TCONS_00009125 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00009125
Unique Name	TCONS_00009125
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	241

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000090:2014..8760-

transcript sequence

>TCONS_00009125 ID=TCONS_00009125|Name=TCONS_00009125|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=241bp
GTCTTTTTCAAGTGAACTTTTTTACAAAGATAGGAAAAAGAAGCATCGCA
CTTCAAAAACTTTAACTCAAATATTGCAAACTTTTCATTAGAATGTTAAT
TGCCAATATAATTGAATTATGGTATGTCGTAAACTCTAGGGCCTCAATAA
CACGACGTTCGCTGAGTTGCTTTTTGAATATGAAACatattgcttttgga
agattgtttaaggtttataacagatcattttcttatttgag

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000090:2014..8760-

Legend: exon

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00009125 ID=TCONS_00009125|Name=TCONS_00009125|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=6747bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000090:2014..8760- (Clytia hemisphaerica)
GTCTTTTTCAAGTGAACTTTTTTACAAAGATAGGAAAAAGAAGCATCGCA
CTTCAAAAACTTTAACTCAAATATTGCAAACTTTTCATTAGAATGTTAAT
TGCCAATATAATTGAATTATGGTATGTCGTAAACTCTAGGGCCTCAATAA
CACGACGTTCGCTGAGTTGCTTTTTGAATATGAAACATATTGCTCTTGCG
AGATTGTTTAAGGTTTATAACAGATCATTTTCTTATTTGAGTAAGAAAGA
GTAAGTTTCCACGGTTCGTACTTTGAACATGGGAAATATGAAACAATCTA
CCAAAATTAGCACCTTTTCATCAACAACATACCATATCTGTCCTATTAAA
AGTTTATAGTTTTTTCGTTAAAGAATGATGCTTGCTTTAGAATTTTTTTT
GGTACTTTCAGATGAAGTGTATAAATAATTTTATAAATATAAATATTTTT
TTCTAGACTTTGCACACATATGCTATATAATATTTTCAGCCGAAGAGCCA
AATGTAAATTTTGGAGATTGAAATATACCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNTAATTTGTCGTTATCGCTTGTTCTTGTATTGC
ACATATGGCTGATTCGGTCGCACATTTAAGTGAAGCTGCAGTTAGCCAAT
GCATCGAGGCTTGTTTGTCTATGTGTGGTTCGTCAAGAAGCTTAGCGTAC
TGCCCGTGGAGATTTTTCGATTTTAGAAATTCAACTTTCATATCAGTTCG
TTTATTTTTAATTTTGTTTTTCCGTTGTTGCTTGTTGAGGGTAGACATTT
GTTCAATTTCAAACTCGAGCTCCTGGCAATAGATTTGCGCCCTTTCATGT
ATCGATTTTGCGTTTCTAGAGGTCTGCCAATCAGAAACCAAGTTGAGGAG
GGCTTCATTGGTTGATAGCAAATAGGTACTGAAGTTGATGATCGAGTTTT
TGAAGTGTTCAGTTAAGTTTATCAGACCTCTACCACCCTCCTTTCTTGGG
ATGTATAATCTCGTTATGTCGCTTTGGCTGTGCATTGCGTGGAACGATTG
CAGCATCTTGCGTGTCTCTCGGTCGATGATTTCAAGTTCGGTTATGGACC
AATCTAGTATTGGAAATCCGTATGACAGTGCCGGTACTGCCCACATGTTG
ATGGCGTTGATTAGATGTTTACTGGAAAGTTCACTTTTTAATATCATTTT
AAGTCGGGNCATATTGCTTTTGGAAGATTGTTTAAGGTTTATAACAGATC
ATTTTCTTATTTGAATAAGAAAGAGTAAGTTTCCACGGTTCGTACTTTGA
GCATGGGAAATACGAAACAATCTACCAAAATTGGCACCCTTTCATCAAAA
AAATACCATATCTGTCGTTTTAAAAGTTTATAGTTTTTTCGTTAAAGAAT
GATGCTTGCTTTAGAATTTTTGTTGGTACTTTCAGATAAAGTGTACGCAG
TTGCCTTTCTCATACAGATTTGTAAAAGGGGTGGCTTTCTAAATTAAAAA
TGGAGAAAAAGAGACTGTTCAAAATGAAACAAAACTGTTAAAGATATGAA
AACCTACTTTTATAGATAGGAAATGTTGTTCTTCTCTGGAAGATCANNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTACAAAGATAG
GAAAAAGAAGCATTGGACTTCAAAAATTTTAACTCAAATATTGGAAACTT
TTCATTAGAATGTTAAATGCCAATATAATTGAATTATGATATGTCGTAAA
CTCCAGGGCCTCAATCACACGACGTTCGCTGCGTTGCTTTTTGAATATGA
AACATATTGCTTTTGGAAGATTGTTTAAGGTTTATAACAGATCATTTTCT
TATTTGAATAAGAAAGAGTAAGTTTCCACGGTTCATACTTTGAATATGGG
AAATATGAAACAATCTAGGTTTATAACAGATCATTTTCTTATTTGAG

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_005111	XLOC_005111	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00009125-exon-sc0000090-1575043694:8575..8760	TCONS_00009125-exon-sc0000090-1575043694:8575..8760	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00009125-exon-sc0000090-1575043694:2132..2157	TCONS_00009125-exon-sc0000090-1575043694:2132..2157	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00009125-exon-sc0000090-1575043694:2014..2042	TCONS_00009125-exon-sc0000090-1575043694:2014..2042	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00009125-exon-sc0000090-1510915933:8575..8760	TCONS_00009125-exon-sc0000090-1510915933:8575..8760	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00009125-exon-sc0000090-1510915933:2132..2157	TCONS_00009125-exon-sc0000090-1510915933:2132..2157	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00009125-exon-sc0000090-1510915933:2014..2042	TCONS_00009125-exon-sc0000090-1510915933:2014..2042	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00009125-exon-sc0000090-1491911889:8575..8760	TCONS_00009125-exon-sc0000090-1491911889:8575..8760	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00009125-exon-sc0000090-1491911889:2132..2157	TCONS_00009125-exon-sc0000090-1491911889:2132..2157	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00009125-exon-sc0000090-1491911889:2014..2042	TCONS_00009125-exon-sc0000090-1491911889:2014..2042	Clytia hemisphaerica	exon

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000090	supercontig	sc0000090:2014..8760 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
6.69542	12.025	22.7651	38.447	1.1936	0.9432	2.27586	0	0.745854	0	0.896721	1.17894	1.76595	0	2.01035	0.940671	0.664439	1.21368	0	0.98456	1.71152	0	0	0.922632	0	2.54433	1.21364	1.29523	0.982388	0

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00009125 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00009125 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

You are here

TCONS_00009125 (transcript) - C. hemisphaerica