAGGTTTACAAATTTACCAGCTTTTTAGCAATTTTTGCCTCGCTAACCCA
AATCTTGCAACCTCTTTACCTTAAGGAAGATTGAGATTAGAGTTTTTCAG
TGTTCCGAAAAAAATGCGTAATAGAAATTTTTTCATCTTCACAGGATCGA
TTCTCAACAACAAAATACATATTTTGGTCTTTGGGTTTGTTTCTGACGTT
TTTCCTTCAAAGAATATCTATCACTTTCCTTTTCCCCTTGAGCGCGCGAA
AAAAAATGATTAGCTTGCGTTCTCGCGCGGACGAATAAAGATGAGGCAGC
AATCTTGATACTTAGTTTCCGCCTGATTTTGTGCCCAGGATAGAATGGTC
CAAATACTGGGGTATGTCATCCAAATGATAAACTATGTCGTTCTGTAAGT
GTTTATTTTCAGAGAGATACAAATAGTATTTTGAATATTATTAACTTATT
TATTTAAGTATTTTTGATCGAAAATTTAAATATATGGTTAAATAAAAAAC
AAATGATAGCAGTTCTGTTTATTCCTCAAACCCCTGGGAAAAGTTTTTTT
GCTGACTTAGCTATTTTACAAATCACAGAAAAGAACTCCCATAGGAATTC
CGATACATAACCTGATTGGTTAATTTCGGAACAGCTTCAAGAAAGTCATA
ATGGCAGATAATTTTAAAAATTTCTGAGGAAATGTGTGTGTAAAGACGAT
ATCAGCTTAACGTGGAAACTCAGATTTGACCCCCGAGAATTCCCCACAAT
GCTTTGTGCGGAAAAAATTTCATCACAAAGCATTGTGGGCAATTCTCGGA
GGTCAAATCTGAGTTTTCACGTTAAGCTGATATCGTCTATTTATCAATGT
TGATGGCTTGTTTATTCTTTAAAGATAAAAGATAACAGGTATAGCTTTTT
CTAATCCTGGAATATTGAGGTTCCAGCTACACTGCCGGCACAGAATCTCT
TACCGCCCTGTTTAAATTTGCTAAAATAAATCCAGTGAAATGCGTTGAAC
TTAAAACTGGACCAGGATTTTCGTCTCTCGGGGGTCTCTCTATCACGTCC
AGTCAGTACTTCCTTTCACTTTATCAATATTACGCGAACGGCGGTGTGTG
CTAAATTATTTTGGTTTTGCTTTGATTTCAAAAGGTCTTAGCAACAGGAC
GCGCGTACACATAGCAACTAGGCTGGGTAGAAAAATCAAAACATAGAATT
AAAAAAAAAATAGCGATCATCGTATAGAGCACTAAAAAATGCCCCCTTTC
TATGTTTAGTTTGTTCTACCTTGGATTATAACTGAAAATATCTTCAAAAA
ACCTTAGTCCGTCATCAGCCCGCACGGTAATCTTTGCCTGCTTCAATTCT
TAGATAATGAATAAGAGCTAAGCCGTGCTTGTGGGCGATAAATTTATGTT
TACTTATCTTTTATATTTTAGTGGCCAATGAAAAGGATGTTGACTAGATA
TGCTTGGCGCTGGCAAAATATGCACGGCATTGATTATGGCATTATTAAAT
ATGTCAATATAGATTCAACGCCCATTAAAGAAAATAATTTGTAAATCTGT
GTATAAATAGTTCTTTTTATCGTGAAATTCAGATATGAGCAAAAGGGAGT
CAAATTTGATATTTGTTTCCTACCTAGATTATAATATTTGCGTTAGAATA
ACGTTAAATTTTCATGAAAAATATTTGGTACGCCCAATCGCGCCAACGGA
AAAGTTCCAATTTTTAATTATCGGGAAATCACAGCCTCAACTGTGAACAC
CCAGGCTAGTGAAGGGAAGGAGTCGCCCTACTTCTCCATTCTAAAGCCTG
GCCTTTATAGAAAAACAATCGAGATGCACATTATTGGTTGAAACAAAAAA
GGAGAAATCAAAACACACAACAATTTTCTGTCTCAAAAAATTATTCTTGA
TTGTTTTAACTAACTCCAAACTAAAGAAAAGTGTCAATATTACATTTACA
TTTTTTTCTCGCTCAAAAAAGTTTTCTTGAAAAAAATGTGAGTGGATTTG
TGTGTTAAATCTTTTTTTCTGTTTTGAGAATCTGTTGTTGCTTGATCAGG
AATTAATTTCTCCTTACCTTACGTGTCAATTTCTTAACGGAAGCAAACCC
GTTTGAGAAAAACTTTCTTTTGTATTCAGAAAAAACCCTTTGTTTTCTCG
TTACGCAAGTTTCCGCGTAGCTAGCCAGGGATTCTGTAAGGCCTGAATGC
CGGATTCTTCCAATCGTTTATACAAACTAAATTCCATAACAATAATCGTA
TTATCATATAAAGCCTATACTACTGTATTACGGTATTACACACATTATGA
ACGACTCCAGTCTAGTCTTATAAGAGTCTTCCACCAAAACAAGGCTCGAT
CTTTCAGGCATCTTAGAGACTTTAAAAATGATTGAATTTGACAAATATTT
TGTATGCTTTATTTCATCAAAAGAACCTAAAGTTATTGGAAAAAAGTCAT
TGGAAAAATACTAATTGAACGTTGTGTTGTGCGCACGTTCGACTATTAAA
ATGGAATCGATCTAACCTTTTTTTCTCTCTTTCATCTATTTCAGCGAAGA
AAATGTATGGAAATTATGTGACCAAATTCGAAAAACTAACCCTACAGAAC
TAAATGAATATTATGCTGTGTTCATCTCAAATAAGAATCACTCTGTAAGT
ACAATAATTGCAATATTTTATGACATTCCTAATGTCCTTGACTTATAACT
CCCAGCCCCCTGAAAATAACTGACCTTTTTCATCACATCCCCACAAAAAA
TACATCCGCTTAGAAAAAAAAGACCTAGTGTCATGTCAATTCTAATTATT
TTGAAATACTGTAGCTTTTCAGTGGTAGCAACAACATTCTCAAATGAAGT
TGATAACCAAACATATTATTTTTTCCACTGACTGAATATCTTCGCCAAGT
TTGAAAAATTGATAATTCACCAAATCGCATGTTTAGGGCCGAATAAACAC
AATATGATCCAATATATACAAACAAAAAGATATCCTATAAAATTTGATAA
CAATAGAACTATTAATATTTCTTTAGATTCCTCTTTGGATGCAAAAACAA
AGTGAAGATCCATTGACAGCTGTTGTTTGGGTGAGTCAATTTTTGCACAA
ATTTCTTAAGGAAACTAATTTTTGCTTTTACCGCAGTTTTTCGGCAAATT
AGTTCAGNTTTTTGCACAAATTTCTTAAGGAAACTAATTTTTGCTTTTGC
GGCAGTTTTTCGGCAAATTAGTTCAGCCTAATATTAGTTACCTGAAGGTA
ATATAATGTGACAAAAAGGAAACGTTCAAATCAATACTTTTCTCAGTACG
CCTTATAGCCCTTCCGAGGAAAGCTAAATAAAGGAAAACTTAGTAAAGGT
CATTGCATTCTTTATCTAAAAAAAAATCTTCGCCATGTATAGTGGTAATA
TTTTTTTAACTTAGGAACTTACAATTTGACCATTCATGCTTCAGATTCAC
TTACCTGGTATGTGCTAACTATTAGCAAACACTAGCCGAAATAAAGTAAA
TGAACTGGTTCATAGAGCAAAAAAGGTTATTTCCTTTATGGGTTTTAGTC
TTCATTTTACCACCCAAAGTTTTGCTGCAATCACTCAGCTATGGTGACGT
AATGTCAGAAGAACATTACAGTGGTGAATTATCCTGAAAAATATTTCATC
ATTTTTTTCATCATTTTTTTTATCCTCAGGATTATCATGTCATCTTGGTT
CAAAAACCTCCATCAGACAAAGCACTGGTTTACGATCTAGATTCAATCAT
GGGTTTCCCATGCCCGTTGGAATTGTACTTACAACAAGCCATTCAGAGTG
ATGCAACACTAAAAAAAGAATATCACAGGTAACTACAGTAGTTTTTTAAT
TTGAGGCGTGGTAATAAATATTTATTTTAGGCGCTACACTTGTAGAAAAC
AGAGAACAACTTACTCCAGGGGGGAGGGTCGGTAGTAAAATCTCAGACAT
AATGACGTTTAATACGGTGGTGGTGTGACGAAAAATCGAAAATAATTTTA
GTACCCAGGGTAGTTAAATACTAAAATGGGTGGGGTATCTATGTGTTAAA
TGTGAAATTTTTTTACTACCTGGTTAGTTAAAACTGGTAAAATTAGCAAA
TTTTAGCTATTTTTGTAATACTTTTATTTTTTTGGATGTCTTTTCTGAAA
AAATCTGAAAATTTTTATAATTTGGGGCAAAACATTAATTTCTGCACTAA
GTGAAAAATGTGTCACAGAAAAAATCATTTTTTAGCTTTTTTTTGTAAAA
TCAGTCCGAAAAGCAACCAAAAAATAGGTGGTCTCCATGACAAATTGTCC
CAAAAACTACCTCTTCCAAGAGTCTGGGTGGTGGTATGTAAAAATTTGTA
AAAATCCTTTTACTATTCATATATGTCTGAGATTTTACTACCGACCCCCT
TCCCCTGCTTACCTAAGCTTTGATGCCGAAGGCTTGGCCACGCTTAATAT
TTAAAAAAATTTGGGCTACGTGTTAATAATTATAGTAAGATTATTTAGTA
GTTTTTGCAAAAAGCAGGATACGTGTTGAATTTGAAGAATCACTGTTTCA
TTGGTGTCTGATGTAATATAGGCGGAAATCCCAAATTGACGTATTTTGTT
TTATCTCATCGGTTTTCAGTATCCAATACTTGGATTTTCAATTTCTTTTT
CTATCTTTTCTAATTTGTAATTGACAAGAGATCTACTGTTTCCTAGATCT
AGAGATCACTCTAGACTTTATGAGGTTAATCTGCTCACCTGCTTTGGTAT
TATTAGAAAACCCTAACGCTTTTGAGATCCTTAACCCTTATACATACTCC
ATTAAAGGAAGAAATTTCGGCGTAAAGAAAATTTGGCAAATCCGCCAAAT
TTCGTCCTATATTTTAGGCTCCAAAATTGGGTTTTTAAAGATTTTGCTAT
CATTTTTTACCCTAAATATCCTGCAACCGCTAAATTAAATTCCCGCAAAA
TTAAATTTTCTTGGCCATTCACCAAATTGAATTCCCACTAAAATTTCTTT
CTTTAATGTAGGCTTTTAGGGGCGGCTTAGAACTAGGGGGAGGGCTTTTC
ATGTAACATTCCTTAACTTTTTATCTAGTTTGTCTTTTTGAATGAAATTT
GACACACAAGATCCTTGCAATATAAGGTAACTGGTGAAAGAATTGTTTTA
ATGACGTCACTTATCATGTCCAAAATGAGCAAAAACCGAAAATTCCCTTT
GTTCTTCTAAATAGCTATTGTATTCTAACAAAGGCTTTTGAAAAGTTCCA
TTAGTTTAACTTGCTCATTTTATTCTAAATAATCAATAAATTACGGTCTG
AACGCTATATTTTGAATAAAAAATAATTCGAAAATAATTTTTAAAAAATT
TCACTTTTCGTTAAGGTTTATTGAAAAGTTTAATTTTTAACCATTTTATT
TTTCTTAAAGCAAATTAAGACATAAAGGATCAGTTTTTAAATTAACCCTG
TTCTTCTTAATGCACGTTTTGTATCTAGCCTGAGCTTTTGTTAGACAGAG
CTTTTTTTAGCATGATAGTATTGGGTGAAGGCTGGTAGCCTAAAGCTAAC
CCAATCAGATTTCCACTGAAATTGTGACTTTTTAGAACCAAAAAGTTGTG
ATGAATATTTTTGTATGGTATCATCTAAGGAAATATACACGCTTTTTTTT
TATAAGAATCAGTAAATTTTGGCTCAGGCTGGGATGTTCTTAATTTTTTT
GGAATTTTAAGGCTTAAATGTTTATACGATGCTTTTAAGACGCTTAGTTT
TTTTAGTTTTTTTACTTAAAATGGGTGTAAAATTAATACTTTTTTAGTTT
CGGAAATCTGAGGCTCAGATTATTCTTAACATGTTCGTAGGTTTTGGCCA
ATTTTCAGCCCCGTGTTCTTATAAAAATAGAATGTAAACAAAATACGTAT
CAGTTTCAACCCAACCCTCTCTCCTCCTTTTCTTTTACTTTTCCCCCATT
GAAATGTTTTGGTTTATTTATGAAATATCATGGGACGCTTGTAGTATGAT
ATATTTTCTCCCCTTCATTTTCGTTTCATTCATTTTCGATTGAAACAACA
GACCACTCGTTTGAGGCACTTTCTATTTCCTTCTATTCTTTGATTGAAAT
TTTCTTCTTCTACTTAAAAACAAACCAATTTCATAATTCTTTTCGAAGTT
TCATCAAAGAAAAAATTTGAACTTTTCTCTCATATATTTTGCTGAGATCA
GCAACTTTTTTTAATAAAACTAACAATGATAGAGAAATCTGATTAACCAT
CTACTATACAGAGATCAAAGGTCGTGGTTCTGGTATCTTGTCCAGCTTCT
TTAATCACCAGTGCTTTGAAGGAAACTTGGAACCAATTTTTTCTATACTA
AAGCTAACATTACTCTTATTTTGTTCTTATGCTTTGTTAAGTTTTAGCCT
CTTACAATTGCTCTTATAGACAAGCTTTTGGTTTATCAAAACCATTTCTA
TAGTCTTTTAGAATAAGCGTTTTTTATAAGGGCAAACTATATAGGACTTC
AAAATATTAAGAACATGTTAAGAACATTCTAAGGCTTTGTGGGCACCCGA
TTTCTTAGGAAAGTGAACAAAAATACTCAAAAAACGAAAAATAAAAACAT
ATTAAGTACATTTTTAGTCTTAAAACTGAAAGACATCAAGAACATCCCAA
GGCTTCAAAATATTTTGGATGTTCTTATAAAAATAAACATGTAGGCTTTG
GATGGTTATTTCATCATTTATATTCTGGGATCCCTCTTTCTCGACCTTCA
AACAACTTTGTGGGGAGAACATCGTCTACCGTTTTTTTATGTAGAATAAA
ATTCATAATATTTAGAAATTTTATAACTAAGAAAATCCGTCAAATAAAAT
GACACTTTTTAAAAATACAATTTAAGGCTCAGAGCAAACTTTTCCTCTCT
TCTCCTCCCACCTTGCTGTGAGGGTTTGACAGAATGATATAAGACTCATT
CATTATGCAAAATATCTATGTAATAACCTCTATATATTCATTATGTCGGA
TAAAAGTTTGTGGGTTATCTGTCATATAAATCCTATTTTTAATTTTTTTT
ACAATAAAAATTAGATCTCTTGACAATCTGTTTTACTTTAAACGATCAGA
AGACCTCACGTGGTCTAACCACTCTGTATGTTACCCCCCCCAAAAAAAAA
TGGGGATTTTTACTCCCGATATTCTCGAAAACTATTTCATTTTTCGAATT
TTGAGTAGCAGATTGCATAGAATTTAAGTTTTGTATTTCTACAATCGTTG
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TGCAATAACCTCTCCTTACCCTCCGGTGGGAAAGAAATATTGCTTGGCCG
GTCCTTAGCTTGCCCCGACAACATTGTTTGGGAGGAGGTTTAAAAGTTTA
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TTCCTTTACTTAATAATTTTTCAACGGTTATAGGAGTGCTTTGAATTTTT
GTTCTTTCTTCCTAGAAAATTTCGTATTGTACCAGCAGACAAATTTTTGG
AAGTCTTTGCATCAGACAGATCTCACATGTTGAAAGCTAATGGGGAGTAT
ATTCAACCACCACCTAATTATCCGCCCATCAGATCAGCTAGTAAGTTGGT
TTTATTGCATTAATAAGGATATTTCTTAACAGAGAAAATAAAATCTAAAA
TCATTAAGTTTTAAGTCACAAGGGTTGATTATCCATATTATAAAACGCTT
ATACCTTGATTCACTGGTCACAAAATGAAAGTTTTTAAGGTTTAGAATGC
TGGATGGAAAATGGAGCAACTTATTTACCATCCAAAACGCCTAAACTGCG
TGGTTTTCACACAAACGCCAGATTGAAAGTGAAATATATCGGCCAATTTT
GAAAAATATGCCAATTAAGAACAAAGAAAGGCCTAGATTCAATCTGTCAT
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CTCTAGCTCCTTCGGGGCTTTATACTCAATTATTTGATCGACTGTGTTTT
AACCAATATCAGCGTGTGCGCTTGTGAAAAATACTTTCAACAATTTTCTC
GATTATAGCTGAACTGATGAATTTGGACGATTTCATATCAATGGCCCCAA
AGATCGGTGACGGAGTTGTGAAAGATTTGCAAGGGTTTGCCGAATATTTT
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TAAATTATTTTGGTTTTCTTGACTTTGTTTTGAAAGTGGAAAGAGTTGGA
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TTGCACCTTGTTTTAAAAGGTTTGATGAAATGACAACAGGGTGTTCTCTT
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GTGTTTTTTTGCGAAAACAACTTGGTTTATCACCCCCCCCCCAAAATTGT
GGACTGAAAAAGTCATACCTGCTAGCATTCAACTAAGAAGCCTCTGTAGC
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TCAAAGAATTTCTGTCCAACTATCTTCTTTCAGGAGATTTGGGTATATAT
TTGAAATTCAATTTTGTGGGTCACTTCAGTCACCCCGTTCTCATAGACTC
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AAAGTCGATGGAGATTGATATTCCCATGTTTTTATGGCTGGGATTTGAAG
TCCATTATATTCGAGCCAGTAAATTCATTGGGGTAGAAAAAATAGCACAA
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ATAGAGTATAATTTTCCACTGTGGACGATACTTGGCCAATTTTTCCAGTG
AGAAGGGGTCCCAGTGGGTCTGTGAGAAGGGGTCCCAGTGGGTCTGCGAG
AAGGGGGTGTCTTCAGTGACCTCACCGTCCTCAAAATTGCAAATACAGGG
TGTCCCTAATTAAAGTATCGAGTCGAAACACAACTATGAGTAGAAAGTTT
TATGTGCGTGTTCACAAAATTGTATTTTAACCTCTCCCTCTTTTTTCTTT
GTCATTACGATTAATTTATACGTTGTAACTACCTTTTGTAATAAGCCTGT
GTGATGGAGAACGTTCTTATATTCTAGCGATAACACACACAAAAACTTTT
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CATAAATTCGCTACTATCGTAAATGGGATACAAAAGAGGTACTCGAGGTG
ACTGCTCAGGTGATTTTTTAACACACCTTTTCCTGCAGTTTCATCATATC
ATGATTTATAAACATGATTTCTTNTGTGATGGAGAACGTTCTTATATTTT
AGCGATAACACACACAAAAACTTTTCTACTCAATCGCATGTTCAAACTCG
ATACTTTAATTAGGGACACCCTGTACATAAATTCGCTACTATCGTAAACG
GGATACAAAAGAGCTACTCGAGGTGACTGCTCAGGTGACTTTTTTAACAC
ACCTTTTCTGCAGTTTCATCATATCATGATTTATAAACATGATTTCTTTT
TTATCAAAATGTTGTTGTTCTTATTTTATAAGATTAGCATCATCATGTGA
TAGAGCTAAGCTATCGACAGTCAGGTAAAAGACTTTTTTTCAAAATAGCA
ATGTATGCATGTTAATTAGACTTTGATGCAGATTAAATTTTCAGTTGTGC
ATTGATATTCTATCTAAAGATGTGATGGCATTAGAACTTTGATAAGAACA
CTCAAACGGACGTAAAGGTTTTATTTTTGCATAAGTGTTCCCGTTTCATA
TGAGAAACATATTTCATATCAAGACAGTGTCTGCCTATTGTTATATTGTG
CTGATATAAGCAAAAAATATTTTTCTTTTCCTTTTTCTGATCAATCTAGC
TTCACATCCGTGTCAATCCAATGTGAAAAAGCTTGTGAATTAAAATTGAT
GAGTAAGCAAACGATATCCCTCTTATTTAAAAACAAAACCTTTAAAGAAC
CGATTAAGTTTTTAATGACAGTAATTATTCATATCTGTGGAGTGGAGTGC
AGAGCCTTCAAATAACATCACCAGACAATCCCTTCATGTTTGTTTTAAAT
ACTTCAGTTTATCATTACAATATTTTTTAGAGAGTTTACACACCCCTGTC
TCGCAGACCCGGTGGAACTTTTTTGCTGAGTGGGATTTCCAGCTGGGATG
AATTCAAAGTGATTTCCCAGAGGGGTTGAAATTACAGGGTATTTTCCTAA
ATTTTCCAGTGGGGCTGGGGTCCCAGTGGGTCTGTGACACAGAGGTGTAA
TTTTTTACGTTAATATTACAGGCCAAACTTGGTAAAAAATGTTTAACAAA
AAGATTTTTTATGTTATATCTTAAGTTATATTATGTTTACCTCATTGTCA
TACTGTCGAATTTTTT

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_006442	XLOC_006442	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000128	supercontig	sc0000128:501676..524141 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
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Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00011511 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: NTAQ1 (Protein N-terminal glutamine amidohydrolase OS=Homo sapiens GN=WDYHV1 PE=1 SV=2)

HSP 1 Score: 187.578 bits (475), Expect = 2.887e-53
Identity = 86/184 (46.74%), Postives = 122/184 (66.30%), Query Frame = 3

Query:  234 CVYTSCYCEENVWKLCDQIRKTNPTELNEYYAVFISNKNHSIPLWMQKQSEDPLTAVVWDYHVILVQKPPSDKALVYDLDSIMGFPCPLELYLQQAIQSDATLKKEYHRKFRIVPADKFLEVFASDRSHMLKANGEYIQPPPNYPPIRSATELMNLDDFISMAPKIGDGVVKDLQGFAEYFGAR 785
            CVY+SCYCEEN+WKLC+ I+  +   L E YAVFISN+   IP+W Q Q+      V+WDYHV+L+      +  +YDLD+++ FPC  + Y++ A +SD  +  ++ RKFR++ AD +L+ FASDRSHM  ++G + +PPP YP I +    MNL+DFISM PK+G G V  L  F   FG++
Sbjct:   21 CVYSSCYCEENIWKLCEYIKNHDQYPLEECYAVFISNERKMIPIWKQ-QARPGDGPVIWDYHVVLLHVSSGGQNFIYDLDTVLPFPCLFDTYVEDAFKSDDDIHPQFRRKFRVIRADSYLKNFASDRSHMKDSSGNWREPPPPYPCIETGDSKMNLNDFISMDPKVGWGAVYTLSEFTHRFGSK 203

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00011511 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00011511 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
NTAQ1	2.887e-53	46.74	Protein N-terminal glutamine amidohydrolase OS=Hom...	[more]

You are here

TCONS_00011511 (transcript) - C. hemisphaerica