TCONS_00011084 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00011084
Unique NameTCONS_00011084
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length2476

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00011084 ID=TCONS_00011084|Name=TCONS_00011084|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2476bp
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caATGCGTTATAAATCTTACTCCATAACACGAGattttcttaactcgaac
ataTTCGTGCTCCCCGTccgggttcgagttatggagactccattgtAGTA
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ATGTTGAATTggtgttttgatattttgtgtCAGATATGATCTTTTTATTA
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atttaaaatataatctAAAGAAACTTGGGTATTGACTAAAAATATATATT
GTAAATAGCTCTATGTTCATATGTAACACAGTTGATAAGAAAAAAGGGAT
AATTTTTGTGATACTgtaaggaaaatttcaaaatgataatATATTAAAAT
GTATGACAaattgtaaaatggtaaaa
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000121:163866..183993+

Legend: exon
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>TCONS_00011084 ID=TCONS_00011084|Name=TCONS_00011084|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=20128bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000121:163866..183993+ (Clytia hemisphaerica)
GATACAGTACAGTGCAAGaattagtttgtttgttttttcagcCGGAGCTT
TAATTTGTTTTATTACCTCACATGACGATCGGTATGTTATTTATTTAGTC
CTTTGGTTCCTGTCTATTCGcgtgttcttacaaaaaactgTAAAATTTTG
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aacgctcgttaaaaagcaatgaaattacaattacaaatctcttcctctga
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AAAAGACGAACATTAAGATTAAAAGACTTGTGAACAATcaagtttttttt
cctttttttttatctaGATCTTTATCGCaccttgtttcaattttttgtta
ttttaaaacaacaaatttttttaatatataatTTGAATTTTCCTGGGGAT
GATGACCATTTGGGGCTAACTGAACATATGTTctgccattttttttaatt
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AACGATTCAATCAGGAGAAATTTAGCGAATGTgattcattgggcttttcc
agaaaaaaaaccgtacacccccTGTTAAGGAGGTCCAACTTTTTGTATGA
GCTACCCCTGGAATTCCAAATTAAAATATTGTACCCCCCTTGGAGTTCCA
AGAAACTTACCCTCTGAATTCCGAATTTTTGTGGGTTTTCAAACAATACC
Tcatggaattccgcttatttttaatggatttttgtaaacccctatggaat
tccgcaacatttcaaaccttaccccctagGAACGGAAATTGACCTCCTCA
ACATggggtgtacggtttttttctgggaaAGCCCATTGCAAAGGTTCAGA
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TTTCTGTCCGTAACCACATTCTGGAAACTGTTATATGAGTCTAAAAAGGA
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AAAATATAGTTTAAGGCATTCAAAGAATATCTGAATCAGGCCAATCGTAT
TTTCCTTTCCGCATCGATTAGAATCGTTTCGATGTTTGATTGAAATGACC
ATTTTTCTTCTCCACATGCGTTCTATGTTTCGCACCATCCTATATATTTT
tcttagaacacccctgtctcacatccccggtggaactttttcctcagtgg
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gcTTTCTTATATCTTGTGTTATCATAATTGGGACCCGTTGCAACCCGTTC
AGTTTGAGTTAATCTACTTTAACACCTCGAAACATAaataaattcatatt
tttgGTCTAAACCCTTTAGTTTTACCCCAAAATTGTAATACCAGATTatc
aaaaagggaaaaaagaagCAAGAAAACCCTAAATCTTATAATCTGGTGCA
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tgaattttcttttcgtcttaaaattttctattcATAGTTTAGAAAAACTA
GCCCCTAAGTTAGTTATCTTATATTACTTGAAGTTTTTCTGATAAAGAAT
TTGTCGGAAAATACCTAACCGCAATCTAAGGTTTTGGTATTAGGTGTCTT
GCTCGGGTAGGGGAAAGAGAAAAGTAGAGATTCTACTGACACAGATATCG
TTGTTTGTTTTTCGTGATTTTACAAAAAGCCAGATAAGATATGACACGTT
ATTTGTTACAATGGTGAGAATTTCTATTCAACGAACCTATTCTACTCGTA
AGTCCCCCATCACCCCCACACGTCAATGTTGGAGTTAAATTTTTGCTCGT
TCACAAGACTCTACCATCAACTTTGATATCTTTTGGACTAACAGTTCTAT
CCATGGTTGTAGTTTTCATATTACACTTatatttttcttaactttttgga
gcTGATTGACGTTGTTTTGGTTAATCTTATTTTATCTCAGGCAAATATCA
AATACGCAAAAATACACGCAGCGCAATCAAGATGCTTTCTTTCACCGTCG
ATGCGATTCTATCATCAAGTAAAACCAAAACGACAACAACAAAACTCAAA
GACGAAAACCACGAGGGTATAGAAGAAGACGCCATTAGAATACCACCCTT
TCACCACCCTTTACCGCCTTTGTCCATTAAAATACCGAAAGCACCTAAAA
TACGTTGTATATCCAAATACGGCACTGCCATAACGGACGATCCATATTTT
GGCCGAGTTGCGGTGTCATTGGAAAATTACTTACTTTGGGAAATGTTCAG
GAAAGTTGGTACTGAAATGGTTATTACAAAGTCAGGAAggtatttacttt
ttatttgaatattgAAACTGTGTGACTGACTCAGTTGGCTTGAGTTAATT
GTTCTTGATACagctgacgctctctaattcgatgttctactattcgatag
gctagatgaaattcgatgaaatttaaagtccccgtgaacaagaaactctc
ataaacgacgctcccttattcgatgaaaatcctattccccttgaagatcg
aactagagagcgtcaactgtatccGTAATAACTTTTGAAAGCCTCTTTGC
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CTAGATTAATACTGATAACCTATCACTTGCTTGTCGAAATCATCATAGTC
GTCCTGGTTAGCACTCAAATTTCAATgttcctttttttcaatttcttgca
gGCGGATGTTTCCAGCCTTACGTTTCTCCGTATCCGGTCTTCATCCATCC
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TAAATACCATGATTCCGAATGGTGTATTACCGGTAAAGGtgtgaaaaaat
tgttttgttagtTCCCAGGTCTTTTCCAAGTCTATTTCTTATGTATGCAG
CCCATAGGGAAATAGGCTTTAGTTTATTCGTTCGTCGTGTTATTAcaatt
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GGCTCAACCAAACTTAGGGATCATtggggacaaaaatttcaaaatttacg
gCTAATCTTTCCTCTTTCAACTCtttaatttagagcgcttccaaattgtt
tgtggttgtaagatttcgtgggaattttccttttttcgcaAATATTATGA
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TTTCTATCCCAGCATTCCCAGAAACACCGTGTAAACAGAGGATGTGTGTC
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AGACTTTGCGGAGAAttgatttcttcattttcaatctttttttccttctt
ttttttctttttctttcttgttcattttctactctggattatctttttaa
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ATCATCCATTCTGTGCATGCACGCTCCGCTCTATAGGGATAAGGCGAATG
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ATGCGCGGAGTATCAGAATTTGCTCGGAGATTAATTCTCGGCTGATCTTT
ATTAACTTTGGTACGATACTGAGATCAGGGTGGGGACCGAAATTTGATAG
ATCATCGAGAATAAACCAATTGACATCAGTTCTCGTTGGACTCTCCTCTT
TCAGTCCAAAGACAACGCTAGAAGAAGAGTAGCTGTTGTAAACCTTTGGA
GTATTTTAGTGTAAAAAGTGCAGACTTCCAGGACTGAAGGCGTTAACtta
ttatattttttccttTAGATTATATTGAATTCCttacaaaaatatcaacc
aAGGTTACATATTACCGAAGTCTACAGTGAAAAAGATATGCTGGCTGATG
ATATAGATCTTGAAGGATTTCCATCAATGACATTCGAATTTCCTGAAGCA
ACATTCATCGCTGTCACCGCATACCAATCTGAACAGGTATTTACTATTAT
TCTTTCTGTGGTGATTCCGAACCATCTTGGGAATCGAACGAGTTCAAGAC
GTGACATCGATTGAGATTCGAATACCAACGCAAACTCGGATCTCAATTGA
ATGGTAAATTCCATTAGCCCGATCAAAAACTTTTAGGCCGTTTGGTCTTT
GAGTTCGGTTTGATCCTGTTAGATGTCCGTCGATTTTGTCCGTTTTCTTC
GATTATGACAGCCGCCGTCATTTGGACCAATCGAATTTGAAAATTGCGGT
AAAACCCGCTCGAGTATCGATTACTCTCGATAGATTATACTTGATTGTGC
TTGTTTAGGTTTAGTCTAATCGAGATTATCGACTTCACTCGATTAATTCT
CGATTCGGCTACCGGTAATTTCTTAGTAATTTCTCTGATGTGAAATCAGT
TTCGGAGATGTTCCGCTCAATGGTAAGGGTAGATCACTTGGCAAAGAAGT
ATACTTCTCAATGATTTGACTTTTCGAAAACGATATTCTCGATATGCATA
GAACCATTGCTGTCCGGTTGTTCTCAAGTACTTACGCTCTCCAAAACATC
TCTAGACATTGTTAGTGTATGTAAATTTAAGCGCTGTTTTatctgaatta
aaaaaaaattattacaggctcaaaaaaataatttccttgTGATTTTGAAA
TCAACTTGTTAAGATGGAAAGTTGGAAAAAGTTAAGCGTCTGGGAGACAT
TCAATTTTCTCACATTATTTTCGCCAGGAGCGACAGTAGAGAGAATGACG
AACAGACtcgtagactggagtcgtttataatacgTGTAATATAGGTGTTA
TATGGAAATACGATAGATATAACGGGATAATTTTAGTGAATGTAACCTAt
agtaattcatgatatgcaccattgcaatgtcttttgacattacatcacag
acCTAATTGCTGATTGGttataagtgacgtaaaatcagtcaatacgtcac
tttcaaccaatcagctgttgggtccggtGCATATCACAAATTCATAATCA
AAGTTTTCCTTATCATACcttacttacttttttttagatatagtagtcta
gcatgctagataGACGACTAATTAAGCAAAAATAATGGCAGGGACAAATT
AAAGCCttatacaaactgatattatcccgttaTGATTATTGTATTATTAT
AACACTATATTACACGGGTTAAAAATGACTCAAGCCTAAGTATCCCAGAC
GATCAGACTTGTTACTTGTCAGATAAAAACGCGACTCCTTACAGATAGAC
ATAAGATATTTGATCTTCTTATCATGATCTCATCGCTTAAGGACTtcctg
taatttgaccaagtacTAAAAGTTATGCGATTCAAAAAACCGTTACGATG
TGTTAACCTATTGCCCCGTGAGACagagattttaaaatttgtcATGTTTA
TACTTTCCTACACAgtcaaaaaatatgatttttagaAAGAGTTTTTTGCT
TGATTTGTAATTAAAACATTCTCTTTCGCCAACATTTAGTTAAATTAGCT
TGTCGTTCCAGTGAGTCGTTCACCAAGACCTGAGACATGGTTGGCAAGCA
CGGAGAAAATAAGGACTGGGGTAGAAGTTGTAGTGTAAATGTAGAACACT
CGTAAGAGTAATTCGGTTAAGACCTGGAAAGCAGGAGGAAAGCACAAAGA
ACTAAGGACTTGAGAGAAATTAAGTAGAAGTGATTCGTAGTGTACAAAGT
TGTAGGTTCATTCCACGGCCCAGTTATACCAAACAAAGACTAAATGGTAC
TTGATCCCTCCTCTCTGCCAGACGCCCATAGCAACTAAAAAGGCGGATCA
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GGTAGAGAGCTATTGAAAGACTAAAGGTGCTAACCCTTACACCTGATAAC
TTTGGATAGTTAGTGCTAACTTTGAGAGAATACAGCTTAACCACTTATTA
CAGAGGTTCACCTAAGAtacaactaaagagacggatcaagagATAGTGGA
GAAATCCATAGGGGAGGGTGACGCCCTTCCCCACCTTTTGGTAGATTGCT
ATCGAAAGGGGAATCTTTGAGTTGCCTCCGATGGCGATCTCAATACTAAA
AGTGTTGAAGTTTCTTAACTTTGTTATTGCTAACTTCAAAAAGTTGCCGT
GGTATACACAGTAAAATAAACTCACAAGAGGTCATCTAAGATACAGACTA
GCgtctttaaaaaaaggaaaaaaggttACACAAGAAGAGGTGTTGGTCCA
AAGGAAAATTATCTTTCTCTAAAATCGAAACATCGGAATGAAAGACACAA
TAAAGAAAGTTTATTCGACGCGATTCGATAAAAACTAATGTTTTTTGTCA
CATCGGTTTTTGCGGCTAGACACTTTGGAGACATCAAACAGGACCATAAA
AATCATCTTCGGTTTTTTTAAATGTGTTGTTTTTCCTTTATTATGACGGA
CCGTCCCTCCCCTTTGATTTTTCTTAGTCGCCTTATGATTATCATCTGAA
TTTAACAGCTTTCTCTTATAAGATTCGATTCATTCGTGTCTAAATTTGTA
CGCGCATAAATATATAGTTAAGTAATTGATGAGCTGTTCTATTGTTTAAC
ATTGACGACTTTTTAATAGTTTGTCTTTTACACCTTTTCTACCTTCTACT
GTATTTCTACCCTTATGAAGTGTCAGCTATCAGCACACAGGTGGTTAGAG
ACTAGACTATAGAAATTCTAATCTCCTTGCCCCTTTGctcaatagcgagt
ttatgtatttgcatttttgatgacggtagagtgactgaagcgatttggaa
tgaCCCGCAATATCCaagacggtaaaagtgctgatttaccgtccacctca
gctggtcaggatctagtcaaattagaaccttaccgtctccgtcgcagaaa
aacactcTCTCCCGCTGCAGGCGAATTTTCGCCACAGTGAGGTAAAAATG
GGCTTCTTTTTGTCTTGAAACTTAAGATTCAAGATTCTAACTCGCTTTGT
AATTCTAGGATCCCGCCTTATGCGAAACTTTCTCTTTGACTGCTTGTTCT
AAAATGTATTGCATTTTTTGACTGAGGGTATTCTATCTTACTCTGTATCa
aagtgtatctcacgtttatcgttctacggaatgaatttttaaattagctg
tagatatcgggtctgtgtacagactaaTTCGATCTCGGCAACTAGCTGTT
AACTTATGAAAAAGTAGCCTAATTTCTGTTTCCATTCTCTCGACTAGACC
CTGCTTCATTCATCTATCTTCGCTATTTTATTTTGCTCCTCCCCAAAACT
GGTCTTATCCGAGTCCTTAACTTTTGTAAGCTTCTTAACGTAAGCTTAAG
GCTTTCTGTGCTATTTTCAGGAATTAAGGTTGAAACAGGAAAGAAACCCT
TTGTTTTTGGATTAATCAtagatgttttaaatagttgaaagttttttgaa
ctATAGCAGATTCTGGATCTGTTATAATATGAGCGGATTATGTTTTATTG
ATTAATATTAACCCCTTGGCTcatttaaaaaaacctttttagaTCGAGTC
CTCCTGATCCATAGAAAACTCAAAACCTAAACCCAAAAACAATAACTCTA
CACCTCTACCTTTTCTAAAGCAAACTCATTTTTCCGTAACTTGAAAGTAG
TTGTGCGTTGTGTTCCTGTTCATTTCTAAACCCTTGTAAAGATTACTCGA
GTATAACTTAAAAGAGTATATCCTAGTAAGTGCGAGTGCAAACGCAAacc
aaatcgggaaatcaaaccGGAAAGATCGGGAAACCGAATCCGGTTATCGC
GATTAATCggatttacgcacaattacaaatgaaaaacactaaTTTTAAGA
AGCTCCTTAACCGGAGTTTAAGGTTTGCACTTAAGTTTGCGTCTGAGATG
AAATAAAGAGAGGGTGCTCTTTGcactagcctgtaccaaactcttcttcg
ctgactgaGAATATAACGCGAATATCAGTTTGTTACACTGACTCAGAAAA
CTGGGACACAGAATCTAGCTAACCGAAACAGACCGACACAcggcaagttt
tttcaaaatataaaaaacgccCGTGGGTGAGATGGTACAGGCTATCTATG
CTCACGATCAAGTACCCTGAATCAACTGTTTCTCCCCAGTGATCTCcttg
gtaaaaaaaaagaaaacatacgaAATCACCCCATGTTGAGAAAATCGCTA
CTGGAATTGTTTTGAATGATGCGCTTTTTCCCTTTGGGAATGAAAAATTG
ATTATTTCCACAtctttctgtttcaaagaaacaCTGGAACAAAAACTGAG
AAGCAGAGCTTCCTGACCACatggagacaggggtgtgattaTCCTGTGAT
TGACATTCACTAAACGGGACCAATTTATTGGACCAAAATTGACACCAGGA
CTCCACACCGAGGAAATAAGACAAAAATatgatttatgatttttgtttta
ttttttgttttcaataaatataaataaagtGTTACAAATATACAATAATT
TTCACGAGATCTGCACATAGATGTGGTTTTTAAAAGGAAGCTCTTTGGGT
GGGAGTTTAGTAAGCAAGAAATGATTGAAAACTAACTTGACAAAATCAAC
GTAAAACAGCAGAACgaatcttttcaaataaaacccCTTATCGTTATTGG
AAAGTCCATCACTTTCAACTCACTGGACGGTTCGAAAATGACAAGGAAAA
AAATCCGAAGTTCAGGTCAGTGTAATGGCTTTAAACAAAAACAGAAGCAA
AATGGCATCAAATTTAAAACTGCTTTCTAACGAGTATTTAATACAATCAC
AACAAACCAACAGAAGAAAAACAAAGTGCATGATGCTCCTAGGCATTGTG
TTGTTTCATTCACCGTTAATGCATTGCGTTTATTGATCAACTAATACACA
AAATCAGTTGACAATAATTATACTCAAACATCTCAAACCAAGCAGGGCTT
GAACCTGCGACCTCTCGCTTGTCGACGAGCACTCTACCAATCTGAGCTAT
TGACTTCATGAGAATATTCGAGTAAATCACCGCTTTCGATTTTATGCAAA
AATTGATAAGCAAGCGCAATGCATTAATggtaaaaaaatcaacaaacacC
AACGACCATCTTGCATTAGATCTTATCTCTATAGTCTTGTTATGAGAACA
CTAGTTATTCGCCAAAAAGTAAGAATCGAATTTGAAAGCCAtttgcttca
tttttatttgaagtcatcGACTAACTGAATTCAGACAAATTCTTTGCTGC
AATCGAAAAACCGAAACAATTGATAAAACATTTAATTTATTCTGCTGTTT
CTCATTGATAGCCAGGTTTAGAAGACAATCAAAACTTGCTCACCAAAGAG
ATACGTTGTAAATTGTTGAAGAAGGGCGGTGGTTGGGTTTCGGATGGAAG
CTGTACATTGTGCATGTTGGTTGTACATTATTTGTTGCAGTTTGTGTGAG
TTTACTGAGGAACGAATCCGAAATAGCGACGTCTGAAAAGTTCggctttt
tttctgaaaaaaatacagAATAAAGAGGAATTGGTTCTTTAGACCAGGGA
GATTGTGTGAATAATTGTTGGGACTCACACTTGcgttttttgaatttgtc
acattTAAAATGTTATTCTCGTTCCCAGAGGAACGACTACTGACATTGCT
GATTGACAGTTGTGTCGCTGACCCTACGTAGGACTCAATTCTTgaataat
ttttgtcaaaatttgtgaaagAAGGGACTACTTTTCAATTTCGTGTTTAT
GCAACCCTATCTAGAGCTGGCAGCTGAACTGATAAAAATTTCCTGTCAAG
CGATaccacccccccccctacaTCCCCTAGTGCCTCCCCTAATGCCCCTC
CCCCCATTTTGATGGTATAATTAATCCACCGGACtccaaaattatcaaat
tgGCTGTTTAAATTTGACTTACTTATTTTCTTTGGATTCTCCATCACGGA
GCTCTAACGCATCTTCAATTTCTGATGGTCCCAGtttcaaatattcttta
aaCAGGTAATCGATTCTGAAAAGGAAACCGAAAATGATTATATAATTGAT
GTTATATCATTGGCATAAAGTTTTACGTGAATCTTTATTTTAGTTTAACA
GCGAAGAACCAAAGGTTAACATTTATCAGATTGTCGAAAAGTTACTTTAA
CAGTACGtaatattttttatcagaacaatttcataagagcAATGAGGCTA
ACAAATGCCAAACATTAAGAGCAATTTACCACGAAACTGAGAGAATTTTA
ATTATACCTAtaggtcaaagtagtaaaactTTCTTAAAATCAAGGACATA
CGTTAAGAAAAACTtgagtttcaaattttcaaaaaaaaaacaatcgaCTA
TTTCTTATATGAAAAAGAGTATTGTACTTACTTGGACCCAGGCTTTGCGT
AATCCATGGGACTTTTTGCTTTCATATCGTAGTTGTAAGGGTTAACCTCG
TGTGCGATAAGTAATTGTAAAAGATCATCTCGTTCCAACAAACTACACAT
GTGAGCTGCCGTTCTACAAAGTAAAGAGATTACATATTATATGATGCTGA
AACTTTAGCCAAATCTCAACAACAACTTGAGCCGCAGATTTCTAATTATC
TCTTAAGGAAGGACATTTTAgcttaaaaatttcgaaaaattgattcTCAA
TCGAAATTGACAGGTTCTTATTTAAAGTTGCGCTGTGTGATTACGACTCT
TGAGCTTACCCCCAAACCTCATTCTCGTGTATCCAAGGCTTCCATAGCGT
AGACAGGAGaagcgcaaaatttgtgtaggagagcagatttttatgacact
gtaatcaTCTATTCATAATGTAAACAGAttattacagtgtcataaaaatc
tgctctcctgcacgaattttgcgcccctcctgtctacgctactggctTTA
GTTACTTTAGATGCACGCCAAagaatattatctagcgctatccaGTAACc
atcaaaaagcaaaaagtacGCAGGGAGCAAGGTTACTTCCTCCCCTGTAA
GAAATATCCTACCTTCCATCACCATCACGAGCTGACATATCTACTTCGTT
CAACAACATGTGGTTGACACATTTCAAATTAACAATGTCCTTGTTATTTA
AGACGGCTTTATGCaataaagtcaatttcccagctTCGACTTTGTCACCA
GTTCTTAGTGTATAGTCCCAGAGGAATTTGAAGATCTCGAAACGTTCGTC
CCCGTGAAATTCGAGGAGATAAGTAAGGGGATCTCGGGAGTCACGTGACC
AGATTCGAGCATTCGCTCCTGCGCCGACTAAGGCTTTGACGCAATCTAAA
GAGCCAATTTCTACTGCctgaaaaattcaaagatttaaattattttatta
cgTACGTTTTCTATTTGGAAGTAGTCTGGGGAGTAACTTACATCAATGTG
AATACCTAAACACGGGAGATAAAAACCTAAAAGTGAAAGTTACTGCAAAT
CTCTAAACGAGTTTCTTCAGAAATGTCACCCTCCCCCCTGAGCTGTGTTT
AATGACCATTGGGAATgtttcaaaatgataattatggGGTCATAAAGGCC
GCTTCGAAATAAGTCGCATCTATAACTTGATACAAGTACCTAAGATGTTT
GAAAATTTGGTTGATGATTGTTTCGTTCATACGGACAACATGAAACTTTA
GATTTCAAAAACTACACGAGTCTCATTCTTAAACAGCGTAAACAGCTTTG
GGATACCATCGAGCACTTACGTCACAGAGAAGAAGTAGAATCGTAAGATA
CATGTATATAAAGTTAAAGAACCAAAGTAAAAGAaccaaagtaaaagaaa
aaaaattatcacctTAAATAATGGTGTTTTTCCGTGTTCGTCTCGTGTGT
CAAGCTTAATTCCAGGTACTTTTAACAACAATTTCAATGTTCGAATACAT
CCCCACGAGGAAGCCATGTGAAGAGCCGTTCTAAAGTTAAAGAAACACTT
TGGTGACTTTGGTGACTTtggtcaactctctctaattcgaacctcaacta
ttcgaatatttctataattcgaaccaaaATATTTGTCCCCTCAGTTAAGA
ATTagtttctataattcgaatctttctctaattcgaagtaAATTACTGAT
CCCTCGAAGATCGAATTTGAGAGAATCAACTGTAATTGGATTGTCCAAAT
TACAGACAGAGGCGCTTATATCGAATTTTTTAATCCGAATCTCGGGGAAG
TATTTATTAGAAGTGGCTACTcgcatcaaaatttttctcattttatgTAA
TAGCCCGTGTAACGTCTGGTCCTATGAATTAAAGTCAGGAGGTTATCGTT
CAACAAATCTCCATCAACCTACCTTCCGCGTCGGTCCTCATAGTTGACAT
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tacaATGCGTTATAAATCTTACTCCATAACACGAGattttcttaactcga
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TATATTATGAACAATATATAATATATGGTGGCAGAGCGACACGAACTCGT
CGAACAAAATTGGGTTTTTTGAACTGATCTAACCGCAAcacattgatcga
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ttttttaatcgaactttaatctttcgatggagttcgattagttcagtTTG
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_006210XLOC_006210Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000121supercontigsc0000121:163866..183993 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
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Blast
[Close]
BLAST of TCONS_00011084 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: TBX2 (T-box transcription factor TBX2 OS=Homo sapiens GN=TBX2 PE=1 SV=3)

HSP 1 Score: 206.838 bits (525), Expect = 2.349e-56
Identity = 113/222 (50.90%), Postives = 140/222 (63.06%), Query Frame = 3 
Query:  321 ITDDPYFGRVAVSLENYLLWEMFRKVGTEMVITKSGRRMFPALRFSVSGLHPSKRYAVAIEIFSADNYRYKYHDSEWCITGKAFPETPCKQRMCVHGDSPATGFKWCSNIVSFHKLKITNNTARSNQKQIILNSLQKYQPRLHITEVYSEKDMLADDIDLEGFPSMTFE---FPEATFIAVTAYQSEQITQLKIDNNPFAKGFRDPTPAEIE-RTRLINPSL 974
            + DDP      V+LE   LW+ F K+GTEMVITKSGRRMFP  +  VSGL    +Y + ++I +AD+ RYK+H+S W + GKA PE P  +RM +H DSPATG +W +  V+FHKLK+TNN +       ILNS+ KYQPR HI              D+   P  TF    FPE  FIAVTAYQ+++ITQLKIDNNPFAKGFRD      E R +L  PSL
Sbjct:  101 VEDDPK-----VTLEAKELWDQFHKLGTEMVITKSGRRMFPPFKVRVSGLDKKAKYILLMDIVAADDCRYKFHNSRWMVAGKADPEMP--KRMYIHPDSPATGEQWMAKPVAFHKLKLTNNIS-DKHGFTILNSMHKYQPRFHIVRAN----------DILKLPYSTFRTYVFPETDFIAVTAYQNDKITQLKIDNNPFAKGFRDTGNGRREKRKQLTLPSL 304
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00011084 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1
Match NameE-valueIdentityDescription
TBX22.349e-5650.90T-box transcription factor TBX2 OS=Homo sapiens GN... [more]
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