TCONS_00009490 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00009490
Unique NameTCONS_00009490
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length2291

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00009490 ID=TCONS_00009490|Name=TCONS_00009490|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2291bp
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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000095:481623..498152+

Legend: exon
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>TCONS_00009490 ID=TCONS_00009490|Name=TCONS_00009490|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=16530bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000095:481623..498152+ (Clytia hemisphaerica)
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TCTCAGATCTTTCTCTTTAGTCTCAAAATTTTGACATTCAATTTTATTCG ATGTTATGTTCTAATTtgtaaaaaacaacatttttattcaagaaTACCTA TAAccttttaatttgtttttcgaaaaaagCAATTTGTACATTCTACATTA GGTAATGAAATAATTATTAGCGAGTACTATAAAACTTGTAAAATTTTAGT TGAGTTTTATATCTTAAAATTCTGATTTGTAAAAtagttaattttcaaaa ataatagcATAATCTTTTAATACCAATTAAAAACCCATTAACGACCTATT GTAAAATATGAGAATATTCGGTTTTCTTTTTCTAGTATAGTAAAAtaata atacaaaaatatatcaaaatacaaatttaa
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_005304XLOC_005304Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000095supercontigsc0000095:481623..498152 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.43358 0 0 0 0 0.387406 0.746012 0 1.436 2.23229 0 1.65266 11.0058 7.32546 12.9846 16.8375 11.6739 18.4178 2.71851 6.64238 9.51149 7.84661 6.94749 7.9509 12.3458 6.15371 6.61439 0 5.58292 5.34386
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00009490 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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