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transcript sequence >TCONS_00007851 ID=TCONS_00007851|Name=TCONS_00007851|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3157bp ttttttggtattttctcgagattttatcattagttttttctgattttttg ctcaaagatgcgtatgaacaatgctcaaaacatgaccgagtccgattttt gagaaaatgccgaaaatgccggaaatatgccggaaatcgccgtttttctg gattttcattggactttttccttataattggttgttttttcattcaaaaa cattattaaNTTCAAAGTAAAGGACGTTCCTGATCTGCTACCCTCCACTG CTGATAGGAGTGATTATTTTTAAGCCCAAAAACAGTCAATGAACCATTCA TCACGCATAGTAACACCATTCATTCAGCAAATCTATTCATGTCATCTTCA TTTTATCCCTCCCTGTGGATTGCAATTGGTTgctcttttttatataattc aACAAATCATTCATGTTTAAATTTGGGATAACACTTTTGATTGCTCCGTA TGGTGCTGCTATCATCAAAACATTTAATCTTCAAAATAATgattataatt taaattttgcaaattggttaaaaaaaattatgctaACTTTAAGACATCCG GGTCAGGTACTTATGAGTGCACTGGTCTTGTATGGCGATTTCAGCAATGA CACCGAGGGTGCGTGGATTCGTCAATGAATTGAGAGTAAGATGATGGAGT TCCGAAGATCATCAAATACCGTATGACAAGTAATAGTATTGATAGAAAAT TGTTGTGGAACATTCATCCATCCATTTTTAGTTCGATCGGAAAAGGGAAG GAAGGAGGTGATATCTTGTCACTTGTGTTGCTGCCATTGTGCCCACAAAA TGCCAGTTGTACTTCGAAATAACAAGAGACGTTCTCTCTACATCTCTCAT AATGTGAAAGATTTAACGAAAGAAGCGTTGAGACCAAGGAGTTGGTATTT ACCTGGTTCAAAGGAAGCTGCGGATCCATACACGAGTGTACGAAAATTGT TTTATGACTTCAACAAGACAGCTTTTTATGGAGATCTCGGTAAAGATATG AACGGTAGTCAGATTTTGACCAATGGTAATACACAACAAAATACAGATTC TAAAACACAAATCAATGGAACGTTCAATGAAATGACCAATGAAAATGTga gcaaaaatttgagaaattcttttcagAAACTTGCTTTGGCTGATAATCGT AACTCAACGTATATACcgcaagataaaaacaataacGAACCACCCGCTGT TCCGCCCTTACCGATTTCCCCACCACGTGTACCACCACCGAAAGTGTCAC CACCCAAACCACCTACCTTCatacaaaaactttcaaatcggAACTCAGAT ACTATAAGTTTGAAAGAGGAGAGTAGTTCATATGCGGATTTTTACGTGCC AAGCAGCGAAACGAAAAAACCAAACTTTTTACGGCGCAGCTCGAAAAGGA GAAGTTTTGATCCGTCAAAATTTAAAGCATTTGACTATATAACTCGATTA GATGATGATATCACTTCTATAACTTCTTCAACGGGGCGGTATTCAGTTCG TTCACACCCACCGCCAGTTATGTTGAGTCCTGACAGTCGTATCGATGAAG TGGTCGACCCCAAACCGATGCTGGAACGCTTCTTAAGGGATACAGAACAA GACATATGTTCAGAATATAAATATCAAAATGTTGGACGATGGAGTAAATT ATCAGATTTTACAATTACATTTAAGTATGAGTTTATCCAGCAGCCGTTGA TTCAATCACTCTACAACACGAACTTGAAGAAGAAgattataaaaagaaga aaagacttTTCATTCCTTGGAGCAAACGAGCTTCTTTCATAGCAGCTACT TATATAGAGAATCCTGAAACACTCACTCAACCACCTGTAGTTACGACTTT CCAACGTCGAAAACAAGGACGTTTCGCATCTTTTCGTCGTACACGATCAA CAATCACAACTGAAACGACCACACAAAGTGTTTCTTCGACCAGAAAGTTC AATTTACGGCGCATGAATAGTTTAGATCGTAATACGATACGATCGTTTCG AAGCAGCGCGTCCACTTTACGGAGACAAAACAGTGAGAATAACGCTACTT GGAAAAAGAAGAGAATGAGCTCGGTTTCTTCGCTACAAAAACAACAGAGC TTTGATGCTGGCTCCTTAAACCATCGGGATGCACGAGCTCTTAAACAACG AAAAAGTAATCGCTATAAAGTGGACGGTGCTCAAAGTTTCTTTGATAGAT ACCAAGATACTTTACGAGTTGATATGTTCTCCGTTGACTTGAATAAACTG ACGATAAAAAGCAATAAAAGTGACGGTTCATCGACCACAAAATCCGTCAC CCCTACGACCCCTCTCACACCGAACTCTACCGACGATAAAGACTCGGTTT TCGATTACAGCGACGAACATTTATCGAAAGAATTTGATTACAAACTTGTC GGTAAAACGTACCAACAACTATTTTACATTCGTTCAAGGCTTTCAGCGAG TGCGCGTAAAAGTGAATTTATGTGTGATGGTTCGTTTGGATGTTCTGCTT GTGATCTGCAATGTTACCCTGAATGGACGAATTCGTAAAAACTTGAACAA GAGAAAGTGGTAGAATGAGATAATGTTATGACTTGTGGATCGCCTTTGGT GAGATAAAACGGTGGCCTGATccaaaaactgtttttctttacgGCAAGTG ACTATACTTGAAACTAATGAGCGTGAGAAACGAAAGTACAATCCAGTCTA TAAGATCTTGTTTGTTTAGAAGGTTACCAAGGGGTCAATGAACGTTCTca gtgaaaatgtttttgatctCTCTACTTGATCCTAAATGAGGAAGGAAATC AATTTATGGAATTAAAGAGAAAAGTTGAACATAAATTTCTGATGGACTGT CAAGGAAGTCATTTTCTGTCAGCCATGTAAGTTGTCACAATGAATGTACG AGTTTTGCTGTGAATCTTTATTTTGAGATGTTTCGATCTCAACTGTCAAG TTACCATCAATATGAACCTTTGCTAACTAATTCATAAAAGAATTCGCCAT TTTAGAAGGATTTCGATTTTTGTCCGAAATATTATTTATATCGTCCAATG TCTAACAATAtttgtaaatatatttttcgCAGCAATATTTTTCCTTTGTA GTTATTTTCTATTGTACATAAATacggaaaataaattttgaaaatttgac aaactaa Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000080:622940..640196+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00007851 ID=TCONS_00007851|Name=TCONS_00007851|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=17257bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000080:622940..640196+ (Clytia hemisphaerica) ttttttggtattttctcgagattttatcattagttttttctgattttttg
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ccaGCGAACGTGACTGTCATGAGGTCATCTTTTTATTGTGTTATTCTTAA
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AATAAGGTAAATGATATGTTCTCGGTGGTCAAGTCATGAGAATTTCTCGG
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AAAGTTCAAGCCAAAAAAGGGTTTTTACCTTTGAGGAAAACGAGTTGAAC
AAGTTTGTGCTTTTATGATAATTAGTTATGATAAGCATGGCGTAACTGCT
tgatattgttttgttttgagaacGTCAACTTTTGCATTGATGTCATTTAA
ATAGTGCATTGTATAACGACCACTAATTATTTTCCTCTATCGCCTTGTGT
TTATAACTTTCACTGTTTGTTTTTATAGGAGTTTATCCAGCAGCCGTTGA
TTCAATCACTCTACAACACGAACTTGAAGAAGAAgattataaaaagaaga
aaagacttTTCATTCCTTGGAGCAAACGAGCTTCTTTCATAGCAGCTACT
TATATAGAGAATCCTGAAACACTCACTCAACCACCTGTAGTTACGACTTT
CCAACGTCGAAAACAAGGACGTTTCGCATCTTTTCGTCGTACACGATCAA
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AATTTACGGCGCATGAATAGTTTAGATCGTAATACGATACGATCGTTTCG
AAGCAGCGCGTCCACTTTACGGAGACAAAACAGTGAGAATAACGCTACTT
GGAAAAAGAAGAGAATGAGCTCGGTTTCTTCGCTACAAAAACAACAGAGC
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ACCAAGATACTTTACGAGTTGATATGTTCTCCGTTGACTTGAATAAACTG
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aaactaa
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000080 | supercontig | sc0000080:622940..640196 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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