TCONS_00010093 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00010093
Unique Name	TCONS_00010093
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	961

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000102:87604..108693-

transcript sequence

>TCONS_00010093 ID=TCONS_00010093|Name=TCONS_00010093|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=961bp
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CGACATATTCGACCAAATTATACCGGTTCGGCAACAAATGTTCATCTGAC
AATCAAAATCCAATCTTTTCGAGAAATCAATGAACGAAAGATGAGCTATG
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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000102:87604..108693-

Legend: exon

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>TCONS_00010093 ID=TCONS_00010093|Name=TCONS_00010093|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=21090bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000102:87604..108693- (Clytia hemisphaerica)
GTGATGGACAAATAAGAAAAGAATGGAATTCACTTTTGAAAGGATACAAC
CGACATATTCGACCAAATTATACCGGTAAATAAAATATTTCCATGTCGTG
GCAATCCTGTGAACATTCCCTTCTCACAGACCAACTCGGAACCCTTCCCA
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GATTTCCCCTTCCCCCTAGGATATGTATCTGTTTTTATATTTTAGTGTGT
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ACACCTTTCGCTAAACGAATTAACCCAGGTTCAAATTCAGTTGACGATTT
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AATTGGAAAATAATATAATTTTAGAAGAATGGATTGTATACAAAATCTAA
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GTGAAAGGAGCTATCATACAAACTCTTAAAGTACTTCAGTCAGTGTTAAT
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CTTACGATATAAATAAATATGACGAATACAAGGACACTGGTATTCAAGGT
ACAATATGTTATAAACATGCATGTGATCCAGGTTGGGAACAAACTAGAGG
TCAACTTTTAAAGAATCTTGCAAAATGGAGTTACGAATATGGCTACACAT
GCCAGCGTTGTGCTCCCAACTACATTAAACCTAAATACGGATTCCATTTA
TGCCAGAGCTGTCCAAAATATCATCAATCCAATGTTGACCATACTCGATG
TGTTGACCCGTATACTGATATGTTTTTAACCCAAGATCTTCTGTTCTATG
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ATGACTTTCATATTGCACCGAAAAACACCAGTTGTTAAAAGCTCAGATTT
CGTGTTAACTGTTCTACATTTGGTAACATCTTTACTCATTAATGTAGGAA
TTATATGTCTCCGGTTTATGAAGCCGGCAAAAATATCATGTTCTATAGAT
GCTATTTCACCAGGATTCTTGTATACTCTCTTTATTACCATTGTTTTAAC
TAAATCACATAAAATTTTAAAAGCATTTGGCTCAATGAGGAAATTAACAA
CGAAAAATAAACGGAACACAATAGTTCAACAATATACCATAATTGTTGGT
TTAATGGTGATTGTTATTGTTTTGACATTGATTGCACTAAGCAGCCAATT
ACCAGAAGTATTATCTCAAAGGGATACCCAAAAACTAATCATCTATTTAT
CCTGCAATAACCTATTGCCAAAAATCTTCCAATTTGGATTTTCAGGAATT
TTACAAATAATTACATTCGTTATTGCGTACCGTGGTCGAAATTTACCGTA
TATTTTCAACGAATCAATGTCTTTACTGTACGCTTCGTTTTCGTCAACAA
TGTCACTCATTGTGATGTTTATTGTTTTAAAATTTGGAGGGAAAAAAGAT
CTGTTTTTACCAGCATCCATCATCTGGGTAGCGGTATCATTGAATTTGAA
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AACCAATCGGCTTCATGTCAGACGATCCAATCATAACTTTACATTTTAAG
AGAATTTCTAAGAATAGTAAATGATATGATATACTTTAAAATATATTTTT
CATTTTTTCCAATTCTGCTTTGTACCTTAACGTTCCAAGTATTATGCATT
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AAATTCTGTATTTTATATTGTACCGTACAAATACAAGACCGTGTTCAAAA
AAGGGGTCTGGTAAGCGAGAGACCGTATTTTGAACTTTTGTATCTTATAC
AGAAATTTATTTTGAGAAATGCTTTCGTTTTCTTCTCAAGGCACAAAAAA
ATGTCAAATAAGAATGTTTTAAACTTTTTAATGACTTTTCGAAACATTTT
CGAATGTTTTGATGTTGATTTCACCACAATACAGGAAATGAAAAAAATAT
AACATAGAGAAAGACAAATGGAGAGTGAAAAGTTTGTTGATATTTCTCAA
GTTGGCGATAAACCAGTTATCACATTTTACCCGTACAATATGGGATATAT
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TATGACGAAAATTCTGAACTCGAAAAATATATCCCATATTGTACTCGGTA
CCGTGCAATAAATATTACAAATTAAATCCTATTTCAAGATGGACTAAACT
TGCAACCCCAATGAGATAGTCACTGTTTATTTTAAGAATATCCGGTGGAT
TTCAAAATCCCCACAATCGTTAAATAAGATTTCAAAATCCCCACAATCGT
TAAATAAGGTGGTTTTCCATGCCATTGGCAATTAGCTCTTTCATTACATC
ACTGGCTAAAAAATTCTCATCGGTTCACTCTGATCGAGATGTGAACTAAC
TATCGATTTTACCCCCGTCATTAATTCTATAATTCATATAAACTTCTAGA
TTCCCTAAAAGAGTAAAAATAATGTATTTTGTGTGTGTTTTTAAGTATTG
TTAGGTATAATTTACACGTTTGAGGCAAAAATTTACCGAAACGAGGAATA
AACTAAGGACAATCTGATTCTAAGACCTCAGAGATTACTAAGAAAGTACA
GATTCTAACAAATTGAACCCATTTTCAGTTTTAAAGTAAAGAAACTAAGC
ATATCAACTCTTCAAGCATCTTGGCATTTTGGCTAAATAACGGACCGGTC
TGTAAAATACCAACCGCTCACATGACTAAATTGAAATCTTGCACACTGTC
TTAGATGGTCAATATCTATCATTGGTGAAATTTTCAAGTCAAAAACTTTA
GTAGCAGTAGTAGCAAGTAGTAGCATTAGCAGCAGTTCCTGAGTTCTGGC
AGGTGGTCAATGTGTATTTTATTATAGACTGGTCTGCAAAGTATCAAATA
CTCATGTGAACGAATTTCAAGGGTCAAAATTTCAAGGTCATAGGACTTGT
CAATCTTGATATTTTAAGCCCCCCCCTCTCAAGATGTTTCCCTAGTAAAA
GAATAGGAATATGCTTGAAGGGTTAAGGGTTAAGAACATCGTAAGAACAA
ATTTTAGACTGAAAATTTCAAAGTATTAAGCACAGCTTAGTGTGCGCAAA
CATTTACCAGTTCCTTATTAAAAAAAAGCGTGTTCCTGTTTTCTTGTATT
GTTTGTGATAAAGTACAATCAATTTCACTTTATACAGAGCTATGGGATCG
ATATTTGGATGTCACAAAAATGGGAGGACTATCGTCTCAAACATAATATT
TCAAAAGTCATTACACCGCTACTAGGTCTTGGTAGACCTTCTAATTTGAT
CTGGGTTCCTGATACAGTTTTTATCAACGAGATCAATTCCAAACAGCATT
TGGTTACTGTTAGAAACAATAAAGTGGATATTAATAGCGATGGCACGGTG
CATTTGATCTCCAGAGTCACTGTAGTTGCATCTTGTCGAATGAATTTTCG
ATTCTATCCATTGGATACACAGTTCTGTTATCTCTTCATAGAGAGTTGTA
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GGTACTAGATTCTGTCATCTCCTAGTCAGACCTTGGCCAGGGGCTAGATT
TTGGCTGTGTTAGAGCCAAAAGTTTTCACCATTAAAGCTTGAGGCCTTTT
TAGTCGGTCCTAATAGAGCACCGGTGCTTATTACGTCAAAGCTCGATAGT
TTCCATTNACTATATGAATTTTTGATTTCAATAAATTCAAAAATTGTTTT
CCGGTACTAGATTCTGTCATCTCCTAGTCAGACCTTGGCCATGGGCTAGA
TTTTGGCTGTGTTAGAGCCAAAAGTTTTCACTATTAGAGCTTGAGGCCTT
TTTAGTCGGACCTAATAGAGCACCGGTGTTTAATACGTCAAAGCTCGATA
GTTTCCATTTTTAGCCCGGCCCTAATTTGATTTTTATCACTTATACCAGC
CTTTATAATGTCAACCAGGGCTGATAAGGTACACCGTTTTTTCATCCAGT
CAACATTGACATATTAAACGTTTACATTTTTTGTCTCTAAACTGATATTT
TGATTATAGTATTTCAGCCTCAACCAAAAAGCAAACCTCTCATAAACTTT
TCCTTTTAGTCGCTTACCCTGACACTTACGTGGATTACAATTGGCGTGTT
GGCGTAATCGTTGAAAAGTATGATCTATCTCAGTATACGTTGGAAAAAGT
CGAGACATTCAAAAATATATCAAAATATGAATCAGGTAGTAAATATTCTC
TAAATTTCAATATTTCCACTCAATTCGTAGGGACATTTTGATTTAATATT
CGAATAGTTGCAAACAAAGTTCAGTGCCTTAGCTACCGGCGGTCAGGGGG
GCTTAGCACCCCCTATAATATTTTTAAGAGTGATTTTTTTCATAAAATGG
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AGTGTTTTTAGCCAACTTAGAGCTCTAGATTTCCAAATCCCTCCCTCGAG
CCAAACCTTGGTTGGCCCTCATGGTGTCACTGAACTTATGCCCCTCCAAT
ATTAATCCTATAGCTACTTTTTCCTATTGTCTAGGGAATTATACAATTCT
TCAGGTCGTGTTTCGTTTCATATTAATAATATTTGAATAGTTGCAAAAAA
AGTTTTAAAATATGCTATCTTTGCTGAACACTTTTTGGACTTATCCTGAC
TAATCCTATAGCTACCTTTTCCTATTTTCTAGGGAATTATACAATTCTTC
AGGTCATGTTTCGTTTTAAGCGAGGCGTTGAAGTTTCGGTCATCCAAGTA
TTCTTTCCGATTGTGTCTGTTGTTTGTGTTTCAATGATCTCCTTATGGTT
AAACAAATATTCTACATCTTCACGTGTAGGTGAGTAATCATAGAGACAAA
AAGTTGGTTAGGGTACTGTCGTTTTCACTTAAATTCATTGAAATCCTTCC
GTTATTGACAAGGCTGAATAGTTTGGCTCCCTCTATTTCTTAGTCCAAAT
CGAAAAGAGCAAGAGAGAATTTTAAAATCCTGTTCCGAAGATAATATAAC
TGAAGGGACGATAAAACTTCTTCCAGTTAAGGAGACATTCGAGTTCTAAA
GGTTCCAGTTATGAGACTTCGCTATGTATTTATTCATCTTTTTTTTCAAC
ATTATGTGTTACTACTTTTTCAACATTGTGTACATTGTGGACCAGACCGA
ATTTCTCTTTGTCATTATAACTCTACGGGCTTTTTAGGGCTTGACTATGC
GTTATAAGATTATTTATTTTTCTTTCCTTTTTTCAGCATTATGCGTTACT
ACCCTCTTAACATTGTGTACTTTGTGGACCAGAGTGAATTTCTCCTTACC
ATTGGTCAGTTATTTCAAAGCATTGGATTGGTATTTCCTGGTTAGTTTCG
TTTTCATTCTGCTGGTGTTGGTTGAATACACCATTGTGGTTAACGTGGAT
ACTTCAAGAGAAAAGAAGAAAGTCAAAAATGCAAAGAAAGAAGAAAAGGT
TAGTGCAGCAATTTTTTCCAGTAACCTTTTAAAAGTGTATTTTGATTTTC
ACTTTATGAAGCTACAGTGAAACCTCTAATTAACGGACACTCTAAAAGGC
AGACACCTCTGATTAGCGGACAATTTCATTTTCCCCGGCCGTTTCCTAGT
CAAATCATCATAAAAAAGTTTCTAAAAGGCGGACACTCAATTATCGGACC
CTCTGATTAGCGGACAATTTTTTTCGCATGAAATGGCCAAAACCCCTATT
TTAGCTCTCCAATTAGCGGACATTGAATATCAAACGGGTCACAGACGTCC
AAAATTGAAAAAAAAATTTTAGATATTTTTATTTCGAGCACTTATTAGTC
TTATTATTCAAATTATTTATACAAATTTCCAGTTTTCCCTTGACCCATTC
AACGAATTTAGGTGGGCCAAAGAAATCATAAATCACTGGTACTTCAAGTC
CGTACTCACCACCTCGATTTAACCTCTTGCCAGTCACTCGAGCTCTTCTA
TGGCCTAGTGTCTGCAGATAAGTACTTTAGACCCCAATTTTATATTTTCG
ACACCCTGGGATGGCCTAATTTAAAAATTGGAGCTCCGAGATCAAAAGTT
TCTAAAAGGCGGACACTTCTAATTAGCGGACACTAACCCCTTTCCCCGAT
GGTGTCCGCTAATTAGAGGTTCCACTGTATATAAAGATGATTTGTTACGA
CCCATCATGGAACTTGATCTTATACGGGTACAAATTTCTAACCGTGCCAC
TATTTCAAGAAAGTTTGGCGGAACTCTGGCATTTAACCATGCTAATAAAC
TAGTATGTTAATTAATCATGTAAAAGGGTGGGAACTTAAGGGCGGCGGGT
GTTTGCTAAAATGGGAGCTCCGTAGGAGAACGAGCAAAAGTTGGTGAGAG
GTCAGCCCCTCCTTCCCCGCCCTCTTCCTACGCTCACTTTTCCCGCGTGA
TATCGTTCCAGCCCGAATGGTGTGCTGGTCTATAGTCTAGGATTTAGTTG
ATGGATTCTAAAAAAACTCCGATATAAAGCCGATGAGGACTCATTTTTGT
GGTCGATAAATTGATACCCCTTTCTAGACGTGTTTATGGACTTTTTCAAA
AGCAAATTTTGACTTCAAAAGCGTATAGCTTGAGAATCACTAAGCCAATT
TTCATAAGTTATATACCAAATTTTAAGTTTGCTTTTCCTCTTTACAATGA
CAAAATAATTTATCAAAAGTTTGCATTATTTCGGACACAGTTAGCAATCA
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AGAAGCACCAGGAGCACCAGTCAATGTTAAAGAAGTCTTGAAACGTAAAA
GGAAAGTCAAATTTGATGATTATGAAACGGGGACTTCGAGAATTGACAGG
GTGGCACGATTTTTGATTCCATGCTCGTATTTCCTCTACAATATTTATTT
TTGGTTTGTTTTTATGGATGAACGACATGCATACGCAGCAGAACACAGCA
GACCCATTCATAAATGAATGCACGGTTTGTGAGAAAGGTTTAACGTTTTA
AATCGTTAGTATGGTACGTTTGAAACTGTTTTGATTTGATTAACAACATG
AATAAGTTGTTGGCTTATTTTCATATTTACTCTGACCATTTTCATGAAGA
AAAGACATGGTTACGCTTTGGCATTGCGGTTAAATTTGTATGCTTTCATG
TGCTAATTGGAAACCTGTTCTAAGCCGTTAACCCAGTCATGTTTTTGGTA
AAATATTAACACTCCGGAGCGCAGTTGTATATTCAAAAATCTTGTTTAAA
TATATAGTTCAACGTTTTTGTTTCTTATAGATAGAACTAAAGCATTATAT
CAGACAAAAGAGTCCAATGTCAATGGTAAGACGAATGTACGAAATATTAC
TGAGTATTTGAGATAACAACATGTTTATTATTAATGTAAACTGTAGCCTA
CAATTCTTATATTTTTGATAGGTCTTATGTATTATCGACATGGTTTTTCT
CTTGATTCTCTTGATTTTTTTTTGATTATATAAACATAATATAACAATAG
AAAGACACTGTCCTGATATCAGATATGTGTCTGATATGAAACTGGAACAC
TAATGTAAAAACAAAACCTTTGCGAATGAAAGAAAATTATCTTTCGTAAA
TTACTAAGAAAAGCAGGATGAGCTAACCTTGGCTAATTTAGGATGCGTTT
TTAGAGATTCAAAAGAGTAAAATACACTCTCTTTTTTGAGAACAATTATT
CTCAGAAATGCCAGAAAATAAGAACAAATTAAAGGTCAAAACGGTTAAAA
TAACTGGCTTGATATCCAGCCGCAGGAATAACCCAATTTTGCCCTAAAAA
TTAGGATAGGATAAAAGTGATTTGAAGCTAAAATTGATAAGAACAAAGAG
ATAAGAACAGCCGAGCCTCTATACAAATTTGCTGCCTCTTATAAAAAAAG
AGTGTACAGGGCGTGTACAGAAGATCTTAAATTTTTAAGCCTCTGAATGT
TCCTAATTTTTTTACTATCAAGCTTGAAGATGTTCTTAACATGTTTTAAT
TTTTGCCATTTTGTGATTTGTTGTCCCTTTTTTTAAATCGGGTCAGAAGG
ACAAAGACTTAAAATTTTAACTGATTTTCATATTTGAAGAGATAATATTA
GTCTAAAGGTTTTTTATCAAAGATTTGGGAACAACCCATAGTGATACATG
TTTTTATTAATAAGAATATCACCAAAATCTTTGAAGCCTTTTGATATTCT
TAACTATTTAAGTTTCGAGCCTAAAAAATTTTTTAACATGTTTTTATTTT
CCCCATCTTTTATGTATTTTTGTCAATTTTCCTAAGATGATTTCTTAGGA
AAATTGTTTTAGAGTCTGCAAAGCCTTAAAATGTTCTTAACTTGTTCTTC
AATTTGGTCATCGAAACCTTATGTTCTTATATAGTTTGTTCTTATATAAA
AAATGTGTATAAGATTTAATCAATGTTACTTATGTTTAGGACTTTCCTGG
AACAACGGTCCCGATCATTGACGTAATTTTTATAGGAATTCTGTATTTTT
TCCATTATCTTTAATACAGAATTTGTCGTTTTATTTTCAAAATTCAATTT
TCCAATATCATCCTTTCTTCAGTGATGGACAGATAAGAAAAGAATGGAAT
TCACTTTTGAAAGGTTACAACCGACACATTCGACCAAATTATACCGGTAA
ATAAAATATTTCCATTTTAAGTCAAAATCTTCAAATTAGCCAAAACCATC
AAATCCACAAGCAGATACACCAAAACCATCAAATCCACCAGTATATTCAC
CAGAACCATCAACTCCAACAGCATATTCACCAGAATAGTCGGCTCCCACA
GCAGATTCATCAGAACCATCAACTCCACCTGCAAGTTCACCAACTTCATC
AAATCCACAAGCAGATTCGCCAAAACCATCAACTCCGGCAGCATATTCAC
CAGAACCATCAATTCCACCAGCGGATTCACCAAAACCATCAAATCCACTA
GTATATTCACCAAAACCTATAATTTCCCAGTTATTTTTTCTGGTCACATC
TTGGGGCAAGTGGGTCACATCTTAGGGCTGCTTTTTGGGGTCACATCTTG
GGGCAAGTGGGGTCACATCTTAGGGCAGCTTTTCGGGTCACATCTTGGGG
CAGGTTTCACATGGCAGGGGTCGTATCTTGGGGCTGTACAGCGGGGTCTG
CTAATTAATAAAAACTACCAAAATAATCTTCATATCACCACAATATGTCG
TTTTTTATGAAATTTGTCGTTCTTTTTGTCTATTTTTAGTTATGCAGGAT
TCTTTAGATAAGCCTCTACGCCGTCGTTTTTGAATCAAAAAAATCTATGA
AATTTCAATTGTGGTGATATGAAGATTATTTGGGTAGTTTTTATTAATTA
GCAGCCCCAAATCTGAGTAAATTTGGGTGAAATTCGGCCTTTATGGTGTA
TTTTCTGGAATATTTTTATCCATTTTAAGGCAAAAAACTTCTAGATCTTT
CAAAATTTTAGTCCTAACAACTTTCACTCATCTTTGCTCATCTCAGAACA
TTTTTTTGATTTTGAAAAACATTGCCTTAATAGGGCTGGACGTATGTTAG
GTTGTTTACTTTGAGTGCTCCCCCTCTCGAGATATATATCTGTTTTTATA
TTTTAGTGTGTTTTGATCATCCAATGCAATTTCCATCTATATTTCCATCT
AGGTTCGGCAACAAATGTTCATCTTAAAAGCAAAGTGCTTTCTTTTCGAG
AAATCAATGAACAAAAGATGGTAAGATTCTTCCCTATTTTTATTTCCAGT
TGCGATAATCTAATCTACAAAATGTATTGAGAATTTTGGTTAATTCCTCG
TTTTTAGCAGTTTAGAAGTTCGGGCGAGAAAGTCTCTTTTGGTCTAATTG
ATAAATTTAATCGAATATTTTAATTCAGGAGGGGTTTATAAGCGTCCAGG
CTATATTCTATAAGATTTCGTGGGCATTTCCCTCTTTTCTCAATTTTTTT
TATATCTATTGACTCTTTAGAAATATTCATTTGGAAGAGGTTCAAAATTT
TTTCTTTTTTTATTGATATTCAAAATACCCTAGATTTATTTTCCATCCTG
CCATTAGGCCCCTTTTTCAGGGTCTTCAACGCGGTTTTGTAACAGTATGA
TATTAAAAATATTTTTTTGATTAAGATCATATTTTTATGTGGAGAAAATA
AATTTTTTCAACTAAACAACACTCCAGACAAGAGTCGATACAGTAATGGT
GTTAAAAGTATTGATATTTTTTATTATTGAAAGTATTTCAATACAAAATA
CTATTGCACAAGAATATATCATTGGTATTTATTCCAAATGTGATGATGGA
ACGATTAAAACGCATTCGAATAGAACAGATGTACAAAAACAAGCTTTGCT
TTACGACAAAATCATCAACTACACCTTCTATTCAGAAAGACAGTATGGCA
AATTTCTTCAAAGTATGGAGTATATCAGCTTTGATGTTTGCACCAGTCAA
GAACATCTCTCGAACCTTACTCAAACACTTATCCTAGACTATCAGTTTCA
ATCAGATGTCAACCATACTGAATCTGGAGAAAACGACGGCAAAATAATTC
TTCTATTCGTCTATTTAGAAAAAGATCTTCACAAATTATTATTAGAATTA
TTATTTGCTCATGGACGTATACCAACATTACTATTGAATTCTCATCCATT
GCCAGGTATTATGAATCCATATTACACGGTGATGGATCCTTTAGACGTTG
AGGTTTACATTCTGTTGATACATGCTAAGATATTCGATTGGCAACGTATA
GGACTGATCTTCATTTCTGGACATGATAAATTATACGTAGATTATTACCG
TGATTTAAATGAAAGAGTTATTAACAAACTTAGAACCGAACATCCAAACT
TATGTTATTTCAAAGAAACAGTCGATATACGAAATGAAACTGATTTGGAA
TCTATGATATTTAAGCTGCACGATGAACAAGATTCGAATGTTTTGATTCT
CTTTGGCGAACCTGATGATCAGATAACTTTAGTCAGGAAAACAAATACGG
ATTTCCATACAAGACATATATGGTTCACTCACGATATTGGGCATGATCTT
AGAGCACTTTTTCCAGATCCTTACGAAAATATTTATTTATTCTCATTTAC
AACTAAACTGAGAGAGCAAATCGTCCTAAATCAACTCAAATATGCTTTCG
ATATCAAACCACGTTTCAAAGAACTTTTTGTTGCTAATGGGAAAACAGCT
GAGTTGGCATTTACTTTGGCTAAAGAGATTTTGGTACAAATCAACAAAGT
GTATGGTAGATTCACTAATTTTACACCTTATTTTCTTGTGAAAAGAGCTA
TTTTACTAACTCTAAAAGTAGTTCAGTCAGTGTTACTTCAGAAAAACATT
TTTTCGCACGAATTTGTACACTCTACGGTGCAAATGGTTTACGATATAGA
TAAATATGACAAATACAAGGACACTGGTATTCAAGGCATATTATGTCATA
AGCATGCATGCGATCCAGGTTGGGAACAAACTAGAGGTCAACTTTTAAAG
AGTCTTACAAAATGGAGTTACGAATATGGCTTCACATGCCAGCGTTGTGC
TCCCAACTACATTAAACCTAAATACGGGTTCCATTTATGCCAGAGCTGTG
CAAAATATCATCAATCCAATGTTGACCATACTCGATGTGTTGACCCATAT
ACTGATATATTTTTAACCCAAGATCTTCTGTTCTATGCATCAATATCCTT
ATCTTGTTTCGGCGTTAGTATCAATGCAATCACACTGATGACTTTCATAT
TGCACCGAAAAACANCCTTGTTTCGGCGCTAGTATCAATGCAATCACACT
GATGACTTTCATATTGCACCGAAAAACACCAGTTGTTAAAAGCTCAGATT
TCGTGTTAACCGTTCTACATTTGGTAACATCTTTACTTATTAATGTAGGA
ATTATATGTCTTCGGTTTATGAAGCCGGCAAAAATATCATGTTCTTTAGA
TGCTATTTCACCAGGATTCTTGTATACTTTCTTTATTACCATTGTTTTAA
CTAAATCGCATAAAATTTTAAAAGCATTTGGCTCAATGAGGAAGTTAACA
ACGAAAAATAAACGGAACACAATAGTTCAACAATATACCATAATTGTTGG
TTTAATGGTGATTGTTATTGTTTTGACATTAATTGCACTAAGCAGCCAAT
TACCAGAAGTATTATCTCAAAGAGATACCCAAAAACTAATCATCTATATA
TCCTGCAATAACCTATTGCCAAAAATCTTCCAATTTGGATTTTCAGGAAT
TTTACAAATAGCTACATTCGTTATTGCGTACCGTGGTCGAAATTTACCGG
ATATTTTCAACGAATCAATGTCTTTACTGTACGCTTCGTTTTCGTCAACA
ATGTCACTCATTGTGATGTTTATTGTTTTAAAATTCGGAGGGAAAAACGA
TCTGTTTTTACCAGCATCCATCATCTGGGTAGCGGTATCATTGAATTTGA
ATATCTATGTACTATTATGTTATGGTAAAAAGATTTATATTATTTTGTTC
ATGAAAGAACGGAATACTAGAAGTTATATACAAAGGAAGACGTTCGAATC
GAACCAATCGGCTTCACTCTAGACGATCCAATCAGAATAACTTAATTTTT
AAGAGAATTTCTAAGCATAGTCCATTCACTTATGATATGATATACTTTAA
TTTAAAATATGATTATAATTGTTTTTAGATTCTGTATGTATCTGTATCCT
AACGCCCCAAGCATTATGCATTATTCAACCTCTCTGGCTGAAATTTTTTA
TAAAAAATCTGTTTTTTTCTTGAATGGGGATCTTTTTCTTATTCAAACTA
AACGACCCCCTCCCCCCTCAACTTTAAAATACACTGTATCACATACCCAG
TGGGACTTTCTAAAATTTCTCATCTCTGTTGTAGACTATCATTATTTTAT
CATCAACATGAAAAATATAAGCAATCTGAGTGGCGAAAAATGTGTACATA
AATGCTGTATTTCATATTGTACCGTACAAATCCGGGGGGGGGGGTACTTA
GGCAAAAATAGGTGCTGGGTATGTGCGGACGGTAAGGGCCAGGTTTTTCA
CCTTTCAAAGTCTCTCTAAGGGTTATAAAAATCAGAAAATTTCAAAGCAG
TCTCTCTAAGGTTGGGAAAAATCACGATTTTGAGAGAAAAAATTACAAAA
AAGTCTCACTAAGGGTAGGAAATTTTTGAAAATCAGAGAAAATTTTTCGA
AAAAGTCTCTCTAAGGGTTATAAAAATCAGAAAATTTCAAAGCAGTCTCT
CTAAGGTTGGGAAAAATCACGATTTTGAGAGAAAAAATTACAAAAAAGTC
TCACTAAGGGTAGGAAATTTTTGAAAATCAGAGAAAATTTTTCGAAAAAG
TCTCTCTAAGGGTTATAAAAATCAGAAAATTTCAAAGCAGTCTCTCTAAG
GTTGGGAAAAATCACGATTTTGAGAGAAAAAATTACAAAAAAGTCTCACT
AAGGGTAGGAAATTTTTGAAAATCAGAGAAAATTTTTCGAAAAAGTCTCT
CTAAGGGTTATAAAAATCAGAAAATTTCAAAGCAGTCTCTCTAAGGTTGG
GAAAAATCACGATTTTGAGAGAAAAAATTACAAAAAAGTCTCACTAAGGG
TAGGAAATTTTTGAAAATCAGAGAAAATTTTTCGAAAAAGTCTCTCTAAG
GGTTATAAAAATCAGAAAATTTCAAAGCAGTCTCTCTAAGGTTGGGAAAA
ATCACGATTTTGAGAGAAAAAATTACAAAAAAGTCTCACTAAGGGTAGGA
AATTTTTGAAAATCAGAGAAAATTTTTCGAAAAAGTCTCTCTAAGGGTCG
GTTTTCGGAGGTCCAGTCCGCACATACCCCTCATCCACCAACCCTAGTAC
CCCCCCCCCCACCCCGGGGGTACAAATATAAGACCGTGTTCAAAAAACGG
GTCTGGTAAGCGAGAGATCGTAATTTGAACTTTCTTGTTGTATCTTTTAC
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TTTGACGAAAATTTTTAACTCGTAAAGTATCTCCCATACCCGGGGGGGGC
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ATTTCCACAGAAGAAATTGTAATAAAGTCTCTCTAAGGGTAAGACTTTTT
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GCATATACCCCTCATTCGCCCCTCATTCGCCAACCCCCAGGCTCCCATAT
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GAGAATCCCCGTCGGATTTCAAAATCTCCACAAACGTTAAATAAGGTGGA
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TACTTGATTTTATGAATTGTAAAAAGTTGTAGATTCCTTAAAGACTAAAA
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CAGATTTAATAGATTTTCTGTTATTAAGTAAAGAAACATTAAAAACATCG
TAAGAAAGATCGAAGCCTGAGAATCTCCAAATAAGCCCAGTCAAAATTTA
CTGATTCTTATAATAAAAAAACGTGTATTTCACTTTATACAGAGTTACGG
GATCGATATTTGGATGTCACAAAAATGGGAAGACTATCGTCTCAAACATA
ACATTTCAAAAGTCATTACACCGCTACTAGGTCTTGGTAGACCTTCTAAT
TTGATCTGGGTCCCTGATACAGTTTTTATCAACGAAATCAATTCTAAATA
GCATTTGGTTACTGTTAGAAACAATAAGGTGGATATTAATAGCGATGGCA
CGGTGCATTTGATCTCCAGAGTCACTGTAGTTGCATCTTGTCGAATGAAT
TTTCGATTCTATCCATTGGATACACAGTTCTGTTATCTCTTCATAGAGAG
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TTTTCGGTACTAGATTCTGTCATCTCCTAGTCAGACCTTGGCCAGGGGCT
AGATTTTGGCTGTGTTAGAGCCAAAAGTTTTCACCATTAAAGCTTGAGGC
CTTTTTAGTCGGTCCTAATAGAGCACCGGTGCTTATTACGTCAAAGCTCG
ATAGTTTCCATTTTTACCTGGCCCTAATTTGATTTTCATCCCTTATACCG
GCCTTTATAATGCCAACCAGGTCTGATTAGGTACACCGTTTTTTCATCCA
GTCAACATCGACATAAACGTTAACAATTTTTGTATCTGAAAACTGATATT
TTGATTATAATATTTCAGCCTCAACTAAAAAAATAACCTCTGATAAACTT
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TGGCGTAATCGTAGAAAAGTATGATCTATCTCAGTATACGTTGGAAAAAG
TCGAGACATTTAAAAATAATATCAAAATATGAATCAGGTAGAAATATTCT
CCAAATTTCAATATATTTTCACTCAGTCCGTGGAGACATTTTCATTTAAT
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CGGGTTCATATTTTTTCAAAAGTGATTTTTTCATAAAATGGAGTATTTAA
ATTTTGTCTTTAATCGAATTATTTTAGTTTTTCGAGTGTGTTTATAATTT
GTAGTTCTAGATTTCCAAATCCCTCCCTCGAGCCAAACCATGATGGGCCC
TCATGGTNTTGTAGTTCTAGATTTCCAAATCTTATTTTGGCGAATAGTGA
TTTTTTTTTATTTTGGCGGGAACTAATTTTGGCGAATGACAAGGTAAATC
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TTAGGCAAGGAAACAAAATATTTGATTTTGGTGGGAACTAATTTTGGCGA
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TCTTTTTTCATTTGTCATAATGGTCTTTTATGTGCATGTTTTGAGTGTAT
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TGGACGGAACTCTGGCATTTAACCATGCTAAAAAACTAGTATGTTAATTA
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GCCCGAATGGTGTGCTGGTCTAGTATTTGCCTCCAAAATAAAGCCGATGA
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TGGACTTTTTCATAAGCAAATTTTGACTTCAAAAGCGTATAACTTGAGAA
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GGATCTTTTCAGCCAGTGGGGATATAAGAATAACGGACTGAAACTCGATG
AGGACCGATATTCCCACATTTTTATGGCTGGAGATTTCAATTCTTTTGTT
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TATATACTTTTAATTGATTATTTTCAGTGGGGAAAAAATTTGAGGATAAT
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CAGTGGGTCTGTGAAAAGGGGGTGTATATATTGAAAACAAGTACAAAATA
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TCTTTAAAAAATGCATCACTAAAGGAAACTGCTTTGGATTCCGCACGAAG
TCGTAAAGCCTCAGAAGCACCAGGAGCACCAGTCAATGTTAAAGAAGTCT
TGAAACGTAAACGGAAAGTCAAATTTGATGATTATGAAACGGGGACTTCG
AGAATTGACAGGGTGGCACGATTTTTGATTCCATGCTCGTATTTCATGTA
CAATATTTATTTTTGGTTTGTATTTATGGATGAACGACATNAATTCCATG
CGCGTTTTTCATGTACAATATTTATTTTTGGTTTGTATTTATGGATGAAC
GACATGCTTACGCAGCAGAACACAACAGACCCATTCATAAATGAATGCAC
GGTTTGTGAGAAAAGTTTATCGTTTTAAATCGTTAGTATGATACGTTTGA
AACTGTTTTGATTTGATTAGCAACGTAAATAAGTTGTTGG

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_005660	XLOC_005660	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000102	supercontig	sc0000102:87604..108693 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.433626	0.361038	0.263533	0	0.147497	0	0.327129	0	0	0.318779	0	0	0.272649	0.15361	0.124891	0.241244	1.04128	0.716114	0.341533	0.50988	1.74873	2.02547	0	1.2616	0.843948	3.75146	0	0	0.0523637	0

Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00010093 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: GBRB3 (Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3 OS=Homo sapiens GN=GABRB3 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 117.472 bits (293), Expect = 1.504e-29
Identity = 65/189 (34.39%), Postives = 104/189 (55.03%), Query Frame = 3

Query:   12 IRKEWNSLLKGYNRHIRPNYTGSATNVHLTIKIQSFREINERKMSYGIDIWMSQKWEDYRLKHNISKVITPLLGLGRPSNLIWVPDTVFINEINSKQHLVTVRNNKVDINSDGTVHLISRVTVVASCRMNFRFYPLDTQFCYLFIESFAYPDTYVDYNWRVG----VIVEKYDLSQYTLEKVETFKNNI 566
            +++  + LLKGY+  +RP++ G    V + I I S   ++E  M Y + ++  Q W D RL +  S +   L    R ++ +WVPDT F+N+  S  H VTV+N  + ++ DGTV    R+T  A+C M+ R YPLD Q C L IES+ Y    +++ WR G      VE+ +L Q+++ +      N+
Sbjct:   37 VKETVDKLLKGYDIRLRPDFGGPPVCVGMNIDIASIDMVSEVNMDYTLTMYFQQYWRDKRLAY--SGIPLNLTLDNRVADQLWVPDTYFLNDKKSFVHGVTVKNRMIRLHPDGTVLYGLRITTTAACMMDLRRYPLDEQNCTLEIESYGYTTDDIEFYWRGGDKAVTGVERIELPQFSIVEHRLVSRNV 223

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00010093 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00010093 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
GBRB3	1.504e-29	34.39	Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3 OS...	[more]

You are here

TCONS_00010093 (transcript) - C. hemisphaerica