TCONS_00011510 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00011510
Unique NameTCONS_00011510
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length3133

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00011510 ID=TCONS_00011510|Name=TCONS_00011510|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3133bp
GGctttgtcaaaacaaaaacacaacGAAGTCAGAATTTTTTTCAGCGCAG
GCAGCACGTTTTTCAGAGAACAAGGGAAGAAAGAGtgtgaaagaaaagaa
agtttaaAGTGGCATTTTTGGATTATGGAAACTGTGAACGGGGGACAATC
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GTGTCTACACCAGCTGTTATTGCGAAGAAAATGTATGGAAATTATGTGAC
CAAATTCGAAAAACTAACCCTACAGAACTAAATGAATATTATGCTGTGTT
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TTGCGAAAACAACTTGGTTTatcaccccccccccaaaattGTGGACTGAA
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tttctgtccaactatcttctttcaggagatttgggtatatatttgaaatt
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TCATGTTTGTTTTAAATACTTCAGTTTATCATTACAATATTTTTTAGAGA
GtttacacacccctgtctcgcagacccggtggaacttttttgcTGAGTGG
GATTTCCAGCTGGGATGAATTCAAAGTGATTTCCCAGAGGGGTTGAAATT
ACAGGGTATTTtcctaaattttccagtggggctggggtcccagtgggtct
gtgacacagaggtGTAATTTTTTACGTTAATATTACAGGCCAAACTTggt
aaaaaatgtttaacaaaaagattttttatgttATATCTTAAGTTATATTA
TGTTTACCTCATTGTCATACTgtcgaatttttt
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000128:501676..524107-

Legend: exon
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>TCONS_00011510 ID=TCONS_00011510|Name=TCONS_00011510|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=22432bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000128:501676..524107- (Clytia hemisphaerica)
GGCTTTGTCAAAACAAAAACACAACGAAGTCAGAATTTTTTTCAGCGCAG
GCAGCACGTTTTTCAGAGAACAAGGGAAGAAAGAGTGTGAAAGAAAAGAA
AGTTTAAAGTGGCATTTTTGGATTATGGAAACTGTGAACGGGGGACAATC
AACATCTTCAAATGTTAGAAAATCTAAGAAACCTCTTCAAGTCTCAAATT
GTGTCTACACCAGCTGTTATTGGTAAGAAAATAGACCTTTTTTCAAAGAG
GACGTCCTGTTGAATAATTATGTAGTCCAGCTATAAAAACAATGGTAGAG
CCATGCATAATTACTGTATCATGCATATTGTAATAATTATGCATGGTTTT
ATCATTGTTTTTCTGCTGGACTACACCAGACCCGATCAATCGAACTTGTC
GAACCAATCGAACAATCGAACTAATCGAACTCCATCGAACGATTAAAGTT
CGATTAAAAAAATTAATCGAACCTAATCGAACACTCACAATTTTTGAAGG
AATAGCAGTTCGATTAGTTCGGTCAGTAAAAAGTTCGATTAGTTCGATGA
TATCAAAAATCCTCATATCTTTCCTCGCTTGTCCTGGCACGCGATTGCCA
ATTTTGACAGTTCCCGGACTTAACAGCTTGACGTTTATTGTACCAGGATA
TTTGTCTATCCGGAATAAAGTCCGTAGCCCCCCTGCTGCGATTTCGCGCG
CGGCCGAGTGGCGGAATACTGGAATACTACACCCGCCCCAACAAACCGCC
TCTGGCGCTAAAAGGATACAGGAAAAGTGTGTAATCCGTTATCGGAAGTA
ATTTCCCGATTTATATTCCAAATTTGGCTTTGAAAAGAAGCTAATATACG
GTGGCGGAGCAGCACAAACTTGTCGAACAAGATTGATTTATCGAACTGAT
CGAACCGAAACCCATTGATCGAACTTAATCAAACACTCACAATCTTTTAA
AAAATCAAAGAGTTCGATTAATCTTTTTAATCAAACTTTAATCGTTCGAT
GGAGTTCGATCAGTTCGATTGTTCGATTGGTTCGACAAGTTCGATTGATC
GGGTCTGGACTACATAATTATTCAACAGGACGTCCTCTTTTGAAAAAAGG
TCTATACAGAGAATTTTATAACTCAAATCAAATGACGACTTTGGAGGTCC
GGTGAAATGGTGGCCAAATTGCCGTCCCATGTTTTGTCAGATGATCCCAA
GTTAGAGCAGTTGACGGTACTGATGTGGACCTAGGGACTTCCTTGGTCTT
TTTTAACATTTTAGTTTGGCGGATAATAGAATAAAAATATACCTGATCAA
CACAACCCAAACCTTCTGTCTTGCGTTTACTCATCCATCCCAACAATTTT
TGTTTTTGGTTATGTAGGTTTTAAATTCCACAAGTAATGAACCTCTCATA
GCTTTATCTTTATCTGAATAAATCTGGTTGAAAACCTTCTGTCCTTTAGT
CACACAGCCACTAGGAAATCAAGCTTTCAGAAAAAACAACATCAGTCAGT
CGAGGATTATAACCTAAATAAGAGAATACCCAAGTTAGAGGATTACCTTA
TTTAGGAGATTTTCAGTCTCTTATTTAAGAGAACGTTACCTAAACTAGGN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNAGGAGAATTCTGTACGTTTCACCAATTTACTTCAGAGCAGA
CTATTTGCGCAATATGAAAATAAGATCACGTGAAAGATCACGTTTCCGTG
ATTCCGATGACACAAAAATAGGGAGGTCAGGGCAAAATTTCAAACTCATC
TAATCACTTTGAGAATAGGGTAAAAAATGCAAGAAAATGAGGGGTCATAG
ACCTCTCAGAAAAAAGCGGTTCCGAAGATATGCCATTTTTTGTGGCTTAA
AAAACAGCTCTTTCGGTAACAAATGGCTTAGGCTAAATGGGTAAGAGCTG
ACGGCACCAAAAACAGTGAAAAAAAACACTTTTTCAGATTCAAAATTTAA
TATCATTACAACGGCTTATTCAATTGTTCTGAAATTTTCAAGAGAGTTGG
ACATGGATGTAAGCTTCCAAGTTTTGAAAAAAAAGTAAAAAATTATTCTC
TGAAGCATGTGTATTTTACAGACCCACCAGCTAATTCAAAGATCAAAGTA
AAAATTTGATCAAAAACAGGTGTTCCTGGAGTCCGATTGGCTTGAAATTT
TGCACACATGCTTGGATTCATGAAACTAGTCAAAATCTGAAATTTCAAAA
TTTTCGGAATATCTGGCAGTATTTTACAGACCGGTCTGTAAATTACACTA
TCTGGTCAAAAAAAGTTGATTCCATGGTCCAATTTACCTGAAATTTTGCA
CACAAGCTGGAATTCATNGTGATTCCATGGTCCGATTTACCTGAAATTTG
GCACACAAGCTGGAATTCATGAAACTAGTCAATATCTGAAATTAAAAAAA
TTTTTGGAATATCTGGCGGTATTTTACAGACCGGTCTGTAAATTACACAT
TTTGATAAAAAAAAGTGATCCCGTCGTCCGATTTACCTGAAATTTTGCGC
ACAAGCTGGGATTCATGAAACAAGTTAAAATCTGAATTTTCAAATTTTCA
GAATATCTGGCGGTATTTTACAGACCAGTCTGTGAATTACACATTCTGGT
TCAAAAAAGGGGATCCTGTGGTCCGATTTACCTGAAATCTTGCACACAAG
CTGGGATTCATGAAAATAGTCTAAAAAGTTTTCAAAATTGCCTGAATATC
TGGCAGTATTTTACAGACCGGTCTTTCTACACAATTTGTTAATCTAGCGT
GTATATACCTAAATGCGCAAATTTTGCACACAAGCCACAATTCATTTAAG
TCAAAATTGAAAACCTGAAAACAGTCCCACCCCATGTCTGAAACTTGATG
AGATTTTATGAGATTTCCAAAACTATGCCATTAGTTAACAACAACTTTTT
CCCACTTTCTTGAAAAAAAAAAATTGCAAAGCAGATTCATTGAGATTTTC
TTTTCTAGAAAAATTTCCTTGCAGAGATGTCCAACAAAATTTGAAACTGG
CAACTCCTGATACAAAATTTCTACAGGTTGATTAAGTTTGGAGAAGTTTT
ACTTAACTTTGAAATGAAAGTTTTCATTTTCCTATGAAGATTTGAGGGCT
TTCGTTCCTATTTTATTTTGGTAGAAGAAACGTTTGTCTCGGGAGGACAC
AAAAGTGTCAAGGCAGTAGCAAGAGATTGGGAATTTAGAGCAGATTTATC
CAAAAAATAAATAAGCTGAAACAAATTATTTTATGTTACTTTGTTGGAGC
TAACATCCCAAAAATCTGTAATTTTTTTTGCATAAAAAATTTCTGAAAGC
TGAGATTCAGTTGTTTGTTTATATTTTCTGCCATTTTGAGAAAAAAAAGA
CCAATCAAAAGGCAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNCAATCAAAAGGCAGTTCGAACGTCAAATGACG
TCACATACAAATCAAAAAATTTGAAAAAAGTTAATGAGAAAATTTGTCTT
ACCATACCATAGAAAACTGGCTCATACGTTTGAGCAGAGCAAGTTTTGGA
AAAACAAATTATATGGCTGAATAGCAGAAGCATTCAGCTTTGATTTGATA
CCACGCACTAGTAAAAATGCTGTGAAATTCCTACCAAAAATTTCAAACCA
AAACTTATTTTTCAATTTCTTGGCTCTTGGAGATCTTTCTTTTTTTCACG
CGTAGATTCAAAACAAACTTNTTTGATACCACGCACTAGTAAAAATGTTT
TGAAATTCCTACCAAAAATTTCAAACCAAAACTTATTTTTCAATTTCTTG
GCTCTTGGAGATCTTTCTTTTTTTCACGCGTAGATTCAAAACTTGAATCA
CGAGGGAAGACGATAGTGAAAAAATTATACGGCTAACGATTTTCGCTCAA
TTGTTATAACCTTTTGAAAAAGGCCTATGTTTTGAAACGTAGGTGCCGGT
TTCCCTGTCCGTCAAAAATGGTAGGTGTGTTGCGATTATCGGACGATTGT
GACTCAAGGAAGCGACGAAAACAGCTGGTTTTTTTTTTAAAAGACAGATT
AAGAAATTCTCTATACTTAAAAAAAAAAAGGTTTCTGAATATCTTTTTTC
AAAGGTGAGATATTTATCTCCAAACTTCTTTTTTACGAAAATCGAGAATT
GTTACCGCCCCGCGCGCGACCTTTTGGCCTCCCTACCAAAAACCAAAATA
AAATATCTTTTCATTCTTTTTCAAACTTCGAAAAACCATAAATAGCCTCA
TTTGCATGTGTTGACGTAACTTTTAAAATAACGAAGAAACACTCTCAACC
TTCAAAATTTTTTCTCGACCCCCTTATTTAGGAGAGACAAGAGCGACTCA
CTTTCTGTTTGACCTGCGTTTTGACCGCGTTTCTTAAATATGGCCCGATC
TATGTTATTACTTTTCACGAAATTCTCATGATGTAGATCGGCCTTTAGAT
TGATAGACCCTAACCATCCTAGGTCCACGAAAATTAAGCAGAACTCAACC
AAATTTTGCTAGAAGGGAGAAAAATACCTGCTCAGTCGATCTATGAAGTT
CAAAACTTCCGCAAAATGATGGGAAGGCCAAAAATTAACGAAGAAAGAAA
AGTCTCCTAGTTAAGAGAAAGAAATCTCCTACTTAAGAGACCTTCTCTTA
AATAGAGTATGCTCTTATTTAGGGTATAATCCTCGACTGTCAGTCCACGT
GCGTTTGGTTTGGGAACTAACGCGAACTACCCATGTCTAAACTTTTCAAT
ATATCTCCAGAACTAACAGATTTTTTGAAATTCTGTAAAAAGGTCTAAGT
TCCTGAATAGTTTTACCATGTTCTGTGAAAAAATCATAAGCATCAGTCAA
ATACTCGTTCACCTATTTAAGATTGAAGACAAAAATTTGCGAAGAAAAAT
AAACCTTGAGCACAAAAAATGCTTTTTTAAACACTTTTTCCACCAAAAAA
CAAATAACTTTTACAGACTTACCTTCCCCAAACATTGAAGAAGCCTCTAC
CAGTCGGGTGTTTAAGATAAAAACTGCAATTATTGCTCTTTTCGGAAATT
ATTGCCGAAAACGGCAATTTTTTTGACGATGAAATGCTGAATCAGCAAAA
TGTGTTGTCCTTTTAAGGGCAAAGATGTCAGAGGTGTTTGAAAGTAGTAA
AATTGCATCAAGAAAAAGGTTTTTCGGATTTTTAAAAGTGATTTTTTCAA
TTTTTCGTTGCTCAATAACATGAAAAGTTCTATAATAATATATTAAAAGA
TCCTGCATCAATGCCGACACACAGCCAGAAAATGATAACAAAACCCTCGT
TGTAAATTTGTTTACATATGACTTGATTTTGCCATCTGCATTTCCAACAA
AAACCAGTTGAAAACAAAACTAAACGAGGCACAGTGGGCCTACTTATCGC
GAGGGTGTCGAATACCACGTGTTCAATAATAAAATCAACTTTTATTTGCA
AAAACAGCAATAATTGCTAAATACGGCAATTTTTATTTATTTACTTTTTT
ATTTTTCTGCAATAATTTCCGAAAAGAGCAACAATTGCAGTTTTTATCTT
AAACACCCGACTGTCTACAAATTAAAGTAAATGAGATAAGATATTATAAA
ACCTTAAAATCAACCAGAATTTACAACCTTTCGTCCCAAGCAAAAGACGT
GCTTTTCTCGCCGCCATCTTGTTTTTGAATGAGAATTCTTGAGAATTCTA
TTCAGTTCCAGCTCCCGCGGTTTTATTTTCATCCAATCAGATCGCGCGAT
TTCACTTTCGCTTTCTCTAGTCAATAAGACTGCGGGATTTGAGTCATGTG
ACATCTCTATTAAAAAACCCGCGCAAATTAAAATAGAAATACAGCTGAAT
TAAGGCCAATATTTTTGGTTTTTCTAAAGGACAAAAGGTATAGGAAGCTT
TACTGAAAGAGGGATAAGGCTGGGACAATCTATCTAAAAGATATGGACAA
AAAAAGGCACTTTTTTGGGTGATAATTAAGATTTTACTTAGAAACTTTAA
TTCTCTTACCCCTGTCTCACCCACCCTGATATGAGCAAGGGAACCATGTT
GGCCACCCCTACTGAAAATTTCAGATCAAAACAAACAAGGAATTAATTCC
TGTAACTCGAAGAAAATTGGAAAAAGCTGGTTTTTGACTGTTTCTGATCC
TGAAGTGCTATTTTTTGGTAAAAGCTATGCAACTTATGTTTGGATTTCTA
GAAAGCTTACCCATTCATTGTCAATATATTTTTTATTTGAAAGTAATCTC
TTCATGGAATAAAAAGATATAGTCAAATCTTGTAGGGTCATTTTTCAAAA
AAATTTTGCCAAAATCGATTTTCGCATTTCGCCATTTTACCCTACGCAAA
CGCACGTGAGTCATCTACAGGATGTATTTGCAACAACAAGGATGAGAGTT
ACCTGAATCAAGTTAAAATTCCCAAGACAATTAGGGGTCTTCAACAAAAA
ACTTTCGAATTTTTTATCGGCATTGGGCCGATAAGGGGGTGGGGGCCAGT
ATGGATTCCATGAAATCTTGCGTCGAAGATATTTTTCCGTACAGCAATCC
TCACGCCAAGCAAAATTTCTTTTGTACCAGCATTCAATTTTTCAATAAGG
GTGCAACTGCAAGATGGGAAAAGAGGCGCATGCGCCAAAATAATTAATAA
ATTGACGCGAGCGTAAGCGAGCAAAAGCAAATTTAGCCAAATGAAAGCTA
AAAATCAATGGATTATGGAGTCATTCACGCCGAGCTGGAATTAAATCTTT
ACGCCAACTGAAAATCAATCAATCTTTGTAAGTACCCTTACGCCAATGCG
CCAAAAACGTTTCAGTTGTACGCCGAAGATCTTCGGCGTTAGTTACACGA
AATCCATACTGGGGGGGGTCCAACTACATACCGATAAAAAAGCAAGTATT
GGGACGAAAATCTTTTCAGCCAATTTCTTTCTGATTTCGTCCACAAACTC
CACTGAAAGCATACAATTTCACTTGCTTTCACCTTCAAGCACAAATTTGC
AACTTTAAAAGTACAGTTTTGAATTAGCTTTGATAAAAAAAACCATTTTT
TCATTGGCCAGCGTGCTGCCATTTCTTTCGAAATGTTGCGACTTCATCGC
GTCTTTTTAACTTTCGTTTTGATTAACAATATCAATGCGGGTATGAAAAA
ACTCAATGTTGGTGCAAATACATAGACAAAAATTCAGCGATGTTGGGTGG
AACTTAGGCGAGATCAGCGCGATGGCGGACATGATTGGAAAAAATTGTGT
TTTCGAAGATGTAAAAGTTGGTTTCGAAAAAGTTTGGCCGATAAGAGCAA
GGGGGGAGGGGGTCTGAAGCTTATCAGCCCAATGCCAATAAAAAACTCAA
AAGTTTTTGTCGAAGACCCCTTAATTAAAACTTGTGAACTTAAAATGATA
AGTGTATCAACCAACCAAATTTTGTCATTCAATTCCCGAGACAGCGCTTC
GATTTTTAAGGCCTTGTTTATACGCTAAAGTAAAAGTAATTCCGCACATG
TAATTGGGTCTGTGTTTGTTTTGCACTATTTGTCGGGTGTTTTCGCAAAT
TTAGAAATTTCAGTACCCGACAAAACACCCGACAGCACCCGACTGTCGGG
TGCACCGGCAGGGTCGTGTTCTGTCTCTCCCGTAGATCTTTTTCTTGGGA
AGTTGATCTTCAAATTAGTTTTCAAGGTTGGCTTGGCTCAAATTTTCATC
TATGGCTCAAATTTTAGGCAATTTCTCATAGTTTTCGAAAATGTTAATTT
CATTAAAAAGCGCCGGGTCATTTTTTCATGAATCACTTTGGAAGTTTTGT
GGCGCATTTTTTTGCTTGCGAGTCAAGTAAACGATACAGCGCTTTTGCAG
CATTAATCTTTGATACACATTTTGGCGGGATGCTAATGTGACTAACTGTC
TGTCACAGGTTTCGTTCTGTACATTTTTTATCCATGGTGAACCCGTTTCC
CTGATTTCCTGATAATTAAAAATTGGAACTTTCCAGTGGACGCGATTGGG
CATACTGCCATCACAAAATATTTTTCGTAAAAATTTACTGTTATTCTAAT
GCTAATACCGTAACTTGGTCTAATGTCGACATCCCTCCTCTAATTCCGAC
CCCCTTTTTATAAGCTGAAATTGATAGAAAAGGTTGAAACTGTTTTTCTT
GGCTTAGTGGTCACAGAGGAATAATCCTTTTTCAATTAGTGATTCAAGCT
TTCATATTATTCTCGTCTCTAAAGAAGGGTGTCGGAATTAGACAAGGGAT
GTCGATATTGGACCAACTTACGGTATAATCTACCGTTAACTGCTCCAACT
TGGGACGAGTGTACGCAACATGGGACTTGTTGATATCTTGCCTGTATTTT
CACTTACTGTTAAATCTCTTTGACAACAAATTTGTTTCGATAAGGCTGGG
CTTAAAAAATTGTTGGTTTGCCGTCACCCGACCCTATATTTTGGAGGTGG
GTCGGTCGGTCAGAATTTTTTTTTATTTTGGCGATTTATGAAATTTTCAT
CCATGGAAGGGTTAACAGTTTGTTTACATTTAGGTAATTTTGAATAAAAA
ACAGAAGTGCTAGCAGGGATTTTACGATTCTCATGCTTGAGACAAACAAG
ATACGAGTTTTGATTTTTTATTGTTTGAAGTTTTTGAAGGAAAAAAAATC
TTCTTTAAAATGGCAATAAAATTTTTTGGGTCGGCAGGTTTGGAGGTAGG
GTCGGTCGGGTGACGACAAACCAACAATTTTTCAAGTCCAGCCTAACTCC
ACCAAGTTTATCAATCGTACTTTCTGTCCTAACATGTCACGATAACTTTC
ACTGATAGCGCACCCTTTTTAACTTTTGTTTTCATTTAAAATGACCGGAC
GCCGAATGGAGAATTAGAGAACGCCCACCGCCCACCGCCTGATGAGATTA
ACAAATAGTGAGTGTGTAACTTGCCGCACGAGTGACGTCAAATGCTCACA
TTACGAATTTTCATATTTCGATTTAAAAGCCTACTCGGTGTTAAAGAGAA
ATCGTGTATTTTTAATATGCCATTCATTAAACTCAAATCAAATGACTTTG
GAGGTTCGGTGAAATGGCAGTGGAATGGCCGTCCCATGTTGCGTAAGATA
GTCCCAAGTTGGAGCAGTTGACGGTAGATAGGAAACATATTAAATTTGAC
TCTTTTTTTTGCTCGTATTTCTAAATTTCACGATAAAAAGAACTATTTAC
AAATTATTTTCTTTAATAGGCCTTGAATTGATATTGACATATTTAATGAT
GTCATAATCAATGCTGTGCATATTTTGTCAGCATCGTGCATATTTTGTCA
ACATGCCACAAAATTATTTTCAGATTTTTAATATTTAAAAATTCCCAAAG
AACACAGTCAGGGTGTCCGGAAAATTCCCCCCGGCAAATTCCCACCCAGT
GAATTCCCCCTGGTGAATTCCCCCCGGCAAATTCCCCCCAGCAAATTCCC
CCCAGCAAATTCCCTCCTGGTGAATTCCCACCCATATATTTTTATAACAA
TTGACATAGGCACATAACATCTTCTAAATTCAATAGAGAATGTAATAAAA
AAGAAGTTGACATGTCGATTGTACATTGACCCTTTGGAAATTTATTGACC
TTCTAAAGGATGAAGAAAACATGGTCCGTGTTGAGATTGTCCAACAACTT
GTCGGCTACACCCCACCAGCCCAGAGACGGAGATATCGTGATTGTAATCA
GCATATTATGACAATAGTTGAGGATTATCCTAATCGTCAGACAGTCCAAT
ATTTGAGAGCTATAGCCCACAACATTGCGTTTTGATAGCTTTGTAAATTG
GGATTTTTCGATTAAAAAACATTTCATATTATTTTATATTACTATTATGC
TCAAATTGTAGTTTTTGTTTGTTTGTTTACTCTATTACAACGGTTTGTGT
TTTAGATTTTGTCATGAGAATATACCATAAGATTAAGAATAACAAAAAAT
AGCAGATTTTATTATTTTCTCAGATATAAAAACTTGATTAATAAGCATTG
TTTCCAGCCTTTCCATAGCCTGGATATCCAGGCTGTAAACTATTTCACTG
TCTAGTTTTTGATATTTTATGTTCTAGTTTACAGCCTGGTCTCCCTAGAG
CGTTTTGCATTCTCCATATGAGAATGCAGTCCGCTTGCTTGAACTCATTT
CGCTAAAGCCGTAAGGGGTGGAGCAATTCTGAAGCAAAAATAGGATAGTC
CTCCACTTGCTAGTGAAGATAGTGCTTTCTGTTACATGAAAACATGAAAA
AGAAGAAAACAGAGGCAAGTTCATTTTCCAAGAAAAAATGGTTGGTTATA
GTGATACATGCAAACTTGTTTATGAGCTTTGGTGTAATCTTTGGATGTTT
TAAATGGTCTTAGAATTTGTTAGTCTGCTTTTCATTAATTTTTCTTTGGC
TGCCCGGGGTTGACTAAAAAGTTTTGGAAACATGGGTTAGCACTTTCATT
CTCTAGGGAGACCAAGCTCTATAATTTTTAGAACTTTGTATGTTGAGGTA
AATTTTGTTTTTTCTAAAATTTCGAGCTTGGATATCAAGGCTAGCCTTTC
CACTGTGATAAGGCTTTCTGCTGAGATCAAAGGAATATTGCAAAACAGCC
GTGAAAAGGTTTTCTTGAAATTTGTTTTGATGCCCAAATGAAAGATATGA
GATAAAAGATAAAACCATGATATTCGACGAACAAGAAGTTGATATAATGA
TATAACAAAAATATAATTAAAAGCGGGTTCCTTTCAGGGTACCTTTTGCT
CTTTTATTGTTGTTTCGATTAAAATATTGAATTTAGAACAATCCATCCAA
CCCCATCTTTTAAAACCATTCATTAATACTCATTACGGTCGTATTACACA
ACCGCGCGCAATCTAAAACTATGACCAGACTGCACTTTTATTTATAAGAA
CATTACATAGAAAATGAGAATTATTCTCTTTCAAGAAAAACTTGATCAAA
ATTATATTCTCAACTTCAGTTGAGTTAGAATCTGAGAATGTGTGTCTGTG
TGTATGTCCCAAAACTTTGGGGCATCCTGGAGACTTCAAAAATTGTTCGA
TTTGGCTAAAACTTTGCACACTTGTTCTTGGGTGAATATCTGGGGGCATT
TTTTTTCATTTTTCAAAAATTTTGATTTTTGGGGCCTGAGGACGAGTTTT
TCGCCAAAACGAGGCTAAAGCTTTGGAGCAGCCTACAGGCCTCCAAAATG
GTCGGATTTGGCACACTTGTTCATTGGATGAATATCTGGGGGTCTACAAT
TGGGCCTATGAATAATTTGAAGCCACTGAAGTTGAGCCCAGTGCGTTGCA
CATGTTCGACTATATAAAAAATATATGGGAAAAAATTTATCAGGGGGAAT
TTTCCGGTGGGGGAATCACCAGGGGGGAATTCACTGGGTGGGAATTCACC
GGGGGGAATTCACCAGGGGGGAATTTTCTGGGAATCCCAGTCAGTGAGGC
TGGAACTTTGATTTTTGAGGTTTACAAATTTACCAGCTTTTTAGCAATTT
TTGCCTCGCTAACCCAAATCTTGCAACCTCTTTACCTTAAGGAAGATTGA
GATTAGAGTTTTTCAGTGTTCCGAAAAAAATGCGTAATAGAAATTTTTTC
ATCTTCACAGGATCGATTCTCAACAACAAAATACATATTTTGGTCTTTGG
GTTTGTTTCTGACGTTTTTCCTTCAAAGAATATCTATCACTTTCCTTTTC
CCCTTGAGCGCGCGAAAAAAAATGATTAGCTTGCGTTCTCGCGCGGACGA
ATAAAGATGAGGCAGCAATCTTGATACTTAGTTTCCGCCTGATTTTGTGC
CCAGGATAGAATGGTCCAAATACTGGGGTATGTCATCCAAATGATAAACT
ATGTCGTTCTGTAAGTGTTTATTTTCAGAGAGATACAAATAGTATTTTGA
ATATTATTAACTTATTTATTTAAGTATTTTTGATCGAAAATTTAAATATA
TGGTTAAATAAAAAACAAATGATAGCAGTTCTGTTTATTCCTCAAACCCC
TGGGAAAAGTTTTTTTGCTGACTTAGCTATTTTACAAATCACAGAAAAGA
ACTCCCATAGGAATTCCGATACATAACCTGATTGGTTAATTTCGGAACAG
CTTCAAGAAAGTCATAATGGCAGATAATTTTAAAAATTTCTGAGGAAATG
TGTGTGTAAAGACGATATCAGCTTAACGTGGAAACTCAGATTTGACCCCC
GAGAATTCCCCACAATGCTTTGTGCGGAAAAAATTTCATCACAAAGCATT
GTGGGCAATTCTCGGAGGTCAAATCTGAGTTTTCACGTTAAGCTGATATC
GTCTATTTATCAATGTTGATGGCTTGTTTATTCTTTAAAGATAAAAGATA
ACAGGTATAGCTTTTTCTAATCCTGGAATATTGAGGTTCCAGCTACACTG
CCGGCACAGAATCTCTTACCGCCCTGTTTAAATTTGCTAAAATAAATCCA
GTGAAATGCGTTGAACTTAAAACTGGACCAGGATTTTCGTCTCTCGGGGG
TCTCTCTATCACGTCCAGTCAGTACTTCCTTTCACTTTATCAATATTACG
CGAACGGCGGTGTGTGCTAAATTATTTTGGTTTTGCTTTGATTTCAAAAG
GTCTTAGCAACAGGACGCGCGTACACATAGCAACTAGGCTGGGTAGAAAA
ATCAAAACATAGAATTAAAAAAAAAATAGCGATCATCGTATAGAGCACTA
AAAAATGCCCCCTTTCTATGTTTAGTTTGTTCTACCTTGGATTATAACTG
AAAATATCTTCAAAAAACCTTAGTCCGTCATCAGCCCGCACGGTAATCTT
TGCCTGCTTCAATTCTTAGATAATGAATAAGAGCTAAGCCGTGCTTGTGG
GCGATAAATTTATGTTTACTTATCTTTTATATTTTAGTGGCCAATGAAAA
GGATGTTGACTAGATATGCTTGGCGCTGGCAAAATATGCACGGCATTGAT
TATGGCATTATTAAATATGTCAATATAGATTCAACGCCCATTAAAGAAAA
TAATTTGTAAATCTGTGTATAAATAGTTCTTTTTATCGTGAAATTCAGAT
ATGAGCAAAAGGGAGTCAAATTTGATATTTGTTTCCTACCTAGATTATAA
TATTTGCGTTAGAATAACGTTAAATTTTCATGAAAAATATTTGGTACGCC
CAATCGCGCCAACGGAAAAGTTCCAATTTTTAATTATCGGGAAATCACAG
CCTCAACTGTGAACACCCAGGCTAGTGAAGGGAAGGAGTCGCCCTACTTC
TCCATTCTAAAGCCTGGCCTTTATAGAAAAACAATCGAGATGCACATTAT
TGGTTGAAACAAAAAAGGAGAAATCAAAACACACAACAATTTTCTGTCTC
AAAAAATTATTCTTGATTGTTTTAACTAACTCCAAACTAAAGAAAAGTGT
CAATATTACATTTACATTTTTTTCTCGCTCAAAAAAGTTTTCTTGAAAAA
AATGTGAGTGGATTTGTGTGTTAAATCTTTTTTTCTGTTTTGAGAATCTG
TTGTTGCTTGATCAGGAATTAATTTCTCCTTACCTTACGTGTCAATTTCT
TAACGGAAGCAAACCCGTTTGAGAAAAACTTTCTTTTGTATTCAGAAAAA
ACCCTTTGTTTTCTCGTTACGCAAGTTTCCGCGTAGCTAGCCAGGGATTC
TGTAAGGCCTGAATGCCGGATTCTTCCAATCGTTTATACAAACTAAATTC
CATAACAATAATCGTATTATCATATAAAGCCTATACTACTGTATTACGGT
ATTACACACATTATGAACGACTCCAGTCTAGTCTTATAAGAGTCTTCCAC
CAAAACAAGGCTCGATCTTTCAGGCATCTTAGAGACTTTAAAAATGATTG
AATTTGACAAATATTTTGTATGCTTTATTTCATCAAAAGAACCTAAAGTT
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GAATCACTCTGTAAGTACAATAATTGCAATATTTTATGACATTCCTAATG
TCCTTGACTTATAACTCCCAGCCCCCTGAAAATAACTGACCTTTTTCATC
ACATCCCCACAAAAAATACATCCGCTTAGAAAAAAAAGACCTAGTGTCAT
GTCAATTCTAATTATTTTGAAATACTGTAGCTTTTCAGTGGTAGCAACAA
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AATATCTTCGCCAAGTTTGAAAAATTGATAATTCACCAAATCGCATGTTT
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GCTTTTTTTTGTAAAATCAGTCCGAAAAGCAACCAAAAAATAGGTGGTCT
CCATGACAAATTGTCCCAAAAACTACCTCTTCCAAGAGTCTGGGTGGTGG
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TTACTACCGACCCCCTTCCCCTGCTTACCTAAGCTTTGATGCCGAAGGCT
TGGCCACGCTTAATATTTAAAAAAATTTGGGCTACGTGTTAATAATTATA
GTAAGATTATTTAGTAGTTTTTGCAAAAAGCAGGATACGTGTTGAATTTG
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ATTGACGTATTTTGTTTTATCTCATCGGTTTTCAGTATCCAATACTTGGA
TTTTCAATTTCTTTTTCTATCTTTTCTAATTTGTAATTGACAAGAGATCT
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TTAAATTCCCGCAAAATTAAATTTTCTTGGCCATTCACCAAATTGAATTC
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TTTTTGAATGAAATTTGACACACAAGATCCTTGCAATATAAGGTAACTGG
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TAATTTTTAAAAAATTTCACTTTTCGTTAAGGTTTATTGAAAAGTTTAAT
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AACTATATAGGACTTCAAAATATTAAGAACATGTTAAGAACATTCTAAGG
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TCTTTCTCGACCTTCAAACAACTTTGTGGGGAGAACATCGTCTACCGTTT
TTTTATGTAGAATAAAATTCATAATATTTAGAAATTTTATAACTAAGAAA
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ACTTTAAACGATCAGAAGACCTCACGTGGTCTAACCACTCTGTATGTTAC
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AGCTAATGGGGAGTATATTCAACCACCACCTAATTATCCGCCCATCAGAT
CAGCTAGTAAGTTGGTTTTATTGCATTAATAAGGATATTTCTTAACAGAG
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ATATTATAAAACGCTTATACCTTGATTCACTGGTCACAAAATGAAAGTTT
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
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The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000128supercontigsc0000128:501676..524107 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
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Blast
[Close]
BLAST of TCONS_00011510 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: NTAQ1 (Protein N-terminal glutamine amidohydrolase OS=Homo sapiens GN=WDYHV1 PE=1 SV=2)

HSP 1 Score: 187.963 bits (476), Expect = 1.501e-53
Identity = 86/184 (46.74%), Postives = 122/184 (66.30%), Query Frame = 2 
Query:  200 CVYTSCYCEENVWKLCDQIRKTNPTELNEYYAVFISNKNHSIPLWMQKQSEDPLTAVVWDYHVILVQKPPSDKALVYDLDSIMGFPCPLELYLQQAIQSDATLKKEYHRKFRIVPADKFLEVFASDRSHMLKANGEYIQPPPNYPPIRSATELMNLDDFISMAPKIGDGVVKDLQGFAEYFGAR 751
            CVY+SCYCEEN+WKLC+ I+  +   L E YAVFISN+   IP+W Q Q+      V+WDYHV+L+      +  +YDLD+++ FPC  + Y++ A +SD  +  ++ RKFR++ AD +L+ FASDRSHM  ++G + +PPP YP I +    MNL+DFISM PK+G G V  L  F   FG++
Sbjct:   21 CVYSSCYCEENIWKLCEYIKNHDQYPLEECYAVFISNERKMIPIWKQ-QARPGDGPVIWDYHVVLLHVSSGGQNFIYDLDTVLPFPCLFDTYVEDAFKSDDDIHPQFRRKFRVIRADSYLKNFASDRSHMKDSSGNWREPPPPYPCIETGDSKMNLNDFISMDPKVGWGAVYTLSEFTHRFGSK 203
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00011510 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1
Match NameE-valueIdentityDescription
NTAQ11.501e-5346.74Protein N-terminal glutamine amidohydrolase OS=Hom... [more]
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