TCONS_00006967 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00006967
Unique Name	TCONS_00006967
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2069

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
protein sequence
transcript from alignment at sc0000072:632061..639689-
coding sequence from alignment at sc0000072:632061..639689-

transcript sequence

>TCONS_00006967 ID=TCONS_00006967|Name=TCONS_00006967|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2069bp
ATTGAGTTTTATAAGGgcattttaataactttttttttattttactactt
tgatttgatttgatctGACAGAAATAAATAAAGTTCGAAGGCAATCAAAT
GCTGGGGATACATATATATTGATCAACCCAAACAAAAAAATTGAACACTG
TACATCACAATCATGTTGGAAGAAGTACTAACAATCCTACTTCTGTCCGT
CCATGCAGCTTCATCCACTAGTTGCCAGGAAAAAGTCTACGGTGGAGTTT
CTGGTACAATTCACGGTGGTGATCACGCCCCTATCCCGCCCAACGATTTT
TGCACTAAAGAAGTTATAAGGGTGGTATTTGGGCGGACCATGGCGgtcaa
attgaattttgaaagtttcgATATAGCAGGAGACATGCCTTATTGCATTT
CAGGAAATATGAAAATTGTTGCCGGttGCTCAGAATATGACACAGAAATC
GCCGAATTCTGCTCAGgAAACATGCGTTCCTCGCTACCCCACGATGTATA
CGCATACACCAGTTGCTTGACAATaacattaaatttcaaaaatgggaATT
TGGGTAATCGAGGTGGATTTCGTGGTTATTTCAGTGAATATTCTGCTGGA
GGCTTGGATTCTTGTAAATACACTGGTACAGGACCGCCGTTGACATCATA
CACAGGGGTGATTGCAACTCCGGATTGGCCAGCTTTGTCTTTACTGGACA
AATGTAATTGGGAGTTGGGTGGTGGCTCAGATGATGGGTATTTGATTCAC
ATCATGGATTTAAGAGACACTTCTTCACGTTTATGCTGGAAAGGGGAAGT
TCAAAAGATCACCATAAGAGatgaaAAAGAGCATACAGCTGGATCGTATT
ATTGTAATCGGAATACGCGCGTTGAATATTATAAACCAAGAATTCAATTG
GGATATCAAAAGAATTCAAACTGGAATAATCGTGGTTTTGTAGTCGGTTG
GGTTGCTTTTAGAGACCCATACCATGACTCGAGTGGCTCTAGTGGCTCTA
GTGTTGGCGGCACCATCACAATCGTCATAGTTGTCATCTTCGTGGTCGTC
TTTGCTGTAATCGCCGCTATTCGTCGCCGACGCGGCTATATCTTCAGTCA
AGGACGTCCTGTAGTAATGACCCCAACCGGCGTCACAGCGCCACCCACTA
CAGGTCCACCTGCTGTTGTAACTTATAGTAACACTACGAAACCAGGAGAC
GAGACAAAAAATTATCCAACACAGCAATTCGTTCCACCACCCTCTGGCGC
TCAACCGCCCTCTCAGTATCCGCCACCCGCTCAATATCCTCCACCCATCG
CCCAAGGTGCTTATCCTCCTACCGCTCAATATCCACCTCCACAAGGAGGC
TACCCGCCACCACCTCAGGGCGCTTATCCACCACCGCCCTCGTATGAAGT
CACTCAAAACCAAAATTCGATGTAAAAGAAAAGTCAAACCTAGTAATAGT
TTTAGATGAGCTTAGAAATGCTATGAATGGAATCGAAGGTATATATTCTT
TTTCAACTaacaaacattgaaatttaATACTCAGAAGAGACGAGAGCAAG
CCAACAAACGACTGTTTACTTACAAAACTAATGGACATCACTGACCCTGA
CATCTTTTACTAACCAAACTACTAAGCTTGCTACCGAAAGAacctttttt
aatgaaatttacgACCGCGAATTAACAAACATTAGTACCGACGTACTCCG
AAAGTACCGTACGCTCCTccgaaaatccaaaaaaggggtgtttattcgaa
gtaatacgataCTAAACCTATTTACAAACAACTATATTATAATATTTTAC
TGACTAACTGTAGATTATTTAACTGACTAATAAGTACTGACATGCTGACA
TAAATTGACATTGTAATGGTATAAATTCTTCGTTTcagtaaaggcttggg
gacacgagaagtttttttcgcgttgatgcaatgcaacatgttctatccca
ccaacacaagaaaaaaagtgtgtgtctcatggtttcttttttgtttcatg
ggacaaaaagtgagggaaatacccaaaagctacgctgattttgtccctgg
gacaatggagcaaaattga

Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00006967-protein

>TCONS_00006967-protein ID=TCONS_00006967-protein|Name=TCONS_00006967-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=420bp
MLEEVLTILLLSVHAASSTSCQEKVYGGVSGTIHGGDHAPIPPNDFCTKE
VIRVVFGRTMAVKLNFESFDIAGDMPYCISGNMKIVAGCSEYDTEIAEFC
SGNMRSSLPHDVYAYTSCLTITLNFKNGNLGNRGGFRGYFSEYSAGGLDS
CKYTGTGPPLTSYTGVIATPDWPALSLLDKCNWELGGGSDDGYLIHIMDL
RDTSSRLCWKGEVQKITIRDEKEHTAGSYYCNRNTRVEYYKPRIQLGYQK
NSNWNNRGFVVGWVAFRDPYHDSSGSSGSSVGGTITIVIVVIFVVVFAVI
AAIRRRRGYIFSQGRPVVMTPTGVTAPPTTGPPAVVTYSNTTKPGDETKN
YPTQQFVPPPSGAQPPSQYPPPAQYPPPIAQGAYPPTAQYPPPQGGYPPP
PQGAYPPPPSYEVTQNQNSM

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000072:632061..639689-

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00006967 ID=TCONS_00006967|Name=TCONS_00006967|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=7629bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000072:632061..639689- (Clytia hemisphaerica)
ATTGAGTTTTATAAGGGCATTTTAATAACTTTTTTTTTATTTTACTACTT
TGATTTGATTTGATCTGACAGAAATAAATAAAGTTCGAAGGCAATCAAAT
GCTGGGGATACATATATATTGATCAACCCAAACAAAAAAGCAAGTTCAAA
TCGAAAACTCCTTGAAAGGAAAGGATACTTTACTGTGGATTTTGATTCAG
AGATTCCTCTTTGGTTGTATATGGTTATTATGCCAGAAACCTTCATTTGA
GCATTCCCTAACTGTTTCATTTACTCATTGTGGAACATGCCAGGCGTTCC
TTAACATTTTCATTAACTTGATGGTACAGGCTATGCCTTCCCTAACTCTT
TCATTTACTAAGTGTTTTACATGCTAGGCATTTCAAAACTCTTGCATTTA
CTCAGGCTAGTATGGGATAGGCCTTCTTTAACTTTTCATTAGCGAGTTTA
TGTATTCGAGATAAATCGAAGGGGGCGGTATAAAGCAAAGCTGACAGGGC
CTAAATCGCCGTCCGCTTTGCTTGACGACCGTAAAAACACCAAGATACCG
TCGTTTGTTTAGGTGATCAAATGCGATATAGAGCCGTACATCAACTTTTG
TTTTGTATCGATTTCACTTACCGTCGCCCTCGATATCCTCCGACACATAA
ACTCGGTATTAACTCAGTTGCTTGATTTTTCGCAACTCTTTTTTTCATTC
TTTAGATTAAACACTGTGCATTACAATCATGTTGAAAGAAGAAAATTCTC
GTTTTACGAAACTCTTTTTTTAACCTTTAGATTGAACACTGTACATCACA
ATCATGTTGGAAGAAGTACTAACAATCCTACTTCTGTCCGTCCATGCAGC
TTCATCCACTAGTTGCCAGGAAAAAGTCTACGGTGGAGTTTCTGGTACAA
TTCACGGTGGTGATCACGCCCCTATCCCGCCCAACGATTTTTGCACTAAA
GAAGTTATAAGGGTGGTATTTGGGCGGACCATGGCGGTCAAATTGAATTT
TGAAAGTTTCGATATAGCAGGAGACATGCCTTATTGCATTTCAGGAAATA
TGAAAATTGTTGCCGGGTATGTTTGTCTATTCTGTTTGAAATGTCGAGTC
TATATCTAAGAATTACTTTCATGGAATGTGTCTTTTGATTTAAAAACATA
TCCTTAACTCTTTGTTTTGTTGAGCTCTCACCTAGAATTAAATTGACCAT
GTCTTGGTTGAAATGTATCATAATCAGCATTGTTTGCGCTATGTACATCT
TCCATTTGGTCAAATTTAAATGTTCAAGATTTTTGAACGTTGAAAAGAGT
TCATCATCATACATGACTCAGGTCGGCCTATTGTAATGTCCATAAAAATT
CTATACTAACTAACTATCACAGTTTTATCTAAAATTATTATTTATTATGG
TTATCTTTTTGGACCTACCCCGGTGGGGTGGAGGTCCTATAAATTAACCT
TTGTCTGTTCGTTCGTCCGTTCGTTCGTTATTAGCTTTCCTCTTGATTGG
CTCATAAGTTTTTTCTGATTTTTTGCACAAAGATGTATAACTATAAACCC
TCGAATGTGGGCAAATTTGGGCCAAAAAACGGCTAAAAAACGGATTTTTT
GGACTTTGTGAAAAATTGGATCATTAACTTTTTCTGATTTTTTGCATGAA
AGTAGGCTACCATCATATGTAACAGATGGCTCAAGCAGATTTTTTCAAAA
AATTTTATTGGCTCAAAAAACGCATGTTTATCTATAAGAATCAGTATTAA
TAAGCATACATCAATGTTCTTTGCCAAATTACTAAATTTTTTGATGAGAT
AGATGTATTTTTTGCTCACAAAGTCTTGAATATGAAAGAATATTTCAAGA
GCATGAAATTTTGGTTTCTAAACGTTTTTTTATAAGAAACAAACGACTGA
TTTTAATAGATCGTCACTATTTGTGTTCTGAATGATTTTTTAATGGTCAC
GCTCACGTAGATATCAATTATGTATGTGTTAAATGCATAACCAGGTAGGT
CCATAAAAGTATCACTTGTTTTTATGGTTTTCACTTTTCTTTTTCGAATA
AAAAACTAACTTTTATACTGATTTTTCTTTTTCATTTAGTTGCTCAGAAT
ATGACACAGAAATCGCCGAATTCTGCTCAGGTAAGACATCATATTGTAAT
TCATGGGCGAACTGATGCGTGAAGAGTCCAGAATGTTTTTGGTAGCGTTT
GTAATTAAAATGATACAATCTAGACAAAAGCCTACTTCTGGCTGAATTCT
ATATCAATTCAGTGAACATCAATTCAGTCTACACTAGGAATGTCATTGGG
CCATATCATTTTATATCAATTCAGGGGGTGGGCGAACATTTTTCAGAGGG
TAATCCTAGAAAAATTTCCAGGTGGTTTATGATCATTGTTCCGAATGTAC
CCCATTTTCACACATTTTCAATGATTTCTTTTTGACTTGAAAAGTTTCGT
CCACCCCCTGTATGGTTTTTTAATGGAACATTTTTAAAAGAAAAACACTA
AAATAACAAATAAAAAGTAACTTAAAGTTAAGAAAAATATAATTAAGAGT
GAGAAACAAACACAACAGCATCGCAATACCTTATTTTTTTATAAGAACAT
AACGCTTCGATGGCAAAAATGTCAAGAACAAGTTAAGAACATTTTAAGGC
TCTGCGGACTCCGAAAACATTCAAAAAGGCGAAAATAAGAACATGTTTTA
AGAACATTTTTAGGCTTGAAACTCAAAAAGTTAAGAACATCCGAAGGCTT
CAAAAATGTTAAATGTTCTAATAAAAAAAACGCGTGCCTTATTTTCAAAT
ATAAAAAACCCCAGCCACCTTAATCGCGCCATCCAGTCTATCAAAATGCT
CAGTGAGCCCTGAGCTAGGTATATCCGGGCAGAAAGTTAAAAATCGACTA
TGATTGATACGTTATATTATTTTAACAACCAGCTAGTCAAAATACAGCAC
AGTTGACGAGGCCCCCAAGCGGTTTTTTGTGATTGCGTGATATGAACTTT
TTTCTAGCGTGATTACGTGATTTGAAATTATTTCTTTTCATGATCAGAGA
TCGTGATTTGAAAGATTTTTGAGCCGTGATGCGTGATTTGGACTTTTTCA
AAGGGAGGTGTGATTATCCAAAATTTTTTACTGAATTTTGTCTTTTTTGT
CGTTTTTGTCTCCGCTGCAGAATATAGATTAAAGTACACCTCCTTCTCAA
TGGGACCCCTTCCTACTGGAAAAATTGTCTATCGTCCCCGGTGGAAAATT
ATCGTCCAATTTCTATCTCCATTGAAAATGATAAAAAAAACAATCCTCAC
TGCAAAATACTTACTACTTTTAACCATCCCCGCTGAATTTTCTGACTTGA
AAACCAAAGAATCCCCAGCCATAAAAAAAATGGCAATATCAATCCTCATC
GAGTTTCAGCGGTCCGTTATTTTTATCCCCACTGGCTGAAAAAATCCTAC
CGGGTCTGTGAGAAGGGGGTGTAGTTTTGAGACAGGCTTTATTTTTTATC
ATTTAGGAAACATGCGTTCCTCGCTACCCCACGATGTATACGCATACACC
AGTTGCTTGACAATAACATTAAATTTCAAAAATGGGAATTTGGGTAATCG
AGGTGGATTTCGTGGTTATTTCAGTGAATATTCTGCTGGAGGCTTGGATT
CTTGTAAATACACTGGTACAGGACCGTAAGTTTTTTATATAAAACACTAT
TAAATACGTTTGTGTAAGTGAGGTCATAGTTTAATCCCCTAGCCTTAGAA
GGGGTCTGAGATTTTAAACCTTGGGTTCTTGTGAACACACCGGTATAGGG
TCTGAGATTTTAAACATTTTTGTAAGAGGGGGGTTGAAATTTATGGGGGG
GGGGTAATTCTACTGATTAAAAATAGGTAAAGTTTTAATCTTGATGAAAT
GAAGTTGGCAAAAGCTACTATGGAGGTTTTCCTACATAGAGGGGTATTGA
CCCCTTAACTTATGGAGACTTATCGTCTAATTCTTTGTGAATATTCAGCT
TAAATCTTGGATTCTTGTAAATATACTGATACTGGACCGCAATTTTTACT
AGGCACTGTAAAATACGTAGGCTATTCACGTAGAATATCAGATTTTGTAT
TTAATTTTTGTCTGTTTATGGTTTAATATTGATGGTCAAGTCCGGTCTTT
TTAAGAATTTTATATAAAGTGTCACAAATTTGAACCTAAAGTTCACTTTT
AAGGGCAGTGTTGCGAGACCTTTTTTAATTTTCTCACATGTATTCTCAAA
AATACAAGTCGCGCGAAAATAAATGGGATTAAGGCTTGTACTAGGCTATA
CTAGATGTCACCCGCGTTGTTTCTACGCAATGAAACGGGATGAGAAATCG
CGGTTTTTAGGGAGGTGCTCCCTAGGGTTGTACAGAATTTTTCAAAAATT
TCAACTTTTTTTCCAGGCCGTTGACATCATACACAGGGGTGATTGCAACT
CCGGATTGGCCAGCTTTGTCTTTACTGGACAAATGTAATTGGGAGTTGGG
TGGTGGCTCAGATGATGGGTATTTGATTCACATCATGGATTTAAGAGACA
CTTCTTCACGTTTATGCTGGAAAGGGGAAGTTCAAAAGATCACCATAAGA
GGTAATTACAAAGCGAAACCAAGGCTAATTTGTTGTTCTATGAGCCAGAC
TAGACTGGCTTTGAGTTGTCCTGAAACACAGTGTAGTCGCGATTATTGAC
TTCCAAGCCCGAAGGGCTAGACTCGAGACTCATGGATGGGAAACGAAGCC
ACTTATTTTATATCCAGAACGCCCGCGCATGGTTTTTACACAAGCGCCGG
ATTGAAACTAAAATCTATCGCTAGATTTAAAAAAATACAGTCCTCAAAAA
AAAAAAAAGGTTAGAGATTCTACTCTAGCCCTTTGGGCTTTAAACTCGAT
GGCCTCAATAACCCGAACCTCTATAACTCAATGTCTCCATAACTCGAACA
AGTTTTCTAGTCCCTTCTGTTAACAAGCCTTTGTAAAGTTGTTTCTATAA
ATCGAAATTTCTTTAACTCGAACGAATTTCTTGTTCTCCGTGCGTGTTCG
AGTTATGGAGATTGCACTGTATTTTCAAGCTAATTGGCTGTTCTACGGGA
CAGTTTGAATGTTGAACTCAGACTTTTAGTTTCGCAAAATTAAGTTATTT
TTTTTTCTTCAGATGAAAAAGAGCATACAGCTGGATCGTATTATTGTAAT
CGGAATACGCGCGTTGAATATTATAAACCAAGAATTCAATTGGGATATCA
AAAGAATTCAAACTGGAATAATCGTGGTTTTGTAGTCGGTTGGGTTGCTT
TTAGAGACCCATACCATGGTAAGTGTTAACCGTTTCGGGGAAATCGGGGA
AACTTTATCGCAATAAGCCAGGCTTCGCTATGGGGTAGTTTTCTTTTAAA
GACCCATACTATGGTAAGTGTTGACCGTTTCGGGGAAATCGGGGAAACTT
GATCGCAATAAGCCAGGCTTCGCTATGGGGTAGTTTTCTTTTAAAGACTC
ATATCATGGTTAGTGTTAACCGTTTTGGGGAAATCGGGGAAACTTAATTT
AATAAAGCCAAGCTTCGTTATGGGTTGGATTTCTTTTAAAGACCCCATAT
CATGGTGAGTTAACCCGGTAATCTTCTCACAGTTCACCGGAATACAAATC
AAAATGTTGCTAATAACTATTAAAGTTTGGAGCCTTAGTTAAGCCTACTT
TAATCTCCACACGGAGCTTCGCTGTCTGGTAATGGTTTTAAAGCTTGTCT
TCTTAGGATCTGCAGCACTGGTCGTATTGGTAAACAATGAAATTTGTACG
GGTGTACACTATAAAGAAATATACAATGTTGATATTTGTTCTGTCCATTT
CTTCGTAGACTCGAGTGGCTCTAGTGGCTCTAGTGTTGGCGGCACCATCA
CAATCGTCATAGTTGTCATCTTCGTGGTCGTCTTTGCTGTAATCGCCGCT
ATTCGTCGCCGACGCGGCTATATCTTCAGTCAAGGACGTCCTGTAGTAAT
GACCCCAACCGGCGTCACAGCGCCACCCACTACAGGTCCACCTGCTGTTG
TAACTTATAGTAACACTACGAAACCAGGTATAGCGTTTTTTAACCCTTTA
AATTTGTTTAGATCTATTCCTTGGATTTTTCCAGTTAACGGTTACAGCTT
GAACTTACCCTTGCAAAACTTAGATATTGTTTAGTTCAACAAGCAGTATT
TTTAACTGGTGTACAACCGTAGCGCTTTAGGATTTTTACTCTAATTGATT
CTTATTTTTTTCCTCATCTTTTACTTTGGCTCCGAGATCATATACAGTGG
GAACACTAAAACTCGGACCTTTTTAACTCGAATGTCTCCTTGACTTGAAA
AAAAGTTTGCTGGTCCCTTCAGCTAACGAACCTTATAATGTCCATAACTC
GAAAAAAATTTGCGTTCCCCGTTACTCTACTGTGTTCTTCTCACTGACCT
TTATATATCCCTGGACCAAGCTATATCTGCCATCTTTGATCGAAGTTTTT
TTTAATTGTTACCTGTAAAGAAGCCATTACAGTGTTTGAAACTTTGCCTA
CCGACAAACGGCGCTACATCACTAGTGTACAAGCGAAATAAGATCTAGCG
CTCTCTACGCGGGTACCAATTTCAAAAAAACTCCGATCGTAATGTTTTGC
TTGGCCGGCATTGAGTAACTTGGTTTAGGGATATATAAAGGTCAGTAATT
CTGCTGTATTGTAATAATATTTCTGTTTATTTTAATTTATTCACACAACG
AAAAGGAGACGAGACAAAAAATTATCCAACACAGCAATTCGTTCCACCAC
CCTCTGGCGCTCAACCGCCCTCTCAGTATCCGCCACCCGCTCAATATCCT
CCACCCATCGCCCAAGGTGCTTATCCTCCTACCGCTCAATATCCACCTCC
ACAAGGAGGCTACCCGCCACCACCTCAGGGCGCTTATCCACCACCGCCCT
CGTATGAAGTCACTCAAAACCAAAATTCGATGTAAAAGAAAAGTCAAACC
TAGTAATAGTTTTAGATGAGCTTAGAAATGCTATGAATGGAATCGAAGGT
ATATATTCTTTTTCAACTAACAAACATTGAAATTTAATACTCAGAAGAGA
CGAGAGCAAGCCAACAAACGACTGTTTACTTACAAAACTAATGGACATCA
CTGACCCTGACATCTTTTACTAACCAAACTACTAAGCTTGCTACCGAAAG
AACCTTTTTTAATGAAATTTACGACCGCGAATTAACAAACATTAGTACCG
ACGTACTCCGAAAGTACCGTACGCTCCTCCGAAAATCCAAAAAAGGGGTG
TTTATTCGAAGTAATACGATACTAAACCTATTTACAAACAACTATATTAT
AATATTTTACTGACTAACTGTAGATTATTTAACTGACTAATAAGTACTGA
CATGCTGACATAAATTGACATTGTAATGGTATAAATTCTTCGTTTCAGTA
AAGGCTTGGGGACACGAGAAGTTTTTTTCGCGTTGATGCAATGCAACATG
TTCTATCCCACCAACACAAGAAAAAAAGTGTGTGTCTCATGGTTTCTTTT
TTGTTTCATGGGACAAAAAGTGAGGGAAATACCCAAAAGCTACGCTGATT
TTGTCCCTGGGACAATGGAGCAAAATTGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000072:632061..639689-

>TCONS_00006967 ID=TCONS_00006967|Name=TCONS_00006967|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=8841bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000072:632061..639689- (Clytia hemisphaerica)
GAGACGAGACAAAAAATTATCCAACACAGCAATTCGTTCCACCACCCTCT
GGCGCTCAACCGCCCTCTCAGTATCCGCCACCCGCTCAATATCCTCCACC
CATCGCCCAAGGTGCTTATCCTCCTACCGCTCAATATCCACCTCCACAAG
GAGGCTACCCGCCACCACCTCAGGGCGCTTATCCACCACCGCCCTCGTAT
GAAGTCACTCAAAACCAAAATTCGATGTAAACTCGAGTGGCTCTAGTGGC
TCTAGTGTTGGCGGCACCATCACAATCGTCATAGTTGTCATCTTCGTGGT
CGTCTTTGCTGTAATCGCCGCTATTCGTCGCCGACGCGGCTATATCTTCA
GTCAAGGACGTCCTGTAGTAATGACCCCAACCGGCGTCACAGCGCCACCC
ACTACAGGTCCACCTGCTGTTGTAACTTATAGTAACACTACGAAACCAGA
TGAAAAAGAGCATACAGCTGGATCGTATTATTGTAATCGGAATACGCGCG
TTGAATATTATAAACCAAGAATTCAATTGGGATATCAAAAGAATTCAAAC
TGGAATAATCGTGGTTTTGTAGTCGGTTGGGTTGCTTTTAGAGACCCATA
CCATGGCCGTTGACATCATACACAGGGGTGATTGCAACTCCGGATTGGCC
AGCTTTGTCTTTACTGGACAAATGTAATTGGGAGTTGGGTGGTGGCTCAG
ATGATGGGTATTTGATTCACATCATGGATTTAAGAGACACTTCTTCACGT
TTATGCTGGAAAGGGGAAGTTCAAAAGATCACCATAAGAGGAAACATGCG
TTCCTCGCTACCCCACGATGTATACGCATACACCAGTTGCTTGACAATAA
CATTAAATTTCAAAAATGGGAATTTGGGTAATCGAGGTGGATTTCGTGGT
TATTTCAGTGAATATTCTGCTGGAGGCTTGGATTCTTGTAAATACACTGG
TACAGGACCTTGCTCAGAATATGACACAGAAATCGCCGAATTCTGCTCAG
ATGTTGGAAGAAGTACTAACAATCCTACTTCTGTCCGTCCATGCAGCTTC
ATCCACTAGTTGCCAGGAAAAAGTCTACGGTGGAGTTTCTGGTACAATTC
ACGGTGGTGATCACGCCCCTATCCCGCCCAACGATTTTTGCACTAAAGAA
GTTATAAGGGTGGTATTTGGGCGGACCATGGCGGTCAAATTGAATTTTGA
AAGTTTCGATATAGCAGGAGACATGCCTTATTGCATTTCAGGAAATATGA
AAATTGTTGCCGGGAGACGAGACAAAAAATTATCCAACACAGCAATTCGT
TCCACCACCCTCTGGCGCTCAACCGCCCTCTCAGTATCCGCCACCCGCTC
AATATCCTCCACCCATCGCCCAAGGTGCTTATCCTCCTACCGCTCAATAT
CCACCTCCACAAGGAGGCTACCCGCCACCACCTCAGGGCGCTTATCCACC
ACCGCCCTCGTATGAAGTCACTCAAAACCAAAATTCGATGTAAACTCGAG
TGGCTCTAGTGGCTCTAGTGTTGGCGGCACCATCACAATCGTCATAGTTG
TCATCTTCGTGGTCGTCTTTGCTGTAATCGCCGCTATTCGTCGCCGACGC
GGCTATATCTTCAGTCAAGGACGTCCTGTAGTAATGACCCCAACCGGCGT
CACAGCGCCACCCACTACAGGTCCACCTGCTGTTGTAACTTATAGTAACA
CTACGAAACCAGATGAAAAAGAGCATACAGCTGGATCGTATTATTGTAAT
CGGAATACGCGCGTTGAATATTATAAACCAAGAATTCAATTGGGATATCA
AAAGAATTCAAACTGGAATAATCGTGGTTTTGTAGTCGGTTGGGTTGCTT
TTAGAGACCCATACCATGGCCGTTGACATCATACACAGGGGTGATTGCAA
CTCCGGATTGGCCAGCTTTGTCTTTACTGGACAAATGTAATTGGGAGTTG
GGTGGTGGCTCAGATGATGGGTATTTGATTCACATCATGGATTTAAGAGA
CACTTCTTCACGTTTATGCTGGAAAGGGGAAGTTCAAAAGATCACCATAA
GAGGAAACATGCGTTCCTCGCTACCCCACGATGTATACGCATACACCAGT
TGCTTGACAATAACATTAAATTTCAAAAATGGGAATTTGGGTAATCGAGG
TGGATTTCGTGGTTATTTCAGTGAATATTCTGCTGGAGGCTTGGATTCTT
GTAAATACACTGGTACAGGACCTTGCTCAGAATATGACACAGAAATCGCC
GAATTCTGCTCAGATGTTGGAAGAAGTACTAACAATCCTACTTCTGTCCG
TCCATGCAGCTTCATCCACTAGTTGCCAGGAAAAAGTCTACGGTGGAGTT
TCTGGTACAATTCACGGTGGTGATCACGCCCCTATCCCGCCCAACGATTT
TTGCACTAAAGAAGTTATAAGGGTGGTATTTGGGCGGACCATGGCGGTCA
AATTGAATTTTGAAAGTTTCGATATAGCAGGAGACATGCCTTATTGCATT
TCAGGAAATATGAAAATTGTTGCCGGGAGACGAGACAAAAAATTATCCAA
CACAGCAATTCGTTCCACCACCCTCTGGCGCTCAACCGCCCTCTCAGTAT
CCGCCACCCGCTCAATATCCTCCACCCATCGCCCAAGGTGCTTATCCTCC
TACCGCTCAATATCCACCTCCACAAGGAGGCTACCCGCCACCACCTCAGG
GCGCTTATCCACCACCGCCCTCGTATGAAGTCACTCAAAACCAAAATTCG
ATGTAAACTCGAGTGGCTCTAGTGGCTCTAGTGTTGGCGGCACCATCACA
ATCGTCATAGTTGTCATCTTCGTGGTCGTCTTTGCTGTAATCGCCGCTAT
TCGTCGCCGACGCGGCTATATCTTCAGTCAAGGACGTCCTGTAGTAATGA
CCCCAACCGGCGTCACAGCGCCACCCACTACAGGTCCACCTGCTGTTGTA
ACTTATAGTAACACTACGAAACCAGATGAAAAAGAGCATACAGCTGGATC
GTATTATTGTAATCGGAATACGCGCGTTGAATATTATAAACCAAGAATTC
AATTGGGATATCAAAAGAATTCAAACTGGAATAATCGTGGTTTTGTAGTC
GGTTGGGTTGCTTTTAGAGACCCATACCATGGCCGTTGACATCATACACA
GGGGTGATTGCAACTCCGGATTGGCCAGCTTTGTCTTTACTGGACAAATG
TAATTGGGAGTTGGGTGGTGGCTCAGATGATGGGTATTTGATTCACATCA
TGGATTTAAGAGACACTTCTTCACGTTTATGCTGGAAAGGGGAAGTTCAA
AAGATCACCATAAGAGGAAACATGCGTTCCTCGCTACCCCACGATGTATA
CGCATACACCAGTTGCTTGACAATAACATTAAATTTCAAAAATGGGAATT
TGGGTAATCGAGGTGGATTTCGTGGTTATTTCAGTGAATATTCTGCTGGA
GGCTTGGATTCTTGTAAATACACTGGTACAGGACCTTGCTCAGAATATGA
CACAGAAATCGCCGAATTCTGCTCAGATGTTGGAAGAAGTACTAACAATC
CTACTTCTGTCCGTCCATGCAGCTTCATCCACTAGTTGCCAGGAAAAAGT
CTACGGTGGAGTTTCTGGTACAATTCACGGTGGTGATCACGCCCCTATCC
CGCCCAACGATTTTTGCACTAAAGAAGTTATAAGGGTGGTATTTGGGCGG
ACCATGGCGGTCAAATTGAATTTTGAAAGTTTCGATATAGCAGGAGACAT
GCCTTATTGCATTTCAGGAAATATGAAAATTGTTGCCGGGAGACGAGACA
AAAAATTATCCAACACAGCAATTCGTTCCACCACCCTCTGGCGCTCAACC
GCCCTCTCAGTATCCGCCACCCGCTCAATATCCTCCACCCATCGCCCAAG
GTGCTTATCCTCCTACCGCTCAATATCCACCTCCACAAGGAGGCTACCCG
CCACCACCTCAGGGCGCTTATCCACCACCGCCCTCGTATGAAGTCACTCA
AAACCAAAATTCGATGTAAACTCGAGTGGCTCTAGTGGCTCTAGTGTTGG
CGGCACCATCACAATCGTCATAGTTGTCATCTTCGTGGTCGTCTTTGCTG
TAATCGCCGCTATTCGTCGCCGACGCGGCTATATCTTCAGTCAAGGACGT
CCTGTAGTAATGACCCCAACCGGCGTCACAGCGCCACCCACTACAGGTCC
ACCTGCTGTTGTAACTTATAGTAACACTACGAAACCAGATGAAAAAGAGC
ATACAGCTGGATCGTATTATTGTAATCGGAATACGCGCGTTGAATATTAT
AAACCAAGAATTCAATTGGGATATCAAAAGAATTCAAACTGGAATAATCG
TGGTTTTGTAGTCGGTTGGGTTGCTTTTAGAGACCCATACCATGGCCGTT
GACATCATACACAGGGGTGATTGCAACTCCGGATTGGCCAGCTTTGTCTT
TACTGGACAAATGTAATTGGGAGTTGGGTGGTGGCTCAGATGATGGGTAT
TTGATTCACATCATGGATTTAAGAGACACTTCTTCACGTTTATGCTGGAA
AGGGGAAGTTCAAAAGATCACCATAAGAGGAAACATGCGTTCCTCGCTAC
CCCACGATGTATACGCATACACCAGTTGCTTGACAATAACATTAAATTTC
AAAAATGGGAATTTGGGTAATCGAGGTGGATTTCGTGGTTATTTCAGTGA
ATATTCTGCTGGAGGCTTGGATTCTTGTAAATACACTGGTACAGGACCTT
GCTCAGAATATGACACAGAAATCGCCGAATTCTGCTCAGATGTTGGAAGA
AGTACTAACAATCCTACTTCTGTCCGTCCATGCAGCTTCATCCACTAGTT
GCCAGGAAAAAGTCTACGGTGGAGTTTCTGGTACAATTCACGGTGGTGAT
CACGCCCCTATCCCGCCCAACGATTTTTGCACTAAAGAAGTTATAAGGGT
GGTATTTGGGCGGACCATGGCGGTCAAATTGAATTTTGAAAGTTTCGATA
TAGCAGGAGACATGCCTTATTGCATTTCAGGAAATATGAAAATTGTTGCC
GGGAGACGAGACAAAAAATTATCCAACACAGCAATTCGTTCCACCACCCT
CTGGCGCTCAACCGCCCTCTCAGTATCCGCCACCCGCTCAATATCCTCCA
CCCATCGCCCAAGGTGCTTATCCTCCTACCGCTCAATATCCACCTCCACA
AGGAGGCTACCCGCCACCACCTCAGGGCGCTTATCCACCACCGCCCTCGT
ATGAAGTCACTCAAAACCAAAATTCGATGTAAACTCGAGTGGCTCTAGTG
GCTCTAGTGTTGGCGGCACCATCACAATCGTCATAGTTGTCATCTTCGTG
GTCGTCTTTGCTGTAATCGCCGCTATTCGTCGCCGACGCGGCTATATCTT
CAGTCAAGGACGTCCTGTAGTAATGACCCCAACCGGCGTCACAGCGCCAC
CCACTACAGGTCCACCTGCTGTTGTAACTTATAGTAACACTACGAAACCA
GATGAAAAAGAGCATACAGCTGGATCGTATTATTGTAATCGGAATACGCG
CGTTGAATATTATAAACCAAGAATTCAATTGGGATATCAAAAGAATTCAA
ACTGGAATAATCGTGGTTTTGTAGTCGGTTGGGTTGCTTTTAGAGACCCA
TACCATGGCCGTTGACATCATACACAGGGGTGATTGCAACTCCGGATTGG
CCAGCTTTGTCTTTACTGGACAAATGTAATTGGGAGTTGGGTGGTGGCTC
AGATGATGGGTATTTGATTCACATCATGGATTTAAGAGACACTTCTTCAC
GTTTATGCTGGAAAGGGGAAGTTCAAAAGATCACCATAAGAGGAAACATG
CGTTCCTCGCTACCCCACGATGTATACGCATACACCAGTTGCTTGACAAT
AACATTAAATTTCAAAAATGGGAATTTGGGTAATCGAGGTGGATTTCGTG
GTTATTTCAGTGAATATTCTGCTGGAGGCTTGGATTCTTGTAAATACACT
GGTACAGGACCTTGCTCAGAATATGACACAGAAATCGCCGAATTCTGCTC
AGATGTTGGAAGAAGTACTAACAATCCTACTTCTGTCCGTCCATGCAGCT
TCATCCACTAGTTGCCAGGAAAAAGTCTACGGTGGAGTTTCTGGTACAAT
TCACGGTGGTGATCACGCCCCTATCCCGCCCAACGATTTTTGCACTAAAG
AAGTTATAAGGGTGGTATTTGGGCGGACCATGGCGGTCAAATTGAATTTT
GAAAGTTTCGATATAGCAGGAGACATGCCTTATTGCATTTCAGGAAATAT
GAAAATTGTTGCCGGGAGACGAGACAAAAAATTATCCAACACAGCAATTC
GTTCCACCACCCTCTGGCGCTCAACCGCCCTCTCAGTATCCGCCACCCGC
TCAATATCCTCCACCCATCGCCCAAGGTGCTTATCCTCCTACCGCTCAAT
ATCCACCTCCACAAGGAGGCTACCCGCCACCACCTCAGGGCGCTTATCCA
CCACCGCCCTCGTATGAAGTCACTCAAAACCAAAATTCGATGTAAACTCG
AGTGGCTCTAGTGGCTCTAGTGTTGGCGGCACCATCACAATCGTCATAGT
TGTCATCTTCGTGGTCGTCTTTGCTGTAATCGCCGCTATTCGTCGCCGAC
GCGGCTATATCTTCAGTCAAGGACGTCCTGTAGTAATGACCCCAACCGGC
GTCACAGCGCCACCCACTACAGGTCCACCTGCTGTTGTAACTTATAGTAA
CACTACGAAACCAGATGAAAAAGAGCATACAGCTGGATCGTATTATTGTA
ATCGGAATACGCGCGTTGAATATTATAAACCAAGAATTCAATTGGGATAT
CAAAAGAATTCAAACTGGAATAATCGTGGTTTTGTAGTCGGTTGGGTTGC
TTTTAGAGACCCATACCATGGCCGTTGACATCATACACAGGGGTGATTGC
AACTCCGGATTGGCCAGCTTTGTCTTTACTGGACAAATGTAATTGGGAGT
TGGGTGGTGGCTCAGATGATGGGTATTTGATTCACATCATGGATTTAAGA
GACACTTCTTCACGTTTATGCTGGAAAGGGGAAGTTCAAAAGATCACCAT
AAGAGGAAACATGCGTTCCTCGCTACCCCACGATGTATACGCATACACCA
GTTGCTTGACAATAACATTAAATTTCAAAAATGGGAATTTGGGTAATCGA
GGTGGATTTCGTGGTTATTTCAGTGAATATTCTGCTGGAGGCTTGGATTC
TTGTAAATACACTGGTACAGGACCTTGCTCAGAATATGACACAGAAATCG
CCGAATTCTGCTCAGATGTTGGAAGAAGTACTAACAATCCTACTTCTGTC
CGTCCATGCAGCTTCATCCACTAGTTGCCAGGAAAAAGTCTACGGTGGAG
TTTCTGGTACAATTCACGGTGGTGATCACGCCCCTATCCCGCCCAACGAT
TTTTGCACTAAAGAAGTTATAAGGGTGGTATTTGGGCGGACCATGGCGGT
CAAATTGAATTTTGAAAGTTTCGATATAGCAGGAGACATGCCTTATTGCA
TTTCAGGAAATATGAAAATTGTTGCCGGGAGACGAGACAAAAAATTATCC
AACACAGCAATTCGTTCCACCACCCTCTGGCGCTCAACCGCCCTCTCAGT
ATCCGCCACCCGCTCAATATCCTCCACCCATCGCCCAAGGTGCTTATCCT
CCTACCGCTCAATATCCACCTCCACAAGGAGGCTACCCGCCACCACCTCA
GGGCGCTTATCCACCACCGCCCTCGTATGAAGTCACTCAAAACCAAAATT
CGATGTAAACTCGAGTGGCTCTAGTGGCTCTAGTGTTGGCGGCACCATCA
CAATCGTCATAGTTGTCATCTTCGTGGTCGTCTTTGCTGTAATCGCCGCT
ATTCGTCGCCGACGCGGCTATATCTTCAGTCAAGGACGTCCTGTAGTAAT
GACCCCAACCGGCGTCACAGCGCCACCCACTACAGGTCCACCTGCTGTTG
TAACTTATAGTAACACTACGAAACCAGATGAAAAAGAGCATACAGCTGGA
TCGTATTATTGTAATCGGAATACGCGCGTTGAATATTATAAACCAAGAAT
TCAATTGGGATATCAAAAGAATTCAAACTGGAATAATCGTGGTTTTGTAG
TCGGTTGGGTTGCTTTTAGAGACCCATACCATGGCCGTTGACATCATACA
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GGACCATGGCGGTCAAATTGAATTTTGAAAGTTTCGATATAGCAGGAGAC
ATGCCTTATTGCATTTCAGGAAATATGAAAATTGTTGCCGG

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_003890	XLOC_003890	Clytia hemisphaerica	gene

The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00006967-protein	TCONS_00006967-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000072	supercontig	sc0000072:632061..639689 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
36.966	34.2557	17.3468	14.7781	290.753	216.619	34.6623	34.8488	22.0578	36.0632	22.8057	39.0596	8.2656	6.99751	1.87541	2.10269	25.5135	18.5951	11.8627	11.4771	69.2653	65.0532	33.0592	39.8277	44.6246	33.701	21.7722	25.291	6.46679	9.01387

Annotated Terms

The following terms have been associated with this transcript:

Vocabulary: **INTERPRO**
Term	Definition
IPR000859	CUB_dom

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00006967 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00006967 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

You are here

TCONS_00006967 (transcript) - C. hemisphaerica