TCONS_00006662 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00006662
Unique NameTCONS_00006662
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length1576

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00006662 ID=TCONS_00006662|Name=TCONS_00006662|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1576bp
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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000069:451319..473789-

Legend: exon
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>TCONS_00006662 ID=TCONS_00006662|Name=TCONS_00006662|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=22471bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000069:451319..473789- (Clytia hemisphaerica)
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TAAAATAAAATGTGTAATGTACAATCGTTGATGCCGTATTTCATGTTTTG AAACTAGAAAGCTGTAGACTTCTGTACACCCCCTTCTCAGAAACCCGGTG GGATTTTTTCAGCTACACGCTATTTTTTTTATAAGAATGGTGTAAATCCA TTTTATCATGGATATTCTTAACCTTTTTGGGAAAATCATCCTAAAATATT CTTACAGCATTCTTAGGTTACGATTCTAATTCAGACTAGATTTAACATTT AGTACACACGTCTCAAGCATAAAATGGCATTTGTGAAAGGAGTGAGCCTT ACTTGGGGGTAATTGACAATTTATAATTGAAAATGCTCTAACAATGGCAC TCTTAGCTTGAGTATAGCAAAATTCCATGATGGTGATATTCTTAGCATTA TTCTTATTTTTTTGGCCATTTTCATCATGGGCATTCTTATAAAGTGTATT CTTATAAAAGAAAAAGCGTGTAGTGGGAGTGAAAATAACGGACTGAAACT CAATGGGGATTATATATTGATGGGGATGATATTACTGGGGATTAGAATTT CATTGTTTTCAAGTCAGAAAACTCAGCGGTGATGGGAAAAAATAGCATAA TATTTACACTGTTTGATGTAAGAGCAAGTTCTTCTTTTATTGTTGCTCCT ATACAATTTTTTATAAGATAAAAAAAGAGCAGAAGGCTTGGACGGTCAAA AATATCAAGAATGAATAAGGAACTATCTGAGCCTCAAGTTTCAGAAATTA CAGGTTTCAACATACAAGTTATTTATCAGATTTGAACCTATTTTCATTGT TTAAAGGAAAGAAACTGAGCGTATTAAGGACACTGTAAGAATATTTAAGC CTGAAAATTTCAAAATATTAAGAACAGCCCGGTCTGAGCCAAAAAAATTT ACTGGTTCTTATAAAACAACTTGCGTGCGAAGATACCCTTAATACTTACA AAAGGCTTCTCGCTGACGTAACCCAGACGGCACACAACGTCAAAACAACG TCCATGTGACATTCATAACGTCCAAATAACGTTCATTTGAACGTTAAAAC AACGTTGTGTGCCAGCTGAGAACGAAACTTTGGGAGGGGCGAGAAGAGAG GGTCTGATCTTCATCTTCAAATAAGTCCTTTACTTATAAGGGTTCGGTTT CAAAGTGATATACTTTTCAATCAGCCTTATTGGAAAGATGAGAAGCATGA CGGTGATTGATTTCATGACCTTAAAAAAATATTAACCGAGAAAAAAAATA TTCATTACATAATTTTTTTTGAATATTTTTTGCATACTTTGCGTCATTCT TTTTGACTTTTTTTCCCAACAGATTTATTACTACAGAATCACTTCTTTGT AGATATCCTTTATCATGATATGCACCACTGCAATGGCTTATGTAAATTAT GCAACTTTTCTGCTTTGTTTTTCCATCCAATACGTCACTTTTTCTATTGT TTAAGTGACGTATTGGATTTAAAATTTTAAAAGTTCTCAGAAGACTCTCC AATGGTGTATATCATGAATTGTATTGCTCACAAGGCTCCTGCCCATCAGT GCGATTACAGTCGATACACGCTTATTCGTACTTTTATTATTCTAATCTTT CTATCATTTGTACTTTTCTCAGTTCCTGTCATGGAGAAACCGTCTTGAAA TATTCTCTATAATTCGAACTTCTCTGTTATTCGAACAAATAAGATTCCTT GTTTAAGTTCGAATTAGCGAGAGTCCACCGTAGTTTGTTTTAGTTTAGTT TTTCATCTTCAATGGTTTAGATTTTGATCTTCAAGATAAGAGTTGTGAAA TTCTTGGTTAAATGTTTATAGTTTTTACATCGTTAAGTGTTTTTTTGGAT ACGACTCAGTAGTCCAGCTAGCTTTTTTGCAATTTTTTTACCATTTATCT AAAATGATATCTTGCTCATTCGTAGGAGCATTTCTACTTTTAGTACTTTT TGATTAGTTTATTATGATTCTCGTGAAGTTTGTTTTCATTTTTTATCACT TCCTTTTTTACTACCTCTCAAAAATCGAGATAAAAAATTGCATAAAAATG GATCCCTCGCTTCCCTTTGTTAATACATGTTTTTTTTTTTATAAGTATAC AAATGTTCTAAACACGTTCTAATTTTCACCATTTTGTGAGTATTTTTGTC TATTTTCCTAAGAAATAGAGTCTTTGAGATTCAAGGCTAAAAATGTTCTT AACCTGTTCTTGATATTTTGGCGATCGAAGCCTTATGTTCTTATATAGTT TGTTCTTATAAAAAGACACGTGCTTGTACACGTGTTGGTAGCATTTTTTG TTATGTATTGTAGGCAAACTTTTGTTGCTCTGGTTATCAACATAATATTA TTTACCGTTACCTAGAATGTCTATTCAAACGTTTGCTTTCTCCAGCCTCT GTGATGGAGTACTAGATTTTGTTTTGATGTGCTCCAAGGAAACCGAAATG CACCGTCAGGGTGAGTCTTTTAAAAATACACGGTAAAAATTTTCAGGTTT CAATTAAGAGTCTATAAAGTACACGTTTCTTTTTAATAAGAACATCTAAA TTTTTGAAGCCTTTGGGTGTTCTTAACTTTTTGAGTTTTAAGCCTAAAAA TGTTCTTAACATGCTCTTATTTCCCCCCAGATTGTGGGCATTTTGCCCAT TTTCCTAAGAAATCAGGTGATTTAGAGTTCCCGAAGCCTTAGGGTAGGGA TGCCAGTACTAAGGAGATAGTATTTTGGTTTCTCACCGAAAGTTCAAAGT TTTGTAATGTTCGTGGGATTTCAACATAATGGGCTTTCTCGGCAAATGAA GTTGCAGGTTGTGTTTTCCTTTCTGTGCTGTTTTTGTCAAACTTTAGTTC TCCAGAAAGTAGTTTAGCTTTCGACCGCAGGACAGAAGATTGGAAATCTC TTTTTTCCCATGGGAAGATAATGAAGAATATTTCCCATATTAAGTATCTT TAAGATGCTGTGTTTTTATTTTGTATTATTATTTAAAGTCGACAATGCAT GCATGGGAGAAAGATTTTTTTCAACCCAGCATGAATCGTAGATGATAAAT TAATGTCGAGTTTCTTTGTATTTGGCTGTGCACTGGTACTCCACCAGAAA CATCAATGGACCTTCTCAGCCTATAAGTTCTTGATTACAGTTGACTCTCT AATTCGAACTCGAACGGGGAATCTTTTTTGTCCGAATTAAAGAAAGATTC GAAATATAGAAAGTATTTTAAGAGGGTTTCTCCTTGACGGGGATTTGGAA TAAGTTCGAATTATGGAAGTTCGAATAAGCGAGCGTCCACTTTTCTTTAT CTATTTAACGTTTCACCTGTAAAAAAGTTGAGGGAGGTTGAGGGAAGACT ATATACCTCATGTTACTTTAGGGTTTAAGCATTGAGCTCCCTGATGAAAT TTCTGGAAGGTTATAAAGGGAAACCTATAATGTGCTATTACTGAAGGTCG TTATCGATTAAAAGGAATATCAATAAAAATCAATTTGTCTTCGATTACAT CGATATTGTGAACGACCAGCTGGTATATTTAACGTTCTTTTTAAAAAACA GTGTCCCAACATAAAGAAAACGTGAAACAATAACGTGAAACATAAATTGG AGAAATTCTCTAAATATACTTTCTCTATAATTCGAATCTCTCTGTAATTC GAACAATTAAGATTTCTCGACCGAGTTCGAATTAGCTAGAGGCAACTGTA GGTATAAATTCGCTAAGTTTACTATGAACGATAAACTTGAGACACAATTG GTTAAGTGTGCTAAATGACGAGATTATACGAAAATCACGAAAATATCCGT TAATAGGATAAAACGGTCCACGCAACGAGATTCAGAAAATCGTGACTCAG AAACATCTCTTCTCTTGTTTGGACATCAAGAGATGACGTAGCTATTGATT GTTTGTTTACTATTCATGTGCTTAGTTTTCTATCCATGTTTTTCTTTTCT GAGTATGTTTGATTTTCGTGGAAAATTCTTCCTTCATTGTAATTTAAGAA AGATTTTGGTATTATTCAGATTTTCATTCTTGGTCATTTAGTTCTCCGAG GCTTAGTAGAGGTCTTAGTAGAGGACGATAACTTTTAAGTCGTGTTTGTA GATTTTTCCAAATCTGATTTCCAGATACTTTAGAATATAAATAAATTGTT TTCTGATTTTTCGGAATTTGGTTCATCTGATATTTTATCGGCTGGATGTC AGTGTCCTTGTCTCGTCTTGTAACTCAACCTTTAAGTATTAGAAATTAAT ATCTTTGGTTTATACGATTTTTGAATCTGATAAATCATAAACTCGGGAAC TGTCAGGAACGTGTAACTTGAATGGTTTCATTGACGAGTCATTACGATTC CCCCCACATTGTTTGGATCTTGTCAGTGATATTTTTGGCAAATGAACGCC TATGATTTGTTTATTTTGGATGAGTTCATTCTTAAAGCTCTCCAATGGAG TACTAAAGATTACTCGTTTAGGGGAAAGAGAATTTTATGATAAGTAACAC TCCATCGTAGCATTAGTTAACTACATTACGTCATCTACAGATTCTACTGA AAATAAAACACTTTCCTTTTTAAGGACCATTTCAAATGCAACTTCTTTAA AGTATAGTATGGTCACGTAACAAGTCGTTTATAGAATCGACGTTATATGA CGGACATCAGGACGTCAGACTCATAAGTTTTCCGTGACCTAGATAATGAT AAATGTTTTTCTATAAAGCCTATCTATTGAAGCTTCTTGTTGTTTGGCTC TGTGTCTTTTCTTGTCGGCCATGGAATAGTTAAAAACTGCAAACTTCTTG ACAGGTGACCCTCTGCTCATACAGCCTGTAAAAAAGTACCGTTGGGCGAA TGGGGGCTTCAGAAACCGCTTTTGTTGTCGCCAACGTTACGAGCTACTTT AATCAGTTTCTCCTTTTTCAATACGATTTAGTTTATAATGTTACTTATTT TCCTTACAGATAAATAGTTAATCAGAAAATAAAGATCAAAAGAATTCAAC GCAACAGATGAACGCACGATACCATCCATGATTCAACGCAACAGAATGGG ACTGAAACTATTCGAACGGATATGTCAAGCGTTAAGGCGCCGTAAAGATC GGCAACACAATACGCATACGAAACTAGTGAACGATACGTCATTTTATGTG GACGCTGGTTGTTATTTCATCGAACGGTCAGACGTTATTTACGGTTACAC GCACTCTGCAGCAGTGGTTAAAAGGACTTCTTTTCCTCCTGCCCATACTC CGGCGCAGACGCCCGCAATCGTACGCAAGAAGAGTACTGTAGACTATAAT GATGATATAGGACACCTGCGGAGGAACGCCATTTTTGAACTCTGCGAAGA AGAGCGTGAAGGTTTAACGATGGTTTTAAAGGGTTATATTCAACAACGGA ACTTAAAAGAATTTGGAATGTTATAGTGGAAAGCGTTGGAGAACCTTGGA AGAAACCTATGGGGATTGAAACATGCCTTGGAGTAACTGTTAGGTTATGC AAAAAGAACTTAACCGTCAACACCTTAGGAATGTGATAGTGAAAAGCAAA TCAGAAACTTGTAAGAAAGCCTATGCGCTATGGAGTTTGTAGGTTAAAGG TTATGCATAAAACACTAAGCCGTTGACACCTAGGACTGTGATAGTGAAAG CGTTGGAGGAGCTTGGAAGCAACCTATAGGGATTGAAAGGTGAATACCCG CGAGAGATTATGCATAAAATGCTAAGCCGTTGATCAGGTGCTGATTTTTA TAACAATAAGCCTAAGTATCTGACATAATGTGCATAGACCCTAATCATGA GATGAGTTGAAGTGTTAATGGTATTCAAAGTTTGCAACATTCTCTCGTGA ACACAACGAGTTTCGATTACCATGAAGTTTTTTCTCTTTGACGTTTCATT ATCGGGCGTGAGACGCAAACATTTTATGGACACATCACACACGCCAAAAG ATGGAAATGAAATGCTGAACTATTTCTTCAATTCGTACTGGCGATTCCGT CAAGCCAAAAATATGAAATACTCCAAAGAACGTCATGGGGAAAATATTAA TGACTGTTTTTAATTATGTTATAAAAGTATGCTTTTTTCGCATATTTTAT CGACCAAATTTATGAAGAAGACAATTTTATCCAGACTATTGAAGAAGCAA TGAAGCACATTTTTTAAAGAATACAACCACTTGATTGGTTAAAAATACTC TGCAAAAGTTATGTTTGCTGTCAATACTTAACAAACTGTTTGAAGAAGGT GTTTTAGCCTTAATTAATCCCATCTATTTGTACATATTAATTTTTGAAAA CAATGGATGAGAGAAGAAAAA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_003739XLOC_003739Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000069supercontigsc0000069:451319..473789 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
3.36979 2.67564 1.68385 1.0579 0.0359832 0.290969 3.7037 3.62355 2.6819 2.53466 2.30082 1.49926 3.5499 3.01144 2.18757 2.11218 1.79242 1.88473 1.30909 4.52693 1.81278 1.97344 6.12717 5.44116 2.29158 2.67105 3.11505 3.75993 2.84165 2.84357
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00006662 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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