TCONS_00007936 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00007936
Unique Name	TCONS_00007936
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	4454

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000080:563056..579630-

transcript sequence

>TCONS_00007936 ID=TCONS_00007936|Name=TCONS_00007936|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4454bp
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GAGGAGATTAGTGACCCATGGGAAAAGAGGAAGCTGAAAGAACTGGAAGA
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CTACACTTCACAAAGAGAACAGTAATGGAAGTAGTGTCGAAGATGATCAC
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TTTCTCTCAACGGACCACGACCTGATGCGTACCCACGAAAAACGACTGCT
CGNN

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transcript from alignment at sc0000080:563056..579630-

Legend: exon

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>TCONS_00007936 ID=TCONS_00007936|Name=TCONS_00007936|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=16575bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080:563056..579630- (Clytia hemisphaerica)
ATTTTACTTGTCTGACTTTGATATAAAATTTGACTGCCAATTCATTCAAT
CTTGATTTGTATTCTTAGCAACTGAATGGAGTTTTAGTTAAATGGTTCAA
TCTGTGTTGTAGTAAATCTAAATGAAAGTTGCTTCCAACACAATTTCTAT
CGGCCATTTGAATGACGCACTAGAATGTTTCGAATACTAGTGCCAGACTC
CTAATATCAATCGCATTTTCTCAGCGTTTCAAAACACATTAACAACACAC
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TATATGTTAAAGGTTCATTTTAAAGATGGAGAAACTTTTATATACTCTGT
TGATAACCATTTTATACTTTCCTGTTGTCCAAAGTAGATGTGGATGTCAC
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ATGACTGATATTTTTATTTGTCCTTGATAATTATGATTATGGTTTTTTAA
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ATTTTTTTCTTATCTAATAAAAATAGTTTAGATATTCAATCAGTAAACGT
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TGATGCAAGTACTTAGCGATTTGATAATTGACATTGACCCTTACATACAA
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ATTGGTCCATCTATAATTTTTACCGTTCAATCACATTTGATGGCCATAGA
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TATTTGATCGAATGCATTCAAAATTCGCACACCATTTTTGAAAAGCGGTT
TCTACAGTATCACACAAAAATTTTCAATTGATATATTCTCAGATATAACC
TCCCAAATTTTGTATAATTTGAGTTTTGGGGTAGTTGCATCTTTTTTAGT
TTTCTGAGCCAAAAAAAAATTGAAAAAGTTGTTTGGGAGAACACAACAGT
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ACGTCATATGATTGATTTGTCTTTCACAAGACAGCAGTTACTAAGGGACA
AGAAAATTTATCCTGTTTGTACTGGATGAGGGTCTAAAGTAATGTATGCT
GTAATGTACGGAGCAATTTGTTATTCAATAGACTGCTGCATGTTTTCCTA
AACAACTATTAAAAATGTCCTCAAATGTTTCGAATCTACTTTTTATCGCA
TACATGCTTAGAATGTGTTCCATTTTTCATGGACTAGGTATCTCAATTTT
GCAAGCCATCTTGAAAAATTAATTAAGTTTCTAAGATATTTTACAGTCAG
GCACATCCTGGCAAATGAACGGGGTATTTTTCACTTGCGACCATTGGCAA
ATGAACGGGGTCGAAAACGAAAGTGACGTAATAGCGCCGAATACCCAGTT
TAATTGAACCGGGTTGGAAATATTTTGCTTCATTTCAAAGAACTGCATAA
ATAAAATTATTTTTCCGTGGGTCAAAATTGTCTTCGAAGATTGAAGAAAC
TTTTAATGAAAAAATAAAGCTCCCAGTTTTCTTCCTTTTTTCCCTTTTTC
AGTTTGAAGTTCATTTTTATTCATTTTCACGCTTTTAGCCTGAGACGTCC
TATCTCATTTACACTGGGTGACGAATACCCCATGCAAATGCTCACCCCGT
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GTTTGGTGGGCTTTGTCCCATGATACACCATCTCTTCTTTAAAACAGCAA
TAGTTTAATAAGTAAACTAAGTAAGCTGTGGCAACAAAATACATTTTAGA
ATTTTTTCCTTTTTGACTTCAATGCTCATATTTTTGATTTCTAAACTTTG
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TTGTAGTCAAATCAGGGAGCTAGCTAACCTGGTATTATGTCCAAGTTTTC
AGAGAATTTAAATATGATACTCAAAATAATTTTATCAAGAGATCAAACTT
ACTCCTTATTATATCTATTTTATTTCAAAAACTGTGTGGAAATTATAGTA
AATCTTAGGTTGCCTATACTTTATATTGTTATTTTGATGTTTTATTCTTG
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GTAATTTTGCATTCAAAGATCTGACAGTTTGGTGTATTAAATTTTTTTTG
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TATAATAAGTGAGGGGTGAGAGAGCTTAAATTAGTTAAATAACTTAATGT
CTTTAACTCATAAACATTTTCAGTTTTTTTTGGATTCCATNGTTAAATAA
CTTAATGTCTTTAATTCATAAACATTTTCTTTTTTTTTTTGGATTCCATG
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GTATTGTTCAGGAAATGTCTATTAGAGTAATTAAATTATGTTTGGAAAAT
TATCAGTAACTGTTTGTTTTTACTAAGGCAAAGTAACACAAATCTGCTTT
GCTGTCCTTTTTTATCAATCTCTGAATTGCAATAGATTCTTTCAGATACT
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TTCAAGCTAACAGGTGTGTATTAATAATAGATCTTGTTTTAAATCATTTC
TTTAGTGAAATAACTATCTTGTTTCAAGTCAATATGGAAAGTTCTTTTGA
GTGAATAATTTCTGTGGACAATTGTTTCAAAACTCAAAATTATTGATGGG
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TCATTTATTCATGAAGTTTTCAATTGATATTTATCAATTTAGCTTTCAAA
ATTCTGGTTTGATATTTTATTTATTCAAAAGGACACGTATGTTAATTTTC
CCAATTCATATGTAACTTACATCATATTTTGTTTTTACTTTTTAAAGATC
TCTTGATCTATTTTTAGCAATGGACCATCATCGAACCAGCACTACAGCGT
ACCTAATTTTAGGGTGCTCCTATTCCAACCAACTTTTCTGGATTTTCAGG
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TCAACTCATCGTAAATAATCTAAATTAAAAAAAATCACTGAAGATGCTTT
ATTTCTAAGTGAATTTCCTTTTCATTTCCCTCTAGGCCTGTTGGAATGCC
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AAATTACAGATGTCAATACGCTACCTCCTTTCCATTCTACAAAGTTTTCA
AAAAAGGTGAGCCATATGATAAAACATCAAATCATCTATTTTGGTGCTCT
ATGCTCCAGTGAAGAATAGTTCACTTCATTTGACTGATGTGTATTGAATA
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TTATTTGGATTAATTGGATTTTACTACCAATTCTACTTTATCAGACTTTA
TAGTTAAACCTTTTGAAAGCCTTACATATTCTAAGAGTTGTTGCTTTTTA
CTCCAGCTTCAAGCAACAAACTGTAAATTTTACCTTTTTCACTCACTGTA
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ATTTTTAGCAACTATGGTAGGAAACATTGAGCATACAGTTTATCTTCATA
CCTCAAGAGGGAACTTTCCCTATCAGGTAACTTTTGTTGTTCTTATAAAA
GAATGAAGCAAACTCTCAAAATTCACTTCCATTTTGCTTGTAAATTGATA
AAAAGTTGATTTGTTGGATAAGAAAAATCATTATCATTATGCATAAAAGT
TTTAAAGNATAAAAAGTTGATTTGTTGGATAAGAAAAAAATCATTATCAT
TATGCATAGAAGCTTTAAAATTTCTGTAATAACTTGTTCATTATACTTTA
TTTTTCAGGTTTTTGCAGTTGGAACCCCAAACCCATACAGGCTACGTGCA
TTTGTATCTGCAAAAATGCCAGCAAATGGAACATTTACTCAATATATTAA
CATGTATAATCCATACAGTGAACCACTACAGGTGAGGCTAGAAATAATCC
AAACCCTTTGTGATTTTCATTTTTTCAATTTACTCCAAATTAGATTATTC
TAAGATGACACTATCTCTCCACCCATTGAGGACGTGTTTAAATCATTACA
AATACTCCTTTCATTCTCTTGTTAACAGTAATTTAAATCTACAAATATAA
TATGAGATGTTTATGGTGTTTATAATCATAATTAAAATACAATAACAAAC
TGTTTTGATATTTTTGTTTTTCAGCTTACAGAGATGTATTCAAGTGGAAA
GGATTTGCATCTTGATTTATTGGGGAATAACGTTAATGGAACTGTTGGTA
AACATTGGGAAATTCCCCCATATGAAATGAAAGCTGTGATGAAGGCAACA
TTCTATTCACAAGGTGAAGGTATATCAAATCGATTCGTGCGAGTCAAGCT
AGGAGCTCCAGCCTCTCCAGCTGATGTGGTCATCATACCATTTGAGATGG
TCATTTCCAATAGTAAGTATTGTCAAGTAAACTCTGACAGTTGTGACTTT
CTTTTTCGCCATATATATTTTCAAATATAGTACATATATTTGAAAATAAT
ATTGTATTAACTACAATTTCAAATTACTGGTACTTTTCATTTTAGAACCT
GGACTCTTTACCAATGTAGATGTATTAGATTTTGGAACTCTAAGAACAAT
GGGTAAGTAAAATGTTTATACTTTCTAAATGTCTAGTTAAATTAGTTGGA
AAATACCTGATAATGTACCTATTTAATTATTAATGAAAATATTCATATTG
AATATACAGGTAATATTAACAGTCGTTAATATACGACTAATCCACTCAAG
AACAAGTGTATTTGTTTATACTTTTGTTTCAATTCACTATTCTCTTCTTC
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ACATTCATCTCACAAGAAACAAAACAGTGGAAAATTAGTGATTTATACAT
CAGATGAGAAAAAGCAACTAGAAGTGCCTTATCACACCAATATACTTCAT
GGGTATGCATTCTTGATTTGCTTTCAATCTTTGTTTTCGGTTGTGATCTT
GCCTAATCAGTATCTTTCACTTGCCAGCACTTGCTGAGAATATTTGCATT
TTTCTAGATTTTATATTCGGGTATTATAACAGCAATACACTGCATACTTT
ATGTAATAATGATTTACTATTATCACATTTCCAGGACTTTGGCGTATTCA
ATAAATAAGACATCATTTTATGCTGCTGACTCTCCCACAACGCAAGTATT
GATGATAACCAACACTTTCAATTCAACATTAGTCATATATAATGCAACTT
TACCACCTGAAACTAAAGATATTTTTTCGGTAAGTTCTTCATATTTCTAA
AAGGATGTTTTTGTCATGTTGGCAAACATGATTTCCTAAAAAAGGAGTAT
TCATCGTATTTATCATTTCCTAACTTAATTACTTATCGAGTCCAAATCAG
TTCTCTGCACACAATTACATCAAGGAGCTTAAGAGGAAGTGCTTTGCTTC
TAATTGCTTTTGGTTTCCTGTGGTAGTCTTAATGATTTTTTTCTTAATTT
GTATTACTTTTTTAATGGTGAACTTTGATCTTTTGTTATTTCTGCGTTGT
TAGGTTGATAATAATTGATTGTTATATAATTAATTGTTTTCACGTGGGTA
ACTTTTTTTTCTTTTGGAATATTTTAGATTGTGAATTTTTCGCCTGCAAT
TATGGTACCTCCAGGAAAATTAGTGTCCCCTCTGTCCATCAATTTCCACG
CAAATAATTCAATGTTATCATTATCAACTATATTGCGACTGTACACCAAT
GCCTCCATTTTCACAATACCAGTGCACTGTTACAATGGAAAACTTCAGGT
ATTGGTGTCTACCAAGTCGTTAAACTTTTCGAAATTATAACCCACAAGCA
TTTTCAATAAAAGTGGTACTCCAATTTTAATGTAAAATGGATCAGTGAAC
TTTTGACGCCTTTTTCTTTTTGCTTGTGGTTTTTTAAATTGCATACGACC
ATCATTATCAAAAACCTCAGATAATATCCTTTTTGAATTTGTAAATGGTC
ATATTTAAATTCTTACCACATTGCATGAGTTCAAAAGATCTAGGTCGAGA
TGTTGTGTCTTTTTGAAGCTAATTGCTTGTGGTCACAAACTTTTCACATA
TTTACTATGTTATTTTTGACCCATGTGCGCCATCCTGCTATATCCTCCCT
TACAATTGACTTTCATCAATTTTACAGTATGAAGTCAATAATGTCAATAA
GAATGTGTTGGATTATGGTACTGTTGGTGTTCAGGAGCAACGTTCCTTAA
CCTTCCGCATCATCAATAATAATCCTGTGGAGGTCAGTACTTTGTGCTTT
CTTATAATCTTATAAACTCACTGTAGTCTTGTTGTTGTTTTTTACCTAGT
GTTGATGCTTGACTGATTGATTTATTACATTGTTGTTGTTCAATATCAGG
TTTCAATCAAAGAGTTTGGCACTCAGTTCGAATTTGCTCGATTACGGCTC
ATGCATGTGTCCAACTCAAAGAGCACTGCAGAACAACAAAAATTACAAAA
CTCACTGAATGAAACGCTCAAAAGTAAAATCGAGAAAGATGAAAATGGAG
AAGAGAAGTTAATCTTGAAGTCGAGCGATGTGGCAACCTTTGAAGTTGAT
ATTGTGGCTCCTGAAAAGGAAGGCACATATCATGGCCAAGTGTTACTCAA
AACTCTATACGAGGTAGGGCTAGTATTGTCTTTGCTTCAATTCACTTATT
GTTAATTTATCTTATTTGGTAGTTTTTGACTTTTCTGAATTTCGGACAGG
TATTCAGGTTTCGTTCTTACGGTAAAAGTTTTCTATTATAACTAAACTTT
TTTGTTTTTATAGACAATTAAAATTCCAATCTTTATGAAAACGGTGGAAG
GAACATTGATAGCAAAACCAAAGAAGATACGCATCAAAAAAGCCTTTCCT
GTAAGTAGAATTCCACTCTTGTCCCACTTGTCACTAGTTTGAAGGATTCA
TGTTTCACAATGCTAACTTTTCTTTACTTGCAGGGGCGGATCGAAAATTA
TCCTTTGTCAATTGAGTCTACTTTCAAATACGGTATCAGTTTACAGAATC
TGAGTGTTTATCCAGAAGATCCTCGCTTCTTCTTCATCAAACCAGATTTT
CTACCACAACTGCCTCCTGGAGAGAAAACTCACGTAAGTGAAAAGGATTT
AGAATTCGCACGTTTTTCGCAAATTTTGTACGGCTGTTATGTAATGAAAA
TCGCAACTTGGTTTAAAGTGTGTACTTAGTTGCGTTATTTATAGTCGATT
CATTGAAATGTCAAAAGCGTATGACTCAAAATTATTTATAAAAGCTTGAA
GGTTGAAAAGGTCAAATCAAACCTTTTTTTAAGCACACATTCTGTTGTTT
GTTTATAGATTGGTTGGGTCAAATTTGATCCTTTTAGAGGGGATGTTGAT
CAATGTTTTCTTTGTGTCTGTGAAATTGATCCAGGTGAGTTGGCTTGTAA
AAATACTACCATCTTCAGCCATCTTAAATACTTTGAATTGTTTCATTAAA
TTCTCCTCCAATTTGTGACTTTTGACGAAATCGTGCAAAAGGCCCTTTAA
AAATGGAAGACTTTTTTTCAGCTTGCGATCACTGGTTCCATAGCCTACCC
TTACCATCAGATACTTGGGAGCTGGACTTCAATCTGCTAGAAAAGTTAAG
GAGAAAATGGGACCTGGTAGAAAGCAAGAAGGACTCCAAGTAAGGGAATA
GTTTGTTCATTATTTTTTTTAGGCGAGACCAATTTGATTAATTATTTTAC
GGGCCCGACCGACCCTGAAATTCCAAAAATCGAAATAAAAATAAAATTGA
TTTTGGTAGTACATTTTTATCTTCGTTGCTTTTACAGACTGCAAAATTTT
CAAAATTTTGGTAGTTTTTCCAAGGTTTTGAGAATTTTTCATTTTATCCA
TGAATTTGACCTTTTTTCGTCTTTTTAGGAAATTTTATAGGTGAAATTCT
AGTTTTATTTTTATTTTTTCGCCGACCGACCGACCCTCTTTATTGGGTCT
CGCCTTAGATGGGATATGATTTGTAAGCTTCACAATTTAATGTGCTCGCT
TGAAATAATTTCGTCCTATCACAGGCTGTCACCTGTTTGAATAAATATTT
GAAAATTGTTACATTTGGTTGTATTCTTATTGTTTTAACCCTACGAAAAC
AGACTAACTTTTTTAATTTTCCTTTGTTTCAGTTTCAACGCATCCATCAT
TATCGATTCTTCAGTCATAAAAAATTACTTAATACCAATACAAGCTAGTC
TGTCATGGCCCACCCTAGTTGAACAATCTATCAAATTCCCTTCGACGTAT
GTTGGCAACTTTACCACAGCTGACATGTATATCACCAACCCTTCAGATCA
TCCATTAGTTGTACAAGTTGTTCCTTTGCTGCATTATCCACAACCTGAAG
GAGGCCTTGATCTCTTGTCTGATCGTTTGATTGTAGACTCTTTTTCACTG
GATTTGAATGGACATTCCCTTTTCACGCTTTCAGATCTACAGGTACCATA
TGTTTTTTTAGACTGTCTTTGTGTTGACTTCGTTTCTTTAAAGATGTTGC
CATCTTCTATCTATCCATCTATCTTTGCCAATTTTACTTTAAAATTTGTA
ATGGATAGATAAATGAATTTGTCTCGTTTTCATGCACTTGTCTGGTTTTT
CAAAATTGGATTCGAATTGATGGCAAGACTCGTTTTAATCTCAAAATCGG
ATGAAGATCACTTTCGTGTGCTATAATATGCTTTATAATCAAAATGTACA
TTATATTTTCAGAGTGGGGAGCATACAAATTCCAAAGTAGCGTCTGCTCT
TGGCATCAACCCTTCGCCTAATAGTTTATCCATGGTTCTTGAGCCGCGTC
AAAGGCGGGCCGTCACCATCGGCTTTACGCCGCAAGACGAGGTCCCCAAA
ACATCTATCATGGTTGTTAGGTCAGTGAATTCTTGATAAATGGCCATTTT
GTTTAACTTTCTTCCAGCTGTGATCCTAATAGGGTTCAATATGAAATTAG
GAATTGAAACTTCTCATCCCTCTTTAGTTTCCTATACACATTCACATCAT
GACACCGAATTTTTTTCTTTCCCAAATGAATGTGCCCTGCAAGGTCATTG
AAATATATTTTATTTTATTTCTGTTTTAGAAACAATCTAACCATTTTGGA
TTTGGTAGTTGTTCACGGTCAAGGCGCAAAAACTAATTTCAAGATAAATG
GCAAACCCCCTGGTGGGAAATCTTCCGTACTTCTCTTTCAAATAAAGGCG
GATCATCTCAAAGATTGCAACAGTAAGCAAATTTCTAAAAACTCTTTCTT
TTTCTCATCATCCGTCTGAATCTCTGTTTCAAAAAGAAAATGCTAGTAAA
CCACGTGGGCTATTCATAGTTGGTTTTCAAAATGAAATTGCATCATCCCA
ATTTCCCATAATTCCACGCATTCACTATATTTTTGATAGCCCGAGTTTCT
TCAATTAGTGTGCCCACGTGGGGAGAACTTTTTGACATTTGATATAATTG
ACAGGTAGTTTCCGGAGTAAAAGTCATCGCTTAGCATTCAGATGTATCGA
AATGTACACACCTCCTTTCAAAATTTCATTATGTAATCGTAACAATTCTG
TTTTGACTTGATATCAAAATTTATATAGCGGTTTTTTAATTCTTTCGCTT
TCTCTTGTTTTCTTACAAATGTTTGCGCAATGCATGCTGTTTCATGTTCA
TTCACTATGAATCATGATAATGTATGAAATAAAATTACAATGCTTGATAT
GTAATACGAGTAGAAGAGATTTGTTATGTGAAATGTTGTATAAGAAACAT
GCCAAAAATTCTAAAGAAGGTTCTTAAGGGTTAAGCTTAAAATCAGGAAG
GCTTATCAAACAAAAATTTCTGTATCTTTACAATAGTAATGATAATTTTC
ACTTATTCTAAACCTGAGAAACCTTTGTCAATGAAGTTTCTCACTAAAAA
CGCAGACTTGTAGCCTTTTGCTTTCAATCCTATTGAATTTTTTTCCAATT
CAGTCCTTTGTTTTAGTCTTAAACTTGTGTTAATTTTGGTGAGTCAAACA
TTTAACGCATGGTGTCTAACAATGTCTAACAAGATCATTTGAACCTCTTT
TACAAAAGATCCTATTTCCATCACTAACTCCTTTTAATTCAATTTCACAG
CTTGCTTACAAAAAGGGATTTTGTTACATTACTTTCACTCGCTTGTAGTG
TTTTAAAATAGAAAAGATATGAAGTGATGATAGAACTCTGGCGTCTATCC
GAGAATTAGTACGTTAGTTTGAATCGTTTTAAAAAGAGGGGAGTTCACTT
TAAACTAATTACAAATCATTATAAAGATTACAAACAAAGTTGTCGATGAC
AAGCCGAATGATATCATTATTTGATAAAACATGATGTAATGTGTAAACAG
ACGTCATTTTAAGGAGGGAAAGCAAAGTAGAAAGGTGATAGACATGATGT
TTTTGATGTTTCAACTTGTTTGTTTACTTTATGTAGAATCGACACCCAAA
GCACGTGTGTATCCTTCTTTCACTGTCAAAGGATCGTTCACGGCAACCAA
TGCCGGTCAACTCCCTGTAGAAGTCGCATCCATGAATATCAATAATTATG
AATGCGAGGGGTACGGCTTTCGTATTTTGAACTGTGAACCATTCATGTTG
ATGCCAAACGCCTCAAGGAAAATCGATATCACGTAAGTTTTTTATAATCC
TTTTTTTGTTTACTTACTCTAGTGTCCTTAAAATTAAGAGATTCCGTGGA
TTTCAAAAAGCTGCTTTTACACATCCCAGTTAACGGGTTTCTCAGCAAAT
AAATCAGTCATTACTATTAAACGTCCTGACCATTTAGATTTTACTTTTCT
GAATCAAGAATGGATTTTTCTTGGAAATTTATTCCATTGAAATATGAGTA
TCTAAAGTATTTAACATGATGCAATAGCGAAGTTAAGCAAGTGTTTATTT
AGACCGTTCAATGCGATATCGTAGGCCTATACATAATTGCATGGTTTGCT
TTGGAAAGTTATGTACAGGCCTACGGTATCGCACTTTACAGTCAAAATAA
ACCCGTGCTTAACCTCGCTAATAGTGATATAAAGTCGAGAATTTAGACGT
GGGACCTTTAGGCGAGGGAGCAGAAATCAGATTTTCTTTTTCAACTGAAA
TTGGGTGGGAACGTTTCATTTCTCATATGACTATTTGACACATTTTTACT
GTCTCACTCCTCCGGTGGATACGCCAATAACAAACAACGAGATAGTCATT
CAATATCGATTAATAGTTGTTTGTTACTGGTTTTTCTTTTGTAATCACGT
CAACGAGTGCTGATTGAATGGCACGTGTCACAGATCACTGCTCGTCTTTC
ATACTTAATGGACACTTTCTTTTTTCCTGTTTATGTAATCGAATTGCTTA
TAATTAATTTAATCGCATTTCGGCGTTCTTTCAACATTTAGCTTATAACT
TCTTGTGTAGTACTCTATCATGTAGTATCAGTCGCATAACTACATCTGAA
AAACCGACTGAAGAGAATATTAGAACACCTCTATACACTATAAGCAGAAT
ACGTATAAAGTAAACAAGTTGCAGCCGAGATAACTTTCGTTTGGACTGCA
TACATGTACTGTATTTCCTTGTTTCAAAGTTGATACAGTGAAACAAATAT
ATTGTGTAAAATACACAATACTCCAAGGACTCCTCATTCTGTCGGGGTCG
AAATTTCCTTGTACAATGTAATTCACACATCCGAATAATATTTATATACA
TTACTGCTGACCAAGCATACTGCGTCAAAAGTGTTTTTTGTCAAATGCTG
AGCTTATGAGAAATTCAATATTTGCTTAGAGTGGTTTCGTACTAATCCTA
CAAATTTCCTTTTTCTATCATTTCAGATTTATTCCTGATTTTACGACATC
AAGAGTGACAAGAAATTTACGAGTATTAACCACCATGGGGCAAGCTTTAG
ATTTCACTTTACTGGCTACATTACCACACCACCTATTACCATTATGCGCC
AGTGCTCTACCACGCCCTTACTGGGAACCATACCTCCATATCGTGACAGC
TATAGTGATGTCAACCATTTTCATTTTTATAATTTTCTTTGCTTATTTTG
ACGCTCAGAAGTATGTGGTTCAGTGTACGTTCACTGCTGGCGGTCTTTCG
AACCGAACACATGGAAAAGATAATATGGATATCTATACAGCTGGTACTGT
ATTTGATCTCAACGCAATCGCTGGCGTCAAAGTAAGGTAAGTCAATGGTT
TTGAATTTTTTTTTGGTTTTGATCACTATGGATATGCCCCTGTATCACAG
GCCCAGCTTTTGACTCACTCCGCAATAGCAAAAATTTCTTGGTAGGAAAA
GAGCCTAAGCTCCCATCCCTATAGGGGAATTTGATAGAAGATATTGTTCT
CCAAAACTAATTTCGATGGGAATCCTTAATCTCACTAAAGGTTTAGCTGA
ACCTGTTTAGAAATCTGTTTGATTTACATGAACGTTGATACACGTTACCA
AAGGATAATGTGAATTACCTGGTCCAAGTTAGAATAGACAAAGGTTTTGT
ATATGTGTTAGAATGANAATTATGAATGCGAGGGGTACGGCTTTCGTATT
TTGAACTGTGAACCATTCATGTTGATGCCAAACGCCTCAAGGAAAATCGA
TATCACGTAAGTTTTTTATAATCCTTTTTTTGTTTACTTACTCTAGTGTC
CTTAAAATTAAGAGATTCCGTGGATTTCAAAAAGCTGCTTTTACACATCC
CAGTTAACGGGTTTCTCAGCAAATAAATCAGTCATTACTATTAAACGTCC
TGACCATTTAGATTTTACTTTTCTGAATCAAGAATGGATTTTTCTTGGAA
ATTTATTCCATTGAAATATGAGTATCTAAAGTATTTAACATGATGCAATA
GCGAAGTTAAGCAAGTGTTTATTTAGACCGTTCAATGCGATATCGTAGGC
CTATACATAATTGCATGGTTTGCTTTGGAAAGTTATGTACAGGCCTACGG
TATCGCACTTTACAGTCAAAATAAACCCGTGCTTAACCTCGATAATAATG
ATATAAAGTCGAGAATTTAGACGTCGGACCTTTAGGCGAGGGAGCAGAAA
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ATGACTATTTGACACATTTTTACTGTCTCACTCCTCCGGTGGATACGCCA
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CTGGTTTTTCTTTTGTAATCACGTCAACGAGTGCTGATTGAATGGCACGT
GTCACAGATCACTGCTCGTCTTTCATACTTAATGGACACTTTCTTTTTTC
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ATCAGTCGCATAACTACATCTGAAAAACCGACTGAAGAGAATATTAGAAC
ACCTCTATACACTATAAGCAGAATACGTATAAAGTAAACAAGTTGCAGCC
GAGATAACTTTCGTTTGGACTGCATACATGTACTGTATTTCCTTGTTTCA
AAGTTGATACAGTGAAACAAATATATTGTGTAAAATACACAATACTCCAA
GGACTCCTCATTCTGTCGGGGTCGAAATTTCCTTGTACAGTGTAATTCAC
ACATCCGAATAATATTTATATACATTACTGCTGATCAAGCATACTGCGTC
AAAAGTGTTTTTTGTCAAATGCTGAGCTTATGAGAAATTCAATATTTGCT
TAGAGTGGTTTCGTACTAATCCTACAAATTTCCTTTTTCTATCATTTCAG
ATTTATTCCTGATTTTACGACATCAAGAGTGACAAGAAATTTACGAGTAT
TAACCACCATGGGGCAAGCTTTAGATTTCACTTTACTGGCTACATTACCA
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ACCATACCTCCATATCGTGACAGCTATAGTGATGTCAACCATTTTCATTT
TTATAATTTTCTTTGCTTATTTTGACGCTCAGAAGTATGTGGTTCAGTGT
ACGTTCACTGCTGGCGGTCTTTCGAACCGAACACATGGAAAAGATAATAT
GGATATCTATACAGCTGGTACTGTATTTGATCTCAACGCAATCGCTGGCG
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TAAAAACGGATTAAAAGAACCAAACACGCCTCCCAAACGGAATAAGCGTA
GACAAGAATCACACCGGCCGAACGGACGTTACACCTTGTATCAAGAACCT
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AGTAGTGTCGAAGATGATCACCAAGAAGAAAAACCTCACGGCTTTACGAC
CGTTGAAAAAGTGAAAAATCGAAAACGTATGGAATATTCTGGACATGGAA
CAATGGATAAATTAGATGAGATTTCTCTCAACGGACCACGACCTGATGCG
TACCCACGAAAAACGACTGCTCGNN

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_004475	XLOC_004475	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000080	supercontig	sc0000080:563056..579630 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
11.8737	10.7816	79.2456	83.2093	19.0232	13.9196	13.5041	15.1262	11.1597	16.5046	2.20473	13.3438	22.0014	22.7547	13.4336	19.4028	15.8508	19.3201	13.3671	17.1235	18.4829	18.0561	9.11551	13.8156	12.5496	18.8491	18.4156	16.607	17.3604	16.9103

Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00007936 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: TM131 (Transmembrane protein 131 OS=Homo sapiens GN=TMEM131 PE=1 SV=3)

HSP 1 Score: 615.535 bits (1586), Expect = 0.000e+0
Identity = 403/1119 (36.01%), Postives = 633/1119 (56.57%), Query Frame = 2

Query:  494 GPSSNQHYSVP----NFRVLLFQPTFLDFQEQPVGMPYVQSIVLSNPSDQNDIEITDVN-TLPPFHSTKFSKKVLPPLTNMTVDLVFLATMVGNIEHTVYLHTS-RGNFPYQVFAVGTPNPYRLRAFVSAKMPANGTFTQYINMYNPYSEPLQLTEMYSSGKDLHLDLLGNNVNGTVGKHWEIPPYEMKAVMKATFYSQGEGISNRFVRVKLGAPASPADVVIIPFEMVISNKPGLFTNVDVLDFGTLRTMDEPKSLNLNVLNVGNKSVQILSIQVIPPNRAVTVQFTPMVLKTSK-KYTKIATVTYTAIHSSHKKQNSGKLVIYTSDEK-KQLEVPYHTNILHGTLAYSINKTSFYAADSPTTQV---LMITNTFNSTLVIYNATLPPETKDIFSIVNFSPAIMVPPGKLVSPLSINFHANNSMLSLSTILRLYTNASIFTIPVHCYNGKLQYEV--NNVNKNVLDYGTVGVQEQRSLTFRIINNNPVEVSIKEFGTQFEFARLRLMHVSNSKSTAEQQKLQNSLNETLKSKIEKDENGEEKLILKSSDVATFEVDIVAPEKEGTYHGQVLLKTLYETIKIPIFMKTVEGTLXXXXXXXXXXXXFPGRIENYPLSIESTFKYGISLQNLSVYPEDPRFFFIKPDFLPQ-LPPGEKTHIGWVKFDPFRGDVDQCFLCVCEIDPACDHWFHSLPLPSDTWELDFNLLEKLRRKWDLVESKKDSNFNASIIIDSSVIKNYLIPIQASLSWPTLVE--QSIKFPSTYVGNFTTADMYITNPSDXXXXXXXXXXXXXXXXEGGLDLLSDRLIVDSFS-LDLNGHSLFTLSDLQSGEHTNSKVASALGINPSPNS---LSMVLEPRQRRAVTIGFTPQDEVPKTSIMVVRNNLTILDLVVVHGQGAKTNFKINGKPPGGKSSVLLFQIKADHLKDCNKSTPKARVYPSFTVKGSFTATNAGQLPVEVASMNINNYECEGYGFRILNCEPFMLMPNASRKIDITFIPDFTTSRVTRNLRVLTTMGQALDFXXXXXXXXXXXXXXXSALPRPYWEPYLHIVTAIVMSTXXXXXXXXAYFDAQK----YVVQCTFTAGGLSNRTHGKDNMDIYTAGTVFDLNAIAGV 3778
            G SS Q  S+     N R + F+P  LDF EQPVGMP ++ + L NPS +  I +  ++ T   FH++ F  + + P  N + D+VFLA +VGN+E+T++++TS  G F YQVF VG PNPYRLR F+ A++P N +F+  IN++NP+SEPLQ+ EMYSSG DLHL+L      GT  K WEIPPYE K VM+A+F S+       F+R+K  A  S  + +I+P E+ ++  PG++++ ++LDFGTLRT D PK LNL++LN G K V I S++  P N A+TV F P+ LK S+ KYTK+A++++ A  +    Q SGK+ +   ++   +LE+PY   +L G L +    T F+  DSP   V   + +TNTF+  ++I++  LP E K +F + NFS  +++ P +     ++ F  + S + +   + L TNAS F +PV  Y G L Y V    + +  +D+G +   E  ++ F IIN+NP+E++IK +    +   + L+ V     T     + +SL E  KS +    + +  + L S   A F V + A + EG + G + + T YE + IP+      G+L   PK + +  +FPG+I +  L+I ++F   + +Q +    ED RF++ +     + L PG+K+ I  + FDP     D C++ +  +  +       + +  D W+ D++L + L + W  ++       +A   +++ + KN +  I A LSWP+++   + +KFP T     +  ++ + NP+D P+ VQ +PL  Y  P   +D L  R  +   + +DL      TL + Q   ++   + S+ G     +    L+++L+P ++++V + FTP      +S+++VRNNLT++D V+V GQG   N ++ GK PG  SS L F+I    LKDC  S  K R  P+FT+K +F   N GQL + + ++ I+ Y CEGYGF+++NC+ F L  NASR I I F PDFT SRV R L+ +TT G    F L A+LP+H+L  CA ALPRP WE  L+I+ + +MS +F+ +I  AY +AQ     +  + +F A   SN          +  G  FDL  I G+
Sbjct:   89 GLSSYQQKSISLYRGNCRPIRFEPPMLDFHEQPVGMPKMEKVYLHNPSSEETITLVSISATTSHFHASFFQNRKILPGGNTSFDVVFLARVVGNVENTLFINTSNHGVFTYQVFGVGVPNPYRLRPFLGARVPVNSSFSPIINIHNPHSEPLQVVEMYSSGGDLHLELPTGQQGGTR-KLWEIPPYETKGVMRASFSSREADNHTAFIRIKTNASDS-TEFIILPVEVEVTTAPGIYSSTEMLDFGTLRTQDLPKVLNLHLLNSGTKDVPITSVRPTPQNDAITVHFKPITLKASESKYTKVASISFDASKAKKPSQFSGKITVKAKEKSYSKLEIPYQAEVLDGYLGFDHAATLFHIRDSPADPVERPIYLTNTFSFAILIHDVLLPEEAKTMFKVHNFSKPVLILPNESGYIFTLLFMPSTSSMHIDNNILLITNASKFHLPVRVYTGFLDYFVLPPKIEERFIDFGVLSATEASNILFAIINSNPIELAIKSWHIIGDGLSIELVAVERGNRTT----IISSLPEFEKSSL----SDQSSVTLASGYFAVFRVKLTAKKLEGIHDGAIQITTDYEILTIPVKAVIAVGSLTCFPKHVVLPPSFPGKIVHQSLNIMNSFSQKVKIQQIRSLSEDVRFYYKRLRGNKEDLEPGKKSKIANIYFDPGLQCGDHCYVGLPFLSKSEPKVQPGVAMQEDMWDADWDLHQSLFKGWTGIKENSGHRLSAIFEVNTDLQKNIISKITAELSWPSILSSPRHLKFPLTNTNCSSEEEITLENPADVPVYVQFIPLALYSNPSVFVDKLVSRFNLSKVAKIDLR-----TL-EFQVFRNSAHPLQSSTGFMEGLSRHLILNLILKPGEKKSVKVKFTPVHNRTVSSLIIVRNNLTVMDAVMVQGQGTTENLRVAGKLPGPGSS-LRFKITEALLKDCTDSL-KLR-EPNFTLKRTFKVENTGQLQIHIETIEISGYSCEGYGFKVVNCQEFTLSANASRDIIILFTPDFTASRVIRELKFITTSGSEFVFILNASLPYHMLATCAEALPRPNWELALYIIISGIMSALFLLVIGTAYLEAQGIWEPFRRRLSFEA---SNPP--------FDVGRPFDLRRIVGI 1177

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00007936 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00007936 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
TM131	0.000e+0	36.01	Transmembrane protein 131 OS=Homo sapiens GN=TMEM1...	[more]

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TCONS_00007936 (transcript) - C. hemisphaerica