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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00006040 ID=TCONS_00006040|Name=TCONS_00006040|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4343bp
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ATCGTACAAATAGCCCAAATCTCTTCTGCAAGTCTATTTCTTGTTATTTC
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tttataaatattttataacaatattttatatgtttttgtGCCC Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000062:43638..47980- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00006040 ID=TCONS_00006040|Name=TCONS_00006040|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4343bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000062:43638..47980- (Clytia hemisphaerica)
AGTCCTCTGGTTAATGTATCCCAAAAATAAATATTTTCTCTTAGTCAAGA
TCAATTAGGATCAAATAATTACAGTTAGAATGTTCTGTGCAGACTATGTC
ACTGCATTTGTTTATCATATGATTATGACAGGTGGTGCTGTCTGGCTATG
TCAGCAAAAAACCAAAGATGATATACCTGACAACAACAATAAACTTAAAT
TTAATGATAGTATTTTCTCTATTGCTGTTCAAAGTCTTGGTCTCAGCCAA
ACACCAAGGCATGAGAGAATTGGTAATCAAACAGTGGACAAAAAACTGAA
CATGTTCTATCCAGTTTTGACAGGCAGTTTAGCAGGCCTGGCTGCATCTG
TGACTTTATATCCTTTGGACTTTGTACGTTCTGGAGTTGTTGAACCAGGG
TTGAAACGTGTTTTATCAGCAGGGTCAACTGTGCCATATGCAGCAACATT
ATTTGGAGTATATTTTGGTTGTCGTGATCCAAAATCTACCTCATCGCAGT
TCAAATGGGCCATGGCAGCTTCTACAGGTGCTGTGCTTGCAGAAATGCCT
TTAGATTATGCAAAGCATAATATGATAGGGAGTACAAGAGTTATACTTGG
TATAGGACTACTATATGTACCATTTGCTGGTTTTATGCTAGTCATGTACG
ACAAAGCATTACTCAAAATATTACATCCCTTTACAAAGGACAATGCTTGA
AATTTTAGGACGCCTTTTTATTACTTTTTGAAATTTGACAGTGTGTAATA
TCATGAATACAGTAAATTTTAAAAATGTTTGTGTATAATATTGTCGTATT
TTAGAAAAGACATTTATTCAAAACCAATTTAGCCATCCATATTCGCAAAA
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CTAAAAATTAAGTAATTTAAGCGATTTCATATGATGCTAGTGGACTATCA
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AATACTTATATATAGGTAACAGACACTTGGCAGTGCAATACAAGGAATGA
TTTTGCGATAAGTTTCGAGATTCTCTTGCATAATACTATTTACCAACATA
CCTTTTTATAGTAAAAGGACATTAGAAAAAGTGCTATCACGTCAATTAGC
ATTTTACATTCAAATTATACAGGATACATTGTACCCTTTTAACCAATGAA
ATTGCTGATATTTTTTGGCCACTAAGAGTTATAAAAAGTTACAGGATTGT
TTTTTTTATTATTTAGGCCCAAGAGTATGATGGAAATGAAACTCTCAACA
AAGATATCAGTGGTTGTTTCTTATGGCCAGAACATGAAACATATTGCAAG
ATCGTACAAATAGCCCAAATCTCTTCTGCAAGTCTATTTCTTGTTATTTC
CTTGTTCATTATACTCATTATCTGGGTCTTCAAATTATATCATTCTTTCC
TTCAAAGACTAATCCTTTACATTTCTTTATGCTCTGCAGTTCTTTGCATC
ACATTTCTTTTAGGTAATATCAACACTAATCATAATAATGCATTTTGTTT
TGTGCAAGCTTTATCGATGCATTATTTTTCTTGGGCTACTCTTTCCTGGG
TTATATGCACTACCATTAACATGGTTTTCATCTTACGCCAATTGAATACT
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TTGGACCATTATACCAGCAGTTATCGGTGATTTTGGAAAAACTGAAATAT
GGTGTTGGATTACTATCCAGCATCCAATACTCAAATTCACTGTGTGGTAT
ATTCCATTATTATTGGTCTGCATGCTGATGATTGTTGTTTATTGCTACAT
ATTCTTCCATAACAAGAAAGTCAGTCGGTCAGCATCAACCGTTTATAGTA
TTGATAAATCTGAAGAGAAGCGCTTAAACAAACAAGAAGTTAAACCCCTT
ATTGGATTTCCATTTATTTATATATTATTCACCATACCAATTTTCATTAT
GAGAATTCGTGAGACTTTCTATCCTGATGATTCACAAAGATTTATTCTGG
TTCTAGTGGCTGTTATCCTTGGTCCATCCATAGGCACCTGCAATGCTTTA
GCCTATGCCCTTTTCCATGGAACATTCAGAGCCTTAACATTCAGGAAGTT
CAAATCTGCTCTCCATACAAAGATTTTCGGTAAAAAATACAAAGTGACCA
GAGGTTTTGACCTGCCAAGCTATTATGAAGATGCTGCAAGGTCCCCCAAC
GTCATGAGAAAAGGACCTCTTGTGTTTCAAAATAAACTTTTTGATCAATC
AGGTAATCGCGAATACATGGTCAAAGTTTGAGTAATACAAAATTTCAATT
TGAATGGATATTAAGTAGAGCTTTTATACTTAGTTAAACGTTTGAATTGA
ATGCACTTTTAAAAATTTGTACTAGTTTGTATGTCAGTTTTATTCTTAAT
TAGTCTCAATTCAAAGATAATATTTTTAATAGCTTCTTCAACAAAGCACT
GATCCATATTCTGGTATATAATTCAAAGTTTTCACCAAAATGCTGTTAGT
AAAATGTATGTATGTAATGTAAAATTTTGATCATTTATATGTAATCTTTA
AAAGAGTTCTGGATAAATAGAATGTGTACTTTATTTTTATATCGCAGGTA
ATTTTGTGTGAATCTAAGAGCAATTATTTTTATAATTATTTTGAAACCAA
TCAAAAAAGAAAATAAATAGCCGTGAAATGTTTCATTTTTGTTTTATTGC
ATCGCAAGGATTACTTAAGTTTGTTTCCTTTTATAAATATTGAATCTGCA
TTGATTAAAATGATCTAAATTATACAATTTTGTTTTTAAGGGCTTATATA
TAGTTAAAAAAAATAAAGATAGCAGCATAATTTAAAGATTCTACAACGAT
GTTGAAAAATTCAACATACTGTTTCTTCTGGCCTGATAACCCATCAAGAT
GCAAGACCATAGTCATACTACAATACCTGTTTAGTAGCATATCATTCATA
TGTTTACTATGTTTACTAGTCATGATAATTATGTTCAAACTCTACAAACT
GTTCGTGCAACGTTTAATTTTATATCTTTGTTGTTGCAGTCTGGTGAATA
CTGCATTATACTTTGTTCATGTGGATAAAATTAGCCCTGGCAGTTGTATA
TTCCAAGGATTTCTGAATCAATTTATGTCATGGACTGAATTATTATGGGT
TTGCGTTGTCACTGGTAATATCTTTTTAGTCATGCATGGATACCAGTTAC
AAAAATACGAAAAGAAAGTTCACCTTTTTGTGTGGTTGACTTCATTATTC
TGGAGCGTTATCCCATTTTTCGGTCATTTTTATGGACAAGCCGGAAGCTG
GTGTTGGATCAAGCGGGAACACACATCAGTACGGTTTGGTGTCTGGTATG
TCCCTTTAATGCTGGTGATCTTTGTAATGTTGGCTATGTGTTTTTACATG
ATTTGCTGTTCTTCCTCATATGAGCAGGAATACACCTACACTGAGGGTGG
TTCTTTCTTTGAGCAGCAACAAAGCCGCAGCAGACACCAATCAGAAGTAA
GGCCCTTGATTGCGTATCCAATCATCTATTTTCTATTGAATCTACCAATG
TTGATTTACCGGATAGATGATGCAGTTCACCCAGATGATGTTCCTGATTA
CACTTTAATGGTTTTGAGTGTCATTGCATCTCCACTCCTTGGTGCCTTCA
ATGCTTTTGCTTTCTGTATTATTGAGGATACGTTGAAAGATTCATGTTCA
ATAGCGGCACTCAGGAATATTCTTTGTTGCACTGGTGAAACAACTAGGAT
TGTCCATAACTATGAGGTTGTAGATGGTGAAAGTTAGATATCAATGACTA
TGCAAGTATTCTTGACTGTTCCATCATAGTCACTAGAATTATACATCAAT
CTGCACATACAAATTAATCATGTGACCAAAATAAAAAATCGGCCAACCTC
TGAGCCGGGACTTCCAGACCATGTATAATATTCAATTGACATTGGTTCCA
TCTAATTGTCAAGTTGCTGATGACCAATGTTTTTAAATAGTTATCCTATT
GTGGTAATGTTGTAGTGATTGTGCTTGTTGAAATTTTCAACCTTATACTG
ACAAACTACAAAGTAGCATAAAGCTAAATTTTTTAAGTTGATTGGGATTA
ATGCAGTATCATTTAATTGCTGGAAAGGAATTTTTTATATTATTTACATC
AATTTTTTAGTTACTTTTTAGTATTCATTTTTAAAGTATTTTTATCCCTT
TTTATAAATATTTTATAACAATATTTTATATGTTTTTGTGCCC
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00006040-exon-sc0000062-1575043694:43638..47980 | TCONS_00006040-exon-sc0000062-1575043694:43638..47980 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00006040-exon-sc0000062-1510915933:43638..47980 | TCONS_00006040-exon-sc0000062-1510915933:43638..47980 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00006040-exon-sc0000062-1491911889:43638..47980 | TCONS_00006040-exon-sc0000062-1491911889:43638..47980 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000062 | supercontig | sc0000062:43638..47980 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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