TCONS_00011381 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00011381
Unique NameTCONS_00011381
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length4585

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00011381 ID=TCONS_00011381|Name=TCONS_00011381|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4585bp
GCATCATCAAACAACCAAAAGAATAAAATCTTTGTTGAAGGAAAGTATGT
ACAAAGGGAAAAACAACCCCCAGTAAAACAGAGTTAAATATTTTGGTAAG
AGGTACTAAGTGTATAGAGCCTAGTTTTAATGCTGAGAGCTGAATTTTCA
GGGCCCACACAACAaccacatttttttcaaataaaaggNTTTATTCAACT
TTCAGACCAATCCAATTATACTTTAACCGCTGACTGTGGAAAAggtgctg
gagtttttatactGATACGAAATAAGATGAGAAACTCACAAATAACTTTG
GTCAACAACATATTCAAACAAAATAAAGCTTCTTTCGGCTCTGCTCTATA
TGGTGAGATATCAGGTCtaattgaaaatgttcaaatagAAGTTCATAACA
GTTCatttattttgaatgaagcTACTTTTTCAGGAGCTggcattttgttt
aaaaagacaaaagaagaTACAGAACGTACACTCCCAATTAATTCATTAAA
ATTAGAtgcattgaattttgaaggaaatGTAGCAAATAAAGGAAAAGGAG
CTGCTTTGTCTCTTTGGAACCTGCGGTATatcattcaaaaaaatgaaata
ttgaactCTAAANTTTTGCATTTATTTTTACAATAGAAATACGATGCTGa
aaacaaagacaaaataaaTTTGCTATATTCACCATTAGAATGCTTAAAAA
TAaggtaTTTGGTTTGCTACTTCTCTTATTTGGAATTTCTCATTTCACAA
ATGCTGATAAAGAACAATGTTCAAGTGATAAAATAATTAGGGATAAAATA
CATGTTGGTTTACATCGAGAGCAAAATTCATCATCATGTCTTCCGTATGA
CCCATTGACAAGATCATATAGCTGTCCCAATCTTGATagtgctttaaaaa
ttaaagataaATTGGCATACAAATGTATCATCGTGTATAGAAACCAAACA
ATTACTGAATCGCATTTTTTATCATCTTCTGATGTTTTCAGTTTGATTTT
GACATCAAATGACACTCAGATCAAAATTGGATTTTATAATATTAATGTTT
CGCTTACATTTAAAGATTGCAATGATATTCGTATATTTGGattcattttt
tttgaagaagatGAATCGACCACTGAAAACAATACTAGAAAAGCTTTGAG
TTTTCCTGGTATACAGAACCTTCAAATTCATCAAGTCACTTTCAATGGAT
TTCATGGACATGCTCTGTCAATATCAAGTATGAAAAGTGGTGTTATAAAT
CTGACAGAAATACAAATGTTTGGTATTGGAGGCCAAACTTTATCAAAGGG
CCTTTATATTGAGTTATCTGGTAGCGATTTACAGTTAATTATTAAAGATT
CTAGCTTTATTCAACTTTCAGACCAATCCAATTATACTTTAACCGCTGAC
TGTGGAAAAggtgctggagtttttatactGATACGAAATAAGATGAGAAA
CTCACAAATAACTTTGGTCAACAACATATTCAAACAAAATAAAGCTTCTT
TCGGCTCTGCTCTATATGGTGAGATATCAGGTCtaattgaaaatgttcaa
atagAAGTTCATAACAGTTCATTTATTTCGAATGAAGCTACTTTTTCAGG
AGCTggcattttgtttaaaaagacaaaagaagaTACAGAACGTACAATCC
CAATTAATTCATTAAAATTAGAtgcattgaattttgaaggaaatGTAGCA
AATAAAGGAAAAGGAGCTGCTTTGTCTCTTTGGAACCTGCGGTATatcat
tcaaaaaaatgaaatattgaactCTAAATTTATGCACAACGAAGCACTGT
TAGCCGGGGATATTTACATTGTCCGTGGCTTTACTACACTTGATAATGTT
AACACGTCAGAATCTAAAcagaaatcatcaaaaaacaaagTTATGAACTA
TGGAAGCATTGTCGTCCATGATACAAAGCTTACTATTCATAAAGCTTATA
TGCATGACCACAAGGGATCTGCTATAATTTTAGACTTTTCAGAGCTCTAT
ATACAGGGTCAGGTCAGAATAACAAACAATACTGCGTTCAATGGCGGAGG
AATAGCACTCTTTAAAAATTCGATCATACATTTAACAGATAGCTCTGATT
TGAATATTTGGTCTAACACTGCAAATGAAAGTGGTGGTGCTGTATATGTC
TCGCCCGCCTATTTTGGTAaatgtttcttccaaaatttgCACCATTTCAA
GGGAAATGTCAAATTATCGTTTAATCAATCACCTAATGGTAGTGCAATAT
ACACAAAGACTTTGCGAGGTTGTGCTGAATATCCTAAAGACATGAAATCT
TACCAACACATATTTAGAAATTTGACAAACTTTACTATAGACTGTTCAAA
GAAAGCAAGATCAAGTTGTATTGCAACAGATGCAAATAGTATTGAAGTAC
ATTATGATGAATGGAATAATACACAACCAGGTGTCCGGTTTCCAATAAAT
ATATCTATGCCAGATGAACTTGGACATGAACAATCTTCCCCATTAATAGT
AAGCATAGAAGAGGGAAATGTTCAATTCTCAAATGGCACAAAGTTCAGTG
TGATCAATAAAAGCTATTTACCATCATTTATTGGGGATCCACATAACCAA
TTCGACTTGAAGATCTATTCATCTTCATATCTCAGTACAACGTTAAAATC
TCTTAAGCTACATGATTGTGATTGGTACCAGAAATTTAATCCCAACAAAA
CTAGATGTCAATGTAAAAGATTTGCTGATGATAACGTCAAATGCTTAGAG
AAAGAACTTTATACAACAGAGGATAAATGGGTTGATGGTGATACCTCTTA
CAACTGCCCAAAAGGATACTGCACATGTCACTATAACCCGTTGGTAAAAT
TCTGTAAATATAATAAGAAAAGTAGATGTGATGAGACAAGGAAAGAAAAC
TCTACTCTTTGCAGTCAATGCAAAGAAGGTTTATCTGTAGTTGCAGGAAG
CATCAAATGTTATAATTGCAGTGGGGATCATAATGGTATTTTNGGTTTAT
CTGTAGTTGTAGGAAGCATCAAATGTTATAATTGCAGTGGGGATCATAAT
GgtattttaaacctttttttgataacttcaGTGATTGACCTATTAGTCGT
TGTTGGTATTCGTTTGTTGAATTATGAGAATTACGCAGCATATTTGGTTC
CTGTAATTTTCTCTTATCGCATGGTGGCACCACTCTTGAGAGACACACCG
CTTAAACTTTGCTCAATAATGCGAATAATTGTATCATTATTTGACCGGAA
TGAAGAAGGTATTGATCAGAATTATATTTGTTTAACACCAGGACTAAATA
ACCTTGAACGCTATTGGTTTGATTTTATCTCAATCTTTTCATGGccattt
gtttatttgattacaaGCTTTATCATTTGGGTTTTACAAATATCAACAAG
GTCATGTGAAAAGTTGAAACTTAAAATTCCACGAGATTCTCAATTTCGAA
CTCAAAGTATCATTGCCCACATCATGTTTTTCGAATTTCTGGAGTTTGCA
TTTGGAGTTTTACACTATATTTCTATCAAAGATGAATATGGCAAATGGTC
GTGCAGAGTTTTTGCTTATGCTGATGTTGAATATCACAAAGGAACACATT
TACCATTGGCTATTGTTGCTTGGGTTGTGATTTTAGTGGTGTTAATATAT
CTGTTCCTTTCCTACTATGATGATTGTttcacaaagataaaaatctTCTT
CAGGTTTCAAAAGATTAgttttaaagaaggaaaatcattttatttcattt
tccgCTTTGTCATGTTTGCTGGTTTTTTAGCTTTTGGTGAATTTTATTTG
TCACCAGGGAGaaatttattaatgacattggTTCTTATGAGTTTGTTGGC
CGTCCAAGTTTATTTTATGCCCTACAAAAACAATTGGTTTAACTGGTTTG
AAATAATAATATTAACAAATTTGATATTGATTGGTGTTCTTACTGAAGAT
GTAATTGATAAAGATGCATGGCAAGCTTGTTTGATCGAGGTTTTAATGTA
TATTCCATTTGCTGGATTTGTTGTATGGATAATCTATTTCATCCACTCGC
TCAATTGTGCCAGGAAATTTCGCCAATGGATTTCTTCTTCAACCATCGTT
ACTACATTACATGGCTGTTTTACCAAATCAGCTAATGTCAAAAAATTACG
CCAGTGCTTTTCTAAAGCAGCTCCAAACTCGGTAAACACTGACGATGGTC
CAATTTTCATTACAGATAAATGATCGAAATTGTGGTAACAATtacatttc
ttctttttttctttgtatgacatagtaaaataatatttttaatttgtatG
AGCATTTCTTATGAGCATTTCTTATGATAAATTTATCGAtttatatgatt
attttaacGATTTTTGGATTCTATTTTTCGATGAATGGGATATTATCAGT
TTATATAAACTACGTAATTGGCCCTTCCATTAATTTCATGCCTCTTTATA
CTGTATAAATAAGTCGTTTAGCATTTTAGCCCATATTAATGGCCGAATGG
AATTCATTTGAGATTTGATAATTATGAAGGTTTTGGACACCCCCTTTCTT
ACAGACCCGGCAaaactttttcagccagtggggat
Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00011381-protein

>TCONS_00011381-protein ID=TCONS_00011381-protein|Name=TCONS_00011381-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=1177bp
MLKNKVFGLLLLLFGISHFTNADKEQCSSDKIIRDKIHVGLHREQNSSSC
LPYDPLTRSYSCPNLDSALKIKDKLAYKCIIVYRNQTITESHFLSSSDVF
SLILTSNDTQIKIGFYNINVSLTFKDCNDIRIFGFIFFEEDESTTENNTR
KALSFPGIQNLQIHQVTFNGFHGHALSISSMKSGVINLTEIQMFGIGGQT
LSKGLYIELSGSDLQLIIKDSSFIQLSDQSNYTLTADCGKGAGVFILIRN
KMRNSQITLVNNIFKQNKASFGSALYGEISGLIENVQIEVHNSSFISNEA
TFSGAGILFKKTKEDTERTIPINSLKLDALNFEGNVANKGKGAALSLWNL
RYIIQKNEILNSKFMHNEALLAGDIYIVRGFTTLDNVNTSESKQKSSKNK
VMNYGSIVVHDTKLTIHKAYMHDHKGSAIILDFSELYIQGQVRITNNTAF
NGGGIALFKNSIIHLTDSSDLNIWSNTANESGGAVYVSPAYFGKCFFQNL
HHFKGNVKLSFNQSPNGSAIYTKTLRGCAEYPKDMKSYQHIFRNLTNFTI
DCSKKARSSCIATDANSIEVHYDEWNNTQPGVRFPINISMPDELGHEQSS
PLIVSIEEGNVQFSNGTKFSVINKSYLPSFIGDPHNQFDLKIYSSSYLST
TLKSLKLHDCDWYQKFNPNKTRCQCKRFADDNVKCLEKELYTTEDKWVDG
DTSYNCPKGYCTCHYNPLVKFCKYNKKSRCDETRKENSTLCSQCKEGLSV
VAGSIKCYNCSGDHNGIXGLSVVVGSIKCYNCSGDHNGILNLFLITSVID
LLVVVGIRLLNYENYAAYLVPVIFSYRMVAPLLRDTPLKLCSIMRIIVSL
FDRNEEGIDQNYICLTPGLNNLERYWFDFISIFSWPFVYLITSFIIWVLQ
ISTRSCEKLKLKIPRDSQFRTQSIIAHIMFFEFLEFAFGVLHYISIKDEY
GKWSCRVFAYADVEYHKGTHLPLAIVAWVVILVVLIYLFLSYYDDCFTKI
KIFFRFQKISFKEGKSFYFIFRFVMFAGFLAFGEFYLSPGRNLLMTLVLM
SLLAVQVYFMPYKNNWFNWFEIIILTNLILIGVLTEDVIDKDAWQACLIE
VLMYIPFAGFVVWIIYFIHSLNCARKFRQWISSSTIVTTLHGCFTKSANV
KKLRQCFSKAAPNSVNTDDGPIFITDK
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000127:128797..134488-

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00011381 ID=TCONS_00011381|Name=TCONS_00011381|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=5692bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000127:128797..134488- (Clytia hemisphaerica)
GCATCATCAAACAACCAAAAGAATAAAATCTTTGTTGAAGGAAAGTATGT ACAAAGGGAAAAACAACCCCCAGTAAAACAGAGTTAAATATTTTGGTAAG AGGTACTAAGTGTATAGAGCCTAGTTTTAATGCTGAGAGCTGAATTTTCA GGGCCCACACAACAACCACATTTTTTTCAAATAAAAGGNTTTATTCAACT TTCAGACCAATCCAATTATACTTTAACCGCTGACTGTGGAAAAGGTGCTG GAGTTTTTATACTGATACGAAATAAGATGAGAAACTCACAAATAACTTTG GTCAACAACATATTCAAACAAAATAAAGCTTCTTTCGGCTCTGCTCTATA TGGTGAGATATCAGGTCTAATTGAAAATGTTCAAATAGAAGTTCATAACA GTTCATTTATTTTGAATGAAGCTACTTTTTCAGGAGCTGGCATTTTGTTT AAAAAGACAAAAGAAGATACAGAACGTACACTCCCAATTAATTCATTAAA ATTAGATGCATTGAATTTTGAAGGAAATGTAGCAAATAAAGGAAAAGGAG CTGCTTTGTCTCTTTGGAACCTGCGGTATATCATTCAAAAAAATGAAATA TTGAACTCTAAANTTTTGCATTTATTTTTACAATAGAAATACGATGCTGA AAACAAAGACAAAATAAATTTGCTATATTCACCATTAGAATGCTTAAAAA TAAGGTAATTTGAAATTTGATATTGTGATAAAGTTGATAGATGATTTTAT CAATCAACTTTATCAATTTCATATTTACAATTTATCAATGCCGCCATTTG GTTTTGAGCTTCATTATTTTTCCTTCCTTTCACTAAATCTTTTATTTTTT TAGGTATTTGGTTTGCTACTTCTCTTATTTGGAATTTCTCATTTCACAAA TGCTGATAAAGAACAATGTTCAAGTGATAAAATAATTAGGGATAAAATAC ATGTTGGTTTACATCGAGAGCAAAATTCATCATCATGTCTTCCGTATGAC CCATTGACAAGATCATATAGCTGTCCCAATCTTGATAGTGCTTTAAAAAT TAAAGATAAATTGGCATACAAATGTATCATCGTGTATAGAAACCAAACAA TTACTGAATCGCATTTTTTATCATCTTCTGATGTTTTCAGTTTGATTTTG ACATCAAATGACACTCAGATCAAAATTGGATTTTATAATATTAATGTTTC GCTTACATTTAAAGATTGCAATGATATTCGTATATTTGGATTCATTTTTT TTGAAGAAGATGAATCGACCACTGAAAACAATACTAGAAAAGCTTTGAGT TTTCCTGGTATACAGAACCTTCAAATTCATCAAGTCACTTTCAATGGATT TCATGGACATGCTCTGTCAATATCAAGTATGAAAAGTGGTGTTATAAATC TGACAGAAATACAAATGTTTGGTATTGGAGGCCAAACTTTATCAAAGGGC CTTTATATTGAGTTATCTGGTAGCGATTTACAGTTAATTATTAAAGATTC TAGCTTTATTCAACTTTCAGACCAATCCAATTATACTTTAACCGCTGACT GTGGAAAAGGTGCTGGAGTTTTTATACTGATACGAAATAAGATGAGAAAC TCACAAATAACTTTGGTCAACAACATATTCAAACAAAATAAAGCTTCTTT CGGCTCTGCTCTATATGGTGAGATATCAGGTCTAATTGAAAATGTTCAAA TAGAAGTTCATAACAGTTCATTTATTTCGAATGAAGCTACTTTTTCAGGA GCTGGCATTTTGTTTAAAAAGACAAAAGAAGATACAGAACGTACAATCCC AATTAATTCATTAAAATTAGATGCATTGAATTTTGAAGGAAATGTAGCAA ATAAAGGAAAAGGAGCTGCTTTGTCTCTTTGGAACCTGCGGTATATCATT CAAAAAAATGAAATATTGAACTCTAAATTTATGCACAACGAAGCACTGTT AGCCGGGGATATTTACATTGTCCGTGGCTTTACTACACTTGATAATGTTA ACACGTCAGAATCTAAACAGAAATCATCAAAAAACAAAGTTATGAACTAT GGAAGCATTGTCGTCCATGATACAAAGCTTACTATTCATAAAGCTTATAT GCATGACCACAAGGGATCTGCTATAATTTTAGACTTTTCAGAGCTCTATA TACAGGGTCAGGTCAGAATAACAAACAATACTGCGTTCAATGGCGGAGGA ATAGCACTCTTTAAAAATTCGATCATACATTTAACAGATAGCTCTGATTT GAATATTTGGTCTAACACTGCAAATGAAAGTGGTGGTGCTGTATATGTCT CGCCCGCCTATTTTGGTAAATGTTTCTTCCAAAATTTGCACCATTTCAAG GGAAATGTCAAATTATCGTTTAATCAATCACCTAATGGTAGTGCAATATA CACAAAGACTTTGCGAGGTTGTGCTGAATATCCTAAAGACATGAAATCTT ACCAACACATATTTAGAAATTTGACAAACTTTACTATAGACTGTTCAAAG AAAGCAAGATCAAGTTGTATTGCAACAGATGCAAATAGTATTGAAGTACA TTATGATGAATGGAATAATACACAACCAGGTGTCCGGTTTCCAATAAATA TATCTATGCCAGATGAACTTGGACATGAACAATCTTCCCCATTAATAGTA AGCATAGAAGAGGGAAATGTTCAATTCTCAAATGGCACAAAGTTCAGTGT GATCAATAAAAGCTATTTACCATCATTTATTGGGGATCCACATAACCAAT TCGACTTGAAGATCTATTCATCTTCATATCTCAGTACAACGTTAAAATCT CTTAAGCTACATGATTGTGATTGGTACCAGAAATTTAATCCCAACAAAAC TAGATGTCAATGTAAAAGATTTGCTGATGATAACGTCAAATGCTTAGAGA AAGAACTTTATACAACAGAGGATAAATGGGTTGATGGTGATACCTCTTAC AACTGCCCAAAAGGATACTGCACATGTCACTATAACCCGTTGGTAAAATT CTGTAAATATAATAAGAAAAGTAGATGTGATGAGACAAGGAAAGAAAACT CTACTCTTTGCAGTCAATGCAAAGAAGGTTTATCTGTAGTTGCAGGAAGC ATCAAATGTTATAATTGCAGTGGGGATCATAATGGTATTTTNGGTTTATC TGTAGTTGTAGGAAGCATCAAATGTTATAATTGCAGTGGGGATCATAATG GTATTTTAAACCTTTTTTTGATAACTTCAGTGATTGACCTATTAGTCGTT GTTGGTATTCGTTTGTTGAATTATGAGAATTACGCAGCATATTTGGTTCC TGTAATTTTCTCTTATCGCATGGTGGCACCACTCTTGAGAGACACACCGC TTAAACTTTGCTCAATAATGCGAATAATTGTATCATTATTTGACCGGAAT GAAGAAGGTATTGATCAGAATTATATTTGTTTAACACCAGGACTAAATAA CCTTGAACGCTATTGGTTTGATTTTATCTCAATCTTTTCATGGCCATTTG TTTATTTGATTACAAGCTTTATCATTTGGGTTTTACAAATATCAACAAGG TCATGTGAAAAGTTGAAACTTAAAATTCCACGAGATTCTCAATTTCGAAC TCAAAGTATCATTGCCCACATCATGTTTTTCGAATTTCTGGAGTTTGCAT TTGGAGTTTTACACTATATTTCTATCAAAGATGAATATGGCAAATGGTCG TGCAGAGTTTTTGCTTATGCTGATGTTGAATATCACAAAGGAACACATTT ACCATTGGCTATTGTTGCTTGGGTTGTGATTTTAGTGGTGTTAATATATC TGTTCCTTTCCTACTATGATGATTGTTTCACAAAGATAAAAATCTTCTTC AGGTTTCAAAAGATTAGTTTTAAAGAAGGAAAATCATTTTATTTCATTTT CCGCTTTGTCATGTTTGCTGGTTTTTTAGCTTTTGGTGAATTTTATTTGT CACCAGGGAGAAATTTATTAATGACATTGGTTCTTATGAGTTTGTTGGCC GTCCAAGTTTATTTTATGCCCTACAAAAACAATTGGTTTAACTGGTTTGA AATAATAATATTAACAAATTTGATATTGATTGGTGTTCTTACTGAAGATG TAATTGATAAAGATGCATGGCAAGCTTGTTTGATCGAGGTTTTAATGTAT ATTCCATTTGCTGGATTTGTTGTATGGATAATCTATTTCATCCACTCGCT CAATTGTGCCAGGAAATTTCGCCAATGGATTTCTTCTTCAACCATCGTTA CTACATTACATGGCTGTTTTACCAAATCAGCTAATGTCAAAAAATTACGC CAGTGCTTTTCTAAAGCAGGTATTAAAATTATGAATTTCCCTTTTTTTAT AGTATTTATTAAAACTTTTAAAGCATTTTAATCCTGTCTGGATATAATTG ACAATTGAAATATTTTTCATTCCTTTTTTTTCAATTTACACGTTTTTTTA TAAGAACATCCAAAATTTTAACTTTTTTAATCTTAACTTTTTGAGTTTCA AGCATGAAAATGTTCTTAACATGTTCTTATTTTCGCCATTTTGTGAGTAT TTTTGACCATTTTCCTAAGAAATTCGGTATTTTAAAGCCTTAAAATGTTC TTAACATGTTCTTATTTTCGCCATTTTGTGAGTATTTTTGACCATTTTCC TAAGAAATTCGGTATTTTAAAGCCTTAAAATGTTCTTAACATGTTCTTAT AACATTTTGGCCATCAAAGCTTTATGTTCTTATATAGTTTGTTCTTATAA AAAAAACGTGTAAATTGAATCATAAAGACAAACTACATTGGTGTTCTTAC TAACTAACCTTCATGCTAGTGCCTAGGTATAGGTAGTATATGAAGCTGAT TTAAAAACACGTGGTATTTTCCTATGAACATCACCTAAAACTTTTTAAGG CTCCAACTTAAGCTTTAGGGCTCAAACTAGCCATCGTCACGTTAAGGGGT TGTGATCTATGAAAAAAAAACAATCTGCGGAAAAGAATTACTTATACTTT AATTGAAACCAGCAAAATTCAATCTACCTGTCACCAAAAATGAACAACTT AGTATCATTACTTTATATCTTAACTTTTAACTTTTCAAGTATTTTATTTC TTGAAAATATCTTTCCAGCGAAACCCTGCAAATAGCTTCTATTACCATTC ATATACTTCACATCGAATCTAAGCACTGATCTTCTAAAGGGCTAATTTCT ATTGAGTCCTAAAATGCCGTCTACAGTTCAAACTTGTACATATCATTTCA TAATATTTATGTTTGTCTATTTTTCAGCTCCAAACTCGGTAAACACTGAC GATGGTCCAATTTTCATTACAGATAAATGATCGAAATTGTGGTAACAATT ACATTTCTTCTTTTTTTCTTTGTATGACATAGTAAAATAATATTTTTAAT TTGTATGAGCATTTCTTATGAGCATTTCTTATGATAAATTTATCGATTTA TATGATTATTTTAACGATTTTTGGATTCTATTTTTCGATGAATGGGATAT TATCAGTTTATATAAACTACGTAATTGGCCCTTCCATTAATTTCATGCCT CTTTATACTGTATAAATAAGTCGTTTAGCATTTTAGCCCATATTAATGGC CGAATGGAATTCATTTGAGATTTGATAATTATGAAGGTTTTGGACACCCC CTTTCTTACAGACCCGGCAAAACTTTTTCAGCCAGTGGGGAT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000127:128797..134488-

>TCONS_00011381 ID=TCONS_00011381|Name=TCONS_00011381|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=10602bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000127:128797..134488- (Clytia hemisphaerica)
CTCCAAACTCGGTAAACACTGACGATGGTCCAATTTTCATTACAGATAAA
TGAGTATTTGGTTTGCTACTTCTCTTATTTGGAATTTCTCATTTCACAAA
TGCTGATAAAGAACAATGTTCAAGTGATAAAATAATTAGGGATAAAATAC
ATGTTGGTTTACATCGAGAGCAAAATTCATCATCATGTCTTCCGTATGAC
CCATTGACAAGATCATATAGCTGTCCCAATCTTGATAGTGCTTTAAAAAT
TAAAGATAAATTGGCATACAAATGTATCATCGTGTATAGAAACCAAACAA
TTACTGAATCGCATTTTTTATCATCTTCTGATGTTTTCAGTTTGATTTTG
ACATCAAATGACACTCAGATCAAAATTGGATTTTATAATATTAATGTTTC
GCTTACATTTAAAGATTGCAATGATATTCGTATATTTGGATTCATTTTTT
TTGAAGAAGATGAATCGACCACTGAAAACAATACTAGAAAAGCTTTGAGT
TTTCCTGGTATACAGAACCTTCAAATTCATCAAGTCACTTTCAATGGATT
TCATGGACATGCTCTGTCAATATCAAGTATGAAAAGTGGTGTTATAAATC
TGACAGAAATACAAATGTTTGGTATTGGAGGCCAAACTTTATCAAAGGGC
CTTTATATTGAGTTATCTGGTAGCGATTTACAGTTAATTATTAAAGATTC
TAGCTTTATTCAACTTTCAGACCAATCCAATTATACTTTAACCGCTGACT
GTGGAAAAGGTGCTGGAGTTTTTATACTGATACGAAATAAGATGAGAAAC
TCACAAATAACTTTGGTCAACAACATATTCAAACAAAATAAAGCTTCTTT
CGGCTCTGCTCTATATGGTGAGATATCAGGTCTAATTGAAAATGTTCAAA
TAGAAGTTCATAACAGTTCATTTATTTCGAATGAAGCTACTTTTTCAGGA
GCTGGCATTTTGTTTAAAAAGACAAAAGAAGATACAGAACGTACAATCCC
AATTAATTCATTAAAATTAGATGCATTGAATTTTGAAGGAAATGTAGCAA
ATAAAGGAAAAGGAGCTGCTTTGTCTCTTTGGAACCTGCGGTATATCATT
CAAAAAAATGAAATATTGAACTCTAAATTTATGCACAACGAAGCACTGTT
AGCCGGGGATATTTACATTGTCCGTGGCTTTACTACACTTGATAATGTTA
ACACGTCAGAATCTAAACAGAAATCATCAAAAAACAAAGTTATGAACTAT
GGAAGCATTGTCGTCCATGATACAAAGCTTACTATTCATAAAGCTTATAT
GCATGACCACAAGGGATCTGCTATAATTTTAGACTTTTCAGAGCTCTATA
TACAGGGTCAGGTCAGAATAACAAACAATACTGCGTTCAATGGCGGAGGA
ATAGCACTCTTTAAAAATTCGATCATACATTTAACAGATAGCTCTGATTT
GAATATTTGGTCTAACACTGCAAATGAAAGTGGTGGTGCTGTATATGTCT
CGCCCGCCTATTTTGGTAAATGTTTCTTCCAAAATTTGCACCATTTCAAG
GGAAATGTCAAATTATCGTTTAATCAATCACCTAATGGTAGTGCAATATA
CACAAAGACTTTGCGAGGTTGTGCTGAATATCCTAAAGACATGAAATCTT
ACCAACACATATTTAGAAATTTGACAAACTTTACTATAGACTGTTCAAAG
AAAGCAAGATCAAGTTGTATTGCAACAGATGCAAATAGTATTGAAGTACA
TTATGATGAATGGAATAATACACAACCAGGTGTCCGGTTTCCAATAAATA
TATCTATGCCAGATGAACTTGGACATGAACAATCTTCCCCATTAATAGTA
AGCATAGAAGAGGGAAATGTTCAATTCTCAAATGGCACAAAGTTCAGTGT
GATCAATAAAAGCTATTTACCATCATTTATTGGGGATCCACATAACCAAT
TCGACTTGAAGATCTATTCATCTTCATATCTCAGTACAACGTTAAAATCT
CTTAAGCTACATGATTGTGATTGGTACCAGAAATTTAATCCCAACAAAAC
TAGATGTCAATGTAAAAGATTTGCTGATGATAACGTCAAATGCTTAGAGA
AAGAACTTTATACAACAGAGGATAAATGGGTTGATGGTGATACCTCTTAC
AACTGCCCAAAAGGATACTGCACATGTCACTATAACCCGTTGGTAAAATT
CTGTAAATATAATAAGAAAAGTAGATGTGATGAGACAAGGAAAGAAAACT
CTACTCTTTGCAGTCAATGCAAAGAAGGTTTATCTGTAGTTGCAGGAAGC
ATCAAATGTTATAATTGCAGTGGGGATCATAATGGTATTTTNGGTTTATC
TGTAGTTGTAGGAAGCATCAAATGTTATAATTGCAGTGGGGATCATAATG
GTATTTTAAACCTTTTTTTGATAACTTCAGTGATTGACCTATTAGTCGTT
GTTGGTATTCGTTTGTTGAATTATGAGAATTACGCAGCATATTTGGTTCC
TGTAATTTTCTCTTATCGCATGGTGGCACCACTCTTGAGAGACACACCGC
TTAAACTTTGCTCAATAATGCGAATAATTGTATCATTATTTGACCGGAAT
GAAGAAGGTATTGATCAGAATTATATTTGTTTAACACCAGGACTAAATAA
CCTTGAACGCTATTGGTTTGATTTTATCTCAATCTTTTCATGGCCATTTG
TTTATTTGATTACAAGCTTTATCATTTGGGTTTTACAAATATCAACAAGG
TCATGTGAAAAGTTGAAACTTAAAATTCCACGAGATTCTCAATTTCGAAC
TCAAAGTATCATTGCCCACATCATGTTTTTCGAATTTCTGGAGTTTGCAT
TTGGAGTTTTACACTATATTTCTATCAAAGATGAATATGGCAAATGGTCG
TGCAGAGTTTTTGCTTATGCTGATGTTGAATATCACAAAGGAACACATTT
ACCATTGGCTATTGTTGCTTGGGTTGTGATTTTAGTGGTGTTAATATATC
TGTTCCTTTCCTACTATGATGATTGTTTCACAAAGATAAAAATCTTCTTC
AGGTTTCAAAAGATTAGTTTTAAAGAAGGAAAATCATTTTATTTCATTTT
CCGCTTTGTCATGTTTGCTGGTTTTTTAGCTTTTGGTGAATTTTATTTGT
CACCAGGGAGAAATTTATTAATGACATTGGTTCTTATGAGTTTGTTGGCC
GTCCAAGTTTATTTTATGCCCTACAAAAACAATTGGTTTAACTGGTTTGA
AATAATAATATTAACAAATTTGATATTGATTGGTGTTCTTACTGAAGATG
TAATTGATAAAGATGCATGGCAAGCTTGTTTGATCGAGGTTTTAATGTAT
ATTCCATTTGCTGGATTTGTTGTATGGATAATCTATTTCATCCACTCGCT
CAATTGTGCCAGGAAATTTCGCCAATGGATTTCTTCTTCAACCATCGTTA
CTACATTACATGGCTGTTTTACCAAATCAGCTAATGTCAAAAAATTACGC
CAGTGCTTTTCTAAAGCAGATGCTTAAAAATAAGCTCCAAACTCGGTAAA
CACTGACGATGGTCCAATTTTCATTACAGATAAATGAGTATTTGGTTTGC
TACTTCTCTTATTTGGAATTTCTCATTTCACAAATGCTGATAAAGAACAA
TGTTCAAGTGATAAAATAATTAGGGATAAAATACATGTTGGTTTACATCG
AGAGCAAAATTCATCATCATGTCTTCCGTATGACCCATTGACAAGATCAT
ATAGCTGTCCCAATCTTGATAGTGCTTTAAAAATTAAAGATAAATTGGCA
TACAAATGTATCATCGTGTATAGAAACCAAACAATTACTGAATCGCATTT
TTTATCATCTTCTGATGTTTTCAGTTTGATTTTGACATCAAATGACACTC
AGATCAAAATTGGATTTTATAATATTAATGTTTCGCTTACATTTAAAGAT
TGCAATGATATTCGTATATTTGGATTCATTTTTTTTGAAGAAGATGAATC
GACCACTGAAAACAATACTAGAAAAGCTTTGAGTTTTCCTGGTATACAGA
ACCTTCAAATTCATCAAGTCACTTTCAATGGATTTCATGGACATGCTCTG
TCAATATCAAGTATGAAAAGTGGTGTTATAAATCTGACAGAAATACAAAT
GTTTGGTATTGGAGGCCAAACTTTATCAAAGGGCCTTTATATTGAGTTAT
CTGGTAGCGATTTACAGTTAATTATTAAAGATTCTAGCTTTATTCAACTT
TCAGACCAATCCAATTATACTTTAACCGCTGACTGTGGAAAAGGTGCTGG
AGTTTTTATACTGATACGAAATAAGATGAGAAACTCACAAATAACTTTGG
TCAACAACATATTCAAACAAAATAAAGCTTCTTTCGGCTCTGCTCTATAT
GGTGAGATATCAGGTCTAATTGAAAATGTTCAAATAGAAGTTCATAACAG
TTCATTTATTTCGAATGAAGCTACTTTTTCAGGAGCTGGCATTTTGTTTA
AAAAGACAAAAGAAGATACAGAACGTACAATCCCAATTAATTCATTAAAA
TTAGATGCATTGAATTTTGAAGGAAATGTAGCAAATAAAGGAAAAGGAGC
TGCTTTGTCTCTTTGGAACCTGCGGTATATCATTCAAAAAAATGAAATAT
TGAACTCTAAATTTATGCACAACGAAGCACTGTTAGCCGGGGATATTTAC
ATTGTCCGTGGCTTTACTACACTTGATAATGTTAACACGTCAGAATCTAA
ACAGAAATCATCAAAAAACAAAGTTATGAACTATGGAAGCATTGTCGTCC
ATGATACAAAGCTTACTATTCATAAAGCTTATATGCATGACCACAAGGGA
TCTGCTATAATTTTAGACTTTTCAGAGCTCTATATACAGGGTCAGGTCAG
AATAACAAACAATACTGCGTTCAATGGCGGAGGAATAGCACTCTTTAAAA
ATTCGATCATACATTTAACAGATAGCTCTGATTTGAATATTTGGTCTAAC
ACTGCAAATGAAAGTGGTGGTGCTGTATATGTCTCGCCCGCCTATTTTGG
TAAATGTTTCTTCCAAAATTTGCACCATTTCAAGGGAAATGTCAAATTAT
CGTTTAATCAATCACCTAATGGTAGTGCAATATACACAAAGACTTTGCGA
GGTTGTGCTGAATATCCTAAAGACATGAAATCTTACCAACACATATTTAG
AAATTTGACAAACTTTACTATAGACTGTTCAAAGAAAGCAAGATCAAGTT
GTATTGCAACAGATGCAAATAGTATTGAAGTACATTATGATGAATGGAAT
AATACACAACCAGGTGTCCGGTTTCCAATAAATATATCTATGCCAGATGA
ACTTGGACATGAACAATCTTCCCCATTAATAGTAAGCATAGAAGAGGGAA
ATGTTCAATTCTCAAATGGCACAAAGTTCAGTGTGATCAATAAAAGCTAT
TTACCATCATTTATTGGGGATCCACATAACCAATTCGACTTGAAGATCTA
TTCATCTTCATATCTCAGTACAACGTTAAAATCTCTTAAGCTACATGATT
GTGATTGGTACCAGAAATTTAATCCCAACAAAACTAGATGTCAATGTAAA
AGATTTGCTGATGATAACGTCAAATGCTTAGAGAAAGAACTTTATACAAC
AGAGGATAAATGGGTTGATGGTGATACCTCTTACAACTGCCCAAAAGGAT
ACTGCACATGTCACTATAACCCGTTGGTAAAATTCTGTAAATATAATAAG
AAAAGTAGATGTGATGAGACAAGGAAAGAAAACTCTACTCTTTGCAGTCA
ATGCAAAGAAGGTTTATCTGTAGTTGCAGGAAGCATCAAATGTTATAATT
GCAGTGGGGATCATAATGGTATTTTNGGTTTATCTGTAGTTGTAGGAAGC
ATCAAATGTTATAATTGCAGTGGGGATCATAATGGTATTTTAAACCTTTT
TTTGATAACTTCAGTGATTGACCTATTAGTCGTTGTTGGTATTCGTTTGT
TGAATTATGAGAATTACGCAGCATATTTGGTTCCTGTAATTTTCTCTTAT
CGCATGGTGGCACCACTCTTGAGAGACACACCGCTTAAACTTTGCTCAAT
AATGCGAATAATTGTATCATTATTTGACCGGAATGAAGAAGGTATTGATC
AGAATTATATTTGTTTAACACCAGGACTAAATAACCTTGAACGCTATTGG
TTTGATTTTATCTCAATCTTTTCATGGCCATTTGTTTATTTGATTACAAG
CTTTATCATTTGGGTTTTACAAATATCAACAAGGTCATGTGAAAAGTTGA
AACTTAAAATTCCACGAGATTCTCAATTTCGAACTCAAAGTATCATTGCC
CACATCATGTTTTTCGAATTTCTGGAGTTTGCATTTGGAGTTTTACACTA
TATTTCTATCAAAGATGAATATGGCAAATGGTCGTGCAGAGTTTTTGCTT
ATGCTGATGTTGAATATCACAAAGGAACACATTTACCATTGGCTATTGTT
GCTTGGGTTGTGATTTTAGTGGTGTTAATATATCTGTTCCTTTCCTACTA
TGATGATTGTTTCACAAAGATAAAAATCTTCTTCAGGTTTCAAAAGATTA
GTTTTAAAGAAGGAAAATCATTTTATTTCATTTTCCGCTTTGTCATGTTT
GCTGGTTTTTTAGCTTTTGGTGAATTTTATTTGTCACCAGGGAGAAATTT
ATTAATGACATTGGTTCTTATGAGTTTGTTGGCCGTCCAAGTTTATTTTA
TGCCCTACAAAAACAATTGGTTTAACTGGTTTGAAATAATAATATTAACA
AATTTGATATTGATTGGTGTTCTTACTGAAGATGTAATTGATAAAGATGC
ATGGCAAGCTTGTTTGATCGAGGTTTTAATGTATATTCCATTTGCTGGAT
TTGTTGTATGGATAATCTATTTCATCCACTCGCTCAATTGTGCCAGGAAA
TTTCGCCAATGGATTTCTTCTTCAACCATCGTTACTACATTACATGGCTG
TTTTACCAAATCAGCTAATGTCAAAAAATTACGCCAGTGCTTTTCTAAAG
CAGATGCTTAAAAATAAGCTCCAAACTCGGTAAACACTGACGATGGTCCA
ATTTTCATTACAGATAAATGAGTATTTGGTTTGCTACTTCTCTTATTTGG
AATTTCTCATTTCACAAATGCTGATAAAGAACAATGTTCAAGTGATAAAA
TAATTAGGGATAAAATACATGTTGGTTTACATCGAGAGCAAAATTCATCA
TCATGTCTTCCGTATGACCCATTGACAAGATCATATAGCTGTCCCAATCT
TGATAGTGCTTTAAAAATTAAAGATAAATTGGCATACAAATGTATCATCG
TGTATAGAAACCAAACAATTACTGAATCGCATTTTTTATCATCTTCTGAT
GTTTTCAGTTTGATTTTGACATCAAATGACACTCAGATCAAAATTGGATT
TTATAATATTAATGTTTCGCTTACATTTAAAGATTGCAATGATATTCGTA
TATTTGGATTCATTTTTTTTGAAGAAGATGAATCGACCACTGAAAACAAT
ACTAGAAAAGCTTTGAGTTTTCCTGGTATACAGAACCTTCAAATTCATCA
AGTCACTTTCAATGGATTTCATGGACATGCTCTGTCAATATCAAGTATGA
AAAGTGGTGTTATAAATCTGACAGAAATACAAATGTTTGGTATTGGAGGC
CAAACTTTATCAAAGGGCCTTTATATTGAGTTATCTGGTAGCGATTTACA
GTTAATTATTAAAGATTCTAGCTTTATTCAACTTTCAGACCAATCCAATT
ATACTTTAACCGCTGACTGTGGAAAAGGTGCTGGAGTTTTTATACTGATA
CGAAATAAGATGAGAAACTCACAAATAACTTTGGTCAACAACATATTCAA
ACAAAATAAAGCTTCTTTCGGCTCTGCTCTATATGGTGAGATATCAGGTC
TAATTGAAAATGTTCAAATAGAAGTTCATAACAGTTCATTTATTTCGAAT
GAAGCTACTTTTTCAGGAGCTGGCATTTTGTTTAAAAAGACAAAAGAAGA
TACAGAACGTACAATCCCAATTAATTCATTAAAATTAGATGCATTGAATT
TTGAAGGAAATGTAGCAAATAAAGGAAAAGGAGCTGCTTTGTCTCTTTGG
AACCTGCGGTATATCATTCAAAAAAATGAAATATTGAACTCTAAATTTAT
GCACAACGAAGCACTGTTAGCCGGGGATATTTACATTGTCCGTGGCTTTA
CTACACTTGATAATGTTAACACGTCAGAATCTAAACAGAAATCATCAAAA
AACAAAGTTATGAACTATGGAAGCATTGTCGTCCATGATACAAAGCTTAC
TATTCATAAAGCTTATATGCATGACCACAAGGGATCTGCTATAATTTTAG
ACTTTTCAGAGCTCTATATACAGGGTCAGGTCAGAATAACAAACAATACT
GCGTTCAATGGCGGAGGAATAGCACTCTTTAAAAATTCGATCATACATTT
AACAGATAGCTCTGATTTGAATATTTGGTCTAACACTGCAAATGAAAGTG
GTGGTGCTGTATATGTCTCGCCCGCCTATTTTGGTAAATGTTTCTTCCAA
AATTTGCACCATTTCAAGGGAAATGTCAAATTATCGTTTAATCAATCACC
TAATGGTAGTGCAATATACACAAAGACTTTGCGAGGTTGTGCTGAATATC
CTAAAGACATGAAATCTTACCAACACATATTTAGAAATTTGACAAACTTT
ACTATAGACTGTTCAAAGAAAGCAAGATCAAGTTGTATTGCAACAGATGC
AAATAGTATTGAAGTACATTATGATGAATGGAATAATACACAACCAGGTG
TCCGGTTTCCAATAAATATATCTATGCCAGATGAACTTGGACATGAACAA
TCTTCCCCATTAATAGTAAGCATAGAAGAGGGAAATGTTCAATTCTCAAA
TGGCACAAAGTTCAGTGTGATCAATAAAAGCTATTTACCATCATTTATTG
GGGATCCACATAACCAATTCGACTTGAAGATCTATTCATCTTCATATCTC
AGTACAACGTTAAAATCTCTTAAGCTACATGATTGTGATTGGTACCAGAA
ATTTAATCCCAACAAAACTAGATGTCAATGTAAAAGATTTGCTGATGATA
ACGTCAAATGCTTAGAGAAAGAACTTTATACAACAGAGGATAAATGGGTT
GATGGTGATACCTCTTACAACTGCCCAAAAGGATACTGCACATGTCACTA
TAACCCGTTGGTAAAATTCTGTAAATATAATAAGAAAAGTAGATGTGATG
AGACAAGGAAAGAAAACTCTACTCTTTGCAGTCAATGCAAAGAAGGTTTA
TCTGTAGTTGCAGGAAGCATCAAATGTTATAATTGCAGTGGGGATCATAA
TGGTATTTTNGGTTTATCTGTAGTTGTAGGAAGCATCAAATGTTATAATT
GCAGTGGGGATCATAATGGTATTTTAAACCTTTTTTTGATAACTTCAGTG
ATTGACCTATTAGTCGTTGTTGGTATTCGTTTGTTGAATTATGAGAATTA
CGCAGCATATTTGGTTCCTGTAATTTTCTCTTATCGCATGGTGGCACCAC
TCTTGAGAGACACACCGCTTAAACTTTGCTCAATAATGCGAATAATTGTA
TCATTATTTGACCGGAATGAAGAAGGTATTGATCAGAATTATATTTGTTT
AACACCAGGACTAAATAACCTTGAACGCTATTGGTTTGATTTTATCTCAA
TCTTTTCATGGCCATTTGTTTATTTGATTACAAGCTTTATCATTTGGGTT
TTACAAATATCAACAAGGTCATGTGAAAAGTTGAAACTTAAAATTCCACG
AGATTCTCAATTTCGAACTCAAAGTATCATTGCCCACATCATGTTTTTCG
AATTTCTGGAGTTTGCATTTGGAGTTTTACACTATATTTCTATCAAAGAT
GAATATGGCAAATGGTCGTGCAGAGTTTTTGCTTATGCTGATGTTGAATA
TCACAAAGGAACACATTTACCATTGGCTATTGTTGCTTGGGTTGTGATTT
TAGTGGTGTTAATATATCTGTTCCTTTCCTACTATGATGATTGTTTCACA
AAGATAAAAATCTTCTTCAGGTTTCAAAAGATTAGTTTTAAAGAAGGAAA
ATCATTTTATTTCATTTTCCGCTTTGTCATGTTTGCTGGTTTTTTAGCTT
TTGGTGAATTTTATTTGTCACCAGGGAGAAATTTATTAATGACATTGGTT
CTTATGAGTTTGTTGGCCGTCCAAGTTTATTTTATGCCCTACAAAAACAA
TTGGTTTAACTGGTTTGAAATAATAATATTAACAAATTTGATATTGATTG
GTGTTCTTACTGAAGATGTAATTGATAAAGATGCATGGCAAGCTTGTTTG
ATCGAGGTTTTAATGTATATTCCATTTGCTGGATTTGTTGTATGGATAAT
CTATTTCATCCACTCGCTCAATTGTGCCAGGAAATTTCGCCAATGGATTT
CTTCTTCAACCATCGTTACTACATTACATGGCTGTTTTACCAAATCAGCT
AATGTCAAAAAATTACGCCAGTGCTTTTCTAAAGCAGATGCTTAAAAATA
AG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_006382XLOC_006382Clytia hemisphaericagene
The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00011381-proteinTCONS_00011381-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00011381-exon-sc0000127-1575043694:133785..134488TCONS_00011381-exon-sc0000127-1575043694:133785..134488Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00011381-exon-sc0000127-1575043694:130170..133635TCONS_00011381-exon-sc0000127-1575043694:130170..133635Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00011381-exon-sc0000127-1575043694:128797..129211TCONS_00011381-exon-sc0000127-1575043694:128797..129211Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00011381-exon-sc0000127-1510915933:133785..134488TCONS_00011381-exon-sc0000127-1510915933:133785..134488Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00011381-exon-sc0000127-1510915933:130170..133635TCONS_00011381-exon-sc0000127-1510915933:130170..133635Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00011381-exon-sc0000127-1510915933:128797..129211TCONS_00011381-exon-sc0000127-1510915933:128797..129211Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00011381-exon-sc0000127-1491911889:133785..134488TCONS_00011381-exon-sc0000127-1491911889:133785..134488Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00011381-exon-sc0000127-1491911889:130170..133635TCONS_00011381-exon-sc0000127-1491911889:130170..133635Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00011381-exon-sc0000127-1491911889:128797..129211TCONS_00011381-exon-sc0000127-1491911889:128797..129211Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000127supercontigsc0000127:128797..134488 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.00531 0.988242 0.367182 0.206557 1.67278 1.05403 1.66772 1.88332 1.85828 1.78557 2.03703 1.17708 2.27001 1.90386 7.31975 5.22199 3.21958 2.73853 3.31804 3.37289 3.206 3.25755 2.59351 4.14952 3.43828 5.40692 4.19103 3.83211 6.45194 5.63836
Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Vocabulary: INTERPRO
TermDefinition
IPR012334Pectin_lyas_fold
IPR011050Pectin_lyase_fold/virulence
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00011381 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top