TCONS_00009486 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00009486
Unique NameTCONS_00009486
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length2975

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00009486 ID=TCONS_00009486|Name=TCONS_00009486|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2975bp
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Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00009486-protein

>TCONS_00009486-protein ID=TCONS_00009486-protein|Name=TCONS_00009486-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=598bp
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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000095:453013..498152+

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR
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>TCONS_00009486 ID=TCONS_00009486|Name=TCONS_00009486|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=45140bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000095:453013..498152+ (Clytia hemisphaerica)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000095:453013..498152+

>TCONS_00009486 ID=TCONS_00009486|Name=TCONS_00009486|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=8985bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000095:453013..498152+ (Clytia hemisphaerica)
ATGCCCTCGTTTTTAAAATTCACTCGAAATGGAAGTTTACGacataagaa
gaaaaaatcacacGAAAACCAAAACAGACCAGACCTTGTCAATGACGCTG
AGAAGAATGCGTTAAAAAGAACATCAAGTTGTACTGTCGACCGATTAAAC
GTCACCAGATCAACGCCAGATCATTCCGTCGTCGGACTAACGACGGAGAA
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GAAGAAATCAGCCCCGAGGAGGAAGCGGACGACGGGCGGTCAACGCCCGC
TGTTTCAACGTtgattgaaaatttcgaaaaacgtgAGGGATTTAGGCTAC
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CCCTCGTTTTTAAAATTCACTCGAAATGGAAGTTTACGacataagaagaa
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TGTCACCTTTAGCTTTGCCAAGAAGGGCTCAAAATGCTAAACCAAACACC
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
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The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
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Position
The following features are aligned
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Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
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Values :
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Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00009486 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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