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transcript sequence >TCONS_00008017 ID=TCONS_00008017|Name=TCONS_00008017|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=512bp attaaaatcaaaacacataaaaattgaaaaaaaaaactaataagagGAAT GAAATGTTTGAACTATGTCCCTTGCGAAGAATCACCGAGCGATCAGAGAT AAAGAATGCATCAAGGAAACCATGAGGAGGAATGGAGAAAAAAACCATAC CTCTTATACTATGTATCAGAGACAAACAATGCCTGCCTTTCTCTATCATC CTCAGATGAGGAGAACGAGGAAGGAGGAGAGCCAGACCTCCACCAGTGTG GACATTGTCGACAAATGTTTTTTAACTTCACCAAATACATCACACACAAA TTACAAAAAGCCTGTTGGAACAGTGACGAACAACCTACACCCACAAATGA GGACGAGGAGGGCGAGACACCGCCCTGGCCGCCCTCTGCAGCTGCAGGCA AAGATGGGAACGGAATCGCCTCGCCACCCGGCGATGAATCAGGGGTTATT GAAGATACGGAGGATATGGAGACAGAGGTGACTGTGAGTGCTTTTTTTAG CTTGAATATGGA Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000081:694882..712121+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00008017 ID=TCONS_00008017|Name=TCONS_00008017|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=17240bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000081:694882..712121+ (Clytia hemisphaerica) attaaaatcaaaacacataaaaattgaaaaaaaaaactaataagagGAAT
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CGATTTACTTGGCTGTCAAAAGGCCAAATAAATCGGCACAGGATACAGCA
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ATCTCGTATCCTGATCTGCCCTTTGAAAATCGATttatgtttgttttgtt
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gttatgcttataaaaagaaaagagtgTAGACCATTAAATTTCAACTGAAT
GAACAATTTAATAACACATCagaaatagaaattcaaatttgagaACTAAC
AGTTTCACCTTTGCAGAATCATCAGCGAAAAAAACTTGCACTTAAAAATT
TGAGGCTTAAAGCCCAAAAAGTCATCCGAAGACTTGAGACCTTTGACGTT
CTCATAGAaggaaaaatgtataaaaaggCAAAACAAACACTCCTTAAGGT
GAAGcgtaaatctttaatttttctttgcttCAGATGAGGAGAACGAGGAA
GGAGGAGAGCCAGACCTCCACCAGTGTGGACATTGTCGACAAATGTTTTT
TAACTTCACCAAATACATCACACACAAATTACAAAAAGCCTGTTGGAACA
GTGACGAACAACCTACACCCACAAATGAGGACGAGGAGGGCGAGACACCG
CCCTGGCCGCCCTCTGCAGCTGCAGGCAAAGATGGGAACGGAATCGCCTC
GCCACCCGGCGATGAATCAGGGGTTATTGAAGATACGGAGGATATGGAGA
CAGAGGTGACTGTGAGTGCTTTTTTTAGCTTGAATATGGA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00008017-exon-sc0000081-1491911889:694882..695043 | TCONS_00008017-exon-sc0000081-1491911889:694882..695043 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00008017-exon-sc0000081-1510915933:694882..695043 | TCONS_00008017-exon-sc0000081-1510915933:694882..695043 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00008017-exon-sc0000081-1575043694:694882..695043 | TCONS_00008017-exon-sc0000081-1575043694:694882..695043 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00008017-exon-sc0000081-1491911889:695605..695647 | TCONS_00008017-exon-sc0000081-1491911889:695605..695647 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00008017-exon-sc0000081-1510915933:695605..695647 | TCONS_00008017-exon-sc0000081-1510915933:695605..695647 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00008017-exon-sc0000081-1575043694:695605..695647 | TCONS_00008017-exon-sc0000081-1575043694:695605..695647 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00008017-exon-sc0000081-1491911889:711815..712121 | TCONS_00008017-exon-sc0000081-1491911889:711815..712121 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00008017-exon-sc0000081-1510915933:711815..712121 | TCONS_00008017-exon-sc0000081-1510915933:711815..712121 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00008017-exon-sc0000081-1575043694:711815..712121 | TCONS_00008017-exon-sc0000081-1575043694:711815..712121 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000081 | supercontig | sc0000081:694882..712121 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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