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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00009232 ID=TCONS_00009232|Name=TCONS_00009232|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1623bp
ACATTTTACGGATACTACAATGGAGCTGAGGATTATTTTTACCACAACAG
ATCTGGCTatcattttccaaaatttcatggTCTTGATCTTCACCATGACG
TAGAAGGAGATCAACAGCCAGTGCGAACACAGGACGGTAATTACAGCACC
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AATAAACGGTGCGTTGGAAGCCAAAGGTATTCTAGAAAACACAGTGATCA
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CAAGGGAAAATCACTAaagaaattgatggttttgatcaatggaagacatt
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CAACACATTGcaacaaaatttattgtttgttCAATCTACATAACGATCCT
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gaaaaacaaacttGAAGATTACAAAAAGGGAATGGTGCCGAGTCGTAAGC
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AATTTTACCATTTCGTTTGATTTTTTACATTCTAAAATTTGACGATTTTT
TATACGATACAatcatttttaattattttatgaaacttttatattttcgt
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ttatctgatattccgatggcggattggccaCCCaccctaaagctctaaag
gagagCGCCAGTTTCCCATCAGAGATGATTGATAATCGGCCTTTGATGTA
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AGAgttttagcgtgtcggatgaaaatttcaccatctgggtgccagataat
caATTGTTAAAACAATGCGCGAG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000091:49392..68850- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00009232 ID=TCONS_00009232|Name=TCONS_00009232|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=19459bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000091:49392..68850- (Clytia hemisphaerica)
ACATTTTACGGATACTACAATGGAGCTGAGGATTATTTTTACCACAACAG
ATCTGGCTATCATTTTCCAAAATTTCATGGTCTTGATCTTCACCATGACG
TAGAAGGAGATCAACAGGTATTCGCTCAATAACCAATAACCATCAGATAG
TGACGAGTTCTTGAAAATTGTTGAAGGAGGCAAAAATCATCAGTCAAAAT
TAATTAAACCTAACGCTTGAGTTACCAGTGCCATAAATGTAATGTCGAAA
TAACTTTCAACAATTTTTGTCATACAGCCCTGATAAATACTAACTCAATC
TCGCTTCAAATAGCTTTTGACCAGATTATTTCATGGCGTATTTAACATTT
TAGCGTAATTCTCCAACTCTAGTTTCATTTTTCATTTTGCCGGTCTATTA
TTTAGCCAGTGCGAACACAGGACGGTAATTACAGCACCTACATGTATTCG
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CCTGTACCTTCCTTTCCAAAATGTCCATGGCCCTCTGATGGCACCTCAAG
AAACTATTGATAAATTTTCATACATCGAAGATAAAAAAAGAAGAGTGTTA
GCTGCAATGGTATCACAATTAGATGATGCTATCGGTCGAGTAAGTCGAAA
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GCGTTCATTGTAAATGTGTTTTGATATTTTTGCCTGGTTTGGCATGATCA
AAAACTTTTCAGTTTTTCATTCAACATTTCATCCAACATTTGAACAAAAT
GTTGGATGAAATGTTGGAGTGGTGTGCTCCGGCCTTTAGTCGCCTATATA
ATACAACATTCCAGTAAAAGCTCTTAAATTCAAGCTTTAAACAAGTATGT
ATGTTACATTATTTTCTAGATAAACGGTGCGTTGGAAGCCAAGGGCATTC
TAGAAAACACAGTGATCATTTTCACTTCAGATAACGGTGCACCCTCAGGA
CAAGGGATGGGAAGTAACTATCCCCTTAGGGGTGAAAAATTCATGGTCTT
TGAAGGTATTCAAAAAATTCTTCATTATTTTAGTCTCCACCTTTATATGT
CCAATCCAACATATAGTACCTGCTAATTATGGTACCTTTTTGTCTTTTTA
TACAGATTTATGATTTAACATTTTCGTTTATTTATGGAAAATTTCTAAAG
GTGGTGTTCGAGTGCCAGCGTTTATCAACAGTCCACTTTTGAAAAGATCA
GGTGTTACTTCAATGCAAATGATGCATGTTACTGATTGGTTACCAACTAT
TGTCAACCTTGCTCAAGGGGAAATCACAAAAGAAATTGATGGTTTGGATC
AATGGAAGACATTGCAAAGTGATGTTGAATCGCCAAGGAAAGAAATCTTG
TTGAATATCGATAATGTGGAGTTTCGACAAGAAGGTTTGATTTCTGGAGA
ATGGAAAATTATTATCGACAGTGAACATGACAGTAAGCTATTACTTTTTT
ATCCTAGCCCTGGATATAAATACTTTTAATGTTGGTCCTGGATTTAGATA
CTTTTTTGATGTTTTAAATGTACGCAAGTCGGGAAAGGGATAATTAAGCA
AAAAGAGGTACATGAATGTGCTACTTGGCCTACCTTCCGTCTCTACCAGT
TAGTACCAGGTAGGATTTCACGAAAATCGCAAAAAAGTGAAAAATCAGTT
CCTCGTTCGGTTGTCTTTTTGGGATTTTAGTCCCTTTGAGCTCACTAATC
TGAAAATTGATAAAATAGACCCTTCGTAGTTTAATTCATTTTATTCATGT
GATAAAAAAGTAACGAGGGAGATACTTACATCTAATATTATATTATTTAG
TTTATGCATCAGACGGTTGGATCAAAGCCCCAGGATACAATGCCACTGGA
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TTGCAATGAAACACATTGTCTGTTCAATCTACAAAACGATCCTTGTGAAT
ATAATGATGTTTCAAGTCAATATCCTGAAATTTATCAACAAATGAAAAAC
AAACTTGAAGATTACAAAAAGGGAATGGTCCCTAATCGAAACAAGCCAGG
AGATGAAAATGCAGATCCCAAACTACACAATGGTGTTTGGGGGCCTTGGA
TCAAGCTTTGATAACTACTTAAGCTGAATTTGGTAGAATATTGCCTTTTT
TGAAAAATGTCACGAACACAATTCATTGTTTTTAGCTTTATACTATTTAT
CTTGTGATAGAACGTGTCTCAATCTTTTCAGGTATTTATTGTACTTTTTT
GTGGTAAATATCTTGACATCTTTTTTATGAATTTTCGTATTTAATTTAAC
GCATTGTAAATTTTTATAGGATCTCGAGCATAACACTTTTCATTAAACAG
TTTAATTTTACTATGAATGTCAGCTACTATTGTTACCTCGATTTGGCTAA
TGTAGGGAAACTCCCTAATTCTTTGCAGTTTCATTTGACTGTTGAATATA
ACTTGATTCATTTTGTTTATCACAGATCTATAAAAGAATAAAACAAATGT
AATGTACGCAATCTTAAATATTCTAAACTGAACGATGGACAAGTTCAACG
ACCTTGTATTTTTTACCATCGTTTATCTTGGATATGCTTTGGGAAAAAGC
GAGCAGCCACCAAATGTGGTCTTCATTGTGGCTGATGATTTGGTAAGACG
TTTGTCTTCAATATTTTTCCATTTTCCCTTCATTGCAAATTCAGAACATT
TGATTGAAAGGTACAAAGTCATTATGTAGCTTAAGGACTTGAGCAATTTT
TTTCCCGATATTGTACTTCCAGGGTTGGACAGATGTTGGTTTTCATGGAT
CAGATCAAATCCCAACACCGAACATTGATAAATTGGCAAAAGAAGGAATT
ATTTTGAATAATTATTATGTGCAACCAATCTGTTCTCCAACGAGAAGTGC
TTTGATGACTGGAAGATATCCTATTCATACTGGTGAGTCAAAACACATTT
TTTTTTACACACTAGACAGGTTGACTAACAGATTTCCCGTAAAATCGTGC
CAAGTTTTAAAGTTGACTAGTCCTCCAGGTTTTTCTATTTTACGTCAGAC
TTTCGAACGTCTGATAGGAAATCCGATCTAGTAAATTAGTTAGAGATCAG
CGATTCAAACATGAGTATTATCAAACAGTACACTTTTGGTCTTTCTGGTA
AGGTCGGAAAATAATTGCATTTAGTTTTCAGCTTGCTGTAAAATAATCTA
AACTTATCGATTGAATTTCTCAATACATTTTTATATTTAGGTATGTACCA
CAATACAATTTATATTGAAGAACCTTGGGGTCTCTCGCTAGAAGAAAAGA
CTCTCCCACAATATTTGAAAGAAATGGGCTATGCTACGCATGCTGTCGGA
AAGGTTAAAATACATAATAATAGTAAAATAAATAAAAAAAGACCAAGCTC
GTTTCAATCAAACTAGCAAACTAACCTTTGGTTAAAAATCTATGTATTTA
AAATTACTAGTAATAAAAACTTAATCTTTACTTTCCAGTGGCACCTTGGA
TTCTTCGCGAAGGAGTACACGCCAACAAACAGAGGATTCGACACATTTTA
TGGATACTATTCTGGTTCAGAAGAGTATTTCAGTCATTCGAGATCGGGAG
CTGATTTCGAACATTTCTACGGTTTAGATTTACGCCGTGATTATCAAGGA
ATCAGTGAAGTATAATAATTTTTTTTCGTTCGTTCGTACGTTCGTTCGTT
CGGATGTTGATTATATCAAGCAGTAATTAAGCTATGTATTTAAGAATTTG
TATTTGACGTGCAATATCAGAATTAAGCTTTCAGTTGTCCATTGTATCTC
TTTATAGCCTGATTGGTCACAAAATGGAACATACAGCAGCGAATTATTCG
CCTCTGAAGCGATAAACATCATCGACGGACATAAATCAGAACAGCCTCTT
TTTCTTTACCTTCCCTTCCAAAACACTCATGGCCCACTGATGGCTCCTCG
AGATTGGATCGATAGATTTTCTTACATTGAAGATAAAAAGAGAAGGATTT
TTGCTGCAATGGTTGCTACTTTAGATGAAGCCATCGGAAAAGTATCTTGA
TGTTTTTCTTCACATTTGCATATTATTTAAGGGGTATAGGGTCAAGAAAA
AATCAAGTCATAATTTTTCAGATTTTTGCAATGAATTTTGGTCAGCCTCT
TCAAATAAATAGCAACTGCATGGACATCTTCTAACCCTCAGCCACATCTT
TAAGTTAGTGTATATGTTTTACACATCCTTACTCAGCAGCACAGATCTCA
ATCACCGAGACACTTCCTCATTTATCTAGGTTCATCAAGCGTTGGAGGAG
AAGGGCATTTTGGATAATACAATCATTATCTTTACTTCTGATAATGGTGC
CATTTCAACGGAAGGATTCTCAAGCAATTATCCTCTGCGAGGTGTAAAAC
ACATGGTGTTCGAAGGTATTGTTTTTACATGATATTTTCTCCAAACTGTT
TTACAAAGGCTATTTACTGAAGGTAGTGACGGCCTCGGAGATTGTTTAAA
ATTTGAAGAATACAGAACCTTTTGAATTTTACCTAACAGTCTTAATTTAT
AAATAGTTTATCTAAAACCAATCTCTGTAAATCCAAGGTGCAGTCCGAGT
GCCAGCGTTTATCAACAGTCCACTATTGAAAAGATCAGGTGTTACTTCAA
TGCAAATGATGCATGTTACTGATTGGTTACCAACTATCGTCAACCTTGCT
CAAGGGAAAATCACAAAAGAAATTGATGGTTTTGATCAGTGGAAGACATT
GCAAAGTGACGTTGAATCGCCAAGAAAAGAAATCTTGTTGAATATCGATC
ACTTCTTTAATCAAGAAGCCCTCATAGCTGGAGAATGGAAAATTATAGTT
GACAGCCTTTATGAGGACGGGCGTAAGAAATTGATTTACATACCTGAAGT
TTTACTCAATTGTTTTCTGAACCTTATAATATCAACTTTGTTATTTGGAG
TCTGGAAAAGTGATTTTCACCAAAACTAATTCTATAGCATTAAAAGAATT
AAAAATAAAGTGAACGAGTCCATTATTGTTTGTACGCACGATTAGTATTG
TCTTTTCAATCTTTTTTTTTTGCACGAAAAAAATGTTTTTAAATTAACGA
TTAGTGCTCAAAAAAGTAAAACGTGCTTCAACTACAATGTGATTTGTTAT
CTTTAGTATACTCTGACGGATGGATCAAGGCTCCAGGATACAACGCCACT
GGAAAAGCAACATCAGTTATCAAATGTGGTCCAAAACCTGACAAAACAAC
ACATTGCAATGAAACACATTGTCTGTTCAATCTACAAAACGATCCTTGTG
AATATAATGATGTTTCAAGTCAATATCCTGAAATTTATCAACAAATGAAA
AACAAACTTGAAGATTACAAAAAGGGAATGGNTTGTGAATATAATGATGT
TTCAAGTCAATATCCTGAAATTTATCGACAAATGAAAAACAAACTTGAAA
ATTACAAAAAAAGTGTAGCTCCCAACAGAAACAAGCCAGGAGACAAAATG
GCTGACCCAAGATTACATGGGGGTGTCTGGTCCCCATGGATAAAATTAAA
CTGAGCTTTTTTTTTGAGGTTTTTCATTGATTGATATAGAACAATCTTAA
AGGTCTTTTTTAAGAAATTTTTTATGCATCTTTTGTACTTTTTAATTGCA
ATAATGAGACAGCTAAACGCTTATCAACATCACATCTTTCTCATTTTCTC
TAAACGTTTTTTGTGCCAAAAAAGGTGAGCGCGTCCGACGGGTTGATGAA
AGGTTAAATAGCAAAAGATTATTTCATAGTCTAAGTTCTACAGTAACTAA
ACAAGGGTCGAAGGGTCAGTCAAGAATCTTATTTCATTTTTGTAAATGTA
GACAATTTTCGTAAGAGTGATGATTTAGGTTCTTAAAAGGTGCTTTTCTA
CTCTACTTTGACACTTTGGCATAGCTTTTGACCACTACGCCTCAAGTACC
ATCATTCTCGAATTATAAACCTTCCGTTTTTTTTACAAAAACTTAAACTC
CAATCGAGTTTTGGTAGTTGACAGAAAAATTTTCCACTTGAAAGTCGTTA
ACGATAATCCAAATGAACGTAAACGGCGGACTATAAGTGATGTCAATATT
TTGCTTTGGTAATACGATGCGCTCGCTACTTACAAGACAAGGTTCAGATA
AACAAAAAGTTTATTTACGCAGTATTTATATTTTTTGTAGAAAGCTTAGC
ATAAACTTTTTACGATGTATTATTTCTTTTACTTGCTTTTATTTTGTATT
GTTGGATATGCTTTGGTGAAAAGTGAGCAGCCTCCAAACGTTGTTCTTAT
TGTAGCTGATGATTTGGTAAGTACTTTCATTTACTGGTTTTTAATTTGAT
TCTCAGATTTTCAAATTTATATTGAAATGTTTACAATTTCTTTTCCAGGG
TTGGACAGATGTTAGTTTCCATGGCTGCGATCAAATCAAAACACCGAATA
TTGATAAATTGGCAAAAGAAGGAATTATTTTGAATAATTATTATGTGCAA
CCAATTTGTACTCCAACGAGAAGTGCTCTGATGACTGGGAGATATCCTAT
ACATACTGGTTAGTCTTTTTCTCGTGCTTCCAGGGCCCGCGCCACCGGGG
GACCAGGAGTGCCATGGCCCCCACTTTTGCAAAGTAAAAATTTTTGGTTG
CGCCTCCTTAAACTCTTTATTTATTGCCCCCCTCACTTTCAATTTCATGG
CGTGGGCCCTGGCTTCGCCTTTAACGATCATGGCCATTTTGTCCCTATTT
TTTAATATATTTCAAACAATATATTCTTTTCTTTGAAGGTATGCAGCATG
GTGTCCTTCTCGCTTCTGAACCTTGGGGTCTCTCTTTGGATGAGAAAACC
CTTCCACAGTATTTGAAAGAAATGGGATATGCTACACACGCCATTGGAAA
AGTAAGGCTTTCTGTAACCTTGTTCCATCTTTTTCGAGTACTTTTTTGTA
TTTCGTTAATGCTTTAAAGGAATAACCAGCTACTTTCGTTTTCAGATATG
TCATGGTGTACCTAATTCTGTAGAGTAATTTCTCCTACGTTATAATTATA
AGATATAACTAAAATAGAATTAGGGACTTTGGCTTGAAAAGGAGACGAAT
TAACTTGTATCTACCCCAAAAGGTTATTTGAAGCCAAAATTTTGATGATA
TTTTTTAATTGCAACATTTTCGAAGTATATTGTAAGTGAGTTTTCAGAAA
TTACTTTATGGCCGATCTGAAAATTAAATGTTGTTCGTTATCCCTTAACA
TACATTTTCTTTCTTTTTTTTCCTTGTAGTGGCATCTTGGTATGTTTGCC
AAAGAATACACACCAACATACAGAGGCTTCGATACATTTTATGGATACTA
CAATGGAGCTGAGGATTACTACTATCATAATGTGTCGGATATGCACTTTC
CTCAATATAGCGGATTGGATTTAAGGAAAGATTCAAATGGTCAAAGCCAG
GTTAGATCGCTGATTGTTTGGAATAAAAATTACGTTAATACACCTCTGTC
TCTGCGTAGATTTTTCTCATGGACATTTTTAACACCATTCCTGGTAGAAG
TTTTTTACGTTTTATCCGCCATTATGGAAGCCATCGTTCGAATCTGTACA
GGCGATCCCTTACGCAATTCGAACGTTTGCTTCCATAATGACGGAAATTG
CTTACGGAAATTTAGTAACGTTTGCCAACCACCTTACCCACTCTAAGCTT
TTCAATAGATTATTTTTATTTCTATTTTCTCAAACAAAGTTGATGCTTAT
TTTCTATTTCTTTTCAGCCAGTTTGGACTCAAAGCGGAAATTATAGCAGC
TTTGTGTTTGCAGAAGAAGCTGTTAATGTGATTTCAAGCCAATCAAAAGA
ACAACCTTTGTTTTTATACCTTCCCTTCCAAAATGTTCATTTCCCATTTG
AAGCACCTCAAGAATGGATCGATAAATTTTCTTTCATTGAAGATGAAAAG
AGAAGAACGTTTGCTGCAATGGTCGCTCTTTTAGATGATGCAGTAAGAAA
AGTAAGGCTCTTTTTACACTTTGAGCCTGATAGTTTTGTTTGTATTGAGA
CCATGGGTATGATGAAGCCAAATTATGTAGTCATAAAAGGTACATGTAGA
TTATAGTAGTCGTTCATCAATCTTAATTTTATGTGANTACCATATGTTGA
TGTAGATTATAGTAGTCGTTCATCAATCTTAATTTTATGTGATTGGCCCT
CTGAACCTACTACTTCTTTGATCTAGATCTGATCCTTGATAGTTGATATC
TAACAATTTAAGGCGTAGGCGTAGTGATTATCATCCTCCTGGGAGGCGCG
AGTTCGTTACCCACCGTGTCACTACGATTCACTTAGCAAGTAAATATATA
TCTTCGCCCGGGAAGACCTATGCAATGCGAGGGGAATCGGGTACCATTAC
TCAGATACAAGAGTGTGGGTAGATTAGACTGGCATTGTGACAAGCCGAGG
CACTTCTAAGGTTCGACCTCGCGTAAGCATCACTCTCCCGGTGTCGTTCC
GTAATTCCTACTCCTTCGGGAGTAGGACCCATCCCGAATGCGTTCGGAGG
GTCTACTCTCGGGTACCTAATAGCCGGGGGGATTGGAATAAGCGGGGGAA
TTGGAAAATATCTCGAAACTTAATAAGCGGGGGGGGGGTGGAATAAAAAT
GTCTTGGGTGGAGAATTTTTGAAAAGGAGGCTAACACAGCATAATTAGGA
CAAAAGAGGGGAACTTTCAAAAACATTTTCCCAAAAATTAATAAGCGGGG
GGGTTGTAATAAGAATGTTCTGGGTGGAAAATTTTCGAAAAATTAATTAG
CGGGGGGGGGGCCGGCTATTAGGTACCCAAGAGTACTTTCTATCATTATA
TCTNTACTTCTAAGGTTCGACCTCGCGTTAGCATCACTCTCCCGGTGTCG
TTCGAGTGTCATGGTATACGTCATGGCTTTGCAGCTCGCGTATGACAAGT
CGCAGTGTCTGTCAGCACCGTAATTCCTACTCCTTCGGGAGTAGGACCCA
TCCCGAATGCGTTCGGAGGGTCTACTTTCTATCATTATATCTCATATCTT
TACCTAACTATTTTTCTTCAATCTTAAATCTCTTATCTAGATTTATGAAG
CTTTGGAAGCTACAGATATGGTTGACAATACTCTGATTATCTTCACTTCT
GACAACGGAGGGAGATCAAGCCAGGGATATGCCAGCAATTTCCCTTTGAG
GGGAGAAAAAGGAAAGATCTTTGAAGGTAGAGAGCATATATAGTATTTTT
TCTCGTATATGTCCGTTTGAAATTTGGTAAATCCCCTAATACCAATTTAC
AATTTTGTTTTTTGATAGGTGGTGTCCGAGTACCAGCATTTATCAACAGT
CCACTTTTGAAAAGATCAGGTGTTACATCAATGCAAATGATGCATGTTAC
TGATTGGTTGCCAACTATCGTCAACCTTGCTCAAGGGAAAATCACAAAAG
AAATTGATGGTTTTGATCAATGGAAGACATTGCAAAGTGACGTTGAATCG
CCAAGAAAAGAAATCTTGTTGAATATCGATACTGAAGTCGGAGAAGAAGG
TCTGATTTTCGATCAGTGGAAAATTATCAAAGAAAGTAAGACTTTTCTCA
TTGTTATGTTTGTTAGTAGTAATTTAGCGACTGTAGTGCAGTGGTAGAGT
ATCCAACTACGGTGCGCAAGGTCGTGGGTTCAATCCCGAGCCGGGTCATA
CCAAAGATTCCCAAAATGGTACTTGATGCCTCTCTACTTGATGCTCAGCA
ATTAAGAGAAGGATCAAGGGTAAGTGGAGCAATCCAGGGAGAAAGAATGG
CGCCCTCCCCTACCTTCGGGTAGATAGCTATCGAAAGATGAGCCTTCGGG
TCACTTCCGACTCCGGTCGTAGACTTAGTAATAATGGGTATTCGAATTAA
TTCTATTTGCATTCTGTATTTTATTATAACCTAGGAATTGTTGTCGCCTT
TGTTTTATATAAATCCAGAGTAATATGTATTTGACGACATCAATTCATAG
TCACAACTGCAGATGGTTGGATGAAACCTGCCGGATACAACGCCAGTGGA
AAAGCAACAACGGTTGTCGATTGTGGTCCAAAACCTGACAAAATGACACA
TTGCAATGAAACACATTGTCTGTTCAATCTACAAAACGACCCTTGTGAAT
ATAATGATGTGTCAAGTCAATACCCTGAAATTTATCAACAAATGAAAAAC
AAACTTGAAGATTACAAAAAGGGAATGGTGCCACCTGTCAATCAACCTGG
GGATAAAAATTGCGATCCAGATTTATTCGGTGGCGTATGGACTCCATGGA
TTGAATTATAGCCTAGCTTAACTTTTATTATTGATCTTGTGCTTGCAAAT
CTTTTATGCTGGGCATTCTTTGTGCAATTTTTCTTCAATTATGTACATCA
TCATTGTTAGCATTTTTTGCTTTCTTTTTCTAACAGCAATTACGTAATTT
CTAGTTGGATTAAACCGTTATACTACAGTGGGAACCGAACTCGGACCTCC
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ATAGTGGCAGATCAATTTTTCACGAAGATTTATTTATTGAAAGTAATGAT
AAGTAAATACCATGGTAGAAAAGAACTTGCTGAGTTTTATTTTCTTTTAT
AGTGCCATTGCCTTTAAAAACTAAAATAAATTTACTATAATTTGATTTCA
TCGACGACCATGGAGGTGTTTTCGTTGATGTTGACTCTGCTGTTGGTATC
CTGTCTTCAATTCGCTTTTGTGGAAAGCGAGCAGCCACCAAATGTGGTTT
TCATTTTGGCTGATGATTTGGTAAGCTTTTCTAAGTTTTTTGTTGAAAGT
TAGTTCAGCCTTTACTGTTTTATTGATCTTTGAACTTTTGAAATCTTGAT
TTCTAGGTAGTAACTTTTCAATCTTTTTATATCAGGGATGGAATGATGTA
GGATTTCATGGCTCTGATCAAATTGAGACACCAAATATTGATAAACTGGC
AAAAGAAGGAATTATTTTGAATAATTATTATGTGCAACCAATCTGCTGTC
CGACGAGAAGTGCTCTGATGACTGGAAGATATCCAATTCATACCGGTGAG
TTGAATATTTTAACTTTTCTCATGAGAGTACTATAAAAAAATCGAAATTG
TTGTTAACGATTTTTTAAATGCAGTCTAATAACGTCTAATTCGACGTTAT
TCTATATGATACACTCCATTATTTGATAATATTGAAAGTAACCGTCAGCA
AGAAACTCTCGTAAATGATACGCTATTCTATTCGATATACTCCCTTATTC
GACGGAAATTCAATTCTTCTTGAACATCGAGTTAGAGAAGGTCAACTTTA
CTTGTTTTCCTTTCTATCAGGAATGTATCACAGTGTTATCCGACCAGAAG
AACCTTGGGGTCTTTCTTTGGATGAGAAGATGTTGCCACAATATTTGAAA
GAACAAGGATACACGACGCATATGGTTGGAAAGGTGAGTTTTCTGTTTTT
ATTGTGATCTTTAAAATGTCTATATAATAAGAAATAGTATACAGTGTTGA
CGCTTTCAATTCCCTTCAAGGGCAATCGGATTTTCATTGAATAAAGAAGT
TTATCAAATAGTATAGTGTCGTTTATGAGAGTTTCTCGTTGATTGGTGCC
TATTCAACATTGTGGAATAATATGGAGCGTATCGGATAGTAGAACATGGA
TTTACAGAGCGTCAATTTAATAATCTCTTTCCTTGCAGTGGCATCTCGGA
TACTTTGCCAAAGAATACACACCAACATACAGAGGCTTCGATACATTTTA
TGGATATTACAATGGAGCTGAGGATTATTTTTACCACAACAGATCTGGCT
ATCATTTCCCTCAATACAGCGGTGTAGATCTTCACCATGCAGTCCATGAG
CAGATGACGGTACAATAGTTTATTAGACAATTATGTTTCCAAGTCGGTGT
TTTTTACACTTTCGCCAAAAACGTGACGAGATGGTACTTAACCGTCACAA
ACCGTACCTACGAAGAAGAGTTTGATGCAGGTTAGTCAGAATGTAGACTA
CTAAAAAATTAATTGTCGTTTTTATAGCATGATTGGTTTCAAGACGGACA
TTACAGTGGAGATCTGTTCACCTCCAAAGCTATCGATATCATTCAAGACC
ATCCAACTACAGATCCATTGTTTCTTTACTTACCATTCCAAAATGTCCAC
GATCCTTGGGACGCACCAAAAGAATGGGTAGATAAATTCTCAAACAAAAT
TGAAGATGAACAACGGAGAACTTTTGCAGCCATGGTTGGGGCCTTAGATG
AAGCTATTGGCAAAGTAAGTGTTTCTCAATTTCATAATTAACATAATTCA
TTGTTTTGATAGTAAAAAAATTCAACTTAACTTAACATTAACTACACGCT
TTTCTTATTAGAAAAAGTAAATCTTTGGTATGGTAAGACCCGGCATTTTC
TATGATTTTTAGGCCTGAATTATTCAGGCTTTCATCAATACTTCTTAAAT
ATTCTTAGCACTCACTGTAGTGACTTGCTTATTGAAATAAAATGAACTTT
TTTAGTCATTTTTGAAATCTGAGGCTGGAATTATTCTCAATTTGTTCCCA
GGTTTTTGCAAAACTGGGACTAATGTTGTTATAAAAAAAGCGTGTACTGA
TTCAATGTCAATCAATATAGGAGAGGTTTAAAGGTTTTGTTTTTACGTAA
GTGTTCCCGTTTCATATCAGACAGATATTTGATACGAGAACAGTGTCTGC
CTATTGTTATATTATGCTGATATAAACAAAAAAATGTTTATGTTTTCCTC
TTTCTGACCAATCTTGCTCCACATCCGTGTCAATCTAATGTGAAAAGCGT
TTGAATTAAAATTGATGAGTAAGCAAACGATATCACTCTTGTTTAAAAAC
AAAGCCTTTAAGCATATGTTGTGTCCTTTTTCAGATTTACGAAGCNATCT
TGTTTAAAAACAAAACCTTTAAGCATATGTTGTGTCCTTTTCCAGATTTA
CGAAGCTTTGGACGAGAAAAATATGCTAGATAATTCCATTATTATTTTCA
CATCTGATAACGGTGGCATCCCTACAGATGGTCATTCAAGTAATTTTCCA
CTGCGAGGGCAAAAATGGAATGCTTACGAAGGTATAGCAAAGAATTACCT
TCATTTATGAAAATCAATTTCATGTATCTGAAAAAAGGCAATAAAATTTC
AATCGAAACTAACAGCTCAAACAGAAAATTATCAAAAATCTGCCTTAACT
CAAAACACAAAAAAACTAGAAAATAAAGCTTTGGAAGTTCTCAAGATCAA
TTTGAAATGTGCTATCTGAAGGACTTTTGACAATAATGATAACCTTTTAG
TCAATGTTTTCACAGGTGGCGTTCGAGTGCCAGCATTTATCAACAGTCCA
CTTTTGAAAAGATCAGGTGTTACATCAATGCAAATGATGCATGTTACTGA
TTGGTTACCAACTATCGTCAACCTTGCTCAAGGGAAAATCACAAAAGAAA
TTGATGGTTTTGATCAATGGAAGACATTGCAAAGTGATGTTGAATCACCA
AGGAAAGAAATCCTGTTGAATATTGACGATATTTTCAACCAAGAGGCTCT
TATAGTTGGAGAATGGAAGATTTTAACAGATTGTAAGTTTTAGCAGCTTT
AAATAAATGTTTTTAATTTTCAACAAAATATCTTTGGATGCCGTGCGCTT
CTATACTTAAAATCTAATCAGTCTTTTAAATTTTCATTTCAGTTGTACAT
CGTTCTACTCGGAAGAAGGATACAATTGATCATGGATATCAAGATGGATG
GATCAAAGCTCCAGGGCACAATTCAACGGGAAAGGCTACTTCACCTGTCA
ATTGTGGTTCAAAACCTGAAAAAGTAACACATTGCATCGAAACACATTGT
CTATTCAATCTACAAAACGATCCTTGTGAATATAACGATGTTTCAAGTCA
ATATCCTGAAATTTATCAACAAATGAAAAACAAACTTGAAGATTATAAAA
AGGGAATGGTGCAAAGTCGAAAACAACCTGGAGACAAAATGTCGGATCCT
CAATTGAATGGAGGTTTTTGGGGACCATGGAAAGAATTGTAATTTGGATT
TGACGGCTGTTGAGATTTTCTATAACAACACTATATTCGCATCACAACAC
AGGGCCCACCCTCACTTTTTGCAAAGTAAAATTTTTGTTGCGCCTCCTTA
TATTCATTCCCCCCCCCCCGTTTCAAATTCAAGGCGTGGGTCCTGCACAC
CAATAGACTAGAGAAACAATCTATATACATTAATATTTACGATAGAAGCT
GTTTCCCATTTTACAATTTTCGTACACATTTTTATATACCTTCATATAGA
ATTTTTTTAATATTTTGGTACAAATAAATTCAATCATTCAATGATGAAGC
GACGCATATTTTTAATTAGCCTGTACACAGTCCCGATATCTATGGCTAAT
TTCAAAGTTCATTGCCGTACTTCGAAACGATAAACGTGAGATAACACTCT
GGTACAGAGTAATTTTCAATGATTTATTTGATTCTTAATTTCATTTTTAT
TTCAATATTTACCTACTCTCTTGTAATCATTATAACTCACCACGTATAAT
TTTTACGATATAATAAGCTGTTTCATATTTTACAATTTTCGTACACATTT
TTTATCAATTATACTCTCAAAGTTATACTCTCATTTTTTTATTTTTTGTT
TTGTTTTTATAAGCATTGGATTTTGGAAAACTTTTACGTTACAAGAAACC
AGATACAACTTGAACTAAAGGCTGAAGAACAATAGAATGATAACTTATTA
TATTGGCTGATATTGTGATAAACTAATACTTCAAGTATCGTTTTACCTCA
GGATTACAAATAATAAAAAATACAGTCGAAAGCAAAACTTTGCAATCGAA
CTTGATCTATGTAAAAGCATTTTAGAGCATTTCACGGGAGGATGTTGTTG
ATGGAATTTCTACTTTTATTTTGTATTCTTGGATATGCTTTGGTGAAAAG
TGAGCAGCCGCCGAACGTTGTTCTTATTGTGGCTGATGATTTGGTAGGTA
CTTTGATTTACTGGTTTTTAATTTGATTCTGAGATTTTTAAATTCATATT
GAATTGTTTACAATTTCTCTTCCAGGGTTGGACAGATGTTAGTTTTCATG
GATCAGATCAAATCCCAACACCGAATATTGACAAATTGGCAAAAGAAGGA
ATCATTTTGAATAATTATTATGTGCAACCAATTTGTTCTCCAACGAGAAG
TGCTTTGATGACTGGGAGATACCCTATTCACACTGGTTGGTTTAAACCTT
AACTTTTTTATCAATCAATAAACTTTGACTCGACTGTTCATAGTTTTCAT
TTTAAAGATCTGTGGCTTTAGTTGTTTTTAATAAAATTTGTTTTTAGATT
TTGGCTGAAACTAAACATAGTGCTCTTACAAAATCGTACTTCTGGAAAAG
ATGATATGTATTCTTAAAAAAGATTATAGGCTTAAAACTTATAGGCTTTT
AGCTTGGAAAGAAACCTTTCATGATTCACTTATTTTTTAAGGAATGTTTC
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ATTCTCCCAGAATATCTACGAGAATTGGGGTATGCTACCCATGCCATCGG
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TATTACAATGGAGCTGAGGATTATTTTTACCACAACAGATCTGGCTATCA
TTTCCCAAAATTTCATGGTCTTGATCTTCACCATGACGTAGAAGGAGATC
AACAGGTAATCAGTCAATAATTAATAACCATCAGATAGTGATGAATTCTT
GAAAATTGCTGAAGGAGACAAAACCATCAGTCAAAATTAATCATAAAAAT
GTACAACCTAACGTTTGAGTTACCAGTGCCGAAAATGTCGAAATAACTTT
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AATTCTCCAACTCTAGTTTCATTTTTCATTTTGCCGGTCTATTATTTAGC
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GCAATCACTACAATCAACCAACATCCATCAGAAAAACCTCTTTTCCTGTA
CCTTCCTTTCCAAAATGTCCATGGCCCTCTGATGGCACCTCAAGAAACTA
TTGATAAATTTTTATACATCGAAGATAAAAAAAGAAGAGTGTTAGCTGCA
ATGGTATCACAATTAGATGATGCTGTCGGTCGAGTAAGTCGAAACATTTT
TTCAACTTTCAAAATCATATGAAACAAATTTGTAAATCATATTGCGTCCA
TTGTAAATGTGTTTTAATACTTTTGCCTGATTCAACAATCAAAGACTTTT
TAGTTTTTCATTCAACACTTCATCTAACATTTGAACAGAATGTTGGATAA
AATGTTGGAGTGGTGTGCCCTGGTCTTTAGTCGCGTATTCTCAACTTCAG
TTGAGCTACAATCTGACAATGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGT
CACAAAAACTTTAGGGCAGCCTGGAGACTTCAAAAATGGTCGGATTTGGC
TGAAATTTTGCACACTTGTTCCTTGGGTGAATATCTGGGTTTATTTTTCA
TTTTTTGAAAATTTTGATTTTTGGGGCCTGGGGACAAGTTTTTCGTCAAA
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TGGCTGAAATTTTGCACACTTGTTCCTTGGGTGAATATCTGGGTTTTTCT
TTTTTCATTTTTCAAAATTTTGATTTTTGGGGCCTGGGGACGAGTTTTTC
GCCAAAACGAGGCTAAAACTTCGGGGCAGCCTGGAGACTTCAAAAATTGT
TTGATTTGGCTGAACTTTTGCACAATTGTTCCTTGGGTGAATATCTGGTC
TACAATTGGGCCTATGAATAATTTGAAGCCACTGGAGTTGAGCCCAGTGC
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TTCAAACTTTAAACAAGTATGTATGTTACATTATTTTCTAGATAAACGGT
GCGTTGGAAGCCAAAGGTATTCTAGAAAACACAGTGATCATTTTCACTTC
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GGGGTGAAAAACACATGGTCTTTGAAGGTATTCAAAAAATTCTTCATTAT
TTTAGTCTCTACCTTTATATGTCCAATCCAACAGATAGTACCTGCTATCT
GTGGTACCTTTTTCTTATTTTTATACAGATTTATGATTTAACATTTTCGT
TTATTTATGGAAATTTTGACAGGTGGTGTTCGAGTGCCAGCATTTATCAA
CAGTCCACTTTTGAAAAAATCAGGTGTTACATCAATGCAAATGATGCATA
TTACTGATTGGTTACCAACTATCGTCAACCTTGCTCAAGGGAAAATCACT
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AAGAAGCTCTCATTGTCGGGAAATGGAAGATCTTGATAGATTGTAAGTTG
ATTTTTTCTGCATTCTAAGACGATTGTTTGCTATGGTAAACAACCAGGAA
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GAACTTTGCTTTTTGATGAATTTTGATACCGGCAGTGCCAGTGAAGTAGA
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TAAGCACCAAACCAGTAAGACAAACTCCAAAATTCAATTAAAGTTTAGGA
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AGCGTTAAAACTCTACCCTTCGAACCTACTTTAGAGCACTTACAAATCGA
TTGTGGTTTCAAAACACCCCGGTGAATTTCCCTTTTGTGCCAAGTATTTT
GTCCCTGATTCTAGTGGTATGGATTTGCTGCGTGCTCAAGAATGAAGTAT
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AACAAATTAAAGGCTTTATTTTTAAGGAATGCTCTTAATTTTACCATTTC
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ATGCGCGAG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00009232-exon-sc0000091-1575043694:68734..68850 | TCONS_00009232-exon-sc0000091-1575043694:68734..68850 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00009232-exon-sc0000091-1575043694:68212..68445 | TCONS_00009232-exon-sc0000091-1575043694:68212..68445 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00009232-exon-sc0000091-1575043694:51374..51509 | TCONS_00009232-exon-sc0000091-1575043694:51374..51509 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00009232-exon-sc0000091-1575043694:50959..51228 | TCONS_00009232-exon-sc0000091-1575043694:50959..51228 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00009232-exon-sc0000091-1575043694:49392..50257 | TCONS_00009232-exon-sc0000091-1575043694:49392..50257 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00009232-exon-sc0000091-1510915933:68734..68850 | TCONS_00009232-exon-sc0000091-1510915933:68734..68850 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00009232-exon-sc0000091-1510915933:68212..68445 | TCONS_00009232-exon-sc0000091-1510915933:68212..68445 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00009232-exon-sc0000091-1510915933:51374..51509 | TCONS_00009232-exon-sc0000091-1510915933:51374..51509 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00009232-exon-sc0000091-1510915933:50959..51228 | TCONS_00009232-exon-sc0000091-1510915933:50959..51228 | Clytia hemisphaerica | exon |
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Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000091 | supercontig | sc0000091:49392..68850 - |
Blast
BLAST of TCONS_00009232 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: ARSB (Arylsulfatase B OS=Homo sapiens GN=ARSB PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 232.261 bits (591), Expect = 2.845e-68 Identity = 143/383 (37.34%), Postives = 199/383 (51.96%), Query Frame = 1
Query: 1 TFYGYYNGAEDYFYHNRSGYHFPKFHGLDLHHDVEGDQQPVRTQDGNYSTYMYSDEAITTINQHPTERPLFLYLPFQNVHGPLMAPQETIDKFSYIEDKKRRVLAAMVSQLDDAIGRINGALEAKGILENTVIIFTSDNGAPSGQGMGSNYPLRGEKHMVFEGGVRVPAFINSPLLKKSGVTSMQMMHITDWLPTIVNLAQGKI--TKEIDGFDQWKTLQSDVESPRIEILLNIDDT---------------------------NHSQEALIV-GKWKILIDSMFVDQWIKAPG-YNASGKATSVVNCGLKPDKTTHCNKIYCLFNLHNDPCEYNDVSSQYPEIYQQMKNKLEDYKKGMVPSRKLDGDKMADPQLHGNVWTSW 1056
T++GY G+EDY+ H R + D ++ YST +++ AI I HP E+PLFLYL Q+VH PL P+E + + +I+DK R A MVS +D+A+G + AL++ G+ NTV IF++DNG + G G+N+PLRG K ++EGGVR F+ SPLLK+ GV + +++HI+DWLPT+V LA+G TK +DGFD WKT+ SPRIE+L NID N S A I G WK+L W P YN S +S D T K LF++ DP E +D+S +YP I ++ ++L+ Y K VP D DP+ G VW W
Sbjct: 164 TYFGYLLGSEDYYSHERCTL-IDALNVTRCALDFRDGEEVATGYKNMYSTNIFTKRAIALITNHPPEKPLFLYLALQSVHEPLQVPEEYLKPYDFIQDKNRHHYAGMVSLMDEAVGNVTAALKSSGLWNNTVFIFSTDNGGQTLAG-GNNWPLRGRKWSLWEGGVRGVGFVASPLLKQKGVKNRELIHISDWLPTLVKLARGHTNGTKPLDGFDVWKTISEGSPSPRIELLHNIDPNFVDSSPCPRNSMAPAKDDSSLPEYSAFNTSVHAAIRHGNWKLLTGYPGCGYWFPPPSQYNVSEIPSS--------DPPT---KTLWLFDIDRDPEERHDLSREYPHIVTKLLSRLQFYHKHSVPVYFPAQDPRCDPKATG-VWGPW 532
The following BLAST results are available for this feature:
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