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The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00006662 ID=TCONS_00006662|Name=TCONS_00006662|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1576bp ttagattaaaataaaacaacatgGAATGCAGATTGTAATCTTGAAATCAT TGTATTTTGTCTGAGGAAGACCTGCCAATATGATAGCACTGAAAGTCGTA AAAAAATGGTACAAAAGAGAATTCTTGCAGAGACTTGTTTTGGACAAAat ttttcatgCACCAAGAATTATATTGATTGGTTGAAGAGTTTCTGAGACGC TACCAACTAATGGTATAAATAGTTAATCAGAAAATAAAGATCAAAAGAAT TCAACGCAACAGATGAACGCACGATACCATCCATGATTCAACGCAACAGA ATGGGACTGAAACTATTCGAACGGATATGTCAAGCGTTAAGGCGCCGTAA AGATCGGCAACACAATACGCATACGAAACTAGTGAACGATACGTCATTTT ATGTGGACGCTGGTTGTTATTTCATCGAACGGTCAGACGTTATTTACGGT TACACGCACTCTGCAGCAGTGGTTAAAAGGACTTCTTTTCCTCCTGCCCA TACTCCGGCGCAGACGCCCGCAATCGTACGCAAGAAGAGTACTGTAGACT ATAATGATGATATAGGACACCTGCGGAGGAACGCCATTTTTGAACTCTGC GAAGAAGAGCGTGAAGGTTTAACGATGGTTTTAAAGGGTTATATTCAACA ACGGAACTTAAAAGAATTTGGAATGTTATAGTGGAAAGCGTTGGAGAACC TTGGAAGAAACCTATGGGGATTGAAACATGCCTTGGAGTAACTGTTAGGT TATGCAAAAAGAACTTAACCGTCAACACCTTAGGAATGTGATAGTGAAAA GCAAATCAGAAACTTGTAAGAAAGCCTATGCGCTATGGAGTTTGTAGGTT AAAGGTTATGCATAAAACACTAAGCCGTTGACACCTAGGACTGTGATAGT GAAAGCGTTGGAGGAGCTTGGAAGCAACCTATAGGGATTGAAAGGTGAAT ACCCGCGAGAGATTATGCATAAAATGCTAAGCCGTTGATCAGGTGCTGAT TTTTATAACAATAAGCCTAAGTATCTGACATAATGTGCATAGACCCTAAT CATGAGATGAGTTGAAGTGTTAATGGTATTCAAAGTTTGCAACATTCTCT CGTGAACACAACGAGTTTCGATTACCATGAAGTTTTTTCTCTTTGACGTT TCATTATCGGGCGTGAGACGCAAACATTTTATGGACACATCACACACGCC AAAAGATGGAAATGAAATGCTGAACTATTTCTTCAATTCGTACTGGCGAT TCCGTCAAgccaaaaatatgaaatactCCAAAGAACGTCATGGGGAAAAT ATTAATGACTGTTTTTAATTATGTTATAAAAGTATGCTTTTTTCGCATAT TTTATCGACCAAATTTATGAAGAAGACAATTTTATCCAGACTATTGAAGA AGCAATGAAgcacattttttaaagaatacaaccacttgattggttaaaaa tacTCTGCAAAAGTTATGTTTGCTGTCAATACTTAACAAACTGTTTGAAG AAGGTGTTTTAGCCTTAATTAATCCCATCTATTTGTAcatattaattttt gaaaacaatggatgagagaagaaaaa Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000069:451319..473789- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00006662 ID=TCONS_00006662|Name=TCONS_00006662|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=22471bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000069:451319..473789- (Clytia hemisphaerica) TTAGATTAAAATAAAACAACATGGAATGCAGATTGTAATCTTGAAATCAT
TGTATTTTGTCTGAGGAAGACCTGCCAATATGATAGCACTGAAAGTCGTA
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TGTTACTTTTTCTGAAGAACGCGTCATTTTTATTACTTCAAATGACCAAT
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GTTGAACTCTTGACTCGCGCAATAGATTTGAGATTGGTTTGTTTTGAATT
CTGTATTTCACAGCCGATTAGAAGTAGGCTTTTGAAGATTTTAGTCGGAA
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GATCATGATTGTGGGACTAGTGAATTGTGTGGAATTAAAACAATTGAGAT
CGATCGTGCCTATTAATTGACGGTTTAGTGCTGTTCAAATTCTTAAGTTG
GGATGACATCATACACGTATTTCTTATTAGCAGATTCATGTAAAAAAGTC
ACGAAAAAACGTCGAGTAAAGCTCTGATTGGCTGAATATTGCACACATAA
GCATTTTTTCCAAAATGTCCAGAGTATGAGGTAAACTTTACATGTCTCAG
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GAATCTGTTAATAGGGAATTTCTGTACTCGTGATAAAGCCATTGTTTTAT
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TAGGAAATTTAGTACTAAAATGATTCGGGAACTTATGGTTGTACCAGCGC
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CCAAGATTAGGGAAGAAAAAAAGGCAGTAAATCGTAGTGTATCATTAAGA
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AAGAAAATTTTTAAAGTGAAGTTTTTGGAATATTTTAGTATCTGATTGAT
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GATTTTACGAACCAAATTTTGTTTGCTAAAGAATTCTCACTTAGTAAGTT
GCTGGAAATAGGTACGAGGTTATTTTATGATTTTTTACTTCTCCCAGTGT
GGGAGTGAGTCGAAAAAGCTAATTAAAATTCAGAAACAACGCATGTTAGC
TGAAAGTCAAAAACATACAAACCAAAAAAGAAATAAAGAAAGTTGAGAAA
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GGAGCCTGTTGATATTTTAGATTTTTTCTTCTTTCTATAGAGTTTTATTT
TGAAAGTAACTAAAATTTTTCATTCGTGGGCTATGAAGAAGAGAGATCTT
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AGATTTATGACGGTTATTTTGATGAATAAGATCTTGTTTGCGGGTTTGGA
AGCTCTTCTTGTCACGTTTTCTTTTCTCCGTTTTGATATTCTAGTCACAT
GAAATGATTCCAGGTTTTTCGTATTCTCCCCTAGTCCTTTATATAACGTC
GAAATAAAGTGCTGTGACAAGTTATCTTGCTTTATGGACCTACCCCGGTG
GGGTGGAGGTCCTATAAATTAACCTGTGTTCGTTCGTTCGTCCGTTCGTC
CGTTCGTCTGTTACCAACTTTTCTCAGGATTGAATCATAGGAATCTTTTG
ATTTTTGGACTTTGTGAAAAATTGGATCATTAATTTTTTCTATTTTTTTG
CATGAAAGTAGGGTACCATCATAGGTAAAAGATGGCTCAAGCAGATTTTN
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AGTCAAATTACTCAATTTTTTTATGAGATAGATGTTTTTTTTCCTCACGA
GGGCTTACTTTTAAAGAATATATGTGTTTAGACATGAAATTTTGGTTGCT
TGGCGTGTTTTTATAGAGAAACTGGCCAAATTCGATATTTTTTTATAAGC
ACATTATCAATTACTTAAGTATAAGCTTTTCTCAAGATTGGCTCTTTCAT
TCTTTATGATTTCTTGCACAAAGATGCATAACTATAAACCCTCGAATGTG
ACGGAGCCCTATTTCGAAGAAAAATGTTTTTGGGCAAATTTGGGCCAAAA
AACGACTAAAAAACGGTTTTTTTGGACTTTGTGAAATATTGGATCATTTT
TTTTTTTAGAATTTTTTTGCATGAAAGTAGGTAAAAGATGGCTCAAGCAG
ATTTTCGTGAAAAAAGAATTTTTCAGCTCAAAAAACGCATCTTTATCTAT
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ATTTTTTGATGAGATAGATGTTTTTTTGCCCACGAAGTCTTGAATATGAA
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AAACAAACGACTAATTTTAATAGATCGTCACTATTTGTGTTCTGAATGAT
TGTTTAACGGTCATATGCTCACGTAGATATCAATTATATATGTGTTAAAT
GCATAACCAGGTAGGTCCATAAAAGTATCACTTGTTGTATTTGAATTTCC
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AAACTAGAAAGCTGTAGACTTCTGTACACCCCCTTCTCAGAAACCCGGTG
GGATTTTTTCAGCTACACGCTATTTTTTTTATAAGAATGGTGTAAATCCA
TTTTATCATGGATATTCTTAACCTTTTTGGGAAAATCATCCTAAAATATT
CTTACAGCATTCTTAGGTTACGATTCTAATTCAGACTAGATTTAACATTT
AGTACACACGTCTCAAGCATAAAATGGCATTTGTGAAAGGAGTGAGCCTT
ACTTGGGGGTAATTGACAATTTATAATTGAAAATGCTCTAACAATGGCAC
TCTTAGCTTGAGTATAGCAAAATTCCATGATGGTGATATTCTTAGCATTA
TTCTTATTTTTTTGGCCATTTTCATCATGGGCATTCTTATAAAGTGTATT
CTTATAAAAGAAAAAGCGTGTAGTGGGAGTGAAAATAACGGACTGAAACT
CAATGGGGATTATATATTGATGGGGATGATATTACTGGGGATTAGAATTT
CATTGTTTTCAAGTCAGAAAACTCAGCGGTGATGGGAAAAAATAGCATAA
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AATATCAAGAATGAATAAGGAACTATCTGAGCCTCAAGTTTCAGAAATTA
CAGGTTTCAACATACAAGTTATTTATCAGATTTGAACCTATTTTCATTGT
TTAAAGGAAAGAAACTGAGCGTATTAAGGACACTGTAAGAATATTTAAGC
CTGAAAATTTCAAAATATTAAGAACAGCCCGGTCTGAGCCAAAAAAATTT
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AAAGGCTTCTCGCTGACGTAACCCAGACGGCACACAACGTCAAAACAACG
TCCATGTGACATTCATAACGTCCAAATAACGTTCATTTGAACGTTAAAAC
AACGTTGTGTGCCAGCTGAGAACGAAACTTTGGGAGGGGCGAGAAGAGAG
GGTCTGATCTTCATCTTCAAATAAGTCCTTTACTTATAAGGGTTCGGTTT
CAAAGTGATATACTTTTCAATCAGCCTTATTGGAAAGATGAGAAGCATGA
CGGTGATTGATTTCATGACCTTAAAAAAATATTAACCGAGAAAAAAAATA
TTCATTACATAATTTTTTTTGAATATTTTTTGCATACTTTGCGTCATTCT
TTTTGACTTTTTTTCCCAACAGATTTATTACTACAGAATCACTTCTTTGT
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GCAACTTTTCTGCTTTGTTTTTCCATCCAATACGTCACTTTTTCTATTGT
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AATGGTGTATATCATGAATTGTATTGCTCACAAGGCTCCTGCCCATCAGT
GCGATTACAGTCGATACACGCTTATTCGTACTTTTATTATTCTAATCTTT
CTATCATTTGTACTTTTCTCAGTTCCTGTCATGGAGAAACCGTCTTGAAA
TATTCTCTATAATTCGAACTTCTCTGTTATTCGAACAAATAAGATTCCTT
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ACGACTCAGTAGTCCAGCTAGCTTTTTTGCAATTTTTTTACCATTTATCT
AAAATGATATCTTGCTCATTCGTAGGAGCATTTCTACTTTTAGTACTTTT
TGATTAGTTTATTATGATTCTCGTGAAGTTTGTTTTCATTTTTTATCACT
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GATCCCTCGCTTCCCTTTGTTAATACATGTTTTTTTTTTTATAAGTATAC
AAATGTTCTAAACACGTTCTAATTTTCACCATTTTGTGAGTATTTTTGTC
TATTTTCCTAAGAAATAGAGTCTTTGAGATTCAAGGCTAAAAATGTTCTT
AACCTGTTCTTGATATTTTGGCGATCGAAGCCTTATGTTCTTATATAGTT
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TTATGTATTGTAGGCAAACTTTTGTTGCTCTGGTTATCAACATAATATTA
TTTACCGTTACCTAGAATGTCTATTCAAACGTTTGCTTTCTCCAGCCTCT
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TCCAGAAAGTAGTTTAGCTTTCGACCGCAGGACAGAAGATTGGAAATCTC
TTTTTTCCCATGGGAAGATAATGAAGAATATTTCCCATATTAAGTATCTT
TAAGATGCTGTGTTTTTATTTTGTATTATTATTTAAAGTCGACAATGCAT
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TAATGTCGAGTTTCTTTGTATTTGGCTGTGCACTGGTACTCCACCAGAAA
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GTTTGTTTACTATTCATGTGCTTAGTTTTCTATCCATGTTTTTCTTTTCT
GAGTATGTTTGATTTTCGTGGAAAATTCTTCCTTCATTGTAATTTAAGAA
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GCTTAGTAGAGGTCTTAGTAGAGGACGATAACTTTTAAGTCGTGTTTGTA
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TTCTGATTTTTCGGAATTTGGTTCATCTGATATTTTATCGGCTGGATGTC
AGTGTCCTTGTCTCGTCTTGTAACTCAACCTTTAAGTATTAGAAATTAAT
ATCTTTGGTTTATACGATTTTTGAATCTGATAAATCATAAACTCGGGAAC
TGTCAGGAACGTGTAACTTGAATGGTTTCATTGACGAGTCATTACGATTC
CCCCCACATTGTTTGGATCTTGTCAGTGATATTTTTGGCAAATGAACGCC
TATGATTTGTTTATTTTGGATGAGTTCATTCTTAAAGCTCTCCAATGGAG
TACTAAAGATTACTCGTTTAGGGGAAAGAGAATTTTATGATAAGTAACAC
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AAATGTTTTTCTATAAAGCCTATCTATTGAAGCTTCTTGTTGTTTGGCTC
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000069 | supercontig | sc0000069:451319..473789 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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