TCONS_00006237 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00006237
Unique Name	TCONS_00006237
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2202

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000066:262586..272606+

transcript sequence

>TCONS_00006237 ID=TCONS_00006237|Name=TCONS_00006237|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2202bp
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CG

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000066:262586..272606+

Legend: exon

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>TCONS_00006237 ID=TCONS_00006237|Name=TCONS_00006237|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=10021bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000066:262586..272606+ (Clytia hemisphaerica)
ATTCCAGCGAACAGTCAAACTGACACTATTCTTTTTTTACTGTTCAggta
aattaaaaagataagcAATAATAAGAAAATGAAACTGGAATAGAAAATGT
AGGTTTCAAGTTGCCTTGGGCTGCTACTGCAAGGCAACTGTGCCAAGCTC
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TTATTTCGTGTCAGTATCTTCAAAATGGCATTATTTGTATCATTATAAGG
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TTGTCATTTGAAGTACTTCACTACTTTTGTAATTCTATAGATTAGATGAT
GTTACCCTTTAATAATACCGGATGTGTCAGAAATAAGTTACCCTGAAGTT
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TCCCGGCATATActtttgaaagatcaaaatgttGGTGGGTATTGGAATAA
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ACTCatgtcaaattttgaaatactttgtAGTGCTGCATAACATGAATACT
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TAAATTctgatgaaattttttaaaggaCGAGTTCCTTGTGTGTTTTGGAA
ATTTATATTTCAATCTTTAACTTGAaatcttccttttctttttcttcgta
ATCTCAAATTCTAATTATTTGCACTTTAACAAACAAGACTACTGTATTTA
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TAtcattttttaccaaaattattgtatatattattttgaatatttaaaat
ttaaaacaggTTAGACCTTGAaggttattttaaatttttgcacttttagg
taaaaaaattaCATGTGAACG

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_003571	XLOC_003571	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000066	supercontig	sc0000066:262586..272606 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
3.27845	2.79516	1.24152	0.621403	178.915	133.699	58.0513	56.5071	28.6236	28.0115	18.6037	27.6218	12.5365	12.7287	10.0119	9.14559	17.5524	19.8849	20.4683	21.1469	15.1666	16.3335	14.6378	14.6135	18.7919	15.8985	62.8172	63.3601	12.739	11.7729

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00006237 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00006237 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

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TCONS_00006237 (transcript) - C. hemisphaerica