TCONS_00009506 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00009506
Unique Name	TCONS_00009506
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	1636

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
protein sequence
transcript from alignment at sc0000095:219931..229009-
coding sequence from alignment at sc0000095:219931..229009-

transcript sequence

>TCONS_00009506 ID=TCONS_00009506|Name=TCONS_00009506|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1636bp
AGGGGTCGAACAGAGCAGTTATGCTATGTGAAGGGAATTTGAGAGATATG
ATTCTGTTTATGTTGCTTTTGGCTGACCTTCATTTCGCTGGTACGTTTGC
TGTCAACAACGGTATGACCAAAGGTATTCAAAAGAAACCTGGTTTTGCTT
TTGCCCATTCAACAATTAGAACAACTCTTAaaTTGAAGGAATGTCCGTTC
AACAAAACAATCATGTacagcaacaaaaacaaaagcttACCTGTCACCAG
GACATGTTCTGATAGGGATAATAATCCGTACATGGAGCTGTTTTGGGATA
AACCAGATGGAGTCTCAGCTTTGGAAACTATCTACTACATTGTACGCTTA
AATATACCTCCATCCAATTTTTGTTTTGGATTTAATGTATCCATGGCAAC
TAAGCTAAAATTCACTGCACAAGATGgcttcattgaaaataaatcttaTT
GGGTCAGCATTGACGCATTCACTGAGAACAGGAAATCTCAAATCctttca
aaaatcataaaattggGAAGTTGTCCTTGGATAGGCGAATGGGCCAATTG
GGGAACATGGTCATCATGCCCGACTGGAATCTGTCCTTCCGGCAATCGAC
AGCCTCCTAAGACGACCAGGACCAGATATTGtatgttgaaaaataataat
gaaaCATATTTGGAAAGTCGTGATTGCAAAGGTTATCGTACGGACAGTAA
AAATTGTGGTTTGATGAAATGTACTACTGATGTTTCATCAAAAGaTCAAG
TAATCAATGGTCGCACCGTTACCATCACTACACAAATTGGAATAGCGTTC
GGTGTTTTAACCCTTTCCATTATTTTGATTGTTGTATTTTACCGGACCAT
CAAGAATCGTCAAGAATTTAAGTTGGTGACTGAGCCAAATCGTGTTACAG
aaCATTCAACTGTATATATCTCACATTTGACAATTGATGAAACCCAAGAA
CGTTCTTTATTGAATCTTGTACACTTTATATCAACTTATGGCATCAGACC
TAAGCTAGATATTTTATGTCAAGTTgaaatcaatgatgctggtggACTTC
ATAATTGGATACCTGATGTCCTGACGAAAATCGATACCGTCATTCTACTC
ATCACCAAAAAATATATCGAGgcATTGACATCTATCAAAGAAAACGATTT
GAAGTTAAATGAGCAGgtttgtaaaatacacactgAATTTAATCTAATCA
AGAAAAGACTGTATCAATCCAAACAACAGAACCCGAAACTTGTAATTCTA
TTGGACGATAAAATAAAGACTGAAATGTTACCAAAAGATCTTTCTGGTCG
AACATTTTGTTTTCTTCCAAAGAGATATGATCAAAAAGACGACGAACGTT
GTAATAAATTACTTGGACATTTATTAAATGTCGAACCGATTCAAATTCAG
TGACGCTTTTGTTTGGATTTGATTGATTACGCCAATCTCGTGCCCAGATC
ACTTTCTGATTTTACTGATTGACGTTTCAACGTGAGTGCTATCAGAATAA
TCACAAAAATacgaactaagggactgggttctGGTTTGGTTTACAGCTTT
TCGAAGTTCATTGATGGCGCTGTGATAATATTTTCCGCTAATGACCTAAA
TGATAGCGGGTTTATGTATTGATCATATTaagaaag

Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00009506-protein

>TCONS_00009506-protein ID=TCONS_00009506-protein|Name=TCONS_00009506-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=466bp
GSNRAVMLCEGNLRDMILFMLLLADLHFAGTFAVNNGMTKGIQKKPGFAF
AHSTIRTTLKLKECPFNKTIMYSNKNKSLPVTRTCSDRDNNPYMELFWDK
PDGVSALETIYYIVRLNIPPSNFCFGFNVSMATKLKFTAQDGFIENKSYW
VSIDAFTENRKSQILSKIIKLGSCPWIGEWANWGTWSSCPTGICPSGNRQ
PPKTTRTRYCMLKNNNETYLESRDCKGYRTDSKNCGLMKCTTDVSSKDQV
INGRTVTITTQIGIAFGVLTLSIILIVVFYRTIKNRQEFKLVTEPNRVTE
HSTVYISHLTIDETQERSLLNLVHFISTYGIRPKLDILCQVEINDAGGLH
NWIPDVLTKIDTVILLITKKYIEALTSIKENDLKLNEQVCKIHTEFNLIK
KRLYQSKQQNPKLVILLDDKIKTEMLPKDLSGRTFCFLPKRYDQKDDERC
NKLLGHLLNVEPIQIQ

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000095:219931..229009-

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00009506 ID=TCONS_00009506|Name=TCONS_00009506|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=9079bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000095:219931..229009- (Clytia hemisphaerica)
AGGGGTCGAACAGAGCAGTTATGCTATGTGAAGGGAATTTGAGAGATATG
ATTCTGTTTATGTTGCTTTTGGCTGACCTTCATTTCGCTGGTACGTTTGC
TGTCAACAACGGTATGACCAAAGGTATTCAAAAGGTATGCTACGAGTAAT
TATTTTTTTAGGTATTGATCAACTATTAGCTCTTATTATTCAAAAATCAC
GAAGTTAGCCTGTTCTGATATTCAAAATAATGTCATGTCATAGTTTTTTG
AGCAATTAGAAAATGTTTTTCAGATTTAATTTTTTTCTTCATTTTCCGAA
TTTTCCGGAATACTATAGCAAAAATGGGTGATAAGATATCGGGAGAAGAC
ATTTTTTAGGCCATTTTTTCCAATCTTCTTACTGATTGGTCATTATTTCT
ACTTTTTCAGAAACCTGGTTTTGCTTTTGCCCATTCAACAATTAGAACAA
CTCTTAGTAAGTACCTTTCAATTTCCTTGTCTTTGGCTTAATAAGTAATC
ATAGATTATCACAGCTTAGACATTTCGTAACTGTCTTGAAAAAATATTAA
CTCAAACAAGTCTTCTGGTCTCTTCGGTTAAACAATGCCTTTTAAACCAA
TTCCCTAAACATCCGAGCAAATTTGTATTCCCTGGTGCGTGTTCGAGTTG
TAGAGACCTCATATATCACGATTATCGAAACGTTCGTTCGTTCGTTCGTT
CGTTTTTTGTTTTTTCCTTCTCTATTCTCTCGTATTTCTTTCGTTGTTAG
ATTCGTTGACGAATTAGTGACTAACTACTTGCAATATTATGGAATTATCA
AAATTCGCACAAATAGAGCTTTTATAAGTATCATTTTTCTCATTTTTAGA
ATTGAAGGAATGTCCGTTCAACAAAACAATCATGTACAGCAACAAAAACA
AAAGCTTACCTGTCACCAGGACATGTTCTGATAGGGATAATAATCCGTAC
ATGGAGCTGTTTTGGGATAAACCAGATGGAGTCTCAGGTAATGTATTTTC
CCTAACTTCGTTTTCAACAAAGCTTTCATTAAATATGAATTGCCATCTAA
CTAAACGTGTAACTGAAATACTGGCTGACCTCGACTAACATAAAAAGTCT
TCTTTCAGTGATAGTCAAGAGTAGAAAGAAAATTATCATTACATACATTT
TTAATACAAATTTTCTACTTAAAGTCTGTCTCAACATAGTCAACAGTGGA
GACATATATATAATAAGCAGATATTCAATAGGTAAAAGTTGGTTATTGAG
ATTTATTAACCCGAGGTGATGTAATATTCAACGAGGCGAAGCTGAGTTGA
ATATTCATCACCGAGGGTTGATAAATCCAATAACCAACGTAAACCTATTG
AATATATGTTTAATTATATGCCAAAATTTCAAAAATTCACGAAATTCACA
ATTGAACTCTTTTATTGTCTCTCTTTAATAGCAACAAAATAAAAGTGACA
AAAAATCAAGTTTCGAAAAAAAGTTAAAAAAAAAAATTCTACTGTGGTAT
AATACCGTGGTATATCAGGAATTATTCAATGGCTGTTTTTGCCTACGGGT
ATATAATAATTCGAATTATACAGCAGTCTTGACGCTCGTTTAAAATATAT
TCCGGAGTGGAATATTATCAAATAAAGAAAGAATTTAAAAAACACTGAAA
GTAAATATTGAAAGCGAAGAATAAAAAAATCAACTTCTTCAATAACTGTA
GTGTTACCGGGTGGCCCAAAAAAAACTTAACATGATTTCGAAAGTGATTT
ATTTGACGTATGTTAGCCGTAAGAGTGCGAAACTTTCAGGATGTCTTTAC
AATGTATTATTATCATTTTCAAGAGTGATTCCTTGAACTGTCTAAAATCG
AATGTCTTTAATTACAGCTTTGGAAACTATCTACTACATTGTACGCTTAA
ATATACCTCCATCCAATTTTTGTTTTGGATTTAATGTATCCATGGCAACT
AAGCTAAAATTCACTGCACAAGATGGCTTCATTGAAAATAAATCTTATTG
GGTCAGCGTAAGTTAAATGCTTGATTTAAGCGTTCGTTTTTTAATTTGTT
TGATATGTTCTCTGGTTATGTCGGTAATGGACTAACATCCATAGCCTTAT
AGTACCTCATACTCCAAAGTTATCAAAAGTAAAGAGCTGTTTCAGGTTAT
GAAGGAAAATTGAATGTAGACTAATTCAAATTGACCAAGTGGAGTGGTTT
AGAGAGCATCCTCTCCTAAAGTACCACACCTAGCTACCACACCACAGAGT
CAGGCATATCTTCCCACACTCTTGTATCAAAGCATGATACCTAATTCCCC
TTACATGGTATGAGTTGACGCGGGTAAAGGTATATTCGGGACAAGCTGGA
GTTTTTACAAGCTCTTATTTGATTTGGTTAGTCGTTAAGATGTAATAAAA
GAATCTTATTACTTTTTCTAAAGAACGCGTCATCTCTATCACTTTAAATG
ACCAATTAGTGAAGTATCTTGTAAAAATTCCAAGGCATCTCCTATATTCA
CTTGTCAAGTGGATCACAGCACATAGTGGCATTCGAATCCCGACCTCCTG
CACGGAAGTGAAGACTGATAACCACTGCATTACTGCCCCTAACTGAAGTA
AAGTGGTTTAGGTATTTGAAACTAACTGTGCACACCGTTTTTAATCTCAT
CTCTTCATGTTTTATTCTATAATATTTCTTCGTATTTCTGAATTACAGAT
TGACGCATTCACTGAGAACAGGAAATCTCAAATCCTTTCAAAAATCATAA
AATTGGGAAGTTGTCCTTGTAAGTAAGCAATATGTTTTATGCGACAACTT
TAATTGAGAACATCTGTTTAAGTTCTGTATATTTAGAGTGAGATACACTT
TCATTTTGATATCTTATTTAGTACTCTCTTGGGAAATAAAACCCGAACGT
GCTCCAAAGGTTTATAGTGCATGTGTATTGTTTTGATATCTGGTAAATCC
AAATTTTGCTTATACAAGCACAATGATGAGAATTTCAGATTCAATCTTAT
TCCGTGGACCTTGCATTACGTTGTTTCAACCTTCATCTAACGGTATATGG
ACATTATATAGACGTTGAAATAAGGTTGTGTGCTGGCCGGGAAAAGGCAT
GTGCATGGTAAGTAATAAAGTGAGTTATCCCCGACTTCAGTTTCCCAGTT
ATCTTCCTCTTCAAGCCTACACTCTACAAATAACCCTCAAATGTTCATCA
TAGGGATAGGCGAATGGGCCAATTGGGGAACATGGTCATCATGCCCGACT
GGAATCTGTCCTTCCGGCAATCGACAGCCTCCTAAGACGACCAGGACCAG
ATATTGTATGTTGAAAAATAACAATGAAACATATTTGGAAAGTCGTGATT
GCAAAGGTTATCGTACGGACAGTAAAAATTGTGGTTTGATGAAATGTACT
ACTGATGTTTCATCAAAAGGTAAGTATTTGTTACTCTTAGGGGCTTCAGG
GACCTAATAAACGCCCCCTCCCTGTTTGTTACTTTTTTCTTTTTTCCAAC
CCCCTGGACCAACATTGGGACCCCTCTCCTAATTTGACACCTAAGAACTT
TGTACCGCATATAATTAAAAATCCACGCTACTAAAGAATCTGAAACTTAC
CCCAGTCTTCCGTCTCAAACGAATTTACGTCTCAGCGAGGTACAAAAAGA
GGCTTTTTAGTCTCCAGATTCAACAAAATTCTGCAAAATGTGAAAGATCT
TGCGCCTAATTTGCTGCTTACAGTTCATTTCCATCTCAGACAAATAAAGC
TTTATTTTGACCATTGCTAAAGTATTTAAAGTAAAAACTCAGAAAAATCT
GCCATCTTAAACTTTATTTGTTAGTCCAGTAGAATTTCATCAAAATAGGG
TCTAGCTAGAAAAAAAAATTATTTAATGTTTCTATATATCGTTGGAAAGA
TAATTTTACCCAACATTCGAAAGCTGATAAAATTATCTTTCCAACGGTAT
ATAGAAACCTTTTATAACATTTTTGGTCAAAAAGTCAAAAAGGTTGACTC
AAAATTATACTGGACTATATATGATTTTATGTTGCCATTGCACAATAAGA
TGTACCAAAAAAACTATAGAGTCGNCGATGACACTGCGCACTTCTAAAAA
TATTTTAGAGACGTAAAAGTCTCCTTCGAAAGATAGCCGTTCTGGTCAGC
AAAATAGATACCGAGTTGTAATAAATGAGTNAAGAACAGGAAATCTCAAA
TCCTTTCAAAAATCATAATATTGGGAAGTTGTCCTTGTAAGTAAGCAATA
TGTTTTATCCGACAACTTTAATTGAGAACATCTGTTTAAGTTCTGTATAT
TTAGAGTGAGATACACTTTCATTTTGATATCTTATTTAGTACTCTCTTGG
GAAATAAAACCCGAACGCGCTCCAAAGGTTTATAGTGCATGTGTATTGTT
TTGATATCTGGTAAATCCAAATTTTGCTTATACAAGCACAATGATGAGAA
TTTCAGATTCAATCTTATTCCGTGGACCTTGCATTACGTTGTTTCAACCT
TCATCTAACGGTATATGGACATTATATAGACGTTGAAATAAGGTTGTGTG
CTGGCCGGGAAAAGGCATGTGCATGGTAAGTAATAAAGTGAGTTATCCCC
GACTTCAGTTTCCCAGTTATCTTCCTCTTCAAGCCTACACTCTACAAATA
ACCCTCAAATGTTCATCATAGGGATAGGCGAATGGGCCAATTGGGGAACA
TGGTCATCATGCCCGACTGGAATCTGTCCTTCCGGCAATCGACAGCCTCC
TAAGACGACCAGGACCAGATATTGTATGTTGAAAAATAATAATGAAACAT
ATTTGGAAAGTCGTGATTGCAAAGGTTATCGTACGGACAGTAAAAATTGT
GGTTTGATGAAATGTACTACTGATGTTTCATCAAAAGGTAAGTATTTGTT
ACTCTTAGGGGCTTCAGGGACCTAATAAACGCCCCCTCCCTGTTTGTTAC
TTTTTTCTTTTTTCCAACCCCCTGGACCAACATTGGGACCCCTCTCCTAA
TTTGACACCTAAGAACTTTGTACCGCATATAATTAAAAATCCACGCTACT
AAAGAATCTGAAACTTACCCCAGTCTTCCGTCTCAAACGAATTTACGTCT
CAGCGAGGTACAAAAAGAGGCTTTTTAGTCTCCAGATTCAACAAAATTCT
GCAAAATGTGAAAGATCTTGCGCCTAATTTGCTGCTTACAGTTCATTTCC
ATCTCAGACAAATAAAGCTTTATTTTGACCATTGCTAAAGTATTTAAAGT
AAAAACTCAGAAAAATCTGCCATCTTAAACTTTATTTGTTAGTCCAGTAG
AATTTCATCAAAATAGGGTCTAGCTAGAAAAAAAAATTATTTAATGTTTC
TATATATCGTTGGAAAGATAATTTTACCCAACATTCGAAAGCTGATAAAA
TTATCTTTCCAACGGTATATAGAAACCTTTTATAAAATTTTTGGTCAAAA
AGTCAAAAAGGTTGACTCAAAATTCTACTGGACTATATATGATTTTATGT
TGCCATTGAACAATAAGATGTACCAAAAAACTATAGAGTCGTCGTATCCC
TAGGATTCGATTCATTCGGTCATTCGAATTGCGACATAAAACTTTCGTTT
GCCTAAAAAAGGTTCACGGTTTCTCTCTAGTCTTTGGTTATATATTATTG
CTTCTAAATTACTCTGTACTAGATGGGCAAAGGAGCAAGGAAATTTGTAA
TTACAAACTACAAATGTATTTCATTTTCAAAATTGAACTTTTTTACAAAG
TATAACTCATTATTTTTTATATTTATAGATCAAGTAATCAATGGTCGCAC
CGTTACCATCACTACACAAATTGGAATAGCGTTCGGTGTTTTAACCCTTT
CCATTATTTTGATTGTTGTATTTTACCGGACCATCAAGAATCGTCAAGAA
TTTAAGTTGGTGACTGAGCCAAATCGTGTTACAGGTGAATGATTTAATTG
TTTAATATCAAGATGGCCTTTCTGCAATATTGTGCGTACACAGCCCCTAT
TGAGGATATCCATTTTTTGAGCTCCACAGCTTTGTCTGACTTAAAAATAA
AGACCTCCCAGGATATCCTGGATGTCCAAGTAGATGGAAGGGTTAAGGAT
ATCCATGAATTTCGTACCCCCTGGATGTTCGATTTTGTCAACAGCGACAC
GGACTATTTCTGCCCAATGCGTGATACATTTTATTTGTTTGTGCTCTTCA
TTTTGTGCAATGAGGGTAGTATTTCGTTAAATTCAGATTCTTAAAACCTT
TTGTACGACGGCCCCTAAGGCTCACCACGCACTTCCAGTTCTTATAAAAT
TTGTGAACTAGGACTGTCTAGGGTCATGGCCCAGAAGGCTCACGAGACAC
TGCACACTTCTGAGTTTTTTTGCGATGACACTGCACACTTCTAAAAATAT
TTTAGAGACGTAAAAGTCTCCTTCGAAAGATAGCCGTTCTGGTCAGCAAA
ATAGATACCGAGTTGTAATAAATGAGTTGATGATAATAGCGAAATAATTT
GTGGTTAAAGTTGATATTTGATCACTTTTTGCTTCCCCGATTTAAGCCCG
AAAATTCCCCGATTTTTGCCCCCGGGGGGGGGGGGATTTTGCTGACCAGC
ACTTAACTCGGAAATTTTGACCTGTAGCATTTGCTATAAACAACTCGGAA
ATTTTAACTCATTTTGCGTAACTCGACATTCATTTTAAAGACCAAACAAA
TTTTTATTGCGCGGGCCGCTCGCTTGGAAATTTCCCGCCGTGACAAAAAG
TCAGAAGTGCGCAGTGTCACTTGAGCCTTCTGGGCCATTGACTTTTGTTT
CCAATGCTCGATTTTTTTCTTCGAGATAGATTGAACGAAAAGAAAACAAG
AAAACAAATTTGATCACGGATCACAAAATACAGCATCGAATCCAATGCTC
TTAATTTTACTGTCCAAAATTTTTTCAATAGAACATTCAACTGTATATAT
CTCACATTTGANCTGACTTAAAAATAAAGACCTCCCAGGATATCCTGGAT
GTCCAAGTAGATGGAAGGGTTAAGGATATCCATGAATTTCGTACCCCCTG
GATGCTCGATTTTGTCAACAGCGACACGGACTATTTCTGCCCAATGCGTG
ATACATTTTATTTGTTTGTGCTCTTCATTTTGTGCAATGAGGGTAGTATT
TCGTTAAATTCAGATTCTTAAAACCTTTTGTACGACGGCCCCTAAGGCTC
ACCACGCACTTCCAGTTCTTATAAAATTTGTGAACTAGGACTGTCTAGGG
TCATGGCCCAGAAGGCTCACGAGACACTGCGCACTTCTGAGTTTTTTTGC
GATGACACTGCACACTTCTAAAAATATTTTAGAGACGTAAAAGTCTCCTT
CGAAAGATAGCCGTTCTGGTCAGCAAAATAGATACCGAGTTGTAATAAAT
GAGTTGATGATAATGGCGAAATAATTTGTGGTTAAAGTTGATATTTGATC
ACTTTTTGCTTTCCCGATTTAAGCCCGAAAATTCCCCGATTTTTGCCACT
GGGGGGGGGGGATTTTGCGGACCAGCAATTAACTTGGAAATTTTAACCTG
TAACATTTGCTATGAACAACTCATTTTGCGTAACTCGACATTCAATTTAA
AGACCAAACAAATTTTTATTGCGCGGGCCGCTCGCTTGGAAATTTCCCGC
CGTGACAAAAAGTCAGAAGTGCGCAGTGTCACTTGAGCCTTCTGGGCCAT
TGACTTTGCTTTCCAATGCTCGATTTTTTTCTTTGAGATAGATTGAACGA
AAAGAAAACAAGGAAAAAGATTTGATCACGAATCACAAAATACAGCATCG
AATCCAATGCTCTTAATTTTACTGTCCAAAATTTTTTCAATAGAACATTC
AACTGTATATATCTCACATTTGACAATTGATGAAACCCAAGAACGTTCTT
TATTGAATCTTGTACACTTTATATCAACTTATGGCATCAGACCTAAGCTA
GATATTTTATGTCAAGTTGAAATCAATGATGCTGGTGGACTTCATAATTG
GATACCTGATGTCCTGACGAAAATCGATACCGTCATTCTACTCATCACCA
AAAAATATATCGAGGTAAGAGGTTCTTTTTTTCTTTCCTAGGTGGCACAA
AGACAAAACAGCTAGACAAGAAAACTAGTCTGTTAATTGATAATGTTAGT
AATTGGGAGTCAAAAAAAGGAGCTACGTAGGAAATCTAGGAAAAGTTGTC
GAATGGGTGCGGATTTTTGAAAAAATCTTCACTTAAGGGAGTGTCTTGGT
TTTCACGTTTTTTATAAGAACATCCTAAATTTTTGAAGCCTTCAGATGTT
CTTAAATTTTTGAGTTTAAAGCCTAAAAATGTCCTTAAAATGTTCTTATT
TTCACCATTTTGTTGGTATTTTTGTTCAATTTCCTCAGAAAATGGGTGTT
TTAGAGTTTGCGACGCTTTAAAATGTTCTTAACATGTTCTTGATATTTTT
TCATCGAAACCTTATGTTCTTATATAGTTCGTTTTTTTTACAAAAACGTG
TACTCTTATCAACAACCTTCGATCAACGTTTTAACAGTTAAATTGTGTTT
TTCTTCATTTTCAGGCATTGACATCTATCAAAGAAAACGATTTGAAGTTA
AATGAGCAGGTTTGTAAAATACACACTGAATTTAATCTAATCAAGAAAAG
ACTGTATCAATCCAAACAACAGAACCCGAAACTTGTAATTCTATTGGACG
ATAAAATAAAGACTGAAATGTTACCAAAAGATCTTTCTGGTCGAACATTT
TGTTTTCTTCCAAAGAGATATGATCAAAAAGACGACGAACGTTGTAATAA
ATTACTTGGACATTTATTAAATGTCGAACCGATTCAAATTCAGTGACGCT
TTTGTTTGGATTTGATTGATTACGCCAATCTCGTGCCCAGATCACTTTCT
GATTTTACTGATTGACGTTTCAACGTGAGTGCTATCAGAATAATCACAAA
AATACGAACTAAGGGACTGGGTTCTGGTTTGGTTTACAGCTTTTCGAAGT
TCATTGATGGCGCTGTGATAATATTTTCCGCTAATGACCTAAATGATAGC
GGGTTTATGTATTGATCATATTAAGAAAG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000095:219931..229009-

>TCONS_00009506 ID=TCONS_00009506|Name=TCONS_00009506|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=14010bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000095:219931..229009- (Clytia hemisphaerica)
GCATTGACATCTATCAAAGAAAACGATTTGAAGTTAAATGAGCAGGTTTG
TAAAATACACACTGAATTTAATCTAATCAAGAAAAGACTGTATCAATCCA
AACAACAGAACCCGAAACTTGTAATTCTATTGGACGATAAAATAAAGACT
GAAATGTTACCAAAAGATCTTTCTGGTCGAACATTTTGTTTTCTTCCAAA
GAGATATGATCAAAAAGACGACGAACGTTGTAATAAATTACTTGGACATT
TATTAAATGTCGAACCGATTCAAATTCAGTGAATTTGACAATTGATGAAA
CCCAAGAACGTTCTTTATTGAATCTTGTACACTTTATATCAACTTATGGC
ATCAGACCTAAGCTAGATATTTTATGTCAAGTTGAAATCAATGATGCTGG
TGGACTTCATAATTGGATACCTGATGTCCTGACGAAAATCGATACCGTCA
TTCTACTCATCACCAAAAAATATATCGAGAACATTCAACTGTATATATCT
CACATCAAGTAATCAATGGTCGCACCGTTACCATCACTACACAAATTGGA
ATAGCGTTCGGTGTTTTAACCCTTTCCATTATTTTGATTGTTGTATTTTA
CCGGACCATCAAGAATCGTCAAGAATTTAAGTTGGTGACTGAGCCAAATC
GTGTTACAGGGATAGGCGAATGGGCCAATTGGGGAACATGGTCATCATGC
CCGACTGGAATCTGTCCTTCCGGCAATCGACAGCCTCCTAAGACGACCAG
GACCAGATATTGTATGTTGAAAAATAATAATGAAACATATTTGGAAAGTC
GTGATTGCAAAGGTTATCGTACGGACAGTAAAAATTGTGGTTTGATGAAA
TGTACTACTGATGTTTCATCAAAAGATTGACGCATTCACTGAGAACAGGA
AATCTCAAATCCTTTCAAAAATCATAAAATTGGGAAGTTGTCCTTCTTTG
GAAACTATCTACTACATTGTACGCTTAAATATACCTCCATCCAATTTTTG
TTTTGGATTTAATGTATCCATGGCAACTAAGCTAAAATTCACTGCACAAG
ATGGCTTCATTGAAAATAAATCTTATTGGGTCAGCAATTGAAGGAATGTC
CGTTCAACAAAACAATCATGTACAGCAACAAAAACAAAAGCTTACCTGTC
ACCAGGACATGTTCTGATAGGGATAATAATCCGTACATGGAGCTGTTTTG
GGATAAACCAGATGGAGTCTCAGAAACCTGGTTTTGCTTTTGCCCATTCA
ACAATTAGAACAACTCTTAGGGTCGAACAGAGCAGTTATGCTATGTGAAG
GGAATTTGAGAGATATGATTCTGTTTATGTTGCTTTTGGCTGACCTTCAT
TTCGCTGGTACGTTTGCTGTCAACAACGGTATGACCAAAGGTATTCAAAA
GGCATTGACATCTATCAAAGAAAACGATTTGAAGTTAAATGAGCAGGTTT
GTAAAATACACACTGAATTTAATCTAATCAAGAAAAGACTGTATCAATCC
AAACAACAGAACCCGAAACTTGTAATTCTATTGGACGATAAAATAAAGAC
TGAAATGTTACCAAAAGATCTTTCTGGTCGAACATTTTGTTTTCTTCCAA
AGAGATATGATCAAAAAGACGACGAACGTTGTAATAAATTACTTGGACAT
TTATTAAATGTCGAACCGATTCAAATTCAGTGAATTTGACAATTGATGAA
ACCCAAGAACGTTCTTTATTGAATCTTGTACACTTTATATCAACTTATGG
CATCAGACCTAAGCTAGATATTTTATGTCAAGTTGAAATCAATGATGCTG
GTGGACTTCATAATTGGATACCTGATGTCCTGACGAAAATCGATACCGTC
ATTCTACTCATCACCAAAAAATATATCGAGAACATTCAACTGTATATATC
TCACATCAAGTAATCAATGGTCGCACCGTTACCATCACTACACAAATTGG
AATAGCGTTCGGTGTTTTAACCCTTTCCATTATTTTGATTGTTGTATTTT
ACCGGACCATCAAGAATCGTCAAGAATTTAAGTTGGTGACTGAGCCAAAT
CGTGTTACAGGGATAGGCGAATGGGCCAATTGGGGAACATGGTCATCATG
CCCGACTGGAATCTGTCCTTCCGGCAATCGACAGCCTCCTAAGACGACCA
GGACCAGATATTGTATGTTGAAAAATAATAATGAAACATATTTGGAAAGT
CGTGATTGCAAAGGTTATCGTACGGACAGTAAAAATTGTGGTTTGATGAA
ATGTACTACTGATGTTTCATCAAAAGATTGACGCATTCACTGAGAACAGG
AAATCTCAAATCCTTTCAAAAATCATAAAATTGGGAAGTTGTCCTTCTTT
GGAAACTATCTACTACATTGTACGCTTAAATATACCTCCATCCAATTTTT
GTTTTGGATTTAATGTATCCATGGCAACTAAGCTAAAATTCACTGCACAA
GATGGCTTCATTGAAAATAAATCTTATTGGGTCAGCAATTGAAGGAATGT
CCGTTCAACAAAACAATCATGTACAGCAACAAAAACAAAAGCTTACCTGT
CACCAGGACATGTTCTGATAGGGATAATAATCCGTACATGGAGCTGTTTT
GGGATAAACCAGATGGAGTCTCAGAAACCTGGTTTTGCTTTTGCCCATTC
AACAATTAGAACAACTCTTAGGGTCGAACAGAGCAGTTATGCTATGTGAA
GGGAATTTGAGAGATATGATTCTGTTTATGTTGCTTTTGGCTGACCTTCA
TTTCGCTGGTACGTTTGCTGTCAACAACGGTATGACCAAAGGTATTCAAA
AGGCATTGACATCTATCAAAGAAAACGATTTGAAGTTAAATGAGCAGGTT
TGTAAAATACACACTGAATTTAATCTAATCAAGAAAAGACTGTATCAATC
CAAACAACAGAACCCGAAACTTGTAATTCTATTGGACGATAAAATAAAGA
CTGAAATGTTACCAAAAGATCTTTCTGGTCGAACATTTTGTTTTCTTCCA
AAGAGATATGATCAAAAAGACGACGAACGTTGTAATAAATTACTTGGACA
TTTATTAAATGTCGAACCGATTCAAATTCAGTGAATTTGACAATTGATGA
AACCCAAGAACGTTCTTTATTGAATCTTGTACACTTTATATCAACTTATG
GCATCAGACCTAAGCTAGATATTTTATGTCAAGTTGAAATCAATGATGCT
GGTGGACTTCATAATTGGATACCTGATGTCCTGACGAAAATCGATACCGT
CATTCTACTCATCACCAAAAAATATATCGAGAACATTCAACTGTATATAT
CTCACATCAAGTAATCAATGGTCGCACCGTTACCATCACTACACAAATTG
GAATAGCGTTCGGTGTTTTAACCCTTTCCATTATTTTGATTGTTGTATTT
TACCGGACCATCAAGAATCGTCAAGAATTTAAGTTGGTGACTGAGCCAAA
TCGTGTTACAGGGATAGGCGAATGGGCCAATTGGGGAACATGGTCATCAT
GCCCGACTGGAATCTGTCCTTCCGGCAATCGACAGCCTCCTAAGACGACC
AGGACCAGATATTGTATGTTGAAAAATAATAATGAAACATATTTGGAAAG
TCGTGATTGCAAAGGTTATCGTACGGACAGTAAAAATTGTGGTTTGATGA
AATGTACTACTGATGTTTCATCAAAAGATTGACGCATTCACTGAGAACAG
GAAATCTCAAATCCTTTCAAAAATCATAAAATTGGGAAGTTGTCCTTCTT
TGGAAACTATCTACTACATTGTACGCTTAAATATACCTCCATCCAATTTT
TGTTTTGGATTTAATGTATCCATGGCAACTAAGCTAAAATTCACTGCACA
AGATGGCTTCATTGAAAATAAATCTTATTGGGTCAGCAATTGAAGGAATG
TCCGTTCAACAAAACAATCATGTACAGCAACAAAAACAAAAGCTTACCTG
TCACCAGGACATGTTCTGATAGGGATAATAATCCGTACATGGAGCTGTTT
TGGGATAAACCAGATGGAGTCTCAGAAACCTGGTTTTGCTTTTGCCCATT
CAACAATTAGAACAACTCTTAGGGTCGAACAGAGCAGTTATGCTATGTGA
AGGGAATTTGAGAGATATGATTCTGTTTATGTTGCTTTTGGCTGACCTTC
ATTTCGCTGGTACGTTTGCTGTCAACAACGGTATGACCAAAGGTATTCAA
AAGGCATTGACATCTATCAAAGAAAACGATTTGAAGTTAAATGAGCAGGT
TTGTAAAATACACACTGAATTTAATCTAATCAAGAAAAGACTGTATCAAT
CCAAACAACAGAACCCGAAACTTGTAATTCTATTGGACGATAAAATAAAG
ACTGAAATGTTACCAAAAGATCTTTCTGGTCGAACATTTTGTTTTCTTCC
AAAGAGATATGATCAAAAAGACGACGAACGTTGTAATAAATTACTTGGAC
ATTTATTAAATGTCGAACCGATTCAAATTCAGTGAATTTGACAATTGATG
AAACCCAAGAACGTTCTTTATTGAATCTTGTACACTTTATATCAACTTAT
GGCATCAGACCTAAGCTAGATATTTTATGTCAAGTTGAAATCAATGATGC
TGGTGGACTTCATAATTGGATACCTGATGTCCTGACGAAAATCGATACCG
TCATTCTACTCATCACCAAAAAATATATCGAGAACATTCAACTGTATATA
TCTCACATCAAGTAATCAATGGTCGCACCGTTACCATCACTACACAAATT
GGAATAGCGTTCGGTGTTTTAACCCTTTCCATTATTTTGATTGTTGTATT
TTACCGGACCATCAAGAATCGTCAAGAATTTAAGTTGGTGACTGAGCCAA
ATCGTGTTACAGGGATAGGCGAATGGGCCAATTGGGGAACATGGTCATCA
TGCCCGACTGGAATCTGTCCTTCCGGCAATCGACAGCCTCCTAAGACGAC
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GTCGTGATTGCAAAGGTTATCGTACGGACAGTAAAAATTGTGGTTTGATG
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Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_005309	XLOC_005309	Clytia hemisphaerica	gene

The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:


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The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


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Expression

Values :

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Annotated Terms

The following terms have been associated with this transcript:

Vocabulary: **INTERPRO**
Term	Definition
IPR000884	TSP1_rpt
IPR000157	TIR_dom

Vocabulary: **Molecular Function**
Term	Definition
GO:0005515	protein binding

Vocabulary: **Biological Process**
Term	Definition
GO:0007165	signal transduction

GO Annotation

GO Assignments

This transcript is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0007165	signal transduction
molecular_function	GO:0005515	protein binding

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00009506 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00009506 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

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TCONS_00009506 (transcript) - C. hemisphaerica