TCONS_00011117 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00011117
Unique Name	TCONS_00011117
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	5311

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000121:10071..25582-

transcript sequence

>TCONS_00011117 ID=TCONS_00011117|Name=TCONS_00011117|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=5311bp
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ATGGACGGCGAGAGAATTTAGGTGATGATTTATCAACAATTTTTGTCGTT
TTATGACATGAAAGATGATCCCTCTGGGCATTCACCACCAAAACCAGCAC
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GACATTCTGAATCCCACACACCAGATACTTCAAGCAACCACAGCGCTACA
CCAAGTGAGTACCCATCGTGGCTTGACGAATCTGCTGTAGAAGCTGCTTC
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GAGCCCATTTCCATTGGGCTCTGAAAAGAGTGTCTTCACTAAGCCTGGCT
TGATACCAAAAGCAACTGGGAGATCTAGTATTCTTGACAATTCTGGCATG
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TGAGACACCAGAAAAATCACCACGAAAAACACCCAGCAAAAGCAACAAGG
AGCATATCAGAAGACCAATGAATGCCTTCATGATCTTCAGCAAGAAACAC
CGACATTTAGTCCATCAGAAACATCCCAATCAGGATAATCGCACGGTATC
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TGTATAGGAAATTGGCAGATGAGGTCAAAGAGCAACACTACAAAAACAAT
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TACTTCCCAACAAACCCTCAGTTATGCCGGTTATGATCTCATCCAAAGTT
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ATGGTATTGCGAGCAGTCAACCTGTCACAGTTCTGAAACAGCAGAATATC
AATATCAACATCAATGATGGGCGACAATCTGTTCTTCTCTTTGGCACCTC
ACAGTCTTCGCAACCACCAAATTTAATACGCCATCATCCACAAGATCCCA
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TTATGTTTTTATCATTCTTAATTACCTATTAATGTAATGAGCAAAAGTGA
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GTAGTAGGTCCCATAGAAATGGATGACAATAGTGACTTTTTGTATAGAAA
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TGTTGTAAACTACATTTCTCGCTTATTATATTATACTTTGCTATAATTGT
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ttaaaaaaaaa

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transcript from alignment at sc0000121:10071..25582-

Legend: exon

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>TCONS_00011117 ID=TCONS_00011117|Name=TCONS_00011117|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=15512bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000121:10071..25582- (Clytia hemisphaerica)
TCGTATACGGGGTTTCCTATTTTCTGACTTGGTTCGATCGATGGAGAAAG
ATGGACGGCGAGAGAATTTAGGTGATGATTTATCAACAATTTTTGTCGTT
TTATGGTATATATTCTACTTCTATTCTTCTTTATTTCTTTCGAAGATGTT
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TTCAACACTTTGACCAACAGCTATCACGAATTCGAGTCCTGGAGCTGTTC
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GTTGTCCATAACTAGTATGTCCTAAGAGTGAAAACTCTAAATTTAATGAT
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AGCCAAATATCAACGTAAACAAAAATGTTGAGCAATGATATTGGGTATGA
TATTAGAAAATCTTTATTCAACATTTATTCAAATTTTTACAAACATTTTT
TAGACATGAAAGATGATCCCTCTGGGCATTCACCACCAAAACCAGCACTC
CTATGATGGTAGTAACAACACACCTAATAGGAAGCGCCCGAGCAGTGCCT
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AAGAGAAAGAAACTATGTACTGACTCAAGAAAGTCAAAGCCAGGGCCATG
GAAACTTTTAACACATGATGTTCTTGCCAGGTTTGATGATGAATACCAGC
CTGGAACTATCAGTGATTTTAGAGAAACTGGCCATGTCAGTATTCAACTA
GACAGTGACAACTCGAGCAAATCTTTTGACCTTTCAACTGGTATAGACTA
TGTTATTATTAATGCTGCTCCAAATAAATCTGACATTACATGCGGTTGCA
TGGTCTGTGTAAGGCTTCCGACTGCTGATGTGTTTGTGAAAGGTGTTGTT
TTGGAAATTAAAGATAGGCCACTAAAATACAAAATCAAAGTTAATGGACA
TAATAATGAAAAATGGTTTTCTCGCATGGATATTAGATGTATTAGACCTC
CTGTGATCAAAAACGAAAATTATGACGATGAAGCCACAGATTCAGCCTTA
TCAGAAACTGAGGTAGACACTGAAGTAGATGAAGTATTTACAACAAAGAG
AATGGATTCAATGCCATCCTCAAGCCGCAGCTCTACGCCCCAAAGTATTG
GCTCACGTTCTAGTCGAGCAACAACCCCACACAATTATAAGAAAGGGGAC
ATTTTGATAGCAAATGATGGGTTTCGTAAAAAGTTTAATGGCAAACAGTG
GAGGAGATTATGTTCTGCTCGCAATTGTGAAAAGGAATCACAGAAGAAAG
GCTTGTGTTCAAGGCACTTCTCATCTCAAAATGATCAATCTCTCAAAAGA
CATTCTGAATCCCACACACCAGATACTTCAAGCAACCACAGCGCTACACC
AAGTGAGTACCCATCGTGGCTTGACGAATCTGCTGTAGAAGCTGCTTCAA
CTTTGATGACACTCAGCAGATGTGCCACTCCATACTCAGATTCTCCAGTC
TTACTAAAGTCCCCAGTATCTTCAATATCACCTTCAAAGATGTATCACCA
CACCACAATCAGTCCTTGCACAACATACCACAGTGTTATAATTGCATCAA
GCAGTACACCGAAAGTTTCACCAAATAGAATGTCTTTAAACAGTACACCA
TCATTACCTGTTAGTCCTGACTCAGGGATTTGTCTGTCATTACGAGAAGA
CAAACATTCATCCCCTAGTGTGAAACTTCAGGAAACAATGTCAAGCAATT
TTGGTGCAAAAAACAGATTCTCTCCAATCAATCCTTTGATATCTACATCA
ATACCATCAAGCATCATTCAATCACCTGTTCCAATTCAACCTTTGCCAAC
AAAACCATCAATTTATGATAGTCCCCCTATGTTGAATAAAGCAAGTGTGA
GCCCATTTCCATTGGGCTCTGAAAAGAGTGTCTTCACTAAGCCTGGCTTG
ATACCAAAAGCAACTGGGAGATCTAGTATTCTTGACAATTCTGGCATGAG
TGATAGTCCAACCAATGTTTCTTGGTCAATGCCAACATCCAAGACCAATG
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TTTAATCCCAGAATTTCAGACATCCTTGCTTTTTGCATAGTCTAAATACA
TGGATGGAAATAAGCCCACAAAAATGCCCTATATTCTTCCAAAATGTGCT
AATTTTATAAACCTTGCTTTGAGCACTACTAAAAGAGGTAGGAAAAATAG
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GCTAGAACTCCTTTCAATTTCATTTATCATTTCTTAAAGCAAAAACAGGA
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GACAGAATACCGGTCATTTTAATGATCTGTTTTTTATAAATTTTTCAATC
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TTTTTATATTACATGATGAATGACTGTTTTGTGCTTATATAGATTCCTTA
TCTTTTATGATAATGTGGTGTGGTAGTGATATATAGTAGTAATCATAGTT
TTAAAAGCTTTTATGAATGAGACAATTGGTTTCTTTCTTTAAAAAAAAAA
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TTTTGCTTAGTAGTAGTTTCTTGAATAAAATGAAGCCTACATAGAAACTT
TCTCTACTTTATTACATGTTTTCTCTATAATTATGTNGTAGTGATATATA
GTAGTAATCATAGTTTTAAAAGCTTTTATGAATGAGACAATTGGTTTCTT
TCTTTAAAAAAAAAACTTATCAGAACAGAGACAATTATTTTCCTCTCGTT
CAAACAAAGGTTAGCTTTTGCTTAGTAGTAGTTTCTTGAATAAAATGAAG
CCTACATAGAAACTTTCTCTACTTTATTACATGTTATCTCTATAATTATG
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ATCAGAGCAGTGGAAATTCATGAATGAATCCTATCTTGGAAATATAATTT
TTCTTTCTTTTTGTAGAGAGCTGATATCATATTCACTATATACAGCCTCT
CAAAACAATTCATTTTCTGATAAAAGGAAAGGAAAATATTTATATGAATA
GTACAAACAATTTTTGTCTACTAAATATGAATGGCTGTTTCGCTCTTCTT
TTATGTTTCCAAACTTGAAAAAAGGAGAAAATGAAGCCCTACACTTTGTT
TTAAAAAAACTTGAATTATCATTTCTTTGGAAATGATTTAAAAATTAATG
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CCAAGGTTCAGCATAAACAGAACAATTAGTTTTGTCAAAGATTAATGTTC
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CTTTCATGGACATTTCTCAAAACAGAAAATAGATGAAACAATAAAACTAT
CACCCTTAAGTTTTTATAACTTTTACTGTTATAATAAGTAAGTAAGTAAG
TATATTCATCTGGTGACTGTCGGCGGAGCCGGGAGTGAGAGAGTCTATCC
CCTTTTCTATTTGCGCTAGACCTGGGAGATCGAATGCTGAGGTGGAGCGC
CGCACCTACTGTCAGCTCCCAGTAACTTACCGCCTAGATCAGATTACCCA
ATCTAAGCTACTCATCCGTTGAGTTGGTGGTGATCGGGGATCGAACCCAC
AACCCTTAGATTGTAAGGCGAATGCTCTACCGACTGAGCTACCCGGTTAC
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TATCAGTGTTAGGGCATAAATGCCTCAAATTCTAATGTTGAGATTCCAAA
ATCATTCAAATGATATTAAGCTAATTTTTGCCATCATAAGCGGTTTCCTT
TCAGCTTTATAAAAATTCTCTTTTGAGTAAATAATAAGAATTTATTTCCA
GGTTTTCTCTGAGTTTTCCTAAAATTAACCCTCCTTGTATTGTATTCTCA
ATTTGAATCAAATCTCCAGAATGAAGCTTAAATTCTAGGGCAGCATGACA
CAGAGAGGTACATCTAATTTTCAATCTCAAAAAAGTTAGTACCCATTAAA
ACAGCAGTAGGGCAAGTACTTTTTTATTTTCTGGTTTACGGACATTCAGA
GATGATCTTTTGGAGCGGAGGATGGAAAAAAAATAAAAATAAAATTGTTG
TTTTCAAACTTTAATGTTGGAGAAAATAAAATGTGTTTTGAGGAAACTTA
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TGATATCCCCATATTTTTCTTGCTTACTGGCCTCTAAATACTAAAAGGGT
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AGCTATGATCACCCATTTCAATCCTCATACCACCCTTTTAATATCCTGTA
GTGGCTACCATCACCTATTTTGAATCTTTACAACACCCTTTTAATACGTT
GCAGGAAACTAACCACAACTGTACTTACTTTGTCTTTATTTTAACACAAT
TAACCATTCTTTCTGGTTCTTTTGAGGTACTGAAAAAGTACTGAAAAGCA
ATAACAAATACAGCCATTGATACTAACCATGATTTTTTTCTAAAACTTTG
GGATAGAAAAGCTTTCGCTGGCTCCTTGAACCTACTTAAACCTATTGAAA
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GGAAGGATAAAAAAGAATAATAAGCTATTGTAAGTTGGGGTGCAACTTCC
TTGCCAGGCAGTTTNGGAGGATAAAAAAAGAATAGTAAGTTATTGTAAGT
TGGGATGCAACTCCCTTGCCAGGTTTACTAAGCAATGAACAGAGTTTGAA
AGAAGTTTCGTTATATCAATATAGAGTTTTTTTGAGTTACATAGATGATT
TCGTTTGTTTACAAGTCTGAATCTAATCTTAATTTCCCAAGTGTATTTAC
CATTCACTCGTCTTTTCACAATTGTTAATGACTTCAAAAACTCATTAAAA
GTGTGTAAGTCTTACAAATGCCTGCCATTTCTGGCAGGCAATTCATCTTA
ACTGCCCAAATCATTTCTTGAGTTAATGTAATGACTATTTTAAGTTTTGA
ATAAGTGAGTCCTTCAATAACATTAAACGTCACGGCGAAATCATCTATAT
CAAAGGCTACAACAATGGGCATTGCTAAGTTTCAGATCAGAAGAAAGTGC
TAAATATGGCCTGGTAGGTTACAGAAACAGCTACGGAAACTTACACAGTA
ATAGGAAAAAGTTAGTTTTCATTCATAAGCAAATTTGGATTTAGTATTGT
TAACTAAAAAGATTTTGTTACTGTAAATATTAAAAAAAATTATTTTCACA
TTTCACTTGATTTCACTCCAAAATATTAAACCGAAGACTGTTCCAGGCAT
ATTATTAATAGACCATAACTCAAAACCTCAATACTGAATTTTATGGAACA
TATAAATATAAGAAATGTTTTTTGCAGTTTGCCCAGATTTGCCTCGACCT
CGGTACTCTCCACTTCTTTGGCTACCATTATGAAAAACAATAAAAATACA
CACGGCATCGATTTATGTAAACATTTGAAATTCAAATATTTAAAACATTC
GAAATTGAAATTTCAAAACATATTCTCATGGTTGGTTGAAATTCGATTGA
CGTTTTTGCTTACGTTAATTTGTAATTTCCCGCAAACTTGTAATTCCCAT
CGTTTGGAAATTCATCACCTTTTTCGAATTTCTTACTAACTTTGAAGGCT
TAAGTAAATGGAATATCATCCAATTAAAACTCGAATCGCGTTTCTATGAC
TTTTTTCAGACCTCTTTTTTAAGTTTCAGATTGATTTCCAGTGTTAAATT
GACATCTTTCAGAATTGCTAGAATTTCAACCCAAACCTTGAGATTAACCA
GGAATCCCCTGGTTGTTTTCGTGAAATTCTGGTTAAATTACCCTCGGTCA
AATTTTCGAAATGATTTAAAATTTCAAAAAATTGCAAAATTGACCATGGG
GAAATTTATCCCGAATTTCCCTCATAACCATGAGATTACTAATACTAACA
AAAAGAAAGAAAGAGAAAAATAAATAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAGAT
CAAGAAAGAAAGAAGATGAAGAAAGATTTTAGTTATGGCACATGCAGTAC
AGTGCAGTACGATAATACAACTGGCAGTTTTTCGATTTGGTTTGATCGAA
TCTAGCTGAATATACTACATTGTACTATCCTTTAAAATTAAAGTTTACTT
TGGTACCACCCAATTTACTACATGGTAGTAATTTTTCTGGGATTTCTTTT
AGGGGACCACCCTTTTTACTACCATGTACTAAATGGAAATAACTTCGAAA
AACCGCCACCCCACCGGCTACACTGAACATGCACCCCCTCCCTCCTGGGT
GGTATCTTAGGTCATTAATTTTTCTAAAAATCAAGGTTAATACCCTACCT
CTAGTTACTACCCCAAGAAATATTTCTATAAGCCAAAATATATTGTTGAT
CTTTTAGACCAAAATCTGACTATTCAATGTCAGGAGTTTTGCTTTGTTTT
TGATAGGCTGGTGAATGAAAAAATTAACTTCTGTGAATTCTTAGTAAGCC
CAGTTTTAAGTGTAAGTAGTGTATTGATCAGCATAAACTTGAGACAGCGA
GTCAAATTTCAGGACCAGCAAATTATAATTTTTTTGTCCCTTGGACCTGC
AAAATTTGGCGTTCTCCAGGTCTTAATAGGACCCCTGCAGTGTTATTGCA
TACTGAACAATTACCTATGTCCAACATATGAATATTAACTCATTATCCTA
CAACCACGCGTCAGGATAAGCTTTTTATGCTTCTTTGGTGTCTTATACTT
CTTTTATTTTTGTTGCCTTTACACATCAATCCTATTACATGTTGTTAATT
TATTTTCTAGACACCCAGCAAAAGCAACAAGGAGCATATCAGAAGACCAA
TGAATGCCTTCATGATCTTCAGCAAGAAACACCGACATTTAGTCCATCAG
AAACATCCCAATCAGGATAATCGCACGGTATCTAAAATTTTAGGTGAAAT
GTGGTATGCTGTCAGTCCTGAAGAGCAACAAATGTATAGGAAATTGGCAG
ATGAGGTAAGCTTTCACAGATGAAACCATAGTCTACTGGAGGTACTTGCT
TTGACTGGAATGGATCACAAAGAGTGTAAACAACCCCTATTCTTAAAGTA
GAGCTTTTCCAAAAATAAAAAGGAAAGAGATGNCTCTAGTTACTACCCCA
AGAAATATTTCTATAAGCCAAAATATATTGTTGATCTTTTAGACCAAAAT
CTGACTATTCAATGTCAGGAGTTTTGCTTTGTTTTTGATAGGCTGGTGAA
TGAAAAAATTAACTTCTGTGAATTCTTAGTAAGCCCAGTTTTAAGTGTAA
GTAGTGTATTGATCAGCATAAACTTGAGACAGCGAGTCAAATTTCAGGAC
CAGCAAATTATAATTTTTTTGTCCCTTGGACCTGCAAAATTTGGCGTTCT
CCAGGTCTTAATAGGACCCCTGCAGTGTTATTGCATACTGAACAATTACC
TATGTCCAACATATGAATATTAACTCATTATCCTACAACCACGCGTCAGG
ATAAGCTTTTTATGCTTCTTTGGTGTCTTATACTTCTTTTATTTTTGTTG
CCTTTACACATTAATCCTATTACATGTCGTTAATTTATTTTCTAGACACC
CAGCAAAAGCAACAAGGAGCATATCAGAAGACCAATGAATGCCTTCATGA
TCTTCAGCAAGAAACACCGACATTTAGTCCATCAGAAACATCCCAATCAG
GATAATCGCACGGTATCTAAAATTTTAGGTGAAATGTGGTATGCTGTCAG
TCCTGAAGAGCAACAAATGTATAGGAAATTGGCAGATGAGGTAAGCTTTC
ACAGATGAAACCATAGTCTACTGGAGGTACTTGCTTTGACTGGAATGGAT
CACAAAGAGTGTAAACAACCCCTATTCTTAAAGTAGAGCTTTTCCAAAAA
TAAAAAGGAAAGAGATGAGTTAAGCAAAGTAAATAAATTTTACTGGAAGG
GCTTCACTTAGCTACTAAGTAAAGTAAGAAAGAGTTAGGAAGCAATCTAT
CGACAGTGAATTCTAGCTTAACACCTAAATACTGAGATGGGGGCTGTAGT
CATAGAGTTCACTATGTAACACTGTCATACAATTAATTCAATCAAAAGTT
TCATCATAAATCCAATTTTGTGATTAGGACTTTATAATTTTTGTGTTCGT
TTAGGTCAAAGAGCAACACTACAAAAACAATCCTGAATGGAAATGGTCTT
CAAAAGATAGAAAGAACAGTCGAACAACAAAACAAAAATCGGAAGATGGT
AATGTAATATCATTTGTTAGTTTAAAAGCAAAATTCTGTACTAAGTTACT
TTAATGGATAAATTTTCACTGGGTTTTAATTTTGCAAATTTGGGTGTCAT
CCACATAATTGGGTCTTCGAAATTTTGAAAGGTCTAATCTGCGAAATTCT
TTTGAACAAAACTCAAAAAATGTCAAATAACTACTTCAAAGTGTTATATA
CTGACATCAAAGAAAAGCAAATAATGTGTGCTAAATCAGGTCTTCGGCCG
TTAAATCAGGTCTTTGGCCTTTAAATCAGGTCTTCGGCCGTTAAATCAGG
TCTTCAGCTGTTGATTCAGGTCTTCAGTCGTTGATTCAGGTCTTTGGCTG
CTAAATCAGGCCTGCGTCCGCTGACGGAAAAAAAAATTGCGTTAGTACCA
TGGTGGTGTGCCATGTGAATTGGATTAAATCACTTAGCACTCAGTTGTAC
TAACTGCAATTAGGGGTGGTCTCTTGATAAAAAATTACCAAATTTTGTTA
TTAGCTGTGTGAAAAATGAAATTTTGTGAGAAAACATCTTATTTTACAAA
ATGAGTTTCTAGGAAGTTGAAATTTTTTTTCTAATTTTCAAAAAGTTTTT
TTTTAATCTCAAAAACGATTTGTCGGTTGCCATAGAAATTCAATATTTTA
AAATGTTTAATTATGTTGTAATTTCCTATTGAAAGAAGGAACAGGATGGA
AAATTGAAACATTTTTAAGATATTAGATTTTGTCTTATCTGAATTTATTG
CTTTTATGATGGTCAAAAAGCCATTTTCACGGGTGGTGTACTATGTAAAT
TTGAGCCAAATTTCAGTTAGCACTAACTGTACTAAGTGTACAAAGGGTGG
TGGTGCAGAGGAATGTAAAGAGATGGAAAAAGAGCTTCTTCAGAACAACA
ATAGACAAACGGCTCGTTATATACCAGGTCCTTTACCCTTAAGGGAGTTT
GTTTCAAGCTAATGGATTTCTTTTGTTGTTGTTTTAAAAAAGTTGTATAA
TTAGCGTGGTATGACGAAATTCTTTTGTTTCAGGTCAAATTACGCGTAAA
CTTTAGGGGCTTATATATTGGGGAGACCTCTTTTATACCAAAAGATACCT
ATATTTTCTTGNGGGGCTTATATTTTGGGGAGACCTCTTTTATACCAAAA
GATACCTATATTTTCTTGCTCAGAATTTTCTAGCGATTCTAATGATATAA
CAGCATCATGACCGCATAATTAGATTAATAGCTAAAGTGCACGAAAATAA
GAAATCAAATCTGTCTTTGATGAATTAATTTCTATCAAATCTTTTAGAAA
TAATTTGGTATCATTGTGATGAGAATTTTTCAGACTACAATGTTAATGTT
AAATTTGTTACTGCATACTGAAAGTTTAAAGAGGAATGGATCAAAAACGA
AAAACATAAAACCACTTTTATAAACACAGCATATAAAAACCAGCCCTCTT
CGCATGGCGAGCCGTTTTTTTCTGAACTTTTTGTAACGACCAAATTAAAG
CTAAAACAAAGGAGTTTTCAATAGACACAATCAGAACACTTCAGGGTAAT
CAGAGAAGCACTTTTTCTATTCCATCCCATTTCTCTGGGTGGTGTTACTA
ACCTCTTGCCAAAGAGTAGTTAGTAGGCATAGTGTCTTGTACTAACTGCT
TGACCCCCCCCTGCTTAGACTTTAGATTTTTACAAAACACAATAACAGTT
TCTAATCAAGGATATAGTAATAAGTTTTGTTATTTCATTTGTTTTTAGGG
ACATCATCAACAACACCAAGGCCTCATTTTGAGCAGGTAAGATTGGTTAC
AAAGGATTAGTAGAAAAAATCAAAAATAACAAAAATCAAAAAAATAGCCA
CATTCTTTTTCACCGTTCAACAAGTGCTGTAAAGCAAAATATAAAGTTTT
TTAGAAATTCAGTTTATTTGAACTGATATCAGGGATTGAATTAGTGTAAC
ACATTTTTCATCGTGGTTTTCAATTAATTACAAGCTAAAAATTGGAAATC
AAGCAATTTCAAGATGCAAAACCATGCTTACCAAAAAAGTGCAATGTGTT
TCTTACCCTTATTTTGATGCACAGATATGTGAATTTTTGGGACTGCAAAA
TTAAGTTTCCTAGAAATGAAAAAACTTGTGTTTATTTCTAGAAATCACCT
GGAGATGTTCAGCTAGAGTGTAAGGAAGACTCCCCATCAATGTTCAATTT
TGATCCTACAAAGCATACACCCCCACCACCACTACACGAGATCTTGAAAG
GACCACATCACATCACCAAAAGCAAAGTCTTCAACTTTGACAACTACAGT
CCTATAACATCTGAATTTGAACATAATCGCTCCTCAATTCAACTAGAAAA
ACAACAAGAGAAGTTGTATCAACAACAACAGCCTTCACCGCAATACCCTA
TTGGCACACACCAACAAACTGTAACAATGCCAACACTACTTCCCAACAAA
CCCTCAGTTATGCCGGTTATGATCTCATCCAAAGTTTCACCTTCAACAAC
ACCCAAGGCTTTCTCTATCTCGAATATAATCCAAAAAGATGAGAAGCCAT
CTGCACAGTTGTCACCACACGCAACAATAACAAACAATGGTATTGCGAGC
AGTCAACCTGTCACAGTTCTGAAACAGCAGAATATCAATATCAACATCAA
TGATGGGCGACAATCTGTTCTTCTCTTTGGCACCTCACAGTCTTCGCAAC
CACCAAATTTAATACGCCATCATCCACAAGATCCCAACAAAGCAGCCCAA
AGTTTGTTATTAATCCCAGCTTCAGTTAATGAGCTTAGAACACCTCAACA
AATGGAATCATCAGCATTCAGTAAATATCAACCTCTGTCATCACATCAAC
ATGTCATGCACAATGATGCTTCTTGGAAATCACTTAGGATGTCTGGTACA
TCAAATACAGTGACTGGAATGAGAAGTTCATCTGTGGCTAGGATTAGATT
TGATGATTCAAAAACAGAGGTGGTTACTGATAGATCTGTTAAATCGGAGC
CAACAACTCCGACACCTGGAAGTCCCTCGAAAAAATCGATTTTGAAACGT
CAATCCAATGATGGAATGGAAAAGTAAGTTTTTTTTTAATTTTAAAAGCT
TTGGGAATCTGTGAAGTGTAAAGGTTTCCACCCATTTGGATTTATTTTCA
TGGGCTTGATCACCCTGACCCTACTTGGGGCCTAGAATAAAATTATAAGC
AATAATAGCGAGTTTATAAGAGTTTATCACTTTTATTTCTTGGTGTTTTA
TACAGGGCTCTTACTGACTTCTTGATATATTTTGATGCTTTTGTCGTTAG
GGTTTTCGAGCAAGTGGATTTCGAGCAGCATTTCAGGAAATTACCGGAAT
TCAATCCAGCTGGTGATCAATTTGCATCGAACGCTGCCACATCATCAAGC
CATCAGAATTCCTATCCGAATGAATTCTTTTTCGGAGATTCCGACCCCGC
TGGAGCTGCATCTCAATCCTTGACATCCAACAGACAAGTTTTGGACAAAC
GTCGAAACCTGGTCATGAAATTGTTTGAGCAGTATGGGTATTACCCACCT
GATAGTGCTACTGTGACTTTCCAGCAACAGCATAAAGATTTGTTCCCAAA
CCGATTCAGCTTGCAAGTAAAAATTCGGGAAGTACGCCAAAATTTGAGGA
AAGCCAGGTAAATATCACATCGAATGAATTCTTAACTCAGGAGGTTGAGT
TTTGAGCTCTTTCAAGAAAAAATCATTTTATATCCTAAATCAGGATTTAA
AATGATTCGATTGAAAATTTAACTATGTAGCTTATTTCAACTTGTTGTCA
ATAAATATGATGACAAAGTGCTCCGTAGAGCTCCGTAGAGCCGAAAAGTT
AATTTTCAAGAATACATATCTTTGATGAAAATAATGCGAGGCTTCAAACT
CCCTGCAATGCTGTAAACATTTTTTCAAAGGATTTAAATTTAAAATTTTT
AATTGAGCTTTGTTAATATTATATTTTGAATTGTTATTTTTTTAGTCCGC
GCAAGATAAAAGGTGAGTAAACAAACTATCGACGTCAATACACCTTTTGA
TTGTTGTGGTGAAGAAATGAACTGGTGTGTTCTCTCTGCACTGTACGATG
GTAAGAATTCTATCCTTTTGATGTGAAAACAATGTTACCACGGTATGGAA
AAAAACAATGATATGGAAATTAATTTTGTCTTTCGTTCAACGGAAGCGTT
CCTTTTAAGTAGTTTATTATTATCATCATTATGTTTTTAACTTATATCTT
ATAATAACCGTCAAAAATTGAATATTGCCAAAAAGAAAATTAAAGAAAAT
ATATTAATCTTCCGTGACAGCTATAGGACCCAAGACATAGTTGGGGTAAG
GGAAATATCTTTTTAAATTAGCTGTATATTTTAATTACCAAATTGCCCAC
TTTAAACACTGGTCTTTAGTATATAGTCATCTTAATGTATTTAAGGTCAA
AATTTTTAAAATCTCCCTCACAAAAATAGAATTATTTTAGGTGTTTTTTT
TTTCAAGAATTTATTTTCTTGTTCTTTTATTGTTTAATTGTAGAAATGAA
TGTTTTATTTAATGAGATAAACTATATTTTTAAGTTGAAGTTGAGATTTG
CAAGTTCTGACAATATCTCCATTTCGTTAGGTTCATTTCTGGATATTTAG
TTGATTTAAGGAGCCAAAGTTATGCTCATTATAAGGTCAACAATTCTTTG
TTTCTCTATGAAATCATTGATGAAAATTCTTTCTGTTAAATAAAAACAGC
GCTAGAAAAAAAAAACTGTTTGGAAAAAAATGTAAATTTAATTAAATTAT
TTTTTCTTGTTCAAAGTATTTTGATTTTAACTCAAGTTTTATTGTATTTT
AAATGTTTTGTTTAACACCTGAATAATTTGATCACTTAGTTATTTTTTTT
TCTCGTATATAAATATCTTAATCTTAAATTAAATAGCATTTTATTTACTG
TCATCTGTAGGATGGTTGATTAGGTTCTCTATTTGAAAAAGCCTATGGCT
TTCATAGAGCTCACATTCAAAAAAAAATATTCAACGAGCTTGACTTATGC
TAAGGGATCAACTCTTGCTTACTCCAAATGCGATTACCAAGACAACGAGT
TTTATGTTTTTATCATTCTTAATTACCTATTAATGTAATGAGCAAAAGTG
ATCCCTCAGTTTAGTCAATCTCACATAATTATTTGTTTCACTTTTATTTT
AAAAAGGTTCTTCTAACATTATATGAAATTGTTTTCTTTTGGTTCAGATT
TTTTTTGAACTCTTTATTTTATTATAACACACACTTAAGTTAGTTTGCAG
TGCTTTTATTTGCTATTATTATATTAAAAAACTTAAAAATTATCCAAATC
GGTAGTAGGTCCCATAGAAATGGATGACAATAGTGACTTTTTGTATAGAA
ACAAGTTTTCTAGCGTGTTATCTTAATCACGTAGCTCATAGTTTTCATTT
AAAAATTGACATACAAGTCTTACTATGCTAAGTCATTCATAATATTTCTT
TTTAAAGTTATGAGTTAAGTTTGACATAATATTGATTTTTACGTGTCTTT
ATCATCTTATCAATGTAATACCATAATACTTTCACATAATAGTTTTTGCT
GCTTTGCTCACTTATCCCAAAAGCTCACAGTATCCTGTAGGTTTGAAAAT
GTTAAAAATATAATTTTTTCACTATAAAAAAGTAAAAATTCTGTTAGAAA
TGTTACTGTAATTTTATTTTCGTGTAAAAGACGTGTTTTATGCGCCATCT
TTTTTGTTTTTGTTTTACTTTTACTTTTCTTCATTAGCAGTAGAATCATT
TTGTTGTAAACTACATTTCTCGCTTATTATATTATACTTTGCTATAATTG
TCACAACTTGTAAAAAACATTATGCTCACTTTAGAACAAACCTCCCATAA
AAATAAGTTTGAAAAACTGAAAAAAAGAAATCACTGTAAATTATATAACA
ATTAAAAAAAAA

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_006226	XLOC_006226	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000121	supercontig	sc0000121:10071..25582 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.218154	0.74565	0.0750485	4.04922e-05	1.33696	0.420041	9.70487	3.1485	5.56995	7.19045	4.82959	8.63467	11.6101	7.88449	5.02525	7.89517	6.57119	12.6106	13.3488	6.83818	13.9801	8.58015	0.963678	3.5976	0.06886	0.38212	9.41986	6.96634	11.8206	11.471

Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00011117 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: CIC (Protein capicua homolog OS=Homo sapiens GN=CIC PE=1 SV=2)

HSP 1 Score: 150.214 bits (378), Expect = 4.711e-36
Identity = 61/88 (69.32%), Postives = 75/88 (85.23%), Query Frame = 1

Query: 1726 KTPSKSNKEHIRRPMNAFMIFSKKHRHLVHQKHPNQDNRTVSKILGEMWYAVSPEEQQMYRKLADEVKEQHYKNNPEWKWSSKDRKNS 1989
            ++P+K  K+HIRRPMNAFMIFSK+HR LVHQ+HPNQDNRTVSKILGE WYA+ P+E+Q Y  LA +VKE H+K +P+WKW +KDRK S
Sbjct:  190 RSPNKREKDHIRRPMNAFMIFSKRHRALVHQRHPNQDNRTVSKILGEWWYALGPKEKQKYHDLAFQVKEAHFKAHPDWKWCNKDRKKS 277

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00011117 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00011117 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
CIC	4.711e-36	69.32	Protein capicua homolog OS=Homo sapiens GN=CIC PE=...	[more]

You are here

TCONS_00011117 (transcript) - C. hemisphaerica