TCONS_00011119 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00011119
Unique Name	TCONS_00011119
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	5456

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000121:10071..25761-

transcript sequence

>TCONS_00011119 ID=TCONS_00011119|Name=TCONS_00011119|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=5456bp
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GAGATTATGTTCTGCTCGCAATTGTGAAAAGGAATCACAGAAGAAAGGCT
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TGAGTACCCATCGTGGCTTGACGAATCTGCTGTAGAAGCTGCTTCAACTT
TGATGACACTCAGCAGATGTGCCACTCCATACTCAGATTCTCCAGTCTTA
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TTACCTGTTAGTCCTGACTCAGGGATTTGTCTGTCATTACGAGAAGACAA
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GTGCAAAAAACAGATTCTCTCCAATCAATCCTTTGATATCTACATCAATA
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ACCATCAATTTATGATAGTCCCCCTATGTTGAATAAAGCAAGTGTGAGCC
CATTTCCATTGGGCTCTGAAAAGAGTGTCTTCACTAAGCCTGGCTTGATA
CCAAAAGCAACTGGGAGATCTAGTATTCTTGACAATTCTGGCATGAGTGA
TAGTCCAACCAATGTTTCTTGGTCAATGCCAACATCCAAGACCAATGAGA
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AACTACAGTCCTATAACATCTGAATTTGAACATAATCGCTCCTCAATTCA
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AATACCCTATTGGCACACACCAACAAACTGTAACAATGCCAACACTACTT
CCCAACAAACCCTCAGTTATGCCGGTTATGATCTCATCCAAAGTTTCACC
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AGAAGCCATCTGCACAGTTGTCACCACACGCAACAATAACAAACAATGGT
ATTGCGAGCAGTCAACCTGTCACAGTTCTGAAACAGCAGAATATCAATAT
CAACATCAATGATGGGCGACAATCTGTTCTTCTCTTTGGCACCTCACAGT
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ACCTCAACAAATGGAATCATCAGCATTCAGTAAATATCAACCTCTGTCAT
CACATCAACATGTCATGCACAATGATGCTTCTTGGAAATCACTTAGGATG
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CTTGTAAAAAACATTATGCTCACTTTAGAACAAACCTCCCataaaaataa
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aaaaaa

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transcript from alignment at sc0000121:10071..25761-

Legend: exon

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>TCONS_00011119 ID=TCONS_00011119|Name=TCONS_00011119|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=15691bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000121:10071..25761- (Clytia hemisphaerica)
CCCCCGGATTAATGGATAGATCGTAAAATCATTGCAGCAACAACAAATCA
ATTTTTTAACAATAGCGCAACCTGTTTGGGCAAGGTAGCCAATCAGAATC
GAGCAAACAAATGAAAAGATTTTTTTAGCCAATTGAAATCAATGGCTTTC
ATGACATATGCTCATTCACTATTTGAGGTTCGTATACGGGGTTTCCTATT
TTCTGACTTGGTTCGATCGATGGAGAAAGATGGACGGCGAGAGAATTTAG
GTGATGATTTATCAACAATTTTTGTCGTTTTATGGTATATATTCTACTTC
TATTCTTCTTTATTTCTTTCGAAGATGTTTTTATTGAATAGAGATTTTCC
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TATCACGAATTCGAGTCCTGGAGCTGTTCAGCTCATATGTTGGACTTTTT
TTATATAATTATATTTTCATCTTTTCCATGTTGTCCATAACTAGTATGTC
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AAAATGTTGAGCAATGATATTGGGTATGATATTAGAAAATCTTTATTCAA
CATTTATTCAAATTTTTACAAACATTTTTTAGACATGAAAGATGATCCCT
CTGGGCATTCACCACCAAAACCAGCACTCCTATGATGGTAGTAACAACAC
ACCTAATAGGAAGCGCCCGAGCAGTGCCTTGAACACCAGCACAGAAACAT
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GACTCAAGAAAGTCAAAGCCAGGGCCATGGAAACTTTTAACACATGATGT
TCTTGCCAGGTTTGATGATGAATACCAGCCTGGAACTATCAGTGATTTTA
GAGAAACTGGCCATGTCAGTATTCAACTAGACAGTGACAACTCGAGCAAA
TCTTTTGACCTTTCAACTGGTATAGACTATGTTATTATTAATGCTGCTCC
AAATAAATCTGACATTACATGCGGTTGCATGGTCTGTGTAAGGCTTCCGA
CTGCTGATGTGTTTGTGAAAGGTGTTGTTTTGGAAATTAAAGATAGGCCA
CTAAAATACAAAATCAAAGTTAATGGACATAATAATGAAAAATGGTTTTC
TCGCATGGATATTAGATGTATTAGACCTCCTGTGATCAAAAACGAAAATT
ATGACGATGAAGCCACAGATTCAGCCTTATCAGAAACTGAGGTAGACACT
GAAGTAGATGAAGTATTTACAACAAAGAGAATGGATTCAATGCCATCCTC
AAGCCGCAGCTCTACGCCCCAAAGTATTGGCTCACGTTCTAGTCGAGCAA
CAACCCCACACAATTATAAGAAAGGGGACATTTTGATAGCAAATGATGGG
TTTCGTAAAAAGTTTAATGGCAAACAGTGGAGGAGATTATGTTCTGCTCG
CAATTGTGAAAAGGAATCACAGAAGAAAGGCTTGTGTTCAAGGCACTTCT
CATCTCAAAATGATCAATCTCTCAAAAGACATTCTGAATCCCACACACCA
GATACTTCAAGCAACCACAGCGCTACACCAAGTGAGTACCCATCGTGGCT
TGACGAATCTGCTGTAGAAGCTGCTTCAACTTTGATGACACTCAGCAGAT
GTGCCACTCCATACTCAGATTCTCCAGTCTTACTAAAGTCCCCAGTATCT
TCAATATCACCTTCAAAGATGTATCACCACACCACAATCAGTCCTTGCAC
AACATACCACAGTGTTATAATTGCATCAAGCAGTACACCGAAAGTTTCAC
CAAATAGAATGTCTTTAAACAGTACACCATCATTACCTGTTAGTCCTGAC
TCAGGGATTTGTCTGTCATTACGAGAAGACAAACATTCATCCCCTAGTGT
GAAACTTCAGGAAACAATGTCAAGCAATTTTGGTGCAAAAAACAGATTCT
CTCCAATCAATCCTTTGATATCTACATCAATACCATCAAGCATCATTCAA
TCACCTGTTCCAATTCAACCTTTGCCAACAAAACCATCAATTTATGATAG
TCCCCCTATGTTGAATAAAGCAAGTGTGAGCCCATTTCCATTGGGCTCTG
AAAAGAGTGTCTTCACTAAGCCTGGCTTGATACCAAAAGCAACTGGGAGA
TCTAGTATTCTTGACAATTCTGGCATGAGTGATAGTCCAACCAATGTTTC
TTGGTCAATGCCAACATCCAAGACCAATGAGACACCAGAAAAATCACCAC
GAAAAGTAAGTCTTCTTTCTTATTTACCTTTTAATCCCAGAATTTCAGAC
ATCCTTGCTTTTTGCATAGTCTAAATACATGGATGGAAATAAGCCCACAA
AAATGCCCTATATTCTTCCAAAATGTGCTAATTTTATAAACCTTGCTTTG
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GCACTGTGGACACTAAATAATCTCAGAAAAGCTGTTGATAGAAGAACAGC
TTTTTTGTATTTAAAAAATCGTAAGAAAATTTGCATTTTTTGATTTTTAT
CTACTAAAATTATGATATGGTCTTGTTCTGCTAGAACTCCTTTCAATTTC
ATTTATCATTTCTTAAAGCAAAAACAGGATCTTTCTTTCTTGTTCTTCTG
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ATGATCTGTTTTTTATAAATTTTTCAATCCAGGCCAGCCATCGTGGGCTC
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ATCAAAATTTGCCAAAAATAAGAATTTTGAGGAAATTCAACCTGATTTTG
CTGTAGATAATATATGGAAAGTTAAGTAAGATTTCTTTTCATCATAAATC
TTTTCAGATATGACATGAGATGAGCTCAGTTTTTATATTACATGATGAAT
GACTGTTTTGTGCTTATATAGATTCCTTATCTTTTATGATAATGTGGTGT
GGTAGTGATATATAGTAGTAATCATAGTTTTAAAAGCTTTTATGAATGAG
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ATTTTCCTCTCGTTCAAACAAAGGTTAGCTTTTGCTTAGTAGTAGTTTCT
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TCTCTATAATTATGTNGTAGTGATATATAGTAGTAATCATAGTTTTAAAA
GCTTTTATGAATGAGACAATTGGTTTCTTTCTTTAAAAAAAAAACTTATC
AGAACAGAGACAATTATTTTCCTCTCGTTCAAACAAAGGTTAGCTTTTGC
TTAGTAGTAGTTTCTTGAATAAAATGAAGCCTACATAGAAACTTTCTCTA
CTTTATTACATGTTATCTCTATAATTATGGTGGTTCCCTTCTAACCAAAA
AAATAAATTATTAAGAATGAAACAAAATAATCAGAGCAGTGGAAATTCAT
GAATGAATCCTATCTTGGAAATATAATTTTTCTTTCTTTTTGTAGAGAGC
TGATATCATATTCACTATATACAGCCTCTCAAAACAATTCATTTTCTGAT
AAAAGGAAAGGAAAATATTTATATGAATAGTACAAACAATTTTTGTCTAC
TAAATATGAATGGCTGTTTCGCTCTTCTTTTATGTTTCCAAACTTGAAAA
AAGGAGAAAATGAAGCCCTACACTTTGTTTTAAAAAAACTTGAATTATCA
TTTCTTTGGAAATGATTTAAAAATTAATGACTTAGTTGAAATAAATGGTC
CTCATTAATTCCTAATCAGAACTAAGAACCCAAGGTTCAGCATAAACAGA
ACAATTAGTTTTGTCAAAGATTAATGTTCAAGTATTTCTTTTTATTATAA
TGAATTAAAATTCAGTTTCTTTTCAAAATCTTTCATGGACATTTCTCAAA
ACAGAAAATAGATGAAACAATAAAACTATCACCCTTAAGTTTTTATAACT
TTTACTGTTATAATAAGTAAGTAAGTAAGTATATTCATCTGGTGACTGTC
GGCGGAGCCGGGAGTGAGAGAGTCTATCCCCTTTTCTATTTGCGCTAGAC
CTGGGAGATCGAATGCTGAGGTGGAGCGCCGCACCTACTGTCAGCTCCCA
GTAACTTACCGCCTAGATCAGATTACCCAATCTAAGCTACTCATCCGTTG
AGTTGGTGGTGATCGGGGATCGAACCCACAACCCTTAGATTGTAAGGCGA
ATGCTCTACCGACTGAGCTACCCGGTTACTGTTATCCTTGTAGTTAAGTA
GCTCAAAGCATTTTTATAGGGATAACAAATATCAGTGTTAGGGCATAAAT
GCCTCAAATTCTAATGTTGAGATTCCAAAATCATTCAAATGATATTAAGC
TAATTTTTGCCATCATAAGCGGTTTCCTTTCAGCTTTATAAAAATTCTCT
TTTGAGTAAATAATAAGAATTTATTTCCAGGTTTTCTCTGAGTTTTCCTA
AAATTAACCCTCCTTGTATTGTATTCTCAATTTGAATCAAATCTCCAGAA
TGAAGCTTAAATTCTAGGGCAGCATGACACAGAGAGGTACATCTAATTTT
CAATCTCAAAAAAGTTAGTACCCATTAAAACAGCAGTAGGGCAAGTACTT
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AGCGCCATTGGAGGAAGCATATTGGGAAAAAGAGATAACTGTTTTTATAT
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AAATTTCTATGAATTTCAATTTTATTTTTATTTTATTTTTGCAAAAAAAA
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TAAAAAAAGTGTCTTTTCTTCCTGACTGAAATGTAACAGAAACATATTTT
TTTGATTTTCTATTTTTGAAAAATCAAGTTATATTTGGTGAGAGGATGTT
GACTGCTAAGTTTTACACGGCATTGAGGGTGATATCCCCATATTTTTCTT
GCTTACTGGCCTCTAAATACTAAAAGGGTATTAAAAGGGGTGGTGGTACG
GGGGGGGGATACATGTTCAGTGTAGTAACCCATGGGTAATAACCTGATTT
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CTAGTTTTTTCTGGGATTTTTTTAGGAGATCACCCCTTTTACTACCATGT
AGCTATTACCATCAATTCGAATCCTTGGTAGCTATGATCACCCATTTCAA
TCCTCATACCACCCTTTTAATATCCTGTAGTGGCTACCATCACCTATTTT
GAATCTTTACAACACCCTTTTAATACGTTGCAGGAAACTAACCACAACTG
TACTTACTTTGTCTTTATTTTAACACAATTAACCATTCTTTCTGGTTCTT
TTGAGGTACTGAAAAAGTACTGAAAAGCAATAACAAATACAGCCATTGAT
ACTAACCATGATTTTTTTCTAAAACTTTGGGATAGAAAAGCTTTCGCTGG
CTCCTTGAACCTACTTAAACCTATTGAAAAGTGAAACAGAAAACTGAAAG
ATTTCTTACTAAAAGTATAAAGGGAATTGGGAAGGATAAAAAAGAATAAT
AAGCTATTGTAAGTTGGGGTGCAACTTCCTTGCCAGGCAGTTTNGGAGGA
TAAAAAAAGAATAGTAAGTTATTGTAAGTTGGGATGCAACTCCCTTGCCA
GGTTTACTAAGCAATGAACAGAGTTTGAAAGAAGTTTCGTTATATCAATA
TAGAGTTTTTTTGAGTTACATAGATGATTTCGTTTGTTTACAAGTCTGAA
TCTAATCTTAATTTCCCAAGTGTATTTACCATTCACTCGTCTTTTCACAA
TTGTTAATGACTTCAAAAACTCATTAAAAGTGTGTAAGTCTTACAAATGC
CTGCCATTTCTGGCAGGCAATTCATCTTAACTGCCCAAATCATTTCTTGA
GTTAATGTAATGACTATTTTAAGTTTTGAATAAGTGAGTCCTTCAATAAC
ATTAAACGTCACGGCGAAATCATCTATATCAAAGGCTACAACAATGGGCA
TTGCTAAGTTTCAGATCAGAAGAAAGTGCTAAATATGGCCTGGTAGGTTA
CAGAAACAGCTACGGAAACTTACACAGTAATAGGAAAAAGTTAGTTTTCA
TTCATAAGCAAATTTGGATTTAGTATTGTTAACTAAAAAGATTTTGTTAC
TGTAAATATTAAAAAAAATTATTTTCACATTTCACTTGATTTCACTCCAA
AATATTAAACCGAAGACTGTTCCAGGCATATTATTAATAGACCATAACTC
AAAACCTCAATACTGAATTTTATGGAACATATAAATATAAGAAATGTTTT
TTGCAGTTTGCCCAGATTTGCCTCGACCTCGGTACTCTCCACTTCTTTGG
CTACCATTATGAAAAACAATAAAAATACACACGGCATCGATTTATGTAAA
CATTTGAAATTCAAATATTTAAAACATTCGAAATTGAAATTTCAAAACAT
ATTCTCATGGTTGGTTGAAATTCGATTGACGTTTTTGCTTACGTTAATTT
GTAATTTCCCGCAAACTTGTAATTCCCATCGTTTGGAAATTCATCACCTT
TTTCGAATTTCTTACTAACTTTGAAGGCTTAAGTAAATGGAATATCATCC
AATTAAAACTCGAATCGCGTTTCTATGACTTTTTTCAGACCTCTTTTTTA
AGTTTCAGATTGATTTCCAGTGTTAAATTGACATCTTTCAGAATTGCTAG
AATTTCAACCCAAACCTTGAGATTAACCAGGAATCCCCTGGTTGTTTTCG
TGAAATTCTGGTTAAATTACCCTCGGTCAAATTTTCGAAATGATTTAAAA
TTTCAAAAAATTGCAAAATTGACCATGGGGAAATTTATCCCGAATTTCCC
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AAATAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAGATCAAGAAAGAAAGAAGATGAAG
AAAGATTTTAGTTATGGCACATGCAGTACAGTGCAGTACGATAATACAAC
TGGCAGTTTTTCGATTTGGTTTGATCGAATCTAGCTGAATATACTACATT
GTACTATCCTTTAAAATTAAAGTTTACTTTGGTACCACCCAATTTACTAC
ATGGTAGTAATTTTTCTGGGATTTCTTTTAGGGGACCACCCTTTTTACTA
CCATGTACTAAATGGAAATAACTTCGAAAAACCGCCACCCCACCGGCTAC
ACTGAACATGCACCCCCTCCCTCCTGGGTGGTATCTTAGGTCATTAATTT
TTCTAAAAATCAAGGTTAATACCCTACCTCTAGTTACTACCCCAAGAAAT
ATTTCTATAAGCCAAAATATATTGTTGATCTTTTAGACCAAAATCTGACT
ATTCAATGTCAGGAGTTTTGCTTTGTTTTTGATAGGCTGGTGAATGAAAA
AATTAACTTCTGTGAATTCTTAGTAAGCCCAGTTTTAAGTGTAAGTAGTG
TATTGATCAGCATAAACTTGAGACAGCGAGTCAAATTTCAGGACCAGCAA
ATTATAATTTTTTTGTCCCTTGGACCTGCAAAATTTGGCGTTCTCCAGGT
CTTAATAGGACCCCTGCAGTGTTATTGCATACTGAACAATTACCTATGTC
CAACATATGAATATTAACTCATTATCCTACAACCACGCGTCAGGATAAGC
TTTTTATGCTTCTTTGGTGTCTTATACTTCTTTTATTTTTGTTGCCTTTA
CACATCAATCCTATTACATGTTGTTAATTTATTTTCTAGACACCCAGCAA
AAGCAACAAGGAGCATATCAGAAGACCAATGAATGCCTTCATGATCTTCA
GCAAGAAACACCGACATTTAGTCCATCAGAAACATCCCAATCAGGATAAT
CGCACGGTATCTAAAATTTTAGGTGAAATGTGGTATGCTGTCAGTCCTGA
AGAGCAACAAATGTATAGGAAATTGGCAGATGAGGTAAGCTTTCACAGAT
GAAACCATAGTCTACTGGAGGTACTTGCTTTGACTGGAATGGATCACAAA
GAGTGTAAACAACCCCTATTCTTAAAGTAGAGCTTTTCCAAAAATAAAAA
GGAAAGAGATGNCTCTAGTTACTACCCCAAGAAATATTTCTATAAGCCAA
AATATATTGTTGATCTTTTAGACCAAAATCTGACTATTCAATGTCAGGAG
TTTTGCTTTGTTTTTGATAGGCTGGTGAATGAAAAAATTAACTTCTGTGA
ATTCTTAGTAAGCCCAGTTTTAAGTGTAAGTAGTGTATTGATCAGCATAA
ACTTGAGACAGCGAGTCAAATTTCAGGACCAGCAAATTATAATTTTTTTG
TCCCTTGGACCTGCAAAATTTGGCGTTCTCCAGGTCTTAATAGGACCCCT
GCAGTGTTATTGCATACTGAACAATTACCTATGTCCAACATATGAATATT
AACTCATTATCCTACAACCACGCGTCAGGATAAGCTTTTTATGCTTCTTT
GGTGTCTTATACTTCTTTTATTTTTGTTGCCTTTACACATTAATCCTATT
ACATGTCGTTAATTTATTTTCTAGACACCCAGCAAAAGCAACAAGGAGCA
TATCAGAAGACCAATGAATGCCTTCATGATCTTCAGCAAGAAACACCGAC
ATTTAGTCCATCAGAAACATCCCAATCAGGATAATCGCACGGTATCTAAA
ATTTTAGGTGAAATGTGGTATGCTGTCAGTCCTGAAGAGCAACAAATGTA
TAGGAAATTGGCAGATGAGGTAAGCTTTCACAGATGAAACCATAGTCTAC
TGGAGGTACTTGCTTTGACTGGAATGGATCACAAAGAGTGTAAACAACCC
CTATTCTTAAAGTAGAGCTTTTCCAAAAATAAAAAGGAAAGAGATGAGTT
AAGCAAAGTAAATAAATTTTACTGGAAGGGCTTCACTTAGCTACTAAGTA
AAGTAAGAAAGAGTTAGGAAGCAATCTATCGACAGTGAATTCTAGCTTAA
CACCTAAATACTGAGATGGGGGCTGTAGTCATAGAGTTCACTATGTAACA
CTGTCATACAATTAATTCAATCAAAAGTTTCATCATAAATCCAATTTTGT
GATTAGGACTTTATAATTTTTGTGTTCGTTTAGGTCAAAGAGCAACACTA
CAAAAACAATCCTGAATGGAAATGGTCTTCAAAAGATAGAAAGAACAGTC
GAACAACAAAACAAAAATCGGAAGATGGTAATGTAATATCATTTGTTAGT
TTAAAAGCAAAATTCTGTACTAAGTTACTTTAATGGATAAATTTTCACTG
GGTTTTAATTTTGCAAATTTGGGTGTCATCCACATAATTGGGTCTTCGAA
ATTTTGAAAGGTCTAATCTGCGAAATTCTTTTGAACAAAACTCAAAAAAT
GTCAAATAACTACTTCAAAGTGTTATATACTGACATCAAAGAAAAGCAAA
TAATGTGTGCTAAATCAGGTCTTCGGCCGTTAAATCAGGTCTTTGGCCTT
TAAATCAGGTCTTCGGCCGTTAAATCAGGTCTTCAGCTGTTGATTCAGGT
CTTCAGTCGTTGATTCAGGTCTTTGGCTGCTAAATCAGGCCTGCGTCCGC
TGACGGAAAAAAAAATTGCGTTAGTACCATGGTGGTGTGCCATGTGAATT
GGATTAAATCACTTAGCACTCAGTTGTACTAACTGCAATTAGGGGTGGTC
TCTTGATAAAAAATTACCAAATTTTGTTATTAGCTGTGTGAAAAATGAAA
TTTTGTGAGAAAACATCTTATTTTACAAAATGAGTTTCTAGGAAGTTGAA
ATTTTTTTTCTAATTTTCAAAAAGTTTTTTTTTAATCTCAAAAACGATTT
GTCGGTTGCCATAGAAATTCAATATTTTAAAATGTTTAATTATGTTGTAA
TTTCCTATTGAAAGAAGGAACAGGATGGAAAATTGAAACATTTTTAAGAT
ATTAGATTTTGTCTTATCTGAATTTATTGCTTTTATGATGGTCAAAAAGC
CATTTTCACGGGTGGTGTACTATGTAAATTTGAGCCAAATTTCAGTTAGC
ACTAACTGTACTAAGTGTACAAAGGGTGGTGGTGCAGAGGAATGTAAAGA
GATGGAAAAAGAGCTTCTTCAGAACAACAATAGACAAACGGCTCGTTATA
TACCAGGTCCTTTACCCTTAAGGGAGTTTGTTTCAAGCTAATGGATTTCT
TTTGTTGTTGTTTTAAAAAAGTTGTATAATTAGCGTGGTATGACGAAATT
CTTTTGTTTCAGGTCAAATTACGCGTAAACTTTAGGGGCTTATATATTGG
GGAGACCTCTTTTATACCAAAAGATACCTATATTTTCTTGNGGGGCTTAT
ATTTTGGGGAGACCTCTTTTATACCAAAAGATACCTATATTTTCTTGCTC
AGAATTTTCTAGCGATTCTAATGATATAACAGCATCATGACCGCATAATT
AGATTAATAGCTAAAGTGCACGAAAATAAGAAATCAAATCTGTCTTTGAT
GAATTAATTTCTATCAAATCTTTTAGAAATAATTTGGTATCATTGTGATG
AGAATTTTTCAGACTACAATGTTAATGTTAAATTTGTTACTGCATACTGA
AAGTTTAAAGAGGAATGGATCAAAAACGAAAAACATAAAACCACTTTTAT
AAACACAGCATATAAAAACCAGCCCTCTTCGCATGGCGAGCCGTTTTTTT
CTGAACTTTTTGTAACGACCAAATTAAAGCTAAAACAAAGGAGTTTTCAA
TAGACACAATCAGAACACTTCAGGGTAATCAGAGAAGCACTTTTTCTATT
CCATCCCATTTCTCTGGGTGGTGTTACTAACCTCTTGCCAAAGAGTAGTT
AGTAGGCATAGTGTCTTGTACTAACTGCTTGACCCCCCCCTGCTTAGACT
TTAGATTTTTACAAAACACAATAACAGTTTCTAATCAAGGATATAGTAAT
AAGTTTTGTTATTTCATTTGTTTTTAGGGACATCATCAACAACACCAAGG
CCTCATTTTGAGCAGGTAAGATTGGTTACAAAGGATTAGTAGAAAAAATC
AAAAATAACAAAAATCAAAAAAATAGCCACATTCTTTTTCACCGTTCAAC
AAGTGCTGTAAAGCAAAATATAAAGTTTTTTAGAAATTCAGTTTATTTGA
ACTGATATCAGGGATTGAATTAGTGTAACACATTTTTCATCGTGGTTTTC
AATTAATTACAAGCTAAAAATTGGAAATCAAGCAATTTCAAGATGCAAAA
CCATGCTTACCAAAAAAGTGCAATGTGTTTCTTACCCTTATTTTGATGCA
CAGATATGTGAATTTTTGGGACTGCAAAATTAAGTTTCCTAGAAATGAAA
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AAGGAAGACTCCCCATCAATGTTCAATTTTGATCCTACAAAGCATACACC
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GCAAAGTCTTCAACTTTGACAACTACAGTCCTATAACATCTGAATTTGAA
CATAATCGCTCCTCAATTCAACTAGAAAAACAACAAGAGAAGTTGTATCA
ACAACAACAGCCTTCACCGCAATACCCTATTGGCACACACCAACAAACTG
TAACAATGCCAACACTACTTCCCAACAAACCCTCAGTTATGCCGGTTATG
ATCTCATCCAAAGTTTCACCTTCAACAACACCCAAGGCTTTCTCTATCTC
GAATATAATCCAAAAAGATGAGAAGCCATCTGCACAGTTGTCACCACACG
CAACAATAACAAACAATGGTATTGCGAGCAGTCAACCTGTCACAGTTCTG
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TAAATATCAACCTCTGTCATCACATCAACATGTCATGCACAATGATGCTT
CTTGGAAATCACTTAGGATGTCTGGTACATCAAATACAGTGACTGGAATG
AGAAGTTCATCTGTGGCTAGGATTAGATTTGATGATTCAAAAACAGAGGT
GGTTACTGATAGATCTGTTAAATCGGAGCCAACAACTCCGACACCTGGAA
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AGGTTTCCACCCATTTGGATTTATTTTCATGGGCTTGATCACCCTGACCC
TACTTGGGGCCTAGAATAAAATTATAAGCAATAATAGCGAGTTTATAAGA
GTTTATCACTTTTATTTCTTGGTGTTTTATACAGGGCTCTTACTGACTTC
TTGATATATTTTGATGCTTTTGTCGTTAGGGTTTTCGAGCAAGTGGATTT
CGAGCAGCATTTCAGGAAATTACCGGAATTCAATCCAGCTGGTGATCAAT
TTGCATCGAACGCTGCCACATCATCAAGCCATCAGAATTCCTATCCGAAT
GAATTCTTTTTCGGAGATTCCGACCCCGCTGGAGCTGCATCTCAATCCTT
GACATCCAACAGACAAGTTTTGGACAAACGTCGAAACCTGGTCATGAAAT
TGTTTGAGCAGTATGGGTATTACCCACCTGATAGTGCTACTGTGACTTTC
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AATTCGGGAAGTACGCCAAAATTTGAGGAAAGCCAGGTAAATATCACATC
GAATGAATTCTTAACTCAGGAGGTTGAGTTTTGAGCTCTTTCAAGAAAAA
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TTGATGAAAATAATGCGAGGCTTCAAACTCCCTGCAATGCTGTAAACATT
TTTTCAAAGGATTTAAATTTAAAATTTTTAATTGAGCTTTGTTAATATTA
TATTTTGAATTGTTATTTTTTTAGTCCGCGCAAGATAAAAGGTGAGTAAA
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CTGGTGTGTTCTCTCTGCACTGTACGATGGTAAGAATTCTATCCTTTTGA
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GAAAATTCTTTCTGTTAAATAAAAACAGCGCTAGAAAAAAAAAACTGTTT
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GGATGACAATAGTGACTTTTTGTATAGAAACAAGTTTTCTAGCGTGTTAT
CTTAATCACGTAGCTCATAGTTTTCATTTAAAAATTGACATACAAGTCTT
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TGACATAATATTGATTTTTACGTGTCTTTATCATCTTATCAATGTAATAC
CATAATACTTTCACATAATAGTTTTTGCTGCTTTGCTCACTTATCCCAAA
AGCTCACAGTATCCTGTAGGTTTGAAAATGTTAAAAATATAATTTTTTCA
CTATAAAAAAGTAAAAATTCTGTTAGAAATGTTACTGTAATTTTATTTTC
GTGTAAAAGACGTGTTTTATGCGCCATCTTTTTTGTTTTTGTTTTACTTT
TACTTTTCTTCATTAGCAGTAGAATCATTTTGTTGTAAACTACATTTCTC
GCTTATTATATTATACTTTGCTATAATTGTCACAACTTGTAAAAAACATT
ATGCTCACTTTAGAACAAACCTCCCATAAAAATAAGTTTGAAAAACTGAA
AAAAAGAAATCACTGTAAATTATATAACAATTAAAAAAAAA

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_006226	XLOC_006226	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000121	supercontig	sc0000121:10071..25761 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0	0.399965	0	0.43226	0.335965	0.403267	0.379894	0	0	2.51446e-10	0	0	0	0	0.171996	0.222547	0.439363	0	0	0.298593	0.795	0	0	0.600749	0.297878	0.669339	0.315499	1.17409	0.958901

Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00011119 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: CIC (Protein capicua homolog OS=Homo sapiens GN=CIC PE=1 SV=2)

HSP 1 Score: 150.214 bits (378), Expect = 4.917e-36
Identity = 61/88 (69.32%), Postives = 75/88 (85.23%), Query Frame = 2

Query: 1871 KTPSKSNKEHIRRPMNAFMIFSKKHRHLVHQKHPNQDNRTVSKILGEMWYAVSPEEQQMYRKLADEVKEQHYKNNPEWKWSSKDRKNS 2134
            ++P+K  K+HIRRPMNAFMIFSK+HR LVHQ+HPNQDNRTVSKILGE WYA+ P+E+Q Y  LA +VKE H+K +P+WKW +KDRK S
Sbjct:  190 RSPNKREKDHIRRPMNAFMIFSKRHRALVHQRHPNQDNRTVSKILGEWWYALGPKEKQKYHDLAFQVKEAHFKAHPDWKWCNKDRKKS 277

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00011119 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00011119 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
CIC	4.917e-36	69.32	Protein capicua homolog OS=Homo sapiens GN=CIC PE=...	[more]

You are here

TCONS_00011119 (transcript) - C. hemisphaerica