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transcript sequence >TCONS_00005949 ID=TCONS_00005949|Name=TCONS_00005949|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1998bp AGATCATGTTAATCTTTGGAAAAGAAGACTATGAGCGTCTTTAAAGaaaa ataacaAGAATAATGTCTGTGAACCGTAAAGAGTCGGACGCCAGTGGAAC CAAGGAGCATCGATCACGAAGCGGTAATGGTCGTTCCGTATCCAACATTG TCCGTAAACTATCACACCGGTCATCCGGTAAACGGAGTACGGGTGGATAT AACAAAGGAAATATGATACCACCACATTGTAAATTCAAGTTGGTCGTACA AACGGTGAAGCCGGAGTTGACGGTATGTTTTATGTTGGCTGAAACGCTTG GTTACGCATTAACTTGCAATAAGACTGAAGATGTCTATGCTGAAAAAGTT ATCAACGATATCAAATTTTGGGAAAGATGTTCATTCATCCCATCCGTCAA TCTATGGTACGATGGATATTGCGCGTTCGAATCGGTTCGTGAATCGTCAC GTTATCTCCTGTTTGTGGATGGGAAATTCTATTTCAAGAAATACGATGGG ACAGAGCGGTTCAAGAAAGACGCTAGTTTCCTTTTCACAAAGCAAGTTAA TATATTTTCACCACGCCGCAGCCAATCAAATATCATTCCACCTGATCCTA ACAAACTCAAAGTCAAAGCAAGCGGAAAATCCCGGAAATTCTCATTAATC TCTTTCCGCTCTTCGGAACGGAACAATGCGGAACGGCATTCGGAACTCCA ACAAATGATCCCATCCGGTGTTTTACCGGTTCCGGAAATGGTTATTCAGT cacaatcaaagaaagaaatgtaTTGTCTTGGATTAAATCAATGCCGCGAT TGTTTAACGTTGAccaattttcaatatatttctgAACGGCTCGCAAAACA AGAAGAAAGATCGAGATCGCATTCTGGTTTACTCAGTTTGAATTCTTCAG TTACCTTNAccaattttcaatatatttctgAACGGCTCGCAAAACAAGAA GAAAGATCGAGATCGCATTCTGGTTTACTCAGTTTGAATTCGTCAGTTAC CTTCTCTGAAGCACCTCCAGATGAAATTGAACTTCTTACATTAGATgcaa gctctatttaagtgtatagttgacgctctctaattcgattttcaaacaAG AAAGCTTATCGATTAAGGgagtgtcgtttatgagagtttcttgttgacgg ggactttaaatttcatccaATAATGGAGTGTATCCAATattagaacgtcg aattagaaagcgtcaaCAACCTGTCTTTTCAACTACCAAACTGACacgtg aacattagataaacgttggaACTACCTTTTGTGTCAGCTGGGTACAATGG ACGCTCTCtctaactcaattttcaagGGGTTCGATATGAATGAATAATGG AGTGCATCGACTAGTAAAATTTCGTTTATGCGAGTTTCTTGTGGACGGTG ATTtccaatattatcgaataatggagcgtttCGAAAAGTAAaacatcgaa taagagagcgttaGCTGCACCGACAAATCTTCAAATATAATCGACTCGAC GATTAATGAACACTACGGAAGAGATGAACACCTTAAGCTTCGGGAAGCTT CGAAAGAAAACGAAATTATGTNGCACTACGGAAGAGATGGACACCTTAAG CTTCGGGAAGCTTCGAAAGAAAACGAAATTATGTACGCTTTCCGTAGAGA ACTTGTCTGCGTCACGGAGTTGATCAGTTTCAAACCTGTGGGTACAAAGC TGGTAAAGCGCAGACGATTATTGAATGTGCTTAAGACATAACTTAGGAAC TGGAAATCTTTTTTCATGATAGTGCATaagaatatttattttaaataaga TCAGAAAGAAATTCAACCACTCCAGGGAATTATTTAGAATTATTTACTGG AAAATCTGCCAAGAGCCTAGAACATTTATATATGATCCCACAATAAACTC CTTGAAATTTAGCTCAGAAATATAtctaaaatatatgaaaaaatgtattt tttaaagCATAAGTAGAACTgtattcgaaaaaaaaacattagtcAAAG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000061:1009673..1033320- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00005949 ID=TCONS_00005949|Name=TCONS_00005949|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=23648bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000061:1009673..1033320- (Clytia hemisphaerica) AGATCATGTTAATCTTTGGAAAAGAAGACTATGAGCGTCTTTAAAGGTTA
GTTTATGAATCTTTTTCTCCTTTGCAAAATAAGTCATTTCACAGTCGAAA
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CTTAACTTTTTAGATTTTAAGCCTAAAGTTTTTCTTAAAACAGTCTCACT
CTCAGGTCCCGTATAAATAAGAGTCTCCCCCCGTTTATAAATTTTCGAAA
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TAAAAATCATACTTTATGCGCCTTATATTGTGACCAATTTTACTTAGATA
ATTGCAATTTTTTTCGCTCACTTTGCTCGCAATACAGTTAATTCGTAACT
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TTAAAAGAAAATCTAACTGCGACCCAATATCAATTTGTTGACAACAATAT
TGAAAACATAAATCTTTTCGCTCGCTTCGCTTGCATTACACATTGTTTCT
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TAACCATGGTGGGGCCTGTTTTTCCCTTTTCCATTCATCAAAGAAATATC
TACTCTTACCCATTATGCCTAGGCAAATGAATTAGTAAAAGTTTAGAAAC
TGGTGGGCGGGGGCACCACTTTGGAAAATTGGGGGGAGGGGGCTGCCATT
TAAAAAAAATTGACTTTGGCCCCTCCAGAAAAATTTTCCCACAACGCCAC
TGACCCTCTCCCCCGGTTCTTGTTAAGACCCTCCCGATTATTTTTGAAAT
TATTTTCAGCTATTCAAATAAGCTAAATTTACCTAAGCTATTAAAAATGT
ATCGATTTTAGTCGATAATTACCTCATTTTGTGGTTTTTAGTTTTTACAA
TTTTCAACACCCCCCCCGGTATTAGCCCCCTCCTCGTCTATTATATTTTG
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TTAGAGTAAGTTTTAATGATTTGAGTAGTTTCGTCTCATTTCCAAAGTTA
TTGTAATTTAGAGCTTACATAAACTATAAATATTCTTAACATGTTCTTAC
ATTTTTGCTCCTCGAACTCTAATGTTTTATAAAAAACTTTATCGAAACAG
AAAAAGTATGCGAAAAGCTCAGTATTACAGATGACATACAGTGATGAAAG
TAAGCACATGTTTGGTTTAATTCTATTTCGCAAAATCAAACTACATAATT
ATACATAATAGATATTAGATGTAATAGGTAGAAATCGGCGTTGAATTTGA
GAGGGTACCTAAATTATGACGGAAAATCTTAATTTCCTTATAAAGAATAT
TGCTTCAAAAATCATAGATTAACCCCCTCCCTGAAATTCACCACAAAAAA
AAAAGATATATTTGCCATATACTATTTACAAAAGCTACAACCTTCCACAG
CATGGTCCTCTCAAGTTAAATCGGGTGTGTGTAGACCTTCACTTTTTTTG
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TTTTCTATCATCGGTTATCGAATATTTTTTGCTTTTAGTTTTTCCATCTT
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TCCGTAAAGCTTGTTTGATCATTAATCTCGTATTCTCTATCACAAATATC
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AAAGTAAGCACATGTTTGGTTTAATTCTATTTCGCAAAATCAAACTACAT
AATTATACATAATAGATATTAGATGTAATAGGTAGAAATCGGCGTTGAAT
TTGAGAGGGTACCTAAATTATGACGGAAAATCTTAATTTCCTTATAAAGA
ATATTGCTTCAAAAATCATAGATTAACCCCCTCCCTGAAATTCACCACAA
AAAAAAAAGATATATTTGCCATATACTATTTACAAAAGCTACAACCTTCC
ACAGCATGGTCCTCTCAAGTTAAATCGGGTGTGTGTAGACCTTCACTTTT
TTTGTTTTGGAAATTTTTACTGTAAGTGTAAAACTGATGAAAAATTCAAA
ATTGTTTTCTATCATCGGTTATCGAATATTTTTTGCTTTTAGTTTTTCCA
TCTTTTCACGATGGTTCTAATACGGTTGCGTTGATCGGGGTTGTTAGTTG
GTGATATTTCCGCTCCCGTCTCTTGTTCACCCGATCCAACATCATTTGGT
TCCATTCCGTTCCGTGTTTCTAGTTCCACTGATACTTGTTCATCTTTCTT
CACCTTTTTTGGCTCGTCTTTCGTCTTTTCCGGCTGTTTTTCTTTCAGTT
TTTCCGCTTGGTCTTCTTTCGGCTTTTCCGTTTGGTCCTCTTTCGGCTTT
TCCTTTTGTTCCTCCATCAGAACTTCTGCTTGTTCCACGGGCTTTGGTTC
ATCTTCCTTTCCCGGGCCTTTGTAAAGTGTTGTCATCATCTCTTTAATCT
GATCAAATTTGGCGAAATCGGAAAATTTAACCGGATCAATCGATTGGTCG
AAACTGATTTTTTCCGTATAACTCATTGCCCTACAGAACTGTTCAACCTC
CTTATCCGTAAAGCTTGTTTGATCATTAATCTCGTATTCTCTATCACAAA
TATCATTAAAATGTGCATTCATCTTGAAGCGGCATTGGATTTTCGTTGGA
TACTTTTTGAAGATTTTTCCCTTCTTCGGCTTTGAGCCATCTTTAACCCA
ACCGTAACCCAAAAGAATGTCCTTATCAACCGTTTTCTGTGAATCGTGTA
TCACAACAATACTATTCTTAAGGTACGTCAATACTGCTTCCTCAACGTTC
CATTCATTCTCATTCGGACTCAGTACGTCAAAAATATCTGCCGTGTCACT
AACAACCTTCCCGTCTCCTGCCACGTTCATATGTTTCTTCACCACACGGT
ACGCCTCACACCTCAACAACACTGTAGCCACGTAACTCTTAAATATTGGT
AAATTAGCAAATAACCTTTTAATACGTTGCCCGTTCATCCGTCTCAGAGT
CTGATCAGGTACGTGCTCCTCCTCATCTGACACTACCAAACTGCCAGACA
AAATATCACTAAAAAGTGCAAACTCCTTAAAACCAGCCTTAACAGAACTG
CACCTACTGGACAAACAATCTTCCCTCTTCCCAACGTCACTTATCAATAA
ACAGTCAGACAACTCCAAGTTCATTTGACTTAGCACACCAATCAATCTCT
GGTGATCAACATCAATGATACTCTCATCGACGTACTCCTTCAATTCATCG
TACTGCAAATCCATCTTATTATTCAAAGCACGGAAATTCCGTTGAATCGA
TTGAACAAATTTTTTCTTGGCTTTCACATCCTTATATGTTGAATACGCAC
CGAAAATCCACGACAGTAAACCAACGCCGGGGCTCACAATAGATAACGCT
TTACCAGTCGTCGCCATGACTCCAGCTACAGCGTAAGACGCCGTTACAAT
CGCCGTAACCCATGACGTAAACTCACCGCCCGTCTTACCAACGTAGTTTC
GTAGATTCTCCGAAATACTACTTTCGCCATTTTCTTTAACAAAATTATCG
ATATCTTTGGTGATTTCTTCATTCAAGCGTTCTGATCCTTTCTTCTTTTG
TTCTTCTTCTTCTTCTTTCGCGTTTTCAAAATATTTGGCGAACGCTTCGT
AAGTGGATTTACATTTTCCAGGTTGTGGATCGAAATTGGCGACTTTGATT
GGCTGATCGCCTCCTTTGATACCAGGTAGGATTGTGTAAACACAGACCAA
CACAAAGATTTCTTTGTAAGATTTCATCGTCTCTACTTTACCTAAAAGGG
GAATGAATGTANTAGATCAACACAAGGATTGTTTTGAAAGGTTTCATCGT
CTCTATTTACCTAAAAAGAGAATGAATGCACGTTTTTTATAAGAACAAAT
TATATAAGAACATGATTCGTTGGCCAAAATACTGAGAGCAAGTTAAGAAC
ATTTAATGCTTTATAAACTCTAAAGCACTTGATCTCTTAGGAAATTACAC
AAAACAATAACAAAATTGTGAAATTAAGAACATTTTGAGAACATTTGAAA
GCTTAAAATTCAAAAAGTTGAGAACTTTTTTGAAGCCTTCTAAAATTTTG
GATGTTTTATAAAAAACTTGTTCAATCACAGGCATCATTTCCCTGCAGGC
ACATTTCTGGTAATTTTGAAACACAACAGAAACTGAGGCTGATATTGAAT
ACTAGAAGTTCAGAACAAATAACACTAGCTAGTACCAAACTTCTTCGCTC
TAAAAAGATAACGCGAACTTCAAAAAGTAAAGAATCTCACATGACATCGG
TATGTTACAGGATAGTCCTTATAAATAACCCTGGTCTGGAAGCTTATTGT
TTTAACTTTTTGTTAGCTTTTTCTTTGTTAATACCGAAAGATGAAAATCG
ATTTGCTCAGTTTTTGATCACGTTACCAAGTCCTCTTGAGATTGGTTTAA
GATTTAATCACATGATCAAAAAGTGAGCAAAACAAACTAATTTCTCAACG
CAAGTTCAAGTAAGAAACAATGGAAAGAAACAAAAGGCTTCCAGACCTGG
GTTTTTTAAACGGACTATGGTTACAGGCTAAAATAATATTTTCAATATTT
TTTGTACAATTGGTTATCATTAAATGGGCTCTTACCGTAGATAATTGATT
AATTAAGCAATTTAAACCATCAATCTAGAGTCGACTTAATCTGCACTGAA
CCAATTTACTTTCATTCTGTATAAGTCCAATATGGTTTTTTGTTGTATTT
GAAGGTTGAGAGTACTTTCTGAATAATTAATGTTTATTGTTTGGAGATTG
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ATTTGTTTATATTTGTATGCCATTTACATTCAAGCCTGGTTTTTAAACAG
ATTAATTTGTACAAGTTTGATTGTATTACTCATGCACAAGAAGCTCCACC
CCCTCCCATGCAACTACACGTCTTTTTTATAAGAACATCCAATATTTTTG
AAGCTTTCTTATGTTTTTGAGTTTTAAGCCTAAAAATGTTCTTAACATAT
TTTCACCAAATTGTGAGTATTTTTGTCCAGTTTCCTAAGAAATTCGGTAT
TTTAGGGTCTGTAAAGTCTTAAAATGTTCTTAACTTGTTCTTAACATTTT
AGCCATCGAAGCCTTATGTTCTTATATAGTTTGTTCTTATGAAAAAGTAT
ACGCATACATGAGAAGCCCTCCAATGCAACTACATTTTATTAGTGGTCAA
TTCCCTTTACAGGGTGTCCCGAAAAAAAGTATCAAGTTCGAACATGATTC
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GGTGCATTTTATGGGAGACTTAAAAAATAAAGTGATCTGTGTAGACGATA
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ATATTATAAATATTTAACTGATCAAGAAGATTGAAATTTTTCCTTCTTTT
GAATTGTAAATACAAGGTGTCAAGTGATCCCATATTATTACAAAGACAGA
TTTCAAACTTGATTCAATAGGAAAGTTTTGAAACAGTAACAAGTAGAGGA
AAGGAAAATATATCATTAAATAAATAAATGGCGAATTTCTTAAAAGTTAT
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TTCTCATATTTTTTATGGCTGGGGATTTCAATTATTTTGCTTTCAAGTCA
GAAAATTCGGTGAGGATGGGAAAAAATAATGAATATTTTGCAGTGAGGAT
TGTTTTTTTATTCTTTTCAGTGGGGACAAAAATTGGAGGATAATTTTCCA
CCGGGGATGTTTTTTTAGCCAATTTTTCCAGTTGGAAAGGTTTCCCAGTG
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AGTTTCAATATACATACAGTGAACATGGTCTAAATTTGGACAAATTCAGG
CCCGGTGGAATAACCTTAAAAGTGGGGAGGCTGAAGGCCCAAACAAAGAT
AAAATTCGCCAAGAATTCGAGAAAAAAGATCTCGTTCGCCCAAAAGTGGG
GAGGCTAAAGTCTCCCCAGTTTCCCCGCTTCCACTGGGCCTGCAATTATA
TTTCTTTGTTTTAGAAAAATAACAAGAATAATGTCTGTGAACCGTAAAGA
GTCGGACGCCAGTGGAACCAAGGAGCATCGATCACGAAGCGGTAATGGTC
GTTCCGTATCCAACATTGTCCGTAAACTATCACACCGGTCATCCGGTAAA
CGGAGTACGGGTGGATATAACAAAGGAAATATGATACCACCACATTGTAA
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TTTCCAGTGGTGCATATAAAGAAGCGGGTCTCTGTTAGACAAGCCCTCCA
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TTGATCCCATTGAATAAATTAGGAATTCTCAAAAGTGAAACATTTGTCGG
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GACAGTGTTTTTATTAAATGACCGTGTAAACTGGTCTATTGTAACTATTT
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GTCCAATATTATCCCCGGTGGAAAAAACCCCTGAAATCCCCACTGGGAAA
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ACCATCGGCGTTTTTTACCGCACAGAAACAGGTGTGTTTTTTTTTAATAT
AACAATTTTCTATTGTAGACATAAATCCCTAATCGAAGTTTATAATTAGG
ATTAATTAGGCTCAAAATATACGAAAAAGTTGCGAAGAGGAAAAGACGTT
AGTGCGTAGAAAACGTATAGACTAAATTGAACGGAGTAATATAAGGAGCG
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AGAAAATAAGGAATTCTTTTTCTCATGTCCTTATCCATTTTCTCACATTT
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000061 | supercontig | sc0000061:1009673..1033320 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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