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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00011380 ID=TCONS_00011380|Name=TCONS_00011380|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3742bp
aaaaaataataaaatttaagaacaaatgACACCAAAATCAATAGCAATGA
CTTACTTATTGTGGATTTTCATAATGTTGGtcaaatcaaaagaaagtttt
cagATTCTCACCACTCAATCGTCATGTGATTCTAACCAATCAACAAAGAT
TTATATCGATCCACAATATGATCAGTGCACCTCCCAAGACTCGAAAACTG
TAAACTGTCCATCCTTATATGCTGCTTATCATTCTACTAAACTATTCgat
aatacttgtattatactGAAGAATTCAGTCGAATCGTACCCATTAAACGT
ATCAATACTTATCCATTCAAGTATCAATTTTGCCATCCAATCTCAGAATC
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GTTTTCTAACGAGGACAGTATACTAACATTTGACCATAGTATAAATATAC
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AAAGACTGTGGGAATGTTGGAATGAATTCACTAAAGGCTAATCGAATCCG
GATTCTTTACCAAGATGTTTATGCATCATCTGGTGATATCCAAATATCAA
ACTCTAATTTCTCTTCTGGGAATAATCAATTTCCAAGTGAGGGTGCCAAA
GCTGCAGAAACCAGATATGGTAAAGGTGGtggaatttcaatgtttttgat
gAATGATATAAATAATACGCTTATCAATATCTCACAATGTAGATTCGATG
GTAATTCAGCTATCTATGGTGGTGGACTGTATTTGTATCTTGAAAAAGGA
ACTTTTAATAACAGACTAACATTAAATGAAACTTATTTCACCAATAACAA
TTCATCGACTTCAGGAGGTGCTCTTTATATTGCTGATTTCTCAAGTAGCC
CTGATAGTAATCAAATCATTATATGCAATTCGAATTTCACTAATAACTTT
TGTGATTTCAATGCAGGAGGATCTGCTATCTACGCTTACAATGGTTATCT
AAAATTCTTAGGTAACAATCGTATCGAACAAAATAACGGAACTGCAATGG
TTCTTGGTGCTACAGAGAGCTACATTAATGGTAACCTAACGCTTGCTAAC
AACAGCGGAAAATATGGTGGTGCTGCATTTTTATACAAGTGTGCCAGGTT
CAAAATAACCCCCACGTCTAATATAGTCTTCAGTAACAACAAAGCATCCA
GAGATGGAGGTGCGATGTTTGtgttccattttttcaaaaagaaaagttgt
aaatgttttttcgcTCCACAGAATAGAACCTCTTTTACCGGATCCATCAA
TTTTACTTATAACACTGCTGCAGTTTATGGTAGACATCTTTACTCATCCA
CCATGAAACTATGTCAGCAATTAAATTTCAACGATACACACAAAGAACGT
ATTTTCTTTACTGGAGAACCTCTAAATGCTGTTAGTACGGCAGCCGATAA
ATTCACACTCGTATCATCTCAATGGCGAAACATAGTGCctggtttttatt
ttaaaccTGAAATCAACATCACGAATGAGAAAGATCAAATTGTTAAATCA
CAAGTTCAAATGATCAGGAAAATTAGAAATACGTCTGAAGATTTAGATAA
TTCTACAAATGGTTTCGgtttattgaataaaaatacaTATGTTGTTGGGC
CAGACCACACTATCAATGTGGCTCTACAAGGACAATCATCTCAGAATTAT
ACACTTGATTTCTACGTTAGTAGTGAATTAGGAGAATTAACACAAAATTT
AACAGTGAAATTATCCAAATGCCCACCGCTGTATTATCtacatcaaaaca
aatgcaAATGTAATGCTAGTGGATTTATTGCTAAATGTACGTCCGATAAT
GCGCTACACATGCTACCAAATTGTTGGATTTCACCACAAGGTAACTCTTA
CGCATGCCCAGTAGATTATTGCGCTATATGTAGCGAACAGAGTAAATTGT
CAACTATCCAAAAATATTGTACGCATAATTTTACACAACCTTGTGACGTC
ACCCGAAATCAAGCATCACGATTATGTAGCCAGTGTCGTAAGAATCACAG
TACAACCATTGGTGGTCGACAATGCGCAGATTGCCGAGGTACGAATAATC
ACTATTGGACACCGATCCTGGCTATTGTCATTGTTAGCCTTTTCCTATTG
TTCATCGCTGCATCAAACTATACTACATATGCGTCTTTTTATCTACCCCT
TATCTTGTTCTATCAATTAGTAACATTGGTAATGACGACCACAAACAGCC
TTggtaatttttcagttttcttaTTCACCATTTTCCATGGTGATGACAGA
TTCATGTATCCATTTTGCTTCATAGATGGTCTTGATGATTTACATAAGAT
CTGGGTCCGATTCATTTCAGCTGCATTGTGGGTCATCCTTTATGGAGTTT
TATGCTTTATCTCAGCACGGGTGTTTCAGAATCAGATGAATCTCAAGCTA
GCGGTTTTACGATCCTGGCCAATCGTGTTTTTACTGTATTATATCGATat
catgaaattttcagtaaaTGCTTTAAAAGGGATGACTATTGATGATCGTA
TGTGTGTTTTCAACTATGCTGAAGAGGAGTTTAATGGACAAAGACATCGT
CCATTATTTTGGTGTAGTATTATAACCACAAGTTGTACTGGATTAATGAT
GCTTGGAATCTTCATGTTGAAAGTGTATTGTAAACGAAATCAAACTATAC
ACGAGTATGTTCATATTGAAGCCAAATCTTTAGATTCGATTGTCAGTCGT
CGAAAGATAATCTTAATATTCGGTTTCTACACCCTATATGTTACCCTCTT
CACGCTCATCATGGAGCTCACCGGTACGAATGCTCTCTTGTTGATTCTTT
CGATCACTTTCACTGGCATATTTGTTTATAAACAACCCTATCAATCCAAA
TTGTATAATTATTATGAGATATTGGTTTATGTTGATTTTATGATCATTGG
TATTTTAAGTAATAATCCAGATAACGAGCATTCAGCTATGGATAATTACA
CTTCGACTTTTGTTGAGGTTTTGATAGTGTTTCCATTTGTTGGTTGTCTT
GTATGCATGCTGATTACTTACTTTGGAACATGGAAATCAAATCAGCAGAA
TCTTGGAAATACAAGGAGTCATTTGATCCCATCACGCGTCATGGAGAGCT
TGTAAATTGTGGAAGACATTGTTTACTATGGGCTGTGGTCTGTGGCTGTG
GTTACGAATCGTTTATGTATTAACTGTAGTGTGGTTTAAGGCTGTTTCca
ctgagctttatataaacCCTAGGGGCAGTTTCAAAATATCGGCCAAGCTA
AATCTTTCGATAGGAGCTTGGTTGGAGTGTGTTACCCTAATGGTAGTAGC
AGTACTCAATCGCGGTGTTATGCATACCGCTACAATCTACTCTGTAATAT
TTTAGCAGTAAACCTTAAAAACAACTCTTTAGCTATGCTTATAAGTTCCT
TAAGTCCCCTTCCTCCAAATGTTTATGATTGATAAGCCCCTTAAACAACC
ATTGAAGTTGAGGGGAGGGGCTTTAcatcaaaaacataaaataccACTGT
TTACTGCCATAAATATTATAGGACTTTTTGTAGATATACTTTTCATTCGT
TTTATGTAGCACTGCTGAACATACAACAAAGTTTAAGAACTATAGTGGCA
TCTTTTTGTGGGTACCATTTCCAAGCACATACTTTGAGCAGT Run BLAST on NCBI protein sequence of TCONS_00011380-protein >TCONS_00011380-protein ID=TCONS_00011380-protein|Name=TCONS_00011380-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=1059bp
MTPKSIAMTYLLWIFIMLVKSKESFQILTTQSSCDSNQSTKIYIDPQYDQ
CTSQDSKTVNCPSLYAAYHSTKLFDNTCIILKNSVESYPLNVSILIHSSI
NFAIQSQNQTSNIDCQGKPYNISITHCSNINFKGISFTNCPSFSNEDSIL
TFDHSINIQLTNIIFHGNESQNILIKDCGNVGMNSLKANRIRILYQDVYA
SSGDIQISNSNFSSGNNQFPSEGAKAAETRYGKGGGISMFLMNDINNTLI
NISQCRFDGNSAIYGGGLYLYLEKGTFNNRLTLNETYFTNNNSSTSGGAL
YIADFSSSPDSNQIIICNSNFTNNFCDFNAGGSAIYAYNGYLKFLGNNRI
EQNNGTAMVLGATESYINGNLTLANNSGKYGGAAFLYKCARFKITPTSNI
VFSNNKASRDGGAMFVFHFFKKKSCKCFFAPQNRTSFTGSINFTYNTAAV
YGRHLYSSTMKLCQQLNFNDTHKERIFFTGEPLNAVSTAADKFTLVSSQW
RNIVPGFYFKPEINITNEKDQIVKSQVQMIRKIRNTSEDLDNSTNGFGLL
NKNTYVVGPDHTINVALQGQSSQNYTLDFYVSSELGELTQNLTVKLSKCP
PLYYLHQNKCKCNASGFIAKCTSDNALHMLPNCWISPQGNSYACPVDYCA
ICSEQSKLSTIQKYCTHNFTQPCDVTRNQASRLCSQCRKNHSTTIGGRQC
ADCRGTNNHYWTPILAIVIVSLFLLFIAASNYTTYASFYLPLILFYQLVT
LVMTTTNSLGNFSVFLFTIFHGDDRFMYPFCFIDGLDDLHKIWVRFISAA
LWVILYGVLCFISARVFQNQMNLKLAVLRSWPIVFLLYYIDIMKFSVNAL
KGMTIDDRMCVFNYAEEEFNGQRHRPLFWCSIITTSCTGLMMLGIFMLKV
YCKRNQTIHEYVHIEAKSLDSIVSRRKIILIFGFYTLYVTLFTLIMELTG
TNALLLILSITFTGIFVYKQPYQSKLYNYYEILVYVDFMIIGILSNNPDN
EHSAMDNYTSTFVEVLIVFPFVGCLVCMLITYFGTWKSNQQNLGNTRSHL
IPSRVMESL Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000127:121432..126439- Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00011380 ID=TCONS_00011380|Name=TCONS_00011380|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=5008bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000127:121432..126439- (Clytia hemisphaerica)
AAAAAATAATAAAATTTAAGAACAAATGACACCAAAATCAATAGCAATGA
CTTACTTATTGTGGATTTTCATAATGTTGGTCAAATCAAAAGAAAGTTTT
CAGATTCTCACCACTCAATCGTCATGTGATTCTAACCAATCAACAAAGAT
TTATATCGATCCACAATATGATCAGTGCACCTCCCAAGACTCGAAAACTG
TAAACTGTCCATCCTTATATGCTGCTTATCATTCTACTAAACTATTCGAT
AATACTTGTATTATACTGAAGAATTCAGTCGAATCGTACCCATTAAACGT
ATCAATACTTATCCATTCAAGTATCAATTTTGCCATCCAATCTCAGAATC
AAACATCCAACATTGATTGTCAAGGCAAACCCTATAACATATCAATCACT
CATTGCTCGAATATCAATTTTAAAGGAATTTCATTTACAAATTGCCCTTC
GTTTTCTAACGAGGACAGTATACTAACATTTGACCATAGTATAAATATAC
AGTTAACGAATATCATATTCCATGGAAACGAGAGTCAAAACATCTTGATA
AAAGACTGTGGGAATGTTGGAATGAATTCACTAAAGGCTAATCGAATCCG
GATTCTTTACCAAGATGTTTATGCATCATCTGGTGATATCCAAATATCAA
ACTCTAATTTCTCTTCTGGGAATAATCAATTTCCAAGTGAGGGTGCCAAA
GCTGCAGAAACCAGATATGGTAAAGGTGGTGGAATTTCAATGTTTTTGAT
GAATGATATAAATAATACGCTTATCAATATCTCACAATGTAGATTCGATG
GTAATTCAGCTATCTATGGTGGTGGACTGTATTTGTATCTTGAAAAAGGA
ACTTTTAATAACAGACTAACATTAAATGAAACTTATTTCACCAATAACAA
TTCATCGACTTCAGGAGGTGCTCTTTATATTGCTGATTTCTCAAGTAGCC
CTGATAGTAATCAAATCATTATATGCAATTCGAATTTCACTAATAACTTT
TGTGATTTCAATGCAGGAGGATCTGCTATCTACGCTTACAATGGTTATCT
AAAATTCTTAGGTAACAATCGTATCGAACAAAATAACGGAACTGCAATGG
TTCTTGGTGCTACAGAGAGCTACATTAATGGTAACCTAACGCTTGCTAAC
AACAGCGGAAAATATGGTGGTGCTGCATTTTTATACAAGTGTGCCAGGTT
CAAAATAACCCCCACGTCTAATATAGTCTTCAGTAACAACAAAGCATCCA
GAGATGGAGGTGCGATGTTTGTGTTCCATTTTTTCAAAAAGAAAAGTTGT
AAATGTTTTTTCGCTCCACAGAATAGAACCTCTTTTACCGGATCCATCAA
TTTTACTTATAACACTGCTGCAGTTTATGGTAGACATCTTTACTCATCCA
CCATGAAACTATGTCAGCAATTAAATTTCAACGATACACACAAAGAACGT
ATTTTCTTTACTGGAGAACCTCTAAATGCTGTTAGTACGGCAGCCGATAA
ATTCACACTCGTATCATCTCAATGGCGAAACATAGTGCCTGGTTTTTATT
TTAAACCTGAAATCAACATCACGAATGAGAAAGATCAAATTGTTAAATCA
CAAGTTCAAATGATCAGGAAAATTAGAAATACGTCTGAAGATTTAGATAA
TTCTACAAATGGTTTCGGTTTATTGAATAAAAATACATATGTTGTTGGGC
CAGACCACACTATCAATGTGGCTCTACAAGGACAATCATCTCAGAATTAT
ACACTTGATTTCTACGTTAGTAGTGAATTAGGAGAATTAACACAAAATTT
AACAGTGAAATTATCCAAATGCCCACCGCTGTATTATCTACATCAAAACA
AATGCAAATGTAATGCTAGTGGATTTATTGCTAAATGTACGTCCGATAAT
GCGCTACACATGCTACCAAATTGTTGGATTTCACCACAAGGTAACTCTTA
CGCATGCCCAGTAGATTATTGCGCTATATGTAGCGAACAGAGTAAATTGT
CAACTATCCAAAAATATTGTACGCATAATTTTACACAACCTTGTGACGTC
ACCCGAAATCAAGCATCACGATTATGTAGCCAGTGTCGTAAGAATCACAG
TACAACCATTGGTGGTCGACAATGCGCAGATTGCCGAGGCACAAATAATC
ACTATTGGACGCCGATCCTTGCTATTGTCATTGTTACNCATTGCGCATAT
TGCCGAGGTACGAATAATCACTATTGGACACCGATCCTGGCTATTGTCAT
TGTTAGCCTTTTCCTATTGTTCATCGCTGCATCAAACTATACTACATATG
CGTCTTTTTATCTACCCCTTATCTTGTTCTATCAATTAGTAACATTGGTA
ATGACGACCACAAACAGCCTTGGTAATTTTTCAGTTTTCTTATTCACCAT
TTTCCATGGTGATGACAGATTCATGTATCCATTTTGCTTCATAGATGGTC
TTGATGATTTACATAAGATCTGGGTCCGATTCATTTCAGCTGCATTGTGG
GTCATCCTTTATGGAGTTTTATGCTTTATCTCAGCACGGGTGTTTCAGAA
TCAGATGAATCTCAAGCTAGCGGTTTTACGATCCTGGCCAATCGTGTTTT
TACTGTATTATATCGATATCATGAAATTTTCAGTAAATGCTTTAAAAGGG
ATGACTATTGATGATCGTATGTGTGTTTTCAACTATGCTGAAGAGGAGTT
TAATGGACAAAGACATCGTCCATTATTTTGGTGTAGTATTATAACCACAA
GTTGTACTGGATTAATGATGCTTGGAATCTTCATGTTGAAAGTGTATTGT
AAACGAAATCAAACTATACACGAGTATGTTCATATTGAAGCCAAATCTTT
AGATTCGATTGTCAGTCGTCGAAAGATAATCTTAATATTCGGTTTCTACA
CCCTATATGTTACCCTCTTCACGCTCATCATGGAGCTCACCGGTACGAAT
GCTCTCTTGTTGATTCTTTCGATCACTTTCACTGGCATATTTGTTTATAA
ACAACCCTATCAATCCAAATTGTATAATTATTATGAGATATTGGTTTATG
TTGATTTTATGATCATTGGTATTTTAAGTAATAATCCAGATAACGAGCAT
TCAGCTATGGATAATTACACTTCGACTTTTGTTGAGGTTTTGATAGTGTT
TCCATTTGTTGGTTGTCTTGTATGCATGCTGATTACTTACTTTGGAACAT
GGAAATCAAATCAGCAGAATCTTGGTAAGTTTAAGCTAACTTAAAGGGAT
AATCAGATGGTTTGTAATATTTGACAGGTAGGATCCTTCTATTATCCTGA
GCAAAATCTCAAAACATTTTTGCCTAACTATTTTCCAAAGTCGAGATTAT
TTAAGTTACAAGTTTTTGCCTATTAGGATGAAAACAATCGAATTTCAACG
TAAGAACCGTGTAAGAACCCAGTTTTCAAAAATTTCAAATTTTGATATCT
CGTTGGATTTTGGAAAATTGTACACAGAAATAGTTCGAGGTTTTACTAAC
AGAAGGTTTCTGCCATCTAAATATCTCAAACCATCTGATTATCCCCTTCC
AGGACCATTGCTTTTATAAGCCAAAAGTAAGAGTTTTTATGACACATCCC
CTTCTCACACACCCAGTGGAGTTTTTTCAGCCAGTGGGGATATAAATAAC
AAACTGAAACTCGATGGGGATTGATATTCCCATATTCTTTGTGGCTGGGG
ATTTCATTTCTTTTGTTTTCAAGTCAGAAAATTCAATGGGGATGGTAAAA
ATAGCATAGTATTTCACAAATACTATGCTATTTTTGGGGACAAATATTGG
AGGGTAATTTTCCACCGGGGACAATATTTTGGCCAATTTTACCAGTTGGA
AAGGGGTCCCAGTGGGTGGGTCTTTGAGAATTATTATTATGACGAAAACA
CTTCAAAGAGCTGTATAGAGGTCTGAAATTTGGTGAGTAGTTCTTTGGGT
CATTTGTTTGGAAAATAATTTCAATGATTTTTCATCCATTACAACCGAGT
GTGTAATACAAGGATTAAATTTTACTTGCTATGCAGTAGGGTTATTTAAG
GCGAGGTCAATTCGATCTGTTGTTTTACGGGCCAAGCTATCCAAAAAATG
AGGGTCGGTCGGTCGGCGAAAAAATAAAAATAAAAGCAGCACAAAAATGT
GAAATAGAAAATAAAAAGGCACAAAAAGGTGGAAATCATGGATAAAATTA
AAAATTGAACATAAATTTCTCAAACCCTTGGAAAATCTACCAAAATTTTG
AAAATTTGGGAATCTGTAAAGCAATGACAATAAAGATGTACTACTAAAAT
AAATGTTTCGATTTTTGGAATTTCAGGGTCGGTCGGTTCCGTAAAATAAC
TAATCAAATTGGTCTCACCTAATGGAACATTATTCATTAGTTCATTTTTT
TTTTTTTTCAATTTTATATAGGAAATACAAGGAGTCATTTGATCCCATCA
CGCGTCATGGAGAGCTTGTAAATTGTGGAAGACATTGTTTACTATGGGCT
GTGGTCTGTGGCTGTGGTTACGAATCGTTTATGTATTAACTGTAGTGTGG
TTTAAGGCTGTTTCCACTGAGCTTTATATAAACCCTAGGGGCAGTTTCAA
AATATCGGCCAAGCTAAATCTTTCGATAGGAGCTTGGTTGGAGTGTGTTA
CCCTAATGGTAGTAGCAGTACTCAATCGCGGTGTTATGCATACCGCTACA
ATCTACTCTGTAATATTTTAGCAGTAAACCTTAAAAACAACTCTTTAGCT
ATGCTTATAAGTTCCTTAAGTCCCCTTCCTCCAAATGTTTATGATTGATA
AGCCCCTTAAACAACCATTGAAGTTGAGGGGAGGGGCTTTACATCAAAAA
CATAAAATACCACTGTTTACTGCCATAAATATTATAGGACTTTTTGTAGA
TATACTTTTCATTCGTTTTATGTAGCACTGCTGAACATACAACAAAGTTT
AAGAACTATAGTGGCATCTTTTTGTGGGTACCATTTCCAAGCACATACTT
TGAGCAGT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000127:121432..126439- >TCONS_00011380 ID=TCONS_00011380|Name=TCONS_00011380|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=9540bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000127:121432..126439- (Clytia hemisphaerica)
GAAATACAAGGAGTCATTTGATCCCATCACGCGTCATGGAGAGCTTGTAA
GTACGAATAATCACTATTGGACACCGATCCTGGCTATTGTCATTGTTAGC
CTTTTCCTATTGTTCATCGCTGCATCAAACTATACTACATATGCGTCTTT
TTATCTACCCCTTATCTTGTTCTATCAATTAGTAACATTGGTAATGACGA
CCACAAACAGCCTTGGTAATTTTTCAGTTTTCTTATTCACCATTTTCCAT
GGTGATGACAGATTCATGTATCCATTTTGCTTCATAGATGGTCTTGATGA
TTTACATAAGATCTGGGTCCGATTCATTTCAGCTGCATTGTGGGTCATCC
TTTATGGAGTTTTATGCTTTATCTCAGCACGGGTGTTTCAGAATCAGATG
AATCTCAAGCTAGCGGTTTTACGATCCTGGCCAATCGTGTTTTTACTGTA
TTATATCGATATCATGAAATTTTCAGTAAATGCTTTAAAAGGGATGACTA
TTGATGATCGTATGTGTGTTTTCAACTATGCTGAAGAGGAGTTTAATGGA
CAAAGACATCGTCCATTATTTTGGTGTAGTATTATAACCACAAGTTGTAC
TGGATTAATGATGCTTGGAATCTTCATGTTGAAAGTGTATTGTAAACGAA
ATCAAACTATACACGAGTATGTTCATATTGAAGCCAAATCTTTAGATTCG
ATTGTCAGTCGTCGAAAGATAATCTTAATATTCGGTTTCTACACCCTATA
TGTTACCCTCTTCACGCTCATCATGGAGCTCACCGGTACGAATGCTCTCT
TGTTGATTCTTTCGATCACTTTCACTGGCATATTTGTTTATAAACAACCC
TATCAATCCAAATTGTATAATTATTATGAGATATTGGTTTATGTTGATTT
TATGATCATTGGTATTTTAAGTAATAATCCAGATAACGAGCATTCAGCTA
TGGATAATTACACTTCGACTTTTGTTGAGGTTTTGATAGTGTTTCCATTT
GTTGGTTGTCTTGTATGCATGCTGATTACTTACTTTGGAACATGGAAATC
AAATCAGCAGAATCTTGATGACACCAAAATCAATAGCAATGACTTACTTA
TTGTGGATTTTCATAATGTTGGTCAAATCAAAAGAAAGTTTTCAGATTCT
CACCACTCAATCGTCATGTGATTCTAACCAATCAACAAAGATTTATATCG
ATCCACAATATGATCAGTGCACCTCCCAAGACTCGAAAACTGTAAACTGT
CCATCCTTATATGCTGCTTATCATTCTACTAAACTATTCGATAATACTTG
TATTATACTGAAGAATTCAGTCGAATCGTACCCATTAAACGTATCAATAC
TTATCCATTCAAGTATCAATTTTGCCATCCAATCTCAGAATCAAACATCC
AACATTGATTGTCAAGGCAAACCCTATAACATATCAATCACTCATTGCTC
GAATATCAATTTTAAAGGAATTTCATTTACAAATTGCCCTTCGTTTTCTA
ACGAGGACAGTATACTAACATTTGACCATAGTATAAATATACAGTTAACG
AATATCATATTCCATGGAAACGAGAGTCAAAACATCTTGATAAAAGACTG
TGGGAATGTTGGAATGAATTCACTAAAGGCTAATCGAATCCGGATTCTTT
ACCAAGATGTTTATGCATCATCTGGTGATATCCAAATATCAAACTCTAAT
TTCTCTTCTGGGAATAATCAATTTCCAAGTGAGGGTGCCAAAGCTGCAGA
AACCAGATATGGTAAAGGTGGTGGAATTTCAATGTTTTTGATGAATGATA
TAAATAATACGCTTATCAATATCTCACAATGTAGATTCGATGGTAATTCA
GCTATCTATGGTGGTGGACTGTATTTGTATCTTGAAAAAGGAACTTTTAA
TAACAGACTAACATTAAATGAAACTTATTTCACCAATAACAATTCATCGA
CTTCAGGAGGTGCTCTTTATATTGCTGATTTCTCAAGTAGCCCTGATAGT
AATCAAATCATTATATGCAATTCGAATTTCACTAATAACTTTTGTGATTT
CAATGCAGGAGGATCTGCTATCTACGCTTACAATGGTTATCTAAAATTCT
TAGGTAACAATCGTATCGAACAAAATAACGGAACTGCAATGGTTCTTGGT
GCTACAGAGAGCTACATTAATGGTAACCTAACGCTTGCTAACAACAGCGG
AAAATATGGTGGTGCTGCATTTTTATACAAGTGTGCCAGGTTCAAAATAA
CCCCCACGTCTAATATAGTCTTCAGTAACAACAAAGCATCCAGAGATGGA
GGTGCGATGTTTGTGTTCCATTTTTTCAAAAAGAAAAGTTGTAAATGTTT
TTTCGCTCCACAGAATAGAACCTCTTTTACCGGATCCATCAATTTTACTT
ATAACACTGCTGCAGTTTATGGTAGACATCTTTACTCATCCACCATGAAA
CTATGTCAGCAATTAAATTTCAACGATACACACAAAGAACGTATTTTCTT
TACTGGAGAACCTCTAAATGCTGTTAGTACGGCAGCCGATAAATTCACAC
TCGTATCATCTCAATGGCGAAACATAGTGCCTGGTTTTTATTTTAAACCT
GAAATCAACATCACGAATGAGAAAGATCAAATTGTTAAATCACAAGTTCA
AATGATCAGGAAAATTAGAAATACGTCTGAAGATTTAGATAATTCTACAA
ATGGTTTCGGTTTATTGAATAAAAATACATATGTTGTTGGGCCAGACCAC
ACTATCAATGTGGCTCTACAAGGACAATCATCTCAGAATTATACACTTGA
TTTCTACGTTAGTAGTGAATTAGGAGAATTAACACAAAATTTAACAGTGA
AATTATCCAAATGCCCACCGCTGTATTATCTACATCAAAACAAATGCAAA
TGTAATGCTAGTGGATTTATTGCTAAATGTACGTCCGATAATGCGCTACA
CATGCTACCAAATTGTTGGATTTCACCACAAGGTAACTCTTACGCATGCC
CAGTAGATTATTGCGCTATATGTAGCGAACAGAGTAAATTGTCAACTATC
CAAAAATATTGTACGCATAATTTTACACAACCTTGTGACGTCACCCGAAA
TCAAGCATCACGATTATGTAGCCAGTGTCGTAAGAATCACAGTACAACCA
TTGGTGGTCGACAATGCGCAGATTGCCGAGGAAATACAAGGAGTCATTTG
ATCCCATCACGCGTCATGGAGAGCTTGTAAGTACGAATAATCACTATTGG
ACACCGATCCTGGCTATTGTCATTGTTAGCCTTTTCCTATTGTTCATCGC
TGCATCAAACTATACTACATATGCGTCTTTTTATCTACCCCTTATCTTGT
TCTATCAATTAGTAACATTGGTAATGACGACCACAAACAGCCTTGGTAAT
TTTTCAGTTTTCTTATTCACCATTTTCCATGGTGATGACAGATTCATGTA
TCCATTTTGCTTCATAGATGGTCTTGATGATTTACATAAGATCTGGGTCC
GATTCATTTCAGCTGCATTGTGGGTCATCCTTTATGGAGTTTTATGCTTT
ATCTCAGCACGGGTGTTTCAGAATCAGATGAATCTCAAGCTAGCGGTTTT
ACGATCCTGGCCAATCGTGTTTTTACTGTATTATATCGATATCATGAAAT
TTTCAGTAAATGCTTTAAAAGGGATGACTATTGATGATCGTATGTGTGTT
TTCAACTATGCTGAAGAGGAGTTTAATGGACAAAGACATCGTCCATTATT
TTGGTGTAGTATTATAACCACAAGTTGTACTGGATTAATGATGCTTGGAA
TCTTCATGTTGAAAGTGTATTGTAAACGAAATCAAACTATACACGAGTAT
GTTCATATTGAAGCCAAATCTTTAGATTCGATTGTCAGTCGTCGAAAGAT
AATCTTAATATTCGGTTTCTACACCCTATATGTTACCCTCTTCACGCTCA
TCATGGAGCTCACCGGTACGAATGCTCTCTTGTTGATTCTTTCGATCACT
TTCACTGGCATATTTGTTTATAAACAACCCTATCAATCCAAATTGTATAA
TTATTATGAGATATTGGTTTATGTTGATTTTATGATCATTGGTATTTTAA
GTAATAATCCAGATAACGAGCATTCAGCTATGGATAATTACACTTCGACT
TTTGTTGAGGTTTTGATAGTGTTTCCATTTGTTGGTTGTCTTGTATGCAT
GCTGATTACTTACTTTGGAACATGGAAATCAAATCAGCAGAATCTTGATG
ACACCAAAATCAATAGCAATGACTTACTTATTGTGGATTTTCATAATGTT
GGTCAAATCAAAAGAAAGTTTTCAGATTCTCACCACTCAATCGTCATGTG
ATTCTAACCAATCAACAAAGATTTATATCGATCCACAATATGATCAGTGC
ACCTCCCAAGACTCGAAAACTGTAAACTGTCCATCCTTATATGCTGCTTA
TCATTCTACTAAACTATTCGATAATACTTGTATTATACTGAAGAATTCAG
TCGAATCGTACCCATTAAACGTATCAATACTTATCCATTCAAGTATCAAT
TTTGCCATCCAATCTCAGAATCAAACATCCAACATTGATTGTCAAGGCAA
ACCCTATAACATATCAATCACTCATTGCTCGAATATCAATTTTAAAGGAA
TTTCATTTACAAATTGCCCTTCGTTTTCTAACGAGGACAGTATACTAACA
TTTGACCATAGTATAAATATACAGTTAACGAATATCATATTCCATGGAAA
CGAGAGTCAAAACATCTTGATAAAAGACTGTGGGAATGTTGGAATGAATT
CACTAAAGGCTAATCGAATCCGGATTCTTTACCAAGATGTTTATGCATCA
TCTGGTGATATCCAAATATCAAACTCTAATTTCTCTTCTGGGAATAATCA
ATTTCCAAGTGAGGGTGCCAAAGCTGCAGAAACCAGATATGGTAAAGGTG
GTGGAATTTCAATGTTTTTGATGAATGATATAAATAATACGCTTATCAAT
ATCTCACAATGTAGATTCGATGGTAATTCAGCTATCTATGGTGGTGGACT
GTATTTGTATCTTGAAAAAGGAACTTTTAATAACAGACTAACATTAAATG
AAACTTATTTCACCAATAACAATTCATCGACTTCAGGAGGTGCTCTTTAT
ATTGCTGATTTCTCAAGTAGCCCTGATAGTAATCAAATCATTATATGCAA
TTCGAATTTCACTAATAACTTTTGTGATTTCAATGCAGGAGGATCTGCTA
TCTACGCTTACAATGGTTATCTAAAATTCTTAGGTAACAATCGTATCGAA
CAAAATAACGGAACTGCAATGGTTCTTGGTGCTACAGAGAGCTACATTAA
TGGTAACCTAACGCTTGCTAACAACAGCGGAAAATATGGTGGTGCTGCAT
TTTTATACAAGTGTGCCAGGTTCAAAATAACCCCCACGTCTAATATAGTC
TTCAGTAACAACAAAGCATCCAGAGATGGAGGTGCGATGTTTGTGTTCCA
TTTTTTCAAAAAGAAAAGTTGTAAATGTTTTTTCGCTCCACAGAATAGAA
CCTCTTTTACCGGATCCATCAATTTTACTTATAACACTGCTGCAGTTTAT
GGTAGACATCTTTACTCATCCACCATGAAACTATGTCAGCAATTAAATTT
CAACGATACACACAAAGAACGTATTTTCTTTACTGGAGAACCTCTAAATG
CTGTTAGTACGGCAGCCGATAAATTCACACTCGTATCATCTCAATGGCGA
AACATAGTGCCTGGTTTTTATTTTAAACCTGAAATCAACATCACGAATGA
GAAAGATCAAATTGTTAAATCACAAGTTCAAATGATCAGGAAAATTAGAA
ATACGTCTGAAGATTTAGATAATTCTACAAATGGTTTCGGTTTATTGAAT
AAAAATACATATGTTGTTGGGCCAGACCACACTATCAATGTGGCTCTACA
AGGACAATCATCTCAGAATTATACACTTGATTTCTACGTTAGTAGTGAAT
TAGGAGAATTAACACAAAATTTAACAGTGAAATTATCCAAATGCCCACCG
CTGTATTATCTACATCAAAACAAATGCAAATGTAATGCTAGTGGATTTAT
TGCTAAATGTACGTCCGATAATGCGCTACACATGCTACCAAATTGTTGGA
TTTCACCACAAGGTAACTCTTACGCATGCCCAGTAGATTATTGCGCTATA
TGTAGCGAACAGAGTAAATTGTCAACTATCCAAAAATATTGTACGCATAA
TTTTACACAACCTTGTGACGTCACCCGAAATCAAGCATCACGATTATGTA
GCCAGTGTCGTAAGAATCACAGTACAACCATTGGTGGTCGACAATGCGCA
GATTGCCGAGGAAATACAAGGAGTCATTTGATCCCATCACGCGTCATGGA
GAGCTTGTAAGTACGAATAATCACTATTGGACACCGATCCTGGCTATTGT
CATTGTTAGCCTTTTCCTATTGTTCATCGCTGCATCAAACTATACTACAT
ATGCGTCTTTTTATCTACCCCTTATCTTGTTCTATCAATTAGTAACATTG
GTAATGACGACCACAAACAGCCTTGGTAATTTTTCAGTTTTCTTATTCAC
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ACACCCTATATGTTACCCTCTTCACGCTCATCATGGAGCTCACCGGTACG
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GTATCAATACTTATCCATTCAAGTATCAATTTTGCCATCCAATCTCAGAA
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CGGATTCTTTACCAAGATGTTTATGCATCATCTGGTGATATCCAAATATC
AAACTCTAATTTCTCTTCTGGGAATAATCAATTTCCAAGTGAGGGTGCCA
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ATGAATGATATAAATAATACGCTTATCAATATCTCACAATGTAGATTCGA
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GAACTTTTAATAACAGACTAACATTAAATGAAACTTATTTCACCAATAAC
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CCCTGATAGTAATCAAATCATTATATGCAATTCGAATTTCACTAATAACT
TTTGTGATTTCAATGCAGGAGGATCTGCTATCTACGCTTACAATGGTTAT
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TTCAAAATAACCCCCACGTCTAATATAGTCTTCAGTAACAACAAAGCATC
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GTAAATGTTTTTTCGCTCCACAGAATAGAACCTCTTTTACCGGATCCATC
AATTTTACTTATAACACTGCTGCAGTTTATGGTAGACATCTTTACTCATC
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AAATTCACACTCGTATCATCTCAATGGCGAAACATAGTGCCTGGTTTTTA
TTTTAAACCTGAAATCAACATCACGAATGAGAAAGATCAAATTGTTAAAT
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AATTCTACAAATGGTTTCGGTTTATTGAATAAAAATACATATGTTGTTGG
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
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Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000127 | supercontig | sc0000127:121432..126439 - |
Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Vocabulary: INTERPRO
| Term | Definition |
|---|
| IPR012334 | Pectin_lyas_fold |
| IPR011050 | Pectin_lyase_fold/virulence |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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