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transcript sequence >TCONS_00009490 ID=TCONS_00009490|Name=TCONS_00009490|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2291bp GtagcttaaaaaaaacaaaaatttgaaatttgaaatttacttCGTGTGAA AACAAAATCAATGTTACTTGAAGATTCATTGTTAACCCCGTACGGGCACA CGTTCCGCTACGCTAGCGTTGGCGGCGAATCCGAAAATTTATCACGTGAC AATATCGCCTCAACACGATTGGTTAAGAGAACTTACAGTGATAGCGCAAA GGACCCATTGAAGAGATTCGAATATTTGAGGAATGGCAAAGCAACCAGTG TTATGATTCGGGCTACACCGAACGCTGTCAGGTGGGACGAAATCAATCGT ATCCAATACCGCTTCCAAGCACTCAATTTTCACAGTGATgTACTTGATGC TTTGATTCAAAACTCACCACCACTTTCAAGACGAGAACACAACGTTGCTT CCAACAAACcgaaaaacgaaaacgaaagtgataaaaacaataacaatatt CCTTTAAATCGTCGCGATGACAACAATAATAACCAAAATGGTAGCCTTAG CAGCGACGACGAAGACGATGAAACAGATCTAATTGACGCGACATCAACAA AAAAGAATGTCGAGAAAATCCGTAATACGCGCTCCGGTAAATTGCGTTCA ATACGACGATCGAATTCGGCCGACGTTCGAAACGAAATCGAACGAAAAGC CTCGGTAGTGCAAGTAGGACCGAAAGACGATACAAGTGACTATAATAGCG ATGAAGAAGTATTTCAAACTCGCTCAGAAGGAGATATAGACTTTAATACA ACAATATGTCATGTTAAAACAGGTCAAATAAAAGACACAACACAAATTCA TGTGCAGTCTTATAATACTACGACGAATAATATGGACAATGATAATAAAC CGTTTACTAAGAAAGACTTGAATCTACTAGCAGATCCTTCTACTTACGGA AAAGCGAGTCAACGACAAGCTTCATCTGCTCCAGCGTCTACGAAAATTTC CGTGGTTACACCAATAGAAAGCGTTTCAATCAACGATCGATTTCGAAGTG AAATAACGAACCTTGGAGATACAACAAACGAGGATTTATCAGCTAAATCG AAAGAAGATCTTATCGAATTGGTCAAAAGTTTACAAAGGGAACTGGAAAC GAGTAAACAACAACAATGCAATCACTCTTCACCACAGATGCTTTCTACGA GATCTTCGTGTAGTCGACAAGATTCTATCAGTGAAGAAATCAGCCCCGAG GAGGAAGCGGACGACGGGCGGTCAACGCCCGCTGTTTCAACGTtgattga aaatttcgaaaaacgtgAGGGATTTAGGCTACAAAGGAGCAGTACTCTAC CGTACAGGATTCGAAAAGCACCAAGTTGAACGCAAACAAATATTCTGTAT GTGATATCGAGGAACCGTTGAAAAGACGAAAGGTTAATTACATTACGTTG AGCAAAAGgaatatgctgacgtcagctaTACAGACGATACATGTATGTAA CATAACCATGCTCTTTATGGATCTTGCCATGCATTGTGGCGGTACGCCCA TTTATTCAAGCCACCAGCCAAACAGAGATCATCGCCCAATATCACCCTTT ATATTCTCACCACGAGTATGCTGTTAAGGCATGAAAGttggggacgagat ggagtttttacaagctcttatttgatttggttggtcgttaaccagtaata aaacaattttgttactttttctaaagaacgcgtcatttttattacttcaa atgaccaattattaaagtatcttataaaaactccatttcATCTGGAAAGT TGAGCCGTTGCAATTGATGATTGACGTTAAATTCAACGCTTGAAGAccaa ataaaaactttacacagAAAGATCACACGTAAATGAGCTACTAGTTAGCC ACTTGatttttttatccatttttggGAAAGGATTGACATGGTTAGTTTGA CAATGGAGACTTCTCAGATCTTTCTCTTTAGTCTCAAAATTTTGACATTC AATTTTATTCGATGTTATGTTCTAATTtgtaaaaaacaacatttttattc aagaaTACCTATAAccttttaatttgtttttcgaaaaaagCAATTTGTAC ATTCTACATTAGGTAATGAAATAATTATTAGCGAGTACTATAAAACTTGT AAAATTTTAGTTGAGTTTTATATCTTAAAATTCTGATTTGTAAAAtagtt aattttcaaaaataatagcATAATCTTTTAATACCAATTAAAAACCCATT AACGACCTATTGTAAAATATGAGAATATTCGGTTTTCTTTTTCTAGTATA GTAAAAtaataatacaaaaatatatcaaaatacaaatttaa Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000095:481623..498152+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00009490 ID=TCONS_00009490|Name=TCONS_00009490|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=16530bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000095:481623..498152+ (Clytia hemisphaerica) GtagcttaaaaaaaacaaaaatttgaaatttgaaatttacttCGTGTGAA
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GCTATTATTTTCTCTCTTTAGTACTTGATGCTTTGATTCAAAACTCACCA
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CCGAAAGACGATACAAGTGACTATAATAGCGATGAAGAAGTATTTCAAAC
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CAGGTCAAATAAAAGACACAACACAAATTCATGTGCAGTCTTATAATACT
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GAATCTACTAGCAGATCCTTCTACTTACGGAAAAGCGAGTCAACGACAAG
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tcCATATAATTCTTGAAGCTTTTTTGGTTTTAAGGGTCTTTACAATACTA
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GATCTTCGTGTAGTCGACAAGATTCTATCAGTGAAGAAATCAGCCCCGAG
GAGGAAGCGGACGACGGGCGGTCAACGCCCGCTGTTTCAACGTtgattga
aaatttcgaaaaacgtgAGGGATTTAGGCTACAAAGGAGCAGTACTCTAC
CGTACAGGGTAGGTTATATATTGAATTATCTTTGATCCAAATGTCATTGG
AAGCGTTCAGAATTTAAGGTTCGGCTCCGCTGTAAAACATCGAGAACTAG
TTCTCTTAGGGGACCTAAAAGACGCTCATCTTATTACTCACTAGTTCTTT
TAAAAGTCATATCTTGACAACAACAGGcttataattttgaaattttgctc
gGAAAAGTTCTTCTGGGATttgatatgttttttttcttcatttctagATT
CGAAAAGCACCAAGTTGAACGCAAACAAATATTCTGTATGTGATATCGAG
GAACCGTTGAAAAGACGAAAGGTTAATTACATTACGTTGAGCAAAAGgaa
tatgctgacgtcagctaTACAGACGATACATGTATGTAACATAACCATGC
TCTTTATGGATCTTGCCATGCATTGTGGCGGTACGCCCATTTATTCAAGC
CACCAGCCAAACAGAGATCATCGCCCAATATCACCCTTTATATTCTCACC
ACGAGTATGCTGTTAAGGCATGAAAGttggggacgagatggagtttttac
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TCTCAGATCTTTCTCTTTAGTCTCAAAATTTTGACATTCAATTTTATTCG
ATGTTATGTTCTAATTtgtaaaaaacaacatttttattcaagaaTACCTA
TAAccttttaatttgtttttcgaaaaaagCAATTTGTACATTCTACATTA
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ataatagcATAATCTTTTAATACCAATTAAAAACCCATTAACGACCTATT
GTAAAATATGAGAATATTCGGTTTTCTTTTTCTAGTATAGTAAAAtaata
atacaaaaatatatcaaaatacaaatttaa
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000095 | supercontig | sc0000095:481623..498152 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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