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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00007483 ID=TCONS_00007483|Name=TCONS_00007483|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3072bp
ccaACTCGTAGAAATTGAATTGTGCTTCATTGTCAcgcaaagaaaaatca
aaaATTATTTTTCCAGCAAAATTCCCTTTACCGTACGGAGATTTCTGTGG
ATAAAACAGGCAACGTTAAACACACCGTAGAAATCAAATCAACATTCATA
CACACACCCATGTCATCATTTTATTGATCCCGGTTTCTTCTTTCTCGTTC
CTGATCGATCTCTGGATTAATCGTTTTTTAAATTGGTTTTAATGGGCATT
GTTGACACACTTTGAGTATAATTTGAAAGACAAGAGAGGTTTTAACTCAA
TTAACCCATATATCATCAGATTGTACAAAGATTTAAAGAGATATTTTTAA
ATGGTATTATAAGAATAAACGAATGATGTGCATAATTTACACGCTATGGA
TTTcattaacttttttattattGAGTATGGTTCGTTGTTCCTTGGTTACA
ATGCGCGGTGGAGAATACATTGTGAAAGACTTACGTGGGGAAAAAATCCA
CTCCGAAACTTTACATGTGGTTTTTCAATTTAAAACTATCGATCCATcaa
gtttgttattgttttcagTCAATCATCAACTTGGCGATTTTATTAGTTTG
GAATTGATCGGTGGAAAGTTGAGATACAAAGGGCGTTTGGGTGATGAAGA
TAAGGGCGCACAAGAAATGATCGTGGGCGGTGACGCCCTTCTTAACGATT
ACCAATGGCACGTGGTGGACCTGAAACTCAACAAACGTACAGTGACCATC
GAGCTGGATTATCAGCCCCACACCAAAACCTTCGAAGGTGCATACGAGGT
ACTGGACCTCGACGGAGACGTTTATCTTGGTGGTGTCAGCTCAACACTGG
ATGTATCCCAGTACGGTATTACCGTGCGCCGATACTCAGGATGTCTCCGT
AATTTCTTCTTCAATGACGACGATTTTTTGTACAAGACCAAATACAGTAA
ACCGACTTACTCTAGCTACGGTGATCTTCTTTGGAATAAATGCGAGAATA
TTGACTACCAACCAATCATGTTTAAAAGCCCGCAAGAATACGCGCTAGTT
CCAACTTACCTGAAACACAGCTTATCTTTGACCTTCAAGTTCCGCACGCT
GATCGGATCCGGACTtctattttccaaagtgtcgAAAGCAGTGACAGCTA
CATTGTATTTGAAAGAAACCAAACTATTTCTTAGCGTAAGAATCGGGGAG
GGGAATGGACCCATTATCATGACCCAGGGCGCGGATCTGGATGACGGCTT
CTGGCATCGTGTTGAAATCTCTATCACAACTAAGCATATTATGCTTAAAC
TGGATCAGTTGTCGGAGCTCAAACATCACAGCCCTTTCTCTCACTTGGTC
TCTTTCCATAAAAGTAACGGAACACTGGGTGGCGGTGAAGAGCACATTAT
GAAAGGTTTCGTCGGCTGCATGTATAACATTTGGATGGACAACACACTGA
TTGATTATCGCAAGTTACACCCAGTTTATTCAGCCGGTGTTCTTCGAAAA
TGTGAATTGAAAGACTATTGTTTGTTTCAGCCGTGTCGCAATGGAGGGCG
GTGCACGCAAAACCATAAATCATACAAATGTGATTGTATCAATACAATGT
ATAGCGGCCCAACCTGCGAAGAATCAGTGTTCCAACGGAGTTGCCAGGAA
TATAAAGAGCTGGGGTTACACGAGGACGCTTATTGTACAATCGATCCGGA
CGGAGATCAAGCTCAAATTAAACCTTTCCGTGTATTGTGTAACATGACAC
GATATTCACACAAAGCGGTCACCATCTTCGAGCATCAGTTACCAACAGAT
GAAATTCAAATCTCAAAAGGCGTCATCGAAGGTCAATCCTATCACCATAA
TATTGATTACGCCATTGATCTAGACACGTTTGATTACCTGCTTCAACACG
CAACTCATTGTCAGCAACACGTCAATTTTAAATGTAAGAACGCGCGGTTG
ATGAATTCTCCGCTCGGTCCAGCTGAAACTGTTTGGATTGGTCGTCAAGG
ACACGATGAACAATACTGGGGTGGAGCCAAACCGGACAGTGGGTCATGTG
CTTGTCGATACGATAAATCATGCGCTAAACCGTACCGCTATTGTAATTGT
GATGTCGGAGACGACGTCTGGAGATCCGATGCAGGTTACCTCAATCAAAC
GGACCGCTTACCCGTCGTTATGATGTCTTTCAAATTGACCGCCAACCAAT
CCTTCTTCAGTGTGGGTCATTTAGAATGTCAATTCAACGCTACAGCTATC
CCGCAAAACCTATCCAAATTCAGGGCGTTAAAAGCCTGCACGCCCTTAAA
CCAGCGCCCGACCAGCCGCCCTCATGTCACAAATCCATCGATCAAGCAGA
ACGAACGTATCTTGAGTTGGGACCGTAAAAAGCCGAACTTCAACTATGGC
CGTAAAAACCCGACCAAAGAACAAGGCTACGTCGGCCCCTTTGTGCCTAA
AGTCAACGTCAACGTCACAGTCGAGCTACCAAAGATATTGGAGAAGCAAG
GGGAAGAAGGCTTGAAATTCACTTTGAGCGTATATGCTGTCATCGTTATT
GCCGTGGCAACCGTTATTGTTGTTATCATTATCGCCATAGTGATTATCGC
TAAGCGTTGTCAGGGGTTACGAAATGGTGGACGAGCTACGAGCGAACACG
ATATGGATGATTATGAAAGAGAGGATGGGGCGGCCGCCAATGAAATGTGT
ACCTTCTTTGGATCTTATTCCCGCCCTAGCAATAGTAACCGCCCTGTTAT
TGAAGTTCACCGCCACTCTATTCATTGTGATACCATTGATGAACTTCCTC
CCGCTTATCGGGAATTCGCCCATGGTTACGGACACCAACCTATTACGACG
CATATAGACTTGAGTTATAAACCGCACAAAAAGAGCTTTGGTATGTTCTG
TTGATAaataaaggttctctttttttgctGTTAACTCAACACAAACAAAA
AGAGGGAAATCTAATTGGTGGATGTTAAAAAACGAAAGGTTTTCTTTTGC
GCGTTGGAAAGATAACCGCGAGAGAAATGCAGCACGTGATTGCTGTATGT
TGCATGAAGAGGCTGCCAACCT Run BLAST on NCBI protein sequence of TCONS_00007483-protein >TCONS_00007483-protein ID=TCONS_00007483-protein|Name=TCONS_00007483-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=843bp
MMCIIYTLWISLTFLLLSMVRCSLVTMRGGEYIVKDLRGEKIHSETLHVV
FQFKTIDPSSLLLFSVNHQLGDFISLELIGGKLRYKGRLGDEDKGAQEMI
VGGDALLNDYQWHVVDLKLNKRTVTIELDYQPHTKTFEGAYEVLDLDGDV
YLGGVSSTLDVSQYGITVRRYSGCLRNFFFNDDDFLYKTKYSKPTYSSYG
DLLWNKCENIDYQPIMFKSPQEYALVPTYLKHSLSLTFKFRTLIGSGLLF
SKVSKAVTATLYLKETKLFLSVRIGEGNGPIIMTQGADLDDGFWHRVEIS
ITTKHIMLKLDQLSELKHHSPFSHLVSFHKSNGTLGGGEEHIMKGFVGCM
YNIWMDNTLIDYRKLHPVYSAGVLRKCELKDYCLFQPCRNGGRCTQNHKS
YKCDCINTMYSGPTCEESVFQRSCQEYKELGLHEDAYCTIDPDGDQAQIK
PFRVLCNMTRYSHKAVTIFEHQLPTDEIQISKGVIEGQSYHHNIDYAIDL
DTFDYLLQHATHCQQHVNFKCKNARLMNSPLGPAETVWIGRQGHDEQYWG
GAKPDSGSCACRYDKSCAKPYRYCNCDVGDDVWRSDAGYLNQTDRLPVVM
MSFKLTANQSFFSVGHLECQFNATAIPQNLSKFRALKACTPLNQRPTSRP
HVTNPSIKQNERILSWDRKKPNFNYGRKNPTKEQGYVGPFVPKVNVNVTV
ELPKILEKQGEEGLKFTLSVYAVIVIAVATVIVVIIIAIVIIAKRCQGLR
NGGRATSEHDMDDYEREDGAAANEMCTFFGSYSRPSNSNRPVIEVHRHSI
HCDTIDELPPAYREFAHGYGHQPITTHIDLSYKPHKKSFGMFC Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000077:234164..252674- Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00007483 ID=TCONS_00007483|Name=TCONS_00007483|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=18511bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000077:234164..252674- (Clytia hemisphaerica)
CCAACTCGTAGAAATTGAATTGTGCTTCATTGTCACGCAAAGAAAAATCA
AAAGTGAGTCTTTCCAGCGAGATTTTAAGCCAAAAAGTCAAAAAAAATGC
AAAAATGCTTGAAATTAAGCAATTCCACGCTTTGTTCTTAATTTGTTCTT
ATCTTTTGGCGTTTTTTGAGCCTCATTGTTCTCATAGAATTGTTCTTAAA
CTTATTGTTTTGTGGTAAATTCCAAAATACACAAAGGGTTCTGGTTTAAT
TTATTAAGACTTTTTCTATCTATTTTAGGAAGAATCTGGTCAAAACTCAC
TTTACAATTGTCTTATATTAGTTGCCAGTAAGAAAAGTATCAAGATGAAA
TTTTGATGCCATTTTTGAAAGTAGGTTTTTTCTGGTTAGAGGTTGCAGGG
CAATTTTAGCACAACAGCCTTTTTGAGAGGTAGTCTTCTTGTTGGACAGG
GTGAATGTATCAGCGAAAGTGTTTACTCTGTACACCCACTTCTCACACAC
CCGGTGGGATTTCTTCAGCCACTGCGGATAAGAATGTGAGGATTTTTTTA
TCTGATTATTTTCAGTGGGGACAAAAATTGGAGGATAATTTTCCACCGGG
GACGATAATTTGGTAAATTTTCCAGTTCGAGGAGGTCCCAGTGGGTCTGT
GAGAAGGGGGCGTATTGAGGATAATTATGAGATTAGCATTTTTCAAACAT
CTGGGTGAATATGTGCCAGAGTTTCAATGATTATTAGAATATTCTTGATG
TTACTTTCGTTTTCCATGCATCTGTGACTTAACTTTAAGAAAGCGCAACC
AGGGTCTTGTTATATCGCTGTTCGGATGGACGTTGAAAAATGTTGTATGC
AAGCTTGGTAACTCTTATTACGCCTAATGCGCAGTAAACCTTTAATTTTT
ACACGCGCCAGTTAAGACCCAGATAACCTAGCTTAAGCACCGTGTTTTGT
TAAAGTTCATCTATCACCGCTCAGCGAAAGTTTTTGTCAGCCTTTCTACG
CTGATGAGCGTACAGTAAACCCTCGTTTATTCGAACTTCTATTATTCGAA
TCTTTCTATAATTCGAACCTTTCTATAATTCGAACTTTTTCTCACTTCCT
ATCAGGGAGAAATCCTCTTAAAATACTCTCTATAATTCGAATTTCTCTGT
TATTCGAACAAATAATATTCCTGGTTCGAGTTCGAATTACATAGAGTCGA
TTGTATTCAAAAGCTCAAATTGTCTCGAAAAAAAACGTTGTTACAAACGC
GCCGCCAGTGCAGTATCCCATCGTCTGAGAAAAAGTCAGATGGTGGCAGA
CATCAGACTGTGTTGCTGATGACCTTGTCTGCTAGTCTCTATTTCTTTTT
GTGTGTTTTTGTGTTTCTTTAGATTTTCTCAGGTGATAGCATAACCCTTT
TCAATTGAACGAGTTTTCCTGCCCTTTGTTTTACTAAGTTAAATGATTTT
AAATATGCCCAACTTTGAATAGCCTCTGGTAACCTGATCCTAGGCAGCAC
GAAAGCTGTAGGAAATTCAATTATTTGGCACCCGATGTAAAAATTTTCTT
CTGCTGACATTTTCTTGCTCGATAATTTAGGAAATTGTCTCATAGAGCTT
GTTGTTAGGCGACCTGTCAGTCCAGGCCACTACCGAAGTACTAGATAAGG
AAGTCACTGGTGACCTGAGCCCCATTAATCACGAAAGTTGTGGAAAATTC
AATGATTTGACAGACTATGTAGAAATCTTCTTCTGACGCCCTTCTAGCTC
TGAATGTTTGGAAAGTCTCATCTCTCAATTTCCCTTGTAACCTATCCACC
AATTTCTCCAGCATCAATCGTCTCTTATATAACTCATCGCGAGAATTTTC
TCGCTTTTGTTCAGACGTTCGCCCCTCCGCCACCGGAATAAAGTATCAGA
TAAAGAATATAACAGCCTTATAATTAGGCTGCTTGCATCCTCAAACGAAT
TCGTGCTTCTTAAACTACCTGCGGTTTTGTAGAGGTCTGCGATTCAGACT
ACCTTATAATTTGGGAAAAAGTAAGAATCACTGTAACATTTCACGTAAAA
GGAAATTTGAAAACAGCCGAACTTCAGACATAATTTAATGGTTATCGATC
CCGTACAAAGCCTTTGTTTTCCCATCAAACCTTTTCATATTTCTTTTATT
ATTCAATGGGCGTATTGGCTCCGCCTCAAATTGGATACGAAATGATTTTA
AATCTTTCCACTAAGTAAATCAAAACACTATAAATGTCCATTTTATCCAT
AAATCTACGAAGCCAAATGTTCAAATATGTTTGTTTGTTCATTCTCGACA
CTGACTCATCCTTTTATCAGGGAAAGTTGGGAAGTGAAAGAAATACTTGG
AAATGGAAATGGAACCAAGGGGCCATCCACATAGTACGTGCGCAGTGAAG
GGGGGAGAGGAACTTAGAAAAAGTGTACGCCTATTGTTTAAATGACGTCA
TTTCTATTGTTCTCTGAGTAGAAGGGGGAGGGGGTATCCAATATTTGGAA
AAATTTTGCGTACGTACTATATAGATGACACCGATATATTCACGATGATG
TGAATCGGCTTGGGGATACGAGACGATTTTTTTCTGTTTTACGATTTCTG
ATTTTTTGGCAGGCACACTTTTAATTGGGCCGTTGTTATAATTGCTTATA
CATAGCTAATTAAAGACACCCCTGTCTCACAGCCTCACATCCCTGGTGGA
ACTTTTTTCTACAGTGAGGATAAAAACTCCTATTGAAATCCCAATGGGGA
TAAAAATTCTATTGTTCCAAGGTTAACAAATCCAGTGGATCGTTTTGGAG
TGCAATTTTTAAACTTTGAATTTCTAATGGGGATAAAATCAAAATCAATA
TTACAGTGGGAAATTTCAGGGTATTTTCCCACCGGGTACCAAATTTCTAC
CAAATTTCCCATCCAGCGGGTCTGTGACACAGAGGTGTGTGAAGTTTTTG
AAAAAAGTCTCACTTAAAAATGTACATACGATTTTACTCCAGTGATTTCA
ATCACCCCTGGCTCAGTGATCCCAAAAAACTTGAGTTTTAAGTCTAAAAA
GGTTTTTAAAATGTTCTTCTTTTCTACATTTGTGAGTTTTTTCTGCAATT
TTATTAAAGATGGGATGTTTTAGAGTCAGCAAAGCCTTAAAATATTCTTA
ACTTGTTCTTGATATTTTGGCCATCGAAAGCTTTATACTGTACGCTCTTA
AATAAATTGTTCTTATAAAAAAAAACGTGTAAATACCAAAAGCGATATAG
AAAATCTTCTGTTTTTTTTAAAGGAAGGTAATTTCAACTTCTATTGTTTT
CAGCTCTAAATCTTATCGGGGATGTTCAAACCTGATATCAGCTGGTCATA
ATTTTCTTCCGGGCGCGGTAAACCTCTGAAGGCCCTTGAAAATTAACCAT
CAGAGGAAAATAGTCCTCCCGCGGAAAATTCTACAACAAGAATCCTGTTG
TGCGCTAGAGAGTCAAAAACTAGTATTTCCTGATGCAGCGCTCTATTCTC
AAACACAAACAGGCAACTTTGTTGTCATTCCCAGACCTACCAAGACGAGT
GCGGTCCTCACATATTCGAGACAGCATATTCGTCAGATTGTTATGTTTTC
ACCCATCCCTTTTTAGAGCTTCAGCGTGGTGTGCAGGAAACAATTACGAT
CTGATCTCAGGTTAGGATTTTCAAAACCTTTCCTAAATCTTAGTGTTTTA
TACTACCATAAACTAGATGTTCCTATTACAATATTTTTAGAGTAAGTTTC
TTGAGAAAGAACATTTTGAAAGATGACACTGTTCCAATTTTGTTTCAATG
AAGATTCTTCTTCATTTTTTTCAAACATGTTTCGTTTTAAACATTGTATT
TTTGAAGATTCGTATTTTATGGGTTTTTAAACTTAGAGGTATTATTTTTA
CGTAAGTGTTTCCGTTTCATATCAGACACATATTTCATACCAGGACAGTG
TCCTACTTATTGTTACATTATGCTGAACAAGCAAAAAAAAATGCTTTTCT
TTTCCTCTTTCTGACCAATCTTCCTCCACATCCTTGTCAATCCAATGTGA
AAAAGCTTGTAAATTTTGCCCTCGACTTTTTCGCATTTTCAGGGAGCCCA
AGAACTCCCTCAAGATTTTACACGTTTTTTTATAAGAACAAGCCCTCGGA
TGTTCTTAACTTTTTCAGTGTTAGGCCTAAAAATGTTTATAACATGTTCT
TATTTTCACCACTTTTTGAGTATTTGTGTCCATTTTCCTAAGAAAAAATT
TCCTAAGCCTTAAAATGTTCTAAACATTTTCTTAATATTTATGCCATCGA
AGCCTTGTGTTCTTATATAGTTTGTTCTTATAGAAAAACGTGTATCTCCT
CTAAAAAGAGACAATATGCAATTGTTGGAAGCGCCATACATAAAATCCAC
AAATCCCGCTCTCCTTTTCTCTCTGTTTTCCAAGAATGCTTTCTTTTCGA
AAAGATCACGATGTCTGGAAAAACGATCATGCTCTTTCCATTTTTCAAAA
ATCTTTTTTTCATATCTAATTATTTTCTTAACGAGGATATGCAACACCTG
GCTAAATATGTCGCTGTATACACCATTGAGTTTGAAGCTCCGAAGGGCTA
GAGATTAAAACTCTCGGATAGGAAATGAAGCGATGGGACCGTGCGGTCTT
CGCACACACGCTTAATTGGAGAATAATATTTGCCACTAGATTTCGCATAA
TCTGACATGTGAGAAACAAAAAAGGCGCAAGATCCAATCCGTCACGCATC
TGTCCCTTTCTCTTGCCTGTGAAAGTGTGAAAATTCGTTTCTAGCTTTTC
TTTGGTTTTATTTCATCGGATAGACAGGAGATCCGTCCTGTATTTTTATA
ATCTGATGTATACAGGACGGGTATGACCTGTGAGGCACTTATCTGCCTCA
AAAGTTTTACAGTGGGAAATTTCGGAAGTTGCGCTTTCTCTAAGAAAGTG
TGACCAGTAAAAGAATAACAAAATTTGATTGGCTATGTTTTCAACCGTTA
TTAGGACCCGGGGGGGGGGTACTAGGGTTGGTGAATGAGGGGTATGTGCG
GACGGGACCTCCGAAAACCGACCCTTAGAGAGACCAAATTTTAGTGAAAA
AGTGACCCTTAGAGAGACTTTTTTGTAATTTTTTCTCTCAAAATCAAAAT
TTTTTTCTAAAAATCGTGATTTTTCCCACCCTTAGAGAGACTACTTTGAA
ATTTCCTGATTTTTGTAACCCTTAGAGAGACTTTTTCGAAAATTTTTTTC
TGATTTTCAAAAATTTCCTACCCTTAGTGAGACTTTTTTGTAATTTTTTC
TCTCAAAATCAAAATTGTTTTCTAAAAATCGTAATTTTTCCCACCCTTAG
ATTAGAGAGACTACTTTGAAATTTCCTGATTTTTGTAACCCTTAGAGAGA
CTTTGAAAGGTGAAAAACCCGAACCTTACCGTCCGCACATACCCAGCACC
TATTTTTGCCTAAGTACCCACCCCTCTGGAAAATTCAAACTGTCAGCCCA
TATCATGCTATATATTTCGCCATCAGTATATAGAATAAGAAATCATACCA
TGGATCTCCAGGCTACTTAATTGGATAGCATAAAAAAGTTGGCTCGTTAT
TTGATTCGATTTGTTTGAAACAGTCTCAAATCAAGGATACACGTTTTTTT
ATAAGAACAAACTATATGAGAACATGAGGCTTCGATGACCAAAAAATCAA
GAACAAAATAACAACATTCCAAGGCTTTACTGGACTTACAGTATGGACAA
CCAATTTCTCAGCAAAAACATCCACAAATTGGTGAAAATAAGAACATGTT
AAGAACATTTTTAGGCTTTAAACTTAAAAAGTTAAGAACATTCAAAGGCA
TCGAAAATTTCGAACATTCTATTAAAAAAAGTGTAACATTCATTATACAA
TATCAAAATCCAATCACCAACAATCTGTTCAATTGGATTTTAATTGACCG
GGTGTGATTCCATTCTTCTTTTCAAAACAAATTGTTTTCGTTTCATTTCT
TTTTGTTTAGGAGTTGATTATCGATTTAACAGTTTTCTTTTCCACCTCCT
TCTCCTCTTCATCCATCAAGTCTCGGACATCGGTTTTCTTTGGAGGTGAC
AAAAGATTATTTAATTCTTATATTGGAACTGTTTTCGCACGATTTATAAT
GCCTTCCAAAAATTAGTTTCATCTTCCTTCTCAGTTTTAATGGAGACATT
TCTTCACACTTGGCTTTCTTACTTAGATTTTGAAATCCAGAGAAAACCAC
ATACTTTTGGTCAGATACAATGTTTTTTGCCATGATCGGCTTTTGTCATC
AGTTCTTATTACAGTATTCAGTGTTTGCGAGTTAATTATTCCGTACAAAC
CCGTACAAACCCGTACAAAGATATGGGATTAATAGTTCAGGGTTGAAACT
TTTTCTTCTAGCTCATGTCATTTGTCATTAGATTTGGAGCTGTCAATTCT
GATTTTTTTCACTGATTTTTTTGCTCTTCTTTACTTTCTCATCTCACCGG
CAGGATATCATGATAGCATCAAAATAGATTGCCTCAAATTTCCGGCTGAC
TAGGCGTGGCTATGGATTTTCGGATTTAATGATAGGATGACAATTTAAAT
TNTCTTCTAGCTCATGTCATTTGTCATTAGATTGGGAGCTGTCAATTCTG
ATTTTGTTCGCTGATTTTTTTGCTCTTCTTTACTTTCTCATCTCACCGGC
AGGATAGCATGATAGCATCAAAATACATTTCCTCAAATTTCCGGCTGACT
AGGCGTGGCTATGGATTTTCGGATTTAATGATAGGATGACAATTAAAATT
TTTAAAGTATTAGTAGATTTTAAATTGAGGCTCTCTCGACTTAGGTGTAA
CAGTAATAAAAACTCGAGTCGACTTTTCATTATGTTTCTCCTAAATATTC
TCATTAAAATTTAGTTACCGAAAAAAGTCATTTTATTCTTCGTCTAAAAT
AAATTGAATGAAACAATGATTATATGTTTTTGAAGATATCCAGTAACGAT
ATCCTAGTGGAAAGTTATTGACATATTTTTTAAAACCTAAGATTAGTATA
ATTTTGTCAAACCATTCAAGTCAAGTTGTTTTCAATAAGTACGTCTGTTA
AACCCATTCACAAATAACCTATAATTTGAAACTACTAATTCGTCTGAAAT
ATATGAAAGGCTGTCAGAAACAAAAACTTTGAAGCTTTATATCTTTTACA
AGATTTACAAAATCTTCTATTTTTTTCGTTTTTTTTTTAACTCTGGAGAA
GAAAGGATAGGACGTGCAAAGAAGTAAATGAAATTAAACCAACTTTACTT
TTTGTATCCCTGTTTAAGCTTTTTCAAGAGTATCTAAACCTTTTACAAGA
TACTCCATTTTTTGTAGTTGGATCAAGAAGATTTTTTCGTTCTTCCTTTT
GACAACAAATAAAAAAACATTTTCATTCCAAAATTGAGATATAGACGAGG
AGTTAAAATTTCTTCGACGAGCTTGATTGTAGAATCTTGTGTGTTTTACA
TGACATCTTTTAACCAATCCAATGCTTCATTTCTAGAGTCCATTCGCTTT
GAGTTTACACTCTTTTTTACAGCCATATGAAAACCATACCAGGCGTGATT
AAAATGATTCCCTTGTGAGTAGTTTCTACATGGTAGCAAGAAAGGGTGTA
AACTATAAGCAAATTACACCCCCATTCTCACAGGATTTTTTAGCCAGTGA
GGCTAAAAATAACGGACTGAAAGTCGATGGGGATTTATATTCCCATATTT
TTTAATGGCTGGGGATTTGAATTCCAATGTTTTCAAGTCAGAAAATTCAG
TGGAGATGGGAACAATAGCATCATATTTTACAGTGAGGATTGGTTTATTC
GGTTTTTTTTCAGTGGGGACAAAAATTGGAATATAATTTCATGTAATTTC
ATGTAATTTTCCACCGGGGACAATATTTGGGCCAATTTTACCAGTGGGAA
GGTAGGGGTCTCAGTGGGTCTGTGAGAAGGGGGTGTCGAATTATATCGTT
GAAAAGATAATTCCGAGAACTACAATCTCAGATAGATAATATTCTCTCTT
GCTAATCACTTTGATTTGTGTTGATGTTGAATCGATACGATATATTATTT
CCCCTCTAAATTGCCAACATATGTCAGAAATAGCATATACATCTCTCGAA
CTCGACCTAAGGGAAACTGATTTAAATTACGGATAGCATTTTTAACATTG
CTCTATGCTCTACTCGATTTACAGTACAACAGAGGGTTGTATTAGAGGGA
GTAGTCTTTTTATAAGAACTAACTATATAAGAACTTCGATGGGCTTCGAT
GACCAAAATGTTAAGAACAAGTTAAGAACATACGAAGGCTTCACAAATTT
TGGATATTCTTCTAAAAAAAACGTGTAGGAAGTCTCAGGAAGTGTAGAGT
AAAGAAGTAAACAGTAAAGAAGTCTGTTATTTAGACGTTGGAGTAGCTGA
CTTGGTGTTCTAATGGATTTCTTCGAGTTTTGTGATTATGCTTCATAAAA
TAAAAAACTTTATATAAGAACAATTTTATAAGAACACAAGGCTGAAAATT
GGCCAAAAACTAAGAACCCTGAGCCTCAGATTTCAGAAATTATTAGGAAA
GTTTTTAAATTTTTAAGTTAAGAAACGTAGTGTATCAAAATTTCAAAACA
ATTAAGAACAGCCCAGTCTGAGCCAAAATTAAATGGTTCTTAAATCAAAA
AGCGTATACACGTTTTTTATAAGAACAGACTTTATAAGAACATAAGGCTT
CGATGGCCAAAATGTTAAGAACAAGTTAAGAACATTATAAGGCGTTTTGG
ACCTTTAGACAAAAATACTCTCAAAATGGGGAAAATAAGAACATGTTTAG
AACATTTTTAGGCTTAAAACTCGAAACAATTAAGAACATCCGAAGGCTTC
AAAGTTAACTGGTTCTTATAAAAAAAGCGTGTATTATGTATGGAAGGGAT
TGTAAGGCTCTGTTTACACGTCCATGTACACTTAGATATACTATGTAGTA
AAGAAGAGATGGATAAATTGAAGATTACGATGAAAAGTAAATAGTTGAAA
TAGAATGATAGTAGGGAGGGAGGCTGGTACCGAGTAAAGAGAAATAACAA
TAAAGAAATAAAAAAACCCACCTGGATTTTAATTCTTTTTTTATTAAATG
TTTATAACTTTGTTTTATTGTTTCGCGCTCTTTTTGAAAAAAATGACGTT
TTCTGATTGGTTGTAAGGGGTAGAAGATTTGTCTTGCAGAGTCAACTATA
TTCTTTTCTTTCTNTTGAAGATTACGATGAAAAGTAAATAGTTGAAATAG
AAGGGAGGGAGGCTGGTACCGAGTAAAGAGAAATAACAATAAAGAAATAA
AAAAAACCCACCTGGATTTTAATTCTTTTTTTATTAAATGTTTATAACTT
TGTTTTATTGTTTCGCGCTCTTTTTGAAAGAAAATGACGTTTTCTGATTG
GTTGTAAGGGGTAGAAGATTTGTCTTGCAGAGTCAACTATCCTCTTTTCT
TTTCTTTTTTTTATTGATTATTTTTTGATACACGATACAAAAAAAACGTA
AGGATGGGAAAAAAAAGTCATTTTCTTGTGTGTGCATGCGTTATCGTGAA
AAATTTTGTGTTTCTGTTTTTGTGTGTGAGTTTGTGTTTTTTGAGGTATA
GATATATCTTGGAAAGTGAATTTCCATACTTCCACTACAGAGGGTTGCTC
TCAAAAATAGCAAAAAGAATTTTGCCGAATTTGGGAAATTAAATTATTCT
GTCGGCATTTTGTTGCGTTAAAGAAAAAGCGATTTAATTTTCAGCGAACA
ATATTTTTAACATTGCATTGATCATTCCATTGTTCCATGAGGCGGCATTT
TTTTTACAAGGGCATTACACGCGCGTTGGGATTTGTTTTCCTTAATTAGC
CGTTAATTCGTTTTACTTTTAATTAAATACAAAGCAGTAATCATTGGTTT
AAGTGAATTAACATACCAATTATAGTGCTCTAATCTTTCTGTCTGGTAAC
ATTGGTTCCTTATTCATCTGCAGATTGTAGGTGGATAGCTTCTGAGAGTA
GTTTGTACGGAGTTATTTTTCGCAATTTTTTGAGCATTTTTGTCCATTTT
CTTAAGAAATCGGGTGTTTTTAGAGTCTGCGAAGCCTTAAAATGTTCTTA
ACTTGTTCTTAACATTCTAGCCATCGAAGCCTATATTCTTATAAAAGAAC
GTGTAGATGGATGTCTTCTAAGAGTATTTTCTACGGAGTTTATTTTCGTC
GATGATAGATCTTCTGCAGTGCTGCACCTCGAGAAACTTTACATTGCACT
CTTTCCAATGAATTTAAAGCTTTTCAAAGCCATTGATACTCTACTGCTAA
TACGGTAGACTCCTTTTTGATGCTTACTTTTTTTCTTTTTCATTCAAGAT
TATTTTTCCAGCAAAATTCCCTTTACCGTACGGAGATTTCTGTGGATAAA
ACAGGCAACGTTAAACACACCGTAGAAATCAAATCAACATTCATACACAC
ACCCATGTCATCATTTTATTGATCCCGGTTTCTTCTTTCTCGTTCCTGAT
CGATCTCTGGATTAATCGTTTTTTAAATTGGTTTTAATGGGCATTGTTGA
CACACTTTGAGTATAATTTGAAAGACAAGAGAGGTTTTAACTCAATTAAC
CCATATATCATCAGATTGTACAAAGATTTAAAGAGATATTTTTAAATGGT
ATTATAAGAATAAACGAATGATGTGCATAATTTACACGCTATGGATTTCA
TTAACTTTTTTATTATTGAGTATGGTTCGTTGTTCCTTGGTTACAATGCG
CGGTGGAGAATACATTGTGAAAGACTTACGTGGGGAAAAAATCCACTCCG
AAACTTTACATGTGGTTTTTCAATTTAAAACTATCGATCCATCAAGTTTG
TTATTGTTTTCAGTCAATCATCAACTTGGCGATTTTATTAGTTTGGAATT
GATCGGTGGAAAGTTGAGGTAATTATCTTTCTTTTCTTTTCTAATTATTT
TTTTCTTTGCAAAGTTTGGGTCAGGAAATTTCACCGAGGGGATTATTACT
AGGGGAAATCTTTGCTCAGGATAATCAGATTGGGAAATTTACCTAGGTGA
AAAATCCAGAAATTGAAATTCACCTAGGTGAAAAATCCAAAAATTGGAAT
TTACCTAAGTGAAAAATCCAGAAATTGAAATTTACCTAGGTGTAAAATCC
AGATTTGGAAATCCACCTAGCTAGGGGAAATTCCAGACTTGGAAATTTAC
CTAGGTGGAAATCCAGATTTGGAAAATCACCACCAAACTTCACAATTGGA
AATTTGCCCGGCGAAAAACCACTTTACAAAACGTATTTACCCTGGCAATT
TTCACATTGAAGAAAATTAAATTAAAATTCATTTTGCGAGATTCCCCTGG
TGGAAAAATGACTTGGAAATCTTATGCACCTATAATCTATATTCAGCTTG
ATTTTGGAGGCGGTTAGTGAGCTTAAAACTGATAGTCTTGAAAATCTTTC
CTCTGTCAGAAAGAATTGTGAATAATTCATACTCGGTATTTTAAAGAGAA
CCCTAGGATGAATAGCCCCTTGTTAAAAGATATTTTGTATCAGATACGTG
ATTTACAATAAAATGTTTTAATAGCCAAAATTCTTATGTAAAACTGAGTT
CAATTTTATCCCTGCTGAGATCGGTGTCTTTCTATCCATATATCGAAATT
CTGATTAATTTCTCATATCTTTTTCCCTGTAATTTTATTTTTCGCTTTCT
TCAAAGAGTCGAGTTTTTTCTTTTTCTTGTTCCCTCCTTGAAATTAAAGC
TATGCTTGCAATCAAATTATAGATACTAAAATTTTTTTATAAAATCCCTT
TTTTTTTAATTCTACCGATTTTTTATATATTAAATTTCTATTTTGATGCT
CCTATCATGTCGAGTTTGATATAAAAGGTATATGCGGTGCTTAAGAGGAG
GAAAGCGTAGAACAAAACAGAATTAATTTCCAATAAAAATAATTTCTATT
ATTTTTGTTTGACGTAGTATTTCACCTCTTAAAAATCCTGGACCTCGATT
TTTTTGAAAACATTTTCAAGTATTTTCTGCGTGTGTGACAATCTTGAAGT
ATTAGCGCAGCTGAGTTATCAAGTAGATGGCAAACTTTTTCTACCCTTCC
CTTTTACAAGAGGAGGCTACTCAAAAAAAGCTCAAATATAACCAATTCAC
GAAAAAAAAAATTTATTGTATTTGAACGTGAACGCAATGTTAGTTCAACA
AAATTATTTTTTTTTTGTATTTGTTCAAAAATAAATTTTGGAAACTTGCC
ATTGTGAAAATATTGTGATTTTTTCATTACACCGTGTGTATGTATATGTG
TTAATCAAATCCCAAAAAGGGCGAGAATTTGCAAAAAAATTTGATCACTG
ATGGTAAAAACTTTGGATAATAAAACCACTAATCAACAAGACATTCCTTT
CTAAAAAAACATCAGGGAAAAATATTTCCCAGCCGGTAAAAAGAAAAATC
ACACTTTAAAACAAAACCTCCTTATCCGAAAAATGACCTGGGATAAAGTT
TTTTTTCTCCAATTTTCCAATTAAAATAAGCTACAATTCATTTTTTCCCG
AAACGAGGTGTAAAACTTTTATTAAATTTTCCTGATTTACTAAACAGCAT
ACTTATATCCCAGCCGCCTGAAAATCTTTTTGCTTTTTTAAAAAGAGTAA
ATTCCGTTTGCAGCACCTTGCGAATGACGAATACAAGATTTCGTTTTTTC
CCTTTTAAAAGAAATATGCGGTCAAATGTTTATAAATTGATAGCAAAAGA
ACACAGTGCCTTTTCCAGCTTTTACTTTCCTCTTCGAAGCGTCCGTCTGC
CGCAGCCAGCTGTCTCGGCTTTACAACTGCATTAGTACCTAGACACTGAT
TAGTTACAATAGCGGTACACGAATTTCGAAATGAATGTTCGATCGCCTTT
TCCTTGTTCGTTGTTCGCTTTAGTATCTTTTTCCATCGTCCTGTGGGAAC
ACAAGTTCTTATACAGAAAATATTTTGAAAATACATTACAACGAGTAGAG
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ATACGTGTTCGAGAAAAAAACTAAAACATATATGAAAAACCCCTCATATT
TTATGCTAGGTAGTTCTTTATTGTTATCTTTCCAACGCTATCGCATGCAT
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AGGATATAACATTTTTTGGAAAATTACCTCCCGGGCATTGTGACTTTTGA
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CTTTCCTAGGGAAATGTTTTATTTTGAATATTTCCAATATAATTTTAAGT
CAAATCTTCATAATAACTCGATTTTAGAGTGTGATTTGGGTTTCAATCAA
AATAACCGACATACGGTTAATTTTGAACGTTTCTGTCAAAGTTTTCTTCA
AAGGGGAGGCGGGGGAAAGTATAGAAAAAGTGTTTCACTCGAACATAAAA
CACGGGATCTCCTGATAAAACGGGGCCAGCTTTTCAAATTCCTTTTTCAA
TTTTAGCTCATGAAAAACAAAAAATTCTTAATGTCATTAAAAAATATCGT
ACTGTACAGATTGAAAAAGAATAGAAAGATAAAAATCAAGAAAAGTCATT
CAGGAAAAACTTAAGGGATTTTTTTTTGTATTTCTCTGATAGTTTAGTAT
TATAGGGTTATGCAAAAGATGAATGCGATTTTCGTTTTCAATGTTTGAAA
GAGTCGAAAAGCGATTAGCTCTCCTCGTGTCTCTTAATCCATCCGTTTTT
CTTCTTTTCTCCTTTTCGACGTCAAAAAACAAACGTCTTAAATTGATTCC
TTATAAAACCTTCACTAGCTTATGGCCTCTTCTAAATAGCAAAATATTCA
AATTTCCTCATAAAATGTATCTTAAGCAATGCTTTTTTCACTCAACTCTA
AGCTTGCATTAATGCGTGAAGGATCTTGACAATCCTTGAGTACTAATTGC
CTCAATTTTTCCCGAATTCAATTTCAAAATTGCAATATCTCCCCAATTTT
GAGAAATTATATTTCAAACCATTCTCAGTAAATTAATATAACCCAGCTGG
CACACACCGTTGTTTCAACGTTCATCTAACGTTATATGGACGTTGTGAAC
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ATGACAATTTTGTGTGAACCCACGTTGAAAATATGCAAATTGAATTATGT
ATGCTTAAGGAGGGAAATCTCTAATCTGTTTAAGAAGAAGGGCAATATTC
ATGATTAATATCTGTGGTCGCATGCCCAAACTTTCCGATATTGTAGTAGT
TTGTGGATTCCAACACACTAGCAATGTGGAGATGGATTTCTCCCAATTCA
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GGCAATCGAGTCCTCTGGTTCCACATGGACCCGTAGCTTAATGGTAGAGC
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GGTTTTCCAACGGTTTTGGTGGCTGGTCAAGAAGACAACATGAGAGCGAT
TGTATTCACTTCATTGTAATACATAAGGGCAATATTCATGATCTAATCTC
TTTAATAATAATGGCTTTGTAATAAAAAGCTACAATTCTTTTTGAATACA
CTCATTACTGCTTTTCAGCGTGAATTAAATCTGGGGGGGGGCTAACTATG
CCAAATGGCTGCCGGGTATGTGTGAGCCATATAGGTCCCTTTTTCACACT
CAAAAATACGAAAGTAAAAAATCAACTCCCAGTGTCATAAGTTCTTGACA
TTTGGACTAAAATTTAAAAATTTTCGAACTTTGGTTCGTACATACCCGTT
ATCTCGCAAACTTCGTAGTCCCCGGATATTTAATCTAATGGTTTGGGTGA
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AATGAAAACATCCACCTCAACCCTTTTTCATCTTCTTCTATTAGATACAA
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GTGACGCCCTTCTTAACGATTACCAATGGCACGTGGTGGACCTGAAACTC
AACAAACGTACAGTGACCATCGAGCTGGATTATCAGCCCCACACCAAAAC
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GACCTTCAAGTTCCGCACGCTGATCGGATCCGGACTTCTATTTTCCAAAG
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TCAGCCGGTGTTCTTCGAAAATGTGAATTGAAAGACTATTGTTTGTTTCA
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TTATTGTACAATCGATCCGGACGGAGATCAAGCTCAAATTAAACCTTTCC
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
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The following features are aligned
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BLAST of TCONS_00007483 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: CNTP2 (Contactin-associated protein-like 2 OS=Homo sapiens GN=CNTNAP2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 250.751 bits (639), Expect = 2.214e-68 Identity = 187/631 (29.64%), Postives = 300/631 (47.54%), Query Frame = 1
Query: 481 LRGEKIHSETLHVVFQFKTIDPSSLLLFSVNHQLGDFISLELIGGKLRYKGRLGDEDKG---AQEMIVGGDALLNDYQWHVVDLKLNKRTVTIELDYQPHTKTFEGAYEVLDLDGDVYLGGVSSTLDVSQYGITVRRYSGCLRXXXXXXXXXLYKTKYSKPTYSSYGDLLWNKCENIDYQPIMFKSPQEYALVPTYLKHSL-SLTFKFRTLIGSGLL-FSKVSKAV-TATLYLKETKLFLSVRIGEGN-GPIIMTQGADLDDGFWHRVEISITTKHIMLKLD--QLSELKHHSPFSHLVSFHKSNGTLGGGEEHIMKGFV----------------GCMYNIWMDNTLIDYRKL---HPVYSAGV-LRKCELKDYCLFQPCRNGGRCTQNHKSYKCDCINTMYSGPTCEESVFQRSCQEYKELGLHEDAYCTIDPDGDQAQIKPFRVLCNMTRYSHKAVTIFEHQLPTDEIQISKGVIEGQSYHHNID---YAIDLDTFDYLLQHATHCQQHVNFKCKNARLMNSPLGPAETVWIGRQGHDEQYWGGAKPDSGSCACRYDKSCAKPYRYCNCDVGDDVWRSDAGYLNQTDRLPVVMMSFKLTANQ---SFFSVGHLECQ-----FNATAIP 2253
R +K+ + + FKT + ++L Q GD+I+LEL KL LG G ++ G +LL+D+ WH V ++ R++ + LD G ++ LDLD ++ GG+ + S + + + GC+ + +N + + K S+ G+L ++ E Y +F + Y VP L L S++F+FRT +GLL FS + + + L E+K+ + + I + I ++ G+ L+DG WH V +L +D + S ++ +SP + GE++ GF+ GCM I +D+ L++ ++ P A V + C + D C+ C +GG+C+Q S+KC C T YSG TC S+++ SC+ YK LG + Y IDPDG + P +V CNMT K TI H L Q+ V+ +++ Y+ +D + A +C+Q+V++ CK +RL+N+P G T W+G+ YWGG+ P CAC +++C P YCNCD WR DAG+L+ D LPV + T Q + SVG L CQ +NA + P
Sbjct: 200 FRNKKMKTLKDVIALNFKTSESEGVILHGEGQQ-GDYITLELKKAKLVLSLNLGSNQLGPIYGHTSVMTG-SLLDDHHWHSVVIERQGRSINLTLDRSMQHFRTNGEFDYLDLDYEITFGGIPFSGKPSSS--SRKNFKGCMESINYNGVNITDLARRKKLEPSNVGNLSFSCVE--PYTVPVFFNATSYLEVPGRLNQDLFSVSFQFRTWNPNGLLVFSHFADNLGNVEIDLTESKVGVHINITQTKMSQIDISSGSGLNDGQWHEVRFLAKENFAILTIDGDEASAVRTNSPLQ-----------VKTGEKYFFGGFLNQMNNSSHSVLQPSFQGCMQLIQVDDQLVNLYEVAQRKPGSFANVSIDMCAIIDRCVPNHCEHGGKCSQTWDSFKCTCDETGYSGATCHNSIYEPSCEAYKHLGQTSNYYW-IDPDG-SGPLGPLKVYCNMTE--DKVWTIVSHDL-----QMQTPVVGYNPEKYSVTQLVYSASMDQISAITDSAEYCEQYVSYFCKMSRLLNTPDGSPYTWWVGKANEKHYYWGGSGPGIQKCACGIERNCTDPKYYCNCDADYKQWRKDAGFLSYKDHLPVSQVVVGDTDRQGSEAKLSVGPLRCQGDRNYWNAASFP 804 HSP 2 Score: 84.7297 bits (208), Expect = 1.967e-16 Identity = 56/210 (26.67%), Postives = 92/210 (43.81%), Query Frame = 1
Query: 1006 YQPIMFKSPQEYALVPTYL-KHSLSLTFKFRTLIGSGLLFSKVSKAVTATLYLKE-TKLFLSVRIGEGNGPIIMTQGADLDDGFWHRVEISITTKHIMLKLDQLSELKHHSPFSHLVSFHKSNGTLGGGEEHIMKGFVGCMYNIWMDNTLIDYRKLHPVYSAGVLRKCELKDYCLFQPCRNGGRCTQNHKSYKCDCINTMYSGPTCEESV 1629
+ F +P Y T+ + S ++F F+TL G+ + K L LK T++ S +G G I++ L+D WHRV K L++D+L + +P + GG +GF+GC+ ++ M+ +D + V ++G + C C NGG+C + + Y CDC NT Y G C + V
Sbjct: 798 WNAASFPNPSSYLHFSTFQGETSADISFYFKTLTPWGVFLENMGKEDFIKLELKSATEVSFSFDVGNGPVEIVVRSPTPLNDDQWHRVTAERNVKQASLQVDRLPQQIRKAPTEGHTRLELYSQLFVGGAGG-QQGFLGCIRSLRMNGVTLDLEERAKV-TSGFISGCSGHCTSYGTNCENGGKCLERYHGYSCDCSNTAYDGTFCNKDV 1005
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