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transcript sequence >TCONS_00009539 ID=TCONS_00009539|Name=TCONS_00009539|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3024bp GCAATTGCGAAAGTTTCTTGTGAACTCAGATAATTCTGAGCAAATTATGG CTCATCTATTCAATTCATATTCTGgccatgttcttacgatgttcttattt tccctcaAATTTCAGCCTCTAAATGTTCATATACAAcgtgtttcaaataa aaaaaagtgaattcaaaacaaaagacaaattaaaataaataacTCTTTAT AAACTTAATAACCAACTCATTAGGCAACTTGTTACCGAGTGTCTTACAAC TTTACAACCATCAGCTCTCAATGTACATAGTCTCATGGTCCTTTTATACA GCAAATAACATGCTAAATATTCATTTCTGGAATTAAAACAATTTTCCAAT CTATAAGTATCCTTTATTAACCCTTTCCTCTATGAAAGTCATAGACACTT TATTAAACGTTGGGAGGAGCAGGGTTTTGCCTCTTACCTTCATCAACCTC ACTATTTGCAACAGAAATAACAGCATAGATAAATGATTGACGatacaaca aaaataaaagctGGAGCAGCTGATAAGATAGCTATAGACTTATCCAAATC GGTTAGGCACTCTTTATGCCAAGGCGTTTGTATGAGTTTACCATCTTCCT TGGCAAAACATTCGCGTACTAATTCGTTGCTGCTGTGTTGTTTGATGTTA GCGATGACTCGTAGTAAAGAAGCTAATGTGAAAAGGGCCAATGATAAATA GAGAAATCCTTTGTATACGGATAGGCAATGAGGCATTTTACATTTAGATT TATTGATTTGGGTAGGTGGGATTTCGGTGTTTTCTTGCGGCTCGGAACCT GTTGTGGCTGAAGTTGAGGGAGATTCAGTGGTTTGGGTAGGTGGGATTTC GGTTTTTTGTTGCGGCTCGGAACCTGTCGTGGCTGAAGTTGAAAGAGATT TAGTGGTTTGGGTAGGTGGGATTTCGGTGTTTCGCTGCGGTTTATCTTGG AGTAATTTCCCAGATTTCCCAGTTTCTTCTTGTAATTCGCCGGCTTCAgt gtcttcatttttcttttcctgtGTTGATACATTGGTGTGGATATGGGAAA TCACTTCTGCAAATCCGGAGATACAGACCAAGAATGCAAAGACACATTGA ACGATGTCTTTACCAAACAACCACCATTTGTATTCAccaacaaaataatt ttccatgTAGAAGTATTGAAGAATCAATTCAGCACCATTATCAGAGAAAA TAATAACAAGAGCtagaaaaagctgaaaattcgAGTACTCCTTGATCACT TCGTCTCGCTGCTTTCTCTTTACTTTTATGACTGGACTGTATACGATTGA TGGATTTTCTTGACTTGGTCCAGGCATTGTGTCATCTTGTGGAGTTTCCC CTGTGTCGGTCAGTCGACTTGGTACTGGCTTTGCGTCATCTTGCGGAGTT TCCACGTTTTCAATGGTTCTGGCGTATCGTTCATCGCGACCAGTAAATTT CCAGGTGCGATAGAAGGAACAAATGGCAATCATCTTGCAGATATATCCGA CTATACCGAATGCAAAAGCAGATTTTGTTACGTGACTGTTACGGTGAAGT GATTGATGTGATCCTTCTAAATGAACAAGATCTCCAAATTCATATGTATA AAAGGCGTAAAAATCACCAATCATATCAATTAAAAACCACCAATAAGTAA CAATCCCAAGAATGTAACCaacaaaatgtttcatttcaacACAATTATAG TTTCCACATTTAGTACTGCAACATAAAGAATTGTTTGAGCAACAGTCCTT GCACCAGTTAAGACAAGAATCGCAACGTTTATCACAATTAAGACAACAAC CACAGCAACAACAGCAACAGTCTCCATCATCACAACATTCACAACATCTT TCTTTATCATCGTTACAGTTGTGAGTGGTATTCAGATAAACTTCAATAAG TTTTCGATTGTAGTTGAAGAAAAACACAACAAGGCTTATAATGAAAGCAA TGAATGGAATTGCGATGATAACACCAAGCCAAGCCTTTTTATTCATATCG GACTCCCATAGCTGGTCAACACCACACCAATATTTGCAACCCTTCGTTAT AGGGAAAGCTCCATTGTGACAAACACGAAAAACAAGGTGCCTAGCTCGGG CAAAAGACTCCCTACTCTATTCCTCATCTGAAGGTGGAATTGTTCGGCTC CTCAAACCTCTACACCAAATCAGAAAATGCTCGAATCCCATGGTAACTTG GTCACTTGTACCCCTTCACGGGGAAAACGCTGTTTGGTTAAGCGTGTTTT ATCAAAGAGATTCCCAAGATATAATCAAGGAGATCTGGAGAGACATTGGT GGCTTGACATCTTTTGGTCATCAGAGGTTTAACCAATCATTGAAGGTTTT GTACAAGAAGAATCAAGAATTTTCGGTCATTTTGACAAACATCGAGGACT CAATGAATCTTTATTTGACTTTGATCTTCATGAACGCTGAAGGTGAAATA AAGGGTGGTCCGTTGTTATCCAAAGCTAGCTTGAATGTGAAAGGTACAAT GACTTACAAAATCCACTCAGAGGGGTGTAATGATGATCCTAATACGTGTG GACATTCAGAAATTATTGTCAACGAGCAGAAATATGATGGCTTTGGAAGG GGAATGACTTTTGTTTTGGTGAATGCTAGTACAGGTGAATATCAGAATTG TAGATCGTTTGATTGGTATGCAGATAGTACAGCATGCCAACGCTCACTAC AATGGTTACAATCGTCTCCCAAAGGAACAACTGTGTTTGGTGCTATTCGC GACGAAGGAACAGTCAAATATAAtgatcaatgtgaaaaagcacTCCTCCT CATCGGTGGAAAGAAACCGTTCCAGAGGCAATCAAGAGGCTCGTTTGCTA TTGTTGGTTACCTTGGTGATCAGAAGCCATTATGGATTGGACAAAACATG AGTGCTCCGGGGAAAGGGCCCACCATTTTGAGTGGACAAGTCCCTTTGAT TTGTTAAATTCTATGTTTCTAATTCCGTCGTAAATTGGTAAATGGaaaaa tagctatttataacccagctggca Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000095:587277..639998- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00009539 ID=TCONS_00009539|Name=TCONS_00009539|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=52722bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000095:587277..639998- (Clytia hemisphaerica) GCAATTGCGAAAGTTTCTTGTGAACTCAGATAATTCTGAGCAAATTATGG
CTCATCTATTCAATTCATATTCTGGCCATGTTCTTACGATGTTCTTATTT
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CCTGAATTTTTACACTAGAAAAACCACACCCTCTGGATTTTTTATTTTCC
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TTGTCTTGAGGGGGTTAAACAGATAAAAAAAATCTTCAAAAAACTTACAA
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GCAGTATTTCTTAGCAAGTCTGGATACAATTTGATATTGCGTACAGGTAA
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CGGGAAAAGTGTATTTGTCAGCTACGTATAGCTACGTACAGAAATAAGTT
CCGTCTTGGAAAATTTTCAAAATTTGATAAGAGAGGGAGGGGCGCGACAT
ACAGAGGTTACTACTCCAGGATATGAGTATCAGGATTTAACAAAAATGAA
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TCATTTGGATCAAATCCAAGCTCCAATTAAAAGGGAGGGTTAATTAACTG
TCTTACTTAGAGTTTATTTAATATATACAAATTCGTGATTATCGCAGGAT
TTAAAAAATTATGATTCAACGGGGGACGATGTTTATATCCTTTTCATTGG
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AGGAAGGATGCTATTTCCCTGTTGACATGGATGATCGTGAATTTTATGAA
TCGGTGATTTGATATCTATTTGATTTTCTTCTACCCTTTTGCTACAATCA
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ACCATGACAATCGAACAACACTGGGAGAGCGATGCTCACGCGAAGTCGAA
TTTCATGATTACCACGGCACTTAACAATGCCTGTCTCATCTATCCATGTT
CATTTATCAGAGTGATGGTACCCAATTCCCCTCACATTGTATGGGTTGAC
CCGGGCGAAGGTACAATCACTGATCACTAGCCAAGTGAATCGTAGTGACA
TGTTGGGTATCGAACTTCCCAGGCGTGAAGTGGACGATAACCATTATACC
AGCTGGCACGCAACGTTGTTTCAACGTTTATCTAATGTTCATAACGTCCA
TATAACGTTAGATGAACGTTGAAACAACGTTGTGTACCAGCTGGGATACC
ACTATGACTATAGTACAGTTAACTCTCTCTAATTCAAATCTCTATTTTTC
GAATCTTTCTATAATTCGATCTAATCTAAGGGCGACCGTAGCATGAAGGT
AGAGCATTCAGCTACGGTGCGCAAGGTTATGGGTTCAATCCCCAGCCGGG
CCATACCAAAGATTCCCAAAATGGTACTTGGTGCCTCTCTGCTTGATGCT
CAGCAACTAAAGAGACGGATCAAGGGTAAGTGGAGAAATCCAGGNTCCCA
AAATGGTACTTGGTGCCTCTCTGCTTGATGCTCAGCAACTAAAGAGACGG
ATCATGGGGAAGTGGAGAAATCCAGGGAACGTAGTGGCGCCCTCCCCTAC
CTTCGGGTAGACAGCTATACGAAAAGGGAGCCTTCGGGTCGCCCTCGACT
GCGGTCGCAAACTTACAAACTTCAGACGAATAGATGACGTCAGAGTGCTT
TCTTTATAATTTGATCTAAAAAATTTGGTTCCTTCAGCTGGGGAGTAGTA
TATTACTCTCTGTTATTCGAATCATCTCTTGAAGAAAATTTTTGGTATCT
ATTGAAGATCAAATTAGAGAGAGAGTCAACTGTATATTGAGAACCTTTGG
TATTTTAACATTTTTTCAGTAAGTTAAAATTTAGGCGAGAATGGTTATTT
CTGCACTTCCACTTTATTTCATTGGATATTTCTATTTGGGATAGGTTTAG
TGGTTGAATGATTTCCAGACTATCTCAGCCATGTTAGAACATTTTTGAGC
TTTTTGATCCTGGAATGCTAGAATCCTAAGTCTAATAATAAAATTCATGT
TTTATGCTTCAGGATCTCAGATAGCGACATGCTGATGCAAGGCTAAATTA
TACTAATATCTGAATCTTTGTGGCTCTTGTTCGTAGAATCGTTAAAAGTT
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TACAGATTTAACACCCACTCCATAGAAGCCCGTGCAGTGAACCGTGGTGC
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GTGTATACTTTTGAATCACTTTTGTCACTCCAATAATTTTTTTTATGATA
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ACGTCATGTGCCGCGCTTAAGGGTGGGGTTTTTCAGCATCCCAAAATGCA
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTTCACACAGATTTACAGCTG
AGAAATATAGTGCACTATAAGGGTTGGGTAAATCAAGAGAAAATGCACTG
AAAGGGTACCTTTTCAGGCATATTGAATTGCACTGTAAGGGTACGATTTT
GAAAAGCAGATTTTGCGCGGCACATACCGTCGTTTCGAAATCGAGTGCCC
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TTGAATTTATTGCTTTATTGTGCCAATGCTTCCATAAAATAGAGTCTACT
TCTGACTGAATTGCTTTCTGACGATTTATGATGACGCTTAGTTTATTACT
CTACTGGGGAAGTAGATTAGGAGCGCTTGACGAGTTCGCCATTTTAATAG
GCAAGCACTAAAAATCCAAATAAAAAAAGTTACTCGGAGTTGAAAGATAT
AATTGAAAATAAGAAGCCAACAACAGATTTTCAATAATCTTTTTTCAAAA
ACGAGAATCATTCAGCCAATTCGATTGACTTCAAAATTTGCCATACTCAC
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CAAATTTGTACGTCGCTACGCATCCTATTTTTACTTTCCTAAAACAACTA
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ACGAAAAAAGTTATGGTTATTAGAATTTACAGTTTTTGTAGAGTTTTTCT
CGAGCTTATGGGACTTATTTTTAGGGTCTGCAATAAATTTAGGGCTGACG
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000095 | supercontig | sc0000095:587277..639998 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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